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Preliminary interspecific genetic maps of the Populus genome constructed from RAPD markers.

Authors :
Yin, Tongming
Huang, Minren
Wang, Mingxiu
Zhu, Li-Huang
Zeng, Zhao-Bang
Wu, Rongling
Source :
Genome. Aug2001, Vol. 44 Issue 4, p602-609. 8p.
Publication Year :
2001

Abstract

We have constructed RAPD-based linkage maps for an interspecific cross between two species of the genus Populus (P. adenopoda and P. alba), based on a double pseudo-test-cross strategy. Of a total of 360 polymorphic fragments scored, 290 showed a test-cross configuration, corresponding to DNA polymorphisms heterozygous in one parent and null in the other. In the female parent, P. adenopoda, 82 markers were grouped in 19 different linkage groups (553 cM), whereas in the male parent P. alba, 197 markers established a much more complete framework map with an observed genome length of 2300 cM covering 87% of the total P. alba genome. The larger number of test-cross markers detected for the P. alba parent than for the P. adenopoda parent might be due to a higher level of heterozygosity in the former than in the latter. In this study, we detected only a small percentage (2%) of the intercross dominant markers heterozygous in both parents and segregating 3:1 in the progeny. The further focus in this mapping study should be on the identification of more intercross markers, to align the two parent-specific maps into a consensus map for mapping important genes causing species differentiation during long evolutionary divergences.Key words: interspecific hybrids, linkage map, poplar, pseudo-testcross mapping strategy.Les auteurs ont produit des cartes de liaison génétique à l'aide de marqueurs RAPD et d'une stratégie de double pseudo-testcross à partir d'un croisement interspécifique entre deux espèces du genre Populus : P. adenopoda et P. alba. D'un total de 360 fragments polymorphes examinés, 290 ont montré une configuration de type testcross, c'est-à-dire qu'ils étaient hétérozygotes chez un parent et absents chez l'autre. Chez le parent femelle, P. adenopoda, 82 marqueurs ont formé 19 groupes de liaison (553 cM) tandis que chez le parent mâle, P. alba, 197 marqueurs ont permis de produire une carte de référence beaucoup plus complète montrant une taille de 2300 cM et couvrant 87% du génome du P. alba. Le plus grand nombre de marqueurs de type testcross au sein du P. alba qu'au sein du P. adenopoda pourrait être dû à une plus grande hétérozygotie au sein de la première espèce. Dans ce travail, seule une faible proportion (2%) des marqueurs étaient hétérozygotes et dominants chez les deux parents et montraient une ségrégation 3 : 1 au sein de la progéniture. Les travaux à venir devraient viser à identifier davantage de marqueurs polymorphes chez les deux parents afin d'aligner les deux cartes spécifiques de chaque parent en une carte consensuelle dans le but de permettre la cartographie de gènes importants à l'origine de la différenciation des espèces au cours de l'évolution.Mots clés : hybrides interspécifiques, carte de liaison génétique, peuplier, stratégie de cartographie en pseudo-testcross.[Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Details

Language :
English
ISSN :
08312796
Volume :
44
Issue :
4
Database :
Academic Search Index
Journal :
Genome
Publication Type :
Academic Journal
Accession number :
10586867
Full Text :
https://doi.org/10.1139/g01-054