1. Organizace standardů pro otevřenou a FAIR neurovědu: International Neuroinformatics Coordinating Facility
- Author
-
Prasun Kumar Roy, Luciano Milanesi, Gary F. Egan, Thomas Wachtler, David N. Kennedy, Paul H. E. Tiesinga, Jeffrey S. Grethe, Tong Boon Tang, Satrajit S. Ghosh, Jan G. Bjaalie, Roman Moucek, Samir Das, Eric Tatt Wei Ho, Linda Lanyon, Mathew Abrams, Trygve B. Leergaard, Maryann E. Martone, Helen S. Mayberg, Stephen C. Strother, Jean-Baptiste Poline, Daniel K. Wójcik, Wojtek Goscinski, and Jeanette Hellgren Kotaleski
- Subjects
Neuroinformatics ,FAIR principy ,Computer science ,Process (engineering) ,Best practice ,rganizace standardů ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Underpinning research ,neuroinformatika ,AIR principles, standards organization ,Community standards ,Biomedicine ,030304 developmental biology ,0303 health sciences ,INCF endorsement process ,Neurology & Neurosurgery ,FAIR principles ,business.industry ,INCF ,General Neuroscience ,tandardy a osvědčené postupy ,Neurosciences ,Reproducibility of Results ,proces schvalování v INCF ,neuroinformatics ,Standards and best practices ,standards and best practices ,1.5 Resources and infrastructure (underpinning) ,Transparency (behavior) ,eurovědy ,Data sharing ,Networking and Information Technology R&D (NITRD) ,Standards organization ,Biochemistry and Cell Biology ,business ,Neuroscience ,Responsible Consumption and Production ,030217 neurology & neurosurgery ,Software ,Information Systems - Abstract
Velká potřebnost koordinace standardů a osvědčených postupů v neurovědách souvisí s úsilím o to, aby se neurovědy staly disciplínou zaměřenou na data. Globální iniciativy a projekty ve výzkumu mozku jsou připraveny generovat obrovské množství neurovědeckých dat. Zároveň se neurovědy, stejně jako mnohé domény v biomedicíně, potýkají s otázkami transparentnosti, přesnosti a reprodukovatelnosti. Široce používané a validované standardy a osvědčené postupy jsou klíčem k řešení výzev ve výzkumu, který využívá velká i malá data, protože tyto standardy a postupy jsou nezbytné pro integraci různých dat a pro rozvoj robustní, efektivní a udržitelné infrastruktury podporující otevřené a reprodukovatelné neurovědy. Vypracování komunitních standardů a jejich přijetí je však obtížné. Současná situace se vyznačuje nedostatkem robustních, validovaných standardů a množstvím překrývajících se, nedostatečně rozvinutých, nevyzkoušených a nedostatečně využívaných standardů a osvědčených postupů. International Neuroinformatics Coordinating Facility (INCF), nezávislá organizace zaměřená na podporu sdílení dat prostřednictvím koordinace infrastruktury a standardů, nedávno zavedla formální proces pro hodnocení a schvalování komunitních standardů a osvědčených postupů podporující FAIR principy. Tím, že INCF formálně slouží jako standardizační organizace zaměřená na otevřené a FAIR neurovědy, pomáhá hodnotit, propagovat a koordinovat standardy a osvědčené postupy napříč neurovědami. Tento článek poskytuje přehled o tomto procesu a diskutuje o tom, jak můžou neurovědy těžit z existence specializované standardizačního orgánu. There is great need for coordination around standards and best practices in neuroscience to support efforts to make neuroscience a data-centric discipline. Major brain initiatives launched around the world are poised to generate huge stores of neuroscience data. At the same time, neuroscience, like many domains in biomedicine, is confronting the issues of transparency, rigor, and reproducibility. Widely used, validated standards and best practices are key to addressing the challenges in both big and small data science, as they are essential for integrating diverse data and for developing a robust, effective, and sustainable infrastructure to support open and reproducible neuroscience. However, developing community standards and gaining their adoption is difficult. The current landscape is characterized both by a lack of robust, validated standards and a plethora of overlapping, underdeveloped, untested and underutilized standards and best practices. The International Neuroinformatics Coordinating Facility (INCF), an independent organization dedicated to promoting data sharing through the coordination of infrastructure and standards, has recently implemented a formal procedure for evaluating and endorsing community standards and best practices in support of the FAIR principles. By formally serving as a standards organization dedicated to open and FAIR neuroscience, INCF helps evaluate, promulgate, and coordinate standards and best practices across neuroscience. Here, we provide an overview of the process and discuss how neuroscience can benefit from having a dedicated standards body.
- Published
- 2021
- Full Text
- View/download PDF