1. Caracterización de Polimorfismos del gen Leptina en sementales de la raza carora
- Author
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Salazar-Sequea, Saúl, De La Rosa, Oscar, Marques-Urdaneta, Alexis, Vilanova Fernández, Lourdes Tibisay, and Vasquez Marin, Belkys Josefina
- Subjects
Alelo ,Bovino ,Allele ,Leptin ,Revistas ,Genotype ,Bovine ,Universidad del Zulia (LUZ) ,Revista Científica ,Artículos [Revista Científica] ,Medio Ambiente ,Leptina ,Polymorphism ,Genotipo ,Universidad de Los Andes (ULA) ,Polimorfismo - Abstract
El objetivo del presente trabajo fue caracterizar los polimorfismos nucleótidicos simples (SNP) LepClaI (rs29004487), LepKpn2I (rs29004488), LepHphI (rs29004508) y LepSau3AI (rs29004501) del gen Leptina, en toros reproductores de la raza Carora. Se colectaron muestras de sangre y semen de 43 toros nacidos entre 2002 y 2013 para la extracción de ADN; éste se obtuvo a partir de metodologías de precipitación salina. Las genotipificaciones se realizaron a través del análisis de la longitud de los fragmentos de restricción de un producto amplificado (PCR-RFLP) y mediante un sistema de amplificación con cuatro cebadores, refractario a mutaciones (TETRA PRIMER PCR). Los productos de amplificación y digestión fueron verificados en electroforesis horizontal en geles de agarosa. Se calcularon las frecuencias alélicas y genotípicas, la heterocigosidad observada (Ho), y se probó el equilibro de Hardy – Weinberg. Las frecuencias alélicas y genotípicas fueron respectivamente 0,98(A), 0,02(T) y 0,95(AA), 0,05(AT) para el polimorfismo rs29004487; 0,59(C), 0,41(T) y 0,14(CC), 0,53(CT), 0,33(TT) para rs29004488; 0,8(C), 0,2(T) y 0,67(CC), 0,26(CT), 0,07(TT) para rs29004501; 0,94(C), 0,06(T) y 0,88(CC), 0,12(CT) para rs29004508. No se observaron desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg y se evidencia la existencia de desequilibrio de ligamiento entre la mayoría de los SNP estudiados. Las frecuencias alélicas y genotípicas de los polimorfismos evaluados en la población de toros de raza Carora, son similares a las obtenidas en otras razas. Esta primera aproximación en la caracterización del gen Leptina en ganado Carora, permitirá considerar el potencial genético de la raza para la producción de leche o de carne. The objective of this work was to characterize the LepClaI (rs29004487), LepKpn2I (rs29004488), LepHphI (rs29004508) and LepSau3AI (rs29004501) single nucleotide polymorphisms (SNP) of the Leptin gene in Carora sires. Blood and semen samples were collected from 43 bulls born between 2002 and 2013 for DNA extraction; this was obtained from salting out methodologies. Genotyping was carried out through the PCR-RFLP analysis and by an amplification system with four primers, refractory to mutations (TETRA PRIMER PCR). The amplification and digestion products were verified in horizontal electrophoresis in agarose gels. Allelic and genotypic frequencies, observed heterozygosity (Ho) were calculated, and Hardy-Weinberg equilibrium was tested. Allelic and genotypic frequencies were respectively 0.98(A), 0.02(T) and 0.95(AA), 0.05(AT) for rs29004487 polymorphism; 0.59(C), 0, 41(T) and 0.14(CC), 0.53(CT), 0.33(TT) for rs29004488; 0.8(C), 0.2(T) and 0.67(CC), 0.26(CT), 0.07(TT) for rs29004501; 0.94(C), 0.06(T) and 0.88(CC), 0.12 (CT) for rs29004508. No deviations from Hardy-Weinberg equilibrium were observed and the existence of linkage disequilibrium was evident among the majority of SNPs studied. The allelic and genotypic frequencies of the polymorphisms evaluated in the Carora bull population were similar to those obtained in other breeds. This first approach in the characterization of the Leptin gene in Carora cattle will allow to consider the genetic potential of the breed for the production of milk or meat. 82-93 delarosa100@gmail.com
- Published
- 2021