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1. Near-field microscopy and fluorescence spectroscopy: application to chromosomes labelled with different fluorophores

Author: C. Bisbal, P. Gall-Borrut, T. Salehzada, Laurent Mahieu-Williame, L. Costa, P. Falgayrettes, L. Nativel, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut d’Electronique et des Systèmes (IES), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Térahertz, hyperfréquence et optique (TéHO), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Etude et de Recherche Multimodal Et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant (CERMEP - imagerie du vivant), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-CHU Grenoble-Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU Saint-Etienne-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), and Institut de génétique humaine (IGH)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, Histology, Materials science, genetic structures, Physics::Optics, 02 engineering and technology, Fluorescence spectroscopy, Pathology and Forensic Medicine, 03 medical and health sciences, Optics, Microscopy, Image Processing, Computer-Assisted, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, Fluorescence microscope, Chromosomes, Human, Humans, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Fluorescent Dyes, 030304 developmental biology, Fluorescence loss in photobleaching, [PHYS.PHYS.PHYS-OPTICS]Physics [physics]/Physics [physics]/Optics [physics.optics], 0303 health sciences, Total internal reflection fluorescence microscope, Staining and Labeling, business.industry, reseauₙational, 021001 nanoscience & nanotechnology, imagerie_RMNₒptique, Chromatin, Spectrometry, Fluorescence, Light sheet fluorescence microscopy, Near-field scanning optical microscope, Fluorescence cross-correlation spectroscopy, sense organs, 0210 nano-technology, business
Abstract: We have coupled a spectrophotometer with a scanning near-field optical microscope to obtain, with a single scan, simultaneously scanning near-field optical microscope fluorescence images at different wavelengths as well as topography and transmission images. Extraction of the fluorescence spectra enabled us to decompose the different wavelengths of the fluorescence signals which normally overlap. We thus obtained images of the different fluorescence emissions of acridine orange bound to single or double stranded nucleic acids in human metaphase chromosomes before and after DNAse I or RNAse A treatment. The analysis of these images allowed us to visualize some specific chromatin areas where RNA is associated with DNA showing that such a technique could be used to identify multiple components within a cell.
Published: 2010

2. Combination of topological parameters and bone volume fraction better predicts the mechanical properties of trabecular bone

Author: Lis Mosekilde, Claude Laurent Benhamou, Sharmila Majumdar, Laurent Pothuaud, Bert van Rietbergen, Olivier Beuf, P. Levitz, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de physique de la matière condensée (LPMC), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biomécanique et génie biomédical (BIM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Orthopaedic Biomechanics
Subjects: Adult, Male, Méthodes et systèmes en IRM et optique, Normalization (statistics), Materials science, Compressive Strength, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Finite Element Analysis, Statistics as Topic, Biomedical Engineering, Biophysics, 030209 endocrinology & metabolism, Monotonic function, In Vitro Techniques, Topology, Models, Biological, Sensitivity and Specificity, 03 medical and health sciences, Bone volume fraction, Imaging, Three-Dimensional, 0302 clinical medicine, categₛt2i, Cluster Analysis, Humans, Computer Simulation, Orthopedics and Sports Medicine, Elastic modulus, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Lumbar Vertebrae, Rehabilitation, Reproducibility of Results, Middle Aged, Magnetic Resonance Imaging, imagerie_RMNₒptique, Elasticity, Finite element method, Exponential function, reseau_international, Trabecular bone, Volume fraction, Female
Abstract: Trabecular bone structure may complement bone volume/total volume fraction (BV/TV) in the prediction of the mechanical properties. Nonetheless, the direct in vivo use of information pertaining to trabecular bone structure necessitates some predictive analytical model linking structure measures to mechanical properties. In this context, the purpose of this study was to combine BV/TV and topological parameters so as to better estimate the mechanical properties of trabecular bone. Thirteen trabecular bone mid-sagittal sections were imaged by magnetic resonance (MR) imaging at the resolution of 117 x 117x 300 microm(3). Topological parameters were evaluated in applying the 3D-line skeleton graph analysis (LSGA) technique to the binary MR images. The same images were used to estimate the elastic moduli! by finite element analysis (FEA). In addition to the mid-sagittal section, two cylindrical samples were cored from each vertebra along vertical and horizontal directions. Monotonic compression tests were applied to these samples to measure both vertical and horizontal ultimate stresses. BV/TV was found as a strong predictor of the mechanical properties, accounting for 89-94% of the variability of the elastic moduli and for 69-86% of the variability of the ultimate stresses. Topological parameters and BV/TV were combined following two analytical formulations, based on: (1) the normalization of the topological parameters; and on (2) an exponential fit-model. The normalized parameters accounted for 96-98% of the variability of the elastic moduli, and the exponential model accounted for 80-95% of the variability of the ultimate stresses. Such formulations could potentially be used to increase the prediction of the mechanical properties of trabecular bone.
Published: 2002

3. Magnetic resonance imaging of normal and osteoarthritic trabecular bone structure in the human knee

Author: David C. Newitt, Sharmila Majumdar, Thomas M. Link, Olivier Beuf, Lynne S. Steinbach, Michael D. Ries, Srinka Ghosh, Nancy E Lane, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie moléculaire et fonctionnelle: de la physiologie à la thérapie, and Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-IFR8-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Adult, Male, Méthodes et systèmes en IRM et optique, musculoskeletal diseases, genetic structures, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Immunology, Osteoarthritis, Knee Joint, Severity of Illness Index, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Rheumatology, Arthropathy, categₛt2i, medicine, Humans, Immunology and Allergy, Pharmacology (medical), In patient, Femur, Tibia, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, 030203 arthritis & rheumatology, medicine.diagnostic_test, business.industry, Reproducibility of Results, Magnetic resonance imaging, Anatomy, Middle Aged, Osteoarthritis, Knee, musculoskeletal system, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, imagerie_RMNₒptique, reseau_international, Trabecular bone, Female, business
Abstract: Objective To use high-resolution magnetic resonance imaging (MRI) to evaluate the trabecular bone structure in the distal femur and the proximal tibia and its to correlate the findings with different stages of osteoarthritis (OA) of the human knee. Methods Axial images of the distal femur and proximal tibia were obtained at 1.5 T in patients without and with mild OA and with severe OA. The spatial resolution was 195 × 195 μm2 with a 1-mm slice thickness. Apparent measures of trabecular bone volume fraction (BV/TV), trabecular number (Tb.N), trabecular separation (Tb.Sp), and trabecular thickness (Tb.Th) were calculated. Results Significant differences existed in the trabecular bone structure of the femur and tibia. Differences in trabecular bone structure between the tibia and the femur decreased with the degree of OA. The apparent BV/TV, Tb.N, and Tb.Sp in the femoral condyles could be used to differentiate healthy patients or patients with mild OA from patients with severe OA (P < 0.05). Among individuals, the structural variation of the lateral and medial femoral condyle was indicative of the extent of the disease. Conclusion High-resolution MRI of the knee joint can provide a noninvasive assessment of trabecular bone structure. Trabecular bone structure, determined by high-resolution MRI, shows significant variation in patients with varying degrees of OA. The impact of OA on trabecular bone is different in the tibia than in the femur, and this difference depends on the extent of the disease.
Published: 2002

4. Trabecular Structure Assessment in Lumbar Vertebrae Specimens Using Quantitative Magnetic Resonance Imaging and Relationship with Mechanical Competence

Author: Olivier Beuf, David C. Newitt, Sharmila Majumdar, Lis Mosekilde, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, Male, Méthodes et systèmes en IRM et optique, Relaxometry, Materials science, Bone disease, Bone density, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Osteoporosis, 030209 endocrinology & metabolism, Lumbar vertebrae, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Bone Density, categₛt2i, medicine, Humans, Orthopedics and Sports Medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Bone mineral, Lumbar Vertebrae, business.industry, Biomechanics, Anatomy, Middle Aged, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, imagerie_RMNₒptique, Vertebra, reseau_international, medicine.anatomical_structure, Female, Nuclear medicine, business
Abstract: The purpose of this study was to use quantitative magnetic resonance imaging (MRI; high-resolution [HR] and relaxometry) to assess trabecular bone structure in lumbar vertebrae specimens and to compare these techniques with bone mineral density (BMD) in predicting stress values obtained from mechanical tests. Fourteen vertebral midsagittal sections from lumbar vertebrae L3 were obtained from cadavers (aged 22-76 years). HR images with a slice thickness of 300 microm and an in-plane spatial resolution of 117 microm2 x 117 microm2 were obtained. Transverse relaxation time T2' distribution was measured by using an asymmetric spin-echo (ASE) sequence. Traditional morphometric measures of bone structure such as apparent trabecular bone fraction (app. BV/TV), apparent trabecular bone number (app. Tb.N), apparent trabecular bone separation (app. Tb.Sp), and apparent trabecular bone thickness (app. Tb.Th) as well as the directional mean intercept length (MIL) were calculated. Additionally, BMD measurements of these sections were obtained by dual-energy X-ray absorptiometry (DXA) and biomechanical properties such as directional stress values (to fracture) were determined on adjacent specimens. With the exception of T2', all morphological parameters correlated very well with age, BMD, and stress values (R between 0.79 and 0.92). However, in the direction perpendicular to the magnetic field, T2' values enhanced the adjusted R2 correlation value with horizontal (M/L) stress values in addition to BMD from 0.70 to 0.91 (p < 0.05).
Published: 2001

5. Proton NMR Imaging in Dental Systems

Author: Olivier Beuf, Michèle Lissac, André Briguet, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biomécanique et génie biomédical (BIM), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, Artifact (error), [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Chemistry, Organic Chemistry, imagerie_RMNoptique, 030206 dentistry, categst2i, Biochemistry, 030218 nuclear medicine & medical imaging, Inorganic Chemistry, stomatognathic diseases, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, stomatognathic system, In vivo, Microscopic imaging, Proton NMR, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Biomedical engineering
Abstract: NMR methods for the analysis of the interface between tissues and prosthetic biomaterials are presented and applied to dental materials. The generation of susceptibility artifacts is explained and their correction is achieved. Results for in vitro and in vivo proton microscopic imaging of teeth and of the jaw area in mammals are given. Further applications of artifact compensation are indicated for imaging the mineral part of bone samples in vitro.
Published: 1999

6. In vivo Transverse Relaxation Time measurements from Localized CT-COSY and JPRESS: a validation study

Author: Martel, D., Friboulet, D., Grenier, D., Ratiney, H., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Images et Modèles
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee, Labex PRIMES
Abstract: International audience
Published: 2013

7. Spectroscopie proche-IR résolue en temps, spatiale et spectrale : réalisation d\textquoterightun système pour la mesure de l\textquoterightactivité cérébrale chez l\textquoterighthomme

Author: Montcel, B., Mottin, S., Gaillard, S., Lange, F., Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Hubert Curien [Saint Etienne] (LHC), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut d'Optique Graduate School (IOGS), Plateforme d'Imagerie Multimodale LyonTech (PILoT), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Mottin, S. and Lelièvre, and G.
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee, Labex PRIMES
Abstract: International audience
Published: 2012

8. Imagerie optique de l\textquoterightactivité cérébrale

Author: Montcel, B., Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

9. MR-liver steatosis assessment using a magnitude-based technique with independent fat and water T2* estimations, T1-related bias correction and accounting for spectral complexity of fat

Author: Leporq, B., Ratiney, H., Pilleul, F., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Departement d'imagerie Digestive, and Hospices Civils de Lyon (HCL)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

10. Polarisation dynamique nucléaire et RMN du 13C : design et performances d\textquoterightun prototype multi-échantillons

Author: CrÉmillieux, Y., Goutailler, F., Montcel, B., Grand, D., Vermeulen, G., Wolf, Pierre-Etienne, Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), SERAS (SERAS), Institut Néel (NEEL), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), and Hélium : du fondamental aux applications (HELFA)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

11. Metabolic Profile of Inflammation in the hyppocampus

Author: Combaz, X., Cayre, M., Le Fur, Y., Pecchi, E., Courtes, S., Confort-Gouny, Sylviane, Ratiney, H., Cozzone, P.J., Viola, A., Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche en neurobiologie - neurophysiologie de Marseille (CRN2M), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

12. MR-liver fat volume fraction quantification using a magnitude-based technique with independent fat and water T2* estimations, T1-related bias correction and accounting for fat multiple resonances

Author: Leporq, B., Ratiney, H., Saint Jalmes, H., Pilleul, F., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Departement d'imagerie Digestive, Hospices Civils de Lyon (HCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

13. Towards in vivo Ultrafast 2D Localized Magnetic Resonance Spectroscopy

Author: Roussel, T., Giraudeau, P., Ratiney, H., Akoka, S., Cavassila, S., Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee
Abstract: International audience
Published: 2011

14. A superwidebore DNP polarizer for multiple sample polarization: cryogenics performance and polarization at low temperature

Author: CrÉmillieux, Y., Goutailler, F., Montcel, B., Grand, D., Vermeulen, G., Wolf, Pierre-Etienne, Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), SERAS (SERAS), Institut Néel (NEEL), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), and Hélium : du fondamental aux applications (HELFA)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

15. Estimation locale de fréquence à l\textquoterightaide du rapport de filtres de Gabor

Author: Blanchard, R., Brusseau, E., Basset, O., Grenier, D., Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie Ultrasonore, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and RMN et optique : De la mesure au biomarqueur
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, Imagerie Ultrasonore, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_ultrasonore, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

16. Quantitative MRS lipid composition follow-up of a GSD1 mouse model subject to a diet change

Author: Ramamonjisoa, N., Ratiney, H., Guillou, H., Mutel, E., Mithieux, G., Pilleul, F., Rajas, F., Beuf, O., Cavassila, S., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), The Inositide Laboratory, Babraham Institute, Nutrition et cerveau (U1213, U855), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Departement d'imagerie Digestive, and Hospices Civils de Lyon (HCL)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

17. Measurement of absolute polarization level of polarized solid-state samples at low temperature using ERETIC technique

Author: CrÉmillieux, Y., Goutailler, F., Montcel, B., Grand, D., Vermeulen, G., Wolf, Pierre-Etienne, Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), SERAS (SERAS), Institut Néel (NEEL), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), and Hélium : du fondamental aux applications (HELFA)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

18. 3D-liver MR-DCE imaging for quantitative perfusion mapping using EGI grid

Author: Leporq, B., Camarasu-Pop, Sorina, Pilleul, F., Beuf, O., Images et Modèles, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Service Informatique et développements
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, reseau_international, Images et Modèles, commₒrale, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, st2i, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Labex PRIMES
Abstract: International audience
Published: 2011

19. Hepatic fatty acid quantification using MRS and GC in a mouse model of GSD1A under two different diets

Author: Guillou, Hervé, G., Mithieux, Pilleul, F., Rajas, F., Beuf, Olivier, Cavassila, S, Ramamonjisoa, N., Mutel, E, Ratiney, Hélène, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Nutrition et cerveau (U1213, U855), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), The Inositide Laboratory, Babraham Institute, Departement d'imagerie Digestive, Hospices Civils de Lyon (HCL), ProdInra, Migration, Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UAR 0241 Direction des Ressources Humaines, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Direction des Ressources Humaines (DRH)-Direction des Ressources Humaines (DRH), and Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service.
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee
Abstract: International audience
Published: 2011

20. CORRIGENDUM: Functional white laser imaging to study brain oxygen uncoupling/re-coupling in songbirds

Author: Mottin, S., Montcel, B., Chatelus, H., Ramstein, S., Vignal, C., Mathevon, N., Laboratoire Hubert Curien [Saint Etienne] (LHC), Institut d'Optique Graduate School (IOGS)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecologie comportementale (EC), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Hubert Curien (LHC), Institut d'Optique Graduate School (IOGS)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université de Rennes (UR)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université de Rennes 1 (UR1)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

21. Accurate Quantication for in vivo 2D J-Resolved Spectroscopy in rat brain at 7T

Author: Roussel, T., Cavassila, S., Langlois, JB., Grenier, D., Ratiney, H., Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, commₒrale, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee
Abstract: International audience
Published: 2011

22. 3D-liver quantitative perfusion mapping using EGEE grid with MR-DCE imaging and MS-325 blood pool contrast agent

Author: Leporq, B., Camarasu-Pop, Sorina, Pilleul, F., Beuf, O., Images et Modèles, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Service Informatique et développements
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, Images et Modèles, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, st2i, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Labex PRIMES
Abstract: International audience
Published: 2011

23. Classification des différents états physiologiques d\textquoterightun organisme aquatique: la daphnie (Daphnia magna) d\textquoterightaprès son spectre RMN HRMAS proton in vivo

Author: Bunescu, A., Fauvelle, F., Ratiney, H., Garric, J., Synthèse et étude de systèmes à intêret biologique (SEESIB), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biophysique Cellulaire et Moléculaire, Centre Recherche Service Santé Armée, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

24. Stratégies de quantification en spectroscopie 2D J-résolue in vivo

Author: Roussel, T., Cavassila, S., Ratiney, H., Ratiney, Helene, Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

25. Sampling strategy effects on in vivo 2D J-Resolved spectroscopy quantification

Author: Roussel, T., Cavassila, S., Ratiney, H., Ratiney, Helene, Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

26. In vivo hepatic localized proton magnetic resonance spectroscopy at 7T in a glycogen storage disease mouse model

Author: Ramamonjisoa, N., Ratiney, H., Rajas, F., Mutel, E., Pilleul, F., Beuf, O., Cavassila, S., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition et cerveau (U1213, U855), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

27. Fat content quantification errors using multiple gradient echo imaging: A phantom and simulation study

Author: Leporq, B., Ratiney, H., Cavassila, S., Pilleul, F., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

28. Short Echo Time H1 Chemical Shift Imaging data quantification in the mouse brain at 11.7T using a constrained parametric macromolecular model

Author: Ratiney, H., Le Fur, Y., Sdika, Michaël, Cavassila, S., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

29. Spectroscopie de resonance magnetique in vivo d\textquoterightun modele murin de glycogenose 1a a 7 T dans le foie

Author: Ramamonjisoa, N., Ratiney, H., Rajas, F., Mutel, E., Pilleul, F., Beuf, O., Cavassila, S., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition et cerveau (U1213, U855), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

30. Novel quantification strategy for in vivo 2D J-Resolved spectroscopy

Author: Roussel, T., Cavassila, S., Ratiney, H., Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille (CINaM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ratiney, Helene, Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

31. Beyond lipid quantification of in vivo clinical hepatic 1.5T 1H MRS signals

Author: Bucur, A., Ratiney, H., Beuf, O., Pilleul, F., Cavassila, S., Ratiney, Helene, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

32. Analyzing Magnetic Resonance Spectroscopic Signals with Macromolecular Contamination by the Morlet Wavelet

Author: Jean-Pierre Antoine, Sophie Cavassila, Adriana Bucur, Hélène Ratiney, Aimamorn Suvichakorn, Ratiney, Helene, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, Physics, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Pulse (signal processing), Noise (signal processing), Gaussian, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, Wavelet transform, imagerie_RMNₒptique, Signal, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, 0302 clinical medicine, Nuclear magnetic resonance, Wavelet, Morlet wavelet, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, symbols, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030217 neurology & neurosurgery, Second derivative
Abstract: We study the Morlet wavelet transform on characterizing Magnetic Resonance Spectroscopy (MRS) signals acquired at short echo-time. These MRS signals usually contain contributions from metabolites, water and a baseline which mainly originates from large molecules, known as macromolecules, and lipids. As its shape and intensity are not known a priori, the baseline accommodation becomes one of the major obstructions in in vivo short echo-time MRS quantification. We acquired an in vivo macromolecule MRS signal on a horizontal 4.7T Biospec system by optimizing the inversion time, which represents the delay between the inversion pulse and the first pulse of the PRESS sequence. As a consequence, the metabolites are nullified while the others are maintained. The metabolite-nullified signal from a volume-of-interest centralized in the hippocampus of a healthy mouse was a combination of residual water, baseline and noise. Compared to the simulated signal of creatine, the signal decays much faster. The time-scale representation of the wavelet can therefore distinguish the two signals without any additional pre-processing. The amplitude of the metabolite is also correctly derived although at earlier time it still has an effect of the baseline. In addition, we also show that the Morlet wavelet can be used to characterize different lineshapes, e.g. Lorentzian, Gaussian or Voigt, which are generally used to model the MRS signals. That is, the first derivative of the modulus of the wavelet transform relates to the damping effect of the Lorentzian lineshape while its second derivative indicates the second-order broadening of the Gaussian and Voigt. The performance of the wavelet when applied to an in vitro creatine is also presented.
Published: 2009

33. Quantitative assessment of the brain macromolecular content in a mouse model of neuro-inflammation from chemical shift imaging data at 11.7T

Author: Ratiney, H., Le Fur, Y., Sdika, Michaël, Touret, M., Bernard, A., Cavassila, S., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupement de Recherche et d'Etudes en Gestion à HEC (GREGH), Ecole des Hautes Etudes Commerciales (HEC Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neuro-oncologie et neuro-inflammation, Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM IFR19, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

34. Simultaneous two-channel mice brain chemical shift imaging using a standard Biospec spectrometer

Author: Rengle, A., Ratiney, H., Cavassila, S., Beuf, O., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

35. Lineshape Pertinence in in vivo hepatic 1H Magnetic Resonance Spectroscopic data fitting

Author: Cavassila, S., Ratiney, H., Bucur, A., Pilleul, F., Beuf, O., Ratiney, Helene, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

36. MRS 2D quantification vs 1D quantification

Author: Roussel, T., Ratiney, H., Cavassila, S., Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille (CINaM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ratiney, Helene, Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

37. Towards structure specific macromolecular content of mouse brain from Chemical Shift Imaging data at 11.7T

Author: Ratiney, H., Sdika, Michaël, Beuf, O., Le Fur, Y., Cavassila, S., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

38. MR-Elastography versus quasi-static US-Elastography

Author: Grenier, D., Brusseau, E., Liebgott, H., Duboeuf, F., Pilleul, F., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, Imagerie Ultrasonore, [INFO.INFO-TS]Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

39. On the use of internal reference for in vivo Magnetic Resonance Spectroscopy in the liver

Author: Bucur, A., Ratiney, H., Beuf, O., Pilleul, F., Cavassila, S., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

40. Morlet wavelet analysis of Magnetic Resonance Spectroscopic signals with macromolecular contamination

Author: Aimamorn Suvichakorn, Hélène Ratiney, Adriana Bucur, Sophie Cavassila, Jean-Pierre Antoine, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, Physics, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Noise (signal processing), Pulse (signal processing), Metabolite, Wavelet transform, 020206 networking & telecommunications, 02 engineering and technology, imagerie_RMNₒptique, 01 natural sciences, Signal, 010309 optics, chemistry.chemical_compound, Nuclear magnetic resonance, Amplitude, Wavelet, Morlet wavelet, chemistry, 0103 physical sciences, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering
Abstract: International audience; We apply theMorlet wavelet transform to characterizing Magnetic Resonance Spectroscopy (MRS) signals acquired at short echo-time. These signals usually contain contributions from metabolites, water and a baseline which mainly originates from large molecules, known as macromolecules, and lipids. The baseline accommodation is one of the major obstructions in in vivo short echo-time MRS quantification as its shape and intensity are not known a priori. In this paper, the simulated signal of the N-acetylaspartate (NAA) metabolite is used as a test signal to be recovered after adding the in vivo macromolecular signal. The in vivo macromolecule MRS signal was acquired on a horizontal 4.7T Biospec system. By optimizing the inversion time, which represents the delay between the inversion pulse and the first pulse of the PRESS sequence, the metabolites are nullified while the others are maintained. The metabolite-nullified signal from a volume-of-interest centralized in the hippocampus of a healthy mouse, which was a combination of residual water, baseline and noise, was added to the signal of NAA. The amplitude of the metabolite is also varied to visualize the sensitivity of the wavelet transform at different ratios between the intensity of the macromolecular and the metabolite signals. Compared to the simulated signal of NAA, the signal decays much faster. The time-scale representation of the wavelet can therefore distinguish the two signals without any additional pre-processing. The amplitude of the metabolite is also correctly derived although at earlier time it still has an effect of the baseline.
Published: 2008

41. Quantification method using the Morlet wavelet for Magnetic Resonance Spectroscopic signals with macromolecular contamination

Author: Jean-Pierre Antoine, Hélène Ratiney, Aimamorn Suvichakorn, Sophie Cavassila, Adriana Bucur, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, Magnetic Resonance Spectroscopy, Macromolecular Substances, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, 02 engineering and technology, Signal, symbols.namesake, 020210 optoelectronics & photonics, Wavelet, Nuclear magnetic resonance, Image Interpretation, Computer-Assisted, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, Humans, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Physics, Models, Statistical, Fourier Analysis, Phantoms, Imaging, Reproducibility of Results, Signal Processing, Computer-Assisted, 020206 networking & telecommunications, Image enhancement, Creatine, Image Enhancement, Lipids, imagerie_RMNₒptique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Morlet wavelet, Fourier analysis, Magnetic resonance spectroscopic, symbols, Regression Analysis, Algorithms, Macromolecule
Abstract: We study the Morlet wavelet transform on characterizing Magnetic Resonance Spectroscopic (MRS) signals acquired at short echo-time. These signals contain contributions from metabolites, water and a baseline which mainly originates from large molecules, known as macromolecules, and lipids. The baseline signal decays faster than the metabolite ones. Therefore, by making use of the time-scale representation of the wavelet, the two signals can be distinguished without any additional pre-processing. This is confirmed by the experimental results which show that the Morlet wavelet can correctly quantify the metabolite contributions even when a baseline is embedded in the MRS signals.
Published: 2008

42. Analyse quantitative des altérations métaboliques chez un modèle murin de neuro-inflammation par SRM

Author: Bucur, A., Bernard, Arlette, Cudalbu, C., Giraudon, P., Graveron-Demilly, D., Ratiney, H., Cavassila, S., Ratiney, Helene, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM IFR19, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuro-oncologie et neuro-inflammation, and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, commₒrale, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Imagerie cérébrale
Abstract: International audience
Published: 2008

43. Automatic Quantitative analysis of HRMAS 1D proton spectra from rat liver biopsies

Author: Ratiney, H., Da Costa, G., Metzinger, V., Eliat, P., Cavassila, S., Saint Jalmes, H., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Ratiney, Helene, Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2008

44. Quantitative analysis of metabolic Alterations in a mouse model of Neuro-inflammation using In vivo MR Spectroscopy

Author: Bucur, A., Bernard, Arlette, Cudalbu, C., Giraudon, P., Graveron-Demilly, D., Ratiney, H., Cavassila, S., Ratiney, Helene, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM IFR19, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuro-oncologie et neuro-inflammation, and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee, Imagerie cérébrale
Abstract: International audience
Published: 2008

45. Estimation d\textquoterightune mixture de gaussiennes par l\textquoterightalgorithme d\textquoterightEspérance-Maximisation pour la modélisation des signaux de macromolécules acquis par inversion-récupération

Author: Ratiney, H., Bucur, A., Cudalbu, C., Cavassila, S., Ratiney, Helene, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee
Abstract: International audience
Published: 2008

46. Quantification of the hepatic fatty infiltration and the metabolite concentrations using Magnetic Resonance Spectroscopy and in and out of phase Imaging

Author: Cavassila, S., Bucur, A., Ratiney, H., Cudalbu, C., Beuf, O., Pilleul, F., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, commₒrale, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2008

47. Effective Voigt model estimation using multiple random starting values and parameter bounds settings for in vivo hepatic 1H Magnetic Resonance Spectroscopy data

Author: Michaël Sdika, Sophie Cavassila, Franck Pilleul, Adriana Bucur, Hélène Ratiney, Olivier Beuf, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Voigt profile, Méthodes et systèmes en IRM et optique, Mathematical optimization, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Gaussian, Monte Carlo method, imagerie_RMNₒptique, imagerie_digestive, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 03 medical and health sciences, Nonlinear system, symbols.namesake, 0302 clinical medicine, In vivo, Kelvin–Voigt material, Damping factor, symbols, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, Applied mathematics, A priori and a posteriori, 030211 gastroenterology & hepatology, categₘixte, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Mathematics
Abstract: In vivo hepatic 1H lineshapes modeled by the complex Voigt function are desirable to reduce systematic error and obtain accurate fits. However, the optimization procedure becomes challenging when the peak resonances overlap and the proportion of Gaussian to Lorentzian dampings is a priori unknown. In this context, nonlinear least-squares algorithms generally invoked in Magnetic Resonance Spectroscopy quantification are highly sensitive to the starting values and parameter bounds. To alleviate this sensitivity, multiple random starting values and parameter bounds settings are used to generate candidate solutions. The "best fit" fulfilling requirements on the cost function and damping factor final values is then selected among them. Monte Carlo studies and an in vivo hepatic 1H signal quantification demonstrated the relevance of the proposed strategy.
Published: 2008

48. Quantification of Metabolites in HR-MAS Spectra of Human Prostate Biopsy Tissues Using ERETIC and the QUEST Algorithm

Author: Zhang, V., Gurascier, H., Albers, M., Ratiney, H., Tabatai, L., Simko, J., Lu, Y., Vigneron, D., Swanson, M., Kurhanewicz, J., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2008

49. Re-configuration of a \textquoterightstandard\textquoteright Biospec spectrometer for simultaneous 2-channel acquisitions: Application for mouse brain MRI and MRS

Author: Rengle, A., Ratiney, H., Bucur, A., Cavassila, S., Beuf, O., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2008

50. Re-configuration of a 'standard' Biospec spectrometer for simultaneous 2-channel acquisitions: Application for mouse brain MRI and MRS

Author: Rengle, A., Ratiney, H., Bucur, A., Cavassila, S., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2008

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