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自身免疫性葡萄膜炎患者外周血 转录组差异表达基因分析.
- Source :
-
Shandong Medical Journal . 1/5/2024, Vol. 64 Issue 1, p78-81. 4p. - Publication Year :
- 2024
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Abstract
- 目的 分析自身免疫性葡萄膜炎(AU)患者外周血转录组差异表达基因。方法 选择AU患者4例,采集 外周静脉血 4 mL,分离有核细胞,采用流式细胞术检测 HLA-B27。利用高通量测序技术对细胞中所有 mRNA进行 测序,通过云平台分析获得与 AU 相关的差异表达基因、功能富集分析和蛋白-蛋白互作网络(PPI)等转录组学特 征。结果 样本有效浓度均达标,Q20、Q30符合测序质量要求,GC含量无明显偏倚,测序结果有效。共筛选出差异 表达基因2 638个,其中表达上调基因1 876个、表达下调基因762个;聚类分析显示,组内样本差异表达基因的高低 表达分布集中,组间样本则距离较远,提示差异表达基因的聚类性较好。差异表达基因 GO富集分析显示,差异表 达基因能够参与免疫应答、白细胞激活、细胞活化等生物学过程;KEGG通路富集分析显示,差异表达基因主要富集 于破骨细胞分化、NF-κB、趋化因子等信号通路;PPI分析发现,POLR2A、RBPJ、SUPT5H等基因处于PPI的核心位置。 结论 AU患者外周血转录组差异表达基因较多,其中 CXCL8、FFAR2、HBB等表达上调,SLC4A10、CD27、PAQR等 表达下调。这些差异表达基因能够通过多种途径参与AU的发生、发展。 [ABSTRACT FROM AUTHOR]
Details
- Language :
- Chinese
- ISSN :
- 1002266X
- Volume :
- 64
- Issue :
- 1
- Database :
- Academic Search Index
- Journal :
- Shandong Medical Journal
- Publication Type :
- Academic Journal
- Accession number :
- 174536841
- Full Text :
- https://doi.org/10.3969/j.issn.1002-266X.2024.01.019