Guazzelli Gonzalez, Júlio, MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Montpellier, Museu de malacologia (Recife, Brésil), Audrey Darnaude, and Thierry Frédou
Evaluating the importance of inshore coastal habitats for the maintenance of exploited coastal fish populations is key to delineate sustainable strategies for both fishery and ecosystem management. Jacks are highly prized tropical marine fishes. Most of them complete their whole life cycle at sea, but some use estuaries at the juvenile stage before moving back to coastal waters and joining offshore adult exploited stocks. This is the case of the horse-eye jack (Caranx latus), an exploited yet poorly studied species frequently found in estuaries in North-Eastern Brazil, at least at the juvenile stage. However, little was known on the species' ecology in these inshore habitats, nor on their importance for the maintenance of its local exploited stock. To start filling this knowledge gap, this thesis combined three complementary research axes. The first one investigated the local size-at-age and growth of C. latus using size data and otolith readings from 282 specimens captured both at Sea and in varied inshore habitats. This allowed to specify fish ages in all the environments colonised by the species in the area and to infer the growth parameters for its local exploited stock. The second axis investigated local variations in the diet and food resources of C. latus juveniles in estuaries and their causes, by a combined analysis of the stomach contents and stable isotopes (13C and 15N) signatures of 439 juveniles of both C. latus and another sympatric jack species (C. hippos), in three neighboring estuaries with contrasted morphological and biological features. It highlighted a plasticity in local resources use by juvenile jacks according to the estuarine environmental settings, allowing them to limit the trophic competition among them, with potential consequences on their respective sizes and abundances. Finally, the third research axis aimed to quantify the importance of local estuaries for sustaining the adult stock of C. latus exploited offshore, by analysing different chemical elements incorporated in the juvenile part of 183 otoliths of juveniles and adults captured in varied estuarine and marine habitats in this area. This revealed that 75% of the sub-adults and adults exploited by the fisheries off the coast of the Pernambuco state have spent their first year of life growing in local estuaries, particularly those under strong marine influence. These findings significantly advance previous knowledge on C. latus ecology and demonstrate that estuaries play a key role in the maintenance of the C. latus population in North-Eastern Brazil. Yet, local differences in the abiotic and biotic environmental conditions experienced by juvenile jacks during their estuarine stay strongly modulate the respective value of these inshore habitats for the renewal of the stock fished at Sea, with strong implications in terms of local fishery and ecosystem management.; Comprendre le rôle des habitats côtiers dans le maintien des populations de poissons marins exploités est essentiel pour définir des stratégies durables pour la gestion des pêches et des écosystèmes. Les carangues sont des poissons marins tropicaux très prisés. La plupart d'entre elles effectuent tout leur cycle de vie en mer, mais certaines utilisent les estuaires au stade juvénile, avant de regagner les eaux côtières pour rejoindre les stocks adultes exploités. C'est le cas de la carangue mayole (Caranx latus), une espèce exploitée mais peu étudiée, que l'on trouve souvent en estuaires au nord-est du Brésil, au moins au stade juvénile. Afin de préciser l'importance de ces habitats côtiers pour le maintien du stock de C. latus exploité dans la région, cette thèse a été construite sur trois axes de recherche complémentaires. Le premier avait pour but de décrire la croissance locale de C. latus, sur la base de données de taille et de lectures d'otolithes pour 282 individus de l'espèce, capturés en mer et dans divers estuaires de la région. Il a permis de préciser l'âge des poissons dans tous les environnements colonisés à chaque stade de vie et d'inférer les caractéristiques de croissance du stock local. Le deuxième axe visait à décrire la variabilité du régime alimentaire et des sources de nourriture des juvéniles de C. latus en estuaire et leurs causes, par une approche combinant l'analyse des contenus stomacaux et des signatures isotopiques (13C and 15N) de 439 juvéniles, de C. latus et d'une autre espèce sympatrique (C. hippos), dans trois estuaires voisins aux caractéristiques biotiques et abiotiques contrastées. Il a montré une plasticité dans l'utilisation des ressources par les juvéniles des deux espèces suivant les caractéristiques estuariennes locales, qui leur permet de réduire la compétition trophique entre eux, avec des conséquences potentielles sur leurs tailles et leurs abondances respectives. Enfin, le troisième axe s'est attaché à quantifier l'importance des estuaires pour le maintien du stock de C. latus exploité en mer, par l’analyse des teneurs en différents éléments chimiques dans la portion juvénile de 183 otolithes de juvéniles et d'adultes capturés dans divers habitats estuariens et hauturiers de l'espèce. Ceci a révélé que 75 % des spécimens pêchés au large ont passé leur première année de vie en estuaire, surtout dans ceux sous forte influence marine. Ces résultats avancent de façon significative les connaissances sur l'écologie de C. latus et indiquent que les estuaires jouent un rôle clé dans le maintien de ses populations dans le nord-est du Brésil. Cependant, les différences locales de conditions environnementales que les juvéniles de carangue connaissent pendant leur séjour estuarien modulent fortement la valeur respective de ces habitats côtiers pour le renouvellement du stock pêché en mer, avec des implications fortes pour la gestion des pêcheries et des estuaires dans cette région du Globe.