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The ChEReef 2022 cruise contributes to the European projects Marha and iAtlantic and the ANR project ARDECO. Its overall objective is to better understand the role of geomorphological, hydrodynamic, sedimentary and anthropic factors in the distribution and health of reef habitats in a canyon of the Bay of Biscay, by answering four main questions: 1. What is the role of the heterogeneity of the geomorphological structures of a canyon in the distribution and diversity of benthic habitats? 2. How does a canyon influence local hydrodynamics and what are the consequences for the nature, distribution and dynamics of benthic habitats? 3. What are the nature, quantities and dynamics of sedimentary and trophic inputs in a canyon? 4. What are the main natural and anthropogenic drivers of the realized niche of reef-buidlinging coral species? To tackle these questions, the cruise includes : - ROV Victor dives dedicated to annual maintenance of the MARLEY benthic observation platform; - ROV Victor dives dedicated to sampling reef-building coral colonies, their associated fauna, substrates and surrounding water, in order to characterize biodiversity and assess the physiological state of corals, including their microbiome; - ROV Victor dives dedicated to photo and video acquisition, including with a hyperspectral camera, to map coral habitats, measure their extent and assess their state of health; - ROV Victor dives dedicated to the deployment of experimental devices to assess growth rates, larval recruitment and colonization rates; - ROV Victor dives dedicated to canyon exploration, to continue mapping benthic habitats within the canyon; - Grab coring to characterize sedimentary facies in the canyon; - Zooplankton sampling in the water column to sample larvae of benthic organisms; - Recovery of three mooring lines, each equipped with a particle trap, an ADCP and a turbidimeter, then redeployment of two of them, in order to characterize currents and particle flows in the canyon, La campagne ChEReef 2022 contribue aux projets européens Marha et iAtlantic et au projet ANR ARDECO. L’objectif est de mieux comprendre le rôle des facteurs géomorphologiques, hydrodynamiques, sédimentaires et anthropiques dans la distribution des habitats récifs d’un canyon du golfe de Gascogne, en répondant à quatre grandes questions : - Quel est le rôle de l’hétérogénéité des structures géomorphologiques d’un canyon dans la distribution et la diversité des habitats benthiques ? - Comment un canyon influence-t’il l’hydrodynamisme local et quelles en sont les conséquences sur la nature, la distribution et la dynamique des habitats benthiques ? - Quelles sont la nature, les quantités et la dynamique des apports sédimentaires et trophiques dans un canyon ? - Quels sont les taux de croissance et les conditions optimales de croissance des espèces de coraux récifaux ? Pour répondre à ces questions, le programme de la campagne inclue: - Des plongées du ROV Victor dédiées à la maintenance annuelle de la plateforme d’observations benthiques MARLEY ; - Des plongées du ROV Victor dédiées à l’échantillonnage des colonies de coraux récifaux, leurs faunes associées, les substrats et l’eau environnante, afin de caractériser la biodiversité et d’évaluer l’état physiologique des coraux récifaux, y compris leur microbiome ; - Des plongées du ROV Victor dédiées à l’acquisition de photos et de vidéos, y compris avec une caméra hyperspectrale afin de cartographier les habitats coralliens, mesurer leur étendue et évaluer leur état de santé ; - Des plongées du ROV Victor dédiées au déploiement de dispositifs expérimentaux afin d’évaluer les taux de croissance, de recrutement larvaire et de colonisation des coraux récifaux ; - Des plongées du ROV Victor dédiées à l’exploration du canyon afin de poursuivre la cartographie des habitats benthiques du canyon ; - Des carottages bennes afin de caractériser les faciès sédimentaires dans le canyon ; - Des profils de mesures et de prélèvements d

Dans le contexte de la Directive Habitats, Faune, Flore, le projet européen Life Intégré Marha a pour objectif d'évaluer et d'améliorer l’état de conservation des habitats naturels marins. L'Ifremer, bénéficiaire associé à ce projet, a développé le projet ChEReef qui s'attelle à l'évaluation de l'état de santé des coraux profonds dans le canyon sous-marin de Lampaul (Golfe de Gascogne). La méthodologie développée pour les habitats de coraux profonds cherche à répondre au double objectif d’évaluation du bon état de conservation (Directive Habitat Faune Flore) et d’évaluation du bon état écologique (Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin). Les deux directives partagent des points communs dans leurs critères et leurs démarches. En particulier, les évaluations cherchent à caractériser le couple état‐pression suivant trois approches : 1. Décrire et cartographier les habitats, 2. Caractériser et cartographier les pressions, 3. Etablir les conséquences des pressions sur les structures et fonctions des habitats. Les deux premières approches s’appuient sur un suivi surfacique, tandis que la troisième requiert un suivi stationnel. Ce suivi stationnel répond au besoin d’acquérir des données sur la biologie des espèces structurantes, la diversité des espèces accompagnatrices, et les processus écologiques forçant la dynamique des espèces et habitats. Les cycles d’évaluation de la DHFF et de la DCSMM ont une période de 6 ans. En environnement profond cependant, la périodicité, l’amplitude et les causes de variations naturelles des populations et des communautés sont très peu contraintes. Il est donc important de caractériser et comprendre les dynamiques naturelles des habitats profonds à différentes échelles spatio‐temporelles afin d’élaborer des indicateurs et proposer des seuils de bon état de conservation et de bon état écologique. C’est une des finalités des six campagnes océanographiques hauturières ChEReef obtenues auprès de la Flotte océanographique Française. Ces

Dans le contexte de la Directive Habitats, Faune, Flore, le projet européen Life Intégré Marha a pour objectif d'évaluer et d'améliorer l’état de conservation des habitats naturels marins. L'Ifremer, bénéficiaire associé à ce projet, a développé le projet ChEReef qui s'attelle à l'évaluation de l'état de santé des coraux profonds dans le canyon sous-marin de Lampaul (Golfe de Gascogne). La méthodologie développée pour les habitats de coraux profonds cherche à répondre au double objectif d’évaluation du bon état de conservation (Directive Habitat Faune Flore) et d’évaluation du bon état écologique (Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin). Les deux directives partagent des points communs dans leurs critères et leurs démarches. En particulier, les évaluations cherchent à caractériser le couple état‐pression suivant trois approches : 1. Décrire et cartographier les habitats, 2. Caractériser et cartographier les pressions, 3. Etablir les conséquences des pressions sur les structures et fonctions des habitats. Les deux premières approches s’appuient sur un suivi surfacique, tandis que la troisième requiert un suivi stationnel. Ce suivi stationnel répond au besoin d’acquérir des données sur la biologie des espèces structurantes, la diversité des espèces accompagnatrices, et les processus écologiques forçant la dynamique des espèces et habitats. Les cycles d’évaluation de la DHFF et de la DCSMM ont une période de 6 ans. En environnement profond cependant, la périodicité, l’amplitude et les causes de variations naturelles des populations et des communautés sont très peu contraintes. Il est donc important de caractériser et comprendre les dynamiques naturelles des habitats profonds à différentes échelles spatio‐temporelles afin d’élaborer des indicateurs et proposer des seuils de bon état de conservation et de bon état écologique. C’est une des finalités des six campagnes océanographiques hauturières ChEReef obtenues auprès de la Flotte océanographique Française. Ces

Océanopolis, centre de Culture Scientifique et Technique localisé à Brest, dédie un espace d’exposition aux environments profonds (https://www.oceanopolis.com/). En particulier, il sera partie prenante de la thématique “mediation scientifique” du projet ANR ARDECO (Assessing Resilience of DEep COrals ) du laboratoire Ifremer EP. A ce titre il prévoit de realiser des activités autours des coraux d’eaux froides, dont la projection de sequences vidéos enregistrées par les robots sous-marins dans différents canyons, aussi bien atlantiques que méditerranéens. Pour répondre à ce besoin, des séquences vidéo des campagnes VIDEOCOR_2017 et CALADU_2021 sont mises à disposition.

Carbon and silicon cycles at the Earth surface are linked to long-term variations of atmospheric CO2 and oceanic primary production. In these cycles, the river-sea interface is considered a biogeochemical hotspot, and deltas presently receive and preserve a major fraction of riverine particles in shallow water sediments. In contrast, periods of glacial maximum lowstand were characterized by massive exports of sediments to the deep-sea via submarine canyons and accumulation in deep-sea fans. Here, we calculate present-day mass balances for organic carbon (OC) and amorphous silica (aSi) in the terminal lobe complex of the Congo River deep-sea fan as an analogue for glacial periods. We show that this lobe complex constitutes a megasink with the current accumulation of 18 and 35% of the OC and aSi river input, respectively. This increases the estimates of organic carbon burial by 19% in the South Atlantic Ocean in a zone representing less than 0.01% of the basin. These megasinks might have played a role in carbon trapping in oceanic sediments during glacial times.

This study characterizes the habitats and megafaunal community of the Congo distal lobe complex driven by turbidity currents through the use of remotely operated vehicle (ROV) still imagery transects covering distances in the order of kilometers. In this sedimentary, abyssal area about 5000 m deep and 750 km offshore from western Africa, large quantities of deposited organic material supplied by the Congo River canyon and channel support aggregations of large sized foraminifers (Bathysiphon sp.) and vesicomyid clams (Christineconcha regab, Abyssogena southwardae) often associated with methane cold seeps, as well as opportunistic deep-sea scavengers. Additionally, bacterial mats, assumed to be formed by large sulfur-oxidizing filamentous bacteria (Beggiatoa type), and black patches of presumably reduced sediment were seen which are, together with sulfur-oxidizing symbiont- bearing vesicomyids, indicators of sulfide-rich sediments. Habitat and faunal distribution were analyzed in relation to the microtopography obtained with the ROV multibeam echosounder, at three sites from the entrance of the lobe complex where the channel is still deep, to the main, flatter area of turbidite deposition. Specific characteristics of the system influence animal distributions: both the forams and the vesicomyid clams tended to avoid the channels characterized by high-speed currents, and are therefore preferentially located along channel flanks affected by sliding, and on levees formed by channel overspill. Foram fields are found in flat areas and form large fields, whereas the vesicomyids have a patchy distribution and appear to show a preference for regions of local topographical relief such as slide scars or collapsed blocks of sediments, which likely facilitate sulfide exhumation. The colonization of sulfide rich sediments by vesicomyids is limited, but nonetheless was seen to occur in the main deposition area where they have to cope with very high sedimentation rates (up to 20 cm/y

The presently active region of the Congo deep-sea fan (around 330 000 km2), called the terminal lobes or lobe complex, covers an area of 2500 km2 at 4700–5100 m water depth and 750–800 km offshore. It is a unique sedimentary area in the world ocean fed by a submarine canyon and a channel-levee system which presently deliver large amounts of organic carbon originating from the Congo River by turbidity currents. This particularity is due to the deep incision of the shelf by the Congo canyon, up to 30 km into the estuary, which funnels the Congo River sediments into the deep-sea. The connection between the river and the canyon is unique for major world rivers. In 2011, two cruises (WACS leg 2 and Congolobe) were conducted to simultaneously investigate the geology, organic and inorganic geochemistry, and micro- and macro-biology of the terminal lobes of the Congo deep-sea fan. Using this multidisciplinary approach, the morpho-sedimentary features of the lobes were characterized along with the origin and reactivity of organic matter, the recycling and burial of biogenic compounds, the diversity and function of bacterial and archaeal communities within the sediment, and the biodiversity and functioning of the faunal assemblages on the seafloor. Six different sites were selected for this study: Four distributed along the active channel from the lobe complex entrance to the outer rim of the sediment deposition zone, and two positioned cross-axis and at increasing distance from the active channel, thus providing a gradient in turbidite particle delivery and sediment age. This paper aims to provide the general context of this multidisciplinary study. It describes the general features of the site and the overall sampling strategy and provides the initial habitat observations to guide the other in-depth investigations presented in this special issue. Detailed bathymetry of each sampling site using 0.1 m to 1 m resolution multibeam obtained with a remotely operated vehicle (ROV)

Ce document est une traduction française que l’on espère transcrire au mieux les descriptions d’habitats de la classification EUNIS. Il vient compléter la traduction en français des habitats terrestres et d’eau douce réalisée par le MNHN‐SPN (Louvel et al., 2013). Il a pour objectif de faciliter l’appropriation de cette typologie par les acteurs concernés (scientifiques, gestionnaires ou bureaux d’études) et favoriser les échanges de connaissance sur la biodiversité des habitats benthiques en cohérence avec ce standard. Il s’agit dans ce document du dictionnaire de la typologie EUNIS dans sa version 2007, revue en 2012 pour des modifications des codes de la classification paléarctique et ceux de la classification des habitats marins de la Grande Bretagne. A noter que cette description reste identique pour les habitats communs à la version 2004, largement utilisée comme typologie de référence, notamment pour la cartographie d’habitats dans le cadre du Rebent. L’annexe 8.1 liste les modifications des codes et libellés par rapport à cette version. Seuls les habitats benthiques présents ou potentiellement présents en France ont été traduits. La présence en France a été déterminée par consultation des experts du domaine ainsi que des documents de référence (référentiel national, descriptifs EUNIS, Barcelone, Cartes historiques, …).

Ce document est une traduction française que l’on espère transcrire au mieux les descriptions d’habitats de la classification EUNIS. Il vient compléter la traduction en français des habitats terrestres et d’eau douce réalisée par le MNHN‐SPN (Louvel et al., 2013). Il a pour objectif de faciliter l’appropriation de cette typologie par les acteurs concernés (scientifiques, gestionnaires ou bureaux d’études) et favoriser les échanges de connaissance sur la biodiversité des habitats benthiques en cohérence avec ce standard. Il s’agit dans ce document du dictionnaire de la typologie EUNIS dans sa version 2007, revue en 2012 pour des modifications des codes de la classification paléarctique et ceux de la classification des habitats marins de la Grande Bretagne. A noter que cette description reste identique pour les habitats communs à la version 2004, largement utilisée comme typologie de référence, notamment pour la cartographie d’habitats dans le cadre du Rebent. L’annexe 8.1 liste les modifications des codes et libellés par rapport à cette version. Seuls les habitats benthiques présents ou potentiellement présents en France ont été traduits. La présence en France a été déterminée par consultation des experts du domaine ainsi que des documents de référence (référentiel national, descriptifs EUNIS, Barcelone, Cartes historiques, …).

Le présent document constitue le rapport d’une expertise scientifique collective confiée par le ministère de l’Écologie, du Développement durable et de l’Énergie (CGDD – direction de la recherche et de l’innovation) et le ministère de l’Éducation nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (direction générale de la recherche et de l’innovation) au CNRS et à l’Ifremer. Le rapport d’expertise et sa synthèse ont été élaborés par les experts scientifiques sous la responsabilité du CNRS et l’Ifremer. Ces documents sont disponibles sur les sites web institutionnels du CNRS et de l’Ifremer.