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Para entender e gerenciar melhor a população de jumentos e mulas é essencial saber informações sobre seu tamanho. Em países em desenvolvimento, esses animais são frequentemente usados como animais de trabalho, principalmente por populações pobres na agricultura e pecuária, mas seu uso está diminuindo no Brasil. Os dados oficiais brasileiros sobre jumentos e mulas começaram a ser mensurados no censo agrícola de 1960 e a partir dessa época foram realizados oito censos agrícolas. Até a redação deste artigo, porém, nenhum trabalho científico analisou os resultados dos censos agropecuários quanto à população de jumentos e mulas no Brasil. Deste modo, nosso objetivo é compilar e analisar os dados oficiais brasileiros de 1960 até 2017, para aprimorar as ações dos stakeholders, pesquisadores e tomadores de decisão preocupados com os jumentos e mulas brasileiras. To better understand and manage the population of donkeys and mules, it is essential to know information about its size. In developing countries, these animals are often used as working animals, mainly by poor populations in agricultural and livestock labor, but their use is decreasing in Brazil. Brazilian official data regarding donkeys and mules started to be measured at the agricultural census of 1960 and, from that time, eight agricultural censuses were published. But until the writing of this paper, no scientific paper was dedicated to the analysis of the results of the official agricultural censuses on the population of donkeys and mules in Brazil. Thus, we aim to compile and analyze the official Brazilian data from 1960 until 2017 to enhance the actions of stakeholders, researchers, and decision-makers concerned with Brazilian donkeys and mules.

Submitted by Ubirajara Cruz (ubirajara.cruz@gmail.com) on 2021-10-26T14:46:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_alessandro_romano_da_rocha.pdf: 1150028 bytes, checksum: ec565e45571a19c57545c4ef683bc1fd (MD5) Made available in DSpace on 2021-10-26T14:46:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_alessandro_romano_da_rocha.pdf: 1150028 bytes, checksum: ec565e45571a19c57545c4ef683bc1fd (MD5) Previous issue date: 2020-07-20 Sem bolsa Estudar os parâmetros populacionais é uma etapa importante na avaliação do status de conservação das espécies, além de fornecer informações relevantes aos programas de manejo da fauna silvestre. Melanophryniscus montevidensis é classificado como uma espécie vulnerável de acordo com a IUCN, com distribuição restritas zonas costeiras do Uruguai e no extremo sul do Brasil. Embora exista alguma informação sobre sua dinâmica populacional uruguaia, não há dados disponíveis sobre suas populações brasileiras. O presente estudo teve como objetivo estimar o tamanho da população de M. montevidensis em uma região no sul do Brasil. Os dados foram coletados de junho de 2018 a junho de 2019 no município de Santa Vitória do Palmar, no Rio Grande do Sul. As taxas de sobrevivência foram altas, constantes e muito semelhantes em todos os modelos construídos. As probabilidades de captura foram influenciadas principalmente pelas chuvas. O modelo POPAN estimou um tamanho populacional de mais de 19.000 indivíduos na área de estudo. Esses dados serão úteis, uma vez que os habitats naturais dessa espécie no Brasil foram rapidamente substituídos por parques eólicos. Studying population parameters is an important step in evaluating species conservation status as well as providing relevant information to wildlife management programs. Melanophryniscus montevidensis is classified as a vulnerable species according to IUCN and it is distributed in the coastal zones of Uruguay and extreme southern Brazil. Although there is some information regarding its Uruguayan population dynamics, no data is available on its Brazilian populations. The present study aimed to estimate the population size of M. montevidensis in a region in southern Brazil. Data were collected from June 2018 to June 2019 at Santa Vitoria do Palmar municipality in the state of Rio Grande do Sul. Survival rates were high, constant and very similar in all built models. Catch probabilities were mainly influenced by rainfall. The POPAN model estimated a population size of more than 19.000 individuals in the study area. These data will be useful since the natural habitats of this species in Brazil have been quickly replaced by wind farms.

The nurse shark, Ginglymostoma cirratum, is a coastal species found in tropical and subtropical waters on the Atlantic Ocean, frequently close to reefs, both coral and rocky. The species was reported as one of the most abundant shark species in coastal waters in Brazil, with the northeastern region possibly holding the greatest numbers of nurse sharks. Despite this, local extirpations and population declines resulted in the evaluation of the species as threatened (Vunerable) in Brazil. The lack of baseline data on its population traits precludes well-elaborated management actions, reinforcing the importance of studies directed to the species. Thus, the objective of this study was to estimate the size and structure of the nurse shark population on coastal reef environments in Paraíba State. Three natural and three artificial reefs were selected based on previous knowledge of nurse shark’s occurrence. Sites were sampled between May 2016 and May 2017. Data recorded included total sharks present during sampling, total of sharks photographed and their estimated total length and sex, as well as water temperature and horizontal visibility. Photographs of the shark’s first dorsal fin were taken and high quality images were used on Interactive Individual Identification System – Contour. Population size estimates were undertaken using Jolly-Seber estimator. Seventeen sharks were positively identified during 38 field excursions, of which 76% were juveniles. There were 36 recaptures of 13 individuals (76% of the total captured sharks) of which 88% were juveniles. The estimator led to an upper population size around 50 individuals, and the population was composed mainly by juvenile sharks, with a sex ratio close to 1:1. The results point to a low population size, however, the high proportion of juvenile individuals probably highlights a sampling error due the limited number of sites and their small geographic range, especially in depth, as all sites were between 12-35m. The high recapture rate emphasizes the site fidelity of the species in the area, which sums up with its low population size to an increased vulnerability. Even though the results are more relevant towards the juvenile size class, they reinforce the need for more populational studies on this endangered species in Brazil, showing as well the need for conservation measures for the species and its environment, particularly on less studied and protected regions, such as Paraíba State. Nenhuma O tubarão lixa, Ginglymostoma cirratum, é uma espécie costeira encontrada em ambientes tropicais e subtropicais do Oceano Atlântico, frequentemente próximo à recifes, tanto coralinos quanto rochosos. A espécie é tida como uma das espécies de tubarão mais abundantes em regiões costeiras no Brasil, com a região nordeste possivelmente abrigando as maiores populações de tubarões lixa. Apesar disto, a pesca e declínios populacionais resultaram na sua avaliação como ameaçada de extinção (categoria Vulnerável) no Brasil. A falta de dados básicos sobre seus aspectos populacionais dificultam a elaboração de boas ações de manejo, reforçando a importância de estudos direcionados à espécie. Assim, o objetivo deste trabalho foi estimar o tamanho e estrutura da população de tubarões lixa em ambientes recifais costeiros na Paraíba. Três recifes naturais e três artificiais foram selecionados com base no conhecimento prévio da ocorrência de tubarões lixa nestes locais. Os pontos de coleta foram amostrados entre maio de 2016 e maio de 2017. Os dados obtidos incluíram o total de tubarões presentes durante a amostragem, o total de animais fotografados, com estimativas de comprimento total e sexo, assim como temperatura da água e visibilidade horizontal, ambas no fundo. Fotografias da primeira nadadeira dorsal foram tiradas e imagens consideradas de alta qualidade foram utilizadas no Interactive Identification System – Contour. Estimativas do tamanho populacional foram realizadas utilizando o estimador Jolly-Seber. Dezessete tubarões foram identificados durante 37 saídas de campo, dos quais 76% foram classificados como juvenis. Ocorreram 36 eventos de captura de 13 indivíduos (76% do total de tubarões capturados) dos quais 88% eram juvenis. O estimador resultou em um limite superior populacional de cerca de 50 indivíduos, com a população sendo composta majoritariamente de tubarões juvenis, com uma razão sexual próxima de 1:1. Os resultados apontam para uma população pequena, no entanto, a alta proporção de juvenis provavelmente destaca uma tendência amostral devido à limitação do número de locais amostrados, e sua baixa variação de profundidade já que todos estavam entre 12 – 35m. A alta taxa de recaptura enfatiza a fidelidade de sítio da espécie na área de estudo, a qual somada a população reduzida, aumenta o seu grau de ameaça localmente. Embora os resultados sejam mais relevantes para a classe juvenil, eles reiteram a necessidade de mais estudos populacionais nesta espécie ameaçada de extinção, no Brasil, assim como a necessidade de ações de conservação focados para o tubarão lixa e seus habitats, particularmente em regiões menos estudadas e protegidas, como a Paraíba.

Neotropical hawk-eagles (Spizaetus spp.) are large forest raptors, having low population densities and high sensitivity to human disturbance. The three species of Brazil’s Atlantic forest (S. ornatus, S. melanoleucus, S. tyrannus) are threatened and little is known of many aspects of their biology, such habitat requirements, nesting behavior, and food habitats. Here I present data about the breeding biology, diet and behavior of the Ornate Hawk-Eagle (S. ornatus; OHE) and the Black-and-white Hawk-Eagle (S. melanoleucus; BWHW), and estimations of distribution - extent of occurrence (EOO) - and population sizes for the three hawk-eagles of the southern Atlantic Forest. I compiled data from nine years of field studies done in Rio Grande do Sul and Santa Catarina combined with data from the literature (n = 191 records). I calculated the total amount of forest available for each species by GIS analyses and estimated population sizes based on species density data from the literature. The EOO was 123,551 km² for BWHE, 92,512 km² for OHE, and 67,824 km² for Black Hawk-Eagle (S. tyrannus; BHE). All species experienced more than 30% shrinkage in their historical distribution (before the year 2000). Forest remnants comprise 32% of BHE’s EOO and around 20% for other hawk-eagle species. Population sizes estimated for the southern region were 869 pairs for BHE (1,684 individuals), 1,532 pairs for BWHE (2,849 individuals), and 2,020 pairs for OHE (1,192 individuals). Population size estimates based only on forest patches larger than 10 km² were 542 pairs for BHE (RS = 48 pairs; SC = 494 pairs), 818 pairs for BWHE (RS = 67 pairs; SC = 751 pairs), and 1,178 pairs for OHE (RS = 67 pairs; SC = 1,111 pairs). I recorded displays and copulation of BWHE in July; the nest was built in an inaccessible, emergent tree in the hillside of a valley. Two nests of OHE were found in emergent trees (20 m and 30 m height) measured 138 x 115 x 45 cm and 132 x 100 x 100 cm; one egg was found (64.5 x 51.1 mm). Spizaetus seems to have very variable breeding cycles and begin breeding in the austral winter. I estimated egg laying occurs from July to September with fledging happening 3-4 months later. Diet of OHE consisted mostly of birds (90%) but also some mammals. Individuals of Spizaetus require large, unbroken forest areas to live, and my data reinforce the critical situation of hawk-eagles in southern Atlantic forest. All three species have lost habitat and their distributions have shrunk over the past decades. The estimated population sizes suggest concern and a need for conservation actions. Conservation of large raptors in the Atlantic Forest is not a simple task, requiring the need to preserve and limit the disturbance of remaining forests, establish connectivity among fragments and reduce direct threats to raptors (e.g., persecution). We also need to better understand the ecological requirements of hawk-eagles and establish public policies to protect both species and their habitats. RESUMO Os gaviões do gênero Spizaetus são espécies florestais de grande porte, que possuem baixas densidades populacionais e são sensíveis a alterações geradas pelo homem. As três espécies que ocorrem na Mata Atlântica (S. ornatus, S. melanoleucus, S. tyrannus) estão ameaçadas de extinção e o conhecimento sobre muitos aspectos de sua biologia, como habitat, comportamento reprodutivo e dieta, são pouco conhecidos. Neste trabalho eu apresento dados sobre a biologia reprodutiva, dieta e comportamento do gavião-de-penacho (S. ornatus, SORN) e do gavião-pato (S. melanolecus, SMEL), bem como estimativas da distribuição - extensão de ocorrência (EOO) - e estimativas de tamanho populacional para as três espécies de Spizaetus na porção sul da Mata Atlântica. Foram compilados os registros das três espécies oriundos de nove anos de estudos realizados no Rio Grande do Sul e em Santa Catarina e somados com registros da literatura (n = 191 registros). O total de remanescente de área florestal na área de distribuição de cada espécie foi calculado por análise espacial (SIG). O tamanho das populações foi estimado para cada espécie utilizando dados de tamanho de território e densidade de indivíduos existentes na literatura. A EOO resultante foi 123.551 km² para SMEL, 92.512 km² para SORN e 67.824 km² para o gavião-pega-macaco (S. tyrannus, STYR). A área de distribuição atual das três espécies apresentou uma redução superior a 30% em relação à distribuição histórica (anterior ao ano 2000). Os remanescentes florestais representaram 32% da EOO de STYR e cerca de 20% da EOO de SMEL e SORN. As populações estimadas foram 869 pares para STYR (1.684 indivíduos), 1.532 pares para SMEL (2.849 ind.), e 2.020 pares para SORN (1.192 ind.). Considerando apenas remanescentes florestais com mais de 10 km², as estimativas resultaram em 542 pares para STYR (RS = 48 pares; SC = 494 pares), 818 pares para SMEL (RS = 67 pares; SC = 751 pares), e 1.178 pares para SORN (RS = 67 pares; SC = 1.111 pares). Em julho/2009 eu observei um ninho de gavião-pato, construído em uma árvore emergente na encosta do vale do rio Vacas Gordas e que não pode ser acessado. Comportamento de corte e cópula foi observado na ocasião. Eu encontrei dois ninhos de gavião-de-penacho, construídos em árvores emergentes (20 e 30 metros de altura) que mediram 138 x 115 x 45 cm e 132 x 100 x 100 cm; um ninho continha um ovo (64,5 x 51,1 mm). Indivíduos do gênero Spizaetus aparentam ter um ciclo reprodutivo flexível, iniciando a reprodução durante o inverno austral. A postura foi estimada ocorrendo entre julho e setembro. A saída do filhote do ninho ocorre cerca de 3-4 meses após a postura. O gavião-de penacho consumiu principalmente aves (90%) e mamíferos. Os gaviões do gênero Spizaetus necessitam de grandes áreas de floresta preservada e as estimativas aqui apresentadas reforçam a situação crítica das populações na porção sul da Mata Atlântica. As três espécies apresentaram redução nas áreas de distribuição, com acentuada perda de habitat nas últimas décadas. Os tamanhos populacionais estimados atingiram limiares de risco, que enquadram as espécies nas categorias de ameaça de extinção da IUCN. A conservação de grandes gaviões florestais na Mata Atlântica não é algo simples; é preciso, além de preservar os remanescentes florestais existentes, reduzir a degradação dos mesmos e estabelecer conectividade entre os fragmentos. Além disso, é necessário que as ameaças diretas às aves de rapina sejam controladas (e.g., caça furtiva). Também é urgente que entendamos melhor as necessidades ecológicas estas espécies e que se estabeleçam políticas públicas para a proteção tanto das aves de rapinas quanto de seus habitats.

Este estudo teve como principal objetivo contribuir para a conservacao e o entendimento da historia natural e ecologia de Asthenes luizae (Furnariidae), uma ave pouco conhecida e restrita aos afloramentos rochosos dos campos rupestres da Cadeia do Espinhaco em Minas Gerais, Brasil. Para tal, monitorou-se uma populacao na Serra do Cipo ao longo de seis anos, investigando os habitos de nidificacao, sucesso reprodutivo e demografia, com enfase nos impacto de uma das ameacas mais apontadas para a especie: o nidoparasitismo pelo icterideo Molothrus bonariensis. Os habitos de nidificacao foram comparativamente analisados com o de especies aparentadas de Synallaxini, investigando-se a historia evolutiva de aspectos dos ninhos. As informacoes disponiveis de sua historia de vida e ecologia foram utilizadas para realizar uma Analise de Viabilidade Populacional(AVP), inferindo sobre o risco de extincao e avaliando o grau de ameaca da especie de acordo com os criterios da IUCN. Os principais resultados relacionados a nidificacao foram: seus ninhos (n =81) fechados nao apresentam tuneis ou tubos na entrada lateral; sao compostos predominantemente por gravetos, mas tambem por outros materiais de origem vegetal, mineral e animal, sendo possiveldistinguir tres camadas de acordo com a composicao; a forracao interna cobre todo o interior do ninho; e os locais de nidificacao nao se restringem a canela-de-ema Vellozia nivea (Velloziaceae)como se supunha anteriormente. Registrou-se uma ampla variedade de locais de nidificacao, situados a baixa altura (media = 33,4 cm), a maioria (95%) em plantas de distintas arquiteturas (ao menos 29 especies; 82% endemicas do Espinhaco), mas tambem sobre rochas. A composicao de gravetos e predominante no clado Synallaxini, mas nao em Asthenes, supondo-se que sejam o estado ancestral deste ultimo. Enquanto tuneis ocorrem na maioria dos ninhos de gravetos, nao haevidencia confirmada de que tubos ocorram em Asthenes, estando aparentemente restritos ao clado contendo o genero recem-separado Pseudasthenes e parentes proximos. Os diversos componentesdo sucesso reprodutivo foram baixos, sendo o sucesso de ninhos (10%) um dos menores dentre Passeriformes neotropicais. Perdas parciais de ovos e ninhegos tambem contribuiram com baixas taxas de produtividade (0,12 filhotes/ninho; 1,22 filhotes/ninho bem-sucedido) e fecundidade (c. 0,58 filhotes/femea). A principal causa de insucesso de ninhos foi o nidoparasitismo por M. bonariensis (56% dos fracassos), que ocorreu com elevada frequencia (60%) e intensidade (2,9parasitas/ninho). Uma vez parasitado, a chance do ninho produzir um filhote legitimo e nula. A predacao foi a segunda causa de insucesso de ninhos para A. luizae (33% dos fracassos), mas o principal empecilho em produzir filhotes legitimos ou parasitas (86% dos fracassos totais). Aeliminacao hipotetica do parasitismo indicou que poderiam ser quase duplicados o sucesso de ninhos (18%), a produtividade (0,22 filhotes/ninho) e a fecundidade (c. 0,98 filhotes/femea). A estacao reprodutiva foi extremamente longa, ocupando 67% do ano, o que pode ser um dos escapes do nidoparasitismo pela especie. O monitoramento de individuos marcados (n = 37) e de territorios viii (n = 22) revelou um forte declinio populacional entre 2009 e 2015. Desde o inicio do estudo houve escassez de femeas, refletida no desvio da razao sexual (M:F = 2,7) e baixa proporcao de individuos pareados (47%). A sobrevivencia anual de adultos foi relativamente alta (72%), mas a de femeasadultas (46%) e a de jovens (29%) foram baixas, embora estimadas com maior incerteza. Trocas de territorios foram raras, sugerindo baixas taxas de migracoes. O aumento no numero de territorios vagos (ate 61%) indica que houve baixo recrutamento por natalidade ou imigracao. A densidade media de adultos foi 0,08 individuos/ha de area de estudo e 0,17 individuos/ha de afloramentos rochosos, mas a densidade de individuos maduros (pareados) foi bastante menor (0,03 e 0,07,respectivamente). O tamanho populacional global da especie foi projetado em c. de 21.800 individuos maduros, distribuidos desigualmente entre os tres principais blocos de montanhas doEspinhaco mineiro (700 no norte, 1.900 no central e 19.800 no sul). A AVP projetou altissimas probabilidades de extincao para a populacao no Parque Nacional da Serra do Cipo, indicando que essas sao inviaveis ao longo de 100 anos se mantidas as condicoes atuais (tempo para extincao = 11- 31 anos), mesmo sob modelos mais otimistas. Cenarios alternativos indicaram que a eliminacao dos efeitos da depressao endogamica nao causou impactos significativos, enquanto a eliminacao dos efeitos do nidoparasitismo elevou a taxas de crescimento populacional em 12-50% e adiou a extincao em 2-31 anos. Contudo, nao garantiu a viabilidade da populacao. Analises de perturbacaodemograficas (elasticidade e sensibilidade) indicaram que a mortalidade de femeas adultas foi o parametro cuja variacao e capaz de causar maiores alteracoes na taxa de crescimento e no tempomedio para extincao. No entanto, dentre os niveis de perturbacao avaliados, somente a reducao de 50% na mortalidade de jovens sob o modelo otimista produziria populacoes viaveis. Populacoesequivalentes a populacao global tambem foram inviaveis, extinguindo-se em media em 18-54 anos. No entanto, seriam viaveis sob o modelo otimista na ausencia do nidoparasitismo. O risco de extincao foi alto o suficiente para que A. luizae seja considerada, no minimo, como Vulneravel pelo criterio E da IUCN. Dada a incerteza da eficiencia e a complexidade de um controle direto de M. bonariensis, sugere-se como possivel estrategia de manejo o controle de impactos antropicosprovenientes de queimadas e criacao de gado, que tem o potencial de favorecer a sobrevivencia e a reproducao de A. luizae, alem de controlar indiretamente o nidoparasitismo. This study aimed to contribute to the conservation and understanding of the natural history and ecology of Asthenes luizae (Furnariidae), a little-known bird confined to rocky outcrops habitats of the campos rupestres of the Espinhaco Range in the state of Minas Gerais, Brazil. Over six years I monitored a population in Serra do Cipo to study the nesting habits, reproductive success and demography, focusing on the impact of one of the most mentioned threat to the species: the broodparasitism by the Shiny Cowbird Molothrus bonariensis. Nesting habits were comparatively analyzed with the related species of Synallaxini, investigating the evolutionary history of nest features. I used the available data regarding its life history and ecology to perform a PopulationViability Analysis (PVA), inferring its risk of global extinction and assessing its threatened status according to the IUCN categories and criteria. The main results related to the nesting were: their closed nests (n = 81) do not have entrance tunnels or tubes; are composed mainly of sticks, but also other vegetable, mineral and animal materials; three nest layers can be distinguished according to the composition; the inner lining covers the entire nest interior; and nest sites are not restricted to the plant species Vellozia nivea (Velloziaceae), as previously supposed. I recorded a wide range of nest sites, mainly at a low height (mean = 33.4 cm), mostly (95%) in plants with diverse architectures (at least 29 species, 82% endemic to Espinhaco), but also on rocks. Stick nests wereprevalent in Synallaxini clade, but not among Asthenes, and I suggest that it was the ancestral state of the latter. While tunnels were recorded in most stick-nesters, any confirmed evidence that tubes occurs within Asthenes was found and it appears to be restricted to the clade containing Pseudasthenes and closest relatives. The various components of reproductive success were low, with the nest success (10%) being one of the lowest among Neotropical passerines. Partial losses of eggs and nestlings also contributed to the low productivity rates (0.12 fledglings/nest; 1.22 fledglings/successful nest) and fecundity (c. 0.58 fledglings/female). The main cause of nest failure was the brood parasitism by Shiny Cowbirds (56% of failures), that occurred with high frequency (60%) and intensity (2,9 parasites/nest). Once parasitized, the chance of a nest produce a host fledgling is zero. Predation was the second major cause of nest failure for A. luizae (33% of failures), but was the main obstacle to a nest produce fledglings, host or parasite (86% of total failures). The hypothetical elimination of brood parasitism indicated that it could be nearly duplicate the rate of nest success (18%), nest productivity (0.22 fledglings/nest) and female fecundity (c. 0.98 fledglings/female). The breeding season was extremely long, occupying 67% of the year, which can be one way to the host to escape from brood parasitism. The monitoring of marked individuals (n = 37) and territories (n = 22) revealed a strong population decline between 2009 and 2015. Since the beginning of the study, there was a shortage of females, reflecting in the biased sex ratio (M:F = 2.7) and low proportion of paired individuals (47%). The adult annual x survival was relatively high (72%), but the annual survival of adult females (46%) and juveniles (29%) were low, although estimated with greater uncertainty. Territory switches were rare, suggesting low migration rates. The increase in the number of vacant territories (up to 61%) indicates that there was low recruitment by birth or immigration. The average density of adults was 0.08 individuals/ha of study area and 0.17 individuals/ha of rocky outcrops, but the density of mature individuals (paired) was much lower (0.03 and 0.07, respectively). The species' global population size was projected as c. 21,800 mature individuals, unevenly distributed among the three main blocks of the Espinhaco Range mountains (700 in the north, 1,900 in central and 19,800 in the south). The AVP projected very high extinction probabilities for the population in the Serra do Cipo National Park, indicating that it is inviable over 100 years if kept current conditions, even under the most optimistic models (time to extinction = 11-31 years). Alternative scenarios indicated that the elimination of the effects of inbreeding depression did not cause significant impacts, whileeliminating brood parasitism effects increased the population growth rates at 12-50% and delayed the time of extinction in 2-31 years. However, it did not ensure the population viability. Demographic perturbation analysis (elasticity and sensitivity) indicated that mortality of adult females was the parameter whose variation cause greatest changes in the population growth rate and the mean time to extinction. However, among the perturbation levels employed, only the 50%reduction in juvenile mortality under the optimistic model would produce viable populations. Populations equivalent to the global population size were also nonviable, extincting within 18-54 years. However, it would be viable under the optimistic model in the absence of brood parasitism.The risk of extinction is high enough to consider A. luizae threatened, at least in the Vulnerable category under the IUCN criterion E. Given the uncertainty of the efficiency and the complexity of a direct control of cowbirds, I suggest as a possible management strategy to control human impacts derived from fires and cattle, which have the potential to promote both the survival and reproduction of A. luizae, in addition to indirectly control the brood parasitism.

Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós–Graduação em Oceanografia Biológica, Instituto de Oceanografia, 2013. População é a unidade fundamental da conservação e sua forma mais simples de monitoramento envolve a amostragem temporal regular para a determinação do status populacional. Uma das populações de baleia jubarte do Hemisfério Sul utiliza a costa do Brasil entre maio e dezembro para se reprodução e criação dos filhotes. Esta população, denominada “estoque reprodutivo A” pela Comissão Internacional da Baleia, tem mostrado sinais de recuperação após um marcado declínio devido a caça e um longo período de moratória. Esta população se concentra principalmente no Banco dos Abrolhos (BA), onde águas calmas e quentes parecem constituir um hábitat ideal. Este estudo teve o objetivo de estimar o tamanho da população de jubartes para o ano de 2011, bem como predizer a distribuição de grupos na costa brasileira. O método de amostragem de distâncias foi implementado, e modelos hierárquicos Bayesianos foram propostos para estimar a abundância. Modelos auto-regressivos condicionais foram aplicados para predizer a densidade em células de 0.5° de latitude e longitude. O tamanho da população foi estimado em 10,160 baleias (Cr.I.95%=6,607-17,692). As maiores densidades foram encontradas entre o Banco dos Abrolhos e a Baía de Todos os Santos (BA). Os resultados sugerem que o aumento populacional acarreta a expansão da população para além do Banco dos Abrolhos. Population is the fundamental unit of conservation and its simplest monitoring tool involves regular sampling over time for population assessing status. One of the Southern Hemisphere humpback whale populations winters at the Brazilian coast typically from May to December where breeding and calving occur. This population, labeled as “breeding stock A” by International Whaling Commission, has shown signs of recovery after the long period of whaling. The goal of this study was to estimate the population size of humpback whales up to 2011, and predict group distribution along the Brazilian coast. Distance sampling methods were implemented and hierarchical Bayesian models were proposed to estimate abundance. Conditional auto-regressive models were used to predict the density in a lattice of 0.5° of latitude and longitude. Population size was estimated at 10,160 whales (Cr.I.95%=6,607-17,692). Highest densities were predicted to occur between Abrolhos Bank and Todos os Santos Bay (BA). The results suggest that the population increase leads to a population expansion beyond Abrolhos Bank.

Financiadora de Estudos e Projetos The capture-recapture process, largely used in the estimation of the number of elements of animal population, is also applied to other branches of knowledge like Epidemiology, Linguistics, Software reliability, Ecology, among others. One of the _rst applications of this method was done by Laplace in 1783, with aim at estimate the number of inhabitants of France. Later, Carl G. J. Petersen in 1889 and Lincoln in 1930 applied the same estimator in the context of animal populations. This estimator has being known in literature as _Lincoln-Petersen_ estimator. In the mid-twentieth century several researchers dedicated themselves to the formulation of statistical models appropriated for the estimation of population size, which caused a substantial increase in the amount of theoretical and applied works on the subject. The capture-recapture models are constructed under certain assumptions relating to the population, the sampling procedure and the experimental conditions. The main assumption that distinguishes models concerns the change in the number of individuals in the population during the period of the experiment. Models that allow for births, deaths or migration are called open population models, while models that does not allow for these events to occur are called closed population models. In this work, the goal is to characterize likelihood functions obtained by applying methods of elimination of nuissance parameters in the case of closed population models. Based on these likelihood functions, we discuss methods for point and interval estimation of the population size. The estimation methods are illustrated on a real data-set and their frequentist properties are analised via Monte Carlo simulation. O processo de captura-recaptura, amplamente utilizado na estimação do número de elementos de uma população de animais, é também aplicado a outras áreas do conhecimento como Epidemiologia, Linguística, Con_abilidade de Software, Ecologia, entre outras. Uma das primeiras aplicações deste método foi feita por Laplace em 1783, com o objetivo de estimar o número de habitantes da França. Posteriormente, Carl G. J. Petersen em 1889 e Lincoln em 1930 utilizaram o mesmo estimador no contexto de popula ções de animais. Este estimador _cou conhecido na literatura como o estimador de _Lincoln-Petersen_. Em meados do século XX muitos pesquisadores se dedicaram à formula ção de modelos estatísticos adequados à estimação do tamanho populacional, o que causou um aumento substancial da quantidade de trabalhos teóricos e aplicados sobre o tema. Os modelos de captura-recaptura são construídos sob certas hipóteses relativas à população, ao processo de amostragem e às condições experimentais. A principal hipótese que diferencia os modelos diz respeito à mudança do número de indivíduos da popula- ção durante o período do experimento. Os modelos que permitem que haja nascimentos, mortes ou migração são chamados de modelos para população aberta, enquanto que os modelos em que tais eventos não são permitidos são chamados de modelos para popula- ção fechada. Neste trabalho, o objetivo é caracterizar o comportamento de funções de verossimilhança obtidas por meio da utilização de métodos de eliminação de parâmetros perturbadores, no caso de modelos para população fechada. Baseado nestas funções de verossimilhança, discutimos métodos de estimação pontual e intervalar para o tamanho populacional. Os métodos de estimação são ilustrados através de um conjunto de dados reais e suas propriedades frequentistas são analisadas via simulação de Monte Carlo.

This study aimed at estimating the population size and attitudes of residents towards caring for domestic dogs, through questionnaire surveys, as well as the frequency of these animals in different habitats (anthropic and forest patch), using scent stations. The study was conducted in a severely fragmented area of the Brazilian Atlantic Forest. A large number of unrestricted dogs was recorded, averaging 6.2 ind/km². These dogs have owners and are regularly fed. Dog records decreased from the anthropogenic matrix to the forest patch edge, which suggests that dogs act as an edge effect on forest patches. Encounters between domestic dog and wild animals can still be frequent in severely fragmented landscapes, mainly at the forest edges. However the fact that most dogs have an owner and are more frequent in the anthropic habitat suggests that their putative effects are less severe than expected for a carnivore of such abundance, but the reinforcement of responsible ownership is needed to further ameliorate such effects. Este estudo tem como objetivo estimar o tamanho populacional de cães e o manejo dado a eles pela população humana através de questionários, bem como estimar a frequência de ocorrência desses animais em diferentes hábitats (antrópico e fragmento florestal), usando armadilhas de pegadas. O estudo foi realizado em uma área altamente fragmentada de Mata Atlântica no Estado de São Paulo. Encontramos um grande número de cães soltos, uma média de 6.2 ind/km². Esses animais possuem donos e são constantemente alimentados. O número de registros de cães diminui da matriz antrópica para o interior dos fragmentos florestais, o que sugere que cães podem atuar como um efeito de borda sobre os fragmentos. Ainda assim, encontros entre cães domésticos e animais silvestres podem ser frequentes em paisagens intensamente fragmentadas, principalmente nas bordas dos fragmentos. No entanto, o fato de que os cães são mais frequentes no ambiente antrópico e a maioria tem dono, sugere que o impacto causado por eles no ambiente natural é menos severo que o esperado para um carnívoro em tal abundância, mas a exigência de responsabilidade por parte dos donos pode reduzir ainda mais este impacto.

Em 2005, um conjunto de entidades iniciou formalmente um processo através do Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Renováveis (IBAMA) para a criação de uma unidade de conservação de proteção integral englobando os estuários Camurupim/Cardoso e Timonha/Ubatuba, no Estado do Piauí. Entre as espécies-bandeira capazes de angariar apoio para a proteção dos referidos estuários, encontra-se o cavalo-marinho Hippocampus reidi, foco do presente trabalho. Os resultados do nosso estudo de um ano, na área em questão, mostraram a existência de uma população residente de H. reidi, encontrada em 19 habitats e com uma das mais altas densidades já reportadas para a espécie (0,04 ind/m²). Esta informação reforça a importância crucial de apoio adicional à proteção daqueles ambientes, que além de abrigar H. reidi, uma espécie listada como Deficiente de Dados pela União Internacional para a Conservação da Natureza (IUCN), é local de ocorrência da tataruga-de-couro (Dermochelys coriacea), espécie considerada Criticamente Ameaçada e o peixe-boi-marinho (Trichechus manatus manatus) uma espécie Vulnerável, de acordo com a Lista Vermelha das espécies ameaçadas da IUCN - 2008.

A diversidade de primatas neotropicais está representada por 128 espécies, e no Brasil 26 estão em categorias de ameaça de extinção e 24 são endêmicas. Desses primatas ameaçados, 15 espécies ocorrem na Floresta Atlântica. A Mata do Paraíso, maior fragmento desse bioma em Viçosa, MG, possui área de 384,5 ha, cuja fauna de primatas está representada por Callicebus nigrifrons (Spix, 1823) e Callithrix sp. Este estudo objetivou estimar a densidade e tamanho populacional, bem como determinar a abundância dos primatas na Mata do Paraíso. Para estimar a densidade e tamanho populacional, foram percorridos cinco transectos lineares de 1 km cada, dispostos paralelamente no interior da mata, seguindo-se as premissas da metodologia Distance para transectos lineares. Os dados foram coletados de agosto de 2004 a fevereiro de 2006, durante 70 levantamentos, totalizando 82,7 km percorridos e 12 avistamentos para cada espécie dos referidos primatas. Adicionalmente, para determinar a abundância das espécies, consideraram-se visualizações obtidas em trilhas acessórias. Obteve-se uma densidade de 4,51 (IC = 2,40 - 8,48) grupos/km² para C. nigrifrons e de 7,45 (IC = 3,82 - 14,54) grupos/km² para Callithrix sp. A abundância de C. nigrifrons correspondeu a 1,43 indivíduo/10 km percorridos e a de Callithrix sp., 1,17 indivíduo/10 km percorridos. O tamanho populacional estimado para C. nigrifrons foi de 28 indivíduos e para Callithrix sp., de 86. Por fim, esses resultados corroboram a necessidade de novas pesquisas, objetivando detectar flutuações populacionais ao longo do tempo, com o intuito de preservar e manejar essas espécies. The diversity of neo-tropical primates is represented by 128 species, with 26 threatened species, 24 of which are endemic of Brazil. Of these threatened primates, 15 species occur in the Atlantic Forest, indicating an alarming state of conservation due to anthropogenic factors. Mata do Paraíso, the largest fragment of this biome in Viçosa, Minas Gerais, comprises an area of 384.5 ha, whose primate population is represented by Callicebus nigrifrons (Spix, 1823), known by titi monkey, and Callithrix sp., denominated marmosets. The present study aimed at estimating the density and population size of these species, as well as at determining their abundance in the area. Five linear 1 km transects, placed in a parallel fashion in a representative portion of the forest, were covered by following the premises of the methodology Distance for linear transects. The data were collected from August 2004 to February 2006, with 70 samplings, totaling 82.7km being sampled, with 24 primate detections. A density of 4.51groups/km² for Callicebus nigrifrons and 7.45groups/km² for Callithrix sp was obtained. Callicebus nigrifrons' abundance corresponded to 1.43 individuals/10 km sampled, and the abundance of Callithrix sp. corresponded to 1.17 individuals/10 km sampled. The population size of Callicebus nigrifrons was estimated in 28 individuals and for Callithrix sp., in 86 individuals. This result corroborates the need for further research to detect fluctuations along time, aiming to preserve and manage these species.

The aim of this research was to study the effects of recurrent selection on the genetic variability of UNB-2U popcorn population after three cycles of recurrent selection (mass selection, full-sib selection and S1 families) based on RAPD markers in 30 progenies from each selection cycle. There was no significant variation between the C0 and C2 cycles based on RAPD, showing that the use of different recurrent selection strategies in the cycles did not decrease genetic variability, due to the size of the population selected in the different cycles. The significant difference observed between mean values of C1 and C2 cycles was attributed to the smaller population size in C1 generation. Individuals were distributed into three large clusters and 20% of the individuals were placed in a group different from their original cycle. This can be explained by alleles’ transference from one generation to another and by the relationship between cycles Com o objetivo de averiguar o impacto da seleção recorrente na variabilidade genética de progênies da população de milho pipoca UNB-2U, após 3 ciclos de seleção recorrente por diferentes métodos (massal, irmãos completos e famílias S1), 30 progênies de cada ciclo foram avaliadas por marcadores RAPD. Constatou-se que não houve variação molecular significativa entre os ciclos C0 e C2, revelando que o uso de diferentes estratégias de seleção recorrente não promoveu estreitamento genético, em razão do tamanho populacional selecionado nos ciclos. A diferença significativa na média entre os ciclos C1 e C2 é atribuída ao menor tamanho populacional da geração C1. A distribuição dendrogrâmica dos indivíduos revelou a formação de 3 grandes grupos, sendo que 20% dos indivíduos foram alocados em grupo distinto do ciclo a que pertenciam, em razão da transferência de alelos nas subseqüentes gerações, bem como da própria semelhança entre os ciclos

Submitted by Guilherme Lemeszenski (guilherme@nead.unesp.br) on 2013-08-22T18:57:56Z No. of bitstreams: 1 S0034-71082000000300006.pdf: 184290 bytes, checksum: a08732c4064d802c543822ed15ad01ae (MD5) Made available in DSpace on 2013-08-22T18:57:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 S0034-71082000000300006.pdf: 184290 bytes, checksum: a08732c4064d802c543822ed15ad01ae (MD5) Previous issue date: 2000-08-01 Made available in DSpace on 2013-09-30T19:53:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0034-71082000000300006.pdf: 184290 bytes, checksum: a08732c4064d802c543822ed15ad01ae (MD5) S0034-71082000000300006.pdf.txt: 26870 bytes, checksum: 0c306c0668f588a94f77ca9e0463b184 (MD5) Previous issue date: 2000-08-01 Submitted by Vitor Silverio Rodrigues (vitorsrodrigues@reitoria.unesp.br) on 2014-05-20T15:13:48Z No. of bitstreams: 2 S0034-71082000000300006.pdf: 184290 bytes, checksum: a08732c4064d802c543822ed15ad01ae (MD5) S0034-71082000000300006.pdf.txt: 26870 bytes, checksum: 0c306c0668f588a94f77ca9e0463b184 (MD5) Made available in DSpace on 2014-05-20T15:13:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0034-71082000000300006.pdf: 184290 bytes, checksum: a08732c4064d802c543822ed15ad01ae (MD5) S0034-71082000000300006.pdf.txt: 26870 bytes, checksum: 0c306c0668f588a94f77ca9e0463b184 (MD5) Previous issue date: 2000-08-01 A partir de perfis populacionais experimentais de linhagens do díptero forídeo Megaselia scalaris, foi determinado o número mínimo de perfis amostrais que devem ser repetidos, via processo de simulação bootstrap, para se ter uma estimativa confiável do perfil médio populacional e apresentar estimativas do erro-padrão como medida da precisão das simulações realizadas. Os dados originais são provenientes de populações experimentais fundadas com as linhagens SR e R4, com três réplicas cada, e que foram mantidas por 33 semanas pela técnica da transferência seriada em câmara de temperatura constante (25 ± 1,0ºC). A variável usada foi tamanho populacional e o modelo adotado para cada perfíl foi o de um processo estocástico estacionário. Por meio das simulações, os perfis de três populações experimentais foram amplificados, determinando-se, dessa forma, o tamanho mínimo de amostra. Fixado o tamanho de amostra, simulações bootstrap foram realizadas para construção de intervalos de confiança e comparação dos perfis médios populacionais das duas linhagens. Os resultados mostram que com o tamanho de amostra igual a 50 inicia-se o processo de estabilização dos valores médios. Based on experimental population profiles of strains of the fly Megaselia scalaris (Phoridae), the minimal number of sample profiles was determined that should be repeated by bootstrap simulation process in order to obtain a confident estimation of the mean population profile and present estimations of the standard error as a precise measure of the simulations made. The original data are from experimental populations founded with SR and R4 strains, with three replicates, which were kept for 33 weeks by serial transfer technique in a constant temperature room (25 ± 1.0°C). The variable used was population size and the model adopted for each profile was a stationary stochastic process. By these simulations, the three experimental population profiles were enlarged so as to determine minimum sample size. After sample size was determined, bootstrap simulations were made in order to calculate confidence intervals and to compare the mean population profiles of these two strains. The results show that with a minimum sample size of 50, stabilization of means begins. Universidade Estadual Paulista IBILCE Departamento de Ciências de Computação e Estatística Universidade Estadual Paulista IBILCE Departamento de Biologia Universidade Estadual Paulista IBILCE Departamento de Ciências de Computação e Estatística Universidade Estadual Paulista IBILCE Departamento de Biologia

The aim of this research was to study the effects of recurrent selection on the genetic variability of UNB-2U popcorn population after three cycles of recurrent selection (mass selection, full-sib selection and S1 families) based on RAPD markers in 30 progenies from each selection cycle. There was no significant variation between the C0 and C2 cycles based on RAPD, showing that the use of different recurrent selection strategies in the cycles did not decrease genetic variability, due to the size of the population selected in the different cycles. The significant difference observed between mean values of C1 and C2 cycles was attributed to the smaller population size in C1 generation. Individuals were distributed into three large clusters and 20% of the individuals were placed in a group different from their original cycle. This can be explained by alleles' transference from one generation to another and by the relationship between cycles. Com o objetivo de averiguar o impacto da seleção recorrente na variabilidade genética de progênies da população de milho pipoca UNB-2U, após 3 ciclos de seleção recorrente por diferentes métodos (massal, irmãos completos e famílias S1), 30 progênies de cada ciclo foram avaliadas por marcadores RAPD. Constatou-se que não houve variação molecular significativa entre os ciclos C0 e C2, revelando que o uso de diferentes estratégias de seleção recorrente não promoveu estreitamento genético, em razão do tamanho populacional selecionado nos ciclos. A diferença significativa na média entre os ciclos C1 e C2 é atribuída ao menor tamanho populacional da geração C1. A distribuição dendrogrâmica dos indivíduos revelou a formação de 3 grandes grupos, sendo que 20% dos indivíduos foram alocados em grupo distinto do ciclo a que pertenciam, em razão da transferência de alelos nas subseqüentes gerações, bem como da própria semelhança entre os ciclos.