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Objective: The aim of this study was to estimate genetic parameters for 305-day cumulative milk yield and components, growth, and reproductive traits in Guzerá cattle. Methods: The evaluated traits were 305-day first-lactation cumulative yields (kg) of milk (MY305), fat (FY305), protein (PY305), lactose (LY305), and total solids (SY305); age at first calving (AFC) in days; adjusted scrotal perimeter (cm) at the ages of 365 (SP365) and 450 (SP450) days; and adjusted body weight (kg) at the ages of 210 (W210), 365 (W365) and 450 (W450) days. The (co)variance components were estimated using the restricted maximum likelihood method for single-trait, bi-trait and tri-trait analyses. Contemporary groups and additive genetic effects were included in the general mixed model. Maternal genetic and permanent environmental effects were also included for W210. Results: The direct heritability estimates ranged from 0.16 (W210) to 0.32 (MY305). The maternal heritability estimate for W210 was 0.03. Genetic correlation estimates among milk production traits and growth traits ranged from 0.92 to 0.99 and from 0.92 to 0.99, respectively. For milk production and growth traits, the genetic correlations ranged from 0.33 to 0.56. The genetic correlations among AFC and all other traits were negative ( 0.43 to 0.27). Scrotal perimeter traits and body weights showed genetic correlations ranging from 0.41 to 0.46, and scrotal perimeter and milk production traits showed genetic correlations ranging from 0.11 to 0.30. The phenotypic correlations were similar in direction (same sign) and lower than the corresponding genetic correlations. Conclusion: These results suggest the viability and potential of joint selection for dairy and beef traits in Guzerá cattle, taking into account reproductive traits. Made available in DSpace on 2022-07-12T10:19:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Genetic-study-of-quantitative-traits-supports-the-use-of-Guzera.pdf: 565236 bytes, checksum: dfaa8a1ebf81c017549a592d9e4ae054 (MD5) Previous issue date: 2022

The objective of this study was to evaluate the influence of information quality in the prediction of genetic values for the Nellore cattle\'s growth traits. The information regarding the Nellore cattle from four farms participating in a program of the Brazilian National Association of Breeders and Researchers (ANCP, acronym in portuguese), named Nellore Brasil, is corresponding to the years 2012 and 2013. The selected farms are certified by the ANCP for quality of zootechnical information, having received the association\'s seal of approval, Global G1. Field data such as batch or management group were considered an assessment criteria, and the growth traits related to the body weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365) and 450 (W450) days were evaluated under different scenarios of information quality: inclusion of all management lot information and random inclusion of management lot information in 90%, 70%, 50%, 30% and absence of information on management lots. During the scrutiny of different scenarios of management lot information for the genetic evaluation of growth traits, it was found that there were changes in the file structure for genetic evaluation, after the statistical treatment of the data. The contemporary group experienced changes in the number of animals due to the poor quality of information. Changes were observed in all the (co)variance components and genetic parameters compared to those obtained by the scenario used as a reference. Concerning growth traits, there was an increase in the estimates of heritability and the additive genetic variance in as far as the number of information about management lots decreased. Due to the change in contemporary groups in the absence of information on management lots, the results obtained in genetic analyzes\' were biased, reaching overestimated breeding values, which can be misleading as to the choice of animals. With respect to the average of predicted breeding values, it was found that for the maternal additive genetic effects of the body weight at 120 and 210 days of age, the change in the information quality interfered negatively, leading to reduction of average breeding values of the herds evaluated. When evaluating correlations or Spearman rank breeding values obtained from data with information quality (scenario), in three groups of accuracy of breeding values compared to those obtained in different scenarios of the inclusion of information, in different proportions, it was found that there was a change in the animal classification for growth traits. Objetivou-se com este trabalho avaliar a influência da qualidade da informação na predição de valores genéticos para as características de crescimento em bovinos da raça Nelore. Foram utilizadas informações de bovinos da raça Nelore provenientes de fazendas participantes do Programa Nelore Brasil da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), correspondentes aos anos de 2012 a 2013. As fazendas selecionadas são certificadas quanto à qualidade da informação zootécnica, possuindo o selo Global G1. Considerou-se como critério de avaliação dados de campo, como lote ou grupo de manejo, sendo analisadas características de crescimento relacionadas aos pesos padronizados aos 120 (P120), 210 (P210), 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, avaliadas sob diferentes cenários de qualidade da informação: inclusão de todas as informações de lote de manejo; inclusão aleatória das informações de lote de manejo em 90%, 70%, 50%, 30% e dados sem a informação do lote de manejo dos animais com medidas fenotípicas. Ao considerar os diferentes cenários das informações de lotes de manejo para a avaliação genética das características de crescimento, verificou-se que houve alterações na estrutura dos arquivos para avaliação genética, após o tratamento estatístico dos dados. O grupo de contemporâneo sofreu alterações no número dos animais em decorrência da pouca qualidade da informação. Observou-se alterações em todos os componentes de (co)variância e parâmetros genéticos, quando comparados aos obtidos pelo cenário utilizado como referência. Para as características de crescimento houve aumento nas estimativas de herdabilidade e nas variâncias genéticas aditivas à medida que se reduziu o número de informações sobre os lotes de manejo. Devido à alteração nos grupos contemporâneos na ausência de informações sobre os lotes de manejo, foram obtidos resultados viesados nas análises genéticas, atingindo valores genéticos superestimados, que podem levar a enganos quanto à escolha dos animais. Ao avaliar as correlações de posto ou Spearman dos valores genéticos obtidos a partir de dados com qualidade na informação (cenário REF), em três grupos de acurácia dos valores genéticos, comparados aos obtidos nos diferentes cenários de inclusão das informações de lotes de manejo houve alteração na classificação dos animais para as características de crescimento avaliadas. Mestre em Ciências Veterinárias

The objective of this study was to estimate the components of variance and genetic parameters of test-day milk yield in first lactation Girolando cows, using a random regression model. A total of 126,892 test-day milk yield (TDMY) records of 15,351 first-parity Holstein, Gyr, and Girolando breed cows were used, obtained from the Associação Brasileira dos Criadores de Girolando. To estimate the components of (co) variance, the additive genetic functions and permanent environmental covariance were estimated by random regression in three functions: Wilmink, Legendre Polynomials (third order) and Linear spline Polynomials (three knots). The Legendre polynomial function showed better fit quality. The genetic and permanent environment variances for TDMY ranged from 2.67 to 5.14 and from 9.31 to 12.04, respectively. Heritability estimates gradually increased from the beginning (0.13) to mid-lactation (0.19). The genetic correlations between the days of the control ranged from 0.37 to 1.00. The correlations of permanent environment followed the same trend as genetic correlations. The use of Legendre polynomials via random regression model can be considered as a good tool for estimating genetic parameters for test-day milk yield records. Made available in DSpace on 2021-08-12T15:01:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Estimation-genetic.pdf: 283041 bytes, checksum: 4e38ef5410ebe3066df90abfed20d0e7 (MD5) Previous issue date: 2021

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior O conhecimento do comportamento associativo entre os vários caracteres de interesse econômico e das diferentes estratégias de seleção possibilita a seleção com êxito de genótipos superiores e ganhos de seleção expressivos. Esta tese foi dividida em quatro capítulos. O primeiro capítulo é o referencial teórico que trata sobre a cultura da soja, melhoramento genético, parâmetros genéticos, análise de trilha e índices de seleção. O segundo capítulo teve por objetivo conhecer os parâmetros genéticos e ganhos de seleção para caracteres de importância agronômica em três populações F2 de soja, a fim de realizar a seleção com êxito de genótipos superiores. Os experimentos foram realizados no Programa de Melhoramento Genético de Soja da UFU, em Uberlândia - MG. Foram desenvolvidas três populações segregantes: PSF2-A: BRS256RR x TMG1179RR; PSF2-B: BRS 256RR x UFUS Xavante e PSF2-C: BRS7380RR x TMG1179RR e avaliados onze caracteres agronômicos. A seleção de genótipos superiores com sucesso é recomendada por meio do número de dias para o florescimento e altura da planta na maturidade na PSF2-A; para o número de dias para o florescimento, número de sementes por vagens, produção de grãos por planta, número de vagens totais e número de dias para maturidade na PSF2-B e para a altura de inserção da primeira vagem, número de nós ramificados e produção de grãos por planta na PSF2-C. No terceiro capítulo os objetivos foram compreender a associação entre caracteres agronômicos em populações F2:3 de soja transgênica RR por meio do estudo de correlação e análise de trilha a fim de possibilitar uma seleção exitosa para o melhoramento genético da cultura. Foram semeadas duas populações segregantes F2:3, sendo elas a PSF2:3–A: BRS256RR x TMG1179RR e a PSF2:3–B: BRS7380RR x TMG1179RR. Foram avaliados oito caracteres agronômicos. Para aPSF2:3–A a seleção indireta para produção de grãos por planta é indicada por meio do caráter número de vagens totais e para aPSF2:3–B a seleção indireta do número de nós produtivos é recomendada mediante o número de nós na maturidade. O caráter número de vagens totais, em ambas populações, é útil na seleção de progênies superiores quanto ao rendimento de grãos. No quarto capítulo os objetivos foram verificar o potencial genético de caracteres agronômicos e selecionar progênies F3:4 de soja com base em diferentes estratégias de seleção. Foram semeadas 123 progênies e os genitores, BRS256RR e TMG1179RR e avaliados onze caracteres agronômicos. O potencial genético da população F3:4 é elevado e permite aplicar distintas estratégias de seleção no alcance de genótipos superiores. As progênies UFU 72, UFU 116, UFU 86, UFU 45, UFU 117, UFU 56, UFU 5, UFU 106, UFU 6, UFU 4, UFU 73, UFU 101, UFU 96, UFU 90, UFU 123, UFU 116, UFU 88, UFU 65, UFU 70, UFU 3, UFU 69 e UFU 37 foram selecionadas por ambos índices de seleção.As progênies UFU 72, UFU 90, UFU 88 e UFU 69 são agronomicamente superiores tanto na seleção direta e indireta, quanto nos índices de seleção de soma de “ranks” de Mulamba & Mock (1978) e do genótipo-ideótipo. The knowledge of the associative behavior between the various characters of economic interest and the different selection strategies enables the successful selection of superior genotypes and expressive selection gains. This thesis was divided into four chapters. The first chapter is the theoretical background that deals with soybean culture, genetic improvement, genetic parameters, path analysis and selection indexes. The second chapter aimed to understand the genetic parameters and selection gains for characters of agronomic importance in three F2soybean populations, in order to carry out a successful selection of superior genotypes. The experiments were carried out in the UFU Soy Genetic Improvement Program, in Uberlândia - MG. Three segregating groups were developed: PSF2-A: BRS256RR x TMG1179RR; PSF2-B: BRS 256RR x UFUS Xavante and PSF2-C: BRS7380RR x TMG1179RR and eleven agronomic characters were formulated. Successful selection of superior genotypes is recommended by the number of days for flowering and plant height at maturity in PSF2-A; for the number of days for flowering, number of seeds per pod, grain production per plant, number of total pods and number of days for maturity in PSF2-B and for the height of insertion of the first pod, number of branched nodes and grain production per plant in PSF2-C. In the third chapter, the objectives were to understand the association between agronomic traits in F2:3transgenicRRsoybean populations through the correlation study and trail analysis in order to enable a successful selection for the genetic improvement of the crop. Two F2:3 segregating populations were sown, PSF2:3-A: BRS256RR x TMG1179RR and PSF2:3-B: BRS7380RR x TMG1179RR. Eight agronomic characters were evaluated. For PSF2:3,the indirect selection for grain production per plant is determined by the number of total pods and for PSF2:3–B,the indirect selection of the number of productive nodes is recommended by the number of nodes at maturity. The number of total pods, in both populations, is useful in the selection of superior progenies in terms of grain yield. In the fourth chapter, the objectives were to verify the genetic potential of agronomic traits and to select soybean F3:4 progenies based on different selection strategies. 123 progenies were sown and the parents, BRS256RR and TMG1179RR and eleven agronomic characters were evaluated. The genetic potential of the F3:4 population is high and allows different selection strategies to be applied to reach superior genotypes. The progenies UFU 72, UFU 116, UFU 86, UFU 45, UFU 117, UFU 56, UFU 5, UFU 106, UFU 6, UFU 4, UFU 73, UFU 101, UFU 96, UFU 90, UFU 123, UFU 116, UFU 88, UFU 65, UFU 70, UFU 3, UFU 69 and UFU 37 were selected by both selection indexes. The UFU 72, UFU 90, UFU 88 and UFU 69 progenies are agronomically superior both in direct and indirect selection, as in Mulamba & Mock (1978) sum of ranks selection indexes and genotype-ideotype. Tese (Doutorado)

This study aimed at estimating genetic parameters for milk production and conformation characteristics in Girolando crossbred dairy cows reared in the High and Low Acre region using the restricted maximum likelihood methodology, under an animal model. We estimated the variance components and genetic parameters using the REML/BLUP procedure (Restricted Maximum Likelihood Methodology/Best Linear Unbiased Prediction). The estimated average for milk production for 305 days of lactation (P305) was of 1523.25 ± 481.11 kg, with a heritability of 0.38 for this characteristic. The conformation characteristics showed no significant correlation with milk production. The phenotypical correlations between the linear characteristics of type were, in general, positive and moderate. The P305 obtained in this study can be considered low and indicates that there is a possibility of increasing milk production through selection in herds along with the use of tested and proven bulls. The heritability estimate found (0.38) indicates that there is genetic variability for milk production, demonstrating that selection for this characteristic would result in genetic progress. Este estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos para produção de leite e características de conformação em vacas leiteiras mestiças Girolando criadas na região do Alto e Baixo Acre, utilizando a metodologia da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal. As estimativas dos componentes de variância e dos parâmetros genéticos foram realizadas pelo procedimento REML/BLUP (Máxima verossimilhança restrita/Melhor predição linear não viesada). A média estimada para produção de leite aos 305 dias de lactação (P305) foi de 1.523,25 ± 481 kg e a herdabilidade para esta característica foi de 0,38. As características de conformação não apresentaram correlação significativa com a produção de leite. As correlações fenotípicas entre as características lineares de tipo foram em geral positivas e de magnitude moderada. A P305 obtida neste estudo pode ser considerada baixa e indica que existe a possibilidade de aumento da produção de leite através de seleção nos rebanhos, juntamente com a utilização de touros testados e provados. A estimativa de herdabilidade encontrada (0,38) indica que há variabilidade genética para produção de leite, demonstrando que a seleção para esta característica resultaria em progresso genético. Made available in DSpace on 2021-03-11T13:01:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 27107.pdf: 567973 bytes, checksum: d7393df52a1942d1c285d63191e61977 (MD5) Previous issue date: 2020

The aim of this study was to investigate genetic control of the traits number of days to flowering (NDF) and number of days to maturity (NDM) in a cowpea cross. Genetic parameters were estimated in segregating and nonsegregating generations of a cross between two contrasting cowpea genotypes (MNC05-828C-1-9-1 × MNC04-792F-146). No evidence for maternal effect was found for either trait. Broad and narrow sense heritability estimates were above 50%, allowing genetic gains from selection of plants in the F2 generation. High significance of additive gene effects and low contribution of dominance and epistatic effects were detected for both traits. The estimated number of genes controlling the traits was around 4 for NDF and 5 for NDM. The results suggest that early-maturing cowpea self-fertilized cultivars can be developed through standard breeding approaches, meeting the demands of modern agricultural systems for more crop seasons per year and mechanized harvesting. Made available in DSpace on 2020-12-23T09:03:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GeneticControlTraitsMaturityCowpea.pdf: 401895 bytes, checksum: edade4060d1b375f17ba134cc83ab036 (MD5) Previous issue date: 2020

O objetivo desse trabalho foi investigar características alternativas indicadoras de habilidade materna passíveis de utilização em programas de melhoramento genético de suínos que impactem positivamente no peso e qualidade dos leitões desmamados por fêmea ao ano. Informações de 4.627 leitegadas e 2.058 fêmeas das raças Large White e Landrace foram avaliadas através de abordagem Bayesiana. Foram propostas seis características alternativas as quais foram avaliadas juntamente com outras três tradicionais características de tamanho de leitegada. O grupo de características alternativas foi formado pelas medidas de ganho de peso médio diário do nascimento a desmama da leitegada biológica e da leitegada recebida, peso médio de desmame da leitegada biológica e leitegada recebida, peso total produzido da leitegada do nascimento ao desmame e potenciais de desmamados, calculado como a porcentagem de leitões desmamados do total de leitões recebidos no início do período de lactação. As herdabilidades estimadas para as características alternativas são baixas (0,02 a 0,06). A associação complexa entre as características indicadoras de habilidade materna e tamanho de leitegada foi demonstrada pelas diferenças observadas entre os tipos de mensuração e raças. Além disso, observou-se uma possível influência do método de amamentação cruzada da leitegada empregado. A inserção de características de desempenho da leitegada (alternativas) como ganho médio diário e peso médio desmamado em programas de melhoramento genético suíno é viável e possivelmente refletirá na melhoria da qualidade do leitão desmamado e no peso desmamado por fêmea ao ano. The aim was to investigate alternative traits to predict maternal ability that could be used in swine breeding programs to positively impact the weight and quality of piglets weaned per female per year. Information from 4,627 litters and 2,058 females of Large White and Landrace breeds were evaluated using Bayesian approach. Six alternative traits were proposed, which were evaluated together with three other traditional litter size traits. The alternative group was formed by the measures of average daily weight gain from birth to weaning from the received litter and the biological litter, average weaning weight of the received litter and the biological litter, total litter weight produced from birth to weaning and potential of weaned, calculated as the percentage of piglets weaned from the total piglets received at the beginning of the lactation period. The estimated heritabilities for the alternative traits are low (0.02 to 0.06). The complex association between traits indicating maternal ability and litter size was demonstrated by the differences observed between measurement types and breeds. In addition, a possible influence of the cross-fostering method was observed. The insertion of litter performance traits (alternatives) such as average daily gain and weaned weight in swine breeding programs is feasible and will possibly reflect in the improvement of the quality of the weaned piglet and the weight weaned per female per year.

Most of the Western Amazon coffee production is made from growing unregistered clones, selected by the coffee growers themselves. The aim of this study is to evaluate the sensory profile and genetic diversity of the most cultivated Coffea canephora clones in the Western Amazon. Coffee samples at cherry stage of the clones 03, 05, 08, 25 and 66 were collected at eight municipalities in the main coffee growing zones, with altitudes ranging from 86 to 381 meters. Beverage quality was evaluated according to the Robusta Cupping Protocols and estimates of the genotype × environment interaction (GE) were made interpreting non-parametric and multivariate methods. The GE interaction was significant and the genetic component was also important to the expression of beverage quality (h2 =82,23). The clones 25 and 05 have good attributes and mean score near 80 points. Sweetness was the sensory descriptor with the greatest impact on beverage quality of these two clones. Harshness was the descriptor that had the greatest negative impact on beverage quality of clone 66. The clones had complexities that differed and that were not necessarily associated with greater beverage quality. Despite the differences in their beverage attributes, these clones that are grown for their high productivity presented low genetic diversity of the beverage quality. Made available in DSpace on 2020-09-04T04:40:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 cpafro-18433.pdf: 630798 bytes, checksum: 721a39dcbcf81eeebfb6b0acd7eacb2c (MD5) Previous issue date: 2020

O objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos para as características peso ao desmame (P205), ao ano (P365) e sobreano (P550) de bovinos Nelore Mocho, criados na região Norte do Brasil. Foram utilizados 39.737 registros de peso pertencentes a 8.530 animais. Os parâmetros genéticos foram obtidos utilizando-se o método da máxima verossimilhança restrita (REML) sob o modelo animal, usando aplicativo computacional WOMBAT. O modelo empregado incluiu efeitos fixos de grupo de contemporâneos (sexo, fazenda, ano e estação de nascimento do animal) e idade da vaca ao parto como covariáveis (efeito quadrático), além de efeitos aleatórios genético aditivo direto, genético materno e ambiente permanente materno, adotando-se o modelo multicaracteristicas. Os coeficientes de herdabilidade direta estimados para as características estudadas foram de média a alta magnitude, variando de 0,32 (P550) a 0,50(P205), mostrando alta variabilidade genética e potencial de ganhos considerável utilizando essas características para a seleção. A herdabilidade materna foi de baixa magnitude, variando de 0,07 (P550) a 0,09 (P205) indicando diminuição do efeito materno ao longo do crescimento do animal. As correlações genéticas entre as características foram altas, positivos e superiores a 0,84, evidenciando alta associação entre as características, podendo-se obter ganhos genéticos via resposta correlacionada para P365 e P550 ao selecionar o P205. Entretanto, observam-se indicativas de que as características avaliadas são passíveis de seleção para o melhoramento genético da raça Nelore Mocho criados na região Norte do Brasil Made available in DSpace on 2020-10-21T09:13:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EstimacaoParametrosGeneticosBovinoNeloreLRRD10.2020.pdf: 77105 bytes, checksum: 431aa5cb5e05f5b126ad0d35913e33ab (MD5) Previous issue date: 2020

Coffee has emerged as an economic alternative culture in the State of Acre, Brazil, but without a clonal variety recommended for the state to overcome the unevenness presented by seed crops. Thus, in order to estimate genetic parameters and indicate progenies of Coffea canephora to compose a clonal variety for the State of Acre, yield, vegetative vigor and plant height were evaluated in five harvests of a randomized complete block experiment with 46 progenies, 4 repetitions and 10 plants per plot by mixed model methodology (REML/BLUP). The harvests were evaluated individually, by the model that considers one harvest, one location and the mean of progenies, and joint analysis (all harvests), by repeatability model with stability and temporal adaptability by the harmonic mean of relative performance of genotypic values method (MHPRVG), with genotypic values of progenies grouped by the Tocher method. There was variability, with possibility of selection, only for grain yield. The yield was strongly affected by production bienniality, with high environmental influence and harvests mean ranging from 14.13±4.60 to 46.20±14.94 bags ha-1 and individual heritabilities from 0.10 to 0.44. Sixteen ?Conilon? coffee progenies with selection gains above 23% were selected. The MHPRVG method allows the refinement of progeny selection throughout the harvests, identifying the most adapted and stable. Made available in DSpace on 2020-06-17T02:05:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 27007.pdf: 559988 bytes, checksum: 9a758784d2097490e48c081c6e755ca4 (MD5) Previous issue date: 2020

Different polynomial functions were tested for mean trajectory modeling with different residual variance structures. A total of 15,148 weight records of 3,115 Nellore Mocho cattle with ages between 1 and 660 days, raised in northern Brazil. First, the mean trajectory of cattle growth curve was fitted by a fixed regression using orthogonal polynomials with orders ranging from two to seven. Analyses were performed using the least-squares method, disregarding animal and/ or maternal random effects. Then, the best model was evaluated using different residual variance structures and homogeneous and heterogeneous classes. We considered as fixed effects those of groups of contemporary and of dam age at birth (as linear and quadratic covariate). The random model part included animal and maternal effects (direct genetic and permanent environments). We concluded that the estimates of variance components and genetic parameters were affected by both fixed regression curve polynomial order and residual variance structure. Moreover, random regression model considering an order-four polynomial function with a fixed curve and six-class residual variance showed better fits. Made available in DSpace on 2020-06-24T11:11:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FittingFixedRegressionCurvesNelloreSemina2020.pdf: 1632500 bytes, checksum: 9c053ba196732c0d42b6942ad75b72ef (MD5) Previous issue date: 2020

Submitted by Matheus Henrique Vargas de Oliveira (matheusvargasoliveira@hotmail.com) on 2019-08-19T01:17:42Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_FINAL - Matheus Henrique Vargas de Oliveira .pdf: 1539050 bytes, checksum: 71b3ced73bc8a7635315934012f25037 (MD5) Approved for entry into archive by Laudicélia Martins Arantes (lm.arantes@unesp.br) on 2019-08-19T15:13:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Oliveira_mhv_me_jabo.pdf: 1539050 bytes, checksum: 71b3ced73bc8a7635315934012f25037 (MD5) Made available in DSpace on 2019-08-19T15:13:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_mhv_me_jabo.pdf: 1539050 bytes, checksum: 71b3ced73bc8a7635315934012f25037 (MD5) Previous issue date: 2019-07-26 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O objetivo do presente estudo foi avaliar a associação do consumo alimentar residual (CAR, kg MS/dia) e composição corporal de bovinos da raça Nelore. Foram utilizadas informações fenotípicas e genotípicas de 1059 e 956 touros do Programa de Melhoramento Genético Nelore Qualitas®, e 1074 novilhos e 1199 touros do Programa de Melhoramento Genético do Instituto de Zootecnia, participantes dos testes de eficiência alimentar nos anos de 2007 a 2018. O pedigree continha informação de cinco gerações, totalizando 7.992 animais, filhos de 1.034 pais e 4.735 mães. Após o controle de qualidade dos genótipos 37.297 SNPs permaneceram em comum nas populações Nelore Qualitas e Insituto de Zootecnia. A seleção genômica foi realizada considerando populações separadas e única por meio do método ssGBLUP. Foram realizadas análises genéticas uni e bi-características e os componentes de (co) variância foram estimados pelo método da Máxima Verossimilhança Restrita. Foram observadas e calculadas as características CARKOCH, consumo alimentar residual proposto por Koch (kg MS/dia); CARAOL, consumo alimentar residual ajustado para área de olho de lombo (kg MS/dia); CAREGS, consumo alimentar residual ajustado para espessura de gordura subcutânea (kg MS/dia); CARAOL EGS, consumo alimentar residual ajustado para área de olho de lombo e espessura de gordura subcutânea (kg MS/dia); AOL, área de olho de lombo (cm²) e EGS, espessura de gordura subcutânea (mm). O modelo de análise dos fenótipos incluiu efeitos aleatórios do animal e resíduo, efeitos sistemáticos de grupo de contemporâneos (GC) e mês de nascimento do animal, bem como as covariáveis idade do animal no início da prova (linear) e idade da vaca ao parto (linear e quadrática). Considerando populações separadas ou única, as herdabilidades das características foram similares com variação entre 0,17 ± 0,05 a 0,36 ± 0,06, o que indica possibilidade de progresso genético. As estimativas de correlações genéticas das características expressas em ambientes diferentes foram positivas, 0,58 ± 0,52 CARKOCH, 0,29 ± 0,47 CARAOL, 0,34 ± 0,47 CAREGS e 0,16 ± 0,50 CARAOL EGS. Considerando uma única população para os dois programas, as correlações genéticas entre as características CARKOCH, CARAOL, CAREGS e CARAOL EGS foram positivas e altas (0,97 ± 0,01 a 0,99 ± 0,01) entretanto, com AOL e EGS (0,06 ± 0,13 a 0,31 ± 0,12) foram positivas e moderadas/baixas. Evidências de associação genética desfavorável do CARKOCH e as características AOL e EGS foram observadas e possivelmente irão implicar em ganhos genéticos negativos. Portanto, o modelo de predição do CARKOCH deve considerar as características de composição de carcaça, a fim de obter independência em relação a AOL e EGS, consquentemente, priorizar o CAREGS e CARAOL EGS como critério de seleção na avaliaçao dos touros. The objective of the present study was to evaluate the association of residual feed intake (RFI, kg DM/day) and body composition of Nelore cattle. Phenotypic and genotypic information was used for 1059 and 956 sires from the Nelore Qualitas® animal breeding Program, and 1074 steers and 1199 animals from the animal breeding Program of the Institute of Animal Science, participants of the food efficiency tests from 2007 to 2018. The pedigree contained information from five generations, totaling on 7,992 animals, offspring of 1,034 males and 4,735 females. After quality control of the genotypes 37,297 SNPs remained in common in Nelore Qualitas e Institute of Animal Science populations. Genomic selection was performed considering separate and single populations using the ssGBLUP method. Uni and bi-traits genetic analyzes were performed and (co) variance components were estimated by the Restricted Maximum Likelihood. The phenotypic traits of RFIKOCH, residual feed intake proposed by Koch (kg DM/day) were observed and calculated; RFILEA, adjusted residual feed intake for loin eye area (kg DM/day); RFIBF, adjusted residual feed intake for backfat thickness (kg DM/day); RFILEA BF residual feed intake adjusted for loin eye area and backfat thickness (kg DM/day); LEA, loin eye area (cm²) and BF, backfat thickness (mm). The model of analysis of the phenotypes included random effects of the animal and residue, systematic effects of group of contemporaries (GC) and month of birth of the animal, as well as the covariates age of the animal at the beginning of the test (linear) and age of the cow at birth (linear and quadratic). Considering separate or single populations, the heritabilities of the traits were similar ranging from 0.17 ± 0.05 to 0.36 ± 0.06, indicating the possibility of genetic progress. Estimates of genetic correlations of the traits expressed in different environments were positive, 0.58 ± 0.52 RFIKOCH, 0.29 ± 0.47 RFILEA, 0.34 ± 0.47 RFIBF and 0.16 ± 0.50 RFILEA BF. Considering a single population for the two programs, the genetic correlations between RFIKOCH, RFILEA, RFIBF and RFILEA BF were positive and high (0.97 ± 0.01 to 0.99 ± 0.01), but with LEA and BF (0.06 ± 0.13 to 0.31 ± 0.12) were positive and moderate / low. Evidence of unfavorable genetic association of RFIKOCH and the LEA and BF traits, that is, the selection will imply negative genetic gains. Therefore, the RFIKOCH prediction model must consider the carcass composition traits, in order to obtain independence in relation to LEA and BF, consequently, to prioritize the RFIBF and RFILEA BF as a selection criterion in the evaluation of the sires. 88882.180624/2018-01

No Acre, a partir do ano 2000, verifica-se aumento na demanda para produção in vitro de embriões. Contudo, diversos fatores ambientais e genéticos interferem na produção de oócitos, embriões e taxa de prenhez. O objetivo deste trabalho foi avaliar os parâmetros produtivos e genéticos da produção in vitro de embriões da raça Nelore no Acre. Foram utilizados dados de 1.292 sessões de aspirações foliculares realizadas em 571 doadoras, fornecidos pela empresa In Vitro Acre. Foram analisadas as variáveis: Número Total de Oócitos, Número Total de Embriões Clivados, Número Total de Embriões Produzidos e Número Total de Prenhez, e os Percentuais de Conversão de Oócitos para Embriões, Conversão de Embriões para Prenhez e Conversão de Oócitos para Prenhez. Foram calculados os parâmetros produtivos, os efeitos genéticos e não genéticos que influenciam na expressão de cada uma delas. Observou-se médias gerais para número de oócitos, embriões e prenhezes por aspiração/vaca de 30,05; 9,82 e 3,03; respectivamente. Para as taxa de Conversão de Oócito/Embrião; Embrião/Prenhez e Oócito/Prenhez obtiveram-se valores de 34,19; 38,39 e 10,68%, respectivamente. Os efeitos não genéticos significativos foram: efeito de fazenda, touro, idade da doadora, ano e tipo de sêmen para todas as variáveis avaliadas e efeito de estação do ano para as variáveis Número Total de Embriões Clivados e Número Total de Prenhez. Observou-se herdabilidade de magnitude baixa a média, indicando variabilidade genética para as variáveis relacionadas à produção de oócitos, embriões e prenhezes. As correlações fenotípicas e genéticas estimadas entre as variáveis Número Total de Oócitos, Embriões e Prenhezes foram positivas e de alta magnitude indicando que a seleção para aumento na produção de oócitos resulta em aumento na produção de embriões e nas taxas de prenhezes. Conclui-se que há variabilidade genética justificando a seleção de doadoras para produção de oócitos, embriões e prenhezes e que atenção deve ser dada a melhoria dos efeitos ambientais para aumentar a eficiência da produção in vitro de embriões. In Acre, from the year 2000, there is an increase in the demand for in vitro production of embryos. However, several environmental and genetic factors interfere in the production of oocytes, embryos and pregnancy rate. The objective of this work was to evaluate the productive and genetic parameters of the in vitro production of Nelore embryos in Acre. Data from 1,292 follicular aspiration sessions were used in 571 donors, provided by In Vitro Acre company. The following variables were analyzed: Total Oocytes, Total Number of Clotted Embryos, Total Number of Produced Embryos and Total Number of Pregnancy, and the Percentages of Oocyte Conversion for Embryos, Conversion of Embryos for Pregnancy and Conversion of Oocytes for Pregnancy. The productive parameters and the genetic and non-genetic effects that influence the expression of each of them were calculated. Overall averages were observed for number of oocytes, embryos and pregnancy per suction/cows of 30.05; 9.82 and 3.03; respectively. For the rates of Oocyte / Embryo Conversion; Embryo / Pregnancy and Oocyte / Pregnancy, the values were 34.19; 38.39 and 10.68%, respectively. The non-genetic significant effects were: farm effect, bull, donor age, year and type of semen for all variables evaluated and season of the year effect for the variables Total Number of Clotted Embryos and Total Number of Pregnancy. Heritability of low to medium magnitude was observed, indicating genetic variability for the variables related to the production of oocytes, embryos and pregnancy. The estimated phenotypic and genetic correlations among the variables Total Number of Oocytes, Embryos and Pregnancy were positive and of high magnitude, indicating that the selection for increase of oocyte production results in an increase of embryo production and in pregnancy rates. It is concluded that there is genetic variability justifying the selection of donors for oocyte, embryo and pregnancy production and that attention should be given to improving environmental effects to increase the efficiency of in vitro embryo production. Keywords: Made available in DSpace on 2020-01-21T00:33:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 26951.pdf: 1074326 bytes, checksum: 9ab8cfbc039bb6688e9fba6b27d33671 (MD5) Previous issue date: 2019 Dissertação (Mestrado em em Ciência Animal) - Programa de Pós-graduação em Sanidade e Produção Animal Sustentável na Amazônia Ocidental, Universidade Federal do Acre, Rio Branco. Orientador: José Marques Carneiro Junior.

There is a demand for barley cultivars that are suitable for the malt industry as well as genotypes that are stable and better adapted for irrigation in the Cerrado. This study aimed to estimate the genetic parameters by assessing 69 barley genotypes from different countries, from 2012 to 2014, under irrigation in the Cerrado. Six agronomic characteristics were assessed: grain yield, plumpness kernel, thousand seeds weight, plant height, degree of plant lodging and days to heading. Analysis of variance, cluster test and phenotypic, genotypic and environmental correlations were performed. Significant effects were observed for genotypes, years and the G x E interaction. High values of broad-sense heritability (> 86%) were found for all the characteristics, which enabled direct selection. The Colombian accession MCU363PI402112 stood out for its agronomic characteristics. Genotype selection based on the phenotypic evaluations was possible due to their good experimental accuracy and precision. Precocious genotypes with high grain yields and homogeneous grain sizes were selected. Due to the environmental influence on the grain yield, additional studies concerning the components of yield in this environment are necessary to facilitate the selection of more productive genotypes.

The purpose of this work was to estimate genetic parameters and selection gain of Pinus caribaea var. hondurensis progeny trial for wood and resin production as well as correlation between them. Experiment was established in complete lattice square 10 x 10 (triple), 100 treatments, 10 plants per plot, 3 m x 3 m spacing. Twelve years after planting the trial had thinned considerably leaving six plants per plot. Twenty-seven years after planting height, diameter at breast height (dbh) and resin production were measured. Deviance analysis, genetic parameter estimates, selection expected gain, genetic and phenotypic correlation were based on REML/BLUP method. Significant phenotypic differences were observed among and within families for all traits. The thinning at 12 years after planting, contributed positively to dbh increase and resin production, with an average of 30.60 cm and 4.83 kg tree-1year-1. The individual narrow sense heritability ranged from 0.25 to 0.38 for dbh and volume. Genetic and phenotypic correlation between growth traits were positive, and significant. Therefore, different selection strategies will be proposed separately for both traits (resin and wood). The selection gains were significant, especially with 10 % selection intensity (individual selection) for dbh (7.53 %) and resin (13.49 %). The trial has had good performance for growth, resin and genetic variability to support the next breeding generation. Made available in DSpace on 2017-11-29T23:21:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016AnandaSGGenetic.pdf: 1393869 bytes, checksum: 9e0590b438ab5fac06cc77aabde71a2a (MD5) Previous issue date: 2017-11-29

SUMMARY We aimed to compare multi-trait and repeatability models to estimate genetic parameters for the traits number of piglets born alive (NBA) and alive at 3 week of age (NP3), litter weight at birth (LW0) and at 3 week of age (LW3), and mean piglet weight at birth (MW0) and at 3 week of age (MW3), considering the first three farrowings of Landrace sows. Heritability (h2) estimates showed an increasing pattern up to the third farrowing for LW0 and MW3. For NBA, NP3, LW3, and MW0 h2 increased from the first to the second and decreased from the second to the third farrowing. In general, heritability estimated in the repeatability model was lower than the mean of the estimates in the multi-trait model. The traits LWO, MW0, and MW3 presented high genetic correlation among different farrowings (0.961–0.997), while NBA, NP3, and LW3 (0.092–0.986) presented irregular values among farrowings. The corrected Akaike information criterion shows that the repeatability model is not indicated for almost all of the studied traits. These results indicate that the multi-trait model is recommended for genetic evaluation of the traits number of piglets born alive and alive at 3 week of age, litter weight and mean piglet weight at birth and 3 week of age, in different farrowings, as different traits. RESUMO Objetivou-se comparar os modelos multicaracterístico e de repetibilidade na estimação de parâmetros genéticos para as características número de leitões nascidos vivos (NLN) e às três semanas de idade (NL3), peso da leitegada ao nascimento (PLN) e às três semanas de idade (PL3), e peso médio do leitão ao nascimento (PMLN) e às três semanas de idade (PML3), considerando os três primeiros partos de fêmeas da raça Landrace. As estimativas de herdabilidade (h2) aumentaram até a terceira ordem de parto para as características PLN e PML3. Para NLN, NL3, PL3 e PMLN as h2 aumentaram da primeira para a segunda parição e reduziram da segunda para terceira parição. Em geral, as herdabilidades estimadas via modelo de repetibilidade foram menores que a média das estimativas obtidas utilizando o modelo muticaracterístico. As características PLN, PMLN e PML3 apresentaram altas correlações genéticas entre as diferentes parições (0,961–0,997), enquanto as características NLN, NL3 e PL3 (0,092–0,986) apresentaram valores irregulares de correlações genéticas entre as parições. Pelo critério de informação de Akaike corrigido o modelo de repetibilidade não foi indicado para a maioria das características estudadas. Esses resultados indicam que o modelo multicaracterístico é recomendado para avaliação genética das características número de leitões nascidos vivos e às três semanas de idade, peso da leitegada ao nascimento e às três semanas de idade e peso médio do leitão ao nascimento e às três semanas de idade, em diferentes parições, como características diferentes.

The aims of this study were to investigate the intrapopulation spatial genetic structure (SGS) of a preserved Swietenia macrophylla population in a managed forest in Southwestern Amazon, in Acre state, Brazil, and assess the genetic parameters that underlie the conceptual framework that guides conservation and management strategies. The study was conducted in Annual Production Unit (APU) 3, where 83 adult trees (DBH?40 cm) were mapped (1650 ha). The diameter at breast height (DBH) was measured and the vascular exchange was sampled. Leaf tissues were collected from 187 juvenile individuals within a radius of 20m of adults. The population presented high heterozygosity (Ho) for adult (0.767) and juvenile (0.763) individuals, but significantly high allelic richness (R) and significantly lower fixation index (F) in adults (R =10.3, F =0.048) than juveniles (R =9.3, F= 0.119). The F value significantly higher for juveniles, suggesting selection against inbred individuals between juvenile and adult life stages. SGS was detected for adults up to 300 m. Mating was mainly through outcrossing (0.97-1.0), but some crossing occurred among related trees (0.02-0.16) and were correlated (rpm =0.06-0.22), indicating a mean effective number of pollen donors ranging from 4.5 to 18.2. Pollen dispersal distances reached 3905m (mean of 1472 m), and mean effective pollination neighbor area of 792 ha. The effective population size (Ne) within family (2.73) was lower than expected for random mating populations. The number of trees (m) required for seed collection was estimated at 55 non-inbreed and not related trees to each other. The core collection consisted of 42 (50.6%) adults across the area. These individuals should be included in seed collection as they represent 100% of the total detected genetic diversity. The inclusion of S. macrophylla on the list of species available for exploitation is not indicated, because the species requires cross breeding for its maintenance and logging reduce the Ne and may negatively impact the pattern of genetic diversity. These will significantly increase the risk of genetic erosion and population extinction due to a lack of adaptive ability. Adults serve as pollen donors that ecologically and genetically contribute to the maintenance of gene flow and Ne. Because it is recognized as a threatened species worldwide, and due to the fact that in areas of natural occurrence the species presents low-density and shows difficulty establishing natural regeneration, we recommend that S. macrophylla be protected from selective logging. Made available in DSpace on 2020-03-16T15:33:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 26982.pdf: 1098581 bytes, checksum: e3723072f33559771ae87b9addcdc83b (MD5) Previous issue date: 2020

J. curcas (physic nut) is one of the most promising oilseeds for biofuel production and the knowledge about genetic parameter estimates is important for its breeding. Here, we evaluated 121 families, from 48 to 60 months of age, aiming genetic evaluation and selection. The trial was set up in an 11 x 11 lattice design, with three replications and 4-plant plot. The traits evaluated were fruit yield (FY), grain (GY) and oil yield (OY), fruit husk percentage (FH) and seed oil content (OC). Individual heritabilities were low (0.19 to 0.23), requiring accurate selection and improvement methods. Moderate repeatabilities were observed for FY (0.54), GY (0.52), OC (0.30) and OY (0.51), indicating that the families evaluated maintained relative superiority over the years. With selection of the 20 best individuals, the predicted genotypic gains (66%) were greater than the additive gains (56%), indicating greater possibilities of success from cultivation of clones. Made available in DSpace on 2018-11-28T23:40:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018M.DeonCBABGeneticevaluationJatropha.pdf: 352573 bytes, checksum: a51777476149cc29ccd504404885fe60 (MD5) Previous issue date: 2018-11-28

O amendoim forrageiro (Arachis pintoi Krapov. & W. C. Greg. e Arachis repens Handro) é uma leguminosa perene com alta capacidade de consorciação com gramíneas, proporcionando melhoria da qualidade da forragem para alimentação animal e redução do uso de insumos na manutenção das pastagens. A variabilidade genética das espécies de amendoim forrageiro ainda não é totalmente conhecida, porém estudos indicam o potencial de melhoria das cultivares já lançadas. Assim, este trabalho teve como objetivos estimar parâmetros genéticos e predizer valores genotípicos via modelos mistos, selecionar genótipos voltados à produção de forragem e uso ornamental, propagados por sementes, e indicar genitores divergentes para o programa de hibridação, de forma a prover subsídios ao programa de melhoramento da espécie. Foram analisados dados de três ensaios de avaliação de genótipos de amendoim forrageiro, em blocos completos casualizados, separados temporalmente. O primeiro ensaio foi instalado em dezembro de 2005, com 19 genótipos e oito avaliações; o segundo, instalado em dezembro de 2008, com 16 genótipos e oito avaliações; e o terceiro, instalado em dezembro de 2011, com 33 genótipos e doze avaliações. Todos os ensaios avaliaram genótipos distintos e tiveram as cultivares Belmonte e BRS Mandobi como testemunhas comuns. Foram avaliadas características agronômicas (ocorrência de pragas e de doenças, florescimento, vigor e altura da planta, produção de matéria seca total e de folhas) e bromatólogicas (teores de proteína bruta e de fibra em detergente ácido e neutro), além da produção de sementes. Os dados foram analisados pela metodologia de modelos mistos (REML/BLUP), para a estimação dos parâmetros genéticos e predição de valores genotípicos. Os valores genotípicos foram utilizados para o estudo de divergência entre genótipos, dentro de cada ensaio, pela estatística multivariada e utilizados na aplicação dos índices de seleção. Houve variabilidade para a maioria das características analisadas, possibilitando ganhos de seleção com alta consistência entre ensaios. A produção de sementes foi inversamente correlacionada às características relacionadas à produção de forragem. Houve estruturação semelhante de características entre ensaios, indicando cobertura do solo, produção de matéria seca e altura como as mais importantes na discriminação de genótipos. A seleção baseada em caracteres agronômicos relacionados à produção de forragem pode ser realizada no período seco do ano com alta acurácia. Há possibilidade de seleção de genótipos de amendoim forrageiro com propagação por sementes para uso como forragem e fins ornamentais. A propagação vegetativa favorece o vigor, a cobertura do solo e a produção de matéria seca das plantas. Há potencial de seleção de genitores altamente divergentes no Banco Ativo de Germoplasma para hibridação voltados à produção de forragem e propagados por sementes. Made available in DSpace on 2018-04-18T01:43:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 26605.pdf: 2651987 bytes, checksum: b41d159ab03a46d01c60613d830582b0 (MD5) Previous issue date: 2018-04-17 Tese (Doutorado em Agronomia: Produção Vegetal) - Curso de Pós-graduação em Agronomia, Universidade Federal do Acre, Rio Branco, AC. Orientador: Giselle Mariano Lessa de Assis.

O Brasil se destaca como o maior exportador de carne, isso se deve principalmente as condições ambientais do país, além da qualidade genética do rebanho produzido. No Acre, a pecuária de corte representa grande parte de economia gerada pelo setor do agronegócio. No entanto, mesmo o rebanho apresentando índices produtivos dentro da média nacional, a adoção de ferramentas como a avaliação genética ainda é uma prática pouco comum entre os produtores. Isso faz com que não se conheça efetivamente as características de desempenho do rebanho a serem melhoradas. Nesse sentido, esse estudo teve por objetivo realizar uma avaliação genética intra rebanho para a obtenção de parâmetros genéticos para características produtivas, reprodutivas e morfológicas em uma propriedade que comercializa reprodutores Nelore padrão e mocho. Os dados analisados são de animais pertencentes a uma fazenda localizada no estado do Acre que comercializa tourinhos para leilões. Foram avaliados os indicadores de desempenho dos animais como peso aos 120 (P120, 240 (P240), 550 (P550) dias, perímetro escrotal (PE) ao sobreano e avaliação visual (EPMURAS). Os resultados de média de peso foram: 123,50 kg (±19,93DP) (P120), 208,31 kg (±22,76DP) (P240) e 316,57 kg (±35,71DP) (P550). Para perímetro escrotal a média foi de 25,30±2,93 e avaliação visual, a média foi de 3,92±1,27 (E), 3,35 (±1,21DP) (P), 3,02 (±1,17DP) (M) e 2,85 (±0,87DP) (U). Foram encontradas correlações fenotípicas positivas para as características de EPMU e desempenho ponderal. Os valores de herdabilidade foram de magnitude mediana a baixa. Observa-se que o plano de melhoramento genético conduzido pela fazenda está sendo efetivo, porém, para aumentar a eficiência do processo de seleção, são necessárias melhorias para atender o objetivo de seleção da propriedade. Made available in DSpace on 2018-08-03T00:58:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 26669.pdf: 566711 bytes, checksum: 2ac996e503ca1b4ca9b2dcf6f4f4ae63 (MD5) Previous issue date: 2018-08-02 Dissertação (Mestrado em Ciência Animal) - Programa de Pós-graduação em Sanidade e Produção Animal Sustentável na Amazônia Ocidental, Universidade Federal do Acre, Rio Branco. Orientador: José Marques Carneiro Júnior.

O objetivo deste estudo foi avaliar um teste de progênies de irmãos completos de Eucalyptus aos 2, 5 e 7 anos de idade para selecionar genitores e indivíduos superiores em um programa de seleção recorrente recíproca no estado de Minas Gerais. O delineamento experimental utilizado foi de blocos ao acaso com 286 famílias de irmãos completos, oito repetições e parcelas lineares de seis plantas. Os caracteres avaliados foram a altura (ALT), diâmetro a altura do peito (DAP) e volume (VOL). A herdabilidade individual no sentido restrito ( ) para VOL para todas as idades foi de aproximadamente o dobro da herdabilidade dos efeitos de dominância da população ( ). A herdabilidade individual no sentido amplo ( ) para o VOL foi média (variou entre idades de 0,28 a 0,39), o que indica a possibilidade de ganhos genéticos com a seleção dentro da população. Foram selecionados 256 indivíduos de 32 famílias de maior VOL (média de 74,24 m³.ha-1.ano-1) para formação do pomar de recombinação e 65 indivíduos para estabelecimento do pomar de hibridação. Foram também selecionados os dez indivíduos com maior VOL para clonagem (média de 86,08 m³.ha-1.ano-1). A metodologia de seleção genética utilizada possibilitou o estudo quantitativo da população de irmãos completos e direcionamento de cruzamentos futuros para o programa de seleção recorrente recíproca em Minas Gerais. Made available in DSpace on 2018-11-25T23:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018M.DeonSFSelecao.pdf: 666830 bytes, checksum: e4e192cd2c110dd697808b6843e54575 (MD5) Previous issue date: 2018-11-22

The purpose of this study was to estimate the genetic parameters and to agronomically characterize 18 accessions of hulless barley and three references of covered barley grains belonging to the Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia germplasm bank, using ten agronomic quantitative traits. The experiment was performed at two sites in Distrito Federal, in May 2012, using the experimental design of randomized blocks with three replicates. The evaluated characteristics were: estimated grain yield, plumpness kernel, thousand seeds weight, plant height, lodging, days to heading, hectoliter weight, and grain protein content. The obtained data were subjected to the variance analysis and the grouped means by Scott-Knott test. Significant differences at 1% of probability were found among the accessions for all the evaluated traits. It is possible to obtain genetic gains due to the high values of the genotypic coefficient of variation. High heritability in the broad sense was observed for all the characteristics, except for protein content, enabling the effective selection of traits of interest from the parents to the descendants. The accessions CI 13453, CN Cerrado 1, CN Cerrado 2, CN Cerrado 5 and PI356466 stood out positively among the others to Yield and Lodging. RESUMO: O objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos e caracterizar agronomicamente 18 acessos de cevada nua, e 3 testemunhas de cevada com grãos cobertos pertencentes ao banco de germoplasma da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, utilizando dez caracteres agronômicos quantitativos. O experimento foi realizado em dois locais no Distrito Federal, em maio de 2012, utilizando um delineamento experimental de blocos ao acaso com três repetições. As características avaliadas foram: rendimento de grãos, classificação comercial, peso de mil sementes, altura de plantas, acamamento, ciclo de espigamento, peso hectolítrico e teor de proteína no grão. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância e as médias agrupadas pelo teste de Scott-Knott. Foram detectadas diferenças significativas a 1% de probabilidade entre os acessos para todas as características avaliadas. Há possibilidade de se obter ganhos genéticos devido aos elevados valores do coeficiente de variação genotípico. Foi observada alta herdabilidade em sentido amplo para todas as características, exceto para teor de proteína, possibilitando a seleção efetiva de características de interesse dos genitores para seus descendentes. Os acessos CI 13453, CN Cerrado 1, CN Cerrado 2, CN Cerrado 5 e PI356466 destacaram-se positivamente dos demais para rendimento de grãos e acamamento. Made available in DSpace on 2018-12-29T23:30:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5230144412PB.pdf: 2035759 bytes, checksum: 269c8a70493c779893588539bfabc825 (MD5) Previous issue date: 2018-12-28

A interação genótipo x ambiente é aspecto importante que deve ser considerado nas avaliações genéticas de populações sob seleção. Modelos de norma de reação são frequentemente utilizados para o estudo da interação genótipo x ambiente e podem ser aplicados em populações que possuem o fenótipo de um grupo de indivíduos aparentados medido ao longo de um gradiente ambiental. Muitos pesquisadores assumem que a norma de reação de determinado genótipo ao longo do gradiente ambiental deve ser linear. Entretanto, impor um modelo linear como mais adequado para descrever o comportamento de determinada característica implica em aplicar restrições que impedem acompanhar seu progresso genético, ou seja, sua evolução ao longo dos diferentes ambientes. De modo geral, para compreender a evolução da característica ao longo do gradiente ambiental os parâmetros genéticos estimados via modelos de norma de reação devem ser analisados de forma complementar. Nesta dissertação, objetivou-se estudar a interação genótipo x ambiente em duas linhagens de codornas de corte na fase final de crescimento criadas sob diferentes níveis de metionina+cistina digestível aparente. Para tal, mensurou-se o ganho de peso dos 21 aos 35 dias de vida das aves. Os níveis testados foram 0,60; 0,70; 0,80; 0,90 e 1,00% de metionina+cistina digestível nas aves da linhagem EV1 e 0,61; 0,71; 0,81; 0,91 e 1,01% de metionina+cistina digestível nas aves da linhagem EV2. Foram utilizados modelos de norma de reação com polinômios de Legendre variando de ordem um a cinco para o ajuste dos efeitos fixos e aleatórios e considerou-se heterogeneidade de variância residual. Os modelos que melhor se ajustaram para cada linhagem diferiram entre si quanto a ordem do polinômio de Legendre utilizado para descrever a trajetória média, sendo necessários polinômios de quarta ordem para a linhagem EV1 e de primeira ordem para a linhagem EV2. Em relação ao ajuste dos efeitos genéticos aditivos, polinômios de quarta ordem foram necessários para a modelagem nas duas linhagens. Ainda, para as duas linhagens modelos que consideraram heterogeneidade de variância residual com cinco classes foram os que melhor se ajustaram. Após determinar o modelo que melhor se ajustou para descrever o ganho de peso ao longo dos níveis de metionina+cistina digestível nas duas linhagens, os parâmetros genéticos foram estimados. As estimativas de correlação e as normas de reação dos genótipos em função dos níveis indicaram que há interação genótipo x nível de aminoácido fornecido às aves para ganho de peso na fase final de crescimento. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,37 a 0,72 ao longo dos ambientes da linhagem EV1 e de 0,20 a 0,75 ao longo dos ambientes da linhagem EV2. Além disso, foram observados altos valores de coeficiente de variação genético aditivo, variando de 0,09 a 0,17 na linhagem EV1 e 0,11 a 0,19 na linhagem EV2. Os resultados obtidos indicam que há variabilidade genética para o ganho de peso em codornas das duas linhagens e que a característica em estudo apresenta boa capacidade em evoluir ao longo das gerações por meio da seleção The genotype x environment interaction is an important aspect that should be considered in the genetic evaluations of populations under selection. Reaction norms models are often used for the study of the genotype x environment interaction and can be applied to populations that have the phenotype of a group of related individuals measured along an environmental gradient. Many researchers assume that the reaction norm of a given genotype along the environmental gradient should be linear. However, imposing a linear model as more adequate to describe the behavior of a certain characteristic implies applying restrictions that prevent its genetic progress, that is, its evolution throughout the different environments. In general, in order to understand the evolution of the characteristic along the environmental gradient, the genetic parameters estimated through models of reaction norm must be analyzed in a complementary way. In this dissertation, we aimed to study the interaction genotype x environment in two lines of European quails in the final stage of growth created under different levels of methionine + cystine digestible apparent. For this, the weight gain was measured from 21 to 35 days old of the quails. The levels tested were 0.60; 0.70; 0.80; 0.90 and 1.00% methionine + cysteine digestible in the quails of the EV1 strain and 0.61; 0.71; 0.81; 0.91 and 1.01% methionine + cystine digestible in quails of the EV2 strain. Legendre polynomial ranging from one to five orders were used for the adjustment of fixed and random effects and heterogeneity of residual variance was considered. The models that fit best for each strain differed according to the order of the Legendre polynomial used to describe the mean trajectory. Four-order polynomials for the EV1 and first-order polynomials for the EV2 strain were required. In relation to the adjustment of the additive genetic effects, fourth-order polynomials were required for modeling both strains. Also, for both strains models that considered heterogeneity of residual variance with five classes showed best fit. After determining the model that best described the weight gain along the levels methionine + cystine digestible in both strains, genetic parameters were estimated. Correlation estimates and reaction norms of the genotypes as a function of levels of the environment gradient indicated interaction between genotype and the amino acid level supplied to the quails for weight gain in the final stage of growth. Heritability estimates ranged from 0.37 to 0.72 throughout the environments in EV1 strain and from 0.20 to 0.75 throughout the environments in EV2 strain. In addition, high values of coefficient of additive genetic variation were observed, ranging from 0.09 to 0.17 in the EV1 strain and 0.11 to 0.19 in the EV2 strain. The results indicate that there is genetic variability for weight gain in quails of both strains and that the characteristic in study can evolve over the generations through selection

Resumo: A eficiência reprodutiva de bovinos, bem como a antecipação da puberdade, traz efeitos positivos nos índices zootécnicos e também na rentabilidade dos sistemas de produção. Assim, objetivou-se neste estudo estimar os parâmetros genéticos e tendências genéticas e fenotípicas para características de crescimento, carcaça e reprodutivas, em um rebanho de bovinos da raça Nelore sob seleção para precocidade sexual, tendo como critério de seleção as características de idade à primeira concepção e ao primeiro parto. Além disso, objetivou-se também avaliar, através de análises multivariadas, dentre as características de crescimento, carcaça e escores visuais, quais discriminam a prenhez precoce. Foram estimados os parâmetros genéticos para as características de peso a nascer (PN), peso aos 120 (P120), 210 (P210), 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, ganho médio diário pré e pós-desmame (GMDPRE e GMDPOS), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EG), espessura de gordura subcutânea na garupa (EGP8), marmoreio (MAR), peso da carcaça quente (PCQ), peso da porção comestível (PPC), perímetro escrotal aos 365 (PE365) e 450 (PE450) dias de idade, período de gestação (PG), período de serviço (PS), intervalo de parto (IDP), fertilidade real (FR), produtividade acumulada (PAC), relação do peso à desmama (RD), idade à primeira concepção (IPC) e idade ao primeiro parto (IPP). Os dados foram fornecidos pela Fazenda Vera Cruz e pelo Programa de Melhoramento Genético Nelore Brasil, coordenado pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). Os componentes de (co)variância foram obtidos por meio do método de Máxima Verossimilhança Restrita, disponível no pacote BLUPF90, em análises uni e bicaracterísticas, utilizando o modelo animal. As estimativas de herdabilidade obtidas para PN (0,39), P120 (0,32), P210 (0,31), P365 (0,33), P450 (0,34), GMDPRE (0,23), GMDPOS (0,27), AOL (0,39), EG (0,34), EGP8 (0,34), MAR (0,38), PCQ (0,39), PPC (0,39), PE365 (0,33), PE450 (0,33), PG (0,23), PS (0,34), IDP (0,23), FR (0,21), PAC (0,23), RD (0,25), IPC (0,21) e IPP (0,24) indicaram possibilidade de seleção genética e incorporação no rebanho. As estimativas de herdabilidade materna para PN (0,06), P120 (0,08), P210 (0,07), P365 (0,05), P450 (0,11), GMDPRE (0,12), GMDPOS (0,08), PE365 (0,07) e PE450 (0,03) indicaram efeitos genéticos das matrizes no desempenho das progênies até a fase pós-desmame, para características de crescimento. As correlações genéticas estimadas entre as características de crescimento, entre crescimento e carcaça, entre as características de carcaça e entre as reprodutivas apresentaram valores de moderada magnitude, sendo todos favoráveis. As características indicadoras de precocidade sexual apresentaram coeficientes de correlação genética variando de -0,51 a - 0,15; de -0,62 a -0,33; e de -0,61 a 0,14, com as características de crescimento, carcaça e reprodutivas, respectivamente. Os coeficientes de correlação genética foram, na maior parte dos casos, favoráveis. As tendências genéticas obtidas no presente estudo demonstraram, de modo geral, a eficácia da utilização dos critérios de seleção adotados, com ganhos genéticos satisfatórios. A seleção para precocidade sexual, com base na idade à primeira concepção, deverá promover mudanças genéticas no sentido contrário nas características de crescimento, carcaça e reprodutivas, sendo este efeito desejável. As características de peso ao nascer, espessura de gordura, ossatura, musculatura, profundidade, inserção da cauda e garupa foram as que apresentaram maior poder de discriminação para a prenhez precoce. Assim, essas características podem ser utilizadas como critérios de direcionamento de manejo e tomada de decisões práticas, a fim de possibilitar que os animais expressem prenhez precoce, orientando o criador na seleção prática de fêmeas para precocidade sexual. Abstract: The reproductive efficiency in cattle herds, as well as the anticipation of puberty, has positive effects on zootechnical indexes and on the profitability of production systems. Thus, the aim of this study was to estimate the genetic parameters and the genetic and phenotypic trends for growth, carcass, and reproductive traits in a Nellore cattle herd under selection for sexual precocity, given age at first conception and age at first calving as selection criterion. Furthermore, this study also aimed to evaluate, using multivariate analyzes, which traits, among growth, carcass and visual scores, better discern early pregnancy. Genetic parameters were estimated for birth weight (BW), weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365) and 450 (W450) days of age, average daily gain pre-weaning and post-weaning (ADGPRE e ADGPOS), rib eye area (REA), backfat thickness (BF), rump fat thickness (RF), marbling (MAR), hot carcass weight (HCW), weight of edible portion (WEP), scrotal circumference at 365 (SC365) and 450 (SC450) days of age, gestation length (LG), days open (DO), calving interval (CI), real fertility (RF), cumulative productivity (CP), relation to weaning (RW), age at first conception (AFCo) and age at first calving (AFCa). Data were provided by Vera Cruz Ranch and the National Association of Breeders and Researchers (ANCP). The covariance components were estimated using the Restricted Maximum Likelihood method, available on BLUPF90 package, in univariate and bivariate analyzes using animal model. The heritability estimated for BW (0.39), W120 (0.32), W210 (0.31), W365 (0.33), W450 (0.34), ADGPRE (0.23), ADGPOS (0.27), REA (0.39), BF (0.34), RF (0.34), MAR (0.38), HCW (0.39), WEP (0.39), SC365 (0.33), SC450 (0.33), LG (0.23), DO (0.34), CI (0.23), RF (0.21), CP (0.25), RW (0.26), AFCo (0.21) and AFCa (0.24) indicated the possibility of genetic selection. The maternal heritability estimated for BW (0.06), W120 (0.08), W210 (0.07), W365 (0.05), W450 (0.11), ADGPRE (0.12), ADGPOS (0.08), SC365 (0.07) and SC450 (0.03) indicated genetic effects of the dam on the progeny performance, until the post-weaning phase, for growth traits. The genetic correlations estimated within growth traits, between growth and carcass traits, within carcass traits and reproductive trait were favorable and of moderate magnitude. The traits that indicate sexual precocity showed genetic correlation coefficients ranging from -0.51 to -0.15, -0.62 to -0.33 and -0.61 to 0.14, between growth, carcass and reproductive traits, respectively. Genetic correlation coefficients were, in most cases, favorable. The genetic trends obtained showed, in general, the effectiveness of the adopted selection criteria with satisfactory genetic gains. Selection for sexual precocity, based on age at first conception, shall promote opposite direction genetic changes on growth, carcass and reproductive traits, which is the desirable effect. Birth weight, fat thickness, bone structure, musculature, rib depth, tail and rump insertion were the traits that presented greater discrimination power for early pregnancy. Thus, these traits can be used as such management targeting criteria and decision-making practices, in order to enable animals to express early pregnancy, guiding the breeders in selecting females for sexual precocity. Made available in DSpace on 2017-12-19T23:28:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Estudogeneticoquantitativodecaracteristicas.pdf: 3462124 bytes, checksum: 72074a72cd1437ba4f2f20135e930ac9 (MD5) Previous issue date: 2017-12-19 Dissertação (Mestrado em Zootecnia) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2017. Orientador: Cláudio Ulhoa Magnabosco.

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