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Microsatellites were used to evaluate and compare the lineage relationships and genetic diversity of two improved cultivars of corn (Zea mays L.), seven modern native races, and eight archaeological Chimú samples (1.100-1.500 AD) of the North Peruvian coast. Electrophoresis was required to remove the PCR inhibitors from ancient DNA. Eight STR primer pairs generated amplicons from the genome of modern corn, but only five amplified ancient corn DNA. To establish the lineage relationships among samples, the coefficient of similarity of Jaccard and the technique of analysis of conglomerate with binding average were used. Thus, the pattern of genealogical and genetic relationships of the genotypes were determined. Seven out of the eight pairs of SSR primers revealed polymorphism, being 2.47 (range 2-6) the average of polymorphic alleles. The total alleles tested were 23, with 97 polymorphic bands for the modern corn, yet being monomorphic for the Chimú corn, generating an average of genetic similarity of 0.44 and 1, respectively. These results suggest the existence of inbreeding in some populations of Chimú corn of the north coast of Peru 500 to 900 years ago. Modern races exhibited higher polymorphism, due to hybridization and better assisted selection, in agreement with cytogenetic data. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Microsatellites were used to evaluate and compare the lineage relationships and genetic diversity of two improved cultivars of corn (Zea mays L.), seven modern native races, and eight archaeological Chimú samples (1.100-1.500 AD) of the North Peruvian coast. Electrophoresis was required to remove the PCR inhibitors from ancient DNA. Eight STR primer pairs generated amplicons from the genome of modern corn, but only five amplified ancient corn DNA. To establish the lineage relationships among samples, the coefficient of similarity of Jaccard and the technique of analysis of conglomerate with binding average were used. Thus, the pattern of genealogical and genetic relationships of the genotypes were determined. Seven out of the eight pairs of SSR primers revealed polymorphism, being 2.47 (range 2-6) the average of polymorphic alleles. The total alleles tested were 23, with 97 polymorphic bands for the modern corn, yet being monomorphic for the Chimú corn, generating an average of genetic similarity of 0.44 and 1, respectively. These results suggest the existence of inbreeding in some populations of Chimú corn of the north coast of Peru 500 to 900 years ago. Modern races exhibited higher polymorphism, due to hybridization and better assisted selection, in agreement with cytogenetic data. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Resumo Os níveis de variabilidade genética populacionais podem ser determinados por marcadores moleculares, como RAPD e AFLP usados em estudos de fingerprinting, ou microssatélites, que são bastante utilizados em estudos de estrutura genética populacional, respondendo a questões ecológicas essenciais para a adoção de medidas conservacionistas. Atualmente são conhecidos microssatélites de regiões codificantes do genoma (SSR-EST), que têm como vantagem a transferabilidade entre espécies próximas em contraste aos microssatélites de regiões anônimas. Esta revisão visa divulgar esta nova modalidade de microssatélites, os SSR-ESTs, que estão sendo cada vez mais utilizados como ferramenta molecular eficiente para estudos populacionais com enfoque em conservação.

Resumo Todos os organismos do planeta estão relacionados evolutivamente através do material genético de DNA. A descoberta da estrutura desta macromolécula, das enzimas de restrição e da Taq polimerase possibilitaram o desenvolvimento de várias tecnologias. Paralelamente aos métodos clássicos, estas tecnologias têm sido usadas na identificação, caracterização e comparações taxonômicas nos mais diversos grupos de organismos. Esta análise propiciou o conhecimento da extensão da biodiversidade do planeta e do grau de similaridade entre plantas, animais e o homem. O reconhecimento da biodiversidade e da composição genética única de cada espécie, torna maior e urgente a necessidade de conhecer para preservar.

Objetivo: presentar los avances diagnósticos, moleculares y radiológicos, así como en las estrategias terapéuticas para gliomas difusos en los últimos 5 años (2018-2023) en la Fundación Universitaria de Ciencias de la Salud (FUCS), Bogotá D.C., Colombia. Materiales y métodos: se describen las técnicas diagnósticas y terapéuticas utilizadas para gliomas difusos con casos ilustrativos. Resultados: se muestran los avances de las herramientas diagnósticas y terapéuticas para el manejo de gliomas difusos. Discusión: en los últimos 5 años se ha avanzado en la clasificación, diagnóstico y tratamiento de los gliomas difusos, gracias a los avances tecnológicos como los marcadores moleculares, la tractografía y la fusión de imágenes para la neuronavegación y las técnicas de estimulación cortical. Esto ha permitido que el tratamiento de los pacientes con dichos tumores mejore la tasa de morbilidad, la calidad de vida libre de enfermedad y la supervivencia global. Conclusiones: las técnicas de diagnóstico como la tractografía, la fusión integral de imágenes intraoperatorias y el mapeo cerebral electrofisiológico con estimulación cortical y subcortical han mejorado el diagnóstico y tratamiento de los gliomas difusos.

El nanche (Byrsonima crassifolia (L.) H.B.K) pertenece a la familia Malpighiaceae. El género Byrsonima tiene distribución noetropical y presenta gran diversidad con más de 100 especies. El objetivo del trabajo fue caracterizar la variabilidad morfológica y genética del fruto de nanche nativo. El trabajo se realizó durante el año 2020, se hizo una recolecta en huertos comerciales en San Lorenzo (SL’s), municipio de Ruiz, Nayarit, se realizó una caracterización morfológica, fisicoquímica y molecular, el análisis estadístico se efectuó con el paquete (SAS) ver.9.0 y los datos genéticos fueron analizados con el software GenAlEx. Los genotipos SL-4 y SL-8 (cultivados) y de los nativos NAT-5 y NAT-6, son de selección del productor, que optan por las siguientes características: nanche grande, dulce, agridulce o agrio, y de color amarillo. Se encontraron ocho marcadores microsatélites ISSRs con los cuales se obtiene polimorfismo, el análisis de conglomerados formo cuatro grupos con las 15 accesiones de nanche, el número máximo de alelos fue siete, la heterocigosis esperada (He) se obtuvo en un rango de 0.58-0.62, la cual es una medida de la diversidad genética, estos índices indican alta diversidad genética de nanche en los municipios de Nayarit.

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The International Union for Conservation of Nature (IUCN) Red List is an important and widely used tool for conservation assessment. The IUCN uses information about a species' range, population size, habitat quality and fragmentation levels, and trends in abundance to assess extinction risk. Genetic diversity is not considered, although it affects extinction risk. Declining populations are more strongly affected by genetic drift and higher rates of inbreeding, which can reduce the efficiency of selection, lead to fitness declines, and hinder species' capacities to adapt to environmental change. Given the importance of conserving genetic diversity, attempts have been made to find relationships between red‐list status and genetic diversity. Yet, there is still no consensus on whether genetic diversity is captured by the current IUCN Red List categories in a way that is informative for conservation. To assess the predictive power of correlations between genetic diversity and IUCN Red List status in vertebrates, we synthesized previous work and reanalyzed data sets based on 3 types of genetic data: mitochondrial DNA, microsatellites, and whole genomes. Consistent with previous work, species with higher extinction risk status tended to have lower genetic diversity for all marker types, but these relationships were weak and varied across taxa. Regardless of marker type, genetic diversity did not accurately identify threatened species for any taxonomic group. Our results indicate that red‐list status is not a useful metric for informing species‐specific decisions about the protection of genetic diversity and that genetic data cannot be used to identify threat status in the absence of demographic data. Thus, there is a need to develop and assess metrics specifically designed to assess genetic diversity and inform conservation policy, including policies recently adopted by the UN's Convention on Biological Diversity Kunming‐Montreal Global Biodiversity Framework. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Se examinaron los caracteres morfológicos y moleculares del género Dysopsis para una reevaluación de las especies, lo que permitió tener una mejor definición de los taxones. D. chilensis, una especie considerada por mucho tiempo como sinónimo de D. glechomoides se restablece, por lo cual ahora el género está formado por cuatro especies. Se designó el lectotipo para tres especies. Además, se elaboraron las descripciones de las especies del género y una clave para separarlas.

The species Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi, race 2, which causes bacterial hereque or moko in musaceae, constitutes a taxonomically complex unit that exhibits a wide genetic, physiological, serological and host range diversity. For this reason, two strains (R4 and R5) selected for their pathogenicity were identified and characterized. For this, 27 samples from 10 symptomatic plants were processed, from which colonies of irregular shape, flat elevation, mucoid appearance, thick edges, cream color and reddish central pigmentation of different intensities were obtained, using selective culture media such as nutrient agar and tetrazolium. Microscopic observations determined the presence of pure colonies, characterized as Gram-negative with straight and curved rods. Pathogenicity tests performed on healthy plants inoculated with the two strains by infiltration resulted in the characteristic symptomatology of the disease. For molecular identification, the universal primers U1 and U2 were used, which amplified a 996 bp band that, when sequenced and compared with the GeneBank® database, revealed 80.58% identity and 92% coverage in isolate R4, and 81.74% identity and 82% coverage for isolate R5. In addition, the specific primers OLI1 and Y2 were used, which amplified a band of 288 bp, allowing the identification of the samples studied as R. solanacearum. These isolates can be used in different breeding programs to search for tolerance to this pathogen and to generate strategies for the integrated management of the disease. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

The genus Rhodomicrobium comprises species with agricultural and environmental importance. However, few investigations have been conducted to identify molecular markers that could be used to distinguish members of Rhodomicrobium from other groups of bacteria. Conserved signature indels (insertions and deletions) in protein sequences are useful for evolutionary and taxonomic studies in bacteria. Homologous sequences of the proteins NAD+ dependent DNA ligase and Serine-tRNA synthetase were obtained from the UniprotKB/Swiss-Prot database and aligned using MUSCLE programme. Phylogenomic analysis was performed through the Maximum Likelihood method with RAxML. Insertions were identified which support the monophyly of this genus and confirm that Rhodomicrobium lacus forms a sister group of R. vannielii and R. udaipurense. Thus, the insertions analyzed constitute important molecular markers for taxonomic and evolutionary studies in Rhodomicrobium, and also for future biochemical or functional studies in those enzymes. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

El cultivo de arveja o guisante se considera un componente esencial de los sistemas agrícolas sostenibles. El principal objetivo de los investigadores de arveja en Argentina y en todo el mundo es mejorar los componentes del rendimiento y la composición de la semilla para mejorar las características nutricionales. Los programas de mejoramiento genético que utilizan técnicas convencionales y no convencionales son una herramienta muy importante para desarrollar nuevas variedades que puedan ser utilizadas más eficientemente en los sistemas de producción pero que también se adapten a las necesidades cambiantes del mercado.

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This study deals with the genetic characterisation of the dog Ca Rater Mallorquí, whose former function was hunting small mammals. The aim of this study is to analyse the within and between breed genetic diversity and genetic differentiation by comparing this population with other breeds with the same geographical distribution and functional characteristics. Thirty-three microsatellites recommended by the International Society of Animal Genetics (ISAG) were analysed in 79 samples. The betweenbreeds genetic diversity study was carried out with data obtained from 275 samples of 5 Balearic dog breeds: Ca Mè Mallorquí, Ca de Bou, Ca de Bestiar, Ca de Conills de Menorca and Ca Eivissenc (Podenco Ibicenco). The population has not a significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, with an HO of 0.656 and an HE of 0.685. The FST statistic showed that 13,10% of the genetic differentiation is due to between-breed differences. The analysis of the genetic structure clearly showed the differentiation of the Ca Rater Mallorquí from the rest of breeds, without any evident signs of substructure. In conclusion, the Ca Rater Malloquí presents a high genetic diversity, it is a defined and genetically homogeneous breed that shows no signs of crossbreeding with the rest of the breeds included in the study. These results provide essential knowledge of the genetic situation of the Ca Rater Mallorquí and constitute a starting point for the design and implementation of a conservation plan for the breed. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Elymus scabrifolius es una gramínea perenne nativa de Sudamérica con gran potencial como recurso forrajero para ambientes con limitantes edáficas. En el presente trabajo se analizó la utilización de caracteres morfológicos y marcadores moleculares AFLP para la identificación genotípica de seis accesiones, un cultivar comercial y siete híbridos artificiales de esta especie. Ambos tipos de marcadores permitieron diferenciar a los materiales analizados en los respectivos dendrogramas, aunque las relaciones entre materiales variaron según el tipo de marcador. El Análisis de Componentes Principales permitió identificar las variables más relevantes para la diferenciación morfológica. Los híbridos se diferenciaron morfológicamente de ambos parentales, excepto un híbrido que se agrupó con su material paterno. Aunque en el análisis de los marcadores AFLP los híbridos se agruparon con uno de sus parentales, se pudo corroborar su origen híbrido mediante el registro de bandas paternas y polimórficas entre parentales. Se concluye que las metodologías empleadas para caracterizar los materiales analizados de E. scabrifolius serían de gran utilidad para el manejo eficiente de colecciones de germoplasma como así también para su utilización en programas de mejoramiento genético.

Orchids of the Vanda genus have great value in the ornamental market due to the showiness of their flowers. Genetic improvement in this genus, is mostly carried out through conventional methods, but the high demand of the current market for new cultivars makes it necessary to include molecular and biotechnological techniques in genetic improvement. The aim of this review is to analyze the usefulness of different molecular and biotechnological tools for the development of a breeding program in Vanda, through the interrelation with reproductive biology and conventional breeding in the genus. A total of 95 articles published in scientific journals were consulted in this review. As a result, a compilation of information is provided that can serve as reference material for technicians, professionals and researchers related to this subject. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

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A nivel mundial se ha observado una transformación en la actividad forestal desde hace varios años, concentrándose en dos fenómenos. La primera, en las necesidades de obtener madera para el abastecimiento del área industrial mediante el establecimiento de plantaciones forestales. Y la segunda, entorno a la protección ambiental de los recursos naturales. Esta revisión se centra en los conocimientos precursores de la biotecnología forestal en la aplicación de nuevas herramientas tecnológicas. La metodología de búsqueda de información se efectuó por relevancia del tema, con investigaciones precedentes y actuales, conjugando sólidos argumentos al entendimiento básico de las tecnologías emergentes en la mejora genética forestal tropical. Del análisis de revisión, se concluye que las limitantes son los escasos recursos económicos destinados a las investigaciones de mejora forestal en busca de utilizar las nuevas herramientas moleculares disponibles, como una estrategia de manejo sostenible y sustentable de los recursos forestales tropicales.

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This study deals with the genetic characterisation of the dog Ca Rater Mallorquí, whose former function was hunting small mammals. The aim of this study is to analyse the within and between breed genetic diversity and genetic differentiation by comparing this population with other breeds with the same geographical distribution and functional characteristics. Thirty-three microsatellites recommended by the International Society of Animal Genetics (ISAG) were analysed in 79 samples. The between-breeds genetic diversity study was carried out with data obtained from 275 samples of 5 Balearic dog breeds: Ca Mè Mallorquí, Ca de Bou, Ca de Bestiar, Ca de Conills de Menorca and Ca Eivissenc (Podenco Ibicenco). The population has not a significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, with an HO of 0.656 and an HE of 0.685. The FST statistic showed that 13,10% of the genetic differentiation is due to betweenbreed differences. The analysis of the genetic structure clearly showed the differentiation of the Ca Rater Mallorquí from the rest of breeds, without any evident signs of substructure. In conclusion, the Ca Rater Malloquí presents a high genetic diversity, it is a defined and genetically homogeneous breed that shows no signs of crossbreeding with the rest of the breeds included in the study. These results provide essential knowledge of the genetic situation of the Ca Rater Mallorquí and constitute a starting point for the design and implementation of a conservation plan for the breed. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Molecular markers can be used to monitor genetic variability in cultivated fish stocks with the aim of developing better aquaculture techniques and increasing productivity. In view of the above, the objective of the present work was to evaluate the genetic variability in pirarucu broodstocks in fish farms in the southeast and northeast of the of Pará state, Brazil. The samples were genotyped using four microsatellite markers, and genetic diversity indices were calculated for each broodstock. A total of 16 alleles were identified from the four loci tested in the 33 pirarucu samples, with means of 3.00, 2.75, and 2.25 alleles per locus in broodstocks from Tucumã, Parauapebas, and Moju municipalities, respectively. The Parauapebas broodstock had the highest mean observed heterozygosity. In the broodstocks from Tucumã and Parauapebas, the markers AgCAm16 and AgCAm18 were not at Hardy-Weinberg equilibrium. This pilot study showed that there were considerable losses of genetic variability in pirarucu breeding centers in the municipalities of Tucumã, Parauapebas and Moju compared to the variability in the natural populations of this fish species. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Pterodon pubescens and P. emarginatus (Leguminosae) are native medicinal plants of Brazil. Extractivism due to its therapeutic properties threatens populations of both species. Studies of genetic diversity is a way to reason the use and promote conservation. We developed microsatellite markers for P. pubescens and transferred them to P. emarginatus to further genetic diversity investigation of these species. From genomic sequences of P. pubescens, obtained via the Illumina MiSeq platform, it was possible to identify 6,514 microsatellite regions, to design 5,419 primer pairs, and to test 30 markers amplification. We provide 26 polymorphic microsatellite markers, 10 of which were genotyped in 48 individuals per species. The number of alleles per locus range from 3 to 16, with high average genetic diversity (P. pubescens HE = 0.753; P. emarginatus HE = 0.691). The genotyped markers have a high paternity exclusion probability (Q values greater than 0.99) and low probability of identity, indicating that set of loci is capable of individual discriminating in P. pubescens and P. emarginatus. Microsatellite markers provided in this study are a tool for population genetics studies and conservation of the two species and can be applied to closely related non-model species. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

The biological pest control has expanded in Brazil with the Trichogramma pretiosum as the main natural enemy. The microsatellite molecular markers Simple Sequence Repeat (SSR) have been the most used, as they are multiallelic, robust and reproducible, in several species. In order to optimize future processes of identification and analysis of the parasitoid's genetic diversity, twenty markers, isolated and characterized for the parasitoid wasp Trichogramma dendrolimi, were tested in 15 generations of T. pretiosum. Those markers, ten have been transferred and can be used to evaluate the genetic variation of T. pretiosum. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

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Los marcadores moleculares son útiles para determinar la presencia de cambios genéticos durante el proceso de transformación. Entre ellos, los marcadores funcionales distribuidos al azar en todo el genoma pueden reflejar variaciones genéticas de interés directo. Por este motivo, el objetivo de este trabajo fue determinar la similitud con la variedad de caña de azúcar sin transformar de diferentes eventos transgénicos mediante el uso de marcadores TRAP (" Target Region Amplified Polymorphism"). Para ello, ADNs provenientes de los eventos transgénicos, los genotipos sin transformar y de otras variedades de caña de azúcar se caracterizaron mediante amplificación con siete a nueve combinaciones de cebadores TRAP. Los marcadores se separaron mediante electroforesis en geles de poliacrilamida en condiciones desnaturalizantes en el equipo Li-cor DNA Analyzer. Los fragmentos amplificados fueron transformados en matrices binarias de 0/1, utilizadas para calcular el coeficiente de Jaccard y construir árboles de similitud. En primer lugar, los marcadores permitieron confirmar las evaluaciones fenotípicas preliminares de eventos resistentes al herbicida glifosato de la variedad RA 87-3, dado que aquellos eventos fenotípicamente similares a la variedad sin transformar no mostraron cambios genéticos o solo algunos menores, mientras que eventos con aberraciones de crecimiento presentaron un alto nivel de polimorfismo. La incorporación en el análisis de otros genotipos permitió validar internamente la técnica asegurando el análisis de un número significativo de bandas polimórficas. Considerando la precisión de esta metodología, se la aplicó de rutina para caracterizar eventos transgénicos de las variedades LCP 85-384, TUCCP 77-42, TUC 95-10 y TUC 03-12 en las primeras etapas del proceso de evaluación. En conclusión, el uso de marcadores TRAP constituye una estrategia rápida y recomendable para caracterizar e identificar eventos transgénicos genéticamente próximos a su genotipo sin transformar. Esto posibilita la selección en las primeras etapas de evaluación de aquellos eventos más adecuados para realizar los ensayos a campo.

Introducción. La pimienta es una especie de la familia de la Piperaceae, originaria de la Costa de Malabar, situada en Kerala al sur de la India. En Costa Rica, las principales plantaciones de pimienta se localizan desde Upala hasta Talamanca, e incluye toda la franja costera y la parte baja de Sarapiquí. Según estudios de factibilidad, el país cuenta con el potencial para producir pimienta con altos parámetros de calidad. Sin embargo, las enfermedades vasculares son una de las principales limitantes del cultivo. Objetivo. El objetivo de esta investigación fue el aislamiento e identificación molecular y morfológica de las especies de Fusarium asociadas al cultivo de la pimienta (Piper nigrum L.) en 2 de las principales zonas productoras del país. Materiales y métodos. Se recolectaron treinta muestras de plantas enfermas de distintas fincas en las zonas de Sarapiquí y Guatuso, se describieron detalladamente los síntomas observados en el sistema radical y/o la base del tallo para cada una de las plantas recolectadas. Los veintiún aislamientos de Fusarium spp. obtenidos se identificaron molecularmente con la secuencia parcial del gen Factor de Elongación 1α (EF-1α) y para la identificación morfológica se utilizaron los medios de cultivo PDA y Carnation Leaf-piece Agar (CLA). Resultados y conclusiones. Se confirmó la presencia de Fusarium oxysporum en las muestras provenientes de Sarapiquí, así como la presencia de Fusarium solani en ambas zonas muestreadas. Se reporta por primera vez, la presencia de las especies Fusarium concentricum y Fusarium proliferatum asociadas a la marchitez vascular.

La “escaldadura” es una enfermedad importante en el cultivo de cebada. En la literatura se han descripto genes que confieren resistencia genética (Rrs) a esta enfermedad. En Argentina, más del 80% del área sembrada de cebada corresponde a las variedades Shakira, Andreia y Scarlett. La primera porta alelos de resistencia para el gen Rrs2, los cuales pueden ser identificados por técnicas moleculares. Sin embargo, no existen reportes de la respuesta fenotípica de estos cultivares en zonas de producción agrícola de cebada en Argentina. El objetivo de este trabajo fue validar el gen Rrs2, involucrado en la resistencia para “escaldadura” en las variedades de cebada más difundidas en Argentina y determinar si el marcador desarrollado sobre dicho gen puede ser aplicado en selección asistida en programas de mejoramiento. Para ello, se utilizaron los cultivares Scarlett, Andreia y Shakira y una población biparental RIL de 158 individuos derivada del cruzamiento de Andreia y Shakira. Los genotipos fueron caracterizados fenotípicamente a campo en las localidades de Bordenave, Balcarce y Coronel Suárez. Además, se caracterizaron molecularmente por la presencia (Rrs2+) o ausencia (Rrs2-) de alelos de resistencia. Los resultados muestran que los genotipos parentales Shakira y Andreia presentan respuestas altamente contrastantes en los tres ambientes de evaluación. Las líneas derivadas de este cruzamiento mostraron diversas respuestas frente al patógeno. Se observó que no existen diferencias significativas entre las líneas que portan el alelo de resistencia (Rrs2+) y la variedad Shakira. Tampoco se encontraron diferencias significativas al analizar la respuesta de las líneas que portan el alelo de susceptibilidad (Rrs2-) y la variedad Andreia. Sin embargo, ambos grupos de líneas difieren significativamente entre sí, de la misma manera que lo hacen las variedades usadas como parentales. Tanto la variedad Shakira como las líneas portadoras de Rrs2+ presentaron buena respuesta frente a la enfermedad. Esto indica que dicho alelo sería el responsable de la resistencia frente al patógeno para estos genotipos. En contraste, la variedad Andreia y las líneas Rrs2- mostraron alta presencia de síntomas de la enfermedad, lo cual confirma que estos genotipos carecen de genes de resistencia efectivos para dicha enfermedad. Además, el marcador molecular desarrollado sobre el gen Rrs2 mostró ser eficaz en la selección de líneas derivadas del cruzamiento entre ambos cultivares. Esto indica que dicho marcador podría ser utilizado en planes de mejoramiento que utilicen fondos genéticos derivados de la variedad Shakira para la selección de individuos que porten alelos de resistencia a la enfermedad. Por último, este trabajo representa la primera caracterización a nivel fenotípico y molecular de cultivares de cebada cervecera utilizados ampliamente en sistemas de producción agrícola en las principales zonas agroecológicas de Argentina. Palablas clave: cebada cervecera, Rhynchosporiumsecalis, Rrs2, marcadores moleculares.

O município de Luiz Alves, SC, mantém tradições familiares na produção de cachaça e aguardente por alambiques artesanais, demandando processos de Identificação Geográfica para valorização do produto local e proteção do conhecimento tradicional associado. A fim de subsidiar a Identificação Geográfica dos produtos, o objetivo deste trabalho foi caracterizar, por bases moleculares, as leveduras nativas utilizadas por seis alambiques da região. Foram realizadas análises de três regiões genômicas: internal transcribed spacer (ITS), large subunit rRNA (LSU) e interdelta para comparação com a levedura comercial UFLA CA-11. Apesar da similaridade das sequências LSU/ITS de todas as leveduras nativas com Saccharomyces cerevisiae, inferências filogenéticas e análises de componentes principais da região interdelta demonstram diferenciação genética importante em relação à levedura comercial, além da singularidade entre as amostras de diferentes estabelecimentos. Os resultados apresentados são pioneiros na caracterização molecular de leveduras utilizadas no processo de produção de cachaças em SC visando à Identificação Geográfica dos produtos de Luiz Alves, e traz o potencial de uso destes marcadores moleculares no processo.

El aumento de requerimientos de bienes y servicios, la degradación de los ecosistemas y el cambio climático conminan a la comunidad científica a buscar alternativas eficientes en el uso y manejo de los recursos forestales maderables y no maderables, así como de otras plantas perennes como los frutales. Por ello, invertir en el progreso de los sistemas agroforestales y el desarrollo de la agroecología es una actividad indispensable. A diferencia de las plantas anuales, en las que las principales técnicas de fitomejoramiento implican hibridación y retrocruzas, en las especies de ciclo de vida largo se deben emplear otros métodos cuya finalidad sea aumentar y mejorar las cualidades útiles para la sociedad. De esta forma se podrán maximizar los beneficios que se obtienen de estas especies y minimizar el impacto ecológico y ambiental. México es un país que por tradición ha dado mayor importancia a la agricultura sobre la forestación y la silvicultura, actividades que hoy día son muy importantes para mitigar los efectos de cambio climático y la conservación de los ecosistemas; sin embargo, instituciones como el Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias (INIFAP) han realizado esfuerzos que buscan contribuir al desarrollo del campo mexicano a través del mejoramiento genético de plantas perennes. El presente texto busca resaltar algunos puntos importantes en cuanto a la historia, las técnicas y algunas experiencias del INIFAP relacionadas a este tema, tan relevante para el bienestar de las sociedades rurales y la conservación de la biodiversidad.

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The objective of this review work was to present the state of the art of methodologies and advances in coffee genetic improvement over time. Coffee (Coffe sp.) Is a highly valued crop for its consumption as a beverage. There are about 130 species of coffee, and the most cultivated are: Coffe arabica, C. canephora and C. liberica. The different levels of ploidy in the genus Coffea hinder the introduction of agronomic and quality characteristics from diploid species to tetraploid species. Therefore, the genetic improvement of coffee based on conventional methodologies is a long and tedious process, which can last up to more than 30 years. However, in recent decades biotechnological techniques have been developed that may well contribute to introducing the desired characteristics and accelerating genetic improvement processes. These methods are described in this article, to finally discuss the challenges and prospects for improvement. coffee genetics in the South of Manabí. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Background and aims:The ayocote bean (Phaseolus coccineus L.; 2n = 2x = 22), is a species native from Mexico that has been domesticated for human consumption, however there is little few information about its qualities, so the aim of this work consisted in investigating and gathering the most relevant aspects including: its center of origin and domestication, geographical distribution, patterns of morpho- agronomic and genetic diversity, productivity, further of beneficial properties of its consumption, it should be noted that its distribution in America ranges from the South from the United States to Northern Argentina. M&M: Different sources of information, both printed and digital, were consulted, which included: libraries, internet databases, manuals and technical reports, as well as personal interviews with experts and producers. Results: The results indicate the current situation of the genetic resource of the ayocote bean both in Mexico and in the world, which includes the different uses that the species has been given, for example its study in areas as diverse as forage production, bioremediation of soils, resistance to low temperatures, until introgression with other Phaseolus species. Conclusions: Due to the various interesting characteristics that the ayocote bean has, it is suggested to develop studies aimed at characterizing genetically and morphoagronomically a greater number of populations of the species, with the aim of generating improved varieties of common bean according to their production areas from germplasm of P. coccineus. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

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La presencia de toros con características seminales deficientes ocasiona fallas considerables en la eficiencia reproductiva de las unidades de producción, debido a la disminución del número de vacas preñadas, siendo más marcado en sistemas bajo programas de inseminación artificial (IA). Los rasgos de calidad seminal (CS) pueden constituir un criterio importante para la selección de machos reproductores utilizados en IA. La identificación de marcadores moleculares asociados con CS en el toro, podría facilitar la selección para estos rasgos. Este estudio tuvo como objetivo evaluar la asociación de los polimorfismos del gen Leptina, sobre la CS de toros de la raza Carora. Se evaluaron las variables volumen de eyaculado (VE), motilidad masal (MM), motilidad individual (MI) y concentración espermática (CE) de 43 toros reproductores Carora, organizados en 8 grupos de edad. Los polimorfismos nucleotídicos simples (SNP) del gen Leptina evaluados fueron: rs29004487 (SNP1), rs29004488 (SNP2), rs29004501 (SNP3) y rs29004508 (SNP4). Se utilizó un análisis de varianza mediante un modelo lineal generalizado (GLM). El factor genotipo contó con 10 niveles y el factor edad, 8 niveles. No se observó efecto del SNP1 sobre ninguna de las variables evaluadas, mientras que el SNP3 tuvo un efecto significativo sobre la CE. Los SNP2 y SNP4 presentaron un efecto altamente significativo sobre la MI y CE. Finalmente, las variables VE y MM no fueron afectadas por ninguno de los SNP estudiados. Los resultados del presente estudio sugieren marcadores potenciales para la valoración y selección genética de bovinos reproductores.

Introducción y Objetivos: El frijol ayocote (Phaseolus coccineus L.; 2n=2x=22), es una especie originaria de México que ha sido domesticada para consumo de su semilla, sin embargo existe poca difusión sobre sus cualidades, por lo que el objetivo del presente trabajo consistió en investigar y reunir sus aspectos más relevantes incluyendo: su centro de origen y domesticación, distribución geográfica, patrones de diversidad morfo-agronómica y genética, productividad, además de sus propiedades benéficas de consumo, cabe destacar que su distribución en América abarca desde el Sur de los Estados Unidos hasta el Norte de Argentina. M&M: Se consultaron diversas fuentes de información tanto impresas como digitales, las cuales incluyeron: bibliotecas, bases de datos en internet, manuales y reportes técnicos, además de entrevistas personales con expertos y productores. Resultados: Los resultados indican la situación actual del recurso genético del frijol ayocote tanto en México como en el mundo, donde se incluyen los distintos usos que se le ha dado a la especie por ejemplo su estudio en áreas tan diversas como producción de forrajes, biorremediación de suelos, resistencia a bajas temperaturas, hasta la introgresión con otras especies del mismo género. Conclusiones: Debido a las diversas características interesantes que tiene el frijol ayocote se sugiere desarrollar trabajos encaminados a caracterizar genética y morfoagronómicamente un mayor número de poblaciones de la especie, con el objetivo de generar variedades mejoradas de frijol común de acuerdo a sus zonas de producción a partir de germoplasma de P. coccineus.

Estudos com marcadores moleculares vêm sendo utilizados no melhoramento genético do arroz, destacando-se a técnica AFLP pela precisão e reprodutibilidade dos dados gerados. No presente trabalho, utilizouse esta técnica para caracterizar 19 cultivares pertencentes ao Banco de Germoplasma de Arroz Irrigado da Epagri, além de três genótipos F cuja base genética é constituída pelas cultivares Epagri 108 e Epagri 109 com introgressão de genes do genótipo multiespigueta. Procurou-se ainda estabelecer a relação entre os agrupamentos formados e a genealogia dos componentes de cada grupo. Foram observados 169 locos polimórficos, gerando dois grupos homogêneos com 17 dos 22 acessos avaliados. Oito das dez cultivares lançadas pela Epagri, bem como os três genótipos multiespigueta, posicionaram-se no mesmo grupo, apresentando similaridade maior do que 50%. Seis dessas cultivares são oriundas de cruzamentos realizados no Ciat, e as outras duas são oriundas de cruzamentos realizados na Embrapa/CNPAF, o que pode explicar em parte a similaridade genética entre elas.

En la Región San Martín existe una confusión en torno a la identificación de tres especies del género Guadua. Según la distribución y las características morfológicas se determina que “Kunth” procedente de La Florida (provincia de San Miguel, Región Cajamarca) corresponde a Guadua angustifolia Kunth, “Marona” procedente de Atumplaya (provincia de Moyobamba, Región San Martín) corresponde a Guadua lynnclarkiae Londoño, y “Guayaquil” procedente de la Región San Martín es definida como Guadua sp. al no tener identificación taxonómica definida. Mediante el análisis morfológico y molecular se identifican las variables morfológicas y moleculares que permiten la discriminación de las especies en estudio. El análisis morfológico se realizó en Guadua sp. y Guadua lynnclarkiae y consistió en mediciones diarias de altura de la planta, distancia entre nudos, número de nudos, número de ramificaciones, número de hojas, color de hojas (verdes claras o de color anaranjado) y diámetro, durante un mes. El análisis molecular fue realizado en las tres especies estudiadas, se extrajo el ADN para posteriormente realizar la amplificación de este por medio de la técnica ISSR. Los iniciadores ISSR utilizados fueron: IS-5, SSR 15, SSR 16 y SSR 22. Las variables morfológicas que permitieron diferenciar a las especies Guadua sp. y Guadua lynnclarkiae fueron la “altura” y “número de hojas”. Mientras que, el iniciador IS-5 permite discriminar a Guadua sp. de Guadua lynnclarkiae y Guadua angustifolia. Los iniciadores SSR 15, SSR 16 y SSR22 no permitieron diferenciar a las especies en estudio.

Introducción. Conocer la diversidad a nivel genético, químico y morfológico que existe entre individuos y poblaciones, es de gran utilidad en los programas de mejoramiento genético, ya que facilita la organización del material y la selección adecuada de genotipos superiores para el desarrollo de una población mejorada. Objetivo. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar genética, química y agronómicamente líneas avanzadas de tomate de cáscara (Physalis ixocarpa Brot.), del programa de mejoramiento de hortalizas del Campo Experimental Bajío (CE-Bajío) del Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias (INIFAP), México. Materiales y métodos. Durante la temporada primavera-verano y otoño-invierno de 2017, se cuantificó la variabilidad genética con marcadores moleculares de ADN de tipo AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism); se determinaron los compuestos fenólicos y tomatidina en fruto, y en lo agronómico el porcentaje de germinación, número de frutos por planta, peso del fruto, diámetro ecuatorial y polar, y el rendimiento. Resultados. Se obtuvo un promedio general de similitud entre los genotipos de 0,86. De acuerdo con las relaciones genéticas, se detectaron las líneas 4 y 70 como posibles progenitores de híbridos y un patrón geográfico en los agrupamientos. La diversidad química indicó que el mayor contenido de flavonoides (51,1 mg EAG/100 g) se presentó en la L-86, de fenoles y antocianinas (396, 8 y 7,22 mg EAG/100 g, resp.) en la L-182, y de taninos (188,4 mg EAG/100 g) en la L-97, mientras que la tomatidina fue mayor en frutos verdes (2,23-3,81 mg EAG/100 g) que en morados. El intervalo de rendimiento de las líneas fue de 11,4 a 47,6 t/ha, donde el 20% de las líneas superaron la media de rendimiento nacional (40 t/ha). Se destacó la L-37 con 47,6 t/ha, que además produjo mayor número de frutos por planta, diámetro ecuatorial y polar, y una tasa de germinación de 93,3%. Conclusión. Las líneas 37, 25, 27 y 167, tienen potencial para ser validadas para uso comercial y como líneas parentales.

El Bosque Seco Tropical (bs-T) es uno de los ecosistemas más degradados de Colombia requiriendo acciones urgentes para la conservación de sus relictos remanentes y la restauración de áreas degradadas. La diversidad genética es una herramienta fundamental para identificar áreas prioritarias de conservación in situ, y evaluar la calidad de las poblaciones como fuentes de semilla para su uso en la restauración. Aquí se presentan los resultados de una caracterización genética realizada con marcadores moleculares ISSRs (Inter Simple Sequence Repeats) en 251 individuos de cuatro especies clave del bs-T Colombiano: Bursera simaruba, Platymiscium pinnatum, Hura crepitans y Caesalpinia ebano. Las poblaciones más diversas para las cuatro especies se encontraron en la región del Caribe y en el enclave del Cañón del Chicamocha. Platymiscium pinnatum y B. simaruba también mostraron valores altos de diversidad en el valle del río Cauca y el desierto de La Tatacoa, respectivamente. Además, se evidenció estructura genética en las cuatro especies que podría estar asociada a las transformaciones históricas del bs-T en los periodos geológicos del Pleistoceno y el Holoceno. Finalmente, se identificaron fuentes de semilla en cada región para cada especie y entre ellos se destacan el norte Caribe y el área del enclave del Cañón del Chicamocha, por su riqueza y particularidad genética.

El aceite de maíz es un subproducto de la industria de molienda seca y húmeda, apreciado por su calidad nutricional. Los ácidos grasos saturados incrementan los niveles de colesterol total, mientras que los ácidos insaturados, como el ácido oleico, disminuyen los niveles sanguíneos de colesterol LDL (colesterol “malo”) y aumentan los de colesterol HDL (colesterol “bueno”). El objetivo general consistió en desarrollar y mejorar poblaciones de maíz por mayor contenido relativo de ácido oleico en el aceite, mediante selección recurrente fenotípica. A fin de evaluar la respuesta a la selección, se compararon los promedios de composición relativa de ácidos grasos de los granos de espigas S1 en tres ciclos consecutivos de selección. El método de selección aplicado fue efectivo para elevar el porcentaje de ácido oleico. A su vez, a partir de un panel de líneas elite de maíz desarrolladas por INTA Pergamino, se realizó la caracterización fenotípica, con el fin de determinar la variabilidad genética y heredabilidad para la composición acídica del aceite. El análisis de los componentes de varianza estimados permitió concluir que el componente genotípico fue el que contribuyó con la mayor parte a la variabilidad fenotípica. Las altas heredabilidades encontradas nos permitieron indicar una elevada confiabilidad del fenotipado llevado a cabo para la búsqueda de asociaciones con marcadores moleculares.Teniendo en cuenta la clasificación de los ácidos grasos según grupos heteróticos pudo detectarse una alta diversidad entre grupos, y un mayor contenido de oleico en el germoplasma de origen argentino comparado con el americano. Se realizaron también tres estudios a nivel molecular. El primero consistió en la búsqueda de marcadores moleculares asociados a la composición relativa de ácidos grasos a partir de poblaciones biparentales producto del cruzamiento de dos líneas contrastantes. El segundo estudio consistió en determinar cambios en la frecuencia de marcadores entre ciclos de selección recurrente de una población de maíz para incremento del porcentaje relativo de ácido oleico. En el tercer estudio se evaluó la utilización de marcadores en la conversión de líneas elite de maíz a versiones alto oleico. Se detectaron QTLs para contenido diferencial de ácido oleico y linoleico en el cromosoma 6, resultado que coincidió con lo hallado a través de las variaciones en las frecuencias alélicas a lo largo de los ciclos de selección evaluados. Por último, se pudo observar una fuerte asociación entre el contenido relativo de ácido oleico y los marcadores moleculares analizados en plantas provenientes de las líneas LP29 y LP214, a las cuales se les está incorporando el carácter alto oleico mediante cruzamientos y retrocruzamientos. Se señala, de esta forma, la relevancia de utilización de estos marcadores en programas de selección asistida para maíz alto oleico.

El objetivo de este estudio fue estimar parámetros genéticos con y sin la inclusión de parentesco genómico para la producción de leche acumulada a 60 (PL60), 150 (PL150), 210 (PL210) y 305 días (PL305) en ganado Simmental en Colombia. Un total de 2883 controles lecheros en 620 vacas de primer parto fueron utilizados. La información genómica se obtuvo a partir de 718 animales genotipados con un chip de una densidad de 30106 marcadores genéticos tipo polimorfismo de nucleótido simple (SNP). Se construyeron modelos de tipo univariado y bivariado bajo la metodología del mejor predictor lineal insesgado (BLUP) y genómico en una etapa (ssGBLUP). Los valores de heredabilidades para PL60, PL150, PL210 y PL305 variaron entre 0,20 a 0,27; 0,25 a 052; 0,30 a 0,35 y 0,20 a 0,23; respectivamente. La inclusión de parentesco genómico no aumentó las heredabilidades y tampoco la precisión de las estimaciones para las características asociadas a producción de leche. La escasez de información fenotípica y la baja conectividad genética entre la población genotipada y no genotipada podrían limitar procesos de selección genética para producción de leche a través del ssGBLUP en la población de ganado Simmental de Colombia.

Characidium sp. aff. C. vidali is a species found in coastal streams in southeastern Brazil, which has karyotypic explanatory elements as the occurrence of microstructural variations, keeping the chromosomal macrostructure of the genus. The objective of this study was to apply cytomolecular tools in the chromosomes of Characidium sp. aff. C. vidali to identify characteristics in their karyotype contributing to cytogenetic definition of this species, adding information about the evolution of the chromosomal structure of the group. The species showed 2n = 50 chromosomes and from 1 to 4 additional B microchromosomes. FISH technique showed histone H3 and H4 genes in the short arm of pair 10, and microsatellites (CA)15, (CG)15, (GA)15 and (TTA)10 clustered in the subtelomeric portions of all A chromosomes, with total accumulation by supernumerary. The telomeric probe marked terminal regions of all chromosomes, in addition to the interstitial portion of four pairs, called ITS sites, with these markings being duplicated in two pairs, hence the double-ITS classification. C-banding revealed that supernumerary chromosomes are completely heterochromatic, that ITS sites are C-banding positive, but double-ITS sites are C-banding negative. So, throughout the evolution to Characidium, genomic events are occurring and restructuring chromosomes in populations. [ABSTRACT FROM AUTHOR]