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1. An siRNA-based screen in C2C12 myoblasts identifies novel genes involved in myogenic differentiation

Author: Ange-Line Bruel, Khaled Bouhouche, Véronique Blanquet, Rayan Alwan, Anne Da Silva, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique des Anomalies du Développement (GAD), IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Université de Bourgogne (UB), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe GAD (LNC - U1231), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique des Anomalies du Développement ( GAD ), IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Université de Bourgogne ( UB ), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) ( IBENS ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] ( LNC ), and Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: 0301 basic medicine, Myoblast proliferation, Muscle Fibers, Skeletal, Proliferation, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, Muscle Development, Cell Line, Myoblasts, Novel gene, Mice, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, RNA interference, Animals, Myocyte, Genetic Testing, RNA, Small Interfering, Gene, Cell Nucleus, Genetics, Myogenesis, [ SDV.BC ] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Cell Differentiation, Cell Biology, Phenotype, Cell biology, 030104 developmental biology, Screen, Differentiation, siRNA, RNA Interference, C2C12, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; AbstractMyogenesis is a highly regulated multi-step process involving myoblast proliferation and differentiation. Although studies over the last decades have identified several factors governing these distinct major phases, many of them are not yet known. In order to identify novel genes, we took advantage of the C2C12 myoblastic line to establish a functional siRNA screen combined with quantitative-imaging analysis of a large amount of differentiated myoblasts. We knocked down 100 preselected mouse genes without a previously characterized role in muscle. Using image analysis, we tracked gene-silencing phenotypes by quantitative assessment of cellular density, myotube quantity, myotube morphology and fusion index. Our results have revealed six genes involved in both stages of C2C12 myogenesis and 13 genes specific to the differentiation stage. These findings prove that our RNAi-based screen could be an efficient tool to detect clear and subtle phenotypes allowing the identification of new myogenic regulators in mammals.
Published: 2017

2. Liver methylene fraction by dual- and triple-echo gradient-echo imaging at 3.0T: Correlation with proton MR spectroscopy and estimation of robustness after SPIO administration

Author: David Masson, Patrick Hillon, Isabelle Robin, Romaric Loffroy, Boris Guiu, Serge Aho, Jean-Michel Petit, Bruno Vergès, Jean-Pierre Cercueil, Douraied Ben Salem, Denis Krausé, Service de radiologie et d'Imagerie médicale diagnostique et thérapeutique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service d'Ophtalmologie (CHU de Dijon), Laboratoire Electronique, Informatique et Image [UMR6306] (Le2i), Université de Bourgogne (UB)-École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale (GETBO), Université de Brest (UBO)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Service de Diabétologie, Service d'Hépato-Gastroentérologie, Hôpital du Bocage, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Service d'Endocrinologie, Diabétologie et Maladies Métaboliques (CHU de Dijon), Service d'hépato-gastroentérologie et cancérologie digestive (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire Electronique, Informatique et Image ( Le2i ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale ( GETBO ), Université de Brest ( UBO ), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon ( ENSBANA ), and Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ) -Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon )
Subjects: Male, Magnetic Resonance Spectroscopy, MESH : Fatty Liver, MESH: Echo-Planar Imaging, [SDV]Life Sciences [q-bio], Carbon Compounds, Inorganic, MESH : Statistics as Topic, Statistics as Topic, MESH : Aged, Contrast Media, MESH : Carbon Compounds, Inorganic, MESH : Tissue Distribution, 030218 nuclear medicine & medical imaging, Correlation, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, MESH : Dextrans, Non-alcoholic Fatty Liver Disease, MESH : Female, Tissue Distribution, MESH: Dextrans, Methylene, Magnetite Nanoparticles, MESH: Fatty Liver, MESH: Aged, MESH: Middle Aged, medicine.diagnostic_test, Echo-Planar Imaging, Dextrans, Nuclear magnetic resonance spectroscopy, MESH : Adult, Middle Aged, MESH: Reproducibility of Results, Adipose Tissue, Liver, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, MESH : Sensitivity and Specificity, Protons, MESH: Adipose Tissue, Adult, Iron Overload, MESH : Male, MESH: Magnetite Nanoparticles, MESH : Adipose Tissue, Sensitivity and Specificity, MESH: Iron Overload, 03 medical and health sciences, Flip angle, Robustness (computer science), MESH: Contrast Media, Linear regression, medicine, MESH : Protons, Humans, MESH : Middle Aged, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, MESH: Tissue Distribution, MESH: Statistics as Topic, Aged, MESH : Contrast Media, MESH : Iron Overload, MESH: Humans, MESH : Echo-Planar Imaging, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], MESH: Magnetic Resonance Spectroscopy, business.industry, MESH : Reproducibility of Results, MESH : Humans, MESH: Biological Markers, MESH: Carbon Compounds, Inorganic, MESH : Liver, MESH : Magnetite Nanoparticles, Reproducibility of Results, MESH: Adult, Magnetic resonance imaging, MESH: Male, MESH: Sensitivity and Specificity, Proton mr spectroscopy, MESH : Biological Markers, Fatty Liver, chemistry, MESH : Magnetic Resonance Spectroscopy, MESH: Protons, Nuclear medicine, business, MESH: Female, Biomarkers, MESH: Liver
Abstract: Purpose To assess the systematic errors in liver methylene fraction (LMF) resulting from fat–fat interference effects with dual- and triple-echo gradient-recalled-echo Dual/Triple GRE) sequences and to test the robustness of these sequences after iron overloading. Materials and Methods Forty type-2 diabetic patients underwent LMF measurement by 3.0T 1H magnetic resonance spectroscopy (corrected for T1 and T2 decays) as the reference standard and liver fat fraction (%Fat) measurement by four Dual/Triple GRE sequences with 20° and 60° flip angle (α), corrected for T1 recovery. The same four sequences were repeated in eight patients after ferumoxide injection. Corrections for systematic errors were determined from the linear regressions (spectroscopy LMF values over Dual/Triple GRE %Fat values). Robustness was tested using Wilcoxon's signed-rank test. Results Fat–fat interference effects produced a ∼10% relative systematic error and T2* decay produced a 1.9%–4.2% absolute systematic error in LMF. When comparing before and after ferumoxide, dual-echo imaging with α = 20° and α = 60°, even when corrected, showed absolute differences of 7.23% [2.81%–10.25%] (P = 0.0117) and 5.65% [1.89%–8.216.8%] (P = 0.0117), respectively; compared to only 1.17% [0.08%–2.83%] (P = 0.0251) and 1.15% [0.37%–2.73%] (P = 0.2626) with triple-echo imaging and α = 20° and α = 60°, respectively. Conclusion Triple-echo imaging with α = 60° corrected for both T1 recovery and fat–fat interference effects is robust after superparamagnetic iron oxide (SPIO) administration and can reliably quantify LMF. J. Magn. Reson. Imaging 2011;33:119–127. © 2010 Wiley-Liss, Inc.
Published: 2010

3. A new polymorphism in myostatin influences beef traits in a blonde d’aquitaine-holstein crossbred population

Author: Renand, Gilles, Vinet, Aurelie, Caste, C., Picard, Brigitte, Cassar-Malek, Isabelle, Bouyer, Claire, Blanquet, Véronique, Oulmouden, Ahmad, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Délégation à l'évaluation, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), UAR 0837 Délégation à l'Evaluation, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Direction Collégiale ( DCOLL ) -Délégation à l'Evaluation ( DEV ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Direction Collégiale (DCOLL)-Délégation à l'Evaluation (DEV), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, cattle, myostatin, beef trait, food and beverages, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: Session 4 : Biotechnology to manage meat quality; The effects on beef traits of the recently discovered mutation in the myostatin gene of Blonde d’Aquitaine cattle were estimated in a population segregating this mutation. Three F1 Blonde d’Aquitaine-Holstein crossbred sires were mated either to F1 or Holstein cows to obtain F2 or back-cross calves. Calves were fattened for veal production and slaughtered at 22 weeks of age. Live, slaughter traits and muscle characteristics were recorded. Genotypes at the new polymorphism were determined by RFLP: 19 T/T; 30 T/G and 8 G/G among the 56 calves with genotypes and phenotypes (43 F2 and 13 back-cross). The mutation was shown to have pleiotropic on most of the recorded traits except growth. Muscling and carcass yield were significantly affected positively by the mutation, while fatness and skeletal development were negatively affected. The mutation effects were partially recessive. The mutation also influenced muscle characteristics with higher proportion of fast white glycolytic muscle fibers. All these effects are coherent with published results of former known mutations in myostatin gene and can explain the superiority of Blonde d’Aquitaine muscling.
Published: 2015

4. L'inactivation de la protéine hsp27 pour comprendre les mécanismes de tendreté de la viande bovine

Author: Kammoun, Malek, Picard, Brigitte, Astruc, Thierry, Barboiron, Christiane, Chambon, Christophe, Blanquet, Véronique, Cassar-Malek, Isabelle, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ACI Phase Inra Phénotypage des animaux modèles, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA., VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), and Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, viande bovine, protéine, muscle, qualité sensorielle, stress oxydatif, microscopie électronique, mécanisme, souris, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Sciences agricoles, Agricultural sciences, tendrete de la viande
Abstract: Numéro Hors Série ; Session : Différenciation de l'offre par la qualitéPartenaires des JSMTV 2014 : Polytech Clermont-Ferrand, France.VetAgro Sup, Institut d'Enseignement Supérieur et de Recherche en Alimentation, Santé Animale, Sciences Agronomiques et de l'Environnement, France.ADIV, Association pour le Développement de l'Institut de la Viande, France.IDELE, Institut de l'Elevage, France.IFIP, Institut du Porc, France.ITAVI, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux, France.CTPA, Centre Technique des Productions Animales et agroalimentaires, France.CIV, Centre d'Information des Viandes, France.; In order to examine the role of Hsp27 in the molecular mechanisms underlying tenderness, we generated an HspB1-null mouse (Kammoun et al., 2013). The mutant mouse was viable, fertile and showed neither apparent morphological noranatomical alterations. The macroscopic or microscopic muscle phenotype was not altered. However, there was evidence for a muscle-type specific alteration of the molecular phenotype in relation to 1) apoptosis, Hsp status and anti-oxidant status in an oxidative muscle and 2) Hsp status and calcium homeostasis in a glycolytic muscle. Lastly, a preliminary transmission electron microscopy experiment revealed ultrastructural abnormalities in the myofibrillar structure of mutant mice. These data suggest that Hsp27 could directly impact the organisation of the muscle cytoskeleton and contribute to the determinism of tenderness at the molecular and ultrastructural levels.
Published: 2014

5. Fine mapping of quantitative trait loci underlying sensory meat quality traits in three French beef cattle breeds

Author: Allais , Sophie, Levéziel , Hubert, Hocquette , Jean-François, Rousset , Sylvie, Denoyelle , Christophe, Renand , Gilles, Journaux , Laurent, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale pour l'Espèce Caprine (CAPRI-IA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Institut de l'Elevage, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale pour l'Espèce Caprine ( CAPRI-IA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), and Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Male, bovin, Meat, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, qualité sensorielle, Quantitative Trait Loci, qualité de la viande, polymorphisme, Breeding, gène de la myostatine, Linkage Disequilibrium, meat quality, race bovine blonde d'aquitaine, beef cattle, Food Quality, Food and Nutrition, Animals, Muscle, Skeletal, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, race bovine charolaise, cartographie fine, Calpain, qtl, race bovine limousine, Calcium-Binding Proteins, Chromosome Mapping, teneur en matière grasse, Myostatin, tendrete, Agricultural sciences, Taste, Alimentation et Nutrition, fine mapping, Mutation, gène candidat, Cattle, Female, France, animal de boucherie, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Sciences agricoles, quantitative trait loci
Abstract: Improving the traits that underlie meat quality is a major challenge in the beef industry. The objective of this paper was to detect QTL linked to sensory meat quality traits in 3 French beef cattle breeds. We genotyped 1,059, 1,219, and 947 young bulls and their sires belonging to the Charolais, Limousin, and Blonde d'Aquitaine breeds, respectively, using the Illumina BovineSNP50 BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA). After estimating relevant genetic parameters using VCE software, we performed a linkage disequilibrium and linkage analysis on 4 meat traits: intramuscular fat content, muscle lightness, shear force, and tenderness score. Heritability coefficients largely ranged between 0.10 and 0.24; however, they reached a maximum of 0.44 and 0.50 for intramuscular fat content and tenderness score, respectively, in the Charolais breed. The 2 meat texture traits, shear force and tenderness score, were strongly genetically correlated (-0.91 in the Charolais and Limousin breed and -0.86 in the Blonde d'Aquitaine breed), indicating that they are 2 different measures of approximately the same trait. The genetic correlation between tenderness and intramuscular fat content differed across breeds. Using a significance threshold of 5 × 10(-4) for QTL detection, we found more than 200 significant positions across the 29 autosomal chromosomes for the 4 traits in the Charolais and Blonde d'Aquitaine breeds; in contrast, there were only 78 significant positions in the Limousin breed. Few QTL were common across breeds. We detected QTL for intramuscular fat content located near the myostatin gene in the Charolais and Blonde d'Aquitaine breeds. No mutation in this gene has been reported for the Blonde d'Aquitaine breed; therefore, it suggests that an unknown mutation could be segregating in this breed. We confirmed that, in certain breeds, markers in the calpastatin and calpain 1 gene regions affect tenderness. We also found new QTL as several QTL on chromosome 3 that are significantly associated with meat tenderness in the Blonde d'Aquitaine breed. Overall, these results greatly contribute to the goal of building a panel of markers that can be used to select animals of high meat quality.
Published: 2014

6. Phénotypage des animaux modèles : L'invalidation du gène hspb1 pour comprendre les mécanismes de tendreté de la viande bovine

Author: Malek Kammoun, Brigitte Picard, Muriel Bonnet, Florian Jean Louis Guillou, Denise Aubert, Vincent Blanquet, Joelle Henri-Berger, Thierry Astruc, Isabelle Cassar-Malek, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biomove, Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] ( PRC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecole Nationale de Lyon, Institut de Génomique Fonctionnelle, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), UMR CNRS 6547, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM)
Subjects: tendreté, [SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, souris KO hspb1, muscle, phénotypage, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [ SDV.BA ] Life Sciences [q-bio]/Animal biology
Abstract: La qualité sensorielle de la viande bovine est un critère important d’appréciation par lesconsommateurs qui demeurent insatisfaits en particulier de la tendreté. Celle-ci a une origine complexeet multifactorielle, qui la rend difficilement maîtrisable par la filière bovine. À l’issue de plusieurs annéesde recherche, notre équipe a établi une liste de marqueurs de la tendreté de la viande. Dans cetteliste, les Heat Shock Proteins (Hsp) figurent à des « carrefours » biologiques dans l’interactomemusculaire lié à la tendreté. Parmi elles, la Hsp27 est différentiellement exprimée entre des musclesde tendreté extrême. Comprendre le rôle de Hsp27 et de ses interacteurs dans l’établissement de latendreté est un des enjeux des recherches en production de viande.Afin d’atteindre cet objectif, l’invalidation du gène hspb1 (codant la protéine Hsp27) a été réalisée parrecombinaison homologue (KO) chez la souris (en collaboration avec l'IGFL et le PBES Lyon). Cemodèle a permis d’analyser les conséquences de l’invalidation de hspb1 sur le développement et lescaractéristiques des tissus liés à la qualité (muscle et tissus adipeux), ainsi que sur la fonctionnalité del’interactome "tendreté". Ce travail s’insérait dans l’Action Incitative du Département Phase« Phénotypage des animaux modèles » (2009-2012).Les souris KO hspb1-/- sont viables et fertiles, ne présentent aucune anomalie apparente mais ont unformat plus petit que celui de leurs témoins (Kammoun et al, 2013a). Au niveau plasmatique, uneinteraction génotype x âge x sexe a été révélée pour 16 paramètres biologiques sur les 36 indicateursmétaboliques mesurés. Les principales différences détectées entre KO et témoins suggèrent desdifférences de métabolismes hépatique et lipidique chez les mâles et de métabolisme du glucose et del’acide urique chez les femelles. Aucune différence n'a été observée pour les paramètresreprésentatifs du métabolisme musculaire. La structure musculaire des animaux a été analysée defaçon complémentaire par microscopie optique et électronique à transmission. La première approche n'a pas permis de révéler de différences dans les caractéristiques des fibres musculaires (typecontractile et métabolique, forme, périmètre, surface de section) à l'exception d'une tendance pour uneproportion plus élevée de fibres de petite taille chez les souris KO. Toutefois, l'analyse des profilsélectrophorétiques des isoformes de chaînes lourdes de myosine suggèrent un retard de maturationmusculaire chez les souris KO. Au niveau ultrastructural, les fibres des animaux KO sont caractérisées,comparativement à celle des témoins, par un appareil contractile musculaire moins organisé (Figure 1)qui devient très déstructuré 72h post-mortem . Ainsi le phénotype musculaire fin des souris KO estaltéré.Une analyse bioinformatique a été réalisée dans l'objectif de compléter la liste des interacteurs de laprotéine Hsp27 et des gènes cibles de l’invalidation d’hspb1 susceptibles de participer à desdifférences de structure du muscle et de la tendreté. Les partenaires ou cibles prédits de Hsp27 sontdes protéines impliquées dans différentes fonctions, comme des Hsps (Hsp20, Cryab, Hsp70a1a etHsp90aa1), des régulateurs de l'apoptose (Fas, Chuk, et caspase-3), des facteurs de traduction(Eif4E et Eif4G1), des protéines du cytosquelette (Desmine) et des antioxydants (Sod1). Lesabondances de 15 protéines ont été quantifiées par Western blot dans deux muscles de souris KO etde leurs témoins. Elles sont modifiées chez les souris dépourvues de Hsp27 principalement dans lemuscle le plus oxydatif (Kammoun et al., 2012, 2013b). Cette étude démontre l'existence de liensfonctionnels entre Hsp27 et ses cibles prédites.L'ensemble des données issues de cette étude réalisée dans une espèce modèle apporte desconnaissances nouvelles sur les mécanismes moléculaires impliqués dans l’établissement de latendreté de la viande bovine. Elle suggère que le statut en Hsp, les processus apoptotiques et laprotection contre le stress oxydatif contribue à l'évolution de l'ultrastructure post-mortem des muscleset à la tendreté de la viande. Ces données seront complétées par les résultats d'une analyseprotéomique en cours. Ces nouvelles connaissances seront validées ultérieurement sur muscle bovin.
Published: 2013

7. A practical approach to reconstruct evolutionary history of animal sialyltransferases and gain insights into the sequence-function relationships of Golgi-glycosyltransferases

Author: Daniel Petit, Jean-Michel Petit, Roxana Elin Teppa, Anne Harduin-Lepers, Brockhausen, Inka, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Inka Brockhausen, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), and Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Genetics, 0303 health sciences, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Sialyltransferase, MOLECULAR PHYLOGENY, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030302 biochemistry & molecular biology, GLYCOSILATION, Computational biology, Biology, PHYLOGENOMICS, Bioquímica y Biología Molecular, ENCODE, Genome, SIALYLTRANSFERASES, Divergent evolution, Ciencias Biológicas, 03 medical and health sciences, biology.protein, Human genome, Gene, Functional divergence, CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS, 030304 developmental biology, Synteny
Abstract: In higher vertebrates, sialyltransferases catalyze the transfer of sialic acid residues, either Neu5Ac or Neu5Gc or KDN from an activated sugar donor, which is mainly CMP-Neu5Ac in human tissues, to the hydroxyl group of another saccharide acceptor. In the human genome, 20 unique genes have been described that encode enzymes with remarkable specificity with regards to their acceptor substrates and the glycosidic linkage formed. A systematic search of sialyltransferase-related sequences in genome and EST databases and the use of bioinformatic tools enabled us to investigate the evolutionary history of animal sialyltransferases and propose original models of divergent evolution of animal sialyltransferases. In this chapter, we extend our phylogenetic studies to the comparative analysis of the environment of sialyltransferase gene loci (synteny and paralogy studies), the variations of tissue expression of these genes and the analysis of amino-acid position evolution after gene duplications, in order to assess their sequence-function relationships and the molecular basis underlying their functional divergence. Fil: Petit, Daniel. Universite de Limoges; Francia Fil: Teppa, Roxana Elin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina Fil: Petit, Jean Michel. Universite de Limoges; Francia Fil: Harduin Lepers, Anne. Universite de Limoges; Francia
Published: 2013

8. Effects of polymorphisms in the calpastatin and µ-calpain genes on meat tenderness in three French beef breeds

Author: Allais, Sophie, Journaux, Laurent, Levéziel, Hubert, Payet-Duprat, Nathalie, Raynaud, Patrice, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Rousset, Sylvie, Denoyelle, Christophe, Bernard-Capel, Carine, Renand, Gilles, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), This work was supported by the Agence Nationale de la Recherche (Paris, France, Contracts n°05-GANI-017-04, ANR-GANI-017, ANR-06-GANI-001), Apis-Gène (Paris, France), the Office de l'Elevage (Montreuil sous Bois, France), and the Fonds National de l'Elevage (Paris, France)., Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne ( UNH ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université
Subjects: calpastatin gene, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, beef cattle, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, μ-calpain gene, meat quality, polymorphism
Abstract: Chantier qualité GA; The objectives of the study were to evaluate allelic frequencies and to test the association of polymorphisms in the calpastatin (CAST) and μ-calpain (CAPN1) genes with meat tenderness in 3 French beef breeds. A total of 1,114 Charolais, 1,254 Limousin, and 981 Blonde d'Aquitaine purebred young bulls were genotyped for 3 SNP in the CAST gene and 4 SNP in the CAPN1 gene. Two of these markers, 1 in each gene, can be found in Australian or American commercial genetic tests. Others have previously been reported in American studies or are newly evidenced SNP. The quantitative traits studied were Warner-Bratzler shear force and a tenderness score evaluated by trained sensory panels. All the SNP were informative in the 3 breeds. Associations of individual markers or haplotypes with traits were analyzed. The results differed in the 3 breeds. The G allele of a CAST marker (position 97574679 on Btau4.0) was found to exert a significant effect on the shear force (+0.18 phenotypic SD; RSD) and tenderness score (-0.22 RSD) in the Blonde d'Aquitaine breed. In the same breed, this marker was associated with another CAST SNP (position 97576054 on Btau4.0) such that the GA haplotype appeared to be associated with tougher meat. Two CAPN1 markers (positions 45221250 and 45241089 on Btau4.0) had a significant effect on both traits in the Charolais breed (from |0.11| to |0.25| RSD). In the same breed, these markers were associated with another CAPNI SNP (position 45219395 on Btau4.0) such that the ACA and AGG haplotypes appeared to be associated with a tender meat and a tougher meat, respectively. Consequently, the present results indicate that the effects of the markers studied are breed-specific and cannot be extended to all Bos taurus breeds. Further studies are also required to identify other more appropriate markers for French beef breeds.
Published: 2011

9. The GENOTEND Oligochip: A tool for predicting beef quality

Author: Cassar-Malek, Isabelle, Bernard-Capel, Carine, Vidal, Véronique, Jesson, Béline, Levéziel, Hubert, Hocquette, Jean-François, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), IMAXIO, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de l'Elevage, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), and Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: GENOTEND, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], OUTIL D'IDENTIFICATION, [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: A European Commission Research Project (FOOD CT-2006-36241); absent
Published: 2010

10. The GENOTEND chip: an oligochip based on genomic markers for the prediction of beef quality

Author: Cassar-Malek, Isabelle, Capel, Carine, Vidal, Véronique, Jesson, Béline, Levéziel, Hubert, Hocquette, Jean-François, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Biopôle Clermont - Limagne, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de l'Elevage, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), and Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], prédiction, GENOMIQUE
Abstract: absent
Published: 2010

11. The effects of polymorphisms in the calpastatin and µ-calpain genes on beef tenderness are breed-specific

Author: Allais, Sophie, Hocquette, Jean-François, Levéziel, Hubert, Duprat, Nathalie, Lepetit, Jacques, Rousset, Sylvie, Denoyelle, C., Bernard-Capel, C., Journaux, L., Renand, Gilles, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), European Association for Animal Production (EAAP). ITA., Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Institut de l'Elevage, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Clermont Université
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: absent
Published: 2010

12. A particular myosin heavy chain isoform variable between beef breeds

Author: Picard, Brigitte, Allais, Sophie, Jurie, Catherine, Cassar-Malek, Isabelle, Levéziel, Hubert, Journaux, Laurent, Renand, Gilles, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), and Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2010

13. Effects of polymorphisms in the calpastatin and µ-calpain genes onmeat tenderness in three French beef breeds

Author: Allais, Sophie, Levéziel, Hubert, Duprat, Nathalie, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Rousset, Sylvie, Denoyelle, Christophe, Bernard-Capel, Carine, Journaux, Laurent, Renand, Gilles, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de l'Elevage, UAR 1276 Agence Nationale de la Recherche, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Direction Collégiale ( DCOLL ) -Agence Nationale de la Recherche ( ANR ), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Institut de l'élevage (IDELE), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), and Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [ SDV.BA ] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: absent
Published: 2010

14. The two mutations, Q204X and nt821, of the myostatin gene affect carcass and meat quality in young heterozygous bulls of French beef breeds

Author: Allais, Sophie, Levéziel, Hubert, Payet-Duprat, Nathalie, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Rousset, Sylvie, Denoyelle, Christophe, Bernard-Capel, Carine, Journaux, L., Bonnot, Aline, Renand, Gilles, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Institut de l'élevage (IDELE), This work was supported by the Agence Nationale de la Recherche (Paris, France, contract numbers 05-GANI-017-04, ANR-GANI-017, ANR-06-GANI-001), Apis-Gène (Paris, France), the Office de l’Elevage (Montreuil sous Bois, France), and the FNE (Fonds National de l’Elevage, Paris, France)., Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), and Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: beef cattle, [ SDV.SA.SPA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, myostatin, [SDV.SA.SPA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, food and beverages, gdf8, carcass trait, meat quality, polymorphism
Abstract: The availability of genetic tests to detect different mutations in the myostatin gene allows the identification of heterozygous animals and would warrant the superiority of these animals for slaughter performance if this superiority is confirmed. Thus, 2 mutations of this gene, Q204X and nt821, were studied in 3 French beef breeds in the program Qualvigène. This work was done with 1,114 Charolais, 1,254 Limousin, and 981 Blonde d’Aquitaine young bulls from, respectively, 48, 36, and 30 sires and slaughtered from 2004 to 2006. In addition to the usual carcass traits recorded at slaughter (e.g., carcass yield, muscle score), carcass composition was estimated by weighing internal fat and dissecting the 6th rib. The muscle characteristic traits analyzed were lipid and collagen contents, muscle fiber section area, and pH. Regarding meat quality, sensory qualities of meat samples were evaluated by a taste panel, and Warner-Bratzler shear force was measured. Deoxyribonucleic acid was extracted from the blood samples of all calves, the blood samples of 78% of the dams, and the blood or semen samples of all the sires. Genotypes were determined for 2 disruptive mutations, Q204X and nt821. Analyses were conducted by breed. The superiority of carcass traits of calves carrying one copy of the mutated allele (Q204X or nt821) over noncarrier animals was approximately +1 SD in the Charolais and Limousin breeds but was not significant in the Blonde d’Aquitaine. In the Charolais breed, for which the frequency was the greatest (7%), young bulls carrying the Q204X mutation presented a carcass with less fat, less intramuscular fat and collagen contents, and a clearer and more tender meat than those of homozygous-normal cattle. The meat of these animals also had slightly less flavor. Also in the Charolais breed, 13 of 48 sires were heterozygous. For each sire, the substitution effect of the wild allele by the mutant allele was approximately +1 SD for carcass conformation and yield, showing that the estimate of the substitution effect was independent of family structure, as it ought to be for a causal mutation. These results illustrate the challenge of using genetic tests to detect animals with the genetic potential for greater grades of carcasses and meat quality.
Published: 2010

15. Traçabilité analytique des produits carnés : origine et alimentation de l'animal

Author: Prache, Sophie, Levéziel, Hubert, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Dominique Bauchart, Brigitte Picard, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [ SDV.BA ] Life Sciences [q-bio]/Animal biology
Abstract: absent
Published: 2010

16. Une isoforme de chaîne lourde de myosine particulière, variable entre les races à viande bovines

Author: Picard , Brigitte, Allais , Sophie, Jurie , Catherine, Levéziel , Hubert, Journaux , L., Renand , Gilles, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), and Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2009

17. Mise en équation de la tendreté de la viande bovine à partir de validations de marqueurs potentiels

Author: Guillemin, Nicolas, Jurie, Catherine, Renand, Gilles, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Levéziel, Hubert, Picard, Brigitte, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), and Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2009

18. The GENOTEND Chip: A Tool to Analyse Gene Expression in Muscles of Beef Cattle

Author: Hocquette, J. F., Bernard-Capel, C., Vuillaume, M. L., Jesson, B., Levéziel, H., Isabelle Cassar-Malek, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), IMAXIO, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Absent, G. Matteo Crovetto (Editeur), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), and Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], ANALYSE, quality, [SDV]Life Sciences [q-bio], tool
Abstract: absent
Published: 2009

19. La puce GENOTEND : Un outil à haut débit pour analyser l'expression des gènes dans le muscle de bovin producteur de viande

Author: Hocquette, Jean-François, Bernard-Capel, Carine, Vuillaume, Marie-Laure, Jesson, Béline, Levéziel, Hubert, Cassar-Malek, Isabelle, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de l'Elevage, IMAXIO, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), and Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], GENOMIQUE
Abstract: absent
Published: 2009

20. Stratégie de phénotypage haut débit de la tendreté de la viande bovine

Author: Guillemin, Nicolas, Jurie, Catherine, Meunier, Bruno, Levéziel, Hubert, Hocquette, Jean-François, Picard, Brigitte, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], GENOMIQUE
Abstract: absent
Published: 2009

21. Effect of muscle and animal types on the expression of HSP in cattle muscle

Author: Guillemin , Nicolas, Levéziel , Hubert, Jurie , Catherine, Hocquette , Jean-François, Picard , Brigitte, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), ProdInra, Archive Ouverte, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), and Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], PROTÉINE HPS
Abstract: absent
Published: 2009

22. Detection of quantitative trait loci affecting carcass and meat quality in two French beef breeds

Author: Allais , Sophie, Levéziel , Hubert, Lepetit , Jacques, Hocquette , Jean-François, Rousset , Sylvie, Denoyelle , Christophe, Bernard-Capel , Carine, Journeaux , Laurent, Renand , Gilles, Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Institut de l'élevage (IDELE), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Clermont Université, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Chantier qualité spécifique "Auteurs Externes" département de Génétique animale : uniquement liaison auteur au référentiel HR-AccessChantier qualité spécifique "Auteurs Externes" département de Génétique animale : uniquement liaison auteur au référentiel HR-Access; absent
Published: 2009

23. Quantification of liver fat content: comparison of triple-echo chemical shift gradient-echo imaging and in vivo proton MR spectroscopy

Author: David Masson, Denis Krausé, Jean-Michel Petit, Romaric Loffroy, Patrick Hillon, Douraied Ben Salem, Jean-Pierre Cercueil, Boris Guiu, Serge Aho, Service de radiologie et d'Imagerie médicale diagnostique et thérapeutique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale ( GETBO ), Université de Brest ( UBO ), Département de radiologie [Brest] ( DR - Brest ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ), Service d'Ophtalmologie (CHU de Dijon), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon ( ENSBANA ), Service d'Hépato-Gastroentérologie, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ) -Hôpital du Bocage, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale (GETBO), Université de Brest (UBO)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), Département de radiologie [Brest] (DR - Brest), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Hôpital du Bocage, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Service d'hépato-gastroentérologie et cancérologie digestive (CHU de Dijon)
Subjects: Male, Magnetic Resonance Spectroscopy, MESH: Echo-Planar Imaging, MESH : Fatty Liver, [SDV]Life Sciences [q-bio], MESH : Aged, MESH : Prospective Studies, MESH : Mathematical Computing, 030218 nuclear medicine & medical imaging, MESH: Magnetic Resonance Imaging, 0302 clinical medicine, Nuclear magnetic resonance, MESH: Aged, 80 and over, MESH : Diabetes Mellitus, Type 2, Image Processing, Computer-Assisted, Medicine, MESH : Female, Prospective Studies, MESH: Mathematical Computing, MESH: Fatty Liver, Mathematical Computing, MESH: Aged, Aged, 80 and over, MESH: Middle Aged, medicine.diagnostic_test, Echo-Planar Imaging, Echo (computing), Middle Aged, MESH: Image Processing, Computer-Assisted, Magnetic Resonance Imaging, Liver, Content (measure theory), 030211 gastroenterology & hepatology, Female, MESH : Software, MESH: Image Enhancement, MESH : Sensitivity and Specificity, MESH : Image Processing, Computer-Assisted, MESH: Diabetes Mellitus, Type 2, MESH : Male, Sensitivity and Specificity, 03 medical and health sciences, MESH: Software, Flip angle, In vivo, MESH : Magnetic Resonance Imaging, Liver fat, Humans, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, MESH : Middle Aged, Spectroscopy, MESH : Aged, 80 and over, Aged, MESH: Humans, MESH : Echo-Planar Imaging, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, MESH: Magnetic Resonance Spectroscopy, MESH : Humans, MESH : Liver, Magnetic resonance imaging, Image Enhancement, Proton mr spectroscopy, MESH: Male, MESH: Prospective Studies, MESH: Sensitivity and Specificity, Fatty Liver, Diabetes Mellitus, Type 2, MESH : Magnetic Resonance Spectroscopy, MESH : Image Enhancement, business, Nuclear medicine, MESH: Female, Software, MESH: Liver
Abstract: International audience; PURPOSE: To validate a triple-echo gradient-echo sequence for measuring the fat content of the liver, by using hydrogen 1((1)H) magnetic resonance (MR) spectroscopy as the reference standard. MATERIALS AND METHODS: This prospective study was approved by the appropriate ethics committee, and written informed consent was obtained from all patients. In 37 patients with type 2 diabetes (31 men, six women; mean age, 56 years), 3.0-T single-voxel point-resolved (1)H MR spectroscopy of the liver (Couinaud segment VII) was performed to calculate the liver fat fraction from the water (4.7 ppm) and methylene (1.3 ppm) peaks, corrected for T1 and T2 decay. Liver fat fraction was also computed from triple-echo (consecutive in-phase, opposed-phase, and in-phase echo times) breath-hold spoiled gradient-echo sequence (flip angle, 20 degrees), by estimating T2* and relative signal intensity loss between in- and opposed-phase values, corrected for T2* decay. Pearson correlation coefficient, Bland-Altman 95% limit of agreement, and Lin concordance coefficient were calculated. RESULTS: Mean fat fractions calculated from the triple-echo sequence and (1)H MR spectroscopy were 10% (range, 0.7%-35.6%) and 9.7% (range, 0.2%-34.1%), respectively. Mean T2* time was 14.7 msec (range, 5.4-25.4 msec). Pearson correlation coefficient was 0.989 (P < .0001) and Lin concordance coefficient was 0.988 (P < .0001). With the Bland-Altman method, all data points were within the limits of agreement. CONCLUSION: A breath-hold triple-echo gradient-echo sequence with a low flip angle and correction for T2* decay is accurate for quantifying fat in segment VII of the liver. Given its excellent correlation and concordance with (1)H MR spectroscopy, this triple-echo sequence could replace (1)H MR spectroscopy in longitudinal studies.
Published: 2009

24. Gene expression in Large White or Duroc-sired female and castrated male pigs and relationships with pork quality

Author: Claudia Terlouw, Dominique Rocha, Anthony Kwasiborski, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Genus plc, Genus Cambridge Research Laboratory, Department of Pathology, University of Cambridge [UK] (CAM), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), The present study was financed by INRA (France) and Genus Plc (UK)., Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), University of Cambridge [UK] ( CAM ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: Male, pig, Meat, [SDV]Life Sciences [q-bio], Sus scrofa, heat shock protein, HSP72 Heat-Shock Proteins, Biology, meat quality, Transcriptome, Andrology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Gene expression, Genetics, Animals, longissimus muscle, Gene, Annexin A2, proteomic, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Gene Expression Profiling, Sire, 0402 animal and dairy science, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, transcriptomic, 040201 dairy & animal science, Breed, Gene expression profiling, Longissimus, Castration, chemistry, Animal Science and Zoology, Female, Orchiectomy
Abstract: Chantier qualité GA; This study assessed expression of 12 genes in 24 pig longissimus samples earlier subjected to a proteomic study by our group. Genes were selected on the basis of the earlier proteomic results. Pigs differed in rearing environment (indoors or outdoors), sire breed (Duroc or Large White) and gender (female or castrated male). At slaughter they experienced different stress conditions. The proportion of gene expression changes influenced by treatment factors was consistent with the proportion of protein changes in an earlier proteomic analysis of the same pigs. Expression levels of genes were often correlated. Gene expression was generally not correlated with the levels of the corresponding protein. Finally, most meat quality traits were correlated with the expression of at least one of the studied genes. The most meaningful of these was the association of a slower pH decline with lower levels of HSP72 expression and higher levels of HSP72 protein. ANXA2 and cMDH expression were also associated with various meat quality traits. These relationships may be related to pre-slaughter stress levels and fibre type composition.
Published: 2009

25. La maîtrise de la tendreté de la viande bovine : identification de marqueurs biologiques

Author: Hubert Levéziel, Gilles Renand, Anne Listrat, Brigitte Picard, Jean-François Hocquette, Nicolas Guillemin, Didier Micol, Isabelle Cassar-Malek, Catherine Jurie, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, 0303 health sciences, apoptose, bovin, tendreté, marqueur biologique, viande, fibre musculaire, muscle, 0402 animal and dairy science, génomique fonctionnelle, bovin à viande, 04 agricultural and veterinary sciences, gène marqueur, 040201 dairy & animal science, tendrete, Agricultural sciences, 03 medical and health sciences, protéomique, transcriptome, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Sciences agricoles, lipide, 030304 developmental biology
Abstract: La tendreté de la viande bovine présente une forte variabilité non maîtrisée qui est à l’origine d’une insatisfaction des consommateurs. De plus, il n’existe pas d’outils fiables et utilisables par la filière bovine pour prédire ce critère de qualité. Depuis de nombreuses années, l’implication des caractéristiques musculaires (collagène, lipides, systèmes protéolytiques, fibres) dans la tendreté a été bien étudiée. Toutefois, lorsque ces caractéristiques sont maîtrisées, il demeure encore une variabilité élevée et non expliquée. Afin d’approfondir les connaissances sur l’origine de cette variabilité, des études de génomique fonctionnelle ont été conduites durant les 10 dernières années. Ces approches permettent de rechercher sans a priori des gènes ou des protéines dont l’expression varie en fonction de la tendreté de la viande. Ces études ont permis d’établir une liste de marqueurs biologiques de la tendreté dont l’analyse phénotypique pourra venir compléter les analyses génétiques de recherche de polymorphismes., Beef tenderness exhibits a high and uncontrolled variability which is one reason for the consumer's dissatisfaction. Moreover, the beef industry does not have predictive tools to measure meat tenderness. During the last few years, the impact of muscular characteristics such as collagen, lipids, proteolytic systems and fibres on meat tenderness has been studied. however, there is still an uncontrolled highly variable meat tenderness even when these muscular characteristics are under control. In order to understand this variability, some genomic studies have been conducted during the last 10 years. They allow the screening, without a priori, of genes and proteins whose expression is variable with meat tenderness. These studies have established a list of tenderness biomarkers whose phenotypic analyses can complete the polymorphism analyses. This article summarises the current knowledge concerning the phenotypic approach, and will be followed by a second article which will present the genetic approach of beef tenderness markers.
Published: 2009

26. Qualités des carcasses et des viandes de jeunes bovins hétérozygotes pour les mutations Q204x et nt821 du gène de la myostatine dans trois races allaitantes françaises

Author: Allais, Sophie, Levéziel, Hubert, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Denoyelle, Christophe, Bernard, Carine, Bonnot, Aline, Journeaux, Laurent, Renand, Gilles, Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut de l'élevage (IDELE), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], GENETIQUE, GENOMIQUE
Abstract: Chantier qualité spécifique "Auteurs Externes" département de Génétique animale : uniquement liaison auteur au référentiel HR-Access; absent
Published: 2008

27. Validation d’un marqueur potentiel de la tendreté de la viande bovine

Author: Guillemin, Nicolas, Levéziel, Hubert, Renan, G., Micol, Didier, Hocquette, Jean-François, Picard, Brigitte, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], QUALITÉ DES PRODUITS, GENETIQUE
Abstract: absent
Published: 2008

28. Des avancées en génomique fonctionnelle et positionnelle chez les bovins à viande: programmes en cours et potentialités

Author: Hocquette, Jean-François, Boichard, Didier, Cassar-Malek, Isabelle, Laville, Elisabeth, Renand, Gilles, Levéziel, Hubert, Picard, Brigitte, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), and Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: absent
Published: 2008

29. MUGENE : Approche combinée de génétique, de génomique et de biologie musculaire pour prédire la qualité de la viande bovine

Author: Hocquette, Jean-François, Laville, Elisabeth, Bernard, Carine, Picard, Brigitte, Cassar-Malek, Isabelle, Sayd, Thierry, Lepetit, Jacques, Jurie, Catherine, Meunier, Bruno, Micol, Didier, Levéziel, Hubert, Renand, Gilles, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Service Aptitudes et Sélection des Races Allaitantes, Institut de l'élevage (IDELE), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de l'Elevage, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), and Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, GENETIQUE ANIMALE, BIOLOGIE, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, GENOMIQUE
Abstract: absent
Published: 2008

30. Validation de marqueurs protéiques de la tendreté de la viande bovine : choix méthodologiques

Author: Guillemin, Nicolas, Meunier, Bruno, Levéziel, Hubert, Renand, Gilles, Lepetit, Jacques, Hocquette, Jean-François, Picard, Brigitte, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: absent
Published: 2008

31. Teneur en lipides du muscle et adiposité des carcasses en races bovines à viande : variabilité génétique et effets de marqueurs dans les gènes DGAT1 et Thyroglobuline

Author: Renand, Gilles, Bonnot, Aline, Levéziel, Hubert, Duprat, Nathalie, Malafosse, A., Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Rousset, Sylvie, Denoyelle, C., Dodelin, V., Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), and Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2007

32. Qualvigene Program: Detection and validation of genes involved in the beef meat quality in the 3 major beef breeds in France

Author: Renand, Gilles, Malafosse, A., Denoyelle, C., Bernard, C., Levéziel, Hubert, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Rousset, Sylvie, Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Selection Units of Charolais, Limousin and Blonde d'Aquitaine breeds, Institut de l'Elevage, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Institut de l'élevage (IDELE), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), and Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], GENOMIQUE
Abstract: Qualvigene; absent
Published: 2007

33. Gènes bovins et qualité des viandes: présentation du programme européen GeMQual

Author: Levéziel, Hubert, Renand, Gilles, Hocquette, Jean-François, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], GENOMIQUE
Abstract: GEMQUAL; absent
Published: 2007

34. Use of interspecific recombinant congenic mice for the fast positional cloning of QTL on mammals: application to the fertility QTL on mice, domestic ox and human

Author: Vaiman, D., Serres, C., Gautier, Mathieu, Montagutelli, X., Monget, Philippe, Humblot, P., Maftah, Abderrahman, Druet, Tom, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Unité de recherche Génétique Biochimique et Cytogénétique (LGBC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Pasteur [Paris], Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Unité de recherche Génétique Biochimique et Cytogénétique ( LGBC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] ( PRC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut Pasteur [Paris] (IP), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], GENETIQUE
Abstract: MAMMIFERTMAMMIFERT; absent
Published: 2007

35. Markers in DGAT1 and TG genes are not associated with intramuscular lipid content in the french beef breeds

Author: Renand, Gilles, Duprat, Nathalie, Levéziel, Hubert, Denoyelle, C., Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Rousset, Sylvie, Dodelin, V., Malafosse, A., Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Analyses et Technologies des Viandes, Institut de l'Elevage, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Service Sélection, Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Institut de l'élevage - site de Villers Bocage, Institut de l'élevage (IDELE), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), and Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], MARKER, [SDV]Life Sciences [q-bio], INTRAMUSCULAR LIPIDS, TG, BEEF, DGAT1
Abstract: absent
Published: 2007

36. La révolution génomique au service de la filière viande bovine

Author: Jean-François Hocquette, A. Malafosse, Hubert Levéziel, Gilles Renand, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: Marbled meat, Genomics, Management, Monitoring, Policy and Law, Biology, 0404 agricultural biotechnology, medicine, 2. Zero hunger, business.industry, 0402 animal and dairy science, [SDV.SA.AEP]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agriculture, economy and politics, 04 agricultural and veterinary sciences, Food safety, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, Breed, GENOMIQUE, Biotechnology, Tenderness, Genetic marker, FILIÈRE VIANDE BOVINE, Animal Science and Zoology, Identification (biology), [ SDV.SA.AEP ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agriculture, economy and politics, DNA microarray, medicine.symptom, business, Agronomy and Crop Science
Abstract: Genomics has brought with it a true biological revolution and has a great number of potential applications in all areas of life sciences. In animal sciences, it will become possible to improve the production of milk or meat according to consumer demands. Concerning food safety, molecular tools have already been commercialized for the detection of contaminants in meat. Genetic markers i.e. DNA markers, have also been marketed to detect the origins of individual bovine animals and their breed. For the genetic selection of cattle, DNA markers likely to be employed for the selection of tenderness or marbling traits of beef have been patented by Australian scientists. Several ongoing projects in France, Europe and the USA aim at studying the relevance of these markers and finding new ones. In muscle biology, tracking gene expression with DNA chips or by physically separating the expressed proteins has led to the identification of genes that play an important role in muscle development. These genes could in turn serve as new biological markers for tenderness, marbling or rearing practices. Large-scale projects both publicly and privately funded, in Europe, the South Sea Islands, and especially in North America aim at exploiting to a maximum new advances in genomics in favour of beef production.
Published: 2007

37. La révolution génomique concerne aussi le bovin

Author: Hubert Levéziel, Gilles Renand, A. Malafosse, Jean-François Hocquette, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: CATTLE, Genomics, Computational biology, Management, Monitoring, Policy and Law, Biology, Genome, 03 medical and health sciences, Human health, Human medicine, Potential source, Gene, 030304 developmental biology, Genetics, 0303 health sciences, 0402 animal and dairy science, [SDV.SA.AEP]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agriculture, economy and politics, 04 agricultural and veterinary sciences, 040201 dairy & animal science, Cell function, GENOMIQUE, 3. Good health, Bovine genome, TISSUE, Animal Science and Zoology, [ SDV.SA.AEP ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agriculture, economy and politics, Agronomy and Crop Science, GENOMICS
Abstract: Genomics has brought about in its wake a true biological revolution and can be applied to all areas of life sciences. Having sequenced the genomes of several different species, genomics techniques now allow us to study polymorphisms and the gene expression of proteins, enhancing our understanding of the biological functions of genes. The combined know-how of physicists and computer scientists, as well as of geneticists and physiologists is required to identify how genes control the dynamics of cell functions. Naturally enough, it is in the sphere of human medicine that the applications of genomics look most promising. Preventive and customized medicine, adapted to the genetic potential and to the way of life of each individual, will in all probability see the light of clay in the foreseeable future. in farm animals, there is no doubt that sequencing the bovine genome will give rise to new concepts and new molecular tools which will accelerate studies in bovine genomics. Comparing the bovine genome with that of other species, including humans, is also a potential source of huge progress for both human health and ruminant husbandry in general.
Published: 2007

38. Qualités des carcasses et des viandes de jeunes bovins charolais hétérozygotes pour la mutation Q204X de la myostatine

Author: Renand, Gilles, Levéziel, Hubert, Duprat, Nathalie, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Denoyelle, C., Dodelin, V., Malafosse, A., Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut de l'élevage - site de Villers Bocage, Institut de l'élevage (IDELE), Service Sélection, Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Laboratoire d'Analyses et Technologies des Viandes, Institut de l'Elevage, Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, MUTATION DU GENE, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, QUALITE DES CARCASSES
Abstract: absent
Published: 2006

39. Propriétés contractiles et métaboliques du muscle long dorsal de 15 races bovines européenes

Author: Hocquette, Jean-François, Jurie, Catherine, Picard, Brigitte, Alberti, P., Christensen, M., Failla, S., GIGLI, S., Levéziel, Hubert, Sañudo, C., Ertbjerg, P., Nute, G.R., Williams, J.L., Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Centro de Investigacion y Technologia Agroalimentaria, Department of Food Science, Royal Veterinary and Agriculutral University, Istituto Sperimentale di Zootecnia, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Departamento de Produccion Animal y Ciencia de los Alimentos, University of Zaragoza, Division of Farm Animal Science, University of Bristol [Bristol], The Roslin Institute, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Zaragoza - Universidad de Zaragoza [Zaragoza], Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Royal Veterinary and Agricultural University = Kongelige Veterinær- og Landbohøjskole (KVL ), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: Session 3: Génomique et qualités des viandes; absent
Published: 2006

40. Q204X myostatin mutation effects on carcass and meat quality traits in heterozygous charolais young bulls

Author: Levéziel, Hubert, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Denoyelle, C., Dodelin, V., Duprat, Nathalie, Malafosse, A., Renand, Gilles, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Analyses et Technologies des Viandes, Institut de l'Elevage, Service Sélection, Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut de l'élevage - site de Villers Bocage, Institut de l'élevage (IDELE), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA )
Subjects: MEAT QUALITY, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], CARCASS, MUTATION DU GENE, BEEF, MYOSTATIN MUTATION
Abstract: absent
Published: 2006

41. The potential benefits of genetics and genomics to improve beef quality-a review

Author: Hocquette, Jean-François, Renand, Gilles, Levéziel, Hubert, Picard, Brigitte, Cassar-Malek, Isabelle, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), and Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: VIANDE, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], BETAIL, GENETIQUE, GENOMIQUE
Abstract: absent
Published: 2006

42. MUGENE: Approche intégrée combinant la génétique, la génomique et la biologie musculaire pour prédire la qualité de la viande bovine selon le potentiel de croissance des animaux et les facteurs d'élevage

Author: Hocquette, Jean-François, Morzel, Martine, Levéziel, Hubert, Renand, Gilles, ProdInra, Archive Ouverte, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, BIOLOGIE, GENETIQUE, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, GENOMIQUE
Abstract: Session 3: Génomique et qualités des viandes; absent
Published: 2006

43. Le projet Qualvigène : mise en évidence du polymorphisme des gènes impliqués dans les qualités de la viande en races Charolaise, Limousine et Blonde d’Aquitaine

Author: Duprat, Nathalie, Malafosse, A., Renand, Gilles, Menissier, Francois, Hocquette, Jean-François, Lepetit, Jacques, Rousset, Sylvie, Denoyelle, C., Journaux, L., Dodelin, V., Levéziel, Hubert, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de l'Elevage, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université
Subjects: bovin, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], gène, bovin à viande, qualité de la viande, race
Abstract: absent
Published: 2006

44. Genetic effects on beef meat quality

Author: Hocquette, Jean-François, Renand, Gilles, Levéziel, Hubert, Picard, Brigitte, Cassar-Malek, Isabelle, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], GENETIQUE
Abstract: absent
Published: 2005

45. La génomique : une nouvelle science qui change notre approche de la biologie du muscle des bovins à viande

Author: Hocquette, Jean-François, Levéziel, Hubert, Renand, Gilles, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), ProdInra, Archive Ouverte, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], BIOLOGIE, GENOMIQUE
Abstract: absent
Published: 2005

46. Sequential gene expression of P-glycoprotein (P-gp), multidrug resistance-associated protein (MRP) and lung resistance protein: functional activity of P-gp and MRP present in the doxorubicin-resistant human K562 cell lines

Author: Marie-Hélène Ratinaud, Jacques Robert, Laure Brémaud, Mireille Verdier, Fabienne Grandjean, Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Homéostasie Cellulaire et Pathologies ( HCP ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST FR CNRS 3503 ) -CHU Limoges, Institut Bergonié - CRLCC Bordeaux, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Homéostasie Cellulaire et Pathologies (HCP), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503), Institut Bergonié [Bordeaux], UNICANCER, ProdInra, Archive Ouverte, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Université de Limoges (UNILIM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-CHU Limoges
Subjects: Cancer Research, Transcription, Genetic, [SDV]Life Sciences [q-bio], ATP-binding cassette transporter, 0302 clinical medicine, CLYCOSYLATION, Gene expression, Enzyme Stability, Tumor Cells, Cultured, Pharmacology (medical), P-glycoprotein, 0303 health sciences, biology, Chemistry, Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction, Flow Cytometry, Transmembrane protein, Drug Resistance, Multiple, Neoplasm Proteins, CELL LINES, [SDV] Life Sciences [q-bio], Blotting, Southern, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Efflux, Multidrug Resistance-Associated Proteins, GENE EXPRESSION, Blotting, Western, Antineoplastic Agents, 03 medical and health sciences, Humans, ATP Binding Cassette Transporter, Subfamily B, Member 1, RNA, Messenger, 030304 developmental biology, DNA Primers, Vault Ribonucleoprotein Particles, Pharmacology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Sequence Analysis, DNA, Blotting, Northern, Molecular biology, Multiple drug resistance, Cell culture, Doxorubicin, Drug Resistance, Neoplasm, biology.protein, ATP-Binding Cassette Transporters, Genes, MDR, K562 Cells
Abstract: International audience; Previous studies have reported that P-glycoprotein (P-gp), a transmembrane efflux pump involved in multidrug resistance (MDR), was overexpressed in the doxorubicin (Dox)-resistant human erythroleukemia cell line K562. Nevertheless, several results suggested that P-gp was not the only mechanism involved in these resistant cells. Sequential co-expression of other MDR-associated proteins was sometimes reported, as MDR-associated protein (MRP) and lung resistance protein (LRP), in different MDR cell lines. Thus, mRNA expression and stability of P-gp, MRP and LRP were analyzed, while their corresponding protein levels were quantified in correlation with functional assay, in the K562 cell line and two Dox-resistant variants (K562/R). Their P-gp content was in accordance with their degree of resistance, but not as much in the level of mRNA expression, suggesting a post-transcriptional regulation. On the other hand, MRP could play a minor role in MDR because of an unchanged expression in K562/R sublines. A surprising progressive disappearance of LRP in both resistant cells suggested that the original mechanism of drug redistribution may be operative, involving a negative role for LRP.
Published: 2001

47. Heavy Chain Fibrillary Glomerulonephritis: A Case Report

Author: Angela Dispenzieri, Mariam P. Alexander, Frank Bridoux, Vincent Javaugue, Alexia Rinsant, Ellen D. McPhail, Sihem Kaaki, Jonathan J. Hogan, Sébastien Bender, Emilie Pinault, Surendra Dasari, Samar M. Said, Guy Touchard, Nelson Leung, Christophe Sirac, Samih H. Nasr, Contrôle de la Réponse Immune B et des Lymphoproliférations (CRIBL), Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Néphrologie [CHU Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service d'Anatomie et de Cytologie Pathologiques [Poitiers], Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Division of Biomedical Statistics and Informatics, Mayo Clinic, Division of Hematology, Mayo Clinic Rochester, Physiologie Moléculaire de la Réponse Immune et des Lymphoproliférations (PMRIL), Université de Limoges (UNILIM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA)
Subjects: Male, Pathology, medicine.medical_specialty, Paraproteinemias, 030232 urology & nephrology, Immunoglobulin light chain, Immunoglobulin G, 03 medical and health sciences, Fatal Outcome, Glomerulonephritis, 0302 clinical medicine, Biopsy, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Kidney, medicine.diagnostic_test, biology, business.industry, Amyloidosis, Fibrillary Glomerulonephritis, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, Nephrology, biology.protein, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Immunoglobulin heavy chain, Immunoglobulin Heavy Chains, business, Kidney disease
Abstract: Heavy chain amyloidosis and heavy chain deposition disease are the only known kidney diseases caused by the deposition of truncated immunoglobulin heavy chains. Fibrillary glomerulonephritis typically results from deposition of DNAJB9 (DnaJ heat shock protein family [Hsp40] member B9) and polytypic immunoglobulin G (IgG). We describe a patient with monoclonal gammopathy (IgG with λ light chain) who developed DNAJB9-negative fibrillary glomerulonephritis leading to end-stage kidney disease, with recurrence in 2 kidney allografts. Pre- and postmortem examination showed glomerular deposition of Congo red-negative fibrillar material that was determined to be immunoglobulin heavy chain. We propose the term "heavy chain fibrillary glomerulonephritis" to describe this lesion, which appears to be a rare kidney complication of monoclonal gammopathy. The diagnosis should be suspected when the kidney biopsy shows fibrillary glomerulonephritis with negative staining for immunoglobulin light chains and DNAJB9; the diagnosis can be confirmed using immunochemical and molecular studies.
Published: 2019

48. Integrated approach combining genetics, genomics and muscle biology to manage beef quality

Author: Gilles Renand, J. F. Hocquette, Y. Briand, Bruno Meunier, Anne Listrat, Isabelle Cassar-Malek, M. Briand, P. Martin, Brigitte Picard, Hubert Levéziel, Christine Leroux, V. Amarger, Julien Bouley, D. Delourme, Y. Ueda, K. Sudre, Catherine Jurie, ProdInra, Archive Ouverte, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Génétique Quantitative et Appliquée (SGQA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de recherche Génétique Biochimique et Cytogénétique (LGBC), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Génétique Moléculaire Animale ( UGMA ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Station de Génétique Quantitative et Appliquée ( SGQA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de recherche Génétique Biochimique et Cytogénétique ( LGBC ), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM)
Subjects: 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Candidate gene, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], media_common.quotation_subject, 0402 animal and dairy science, Single-nucleotide polymorphism, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, Computational biology, Integrated approach, Biology, 040201 dairy & animal science, génétique, génomique, Muscle hypertrophy, [SDV] Life Sciences [q-bio], Transcriptome, 03 medical and health sciences, SNP, Identification (biology), Quality (business), 030304 developmental biology, media_common
Abstract: Up to now, genetic selection in cattle has been directed in favour of muscle growth, which changes muscle characteristics, and hence meat quality. One key concern, that now needs examination, is to understand the relationships between muscle growth and muscle characteristics related to meat quality. To achieve such a goal, muscles of divergently selected animals were analysed by three complementary approaches: (i) determination of muscle biochemical characteristics, (ii) identification of differentially expressed genes using transcriptomic and proteomic tools, (iii) identification of Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) within candidate genes.
Published: 2003

49. Involvement of ST6Gal I‐mediated α2,6 sialylation in myoblast proliferation and differentiation

Author: Jean-Michel Petit, Caroline Vergé, Frédéric Chirat, Amel Bouchatal, Yann Guérardel, Abderrahman Maftah, Université de Lille, CNRS, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 [UGSF], Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Myoblast proliferation, Cellular differentiation, Notch signaling pathway, sialylated glycoproteins, sialyltransferases, MyoD, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Myoblasts, Mice, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, myoblastic fusion, Animals, Myocyte, beta-D-Galactoside alpha 2-6-Sialyltransferase, lcsh:QH301-705.5, Cells, Cultured, Research Articles, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Cell Proliferation, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Chemistry, Myogenesis, N-glycans, Pax7, PAX7 Transcription Factor, Cell Differentiation, N‐glycans, musculoskeletal system, Cell biology, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], 030104 developmental biology, lcsh:Biology (General), Cell culture, 030220 oncology & carcinogenesis, C2C12, tissues, Research Article
Abstract: Myogenesis is a physiological process which involves the proliferation of myoblasts and their differentiation into multinucleated myotubes, which constitute the future muscle fibers. Commitment of myoblasts to differentiation is regulated by the balance between the myogenic factors Pax7 and MyoD. The formation of myotubes requires the presence of glycans, especially N‐glycans, on the cell surface. We examined here the involvement of α2,6 sialylation during murine myoblastic C2C12 cell differentiation by generating a st6gal1‐knockdown C2C12 cell line; these cells exhibit reduced proliferative potential and precocious differentiation due to the low expression of Pax7. The earlier fusion of st6gal1‐knockdown cells leads to a high fusion index and a drop in reserve cells (Pax7+/MyoD−). In st6gal1‐knockdown cells, the Notch pathway is inactivated; consequently, Pax7 expression is virtually abolished, leading to impairment of the proliferation rate. All these results indicate that the decrease in α2,6 sialylation of N‐glycans favors the differentiation of most cells and provokes a significant loss of reserve cells., The knockdown of st6gal1 in C2C12 murine myoblastic cells induces an increase in cell fusion and in myotube formation at the expense of cell proliferation and maintenance of a reserve cell pool. The decrease in α2,6 sialylated N‐glycans may affect the receptors that would be involved in the Notch signaling pathway that results in reduced expression level of Pax7.
Published: 2019

50. WFIKKN1 and WFIKKN2: 'Companion' proteins regulating TGFB activity

Author: Olivier Monestier, Véronique Blanquet, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), and Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: 0301 basic medicine, Protein family, GASP1, [SDV]Life Sciences [q-bio], Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Immunology, GASP2, Myostatin, SMAD, Bone morphogenetic protein, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 03 medical and health sciences, Protein Domains, Transforming Growth Factor beta, WFIKKN, Animals, Humans, Immunology and Allergy, WFIKKNRP, Genetics, biology, Proteins, Transforming growth factor beta, 030104 developmental biology, GDF11, biology.protein, Intercellular Signaling Peptides and Proteins, Kunitz domain, Carrier Proteins, myostatin inhibitors, Follistatin
Abstract: The WFIKKN (WAP, Follistatin/kazal, Immunoglobulin, Kunitz and Netrin domain-containing) protein family is composed of two multidomain proteins: WFIKKN1 and WFIKKN2. They were formed by domain shuffling and are likely present in deuterostoms. The WFIKKN (also called GASP) proteins are well known for their function in muscle and skeletal tissues, namely, inhibition of certain members of the transforming growth factor beta (TGFB) superfamily such as myostatin (MSTN) and growth and differentiation factor 11 (GDF11). However, the role of the WFIKKN proteins in other tissues is still poorly understood in spite of evidence suggesting possible action in the inner ear, brain and reproduction. Further, several recent studies based on next generation technologies revealed differential expression of WFIKKN1 and WFIKKN2 in various tissues suggesting that their function is not limited to MSTN and GDF11 inhibition in musculoskeletal tissue. In this review, we summarize current knowledge about the WFIKKN proteins and propose that they are “companion” proteins for various growth factors by providing localized and sustained presentation of TGFB proteins to their respective receptors, thus regulating the balance between the activation of Smad and non-Smad pathways by TGFB.
Published: 2016

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