Search

Amino acids sequences of CagL obtained from 42 H. pylori isolates aligned against H. pylori strain P12.

Introduction: Disability and decrease in the quality of life owing to the nature of schizophrenia are considered factors that predispose patients to parasitic infections. This study aimed to investigate intestinal parasites in schizophrenia and healthy volunteers with similar age-gender data and to contribute to the literature and/or clinical practice by determining the underlying cause of gastrointestinal complaints (such as side effects of psychiatric drugs or overlooked parasitic infection) in patients with schizophrenia. Methods: This case-control study included 30 patients with schizophrenia and 30 healthy volunteers. Their stool samples were examined for the presence of intestinal parasites primarily microscopically or serologically in cases requiring differential diagnosis. Results: The overall positivity rate of intestinal parasites was 25% (15/60). The difference between the intestinal parasite detection rates, which was 36.7% (11/30) in the schizophrenia group and 13.3% (4/30) in the healthy control group, was significant (odds ratio: 3.76; 95% confidence interval: 1.04-13.65; p

Milet antik kentindeki Ionic Stoanın bir bölümünde 1979-1988 yılları arasında ayağa kaldırma çalışmaları yapılmıştır. Yapının ayağa kaldırılan bölümlerindeki taş tamamlama uygulamaları bu çalışmanın esasını oluşturmaktadır. Tamamlamanın hangi yöntem ve üslup ile ele alındığı, tamamlamada tercih edilen malzeme türü, yeni malzemenin özgün malzeme ile uyumu, müdahalenin estetik boyutu, çağdaş tamamlama müdahalesini özgünden ayıran belirtme esasları ve son olarak da tamamlama müdahalesinin kalıcılığı ve sürdürülebilirliği konuları üzerinde durulmuştur.

Introduction The opinion that latent Toxoplasma gondii infection is having a broadly asymptomatic projection has now been interrogated, in specific due to the echoed association between the latent infection and an elevated incidence of schizophrenia or even suicide attempts. Notwithstanding conducted studies aimed to understand this feasible link are restricted. Methods In the present case-control study, we focused to illuminate the relationship between the serological and molecular presence of T gondii and schizophrenia with or without the suicide attempts by comparing it with healthy individuals. A total of 237 participants (117 in schizophrenia and 120 in healthy control) were included in this study. Results Overall, latent T gondii infections were found statistically higher in 63 (53.8%) of the 117 patients with schizophrenia and in 33 (27.5%) of the 120 controls (P < .001). In schizophrenia patients, seroprevalence T gondii was again found to be statistically higher in suicide attempters (59.6%), compared with no history of suicide attempts (48.3%; P < .05). The molecular positivity rate of T gondii DNA was higher in the schizophrenia group, compared with the healthy control group (P < .05), whereas the history of suicide attempts was not statistically associated (P = .831) with T gondii DNA positivity by polymerase chain reaction. Conclusion This case-control study enlightens additional demonstration to the belief that T gondii infection would be an underlying component for the pathophysiology of schizophrenia. Regardless of the clarity results of this study, this supposition warrants further endorsement. Istanbul Aydin University Scientific Research Projects Unit [2020/13] Istanbul Aydin University Scientific Research Projects Unit, Grant/Award Number: 2020/13

Yapay zekâ insanlara has özelliklerden olan akıl yürütme, mevcut bilgilerden çıkarım yapma, bilgileri kullanarak genelleme yapabilmesi ve geçmiş tecrübelerimizden yararlanarak yaşantımızda kalıcı etki bırakması (öğrenme) gibi zihinsel süreçlerimize ait yeteneklerin bir bilgisayar ya da makineye sezgisel ve meta-sezgisel yöntemlerle geliştirilen programlar yardımıyla kazandırılmasını sağlayan geniş ve kapsamlı bir çalışma alanıdır. Yapay sinir ağı karşımıza en çok çıkan Yapay Zekâ yöntemlerinden bir tanesidir. Sınıflandırma ve Tahmin problemlerinde sıkça kullanılan Yapay Sinir Ağlarının eğitilmesinde kullanılan ve geliştirilen sezgisel ve meta-sezgisel çok sayıda algoritma bulunmaktadır. Gün geçtikçe de bu algoritmaların sayısı artmaya devam etmektedir. Bu tez çalışmasında YSA'ların eğitiminde kullanılan metotlardan İleri Beslemeli Sinir Ağı, Kademeli İleri Sinir Ağı, Genelleştirilmiş Regresyon Sinir Ağı, Olasılıksak Sinir Ağı ve Tekrarlayan Sinir Ağı kullanılarak YSA ağları eğitilmiş sonuçlar tek ara katmanlı sinir ağı ve çok ara katmanlı 10 kat çapraz doğrulamalı sinir ağları ile YSA'ların performans değerleri belirlenmiştir. Tez çalışmamızın performanslarını kontrol etmek adına UCI Machine Learning Repository'de yer alan Ionosphere, Iris ve Wine olmak üzere 3 veri kümesi deneysel sonuçlarda kullanılmıştır. Deney sonuçlarında Karışıklık matrisleri bulunmuş ve bu karışıklık matrisinden yaralanarak sınıflandırma doğrulukları, hassasiyetleri, duyarlılık ve F1-Skorları dinamik olarak yapılan kodlama ile parametreler istenildiği zaman güncellenebilmektedir. Belirlenen parametreler ile hem tek ara katman için hem çok ara katmanlı 10 kat çapraz doğrulama teknikleri kullanılarak hedeflenen değerler hesaplanmıştır. Ionosphere veri kümesi üzerinde Tek Ara Katmanlı metotlardan %88,57 ile en yüksek doğruluk derecesi İleri Beslemeli Sinir Ağı metodu ile sağlanırken, Çok Ara Katmanlı ve 10 Kat Çapraz Doğrulama kullanan metotlardan %96,58 ile en yüksek doğruluk derecesine Kademeli İleri Sinir Ağı metodu ulaşmıştır. Iris veri kümesi üzerinde Tek Ara Katmanlı metotlardan %98,67 ile en yüksek doğruluk derecesi Tekrarlayan Sinir Ağı metodu ile sağlanırken, Çok Ara Katmanlı ve 10 Kat Çapraz Doğrulama kullanan metotlardan %100 ile en yüksek doğruluk derecesine yine Tekrarlayan Sinir Ağı metodu ulaşmıştır. Şarap veri kümesi üzerinde Tek Ara Katmanlı metotlardan %96,63 ile en yüksek doğruluk derecesine İleri Beslemeli Sinir Ağı ve Kademeli İleri Sinir Ağı metotları ile sağlanırken, Çok Ara Katmanlı ve 10 Kat Çapraz Doğrulama kullanan metotlardan %100 ile en yüksek doğruluk derecesine Tekrarlayan Sinir Ağı metodu ulaşmıştır., Artificial intelligence is a wide and comprehensive field of study which is about the acquisition of the abilities of our mental processes such as reasoning, making inferences from existing information, making generalizations using information, and making a permanent effect in our lives (learning) by making use of our past experiences to a computer or machine with the help of programs developed with intuitive and meta-intuitive methods. Artificial neural network is one of the most common Artificial Intelligence methods. There are many heuristic and meta-heuristic algorithms that are used and developed in training Artificial Neural Networks, which are frequently used in Classification and Prediction problems. The number of these algorithms continues to increase day by day. In this thesis study, ANN networks were trained using the methods used in the training of ANNs: Feed Forward Neural Network, Graded Advanced Neural Network, Generalized Regression Neural Network, Probability Neural Network and Recurrent Neural Network. Performance values of ANNs were determined with the results of single interlayer neural network and multi-interlayer 10-fold cross verification neural networks. In order to evaluate the performances of our thesis, 3 data sets, Ionosphere, Iris and Wine, which are in the UCI Machine Learning Repository, were used in the experimental results. Confusion matrices were found in the experimental results and by using this confusion matrix, the classification accuracies, sensitivity, specificity and F1-Scores can be updated at any time by dynamically coding. Target values were calculated by using the determined parameters for both single interlayer and multi-interlayer 10-fold cross validation techniques. On the Ionosphere dataset, the highest accuracy value with 88.57% of the Single Interlayer methods was provided by the Feed Forward Neural Network method, while the Stepped Advanced Neural Network method reached the highest accuracy with 96.58% among the methods using Multi-Interlayer and 10-Fold Cross Validation. On the Iris dataset, the highest accuracy value of 98.67% and 100% was achieved with both Single Interlayer and Multi-Interlayer and 10-fold Cross Verification methods by using Recurrent Neural Network method. On the wine data set, the highest accuracy value with 96.63% from Single Interlayer methods is provided by the Feed Forward Neural Network and Progressive Neural Network methods, while the Recurrent Neural Network method reached the highest accuracy with 100% among the methods using Multi-Interlayer and 10-Fold Cross Validation.

In people living with human immunodeficiency virus (HIV), several complaints related to the gastrointestinal system, mainly diarrhea can be determined. In our study, we aimed to detect the existence of intestinal parasites with conventional methods based on microscopy and with molecular methods based on multiplex-PCR among 90 anti-retroviral treatment (ART) naive or ART adherent HIV/AIDS cases. The existence of Giardia spp., Blastocystis spp., Entamoeba histolytica, Dientamoeba spp. and Cryptosporidium spp. were searched in stool samples and the relation with the existence of these parasites and demographic/clinical data of the cases were determined. The demographic and clinical data of the participants included in the study were as follows; the average age was 34.02 ± 9.7 years, average time of diagnosis was 2.4 ± 1.7 years. Gender distribution was as follows; 85.6% male and 14.4% female. HIV transmission was related with heterosexual intercourse in 60%, homosexual intercourse in 33.3%, blood/blood products contact in 1.1% and with unknown routes in 5.6% of the cases. Fifty percent of the patients were in pre-ART and 50% was in on-ART state. The average CD4+ T lymphocyte count was detected as 400 cells/mm3 and the median of viral load was 114.527 copies/ml. An overall prevalence of at least one intestinal parasitic infection was recorded as 36.7% and the prevalence of this infection due to Blastocystis spp. was 22.2%, followed by Dientamoeba spp. (13.3%), E.histolytica (4.4%), Cryptosporidium spp. (3.3%), Giardia spp. (2.2%) and multiple parasitic infections (7.7%). The type of sexual behaviours related with the detection of intestinal parasites were statistically significant especially in homosexual intercourse (p< 0.001). The increase in CD4+ T lymphocyte counts were reversely associated (p= 0.062) and the increase in the levels of viral load were positively associated (p< 0.001) with detection rate of intestinal parasite. The detection of parasites by molecular methods was statistically significant in pre-ART participants (p= 0.002) and participants with diarrhea (p= 0.019). In the present study, the increase in the frequency of intestinal parasitic infections has shown that essential interventions are required. In all HIV/AIDS cases, routine parasitic screening should be performed by more sensitive methods to manage early and specific treatment.

PİYANO EĞİTİMİNDE ÖĞRENCİLERİN YARATICILIK DÜZEYLERİ İLE PİYANO PERFORMANSLARININ İNCELENMESİÖğrencilerin iyi bir piyano performansı göstermeleri önemli bir husustur. Piyano performansının sahne kaygısı, özgüven ve öz yeterlilik gibi birçok durum ile ilişkili olduğu bilinmektedir. Bu araştırmada; Uludağ Üniversitesi Müzik Eğitimi Ana Bilim Dalı piyano öğrencilerinin genel yaratıcılık düzeyleri ile piyano performanslarını etkileyen faktörlerin incelenmesi ve genel yaratıcılık düzeyi ile piyano performansı arasındaki ilişki düzeyinin ortaya konulması amaçlanmaktadır.Piyano dersi, müzik eğitimi veren kurumlarda ve özellikle Müzik Eğitimi Ana Bilim Dalları'nda zorunlu ders olarak okutulduğundan dolayı; Araştırmamızda piyano eğitimi alan öğrencilerin öz yeterlilik algıları ve piyano performansları Gün (2014, s. 49) tarafından geliştirilen `Piyano Performansı Öz yeterlik Ölçeği` ile belirlenirken, öğrencilerin genel yaratıcılık düzeylerinin belirlenmesinde ise Çoban (1999, s. 228) tarafından Türkçe geçerlilik ve güvenirliliği yapılan `Ne Kadar Yaratıcısınız` ölçeği kullanılmıştır.Araştırma kapsamında çıkan sonuçlar SPSS 21.0 paket programında değerlendirilmiş olup, P

Amaç: Amibik infeksiyonlar, barsakta kolonizasyonun yanı sıra, karaciğer, akciğer ve beyin gibikonak dokularda da invazyon ve hasara neden olabilen ciddi paraziter hastalıklardır. Rutindeamebiyaz tanısı, dışkının mikroskopik incelemesinde Entamoeba histolytica (E. histolytica) kistve trofozoitlerinin görülmesiyle konulmaktadır. Ancak E. histolytica’ya benzer morfolojide olupnon-patojen olan Entamoeba türlerinin de olduğu anlaşılmış, Enzyme-linked immunosorbentassay (ELISA) ve son yıllarda Polimerase Chain Reaction (PCR) tanıda kullanılmayabaşlanmıştır. Bu çalışmada, E. histolytica ve E. dispar ayrımını yapmak için multipleks PCRyöntemi kullanılmış ve sonuçlar ELISA ile mikroskopi verileri ile kıyaslanmıştır.Gereç ve yöntem: Çalışmaya kronik inflmatuar barsak hastalığı olan ve mikroskopisindeEntamoeba kistleri görülen toplamda 83 hastanın dışkı örneği dahil edilmiştir. ÖrneklerdekiEntamoeba türlerinin varlığı mikroskopi ile değerlendirilmiş ve tür ayrımında ELISA ve PCRyöntemleri üretici firmanın önerileri doğrultusunda uygulanmıştır.Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 83 hastanın 48 tanesi (% 58) E. histolytica açısından PCR ilepozitif olarak bulunmuştur. PCR ile pozitif olarak bulunan 48 örneğin 40 tanesinde (% 48) E.histolytica II antijeni ELISA ile pozitif olarak belirlenmiştir.Sonuç: Mikroskopik tanı yöntemi ile E. histolytica’nın diğer Entamoeba türleri ile kolaylıklakarışabileceği bilinmektedir. ELISA ile kıyaslandığında Entamoeba DNA’sını saptayan PCRyönteminin duyarlılık ve özgüllüğünün ise daha yüksek olduğu belirlenmiştir.

Amaç: Çalışmamızda, dispepsi tanısı almış hastaların biyopsi materyallerinde Sydney SınıflmaSistemine göre H. pylori ve histopatolojik değişikliklerin tespit edilmesi ve bu parametrelerin H.pylori ile birlikteliğinin değerlendirilmesi amaçlandı.Gereç ve yöntem: Dispeptik şikayetlerle başvuran ve endoskopi endikasyonu olan 88 hastadanantrum ve korpus biyopsi örnekleri alınarak gastrik mukozada meydana gelen değişikliklerSydney sınıflma sistemine göre (H. pylori, kronik enflmasyon, PNL aktivitesi, atrofi, intestinalmetaplazi) değerlendirildi.Bulgular: Çalışmaya alınan biyopsi örneklerinde H. pylori 88 hastanın 46’sında (%52,3) pozitifiken, 76’sında (%86.3) kronik enflmasyon, 54’ünde (%61.3) PNL aktivasyonu, 8’inde (%9.1)atrofi, 12’sinde (%13.6) intestinal metaplazi saptandı. Çalışmaya alınan H. pylori ile enfekteolan 46 hastadan 45’inde (%97.8) kronik enflmasyon, 42’sinde (%91.3), PNL aktivasyonu,6’sında (%13) atrofi ve 8’inde (%17.4) intestinal metaplazi görülürken, H. pylori ile enfekteolmayan 42 hastanın 31’inde (%73.8) kronik enflmasyon, 12’sinde (%28.6) PNL aktivasyonu,2’sinde (%4.8) atrofi ve 4’ünde (%9.5) intestinal metaplazi saptandı.Sonuçlar: H. pylori ve mide kanseri ilişkisinde hastalığın öncüsü olabilen bu lezyonların erkendönemde tanımlanmasının hastalığın takip ve tedavisi açısından önemli olduğu bilinmektedir.Bu nedenle, ülkemizde yaygın olarak bulunan H. pylori enfeksiyonunun Sydney sınıflmasıile saptanan pre-kanseröz değişikliklerle birlikte değerlendirilmesinin önemli olabileceğidüşünülmüştür.

Not Available

Mide kanseri, başlangıçta neredeyse hiç belirti vermediği için erken evrede tespit edilmesi zor olan bir kanser türüdür. Mide kanseri, hem dünyada hem de Türkiye'de görülme sıklığı giderek artan bir kanser türüdür. Mide kanseri tanısında dünya genelinde en yaygın kullanılan yöntem endoskopidir. Ancak kesin teşhis endoskopik yöntemle alınan biyopsi sonucu ile konmaktadır. Endoskopi ile tanı oldukça spesifik ve hassas bir yöntemdir. Yüksek çözünürlüklü endoskopi ile mukoza yüzeyinin hafif renk değişikliklerini, kabarıklıklarını ve yapısal değişikliklerini tespit etmek mümkündür. Ancak yapılan işlemler doktor gözüyle yapıldığı için kanserli bölgelerin gözden kaçırılması ve/veya eksik tespit edilebilmesi söz konusu olabilmektedir. Kanserli alanın tamamen tespit edilememesi, hastaya cerrahi müdahaleden belli bir süre sonra kanser vakasının nüksetmesi problemi ile karşı karşıya kalınabilmektedir. Bu problemin ortadan kalkması için uzman doktor yardımıyla ve görüntü işleme tekniklerini kullanarak bir bilgisayarlı karar destek sistemi (BKD) gerçekleştirilmiştir. v Gerçekleştirilen BKD sistemi gastroenteroloji doktorlarına yardımcı bir asistan gibi çalışarak midede endoskopik görüntülerde kanserli alanın tespit edilmesi, bu alanlardan biyopsinin alınması ve daha iyi tanı konmasına yardımcı olmaktadır. Bu tez çalışmasında Gastroenteroloji bilim dalına gelen hastalardan biyopsi alınan ve patolojik sonucunda kanser teşhisi konulan hastalardan temin edilmiş endoskopi görüntüleri üzerinde çalışılmıştır. Kanserli alanın tespit edilmesi için Bölge Büyütme (BB), İstatistiksel Bölge Birleştirme (İBB), İstatistiksel Bölge Birleştirmede Bölge Büyütme (İBBBB) yöntemleri uygulanmıştır. Uygulanan yöntemler sonucunda elde edilen bölge kesin kanserli bölge olarak ifade edilmemelidir. Ancak bu uzman doktorların biyopsi işlemini bir kereden fazla yapması yerine tespit edilen alanlardan da biyopsi örneği alarak hastaların daha fazla endoskopi ve biyopsi işlemine maruz kalmalarını önleyebilecektir. Böylece bu çalışma ile hastaların morallerinin bozulmasını, fazla biyopsi sonucu oluşabilecek komplikasyonları ve doktorlara karşı oluşabilecek güven kaybını engellemiş olacaktır. Endoskopi görüntülerinde yapılan BB yöntemine göre kitle-doku sınıflandırması sonuçlarına göre en yüksek sınıflandırma doğruluğu %99.63, en yüksek duyarlılık %94.59, en yüksek belirleyicilik %100 ve en yüksek ROC eğrisi değeri ise %97.29'dır. İBB yöntemine göre kitle-doku sınıflandırması sonuçlarına göre en yüksek sınıflandırma doğruluğu %98.33, en yüksek duyarlılık %89.34, en yüksek belirleyicilik %100 ve en yüksek ROC eğrisi değeri ise %90.82'dır. İBBBB yöntemine göre kitle-doku sınıflandırması sonuçlarına göre en yüksek sınıflandırma doğruluğu %98.25, en yüksek duyarlılık %99.43, en yüksek belirleyicilik %100 ve en yüksek ROC eğrisi değeri ise %94.52 elde edilmiştir., Stomach cancer is a type of cancer that is hard to detect at an early stage because it gives almost no symptoms at the beginning. Stomach cancer is an increasing incidence of cancer both in the World as well as in Turkey. The most common method used worldwide for gastric cancer diagnosis is endoscopy. However, definitive diagnosis is made with endoscopic biopsy results. Diagnosis with endoscopy is a very specific and sensitive method. With high-resolution endoscopy it is possible to detect mild discolourations, bulges and structural changes of the surface of the mucosa. However, because the procedures are performed with the eye of a doctor, it is possible that the cancerous areas may be missed and / or incompletely detected. Because of the fact that the cancerous area can not be completely detected may cause the problem of cancer recurrence after a certain period of surgical intervention. In order to overcome this problem, a computerized vii decision support system (CDS) has been implemented with the help of specialist physicians and image processing techniques. The performed CDS system works as an assistant to doctors of gastroenterology, helping to identify the cancerous area in the endoscopic images of the scaffold, to take biopsies from these areas and to make a better diagnosis. In this thesis study, endoscopy images obtained from patients who came to gastroenterology discipline were obtained from patients who were biopsied and diagnosed as pathologically proven cancer. Region growing (RG), Statistical Region Merging (SRM), Statistical Region Merging with Region Growing (SRMWRG) methods were applied to determine the cancerous area. The area obtained as a result of the applied methods should not be expressed as a definite cancerous region. However, this would prevent patients from being subjected to more endoscopy and biopsy by taking biopsy specimens from established areas instead of performing more than one biopsy procedure by specialist doctors. Thus, this study would have prevented the deterioration of patients' morale, the complications that may result in excessive biopsy, and the loss of faith that may arise against doctors. According to the mass-tissue classification results with RG method performed on endoscopy images, the highest classification accuracy is 99.63%, the highest sensitivity is 94.59%, the highest determination is 100% and the highest ROC curve value is 97.29%. The highest classification accuracy was 98.33%, the highest sensitivity was 89.34%, the highest predictive value was 100% and the highest ROC curve value was 90.82% according to the mass-tissue classification results with the SRM method. Also, the highest classification accuracy was 98.25%, the highest sensitivity was 99.43%, the highest specificity was 100%, and the highest ROC curve value was 94.52% according to the mass-tissue classification results with SRMWRG method., Bu tez çalışması Selçuk Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Koordinatörlüğü tarafından 15101020 nolu proje ile desteklenmiştir.

İnsan immünyetmezlik virüsü (HIV) infeksiyonu, dünya çapında önemli bir sağlık sorunudur.Bu kronolojik derlemede, HIV bilimindeki en önemli kilometre taşlarının bazılarına tarihselbir bakış açısının kazandırılması amaçlanmıştır. Bu derleme, özellikle HIV tedavisi içinepidemiyoloji, bulaş yolları, klinik semptomlar, güncel tanı algoritması ve etkili tedavi rejimlerihakkındaki güncel araştırma yönlerine odaklanacaktır. Ayrıca viral infeksiyon, toplumumuzdagörülen ve hala tedavi edilemeyen damgalanma, dışlanma gibi sosyolojik boyutları ile dedeğerlendirilecektir., Human immunodeficiency virus (HIV) infection remains a major health issue worldwide.In this Timeline review article, we aimed to provide a historical perspective of some of theconsiderable milestones in HIV science. This review manuscript will focus on some of thecurrent research directions about epidemiology, transmission ways, clinical symptoms, currentdiagnostic algorithm and effective tretment regimens, in particular in the search for a cure forHIV. Moreover, viral infections will also be assessed in terms of sociological dimensions, suchas stigmatization and exclusion, which are seen in our community and are still untreatable.

Opportunistic infections such as cryptosporidiosis and cyclosporiasis are commonly encountered in patients with acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). We investigated the existence of opportunistic protozoans that significantly affect the quality of life in HIV-1 infected patients using conventional and molecular methods. The study group comprised 115 HIV-1 positive patients. In the identification of Cyclospora cayetanensis and Cryptosporidium, the formol-ether precipitation method was used and smears were evaluated in optical microscope by staining modified Ziehl-Neelsen (ZN). The primers and probes used for PCR were Heat shock protein 70 for C. cayetanensis and the oocysts wall protein for Cryptosporidium spp.. Cyclospora and Cryptosporidium spp. oocysts were detected in one and two patients, respectively, by staining, whereas we detected C. cayetanensis in three patients out of 115 (2.6%) by PCR, and Cryptosporidium spp. in a further three patients (2.6%). C. cayetensis was detected in patients with CD4 counts of 64 cells/mu m, 182 cells/mu m and 287 cells/mu m, respectively. Cryptosporidium spp. was detected in patients with CD4 counts of 176 cells/mu m, 241 cells/mu m and 669 cells/mu m. As conclusion, PCR method is faster and more sensitive than microscopic methods and to screen intestinal pathogens routinely in patients infected with HIV should not be neglected in developing countries like Turkey.

Introduction: Clostridium difficile is a gram-positive, obligatory anaerobe, spore-forming microorganism, which is highly associated with nosocomial infections. In our hospital and our country, the incidence of nosocomial diarrhoea and C. difficile-associated nosocomial diarrhoea rates are not clear. Determining the C. difficile-associated nosocomial diarrhoea incidence, reviewing the current resistance status of C. difficile, and evaluating diagnostic and therapeutic approaches for this pathogen were the major aims of the present study. Materials and Methods: This prospective clinical study included 100 diarrhoea samples from hospitalized patients in Istanbul University Cerrahpasa Faculty of Medicine. The diarrhoea samples were investigated by culture, card test and ELISA methods and bacterial resistance profiles were evaluated with the E-test method. Results: Toxin A/B was found positive in 30/100 patients (30%) by ELISA. The duration of hospitalization and diarrhoea period were significantly longer in Toxin A/B positive patients than negative patients (p< 0.05). Recurrences were detected in 41% of toxin A/B positive patients (statistically not significant but clinically important). When ELISA was accepted as the main test, sensitivity and specificity of the culture and card test methods were found as 56%, 75% and 76%, 80%, respectively. C. difficile resistance rates were determined for metronidazole as 29.4% and for vancomycin and teikopilanin as 2.9%. Conclusion: Our results support that C. difficile is still an important pathogen in nosocomial diarrhoea. Furthermore, the high rate of antibiotic resistance for metronidazole may cause difficulties in treatment. The results indicate the necessity of further studies to develop control measures and effective/reasonable treatment options for patients.

OBJECTIVE The aim of our study is to determine the general intestinal parasite prevalence in Istanbul University Istanbul Faculty of Medicine Hospital, which is located in European and Asian geographical features of Turkey. METHODS Between January 1988 and December 2012, a total of 111,889 stool samples from patients who were admitted to the Istanbul University Istanbul Faculty of Medicine Hospital were examined microscopically by using native lugol and formalin-ether concentration technique; in addition, the cellophane tape test technique was used to examine the perianal area. RESULTS The prevalence of intestinal parasites was found to be 5% (5486/111,889) in Istanbul. Giardia intestinalis was the leading parasite (62%), and the prevalence of the rest of the intestinal parasites was as follows: Enterobius vermicularis, Ascaris lumbricoides, and Blastocystis hominis: 16%, 7%, and 6%, respectively. Between 2000 and 2012, a highly significant reduction in general parasite prevalence was determined, compared to the 1988 and 2000 time period (p

Background: Eosinophils may suggest the presence of a great variety of anomalies whereupon allergies, malignancies, certain tissue disorders, idiopathic hypereosynophilic syndrome and parasitic infections (with the exception of protozoons) can be cited as a few. Although the clinical manifestations may differ, the eosinophils level is quite an important data in cases related to the helminth infections. Similarly, in parasitic infections related to larva migrans (visceral, cutaneous, ocular), the eosinophils level is again a primary indicator and its evident cause is the roundworm Toxocara spp. Aim: The aim of this study was to evaluate the significance characteristics of Toxocara spp. in patients with eosonophilia. Materials and Methods: In our study, serums were collected from 93 patients of various age groups with eosonophilia (10% and above) while visiting Istanbul University Medical Faculty due to various complaints. Results: Serum samples were treated with Toxocara IgG ready ELISA kit and Toxocara western blot IgG ready kit. Based on the ELISA method; out of 93 patients, 30 patients (32.3%) were positive. Western blot technique; 45 (48.4%) were positive with anti-toxocara IgG antibodies. Conclusion: Results point out to western blot technique being more sensitive and superior on a scale of (P < 0.0001) when compared with the ELISA method.

Stratonikeia Kuzey Cadde Doğu Portik Taban Mozaikleri Koruma ve Onarım Çalışmaları 2013-2015 yılları arasını kapsayan bir koruma ve onarım programı çerçevesinde sürdürülmüştür. 2008 yılı sonrasında yapılan arkeolojik kazılar ile ortaya çıkarılan taban mozaiği, ulusal ve uluslararası koruma ilkelerine bağlı kalınarak koruma altına alınmıştır. Bu çalışma, taban mozaiğinin gelecek nesillere ulaşması için yapılacak koruma çalışmalarına ışık tutması amacıyla yapılmıştır. Taban mozaiği, Antik dönemlerde geçirmiş olduğu yer sarsıntıları, iklimsel ve fiziksel etkiler sonucunda yoğun bir şekilde tahribata uğramıştır. Koruma basamakları kapsamında taban mozaiğinin belgeleme çalışmaları yazılı rapor, fotoğraflama ve görsel bozulma haritası şeklinde yapılmıştır. Bizans Dönemi’nde yapılan mozaik döşemenin yapım teknolojisi ile malzeme özellikleri, bozulmaları ve bozulmaya sebep olan kaynakların belirlenmesi koruma ve onarımlarda kullanılacak benzer özelliklere sahip harç örnekleri hazırlamak amacıyla malzeme analizleri yapılmıştır. Analiz çalışmaları için toplamda 7 panelden oluşan taban mozaiğinin uygun yerlerinden özgün harç örnekleri alınmıştır. Harç örneklerinin ilk olarak görsel tanımlamaları yapılmış devamında ise basit fiziksel özelliklerinin tespitine yönelik olarak yoğunluk ve gözeneklilik tayini yapılmış, mekanik özelliklerinin tespitine yönelik ise nokta yükleme deneyi yapılmıştır. Malzemenin bileşim özelliklerinin belirlenmesi amacıyla kızdırma kaybı deneyi, asitte çözünen ve çözünmeyen kısımlarının tayini ve asitte çözünmeyen kısmın tane boyu dağılımı analizleri yapılmıştır. Ayrıca örneklerdeki toplam suda çözünebilir tuz miktarı tespit edilmiş ve tuz çeşitlerinin belirlenmesi için gerekli testler yapılmıştır. Malzemenin mineralojik özelliklerinin tespitine yönelik olarak ince kesit, XRF ve XRD analizleri yapılarak sonuçları genel olarak değerlendirilmiştir. Bağlayıcı olarak hidrolik kireç, agrega olarak ise tuğla kırığı ve tozu, puzzolan (volkanik tüf), dere kumu ve mermer tozu kullanılarak özgün harç ile mekanik ve fiziksel özellikleri bakımından uyumlu onarım harçları hazırlanmış ve arazideki onarımlarda kullanılmıştır. Portik mozaiğinin koruma ve onarım çalışmalarında mozaiği mevcut hali ile olduğu gibi koruma anlayışı esas alınmıştır. Bu sebeple depremler ve/veya topraktaki oturmalar nedeniyle oluşmuş olan çökme, yükselme ve çatlaklar olduğu gibi korunmuştur. Özgün harç yapısında meydana gelen bozulmalar ve çatlaklar enjeksiyon harçlarının yüzeyden açılan kanallar yoluyla enjekte edilmesiyle doldurulmuştur. Kısmi tessera boşluklarında, kazı sırasında ele geçen özgün tesseralar kullanılarak tamamlamalar yapılmıştır. Bozulmuş tesseralar sağlamlaştırıldıktan sonra tekrar kullanılmıştır. Mozaiğin batı kenarına kireç harcı ile bordür yapılmış, lakuna dolgu tamamlama çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Mozaik yüzeyinde bulunan kir ve kalker kalıntılarının mekanik olarak temizliği yapılmıştır. Conservation and restoration works of Stratonikeia North Street East Portik floor mosaics had been carried out between 2013 and 2015 within the frame of a conservation and restoration program. Floor mosaics were uncovered in the course of archaeological excavations after 2008 and taken under protection as per the national and international conservation principles. The aim of this study is to reveal essential information about the mosaics to be used for their conservation. Mosaic pavement has suffered intense damage due to earthquakes, climatic conditions and physical effects since antiquity. Documentation of the pavement was carried out in the scope of the study by detailed descriptions, photographs and visual damage maps. Material analyses were conducted in order to reveal material characteristics, the deterioration state of the mosaics and mortars, possible sources of deterioration problems and also to develop compatible repair mortars for restoration works. Mortar samples to be analyzed were collected from each of the seven mosaic pavement panels. The samples were documented according to their visual characteristics. Basic physical properties were determined by measuring porosity and density of the samples. Point load tests were performed for the determination of mechanical properties. To investigate the compositional properties of the mortars acid soluble and insoluble parts and the grain size distribution of the acid insoluble parts were determined. The water soluble salts in the samples were determined qualitatively by spot tests and the total salt content of the samples were determined by conductivity measurements. Thin section, XRF and XRD analyses were performed to determine the mineralogical properties of the materials. Repair mortars compatible with the original mortar in terms of mechanical and physical properties were prepared using hydraulic lime, brick fragments and powder, pozzolan (volcanic tuff), river sand and powdered marble. Prepared repair mortar was used in situ. Conservation and restoration works of the mosaic pavements were implemented to preserve them in their current state. Therefore, deformations and cracks due to soil settlements and/or eathquakes were preserved as they are. Deteriorations and cracks in the original mortar were consolidated by injecting the repair mortar through the canals opened in the original mortar. Partial lacunae in the tesserae were filled using the original tesserae recovered during the excavation. Deteriorated tesserae were consolidated and reused. The west edge of the pavement was bordered using lime mortar and the lacunae were filled in. Dirt and calcareous depositions on the mosaic tesserae were cleaned mechanically.

In this study, differences of Iğdır, Karakoyunlu District dialect from Turkey Turkish and its distinctive features are handled. With this in hand, I also focused on the similarities and distinctive features of Azerbaijanis' from Karakoyunlu District dialect and stanrad Azerbaijan Turkish. My study is based on the 8 hours and 40 minutes of voice recording which I recorded with nine people from villages and Karakoyunlu Central District. The database consists of 34 texts which I have analysed from these compilations. In the introduction section of the thesis the population structure, culture and ethnical structure of Iğdır, Karakoyunlu District is mentioned. The examination section of the study consists of "Phonetics" and "Morphology" sections. In these sections, the examples which the phonetic and structural features are shown, the text and line they are used are shown in brackets. In the conclusion section of the thesis, I have tried to summarize the distinctive features of dialect of Iğdır, Karakoyunlu District, and mentioned the common features of East Group dialects and Azerbaijan Turkish. To give some examples; - The 'k' to 'h' change in small voice and final voice is a feature which can be seen both in Azerbaijan Turkish and East Group dialects of Anatolia. In Karakoyunlu District dialect -k>-ḫ change can be seen: teḫsi “taksi”, çoḫ “çok”, sancaḫ “sancak”. - One of the common features of Karakoyunlu District dialect especially with the Kars District dialects and Azerbaijan Turkish is that the metathesis event can be seen too often: yüskeh “yüksek”, ireli “ileri”, torpaḫ “toprak”. In "Vocabulary" section, a list of words which are not used in Turkey Turkish or which has phonetic or meaning differences are given. ÖZ: Bu yapılan çalışmada Iğdır İli Karakoyunlu İlçesi ağzının Türkiye Türkçesinden farklı tarafları ve ayırıcı özellikleri ele alınmıştır. Bunun yanı sıra Karakoyunlu İlçesi Azerilerinin ağzı ile ölçünlü(standart) Azerbaycan Türkçesindeki benzerlikler ve ayrılan yanlar üzerinde durulmuştur. Çalışmamız, 2015 yılında Karakoyunlu Merkez İlçesi ile birlikte dokuz Azeri kökenli insanların yaşadığı köylerden derlediğimiz, 8 saat 40 dakikalık ses kaydına dayanmaktadır. Veri tabanını, bu derlemelerden çözümlediğimiz 34 adet metin oluşturmaktadır. Tezin giriş bölümünde Iğdır İli ve Karakoyunlu İlçesinin nüfus yapısı, kültürel ve etnik yapısına değinilmiştir. Çalışmanın inceleme kısmı “Ses Bilgisi” ve “Biçim Bilgisi” kısmından oluşmaktadır. Bu bölümlerde, ses ve yapı özelliklerini gösteren örnekler, geçtiği metin ve satır numaraları parantez içinde gösterilmiştir. Metnimizde örneği bulunmayan bağımlı biçimbirimlerin kullanımları ise, yakın çevremizden duyup kaydettiğimiz örneklerle açıklanmaya çalışılmıştır. Tezin sonuç bölümünde ise, Iğdır İli Karakoyunlu İlçesi ağzının ayırıcı özellikleri özetlenmeye çalışılmış, Doğu grubu ağızları ve Azerbaycan Türkçesi ile ortak yanları üzerinde durulmuştur. Birkaç özellik verecek olursak; - İç seste ve son seste k>ḫ değişimi hem Azerbaycan Türkçesinde hem de Anadolu’da Doğu grubu ağızlarında görülen bir özelliktir. Karakoyunlu İlçesi ağzında da -k>-ḫ değişimi görülür: teḫsi “taksi”, çoḫ “çok”, sancaḫ “sancak”. - Karakoyunlu İlçesi ağzının Doğu Grubu ağızlarından özellikle Kars İli Ağızları ve Azerbaycan Türkçesi ile ortak özelliklerinden biri de göçüşme olayının çok sık görülmesidir: görülmektedir: yüskeh “yüksek”, ireli “ileri”, torpaḫ “toprak”. “Söz Varlığı” kısmında, Türkiye Türkçesinde kullanılmayan ya da ses ve anlam farklılığıyla geçen sözcüklerin listesi verilmiştir. Türk Dili ve Edebiyatı Dalında Yüksek Lisans Tezidir. Tez (Yüksek Lisans)--Doğu Akdeniz Üniversitesi, Fen ve Edebiyat Fakültesi, Türk Dili ve Edebiyatı Bölümü, 2016. Tez Danışmanı: Yard. Doç. Dr. Gülseren Tor.

Bu çalışmada, tahkimin hukuki niteliği, doktrindeki görüşler de dikkate alınarak irdelenmiştir. Milletlerarası tahkim ile milli tahkim arasındaki ayrım kriterleri önemlidir. Sıklıkla birbirine karıştırılan tahkimin hukuki niteliği ile hakem kararının hukuki niteliği ayrı ayrı ele alınarak hakem kararlarının tenfizinde ortaya çıkan birtakım sorunlar tespit edilmiştir. Bu bakımdan milli (yerli), yabancı ve milletlerarası hakem kararı kavramlarından ne anlaşılması gerektiği açıklanmaya muhtaçtır. Bir hakem kararı milli bir hakem kararı ise, bu takdirde yerli hakem kararlarının tabi olduğu kurallara göre icra edilecektir. Buna karşılık yabancı bir hakem kararı bahse konu olursa, bu takdirde kararın tenfizi ve tanınması söz konusu olacaktır. Tahkimin milletlerarası nitelikte olup olmadığının tespitinde genel olarak uyuşmazlık taraflarının statüleri (vatandaşlık vs.) yahut uyuşmazlık konusunun karakteri dikkate alınır. Türk uygulaması bakımından hakem kararlarının icrasında uluslararası sözleşmeler ile MÖHUK ve MTK’nın uygulama alanları farklı ihtimallere göre değişkenlik göstermektedir. In this research, arbitration law qualifications are studied according to doctrine. Segregation criterias between International and national arbitration are important. Arbitration's law qualifications and Arbitral Award's law qualifications which one frequently confused are discussed seperately in arbitral award recognitions while some problems have been detected. In this regard, national (domestic) and international arbitration are in need of a foreign concept to explain what should be understood. If a arbitral award is a national arbitral award, in this case it shall be conducted according to the rules that apply it domestic arbitration. But if in speak of a foreign arbitral award in this case the decision recognition and enforcement will be subject to. The status of the disputing parties or charecteristics of the dispute should be considered in determination of the scope of the arbitration is international or not. Different possibilities vary with international agreements with MÖHUK and MTK application fields with regard to the Turkish application.

Stratonikeia Kuzey Cadde Doğu Portik Taban Mozaikleri Koruma ve Onarım Çalışmaları 2013-2015 yılları arasını kapsayan bir koruma ve onarım programı çerçevesinde sürdürülmüştür. 2008 yılı sonrasında yapılan arkeolojik kazılar ile ortaya çıkarılan taban mozaiği, ulusal ve uluslararası koruma ilkelerine bağlı kalınarak koruma altına alınmıştır. Bu çalışma, taban mozaiğinin gelecek nesillere ulaşması için yapılacak koruma çalışmalarına ışık tutması amacıyla yapılmıştır. Taban mozaiği, Antik dönemlerde geçirmiş olduğu yer sarsıntıları, iklimsel ve fiziksel etkiler sonucunda yoğun bir şekilde tahribata uğramıştır. Koruma basamakları kapsamında taban mozaiğinin belgeleme çalışmaları yazılı rapor, fotoğraflama ve görsel bozulma haritası şeklinde yapılmıştır. Bizans Dönemi'nde yapılan mozaik döşemenin yapım teknolojisi ile malzeme özellikleri, bozulmaları ve bozulmaya sebep olan kaynakların belirlenmesi koruma ve onarımlarda kullanılacak benzer özelliklere sahip harç örnekleri hazırlamak amacıyla malzeme analizleri yapılmıştır. Analiz çalışmaları için toplamda 7 panelden oluşan taban mozaiğinin uygun yerlerinden özgün harç örnekleri alınmıştır. Harç örneklerinin ilk olarak görsel tanımlamaları yapılmış devamında ise basit fiziksel özelliklerinin tespitine yönelik olarak yoğunluk ve gözeneklilik tayini yapılmış, mekanik özelliklerinin tespitine yönelik ise nokta yükleme deneyi yapılmıştır. Malzemenin bileşim özelliklerinin belirlenmesi amacıyla kızdırma kaybı deneyi, asitte çözünen ve çözünmeyen kısımlarının tayini ve asitte çözünmeyen kısmın tane boyu dağılımı analizleri yapılmıştır. Ayrıca örneklerdeki toplam suda çözünebilir tuz miktarı tespit edilmiş ve tuz çeşitlerinin belirlenmesi için gerekli testler yapılmıştır. Malzemenin mineralojik özelliklerinin tespitine yönelik olarak ince kesit, XRF ve XRD analizleri yapılarak sonuçları genel olarak değerlendirilmiştir. Bağlayıcı olarak hidrolik kireç, agrega olarak ise tuğla kırığı ve tozu, puzzolan (volkanik tüf), dere kumu ve mermer tozu kullanılarak özgün harç ile mekanik ve fiziksel özellikleri bakımından uyumlu onarım harçları hazırlanmış ve arazideki onarımlarda kullanılmıştır.Portik mozaiğinin koruma ve onarım çalışmalarında mozaiği mevcut hali ile olduğu gibi koruma anlayışı esas alınmıştır. Bu sebeple depremler ve/veya topraktaki oturmalar nedeniyle oluşmuş olan çökme, yükselme ve çatlaklar olduğu gibi korunmuştur. Özgün harç yapısında meydana gelen bozulmalar ve çatlaklar enjeksiyon harçlarının yüzeyden açılan kanallar yoluyla enjekte edilmesiyle doldurulmuştur. Kısmi tessera boşluklarında, kazı sırasında ele geçen özgün tesseralar kullanılarak tamamlamalar yapılmıştır. Bozulmuş tesseralar sağlamlaştırıldıktan sonra tekrar kullanılmıştır. Mozaiğin batı kenarına kireç harcı ile bordür yapılmış, lakuna dolgu tamamlama çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Mozaik yüzeyinde bulunan kir ve kalker kalıntılarının mekanik olarak temizliği yapılmıştır.Anahtar Kelimeler: Kültür Varlıkları, Antik Dönem Mozaik, Koruma ve Onarım,Kireç Harcı Conservation and restoration works of Stratonikeia North Street East Portik floor mosaics had been carried out between 2013 and 2015 within the frame of a conservation and restoration program. Floor mosaics were uncovered in the course of archaeological excavations after 2008 and taken under protection as per the national and international conservation principles. The aim of this study is to reveal essential information about the mosaics to be used for their conservation. Mosaic pavement has suffered intense damage due to earthquakes, climatic conditions and physical effects since antiquity. Documentation of the pavement was carried out in the scope of the study by detailed descriptions, photographs and visual damage maps. Material analyses were conducted in order to reveal material characteristics, the deterioration state of the mosaics and mortars, possible sources of deterioration problems and also to develop compatible repair mortars for restoration works. Mortar samples to be analyzed were collected from each of the seven mosaic pavement panels. The samples were documented according to their visual characteristics. Basic physical properties were determined by measuring porosity and density of the samples. Point load tests were performed for the determination of mechanical properties. To investigate the compositional properties of the mortars acid soluble and insoluble parts and the grain size distribution of the acid insoluble parts were determined. The water soluble salts in the samples were determined qualitatively by spot tests and the total salt content of the samples were determined by conductivity measurements.Thin section, XRF and XRD analyses were performed to determine the mineralogical properties of the materials. Repair mortars compatible with the original mortar in terms of mechanical and physical properties were prepared using hydraulic lime, brick fragments and powder, pozzolan (volcanic tuff), river sand and powdered marble. Prepared repair mortar was used in situ. Conservation and restoration works of the mosaic pavements were implemented to preserve them in their current state. Therefore, deformations and cracks due to soil settlements and/or eathquakes were preserved as they are. Deteriorations and cracks in the original mortar were consolidated by injecting the repair mortar through the canals opened in the original mortar. Partial lacunae in the tesserae were filled using the original tesserae recovered during the excavation. Deteriorated tesserae were consolidated and reused. The west edge of the pavement was bordered using lime mortar and the lacunae were filled in. Dirt and calcareous depositions on the mosaic tesserae were cleaned mechanically.Keywords: Cultural Heritage, Ancient Mosaic, Conservation and Restoration, Lime Mortar 140