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9. Observed controls on resilience of groundwater to climate variability in sub-Saharan Africa

Author

Cuthbert, M.O., Taylor, R.G., Favreau, G., Todd, M.C., Shamsudduha, M., Villholth, K.G., MacDonald, A.M., Scanlon, B.R., Kotchoni, D.O.V., Vouillamoz, J.-M., Lawson, F.M.A., Adjomayi, P.A., Kashaigili, J., Seddon, D., Sorensen, J.R., Ebrahim, G.Y., Owor, M., Nyenje, P.M., Nazoumou, Y., Goni, I., Ousmane, B.I., Sibanda, T., Ascott, M.J., Macdonald, D.M.J., Agyekum, W., Koussoubé, Y., Wanke, H., Kim, H., Wada, Y., Lo, M.-H., Oki, T., Kukuric, N., Cuthbert, M.O., Taylor, R.G., Favreau, G., Todd, M.C., Shamsudduha, M., Villholth, K.G., MacDonald, A.M., Scanlon, B.R., Kotchoni, D.O.V., Vouillamoz, J.-M., Lawson, F.M.A., Adjomayi, P.A., Kashaigili, J., Seddon, D., Sorensen, J.R., Ebrahim, G.Y., Owor, M., Nyenje, P.M., Nazoumou, Y., Goni, I., Ousmane, B.I., Sibanda, T., Ascott, M.J., Macdonald, D.M.J., Agyekum, W., Koussoubé, Y., Wanke, H., Kim, H., Wada, Y., Lo, M.-H., Oki, T., and Kukuric, N.

Abstract

Groundwater in sub-Saharan Africa supports livelihoods and poverty alleviation, maintains vital ecosystems, and strongly influences terrestrial water and energy budgets. Yet the hydrological processes that govern groundwater recharge and sustainability—and their sensitivity to climatic variability—are poorly constrained. Given the absence of firm observational constraints, it remains to be seen whether model-based projections of decreased water resources in dry parts of the region are justified. Here we show, through analysis of multidecadal groundwater hydrographs across sub-Saharan Africa, that levels of aridity dictate the predominant recharge processes, whereas local hydrogeology influences the type and sensitivity of precipitation–recharge relationships. Recharge in some humid locations varies by as little as five per cent (by coefficient of variation) across a wide range of annual precipitation values. Other regions, by contrast, show roughly linear precipitation–recharge relationships, with precipitation thresholds (of roughly ten millimetres or less per day) governing the initiation of recharge. These thresholds tend to rise as aridity increases, and recharge in drylands is more episodic and increasingly dominated by focused recharge through losses from ephemeral overland flows. Extreme annual recharge is commonly associated with intense rainfall and flooding events, themselves often driven by large-scale climate controls. Intense precipitation, even during years of lower overall precipitation, produces some of the largest years of recharge in some dry subtropical locations. Our results therefore challenge the ‘high certainty’ consensus regarding decreasing water resources4 in such regions of sub-Saharan Africa. The potential resilience of groundwater to climate variability in many areas that is revealed by these precipitation–recharge relationships is essential for informing reliable predictions of climate-change impacts and adaptation strategies.

Published
2019

11. AMMA-CATCH, a critical zone observatory in West Africa monitoring a megion in transition

Author

Galle, Sylvie, Grippa, M., Bouzou Moussa, I., Cappelaere, B., Demarty, J., Mougin, E., Panthou, G., Adjomayi, P., Bâ, A., Boucher, M., Cohard, J, Descloitres, Marc, Descroix, Luc, Abdou, Malam, Malam-Issa, Oumarou, Agbossou, E., Cohard, M., 14, Sambou, Vouillamoz, J-M, Chazarin, J-P, 11, Mamane, Peugeot, C., Diawara, M., Dossou, M., Favreau, G., Gangneron, F., Gosset, M., Hector, B., Hiernaux, P., Issoufou, B., Kergoat, L., Lawin, E., Lebel, T., Legchenko, A., Malam-Issa, O., Mamadou, O., Nazoumou, Y., Pellarin, T., Quantin, G., Sambou, B., Seghieri, J., Seguis, L., Vandervaere, J., Vischel, T., Vouillamoz, M., Zannou, A., Afouda, S., Alhassane, A., Arjounin, M., Ba, H., Biron, R., Cazenave, F., Chaffard, V., Guyard, H., Koné, A., Mainassara, I., Mamane, A., Oi, M., Ouani, T., Soumaguel, N., Wubda, M., Ago, E., Alle, C., Allies, A., Arpin-Pont, F., Awessou, B., Cassé, C., Charvet, G., Dardel, C., Depeyre, A., Diallo, B., Do, T., Fatras, C., Frappart, F., Gal, L., Gascon, T., Gibon, F., Guiro, I., Ingatan, A., Kempf, J., Kotchoni, O., Lawson, M., Leauthaud, C., Louvet, S., Mason, E., Nguyen, C., Perrimond, B., Pierre, C., Richard, A., Robert, E., Román-Cascón, C., Velluet, C., Wilcox, C., Institut des Géosciences de l’Environnement (IGE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES (UMR_7618 / UMR_D_242 / UMR_A_1392 / UM_113) ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Subjects
CENTRAL SAHEL, 010504 meteorology & atmospheric sciences, 0208 environmental biotechnology, 02 engineering and technology, 01 natural sciences, Water balance, Démographie, 11. Sustainability, Water cycle, lcsh:Environmental sciences, Hydrologie, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 2. Zero hunger, lcsh:GE1-350, Régime hydrique du sol, Utilisation des terres, CLIMATE-CHANGE, lcsh:QE1-996.5, GROSS PRIMARY PRODUCTION, Groundwater recharge, LAND-SURFACE, Geography, SEMIARNIGER, SATELLITE DATA, Ressource en eau, P40 - Météorologie et climatologie, Soil Science, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Context (language use), HARD-ROCK AQUIFERS, Monsoon, 12. Responsible consumption, SURFACE SOIL-MOISTURE, MONSOON MULTIDISCIPLINARY ANALYSIS, WATER STORAGE CHANGES, Mesure, Couverture végétale, P10 - Ressources en eau et leur gestion, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, 0105 earth and related environmental sciences, P36 - Érosion, conservation et récupération des sols, Changement climatique, Land use, Analyse de données, Global change, 15. Life on land, 020801 environmental engineering, lcsh:Geology, 13. Climate action, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Climatologie, Physical geography, U30 - Méthodes de recherche, Surface runoff
Abstract

International audience; West Africa is a region in fast transition from climate, demography, and land use perspectives. In this context, the African Monsoon Multidisciplinary Analysis (AMMA)-Couplage de l'Atmosphere Tropicale et du Cycle eco-Hydrologique (CATCH) long-term regional observatory was developed to monitor the impacts of global change on the critical zone of West Africa and to better understand its current and future dynamics. The observatory is organized into three thematic axes, which drive the observation and instrumentation strategy: (i) analyze the long-term evolution of eco-hydrosystems from a regional perspective; (ii) better understand critical zone processes and their variability; and (iii) meet socioeconomic and development needs. To achieve these goals, the observatory has gathered data since 1990 from four densely instrumented mesoscale sites (similar to 10(4) km(2) each), located at different latitudes (Benin, Niger, Mali, and Senegal) so as to sample the sharp eco-climatic gradient that is characteristic of the region. Simultaneous monitoring of the vegetation cover and of various components of the water balance at these four sites has provided new insights into the seemingly paradoxical eco-hydrological changes observed in the Sahel during the last decades: groundwater recharge and/ or runoff intensification despite rainfall deficit and subsequent re-greening with still increasing runoff. Hydrological processes and the role of certain key landscape features are highlighted, as well as the importance of an appropriate description of soil and subsoil characteristics. Applications of these scientific results for sustainable development issues are proposed. Finally, detecting and attributing eco-hydrological changes and identifying possible regime shifts in the hydrologic cycle are the next challenges that need to be faced.

Published
2018
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12. A positive interaction between inhibitors of protein synthesis and cefepime in the fight against methicillin-resistant Staphylococcus aureus

Author

Guignard, B., Vouillamoz, J., Giddey, M., Moreillon, P., Guignard, B., Vouillamoz, J., Giddey, M., and Moreillon, P.

Abstract

Quinupristin-dalfopristin (Q-D) synergizes with cefepime for the treatment of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). Here, we studied whether the synergism was restricted to MRSA and if it extended to non-beta-lactam cell wall inhibitors or to other inhibitors of protein synthesis. Three MRSA and two methicillin-susceptible S. aureus (MSSA) strains were tested, including an isogenic pair of mecA −/mecA + S. aureus Newman. The drug interactions were determined by fractional inhibitory concentration (FIC) indices and population analysis profiles. The antibacterial drugs that we used included beta-lactam (cefepime) and non-beta-lactam cell wall inhibitors (D-cycloserine, fosfomycin, vancomycin, teicoplanin), inhibitors of protein synthesis (Q-D, erythromycin, chloramphenicol, tetracycline, linezolid, fusidic acid), and polynucleotide inhibitors (cotrimoxazole, ciprofloxacin). The addition of each protein inhibitor to cefepime was synergistic (FIC ≤ 0.5) or additive (FIC > 0.5 but < 1) against MRSA, but mostly indifferent against MSSA (FIC ≥ 1 but ≤ 4). This segregation was not observed after adding cotrimoxazole or ciprofloxacin to cefepime. Population analysis profiles were performed on plates in the presence of increasing concentrations of the cell wall inhibitors plus 0.25 × minimum inhibitory concentration (MIC) of Q-D. Cefepime combined with Q-D was synergistic against MRSA, but D-cycloserine and glycopeptides were not. Thus, the synergism was specific to beta-lactam antibiotics. Moreover, the synergism was not lost against fem mutants, indicating that it acted at another level. The restriction of the beneficial effect to MRSA suggests that the functionality of penicillin-binding protein 2A (PBP2A) was affected, either directly or indirectly. Further studies are necessary in order to provide a mechanism for this positive interaction

Published
2018

13. Recent Advances in Quantitative Remote Sensing

Author

Hector, B., Cohard, J.-M., Pellarin, T., Cappelaere, B., Demarty, J., Galle, S., Grippa, Manuela, Kergoat , Laurent, Lebel, T., Mamadou, O., Panthou, G., Peugeot, C., Vandervaere, J. P., Vischel, T., Vouillamoz, J.-M., Laboratoire d'étude des transferts en hydrologie et environnement (LTHE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géosciences Environnement Toulouse (GET), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), HMCI, Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Civil Engineering Programme, University of KwaZulu-Natal (UKZN), IRD Benin, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Transferts dans les Eco-hydrosystèmes (TECHS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut des Géosciences de l’Environnement (IGE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG ), and Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])

Subjects
[SDU.STU.HY]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

14. Constructing an everywhere and locally relevant predictive model of the West-African critical zone

Author

Hector, B., Cohard, J. M., Pellarin, T., Cappelaere, B., Demarty, J., Galle, S., Grippa, M., Kergoat, L., Lebel, T., Mamadou, O., Panthou, G., Peugeot, C., Vandervaere, J. P., Vischel, T., Vouillamoz, J. M., Institut des Géosciences de l’Environnement (IGE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géosciences Environnement Toulouse (GET), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Civil Engineering Programme, University of KwaZulu-Natal (UKZN), Laboratoire d'étude des transferts en hydrologie et environnement (LTHE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), HMCI, and Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG)

Subjects
[SDU.STU.HY]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

15. AMMA‐CATCH, a Critical Zone Observatory in West Africa Monitoring a Region in Transition

Author

Galle, S., primary, Grippa, M., additional, Peugeot, C., additional, Moussa, I. Bouzou, additional, Cappelaere, B., additional, Demarty, J., additional, Mougin, E., additional, Panthou, G., additional, Adjomayi, P., additional, Agbossou, E.K., additional, Ba, A., additional, Boucher, M., additional, Cohard, J.-M., additional, Descloitres, M., additional, Descroix, L., additional, Diawara, M., additional, Dossou, M., additional, Favreau, G., additional, Gangneron, F., additional, Gosset, M., additional, Hector, B., additional, Hiernaux, P., additional, Issoufou, B.-A., additional, Kergoat, L., additional, Lawin, E., additional, Lebel, T., additional, Legchenko, A., additional, Abdou, M. Malam, additional, Malam-Issa, O., additional, Mamadou, O., additional, Nazoumou, Y., additional, Pellarin, T., additional, Quantin, G., additional, Sambou, B., additional, Seghieri, J., additional, Séguis, L., additional, Vandervaere, J.-P., additional, Vischel, T., additional, Vouillamoz, J.-M., additional, Zannou, A., additional, Afouda, S., additional, Alhassane, A., additional, Arjounin, M., additional, Barral, H., additional, Biron, R., additional, Cazenave, F., additional, Chaffard, V., additional, Chazarin, J.-P., additional, Guyard, H., additional, Koné, A., additional, Mainassara, I., additional, Mamane, A., additional, Oi, M., additional, Ouani, T., additional, Soumaguel, N., additional, Wubda, M., additional, Ago, E.E., additional, Alle, I.C., additional, Allies, A., additional, Arpin-Pont, F., additional, Awessou, B., additional, Cassé, C., additional, Charvet, G., additional, Dardel, C., additional, Depeyre, A., additional, Diallo, F.B., additional, Do, T., additional, Fatras, C., additional, Frappart, F., additional, Gal, L., additional, Gascon, T., additional, Gibon, F., additional, Guiro, I., additional, Ingatan, A., additional, Kempf, J., additional, Kotchoni, D.O.V., additional, Lawson, F.M.A., additional, Leauthaud, C., additional, Louvet, S., additional, Mason, E., additional, Nguyen, C.C., additional, Perrimond, B., additional, Pierre, C., additional, Richard, A., additional, Robert, E., additional, Román-Cascón, C., additional, Velluet, C., additional, and Wilcox, C., additional

Published
2018
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16. Identity and parentage of two alpine grape cultivars from Switzerland (Vitis vinifera L. Lafnetscha and Himbertscha)

Author

Vouillamoz, J. F., Maigre, D., and Meredith, C. P.

Abstract

Four closely related white grape cultivars from the Western Alps (Switzerland) - Humagne Blanc, Completer, Lafnetscha and Himbertscha - and three putative relatives or synonyms - Gouais Blanc, Plantscher and Bordeaux Blanc - were analyzed with up to 50 microsatellite markers. Humagne Blanc and Completer are ancient cultivars from the Haut-Valais and Graubünden regions, respectively. Lafnetscha and Himbertscha are lesser-known cultivars scarcely cultivated in Haut-Valais. Lafnetscha is frequently considered as synonym of Completer. Himbertscha might be related to Gouais Blanc, one of the parents of Chardonnay, Gamay, etc. Plantscher, a putative synonym of Lafnetscha, is scarcely cultivated in Haut-Valais (Switzerland) and Bordeaux Blanc (or Gros Bourgogne) is a cultivar of unknown origin (despite its names) cultivated in Switzerland. Our results allowed us to determine the true-to-type Lafnetscha and confirmed that Lafnetscha is not a synonym of Completer. Plantscher is not a synonym of Lafnetscha but a synonym of Bordeaux Blanc (or Gros Bourgogne) and is a likely parent or progeny of the Hungarian Furmint. Himbertscha is not related to Gouais Blanc and shares at least one allele at each locus with Humagne Blanc, providing strong evidence of a parent/progeny relationship. Given that Humagne Blanc is an older cultivar, we propose that it is the parent of Himbertscha. Alleles at 49 out of 50 microsatellite loci are consistent with Lafnetscha being the progeny of Completer and Humagne Blanc. The exception is a 10-base pair discrepancy at one locus (VVMD 36), most likely due to the occurrence of a null allele, since this parentage is supported at other markers by very high likelihood ratios. With Lafnetscha = Completer x Humagne Blanc, we present the second grape cultivar parentage showing a multiple repeat discrepancy at one locus. This study emphasizes that one multiple repeat unit discrepancy is not sufficient to reject a parentage, and that the greater is the number of loci, the greater are the chances to encounter null alleles or clonal mutations., VITIS - Journal of Grapevine Research, Vol. 43 No. 2 (2004): Vitis

Published
2015
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17. Microsatellite pedigree reconstruction provides evidence that ‘Müller-Thurgau’ is a grandson of ‘Pinot’ and ‘Schiava Grossa’

Author

Vouillamoz, J. F. and Claire Arnold

Abstract

‘Müller-Thurgau’ has recently been proven to be a cross between ‘Riesling’ and ‘Madeleine Royale’, a 19th century cross whose parents are unknown. Parentage analysis based on 93 grape cultivars of central Europe genotyped at 57 microsatellites provides here evidence that ‘Madeleine Royale’ = ‘Pinot’ × ‘Schiava Grossa’. Since ‘Riesling’ is known to be a progeny of ‘Gouais Blanc’, ‘Müller-Thurgau’ is therefore a grandchild of ‘Pinot’ (either ‘Pinot’ noir, gris or blanc), ‘Schiava Grossa’ (or ‘Frankenthaler’ or ‘Trollinger’) and ‘Gouais Blanc’ (or ‘Heunisch Weiss’)., VITIS - Journal of Grapevine Research, Vol. 49 No. 2 (2010): Vitis

Published
2015
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22. La parenté du Sangiovese

Author

Vouillamoz, J., Monaco, A., Laura Costantini, Marco Stefanini, Scienza, A., and Maria Stella Grando

Subjects
Settore AGR/03 - ARBORICOLTURA GENERALE E COLTIVAZIONI ARBOREE
Published
2007

50. The use of magnetic resonance sounding for quantifying specific yield and transmissivity in hard rock aquifers: The example of Benin.

Author

Vouillamoz, J. M., Lawson, F. M. A., Yalo, N., and Descloitres, M.

Subjects
*MAGNETIC resonance, *AQUIFERS, *BOREHOLES, *WATER supply, *GEOPHYSICS
Abstract

Hundreds of thousands of boreholes have been drilled in hard rocks of Africa and Asia for supplying human communities with drinking water. Despite the common use of geophysics for improving the siting of boreholes, a significant number of drilled holes does not deliver enough water to be equipped (e.g. 40% on average in Benin). As compared to other non-invasive geophysical methods, magnetic resonance sounding (MRS) is selective to groundwater. However, this distinctive feature has not been fully used in previous published studies for quantifying the drainable groundwater in hard rocks (i.e. the specific yield) and the short-term productivity of aquifer (i.e. the transmissivity). We present in this paper a comparison of MRS results (i.e. the water content and pore-size parameter) with both specific yield and transmissivity calculated from long duration pumping tests. We conducted our experiments in six sites located in different hard rock groups in Benin, thus providing a unique data set to assess the usefulness of MRS in hard rock aquifers. We found that the MRS water content is about twice the specific yield. We also found that the MRS pore-size parameter is well correlated with the specific yield. Thus we proposed two linear equations for calculating the specific yield from the MRS water content (with an uncertainty of about 10%) and from the pore-size parameter (with an uncertainty of about 20%). The later has the advantage of defining a so-named MRS cutoff time value for indentifying non-drainable MRS water content and thus low groundwater reserve. We eventually propose a nonlinear equation for calculating the specific yield using jointly the MRS water content and the pore-size parameters, but this approach has to be confirmed with further investigations. This study also confirmed that aquifer transmissivity can be estimated from MRS results with an uncertainty of about 70%. We conclude that MRS can be usefully applied for estimating aquifer specific yield and transmissivity in weathered hard rock aquifers. Our result will contribute to the improvement of well siting and groundwater management in hard rocks. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2014
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