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Resumen Antecedentes La onicomicosis afecta a entre el 2 y el 30% de la poblacion mundial; la biopsia ungueal facilita el diagnostico y diferencia invasion de colonizacion. Objetivos Evaluar la utilidad diagnostica de la biopsia ungueal con coloracion de PAS en las onicomicosis frente al examen directo con KOH, el cultivo y su combinacion en un laboratorio de referencia de Colombia. Metodos Se incluyo a 66 pacientes, a quienes se les realizo lectura ciega e independiente de las tres pruebas; la utilidad se definio a partir de los resultados de validez (sensibilidad, especificidad, indice de Youden, cocientes de probabilidad), desempeno (valores predictores), eficiencia (proporcion de pacientes correctamente diagnosticados) y reproducibilidad (indice kappa). Resultados La edad media de los pacientes fue 55 ± 16 anos, el 76% fueron mujeres y el 66,7% (n = 44) de los examenes directos con KOH resultaron positivos; para el cultivo, el 62,1% (n = 41) de las muestras fueron positivas y con la biopsia lo fueron el 56,1% (n = 37). Los principales agentes causales fueron mohos no dermatofitos en un 36,4% (n = 24) y las especies con la mayor frecuencia fueron Neoscytalidium dimidiatum (n = 11), Trichophyton rubrum (n = 11) y Candida parapsilosis (n = 13). La sensibilidad de la biopsia ungueal frente al KOH o el cultivo fue del 71%, la especificidad del 83%, el indice de Youden 0,54, el cociente de probabilidad positivo de 4,25, el cociente de probabilidad negativo de 0,35, el valor predictivo positivo el 92%, el valor predictivo negativo el 52%, la eficiencia el 74% y el coeficiente kappa 0,45. Al evaluar la biopsia solo en pacientes con onicolisis de la lamina ungueal superior al 50%, aumentaron todos los parametros de utilidad diagnostica. Conclusiones La utilidad global de la biopsia fue moderada para pacientes con mayor sintomatologia, por lo que se recomienda su uso en presencia de onicolisis extensa y en los casos en los que se requiera discriminar colonizacion de invasion.

La Direccion Nacional de Investigacion e Innovacion invita a los docentes investigadores a participar en esta iniciativa para la apropiacion social del conocimiento en medio de la coyuntura que nos aboca a trabajar juntos y a compartir saberes a las comunidades. Serie Podcast "Mi ejercicio academico vs. Covid-19" Introduccion: "La apropiacion social se entiende como un proceso y practica social de construccion colectiva de conocimiento, cuyos integrantes pueden ser individuos, organizaciones o comunidades, que se involucran en interacciones tendientes a intercambiar saberes y experiencias." (Colciencias, 2019, p.77). Objetivo: Consolidar productos de apropiacion social del conocimiento de todos los grupos de investigacion USTA.

Background: The yeasts species determination is fundamental not only for an accurate diagnosis but also for establishing a suitable patient treatment. We performed a concordance study of five methodologies for the species identification of oral isolates of Candida in Colombia. Methods: Sixty-seven Candida isolates were tested by; API® 20C-AUX, Vitek®2 Compact, Vitek®MS, Microflex® and a molecular test (panfungal PCR and sequencing). The commercial cost and processing time of the samples was done by graphical analysis. Results: Panfungal PCR differentiated 12 species of Candida, Vitek®MS and Microflex® methods identified 9 species, and API® 20C-AUX and Vitek®2 Compact methods identified 8 species each. Weighted Kappa (wK) showed a high agreement between Panfungal PCR, Vitek®MS, Microflex® and API® 20C-AUX (wK 0.62-0.93). The wK that involved the Vitek®2 Compact method presented moderate or good concordances compared with the other methods (wK 0.56-0.73). Methodologies based on MALDI TOF MS required 4 minutes to generate results and the Microflex® method had the lowest selling price. Conclusion: The methods evaluated showed high concordance in their results, being higher for the molecular methods and the methodologies based on MALDI TOF. The latter are faster and cheaper, presenting as promising alternatives for the routine identification of yeast species of the genus Candida.

Background: The yeasts species determination is fundamental not only for an accurate diagnosis but also for establishing a suitable patient treatment. We performed a concordance study of five methodologies for the species identification of oral isolates of Candida in Colombia. Methods: Sixty-seven Candida isolates were tested by; API® 20C-AUX,Vitek®2 Compact, Vitek®MS, Microflex® and a molecular test (panfungal PCR and sequencing). The commercial cost and processing time of the samples was done by graphical analysis. Results: Panfungal PCR differentiated 12 species of Candida, Vitek®MS and Microflex® methods identified 9 species, and API® 20C-AUX and Vitek®2 Compact methods identified 8 species each. Weighted Kappa (wK) showed a high agreement between Panfungal PCR, Vitek®MS, Microflex® and API® 20C-AUX (wK 0.62-0.93). The wK that involved the Vitek®2 Compact method presented moderate or good concordances compared with the other methods (wK 0.56-0.73). Methodologies based on MALDI TOF MS required 4 minutes to generate results and the Microflex® method had the lowest selling price. Conclusion: The methods evaluated showed high concordance in their results, being higher for the molecular methods and the methodologies based on MALDI TOF. The latter are faster and cheaper, presenting as promising alternatives for the routine identification of yeast species of the genus Candida. RESUMEN: Introducción: La clasificación a nivel de especies de las levaduras del género Candida de origen clínico es fundamental para el diagnóstico y la instauración de un adecuado tratamiento para el paciente. Se realizó un estudio de concordancia de cinco metodologías usadas para la identificación de aislamientos orales de Candida spp en Colombia. Métodos: Sesenta y siete aislamientos de Candida spp fueron identificados a nivel de especie utilizando; API® 20 C AUX‚ Vitek® 2 Compact, MALDI TOF (Vitek® MS y Microflex®) y una prueba molecular, PCR Panfungal y secuenciación. Un análisis del costo comercial y tiempo de procesamiento de las muestras por cada método fue realizado mediante el análisis gráfico de ambas variables. Resultados: La PCR Panfungal y secuenciación diferenció 12 especies de Candida‚ los métodos Vitek® MS y Microflex® identificaron 9 especies y los métodos API® 20 C AUX y Vitek® 2 Compact identificaron 8 especies. El análisis de Kappa ponderado (wK) demostró una concordancia alta entre los métodos PCR Panfungal y secuenciación‚ Vitek® MS‚ Microflex® y API® 20 C AUX‚ concordancias agrupadas en las categorías buena y muy buena (wK 0.62-0.93); los Kp que involucraron el método Vitek® 2 Compact presentaron concordancias moderadas o buenas frente a los otros métodos (wK 0.56-0.73). Las metodologías basadas en MALDI TOF MS requirieron 4 minutos para generar un resultado y el método Microflex® fue el método que en nuestro medio presentó el menor precio de venta del servicio. Conclusión: Los métodos evaluados presentaron una alta concordancia en sus resultados‚ siendo más alta para los métodos moleculares y las metodologías basadas en MALDI TOF MS; estas últimas son metodologías más rápidas, económicas y precisas, las cuales se presentan como alternativas prometedoras para la identificación rutinaria de especies de levaduras del género Candida. COL0013709

Onychomycosis affects between 2% to 30% of the world population. Nail biopsy may help in making a diagnosis and can distinguish between invasion and colonisation.To evaluate the diagnostic usefulness of nail biopsy with Periodic acid-Schiff (PAS) staining for onychomycosis, compared to direct KOH examination, culture and its combination in a reference laboratory in Colombia.The study included 66 patients in whom a blind and independent reading of the three tests was performed. The usefulness was defined based on the validity (sensitivity, specificity, Youden's index, likelihood ratios), performance (predictive values) efficiency (proportion of correctly diagnosed patients), and reproducibility (kappa coefficient).The mean age of the patients was 55±16 years, and included 76% women. The direct tests with KOH were positive in 66.7% (n=44), 62.1% (n=41) were positive with culture, and 56.1% (n=37) with the biopsy. The main causal agents were non-dermatophytes moulds in 36.4% (n=24). The most frequent species were Neoscytalidium dimidiatum (n=11), Trichophyton rubrum (n=11), and Candida parapsilosis (n=13). The sensitivity of nail biopsy, when compared to the standard (KOH and/or culture), was 71%, specificity 83%, Youden's index 0.54, positive likelihood ratio 4.25, negative likelihood ratio 0.35, positive predictive value 92%, negative predictive value 52%, efficiency 74% and kappa coefficient 0.45. When biopsy was evaluated only in patients with onycholysis of the nail plate greater than 50%, all the parameters of diagnostic usefulness increased.The overall usefulness of the biopsy was moderate for patients with more severe symptomatology, which makes its use advisable in cases of extensive onycholysis, and when discriminating colonisation from invasion is required.

The increase of dermathophytosis in patients with poor therapeutic response leads us to study the antifungal susceptibility of 36 clinical isolates to itraconazole, ketoconazole and fluconazole by the E-test method. According to established parameters by the Clinical Laboratory Standards Institute, the resistance to one or more antifungal drugs was demonstrated in seven isolates (19.4%) as follows: three Trichophyton rubrum, three T. mentagrophytes and one T. tonsurans. A T. rubrum isolate was resistant to the three azolic drugs; the other six only to fluconazole. It is important to establish the antifungal susceptibility as part of the study procedures in patients with dermatophytosis and a poor antifungal response.

The increase of dermathophytosis in patients with poor therapeutic response leads us to study the antifungal susceptibility of 36 clinical isolates to itraconazole, ketoconazole and fluconazole by the E-test method. According to established parameters by the Clinical Laboratory Standards Institute, the resistance to one or more antifungal drugs was demonstrated in seven isolates (19.4%) as follows: three Trichophyton rubrum, three T. mentagrophytes and one T. tonsurans. A T. rubrum isolate was resistant to the three azolic drugs; the other six only to fluconazole. It is important to establish the antifungal susceptibility as part of the study procedures in patients with dermatophytosis and a poor antifungal response.