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International audience; Afin d’améliorer la sécurité des batteries Li-ion, des études sont actuellement menées sur une nouvelle génération d’accumulateur tout solide au lithium. Dans ces dispositifs, l’électrolyte liquide inflammable est remplacé par un électrolyte solide, ce qui rend possible l’utilisation de Li métallique à l’électrode négative et devrait permettre un gain en termes de densité d’énergie massique et volumique. Cependant, de nombreux verrous technologiques doivent être levés avant d’envisager une commercialisation de ces systèmes. Les récentes recherches sur les électrolytes solides ont permis de développer des matériaux ayant des conductivités ioniques comparables à celles des électrolytes liquides (10-2-10-3 S.cm-1). Un des facteurs limitant les performances de ces systèmes tout-solide est la résistance interfaciale entre les électrodes et l’électrolyte1. Ainsi, il apparaît crucial de caractériser le comportement de ces interfaces, aussi bien lors du montage des accumulateurs, qu’en cyclage. Parmi les électrolytes solides les plus prometteurs, les sulfures et notamment l’argyrodite (Li5,7PS4,7Cl1,3)2 possèdent une haute conductivité ionique, une densité relativement faible, et peuvent être mis en forme de manière relativement aisée. Cependant, leur domaine de stabilité en potentiel est restreint (1,8 - 2,5V/Li+/Li). Ainsi, nous avons choisi de l’associer à une électrode positive Li [LitTi1-t] S2 (t

International audience; Lors de l'exploitation des fronts rocheux, les maîtres d'ouvrages (routes, réseaux ferrés) et les carriers sont confrontés à des problématiques communes et également spécifiques à leur activité (enjeux économiques et sanitaires). L'utilisation de l'imagerie 2D et 3D peut permettre d'aider à l'optimisation de l'exploitation des talus rocheux. Elle peut également aider à la détection de configurations amiantifères par la combinaison d'informations structurale et géologique du talus. L'analyse de stabilité des fronts rocheux, mais aussi l'optimisation des tirs, nécessitent la détection des variations géologiques et des discontinuités. Par ailleurs, dès que l'on excave un matériau rocheux, la présence potentielle de particules fines doit être identifiée pour éviter tout risque sanitaire. Les carriers cherchent, en plus, à détecter des minéraux pénalisants pour la vente de produits issus de leur gisement, tels que les sulfures, la calcite, la silice et les argiles. Pour répondre, à ces enjeux économiques et sanitaires, les géologues effectuent un travail de cartographie manuel minutieux, long, couteux et fastidieux selon la surface concernée. Or, la constante évolution de la puissance de calculs des ordinateurs permet à des techniques numériques autrefois lourdes en temps de calculs, d'être résolues sur des ordinateurs personnels. Segmenter une image 2D d'un front rocheux en entités lithologiques homogènes est envisageable avec des moyens réduits. Il en est de même pour la détection des discontinuités sur des modèles 3D ou 2D. Ces techniques restent semi-automatiques, mais peuvent fortement diminuer le temps de cartographie. De plus, si les images 2D sont acquises en suivant la procédure adaptée à la photogrammétrie, il est alors possible de produire un maillage texturé et précis en 3D du front rocheux grâce aux outils proposés en libre accès sur le net notamment VisualSfM, MicMac ou commercialisés et peu coûteux comme Metashape. Ainsi, un archivage de sa géométrie peut alors être mis en place pour un suivi précis de l'exploitation d'une carrière. Ces archives aideront à l'optimisation des séquences d'exploitation par une meilleure connaissance du massif et à éviter les zones indésirables en suivant des règles de décision objectivées. Concernant les maîtres d'ouvrages, la capture des images avant et après travaux peut également servir d'archives pour des raisons de maintenance des ouvrages. Quel que soit l'acteur, l'archivage peut être utile à des fins de preuve en cas de litige. Les carriers et les maîtres d'ouvrages sont également confrontés au besoin de localiser les particules fines de minéraux pour des raisons différentes selon l'acteur concerné. Les carriers cherchent à produire des granulats utilisables dans les bétons, plus avantageux à la vente, mais plus contraignant qualitativement que les granulats routiers. Par exemple, la présence de sulfures dans les granulats dégrade la qualité des bétons et est donc à éviter. Par ailleurs, pour les maîtres d'ouvrages des déblais rocheux le long des voies de communication, l'application de la loi de repérage de l'amiante avant travaux à partir du 1er mars 2019, les obligera à localiser l'amiante sur des kilomètres de linéaire. Il faut réduire l'exposition des travailleurs, et donc minimiser le temps nécessaire pour reconnaître les structures « amiantifères ».

PurposeIn the context of urban extension, the depletion of natural resources for construction constitutes a crucial issue. Specifically, in the field of earthworks, the amounts of materials can be massive and pose the crucial problem of resource shortage. Therefore, the reuse of excavated urban soils from foundation layers as new earthwork construction materials appears to be a sustainable and promising solution. Before repurposing, a better knowledge of urban soils and their potential pollutant load is compulsory.Materials and methodsIn this paper, two soils excavated from the town of Paris are studied. After the stripping of their surface, to remove organic matter and surface pollution, the matrixes were submitted to elemental analyses using ICP-OES, C/S measurements, and XRF techniques. The elemental analyses were carried out on the whole materials, on three granulometric fractions (400m) and on the families of artifacts (i.e., construction and demolition wastes, natural gravel, industrial wastes, magnetic, and non-magnetic slags) found in the soils. The combination of elemental analyses and a least absolute residual (LAR) procedure were used to quantify artifact contributions in all granulometric fractions.Results and discussionThe soils exhibit evidence of anthropic inputs with high contents of pollutants under the forms of carbonaceous, sulfur mineral and metallic alloys. Carbonaceous and trace pollutions are concentrated in magnetic and non-magnetic slags, while sulfur and strontium pollutions are concentrated in gypsum components. In both cases, all the granulometric fractions (including whole material) can be retrieved as a combination of artifact composition, suggesting that the Technosols mainly result from the mixture of these artifacts. The amounts of natural material, gypsum components, and magnetic slags increase with the fineness of the fractions. In contrary, the amount of non-magnetic slags decrease with the fineness of the fractions and suggests that the processes of slag weathering are not similar: carbonaceous slags are more stable than iron-enriched slags.ConclusionsThe elemental analyses of granulometric fractions of soils and the artifacts using LAR analyses help in identifying the compositions of each granulometric fraction and give insight into the evolution of artifacts in the soil. These tools are also promising regarding the assessment of geo-environmental characteristics of urban soils, which in turn provides relevant information regarding management and reuse.

Alvinocaridid shrimp are an emblematic taxon at hydrothermal vents on the Mid-Atlantic Ridge, but how they locate active vents and detect their habitat is still enigmatic. They might use the chemical and thermal signatures of the hydrothermal fluid as orientation cues. The chemo- and thermosensory abilities of the hydrothermal species Mirocaris fortunata and the coastal species Palaemon elegans were investigated using various approaches. Structural features of the peripheral and central nervous system were used as rough estimates of their olfactory abilities. The co-ionotropic receptor IR25a, involved in chemodetection, was identified and located in the antennal appendages. A new electroantennography method was developed to test the detection of hydrothermal fluid chemicals. Several attraction tests were conducted at atmospheric and in situ pressure to investigate the behavior of the vent and shallow-water species when exposed to a food odor, sulfide and warm temperatures. Altogether, these results provide advances in the knowledge of the chemosensory biology of vent shrimp, and a substantial background for future researches on sensory adaptations to the hydrothermal environment.; Les crevettes Alvinocarididae sont emblématiques des sources hydrothermales de la Dorsale Médio-Atlantique, mais les mécanismes qui leur permettent de détecter leur habitat sont énigmatiques. Il est supposé que les signatures chimique et thermique du fluide hydrothermal leur servent de repères pour s’orienter. Les facultés chimio- et thermosensorielles de l’espèce hydrothermale Mirocaris fortunata et de l’espèce côtière Palaemon elegans ont été étudiées avec plusieurs approches. Des traits structuraux du système sensoriel périphérique et central ont été comparés pour inférer sur les facultés olfactives de chaque espèce. L’expression du récepteur ionotropique IR25a dans les organes chimiosensoriels a été mesurée. Une technique d’électroantennographie a été mise au point afin de tester la détection de composés chimiques de fluide hydrothermal par les crevettes. Plusieurs expériences à pression atmosphérique et in situ ont été réalisées afin d’étudier le comportement des espèces hydrothermale et côtière exposées à une odeur de nourriture, du sulfure ou des températures relativement chaudes. L’ensemble des résultats montre que M. fortunata présente un système chimio- et thermosensoriel fonctionnel et apporte des bases substantielles pour approfondir les connaissances sur les adaptations sensorielles en milieu hydrothermal profond.

International audience

National audience

This thesis aimed to study the geochemical microenvironments created by Zostera noltei meadows and its root system in Arcachon Basin and to evaluate the effect of these microenvironments 1) on living benthic foraminifera ecology, a group of organisms present in large densities in sediment which impact on marine biogeochemical cycles remain poorly known and 2) on the chemical species and associated benthic fluxes. To fulfill these objectives, a multidisciplinary strategy was developed. The study of benthic foraminiferal ecology at centimeter scale, conducted in sediments with or without vegetation in February and July 2011, has shown the presence of three major species with specific metabolisms. Zostera noltei meadows seem to influence the densities and the living depth of heterotrophic (Ammonia tepida) and mixotrophic (Haynesina germanica) calcareous species, present in the sediment surface. The third species (Eggerella Scabra), which anaerobic metabolism is still to discover, is found throughout the sedimentary column and seems to prefer the organic matter coming from the degradation of the seagrass. In surface sediment, the contribution of these three species to aerobic remineralization was estimated at 7%, i.e. 5 times more than the maximum rates previously recorded in marine environments. The presence of the seagrass also influences geochemistry where enriched iron and depleted sulfide structures are observable in 2D thanks to DET-DGT gels developed here. Dissolved phosphorus depended on seagrass uptake and was highly concentrated only as scattered spots. A slice of sediment, taken face to face with the DET-DGT gel, was also conducted during this study aiming to map the solid phase and foraminiferal density. Despite this work is still in progress, methods such as X-ray microfluorescence and microtomography showed promising perspectives. New research pathways have been opened through technological developments and innovative approaches combining physiology, ecology, and geochemistry., Cette thèse visait l’étude des micro-environnements géochimiques créés par la présence de l’herbier de Zostera noltei et de son réseau racinaire dans le Bassin d’Arcachon ainsi que ses effets 1) sur l’écologie des foraminifères benthiques, un groupe d’organismes présent en grand nombre dans les sédiments et dont l’influence sur les cycles biogéochimiques reste mal connue et 2) sur les espèces chimiques et les flux benthiques associés. Pour y répondre, une stratégie multidisciplinaire a été mise en place. L’étude écologique des foraminifères benthiques à l’échelle centimétrique, conduite dans des sédiments avec et sans végétation en février et juillet 2011, a montré la présence de trois espèces majeures aux métabolismes spécifiques. L’herbier de Zostera noltei semble influencer la densité et la profondeur de vie des espèces calcaires hétérotrophe (Ammonia tepida) et mixotrophe (Haynesina germanica), présentes près de la surface des sédiments. La troisième espèce (Eggerella scabra), au métabolisme anaérobie encore inconnu, est retrouvée sur au moins 7 cm de sédiment et semble préférer le carbone organique issu de la dégradation de l’herbier. En surface, la contribution des foraminifères à la reminéralisation aérobie a été évaluée à 7 % soit 5 fois plus que lors des études précédentes dans d’autres environnements marins. La présence de l’herbier influence également la géochimie du sédiment où des structures enrichies en fer dissous et appauvries en sulfure sont observables en 2D grâce aux gels DET-DGT développés ici. Le phosphate dissous semble dépendre de la demande des zostères et est observé à forte concentration uniquement sous forme de spots. Une tranche de sédiment, prélevée en vis-à-vis du gel DET-DGT visait la réalisation de cartes de la phase solide et de la densité des foraminifères. Bien que ce travail reste inachevé, des méthodes comme la micro-fluorescence et la micro-tomographie aux rayons X donnent des perspectives prometteuses. De nouvelles voies de recherches ont ainsi été ouvertes grâce à des méthodologies innovantes combinant physiologie, écologie et géochimie.

International audience; Soils in boundary conditions of contrasting ecosystems generally show unique features. Transition often leads to changes in soil-forming processes, whereby the environment never comes to equilibrium and therefore the soil chemistry and mineralogy show different influences. Such an environment was analysed in the Saloum River basin, west-central Senegal. The objective was to identify the main pedogenic processes prevailing in this saline and acid pedoenvironment and to assess the influence of environmental factors (climate, topography, soil salinity and acidity) on local soil formation and mineral distribution. The terrace landscape is built up by a floodplain, a low terrace, which is still influenced by groundwater, and a middle terrace. The results show that soil properties are strongly influenced by hydrology, salinity and acidity in the entire toposequence: Gleyic Hyposalic and Hypersalic Solonchaks (Sulfatic) in the floodplain, Haplic Gleysols (Thionic) in the low terrace, and Endogleyic Arenosols in the middle terrace. The oxidation of pyrite followed by the redistribution of the main products (Fe2+ and SO42-) represents the major chemical process responsible for iron oxide and jarosite formation. Mineral distribution and crystallinity are linked to the landscape position, which controls the hydrological behaviour and reactions of Fe and S ions. Finally, we observed intrapedon processes such as gleysation, sulfidisation and sulfurisation, as well as interpedon processes such as salinisation, colluvio-alluviation and lateral eluviation. The combination of processes depends strongly on the landscape positions.

International audience; Living organisms are subjected to oxidative stress conditions which are characterized by the production of reactive oxygen, nitrogen, and sulfur species. In plants as in other organisms, many of these compounds have a dual function as they damage different types of macromolecules but they also likely fulfil an important role as secondary messengers. Owing to the reactivity of their thiol groups, some protein cysteine residues are particularly prone to oxidation by these molecules. In the past years, besides their recognized catalytic and regulatory functions, the modification of cysteine thiol group was increasingly viewed as either protective or redox signaling mechanisms. The most physiologically relevant reversible redox post-translational modifications (PTMs) are disulfide bonds, sulfenic acids, S-glutathione adducts, S-nitrosothiols and to a lesser extent S-sulfenyl-amides, thiosulfinates and S-persulfides. These redox PTMs are mostly controlled by two oxidoreductase families, thioredoxins and glutaredoxins. This review focuses on recent advances highlighting the variety and physiological roles of these PTMs and the proteomic strategies used for their detection.

International audience; The main objective of this study was to develop a methodology to predict the hydrogen sulphide content of raw biogas produced during anaerobic mono-digestion of a bioenergy feedstock. Detailed chemical and biological analyses were made on 37 different feedstocks originating from urban wastewater treatment plants, farms, agri-food facilities and municipal wastes. Total sulphur content ranged from 1 to 29.6mgS/kg of total solids, and 66% of the feedstocks analysed contained less than 5mgS/kg of total solids. The biochemical methanogenic potential and biochemical biogas potential of each feedstock combined with its S content were used to predict appearance of H 2S in the raw biogas. A model to link H 2S in biogas with the carbon:sulphur ratio was established. Based on this model, a minimum carbon:sulphur ratio of 40 is required in feedstock to limit the concentration of hydrogen sulphide in raw biogas to less than 2% (volume/volume).

La nécessité de rénover les réseaux d’assainissement des grandes villes et les besoins de construire de nouvelles structures conduisent les gestionnaires de réseaux d’assainissement et les fabricants de canalisation à rechercher des solutions pour obtenir des installations d’assainissement durables. Parmi les détériorations rencontrées dans ces structures, 9% peuvent être attribués à la biodétérioration des matériaux cimentaires. Cette étude a deux objectifs principaux. Le premier est de développer un essai accéléré reproductible en laboratoire et qui donne des résultats proches de ceux obtenus sur site. Le second est d’étudier la biodétérioration des matériaux cimentaires pour mieux comprendre les mécanismes et plus spécifiquement la différence de comportement entre les matériaux à base de ciment d’aluminate de calcium (CAC) et de ciment Portland ordinaire (OPC). Dans ce cadre, différentes formulations cimentaires ont été exposées in situ afin de déterminer les paramètres influant sur la biodétérioration. En parallèle, des expériences en laboratoire ont été réalisées pour mieux comprendre chaque étape du mécanisme de biodétérioration. Les résultats des expositions sur site montrent que les matériaux à base de CAC ont une durabilité plus importante que les autres formulations cimentaires. Les études réalisées en laboratoire permettent d’attribuer ces meilleures performances à la teneur en aluminium qui inhibe la croissance des microorganismes tout en protégeant la matrice grâce à la précipitation d’une couche d’alumine hydratée dans la porosité et à la surface de ces matériaux et qui maintient le pH à 3,5-4. La chimie de surface a également un rôle important en favorisant ou non l’oxydation abiotique de l’H2S. Les résultats des expositions sur site et des différents essais de laboratoire ont été utilisés pour développer un essai accéléré donnant des résultats prometteurs. The need for renovation of sewer networks in major cities and the necessity to build new structures lead managers of sewer pipe and manufacturers to seek for solutions for sustainable sanitation. 9% of damages encountered in these structures can be attributed to the biodeterioration of cementitious materials. This study has two main objectives. The first one is to develop an accelerated reproducible laboratory test that gives results similar to those obtained on site. The second is to study the biodeterioration of cementitious materials in order to better understand the mechanisms and more especially the durability differences between materials based on calcium aluminate cement (CAC) and ordinary Portland cement (OPC). Within this framework, different cement formulations were exposed in situ to identify the parameters influencing biodeterioration. Meanwhile, laboratory experiments were conducted to better understand each step of the biodeterioration’s mechanisms. Results of on site exposition show that materials based on CAC have a greater durability than other cement formulations. Laboratory studies assign these best performances to the aluminum content which inhibits the growth of microorganisms while protecting the matrix by precipitation of a hydrated alumina layer in the porosity and on the surface of these materials. This layer maintains the pH at 3.5-4. Surface chemistry was shown to play an important role in catalyzing abiotic oxidation of H2S. The results of on-site exhibitions and various laboratory tests were used to develop an accelerated test giving promising results.

Gypsum crystals occur in Vertisols on the west coast of New Caledonia. These soils are derived from the weathering of basic rocks that contain no gypsum. The sulphur isotopic ratio 34 S/ 32 S was used as tracer to identify the origin of the gypsum. A total of 26 measurements of δ 34 S were made on gypsum crystals from the Vertisols and compared to those of continental sulphates and to marine gypsum in tidal flats. The δ 34 S value of the crystals located in New Caledonian Vertisols decreases with increasing distance from the coast. This suggests that the gypsum in the Vertisols comes from two sources: an oceanic source where the major part of the sulphur is introduced by atmospheric precipitation, and a continental source where sulphides disseminated in various subsurface deposits are oxidized. Gypsum from atmospheric precipitation penetrates the Vertisols through vertical cracks that probably formed in dry seasons during the last glacial period.

Dans les réseaux d'assainissement, les bétons sont exposés à un environnement très agressif. En effet, les effluents contiennent des composes sulfurés organiques et inorganiques qui peuvent être utilisés par des bactéries sulfato-réductrices pour former du sulfure d'hydrogène. Ce dernier, sous forme gazeuse, se condense sur les parois en béton des réseaux et est oxydé sous la forme d'acide sulfurique par des bactéries sulfo-oxydantes. La dégradation des structures d'assainissement en béton par l'acide sulfurique biogénique est donc caractérisée par des effets combinés de plusieurs mécanismes. Ces mécanismes physico-chimiques peuvent conduire à l'apparition de fissuration du béton et à la corrosion des armatures en acier conduisant à des dommages irréversibles des réseaux d'assainissement. Pour maîtriser ces dégradations, mais aussi pour limiter la formation de sulfure d'hydrogène (qui est un gaz malodorant et très toxique), les gestionnaires ont plusieurs solutions basées sur l'oxygénation des effluents, l'addition de sels ferreux, etc. Quand le béton est dégradé, les solutions consistent à réparer ou à remplacer ce béton par de nouveaux matériaux plus résistants à base cimentaire ou polymère. Toutes ces solutions ne sont toutefois pas toujours totalement efficaces si le processus global de fonctionnement des réseaux d'assainissement n'est pas considéré. Pour répondre aux demandes concernant le choix du matériau adéquat pour un environnement donné et un processus défini, l'objectif de ce travail est d'étudier les mécanismes de biodégradation du béton et de considérer la durabilité à la fois du matériau et de la structure. Des propositions pour de nouvelles solutions limitant les dégradations sont aussi exposées.

Respiration is a fundamental catalytic process in the aerobic and anaerobic energy metabolism of many prokaryotic and most eukaryotic organisms. The major difference between these organisms is that various organic and inorganic substrates can be used to donate or accept electrons in the bacterial and archaeal kingdoms, in various ranges of redox potentials in order to drive aerobic (with oxygen as electron acceptor) and anaerobic respiratory pathways. During the last few decades, several bacterial strains have been reported to use chlorinated compounds as terminal electron acceptor under anaerobic conditions, in a process called dehalorespiration. Among more than thirty dehalorespiring bacterial strains isolated to date, the Dehalococcoides group and the Gram-positive genus Desulfitobacterium comprise the largest number of reductively dehalogenating pure cultures. While most Dehalococcoides isolates appeared as highly specialized bacteria that depend strictly on dehalorespiration for growth, members of the genus Desulfitobacterium are very versatile microorganisms with regards to the electron donors and acceptors utilized. Globally, this remarkable prokaryotic respiratory flexibility is guaranteed by an elaborate reservoir of complex redox enzymes. Regarding the specific electron transport chain involved in dehalorespiration, rather little knowledge has been obtained so far with the exception of the key enzyme, the reductive dehalogenase, well described in several dehalorespiring bacteria, and of little information on b-type cytochromes and menaquinones. The overall objective of this thesis was to identify new possible components of the electron transport chain by comparative proteomic analysis, to investigate the presence/absence of a regulatory pathway leading to the biosynthesis of the reductive dehalogenase, and finally to characterize newly identified proteins that might support the dehalorespiration process. A comparative 2D proteomic analysis was performed on Desulfitobacterium hafniense strain TCE1, a bacterium capable of using tetrachloroethene (PCE) as electron acceptor. Soluble and membrane-associated proteins were analyzed from cells cultivated on different couples of electron donors and acceptors, lactate – fumarate (LF), lactate – PCE (LP), hydrogen – fumarate (HF), and hydrogen – PCE (HP). Cells growing on LP or HP revealed 72 and 93 protein spots in membrane fraction, and 49 and 12 spots in soluble fraction that correspond to increasingly expressed proteins compared to their fumarate-grown counterparts. More than 80 proteins were identified by mass spectrometry analysis, among which the key enzyme in the dehalorespiration process, the PCE reductive dehalogenase (PceA), as well as interesting candidates which could support dehalorespiration. The possible role of these proteins was analyzed in further details. Involved in energy and carbon metabolisms, electron transfer flavoproteins (ETF) and proteins related to the Wood-Ljungdahl pathway of CO2 fixation were identified in HP growth conditions. Proteins associated to stress response such as the phage shock protein PspA, and to regulatory pathways, the transcriptional repressor CodY, were also observed and discussed. Although only slightly induced by PCE, an additional protein displaying homology to sulfur-transferases was found in a large abundance in the fraction of membrane-associated proteins. This protein was named PhsE, as the corresponding gene belongs to a gene operon with homology to the molybdoenzyme thiosulfate/polysulfide reductase operons (phs/psr) found in Salmonella typhimurium or Wolinella succinogenes. PhsE protein architecture resembles to the class of tandem-domain rhodaneses, with the particularity to contain two active-site cysteines. It is also characterized by the presence of a typical lipoprotein signal peptide (LSP), which anchors PhsE on the outside of the cytoplasmic membrane. In the genome sequence of D. hafniense strain Y51, phsE (DSY3892) is part of an apparent operon encoding one out of about sixty different members of the complex iron-sulfur molybdoenzyme (CISM) family. PhsA, the catalytic molybdoenzyme, displays significant sequence homology with the thiosulfate/polysulfide reductase (PhsA/PsrA) subfamily. So far no other CISM operon has been described with a sulfur-transferase encoding gene. Despite the numerous functions proposed for rhodanese in cyanide detoxification, Fe/S cluster formation, oxidative stress protection, sulfur mobilization and involvement in general sulfur metabolism, the question of the physiological role of PhsE remains open. The expression of the Phs complex appeared to be influenced by the addition of sulfide in the culture medium, generally used as reducing agent in anaerobic cultures. Sulfide is known to affect the intracellular redox status. Therefore, it is hypothesized that PhsE might be involved in the control of the redox balance of the cell, notably by scavenging potentially toxic reduced sulfur species. To support data obtained at the protein level during proteomic analysis, genes and the corresponding messenger RNA from D. hafniense strain TCE1 were studied. While in silico DNA sequence analysis did not reveal any obvious features regulating the transcription of pceA, puzzling results were obtained in proteomic analysis showing an almost complete absence of PceA in cells grown on fumarate. To characterize this phenomenon, starting from a routinely PCE-grown inoculum, strain TCE1 was repeatedly transferred on medium containing fumarate as electron acceptor. The pool of pceA gene in the total culture DNA decreased significantly already after fifteen successive sub-cultures on fumarate, suggesting a shift in strain TCE1 population upon relief of the PCE selection pressure. Consequently the level of pceA mRNA and PceA protein also followed the same trend. Secondly, a PCE pulse experiment was performed in an anaerobic continuous culture of strain TCE1 on fumarate. It revealed that PCE itself has no power of induction on genetic level, except for the positive effect observed on pspA transcripts which encodes a protein involved in cell membrane integrity. Finally the expression study of the phsFABCDE gene cluster revealed that all phs genes are co-transcribed, and most likely build an operon. Thus phsE seemed to be strictly coregulated with the phs operon, and not under the influence of another promoter. In conclusion, proteomic analysis enabled to investigate the general physiological status of Desulfitobacterium hafniense strain TCE1 during dehalorespiration. A tentative model of the dehalorespiration pathway is proposed in summarizing recent data obtained on the topology of the PCE reductive dehalogenase and on sequence similarity with proteins involved in other anaerobic respiratory pathways. Regarding the possible support of PhsE towards the dehalorespiration, the complicated chemistry of sulfur does not allow to clearly attribute a function to the Phs complex, but there are indications that it might build a 'sulfur' oxidoreductase which could catalyze the conversion of sulfide to polysulfide with concomitant electron transfer to the quinone pool. The sulfide oxidation activity might be useful to D. hafniense to scavenge toxic sulfur species, avoiding that they disturb the redox balance of the cell, and redox-sensitive enzymatic complexes.

Les matériaux constitutifs des réseaux d'assainissement sont parfois exposés à un environnement très agressif. En effet, les effluents contiennent des composes sulfurés organiques et inorganiques qui peuvent être utilisés par des bactéries sulfato-réductrices pour former du sulfure d'hydrogène. Ce dernier, sous forme gazeuse, se condense sur les parois des réseaux et est oxydé sous la forme d'acide sulfurique par des bactéries sulfo-oxydantes. Le LCPC a entrepris une étude pluriannuelle permettant d'améliorer la compréhension des mécanismes de dégradation mis en jeu, et ainsi, proposer des solutions de construction, de réhabilitation et de réparation adaptées. L'objectif de cette contribution est de présenter, d'une part, l'organisation de ces recherches et, d'autre part, les premiers résultats obtenus sur les matériaux cimentaires. Pour la partie expérimentale, deux types d'appareillage ont été mis en place, l'un permettant de réaliser des essais de vieillissement purement chimique en milieu acide, et l'autre, des essais de vieillissement biochimique en présence de bactéries permettant de simuler l'environnement présent dans les réseaux d'assainissement. L'analyse des données des mesures de pertes de masse, des observations MEBE complétées par des microanalyses EDS, de diffractométrie des rayons X, etc. des matériaux cimentaires étudiés, a permis de quantifier les dégradations et de montrer l'avantage des essais de vieillissement par voie biochimique.

The southern Bolivian Altiplano is a volcanic area which contains numerous undrained basins occupied by playas and saline lakes, locally named salars. Solutes carried by springs and rivers into the salars originate mostly from the alteration of the volcanic rocks and the re-solution of ancient buried evaporites. Both weathering and hydrothermal alteration lead to Na-HCO 3 inflow waters of similar composition. High contents of lithium and boron are not specifically related to hydrothermal activity. Evaporite leaching leads to Na-Cl inflow waters of higher salinity. Atmospheric precipitation contributes only a small amount of Ca and SO 4 , and very little Na or Cl. The calculated evaporative evolution of the inflow waters shows that about half of them should become highly alkaline brines and the other half should end as near-neutral brines. However, alkaline soda lakes are rare in this region. Most lake brines are of the Na-Cl and Na-Cl-(SO 4 ) types. To understand this anomaly one characteristic sequence of evaporating waters was studied in detail. Precipitation of calcite and Mg-smectites accounts only partially for the reduction of alkalinity. A further loss of alkalinity is probably related to the oxidation of wind-blown native sulfur in peripheral ponds. Wind-blown sulfur is also deposited around the lakes, on the drainage basins. In the rainy season, ephemeral streams carry along sulfur particles in permanent pools of the preconcentration areas. A hydrologic control of brine chemistry is suspected. Inflow waters, that should become alkaline, appear to evolve to neutral brines if they remain in contact with atmospheric dust and peripheral colluvium for a long time. On the contrary, inflow waters to soda lakes are generally close to the shore and have only minimal contact with atmospheric dust and peripheral sediments. Presently, all lakes are at relatively low levels, and inflow waters often drain an important area of the drainage basin before reaching the topographic low. In the past, lakes were at higher levels and less interaction occurred between inflow waters, atmospheric dust, and peripheral sediments. As a result, the chemistry of some lakes may have changed during the Quaternary.

This thesis was carried out in the frame of an EU-FP6 project (Bioshale) and has, as main objective a better understanding of metal concentration processes in black shale ores and their beneficiation by hydro-and biotechnologies. The low mature organic matter (OM) of the Lubin ore (Kupferschiefer) played a role during syn-, dia- and epigenetic metal enrichment processes. The ore contains 7% of Cu as well as Ag, Co, Ni, Pb, Zn, as sulphides (chalcocite, covellite, bornite, chalcopyrite...). The concentration of some elements (Cu-Fe-Co-Ni-V) is low into the OM (=0.2%). The more mature OM from Polkowice (Kupferschiefer) contains less associated elements (Fe- V-S). Base metal contents are lower (90%) than during heap leaching (7%) ainsi que Ag, Co, Ni, Pb, Zn,... y sont principalement présents sous forme de chalcocite, covellite, bornite, chalcopyrite... Certains éléments (Cu, Fe, Co, Ni, V) se retrouvent à de faibles teneurs dans la MO (=0,2%). La MO plus mature de Polkowice (Kupferschiefer), contient moins d'éléments associés (Fe, V, S). Les teneurs en métaux de base y sont plus faibles (90%) que par lixiviation en tas (

Two strains of Thiobacillus, T. ferrooxidans and T. thiooxidans, have been isolated from a bacterial inoculum cultivated during a one-year period in a 1001 continuous laboratory pilot for treatment of an arsenopyrite/pyrite concentrate. The optimum pH for the growth of both strains has been found to be between 1.7 and 2.5. Because of the high metal toxicity in bioleach pulps, the tolerance of T. ferrooxidans and T. thiooxidans with respect to iron and arsenic has been studied. The growth of both strains is inhibited with 10 g/l of ferric ion, 5 g/l of arsenite and 40 g/l of arsenate. 20 g/l of ferrous iron is toxic to T. ferrooxidans but 30 g/l is necessary to impede the growth of T. thiooxidans.

Many porphyry-type (Cu-Au) and neutral epithermal (Pb-Zn and Au ± Ag) ore deposits are encountered in the region of the Apuseni Mountains, located at the foot of the Carpathian chain in the Western Romania. These deposits are related to a neogene andesitic volcanism. In order to demonstrate possible genetic relationships between the porphyry-type and neutral epithermal deposits, the Bolcana porphyry has been investigated since it is surrounded by a number of epithermal low-sulfidation veins with a Pb-Zn ± Au mineralisation. These veins are currently mined at the Troita and Magura sites. A structural analysis and a 3D modelling pf these deposits indicate that the geometry and orientation of fractures and mineralized vein are consitent both with direction of regional extension and with a NW-Se pregression of the different andesitic intrusions. In order to establish precisely the temporal relationship between the different ore deposits, a Re-Os dating method has been developped and applied on pyrite wich is ubiquitous in all of the deposits. This method enabled us to assign an age of 10.9 ± 1.9 Ma for the porphyry-hosted mineralization. The ages obtained for the epithermal systems are somewhat approximative as perturbations of the Re-Os system are observed for these environements. A fractionation of rhenium responsible for a significant enrichment in this element for the apical zone of the porphyry has been demonstrated. This enrichment is most probably related to a maximum boiling event , which may also explain a similar enrichment in arsenic for the pyrite in the same zone. The sources for the metals have been characterized at the district scale by combining two isotopic systems (Re-Os and Pb-Pb) on both pyrite and galena. The osmium data indicate that the Troita deposti has compostion which is similar to that of the Bolcana porphyry. In constrast the results obtained for the Magura deposits indicate the Re-OS system has in this case been perturbed due to a weathering of nearby ophiolites which probably contributed some osmium to the pyrite at Magura. Additional results obtained for common lead seem to confirm the osmium data, with an osmium isotopic composition which has a more important mantle-derived component than at Troita., La région des monts Apuseni, au pied de la chaîne des Carpathes en Roumanie, comporte de nombreux gisements de type porphyre (Cu-Au) et épithermal neutre (Pb-Zn et Au ± Ag) liés à un volcanisme andésitique néogène. Afin de comprendre les relations existant entre les gisements de type porphyre et épithermal neutre, le porphyre de Bolcana a été étudié car il possède la particularité d'être bordé par un ensemble de filons épithermaux low-sulfidation minéralisés à Pb-Zn ± Au exploités au niveau des mines de Troita et de Magura. Une étude structurale et une modélisation en 3D de ces différents gisements montrent que la géométrie et l'orientation des fractures et des veines minéralisées sont compatibles avec les directions d'extension régionale et la progression du NW vers le SE des différentes intrusions andésitiques de la région. Dans le but d'établir de manière précise les relations temporelles entre les différents gisements du secteur, un développement méthodologique a permis de réaliser des datations, par l'utilisation du système isotopique Re-Os, directement sur la minéralisation sulfurée la plus ubiquiste du système : la pyrite. L'application de cette méthodologie sur les pyrites des minéralisations a ainsi permis d'obtenir un âge de 10,9 ± 1,9 Ma pour le porphyre. Les âges obtenus dans les systèmes épithermaux restent approximatifs car des perturbations du système isotopique Re-Os sont observées dans ces environnements plus superficiels. Un fractionnement du rhénium avec un enrichissement important au niveau de la zone apicale du porphyre a été mis en évidence, et qui doit être sûrement relié à une zone d'ébullition maximale. Une répartition similaire des teneurs en arsenic des pyrites a pu y être observée. Une caractérisation des sources des métaux a été réalisée à l'échelle du district en utilisant de manière croisée, sur pyrite et galène, deux systèmes isotopiques (Re-Os et Pb-Pb). L'osmium montre que le gisement de Troita possède une signature similaire au porphyre de Bolcana alors que les résultats obtenus pour le gisement de Magura indiquent que le système a subi des perturbations, interprétées comme liées à un lessivage des ophiolites encaissantes et une incorporation partielle de leur signature. Le plomb commun confirme ces données d'osmium avec une signature isotopique plus mantellique que celui de Troita.

The implementation of in situ autonomous observatories for biogeochemicalstudies in the open ocean water column and in deep-sea chemosynthetic environments is crucial for the understanding of these ecosystems. We focussed this study on silicate and sulphide, two key compounds of the marine food chain. A voltammetric method for sulphide measurements on silver electrode is presented, and a new method for quantitative determination based on the solubility difference between silver chloride and silver sulphide is proposed. A completely reagentless method for silicate measurements is developed using molybdate and protons produced during molybdenum oxidation. These analyticaldevelopments allowed us to validate a submersible potentiostat, first step toward a new sensor for in situ measurements. A Drake Passage water masses analysis is also performed using data collected during the Drake ANTIII/3 oceanographic cruise in 2006., La réalisation d'observatoires biogéochimiques autonomes pour l'étude de la colonne d'eau dans l'océan ouvert et des écosystèmes chimiosynthétiques profonds est une étape primordiale dans l'acquisition de données océaniques pour une meilleure compréhension des écosystèmes. Nous nous intéressons ici à l'acide silicique et aux ions sulfure, composés clés de la chaîne alimentaire marine. Nous proposons une méthode de mesure voltammétrique des ions sulfure sur électrode d'argent ainsi qu'une mesure originale sans calibration basée sur la différence de solubilité entre le chlorure d'argent et le sulfure d'argent. Uneméthode d'analyse de l'acide silicique autonome en réactifs est développée grâce aux molybdates et aux protons libérés lors de l'oxydation du molybdène. Ces développements analytiques ont permis de participer à la validation d'un potentiostat immergeable autonome, premier pas vers un capteur pour la mesure de ces paramètres in situ. En parallèle une analyse des masses d'eau du Passage de Drake est réalisée grâce aux données hydrographiques collectées pendant la campagne Drake ANT XXIII/3 en 2006.

The phenomenon of summer mortalities of the Pacific cupped oyster Crassostrea gigas is observed in France since the beginning of the 90's. These mortalities are classically associated to younger stages and summer temperatures and occur during the reproduction period of the animal. The studies undertaken during the project Morest (2001-2005), showed that a number of biological and environmental risks, the interaction of them induces lethal stresses for animals in physiological weakness, exists in summer. Among these risks, that which is withstood by the oysters bred close to the sediment proved to be significant in intertidal areas. In Quiberon bay (southern Brittany, France), the breeding practices of sowing oysters in deep water is thus likely to expose oysters to these adverse conditions. The follow-up of mortality operated on the leasing grounds of the bay indicates a large variability according to the bay sectors, as well in term of absolute level of mortality as of differential between oysters bred on the ground and in open water. In the same periods, experiments confirmed that the oysters bred close to the sediment showed different physiological parameters (maturation, index of vitality) and growth compared to those kept at an elevation of 60cm from the ground. However, the levels of mortality did not reflect these differences in 2003 and 2004. The existence of reduced compounds (sulphide and ammonia) inside the sediment, and their potential flux into the suprabenthic water is required to explain this sediment effect. The results show that the solid sediment of the bay of Quiberon is a potential source of these toxic compounds, which can be found in the water column. The sulphide and ammonia concentrations measured in the water column are however below their values of acute toxicity, according to the low values of mortality recorded in 2003 and 2004. Measurements of ecotoxicity of the sediment and water column showed generally low values, lower than those found in intertidal areas., Le phénomène des mortalités estivales de l'huître creuse Crassostrea gigas est observé en France depuis le début des années 90. Ces mortalités sont classiquement associées à des stades jeunes et des températures estivales et surviennent au cours de la période de reproduction de l'animal. Les études menées dans le cadre du projet Morest (2001-2005), ont montré qu'il existait, en période estivale, des risques d'origines biologiques et environnementales, dont l'interaction induisait des stress létaux pour des animaux en situation de faiblesse physiologique. Parmi ces risques, celui subi par les élevages à proximité du sédiment s’est avéré important sur estran. La pratique culturale des semis en eau profonde en baie de Quiberon (Morbihan) est donc susceptible d'exposer les huîtres à ces conditions défavorables. Le suivi de mortalité opéré sur les concessions de la baie dénote une variabilité importante selon les secteurs de la baie, tant en terme de niveau absolu de mortalité que de différentiel entre les huîtres au sol et en pleine eau. Expérimentalement, l'étude a confirmé que les huîtres élevées à proximité du sédiment présentaient des différences physiologiques (maturation, indice de vitalité) et de croissance par rapport à celles élevées en pleine eau. Ces différences ne se répercutent cependant pas, en 2003 et 2004, sur le niveau de mortalité. L'existence de substances réduites (sulfure et ammonium) dans le sédiment, et leur potentiel de diffusion dans l'eau suprabenthique a été recherchée pour expliquer cet impact du sédiment. Les résultats montrent que le sédiment consolidé de la baie de Quiberon possède le potentiel pour être la source de ces substances toxiques, qui peuvent se retrouver dans la colonne d'eau. Les concentrations de sulfure et d'ammonium mesurées en 2003 et 2004 dans la colonne d'eau sont restées en deçà des valeurs de toxicité aiguë pour ces substances, dans un contexte global de faible mortalité. Les mesures d'écotoxicité du sédiment ont montré des valeurs généralement faibles, et inférieures à celles mesurées sur estran.

En 1993, j'obtenais un poste de Maître de Conférences à Roscoff et, début 1994, suite à la nomination d'André Toulmond au poste de Directeur de l'Observatoire Océanologique de Roscoff, celui-ci me confiait la responsabilité de l'équipe de recherche d'Ecophysiologie. Issue du rapprochement d’un groupe de phycologie benthique et d’un groupe de physiologie comparée, cette équipe est structurée autour d'une thématique commune, l’étude des mécanismes d’échange de métabolites et de leurs adaptations. Ainsi, nos études portent sur des organismes vivant dans des milieux marins particulièrement contraignants, la zone intertidale en régime mégatidal et les sources hydrothermales profondes, et nous nous intéressons à des fonctions diverses, respiration et excrétion chez les animaux, respiration et photosynthèse chez les végétaux. Mais, au-delà de cette diversité de modèles et de milieux d'étude, nous partageons surtout une approche comparative et intégrée. Comparative, car les problèmes biologiques que nous cherchons à comprendre sont étudiés en utilisant la variété des réponses offertes par les différentes espèces modèles que nous sélectionnons. Et intégrée car dans l'étude d'un problème donné nous nous efforçons d'aborder différentes échelles d’organisation biologique. Le pivot central, à la fois point de départ et objectif ultime, c'est la compréhension du fonctionnement de l'organisme dans son milieu, véritable définition de l'écophysiologie. Mais pour arriver à cette compréhension nous nous efforçons de décortiquer les mécanismes sous-jacents, jusqu'à l'échelle moléculaire si cela s'avère possible et nécessaire, en essayant de dégager des processus généraux à partir des relations structure-fontion particulières que nous sommes amenés à décrire. Enfin, plus récemment, nous nous sommes intéressés à la dimension évolutive de ces problèmes en travaillant à l'échelle de la population ou de l'espèce, analysant notamment nos résultats en termes de phylogénie. La double signification du terme adaptation prend alors tout son sens, à la fois processus physiologique permettant à un organisme de moduler les propriétés de tel ou tel système de façon à s'accommoder des variations du milieu dans lequel il vit, mais également le résultat d'un processus évolutif associant mutations et sélection naturelle et ayant abouti à l'espèce considérée. Dans l'un ou l'autre cas, je suis persuadé que l'approche comparative peut se révéler extrêmement fructueuse, surtout lorsque l’on s’intéresse à des milieux « extrêmes » dans lesquels les adaptations, qu’elles soit physiologiques ou évolutives, sont exacerbées. Cette démarche se rapproche de celle, courante dans le domaine de la recherche médicale, qui consiste à étudier des cas pathologiques (donc « anormaux ») pour en inférer des règles physiologiques « normales ».Naturellement, une telle approche, aussi transversale, réclame un éventail de techniques très large qui dépasse largement les capacités d'un seul individu. La constitution d'une équipe de recherche polyvalente prend alors tout son sens et, à la suite d'André Toulmond, je m'efforce de maintenir et de développer ce potentiel au sein de l'équipe d'Ecophysiologie. Celle-ci réunit ainsi des collaborateurs aux compétences diverses ce qui nous permet de maitriser un certain nombre des techniques nécessaires à la réalisation des projets abordés : anatomie et histologie (techniques de microscopie), biochimie fonctionnelle et structurale (enzymologie, spectroscopie), biologie moléculaire (séquençage, phylogénie), etc. Mais il n'en demeure pas moins essentiel de nous appuyer sur des collaborations scientifiques nationales et internationales. D'une part avec des équipes ayant une vision plus large, plus écologique, des milieux que nous étudions tout en nous offrant un accès privilégié aux campagnes océanographiques . D’autre part, avec des équipes ayant une approche plus pointue, plus biophysique, et maîtrisant parfaitement l'une ou l'autre des techniques qui nous sont nécessaires .Dans le texte qui suit, j'essaierai d'illustrer les deux approches évoquées ci-dessus, en me limitant à deux grands projets dans lesquels je suis plus particulièrement impliqué : •l'approche intégrée pour comprendre les mécanismes de transport du dioxyde de carbone et de l'hydrogène sulfuré chez le vestimentifère Riftia pachyptila;•l'approche comparative de l'équilibre acide-base et du transport de l'oxygène chez les crustacés hydrothermaux. A la suite de chacune des présentations rédigées en français, on trouvera une copie des articles originaux correspondants. Mes autres travaux concernent l'étude du transport de l'oxygène chez deux annélides polychètes inféodées au milieu hydrothermal: Alvinella pompejana, le ver de Pompéï qui colonise les cheminées, et Branchipolynoe, polynoidé commensal des modioles. Ces travaux ont fait l'objet de la thèse de Stéphane Hourdez et des articles qui en sont issus. Enfin, je concluerai en essayant de répondre à une question qui m’est souvent posée : pourquoi diable aller chercher des modèles biologiques aussi loin que sur les sources hydrothermales profondes ?

En 1993, j'obtenais un poste de Maître de Conférences à Roscoff et, début 1994, suite à la nomination d'André Toulmond au poste de Directeur de l'Observatoire Océanologique de Roscoff, celui-ci me confiait la responsabilité de l'équipe de recherche d'Ecophysiologie. Issue du rapprochement d’un groupe de phycologie benthique et d’un groupe de physiologie comparée, cette équipe est structurée autour d'une thématique commune, l’étude des mécanismes d’échange de métabolites et de leurs adaptations. Ainsi, nos études portent sur des organismes vivant dans des milieux marins particulièrement contraignants, la zone intertidale en régime mégatidal et les sources hydrothermales profondes, et nous nous intéressons à des fonctions diverses, respiration et excrétion chez les animaux, respiration et photosynthèse chez les végétaux. Mais, au-delà de cette diversité de modèles et de milieux d'étude, nous partageons surtout une approche comparative et intégrée. Comparative, car les problèmes biologiques que nous cherchons à comprendre sont étudiés en utilisant la variété des réponses offertes par les différentes espèces modèles que nous sélectionnons. Et intégrée car dans l'étude d'un problème donné nous nous efforçons d'aborder différentes échelles d’organisation biologique. Le pivot central, à la fois point de départ et objectif ultime, c'est la compréhension du fonctionnement de l'organisme dans son milieu, véritable définition de l'écophysiologie. Mais pour arriver à cette compréhension nous nous efforçons de décortiquer les mécanismes sous-jacents, jusqu'à l'échelle moléculaire si cela s'avère possible et nécessaire, en essayant de dégager des processus généraux à partir des relations structure-fontion particulières que nous sommes amenés à décrire. Enfin, plus récemment, nous nous sommes intéressés à la dimension évolutive de ces problèmes en travaillant à l'échelle de la population ou de l'espèce, analysant notamment nos résultats en termes de phylogénie. La double signification du terme adaptation prend alors tout son sens, à la fois processus physiologique permettant à un organisme de moduler les propriétés de tel ou tel système de façon à s'accommoder des variations du milieu dans lequel il vit, mais également le résultat d'un processus évolutif associant mutations et sélection naturelle et ayant abouti à l'espèce considérée. Dans l'un ou l'autre cas, je suis persuadé que l'approche comparative peut se révéler extrêmement fructueuse, surtout lorsque l’on s’intéresse à des milieux « extrêmes » dans lesquels les adaptations, qu’elles soit physiologiques ou évolutives, sont exacerbées. Cette démarche se rapproche de celle, courante dans le domaine de la recherche médicale, qui consiste à étudier des cas pathologiques (donc « anormaux ») pour en inférer des règles physiologiques « normales ».Naturellement, une telle approche, aussi transversale, réclame un éventail de techniques très large qui dépasse largement les capacités d'un seul individu. La constitution d'une équipe de recherche polyvalente prend alors tout son sens et, à la suite d'André Toulmond, je m'efforce de maintenir et de développer ce potentiel au sein de l'équipe d'Ecophysiologie. Celle-ci réunit ainsi des collaborateurs aux compétences diverses ce qui nous permet de maitriser un certain nombre des techniques nécessaires à la réalisation des projets abordés : anatomie et histologie (techniques de microscopie), biochimie fonctionnelle et structurale (enzymologie, spectroscopie), biologie moléculaire (séquençage, phylogénie), etc. Mais il n'en demeure pas moins essentiel de nous appuyer sur des collaborations scientifiques nationales et internationales. D'une part avec des équipes ayant une vision plus large, plus écologique, des milieux que nous étudions tout en nous offrant un accès privilégié aux campagnes océanographiques . D’autre part, avec des équipes ayant une approche plus pointue, plus biophysique, et maîtrisant parfaitement l'une ou l'autre des techniques qui nous sont nécessaires .Dans le texte qui suit, j'essaierai d'illustrer les deux approches évoquées ci-dessus, en me limitant à deux grands projets dans lesquels je suis plus particulièrement impliqué : •l'approche intégrée pour comprendre les mécanismes de transport du dioxyde de carbone et de l'hydrogène sulfuré chez le vestimentifère Riftia pachyptila;•l'approche comparative de l'équilibre acide-base et du transport de l'oxygène chez les crustacés hydrothermaux. A la suite de chacune des présentations rédigées en français, on trouvera une copie des articles originaux correspondants. Mes autres travaux concernent l'étude du transport de l'oxygène chez deux annélides polychètes inféodées au milieu hydrothermal: Alvinella pompejana, le ver de Pompéï qui colonise les cheminées, et Branchipolynoe, polynoidé commensal des modioles. Ces travaux ont fait l'objet de la thèse de Stéphane Hourdez et des articles qui en sont issus. Enfin, je concluerai en essayant de répondre à une question qui m’est souvent posée : pourquoi diable aller chercher des modèles biologiques aussi loin que sur les sources hydrothermales profondes ?

BACKGROUND—Mucins play an important protective role in the colonic mucosa. Luminal factors modulating colonic mucus release have been not fully identified. AIM—To determine the effect of some dietary compounds on mucus discharge in rat colon. METHODS—An isolated vascularly perfused rat colon model was used. Mucus secretion was induced by a variety of luminal factors administered as a bolus of 1 ml for 30 minutes in the colonic loop. Mucin release was evaluated using a sandwich enzyme linked immunosorbent assay supported by histological analysis. RESULTS—The three dietary fibres tested in this study (pectin, gum arabic, and cellulose) did not provoke mucus secretion. Luminal administration of sodium alginate (an algal polysaccharide used as a food additive) or ulvan (a sulphated algal polymer) induced a dose dependent increase in mucin discharge over the concentration range 1-25 mg/l (p

Biological tests were carried out using static bioassay systems to determine the median lethal concentration of total sulfide (H2S, HS, S2) for African catfish (Heterobranchus longifilis, Valenciennes, 1840) at fry and juvenile stages.