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The implementation of the “Green and Blue Infrastructure” in France intends to ensure the functional connectivity of habitats (green veining). It is one of the nature conservation policies which aim to reduce the loss of biodiversity caused by the destruction and degradation of natural habitats. The objective of this work was to quantify the impact of connectivity, in comparison to other environmental factors, on the diversity of butterfly communities and their genetic diversity in three French agricultural regions. Two different approaches were applied to understand the underlying processes driving these diversity patterns: i) the study of the whole community and of the different ecological groups, ii) the study of landscape features resistances to butterfly dispersal using a landscape genetics approach on one species: the Meadow brown (Maniola jurtina L.). Our findings show that although local characteristics play a dominant role, landscape context does have an influence on community composition. Arable land cover decreases species diversity, and the Meadow brown genetic diversity and gene flow. Grasslands support more species rich communities, including non-frequent species. Grassy linear landscape elements host impoverished communities, but improve Meadow brown dispersal and enhance its genetic diversity. Species diversity is higher within grasslands in proximity to woody habitats: butterflies may benefit from resources on forest edges; moreover, woodlands seem to limit Meadow brown dispersal while increasing its genetic diversity. The habitat complementarity we evidenced here led us to question the classic model of ecological continuities as a collection of independent sub-networks, one for each type of habitat. According to conservation issues, species under interest and landscape contexts, we also need to identify situations where, among a broad panel of possible conservation actions, increasing connectivity is the most effective solution.; La mise en place Trame Verte et Bleue sur le territoire français a pour vocation de garantir la connectivité fonctionnelle entre habitats. C’est une des réponses politiques qui vise à enrayer le déclin actuel de la biodiversité, lie notamment à la destruction et à la dégradation des habitats. L’objectif de cette thèse est de quantifier l’effet de la connectivité, au regard d’autres facteurs environnementaux, sur la diversité des communautés et la diversité génétique des papillons de jour dans trois régions agricoles. Deux approches sont utilisées pour comprendre les processus qui sous-tendent ces patrons de diversité : i) l’étude de la communauté dans son ensemble et des groupes écologiques qui la compose, ii) l’étude de la résistance des milieux a la dispersion par génétique du paysage sur une espèce : le Myrtil (Maniola jurtina L.). Les résultats montrent que même si les caractéristiques locales jouent un rôle plus fort, la structure du paysage influence la composition des communautés. Ainsi, la quantité de terres arables réduit la richesse spécifique, la diversité génétique, et les flux de gènes chez le Myrtil. Les prairies hébergent des communautés diversifiées, incluant des espèces peu fréquentes. Les éléments linéaires enherbes supportent des communautés appauvries, mais favorisent la dispersion et la diversité génétique du Myrtil. La diversité des papillons est plus forte a proximité de boisements : les papillons pourraient bénéficier de ressources sur les lisières ; par ailleurs, les milieux boises semblent à la fois limiter les flux de gènes du Myrtil tout en accroissant sa diversité génétique. La complémentarité des milieux soulevée ici nous invite à repenser le modèle classique en ≪ sous-trames ≫ indépendantes de la Trame Verte et Bleue. Selon les enjeux de conservation, les espèces et les contextes paysagers, il est nécessaire de distinguer les situations ou, parmi un panel d’actions envisageables, améliorer la connectivité est une solution pertinente.

Session 1. Biodiversité et fonctionnements écologiques des agroécosystèmes; Les lisières, entre milieux forestiers et milieux ouverts agricoles, sont très fréquentes dans les paysages ruraux caractérisés par de petits fragments forestiers. Elles constituent un enjeu pour la gestion des territoires et rendent des services écosystémiques à l’agriculture et à la foresterie. L’objectif de ce travail est d’étudier l’effet de la structure des lisières entre bois et parcelles agricoles sur la biodiversité des plantes et des pollinisateurs (apoïdes et papillons) et de tester l’hypothèse selon laquelle les communautés végétales et animales seront d’autant plus différentes entre la lisière et la parcelle adjacente que la parcelle adjacente est fortement perturbée et que la lisière est abrupte. Notre étude porte sur la flore vasculaire et des insectes pollinisateurs : apoïdes, rhopalocères présents sur une vingtaine de segments de lisières étudiés simultanément sur 3 sites de forêts de plaine (Régions : Centre, Aquitaine et Midi-Pyrénées). Les lisières étudiées présentaient des faciès différents en termes de perturbations de la parcelle adjacente (prairies versus cultures annuelles) et du type de lisière (abrupt ou douce). Les relevés floristiques et les captures de rhopalocères ont été réalisés sur les 3 sites, alors que lescaptures d'apoïdes n'ont été réalisées que dans les régions Centre et Midi-Pyrénées. Les observations conduites montrent des patrons de réponse diversifiés des communautés végétales aux effets de lisière, en fonctions de la région d’étude et du régime de perturbation des habitats ouverts. La similarité de composition des communautés végétales entre la parcelle la lisière ne varie pas en fonction de l'intensité de perturbation de la parcelle adjacente mais entre sites d'études, les communautés les plus similaires présentant la flore la plus pauvre. L’intérêt des lisères forestières en milieu tempéré pour les apoïdes est confirmé dans deux cultures àpollinisation entomophile (colza et vergers). Elles abritent des sites de nidification et d’accouplement desabeilles terricoles, dominantes dans les assemblages observés. Concernant les apoïdes, seule la région Midi-Pyrénées présente une différence entre lisières et parcelles, avec un indice de diversité assez faible pour lesparcelles de milieu ouvert. Les papillons sont plus abondants dans les lisières de milieu ouvert que dans les milieux ouverts. Les communautés de Rhoaplocères présentent des diversités de Shannon sensiblement identiques entre lisières et parcelles en Aquitaine et en Midi-Pyrénées. Seule la région Centre montre une différence plus sensible entre lisières et parcelles. Compte tenu de leur importance et de leur omniprésence dans les paysages ruraux tempérés ; il semble nécessaire de mieux prendre en compte les caractéristiques des lisières, dans leur variabilité, dans les stratégies de gestion de la biodiversité. Cette biodiversité est susceptible de rendre des services écosystémiques, notamment de régulation des bioagresseurs.