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SUMMARY 1. The conservation of salmonid inter- and intra-specific diversity is a well-known challenge, and general management guidelines and conservation processes are available. However, research demonstrating the outcomes of practical conservation actions is largely lacking. 2. We monitored the spatiotemporal genetic and demographic evolution of a native Mediterranean brown trout population in a river in the French Alps to assess the efficacy and early effects of genetic refuge (i.e. cessation of stocking) and wild trout translocation strategies. We also studied the use of angling as a tool to limit the introgression of the wild standing population. 3. We found that the rate of non-native alleles in wild populations was age dependent, underpinning the importance of using age profiles in the design of genetic conservation studies. 4. Genetic refuge and direct translocation of wild trout resulted in a rapid and significant decrease in the percentages of non-native alleles. Moreover, the genetic refuge strategy resulted in a significant reduction in the number of pure non-native individuals, without changing trout densities, whilst direct translocations resulted in the establishment of dense, self-sustaining native trout populations. Direct translocations changed the distribution of genotype categories and increased densities up to 55-fold in 3 years. Our results also showed that angling resulted in a selective pressure on non-native trout introduced at fry stage, whereas non-native trout issued from natural recruitment were not affected. 5. Our study provides insights for improving the efficacy of practical conservation policies and can be used in other native freshwater fish conservation plans. Proactive measures such as direct translocation need to be implemented together with passive approaches such as genetic refuge policies. Before implementing such actions, accurate genetic and demographic studies at small geographical scales are essential to ensure that no self-sustaining population of non-native fish is present. To obtain rapid colonisation, we recommend introducing fish along whole river sections rather than concentrating on a few river stretches. Angling pressure can be used as an additional tool to improve restoration.

L’examen 2012 du lac du Bourget a confirmé le bon état écologique de l’écosystème pélagique et la continuité de sa progression vers un état oligotrophe. En dépit d’une augmentation marquée au cours des 4 dernières années et en particulier en 2012 des apports en Phosphore particulaire par les principaux tributaires (la Leysse et le Sierroz participant à la même hauteur avec 18-19 tonnes de Ptot transité au lac), les concentrations en Ptot et PO4 dans la colonne d’eau au milieu du lac ont continué de chuter, atteignant des niveaux « record » avec 14 et 10 μg/L, respectivement. Cette baisse de concentration en nutriments ne s’est toutefois pas accompagnée d’une baisse de la biomasse phytoplanctonique qui au contraire a augmenté significativement en 2012 (d’un peu plus de 20%). A l’exception du développement de l’espèce Scenedesmus (plutôt caractéristique des milieux riches en nutriments) en début de printemps, la composition phytoplanctonique a été dominée par des diatomées, des chrysophycées et des cryptophycées avec des espèces (notamment mixotrophes) plutôt caractéristiques de milieux oligotrophes. Pour la première fois aucune cyanobactérie filamenteuse (et susceptible d’être toxique) n’a été détectée en 2012 (en 2009 Planktothrix et Microcystis étaient présentes, en 2011 Aphanizomenom avait été détectée). Au cours des 4 dernières années, de manière concommitante à la disparition de P. rubescens, la proportion des formes nanophytoplanctoniques a augmenté de manière quasi exponentielle atteignant en 2012 la valeur de 43% (proportion comparable à ce qui est enregistré au lac d’Annecy). La proportion des formes picophytoplanctoniques (dominées par les picocyanobactéries du genre Synechococcus) est également en augmentation corroborant la réoligotrophisation marquée de l’écosystème. La biomasse du peuplement zooplanctonique a été très élevée en 2012 avec une très forte dominance des Daphnies, responsable d’une importante phase des eaux claires entre fin mai et début juin. Un événement remarquable a toutefois été constaté, l’absence du second pic de production observée généralement en fin d’été, probablement lié aux mauvaises conditions météorologiques enregistrées à cette période. Au cours des dernières années, il a été constaté que le groupe des calanides a régréssé alors qu’il est plutôt caractéristique de milieux en bonne santé. Si ce phénomène n’est pas encore complètement expliqué, il n’en reste pas moins que la dynamique zooplanctonique reste typique d’un milieu oligomésotrophe. De plus, le rapport entre les abondances zooplanctoniques et biomasses phytoplanctoniques suggère que le lac du Bourget est caractérisé par une bonne efficience trophique et ce surtout depuis la disparition, fin 2009, de P. rubescens. En lien avec (i) la restauration de l’écosystème, (ii) un changement dans la pratique de pêche (i.e. la modification de la maille des filets) et (iii) de manière concommitante à la disparition de P. rubescens, le peuplement de poissons du lac du Bourget est dans un état très satisfaisant avec la confirmation d’un stock élevé de corégones (lavarets) qui atteint en 2012 un rendement record. L’amélioration significative de l’état trophique du lac du Bourget observé depuis les 3 dernières années est donc renforcée à présent par la réponse du compartiment biologique supérieur, avec le retour emblématique du lavaret. L’ensemble des paramètres limnologiques classiques mesuré au cours de l’année 2012 (transparence, chlorophylle a, Phosphore total) mais également bon nombre d’autres descripteurs (composition et taille phytoplanctoniques, biomasse et dynamique zooplanctoniques, peuplement piscicole) permettent de confirmer que l’état et le fonctionnement pélagique du lac du Bourget est bon à très bon (ce qui est aussi corroboré par l’excellente qualité sanitaire) et qu’il peut-être classé comme étant oligo-mésotrophe. Toutefois, l’analyse du peuplement des macroinvertébrés du lac a révélé que ce dernier se caractérise encore par une quantité de matière organique trop importante, qui s’accumule dans les substrats fins de la zone littorale du lac. Cette dernière se traduit par des activités de consommation et de dégradation importantes conduisant à des conditions hypoxiques. Au fond du lac, les faibles abondances et diversité de ce peuplement benthique témoignent également d’un dysfonctionnement caractérisé par une accumulation de matière organique non transférée au sein des réseaux trophiques du lac du Bourget et dont l’hypolimnion présente encore des hypoxies voire des anoxies.

International audience; Cyanobacterial blooms induce significant costs that are expected to increase in the near future. Cyanobacterial resistance to zooplankton grazing is one factor thought to promote bloom events. Yet, numerous studies on zooplankton ability to graze upon cyanobacteria have been producing contradictory results and such a puzzle might arise from the lack of direct observations in situ. Our objective was to track, using fatty acid (FA) and fatty acid stable isotope analyses (FA-SIA), the fate of cyanobacterial organic matter in the food web of a lake subjected to summer blooms of Planktothrix rubescens. A metalimnetic bloom of P. rubescens occurred in Lake Bourget (France) during the study period (May-November 2009). The bloom was especially rich in alpha-linolenic acid, 18:3(n-3), but none of the considered zooplankton taxa exhibited spiking content in this particular FA. FA-SIA revealed, however, that over a quarter of 18:3(n-3) in small zooplankton (< 500 mu m) was provided by P. rubescens while large cladocerans (> 500 mu m) did not benefit from it. P. rubescens 18:3(n-3) could be tracked up to perch (Perca fluviatilis) young of the year (YOY) to which it contributed to similar to 15 % of total 18:3(n-3). Although transferred with a much lower efficiency than micro-algal organic matter, the P. rubescens bloom supported a significant share of the pelagic secondary production and did not constitute, sensu stricto, a 'trophic dead end'. The cyanobacterial bloom also provided perch YOY with components of high nutritional values at a season when these are critical for their recruitment. This cyanobacterial bloom might thus be regarded as a significant dietary bonus for juvenile fish.

Après l’important changement observé entre 2009 et 2010, marqué par l’importante baisse de la biomasse phytoplanctonique et la disparition de l’efflorescence à Planktothrix rubescens, une nouvelle bascule semble avoir opéré au cours de l’année 2013, avec la plus faible biomasse phytoplanctonique jamais enregistrée sur l’ensemble de la chronique, une augmentation très importante de la proportion des formes picophytoplanctoniques, une valeur record pour la transparence moyenne, etc. Avec une concentration moyenne hivernale de 10 à 11 μg/L de phosphore total, une concentration moyenne annuelle de 3,4 μg/L pour la chlorophylle a et de 8 m pour la transparence, le lac du Bourget n’a jamais autant mérité que cette année le statut de lac oligo-mésotrophe. 2013 a pourtant été une année où, comme les 4 précédentes, les apports en Phosphore particulaire par les principaux tributaires (la Leysse et le Sierroz), ont continué d’augmenter significativement mais sans répercussion sur les concentrations en Ptot et PO4 dans la colonne d’eau au milieu du lac qui eux ont continué de chuter, atteignant les niveaux « record » cités ci-dessus. En bout de chaîne, le peuplement de poissons du lac du Bourget se révèle toujours dans un état très satisfaisant avec la confirmation d’un stock élevé de corégones qui atteint en 2013 un rendement presque comparable à 2012. L’amélioration significative de l’état trophique du lac du Bourget observé depuis les 4 dernières années continue d’être renforcée par la réponse du compartiment biologique supérieur. L’examen 2013 du lac du Bourget confirme donc le bon état écologique de l’écosystème pélagique et la continuité de sa progression vers un état oligotrophe stricte. Le shéma ci-dessous est une tentative de résumé de l’état et de l’évolution du lac entre 2012 et 2013. Les chiffres proposés comme objectifs à atteindre pour 2020 restent à être entérrinés par le conseil scientifique.