Search

Patates kist nematodları (PKN) Altın kist nematodu olarak isimlendirilen Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 ve Beyaz kist nematodu olarak isimlendirilen G. pallida Stone, 1973, tüm dünyada hemen hemen tüm patates alanlarında önemli verim kayıplarına neden olan yaygın türlerdir. Önemli karantina etmenleri olan PKN’nın doğru ve hızlı teşhisi mücadelesi açısından çok önemlidir. Bu iki türün oluşturduğu risk nedeniyle, Türkiye'de bu etmenlerin varlığı sertifikalı ve yemeklik patates alanlarında ulusal survey programı kapsamında taranmaktadır. Çalışma kapsamında Niğde, Nevşehir, İzmir, Afyon ve Bolu illerine ait 10 farklı lokasyondan elde edilen PKN popülasyonlarına ait kist ve ikinci dönem larvalar morfolojik ve morfometrik karakterlerine göre teşhis edilmiştir. Çalışma İzmir ili hariç diğer illerdeki G. rostochiensis popülasyonlarının ilk detaylı morfolojik ve morfometrik verilerini içermektedir. Çalışma sonucunda popülasyonların tamamı G. rostochiensis olarak teşhis edilmiştir. Türkiye’deki bulaşık alanların tamamını kapsayacak şekilde ilk kez yapılan bu çalışmayla ülkemizdeki G. rostochiensis popülasyonlarının morfolojik olarak teşhisinin yapılabildiği, ölçüm değerlerinin referans literatürlerle uyumlu olduğu belirlenmiştir. Ancak rutin analizlerde tüm dünyada en önemli karantina etmenlerinden biri olan Patates kist nematodlarının teşhisinde morfolojik ve moleküler yöntemlerinin bir arada kullanılmasının daha doğru olacağı düşünülmektedir., Potato cyst nematodes (PCN) Golden cyst nematode, Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 and Pale cyst nematode, G. pallida Stone, 1973, are sibling species that cause significant yield losses in potatoes almost all over the world. The accurate and rapid diagnosis of PCN, which are important quarantine pests, is very important for management program. Due to the risks posed by these two species, national survey program is implementing in certificate and table potato producing areas in term of the presence of PCN in Turkey. Within the scope of the study, cysts and second-stage larvae of PCN populations obtained from 10 different locations belonging to Niğde, Nevşehir, İzmir, Afyon, and Bolu provinces were identified according to their morphological and morphometric characters. The study includes the first detailed morphological and morphometric data of G. rostochiensis populations in other provinces except İzmir. As a result of the study, all populations were identified as G. rostochiensis. The results of this study conducted for the first time to cover all of the areas infested with PCN in Turkey were show that measurements values is consistent with literature references and G. rostochiensis populations of our country can be identified morphologically. However, it is thought that it would be more accurate to use morphological and molecular methods together in the diagnosis of PCN, which is one of the most important quarantine pest in routine analysis.

The Mediterranean cereal cyst nematode, Heterodera latipons, is an important plant parasitic nematode that negatively impacts cereal production worldwide, particularly in the Mediterranean Basin. Successful control of cereal cyst nematodes requires knowledge of the nematode species/pathotypes and their biology. However, little information is currently available concerning the phenotypic and genotypic variability of H. latipons populations in Turkey. This study analyzed the morphological/morphometric and genetic characteristics of Turkish H. latipons populations to define intraspecific distinctions between them. Morphological and morphometric studies focused on the pattern of the perineal region of cysts and second stage juveniles (J2), while the molecular analyses used sequenced ITS-rDNA regions targeting the internal transcribed spacer (ITS) region of rDNA. The data from these investigations demonstrate that nematode populations from Adana and Hatay provinces differ from the populations collected in Kilis, Gaziantep, and Mardin provinces. These phenotypic and genotypic differences between H. latipons populations may indicate that they are heterogenic, with at least two pathotypes. To date, this study is the most comprehensive analysis identifying H. latipons populations in major wheat-producing areas of Turkey.

WOS: 000369882800001, Root-lesion nematodes (RLN; Pratylenchus thornei and Pratylenchus neglectus) are serious plant parasitic nematodes that attack wheat roots and cause significant losses in grain quality and quantity worldwide. They are widely distributed in Turkish wheat growing areas and can be only controlled by growing resistant cultivars and non host crops. So far, there is no commercial wheat cultivar identified as completely resistant to the RLN is available. The objective of this research was to evaluate some Turkish wild Emmers (Triticum dicoccoides) and national spring wheat varieties for resistant to P. thornei and P. neglectus. In the experiments, 32 wild Emmers and 42 wheat cultivars were inoculated with P. thornei or P. neglectus individuals and grown under controlled conditions in a growth room for 9 weeks. The results showed that 25 and 35 wheat varieties were moderately resistant to P. thornei and P. neglectus, respectively. In total, 17 lines exhibiting multiple resistance reactions to both nematodes were in the same group with the check lines (P, Tubitak Project [112 O 565], This publication was supported by Tubitak Project number 112 O 565. The authors thank Prof. Dr. Hakan Ozkan (University of Cukurova) for selecting and supplying the Emmer wheats and Turkish varieties used in the study.

Kök-ur nematodları geniş bir konukçu dizisine sahip olup önemli kültür bitkilerinde ağır verim kayıplarına neden olmaktadır. Türkiye’de nematodlar ile mücadelede nematisit kullanımına önemli kısıtlamalar getirilmekte bunun yanında mücadelede yeni metotlar ortaya konması gerekmektedir. Bu yüzden biber seralarında Kök-ur nematodları ile mücadelede alternatif mücadele programlarının geliştirilmesi büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada toprak solarizasyonu ile birlikte iki farklı kimyasal ve toprak fumigantının iki ve dört hat şeklinde damla sulama sistemi ile kombine edilerek nematodlarla ile mücadele programlarında kullanılabilirliği araştırılmıştır. Çalışmada solarizasyon + metam sodyum + iprodione uygulaması, dört lateral hatlı damla sulama sisteminde verime ve nematodun kökteki urlanması üzerine etkili bulunmuştur. Bitki boyu ve nematodun üreme gücüne solarizasyon + iprodione uygulamasının dört lateral hatlı damla sulama sisteminde en yüksek etkiye sahip olduğu saptanmıştır., Root-knot nematodes possess a wide group of hosts and cause significant yield losses in many economically important plant species. Restrictions on the use of nematicides in Turkey have increased; hence it is needed to discover new control methods for managing Root-knot nematodes. Therefore, establishing alternative control programme to combat root-knot nematodes in pepper greenhouse in Turkey remarkably is significant. In this study, soil solarization with two diverse chemicals and soil fumigants combined with two and four drip irrigation pipe in both side of systems for using availability against nematode was investigated. Solarization + metham sodium + iprodione application with four lateral drip irrigation pipes in both side of system were found to be effective on yield and nematode galls on the roots. Solarization + iprodione with four drip irrigation pipe in both sides of systems were found to have the highest impact on plant height and nematode reproduction rate.

WOS: 000338176400035, Grapevines is host for many plant parasitic nematode species and virus transmission species. Surveys were undertaken in 15 vineyards in Turkey. Samples were taken from each vineyard older than 10 years, from depth of 0-30 cm and 30-60 cm. Totally 300 subsamples were examined. In this study, 22 species were identified belonging to 16 genus within Tylenchida, Aphelenchida, Dorylaimida and Triplonchida orders from soil and root samples of vine (Vitis vinifera L.) in the Central Anatolia Region (Nevsehir, Karaman, Konya, Isparta and Burdur provinces). Malenchus fusiformis, Aphelenchoides clarus, A. confusus, Rotylenchus (R.) colbrani, Xiphinema diversicaudatum and Trichodorus similis were found for the first time in Turkey. The species most frequently encountered were X pachtaicum and Helicotylenchus crenacauda., General Directorate of Agricultural Research and Policies (GDAR), Food, Agriculture and Livestock Ministry [TAGEM/BS/96/06/09/502], This study is part of a research project "The vineyards of Central Anatolia Region Integrated Pest Management Research, Practice and Training Project" TAGEM/BS/96/06/09/502, supported by the General Directorate of Agricultural Research and Policies (GDAR), Food, Agriculture and Livestock Ministry.

Root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) are among some of the most economically important plant parasitic nematodes in the world. It is known that the nematode belong to Meloidogyne genus causes significantly crop losses in vegetables and cereals. The root-knot nematodes, M. artiellia causes damages especially cereals, legumes and cruciferous crops. Isolates of M. artiellia recovered from root and soil samples collected from wheat fields in 2012 growing season were firstly identified by using morphological and molecular aspects in Hatay province of Turkey. M. artiellia was morphologically identified by using morphological features and allometric criteria of second stage juvenile and female. Also, it was molecularly identified by using the sequences of partial mitochondrial DNA cytochrome C oxidase subunit (COI) gene region andclearly separated from other species, Kök-ur nematodları (Meloidogyne spp.) dünyada ekonomik önem sahip bitki paraziti nematodları arasındadır. Meloidogyne cinsine ait nematod türleri sebzelerde ve tahıllarda önemli oranda ürün kayıplarına neden oldukları bilinmektedir. Kök ur nematodu, M. artiellia özellikle tahıllar, baklagiller ve cruciferae familyasına ait ürünlerde zarara neden olabilmektedir. Bu çalışmadaki M. artiellia izolatları Türkiye’de ilk defa Hatay ili buğday ekim alanlarından 2012 yılı üretim sezonunda toplanan toprak ve kök örneklerinden elde edilmiş olup morfolojik ve moleküler olarak tanımlamaları yapılmıştır. M. artiellia, ikinci dönem larva ve dişi bireylere ait morfolojik özellikler ve allometrik kriterler esas alınarak tanımlanmıştır. Ayrıca, mitokondriyal DNA’nın sitokrom C oksidaz alt ünitesine (COI) ait nükleotid dizilimleri kullanılarak moleküler olarak da tanımlanmış ve diğer kök ur nematodu türlerinden bariz olarak ayrıldığı saptanmıştır

WOS: 000394922000005, PubMed ID: 28163585, To identify loci linked to nematode resistance genes, a total of 126 of CIMMYT advanced spring wheat lines adapted to semi-arid conditions were screened for resistance to Heterodera avenae, Pratylenchus neglectus, and P. thornei, of which 107 lines were genotyped with 1,310 DArT. Association of DArT markers with nematode response was analyzed using the general linear model. Results showed that 11 markers were associated with resistance to H. avenae (pathotype Ha21), 25 markers with resistance to P. neglectus, and 9 significant markers were identified to be linked with resistance to P thornei. In this work we confirmed that chromosome 4A (similar to 90-105 cM) can be a source of resistance to P. thornei as has been recently reported. Other significant markers were also identified on chromosomal regions where no resistant genes have been reported for both nematodes species. These novel QTL were mapped to chromosomes 5A, 6A, and 7A for H. avenae; on chromosomes 1A, 1B, 3A, 3B, 6B, 7AS, and 7D for P. neglectus; and on chromosomes 1D, 2A, and 5B for P. thornei and represent potentially new loci linked to resistance that may be useful for selecting parents and deploying resistance into elite germplasm adapted to regions where nematodes are causing problem., Grains Research & Development Corporation (GRDC); Turkish Ministry of Food Agriculture and Livestock, The authors would like to thank the Grains Research & Development Corporation (GRDC) for its financial support of this study. Thanks also go to CIMMYT's spring wheat breeding program in Mexico for providing the wheat germ plasm. Special thanks also go to the Turkish Ministry of Food Agriculture and Livestock for their support. Editing assistance from E. Quilligan is appreciated.

Root-lesion nematodes (RLN; Pratylenchus thornei and Pratylenchus neglectus) are serious plant parasitic nematodes that attack wheat roots and cause significant losses in grain quality and quantity worldwide. They are widely distributed in Turkish wheat growing areas and can be only controlled by growing resistant cultivars and non-host crops. There is no commercial available a wheat cultivar identified as completely resistant to RLN, so that, the breeding programs contain moderately resistant parents to incorporate this trait in high yielding adapted wheat germplasm. The objective of this research was to evaluate some Turkish wild Emmers (Triticum dicoccoides) and national spring wheat varieties for resistant to P. thornei and P. neglectus. In the experiments, 32 wild Emmers and 42 wheat cultivars were inoculated with P. thornei or P. neglectus individuals and grown under controlled conditions in a growth room for 9 weeks. The results showed that 25 and 35 wheat varieties were moderately resistant to P. thornei and P. neglectus, respectively. In total, 17 lines exhibiting multiple resistance reactions to both nematodes were in the same group with the check lines (P, Kök lezyon nematodları (RLN; Pratylenchus thornei ve P. neglectus) buğday köklerine saldırarak, tahıl kalitesi ve miktarında küresel olarak önemli kayıplara neden olan önemli bir bitki paraziti nematod gurubudur. Türkiye’de buğday ekiliş alanlarında yaygın olarak bulunan bu nematodlarla ancak dayanıklı çeşitler ve rotasyonla mücadele etmek mümkündür. Maalesef bugüne kadar bu nematod gurubuna karşı tamamen dayanıklı olarak tanımlanan hiçbir ticari buğday çeşidi bulunamamıştır. Bu nedenle, buğday ıslah programlarında yüksek verimli ve kaliteli buğday çeşitlerine orta derecede (kısmi) dayanıklı ebeveynler kullanılarak dayanıklılık entegre edilmeye çalışılmıştır. Bu araştırmanın amacı bazı Türk yabani Emmer’lerinin (Triticum dicoccoides) ve bazı ulusal yazlık buğday çeşitlerinin P. thornei ve P. neglectus’a karşı dayanıklılık durumlarını ortaya koymaktır. Bu amaçla her iki nematoda karşı yapılan iki farklı denemede, 32 yabani Emmer buğdayı ve 42 buğday çeşidinin, P. thornei veya P. neglectus bireylerine karşı dayanıklıkları 9 hafta boyunca kontrollü koşullar altında testlenmiştir. Sonuç olarak, P. thornei ve P. neglectus’a karşı sırasıyla 25 ve 35 buğday çeşidinin orta derecede dayanıklılık reaksiyonu sağladığı belirlenmiştir. Toplamda 17 çeşit her iki nematoda karşı dayanıklılık göstermiştir (p

Kök-ur nematodları geniş bir konukçu dizisine sahip olup önemli kültür bitkilerinde ağır verim kayıplarına neden olmaktadır. Türkiye’de nematodlar ile mücadelede nematisit kullanımına önemli kısıtlamalar getirilmekte bunun yanında mücadelede yeni metotlar ortaya konması gerekmektedir. Bu yüzden biber seralarında Kök-ur nematodları ile mücadelede alternatif mücadele programlarının geliştirilmesi büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada toprak solarizasyonu ile birlikte iki farklı kimyasal ve toprak fumigantının iki ve dört hat şeklinde damla sulama sistemi ile kombine edilerek nematodlarla ile mücadele programlarında kullanılabilirliği araştırılmıştır. Çalışmada solarizasyon + metam sodyum + iprodione uygulaması, dört lateral hatlı damla sulama sisteminde verime ve nematodun kökteki urlanması üzerine etkili bulunmuştur. Bitki boyu ve nematodun üreme gücüne solarizasyon + iprodione uygulamasının dört lateral hatlı damla sulama sisteminde en yüksek etkiye sahip olduğu saptanmıştır., Root-knot nematodes possess a wide group of hosts and cause significant yield losses in many economically important plant species. Restrictions on the use of nematicides in Turkey have increased; hence it is needed to discover new control methods for managing Root-knot nematodes. Therefore, establishing alternative control programme to combat

The second stage juveniles (J2) of Root-knot nematode infect plant roots and feed on the inside roots as obligate parasites. After hatching, in case of inability to find plant roots, they die within a limited period. It is important to know the viability of second stage juveniles without feeding regarding their pathogenicity. In this study, the survivability of the second stage juveniles of root knot nematodes without feeding and the effect of different applications on hatching were investigated. In the first part of the study, the survival rate of Meloidogyne incognita and M. hapla second stage juveniles without feeding was determined. The survivability of M. incognita and M. hapla juveniles at differing time periods were determined by counting under the microscope. Juveniles were placed in a cold room in order to determine survival rate for 108 days at +4°C. The 50% of M. hapla lived until 71th day and 6,5% lived until 101st day in the cold room conditions. M. hapla juveniles entirely died on 108th day. The longest survivability of M. incognita juveniles was found on 66th day. In the second part of the study, the effect of tap water, hydrogen peroxide (H2O2) 3 different (1%, 2%, 3%) doses with 5 different temperatures (room temperature 16-22°C, 20°C, 25°C, 30°C, 35°C) applications were investigated on M. incognita egg mass hatching in laboratory conditions. The highest hatching rate was found from tap water at 30°C application and the least number of larvae hatching was determined on H2O2 applications., Kültür bitkilerinin obligat parazitleri olan Kök-ur nematodlarının yumurtalarından ikinci dönem larvaları (J2) çıktıktan sonra konukçu bitki kökü bulamayanlar belirli bir süre sonunda ölmektedirler. Yumurtadan çıkan larvaların beslenme olmaksızın yaşam sürelerinin bilinmesi nematodun patojenitesi açısından önem arzetmektedir. Bu çalışmada, kök-ur nematodu ikinci dönem larvalarının beslenme olmaksızın canlılıklarını sürdürmesi ve yumurtadan çıkışlarına farklı uygulamaların etkileri araştırılmıştır. Çalışmanın ilk aşamasında Meloidogyne incognita ve M. hapla türlerine ait larvaların beslenme olmaksızın yaşam sürelerini ortaya çıkarılmıştır. M. incognita ve M. hapla ikinci dönem larvalarının canlılık oranı mikroskop altında sayım yapılarak belirlenmiştir. Yaşam süresinin belirlenmesi amacıyla elde edilen nematodlar 108 gün süresince +4°C bekletilmiştir. Bu çalışmada, M. hapla 50. güne kadar %71’e yakın oranda canlılığını korumuş olup %6,5’i 101. güne kadar canlılığını koruyabilmiştir. M. hapla larvaları 108’inci günde tamamen ölmüştür. M. incognita’nın en uzun hayatta kalma süresi 66. güne kadar tespit edilmiştir. Çalışmanın ikinci aşamasında, M. incognita’nın yumurtalarından larva çıkışına laboratuvar koşullarında, çeşme suyu ve Hidrojen peroksit (H2O2)’in 3 farklı (%1, %2, %3) dozunun 5 farklı sıcaklıktaki (oda sıcaklığı 16-22°C, 20°C, 25°C, 30°C, 35°C) etkileri araştırılmıştır. En yüksek yumurtadan larva çıkışı 30°C çeşme suyu uygulamasından ve en düşük larva sayısı ise H2O2 uygulamalarından saptanmıştır.

Cereal cyst nematodes (CCNs) are plant parasites that significantly limit global cereal production. The most frequently reported pathogenic species are Heterodera avenae, H. filipjevi, and H. latipons. One of the most cost-effective, environmentally friendly, and easily adopted control measures is the use of genetic host resistance, which maintains nematode populations below the economic damage threshold level. Many effective sources of resistance to CCNs have been identified in cereals; however, their effectiveness and usefulness is dependent on the interaction of the specific putative resistant accession and the CCN pathotype found in a specific region. In this study, 719 wheat lines from the Facultative and Winter Wheat Observation Nurseries, representing a broad geographical spectrum of breeding lines and varieties from Europe, Central Asia, and the International Winter Wheat Improvement Program, were screened against H. filipjevi under controlled conditions. The results indicated that 114 and 90 genotypes were ranked resistant and moderately resistant, representing 15.8% and 12.5% of the screened genotypes, respectively. The frequency of resistant genotypes observed in the germplasms varied significantly among the different original countries and was the highest for genotypes that originated from Bulgaria (59.3%). From those phenotyped germplasms, a set of 289 lines was genotyped to understand if resistance sources are located at the same site or originate from different locations in the genome.

Bu çalışmada, Tahıl kist nematodu, Heterodera avenae’nin Wollenweber yumurtalarının inkübasyonu üzerine sıcaklığın etkisi ile in-vitro koşullarda en uygun deneme test materyallerinin (toprak tipi, inokülasyon oranı ve inokülasyon zamanı) belirlenmesi araştırılmıştır. Sıcaklılığın H. avenae yumurtalarının inkübasyonu üzerine etkisinin araştırıldığı çalışma iki farklı inkübasyon süresinde gerçekleştirilmiş olup, birinci aşamada 4 ºC‘de 66 gün inkübe edilen kistler ikinci aşamada farklı sıcaklıklara (5, 10, 15, 20 and 25 ºC) transfer edilmiştir. Çalışma sonucunda her bir sıcaklık için toplam yüzde larva çıkış oranı hesaplanmış ve 252 günlük inkübasyon süresinde sıcaklığın larva çıkış oranını önemli derece etkilediği görülmüştür. Düşük sıcaklıklardaki (5,15 ve 10 ºC) larva çıkış oranı %46.7, %82.3. ve %45.9 ile yüksek sıcaklıklardaki (20 ve 25 ºC) larva çıkış oranına %30.7 ve %19.0 göre daha yüksek bulunmuştur. En yüksek larva çıkış oranı %82.3 ile 10 ºC’de, en düşük larva çıkış oranı %19.0 ile 25 ºC’de gerçekleşmiştir. İn-vitro koşullarda H.avenae ile yürütülecek denemelerde, yetiştirme ortamı olarak kumlu toprak tipinin (% 29 tarla toprağı, % 70 kum: % 1: organik madde) tercih edilmesi, nematodun bitkiye inokülasyonunun dikimin 1. gününde, inokülasyon yoğunluğunun ise 2,5 adet ikinci dönem larva/gram toprak olacak şekilde yapılması önerilmektedir

Türkiye’de buğday ıslah programlarında Tahıl kist nematodları, Heterodera filipjevi (Madzhidov) Stelter, H. avenae (Wollenweber) ve Kök lezyon nematodlarına (Pratylenchus thorneiSher & Allen) karşı dayanıklı çeşitlerin geliştirilmesi enstitülerce eşzamanlı olarak yürütülmektedir. Bu çalışmada CIMMYT-Mexico tarafından kullanılan dayanıklılık kaynağı AUS4930 7.2 ve yüksek verimli Pastor ebeveylerinin melezlenmesinden elde edilen 42 (F9) adet melez hattın P. thornei and H. filipjevi karşı reaksiyonlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Denemeye alınan materyallerden 32 hat P. thornei’ ye karşı, 5 hat ise H. filipjevi’ ye karşı dayanıklı bulunmuştur. Her iki nematoda karşı dayanıklı bulunan 4 hattan (2, 7, 23 and 41) sadece 3 tanesinin (2, 7, 41) Cre 1 genini taşıdığı bilinmektedir. Bazı hatlar Cre1 genini taşımasına rağmen her iki nematoda veya nematodlardan bir tanesine kaşı duyarlı bulunmuştur. Elde edilen sonuçlara göre H. filipjevi ve P. thornei ile Cre1 geni dayanıklılıkları arasında buğday genomunda bulunan farklı dayanıklılık bölgelerinden dolayı bir ilişki bulunamamıştır

Turkey is ranked among top ten wheat producing countries in the world. Cereal cyst nematodes are considered one of the most damaging plant parasitic nematodes on wheat worldwide. Up to date, the most effective method of controlling this group of nematodes is the use of crop rotation and resistant varieties. The successful development of disease-resistant plants is contingent on knowledge of the pathotypes of the causal agent. In this study, three populations of Heterodera filipjevi (Madzhidov, 1981) Stelter were collected from different locations (Afsin, Elbistan and Yozgat) in Turkey in order to identify their pathotype using “The International Test Assortment of Cereal Cultivars”. The results showed that two populations gave a similar reaction to the resistant and susceptible varieties. These populations were determined as Ha 33 pathotype which is a new report for Turkey., Türkiye dünya buğday üretiminde ilk on ülke arasında yer almaktadır. Tahıl kist nematodları dünya genelinde buğday yetiştiriciliğinde en zararlı bitki paraziti nematod gruplardan biri olarak bilinmektedir. Bugüne kadar yapılan çalışmalara göre bu nematod gurubu ile en etkin mücadele yöntemi münavebe ve dayanıklı çeşit kullanımıdır. Nematodlara karşı dayanıklı çeşit geliştirmede en önemli unsur hedeflenen alanlardaki nematodların popülasyonlarına ait patotiplerin belirlenmesidir. Bu çalışmada Orta Anadolu Bölgesi’nde buğday alanlarında yaygın bulunan ve önemli zarara neden olan Heterodera filipjevi (Madzhidov, 1981) Stelter’ nin patotipini belirlemek amacıyla üç farklı lokasyondan (Afsin, Elbistan and Yozgat) alınan popülasyonlar “Uluslararası test materyalleri” kullanılarak denemeye alınmıştır. Bu araştırma sonucunda her üç populasyonun H. filipjevi’nin Ha3 gurubu Ha 33 patotipine ait olduğu belirlenmiştir.

The cereal cyst nematodes, Heterodera avenae group, are known as parasites of cereals worldwide. In Turkey, the cereal cyst nematodes, Heterodera filipjevi, H. avenae and H. latipons, are the three known species infested wheat fields and cause high yield losses. The using of resistance varieties is one of the most effective methods for controlling cereal cyst nematodes. Recently, resistance genes (Cre genes) which are obtained from wild wheat genotypes have been transferred into bread wheat varieties to control the cereal cyst nematodes species. In this study, the efficiency of some sources of resistance (CreR, Cre1, Cre2, Cre3, Cre7 and Cre8) in wheat against some Turkish H. avenae, H. filipjevi and H. latipons populations was investigated in-vitro conditions. According to results, the effect of resistance genes showed variation depending on different Cereal cyst nematode populations; H.avenae, H. filipjevi and H. latipons. Although Cre1 gene was only found as completely resistant to all (three) nematode species, Cre3 and Cre7 were found resistant to H. avenae and H. latipons. Cre R was also determined as resistant to H. filipjevi and H. latipons populations but Cre8 was only found resistant against to H. filipjevi population. No resistance was found in Cre 2 gene against to all nematode populations. Additionally, 2 resistance gene-free variety and lines were found resistant to H. avenae; 3 wheat lines to H. filipjevi and 11 wheat genotypes were found moderately resistant to H. latipons., Tahıl kist nematodları, Heterodera avenae group, buğdayın önemli zararlılar arasında yer almaktadır. Türkiye’de buğday alanlarının Tahıl kist nematodları, Heterodera filipjevi, H. avenae ve H. latipons’la bulaşık olduğu bilinmektedir. Dayanıklı çeşit ve hatların Tahıl kist nematodları karşı kullanılması en önemli mücadele yöntemlerinden biridir. Son zamanlarda, Tahıl kist nematodlarına karşı buğdayın yabani formlarından elde edilerek ekmeklik buğday çeşitlerine aktarılmış birçok dayanıklılık (Cre genleri) geni geliştirilmiştir. Bu çalışmada dayanıklılık genlerinin (Cre R, Cre1, Cre2, Cre3, Cre7, Cre8) H.avenae, H. filipjevi ve H. latipons‘un ülkemizdeki bazı popülasyonlara karşı etkinlikleri in-vitro koşullarda araştırılmıştır. Çalışmada sonucunda Tahıl kist nematodları, H.avenae, H. filipjevi ve H. latipons popülasyonlarına göre dayanıklılık genlerinin etkinliklerinin değişiği; bunla birlikte Cre1’in her üç nematod türüne karşı tam bir dayanıklılığa sahip olduğu, Cre3 ve Cre7’nin H. avenae ve H. latipons’a, Cre R’nin H. filipjevi ve H. latipons’a, Cre8’in ise sadece H. filipjevi popülasyonlarına karşı dayanıklı olduğu ve Cre2’nin ise her üç nematod türüne karşı dayanıklılığa sahip olmadığı saptanmıştır. Ayrıca, dayanıklılık geni içermeyen çeşit ve hatlardan H. avenae karşı 2 adet, H. filipjevi karşı 3 adet, H. latipons’a karşı 11 adet buğday genotipi orta dayanıklı bulunmuştur.

The aim of this Euphresco project was to coordinate ongoing and future research in the field of Meloidogyne enterolobii detection and identification and to validate new methods in a collaborative way. It contained six main topics: - Test performance study on nematode extraction methods to detect motile stages (second stage juveniles) of M. enterolobii in soil samples. - Test performance study on fast and simple DNA extraction from target nematode in complex nematode suspension after extraction from soil samples (Lysis buffer; Holterman et al., 2009). DNA needs to be clean enough (without inhibitors) for further by molecular detection/identification tools. Labs were encouraged but not required to use additional extraction methods. The aim was to test a fast and simple DNA extraction protocol that can be harmonized between NPPO laboratories in the future. - Methods development and in-house validation of qPCR methods to detect, identify and potentially quantify M. enterolobii in complex nematode suspensions obtained from soil samples (develop protocols for robust, specific and sensitive detection/identification that can be harmonized between NPPO labs, independent of lab equipment and chemistry). - Test performance study on protocols developed under topic 3. - Final meeting to communicate and discuss results. Optional workshop on Barcoding as new diagnostic tool for fast and reliable nematode identification was offered to interested groups. - Publication of results in peer-reviewed research journals and discussion for inclusion of protocols into EPPO diagnostic standard protocol. Identification of future research priorities in the field of Meloidogyne enterolobii research., Scientific report of the Euphresco funded project 'Development and validation of innovative diagnostic tools for detection and identification of the quarantine nematode Meloidogyne enterolobii in support of integrated plant protection strategies in the EU member states'

WOS: 000317956400014 In this study, the effect of temperatures on the incubation duration of the cereal cyst nematode cysts, Heterodera avenae Wollenweber and determining of the optimum methods and materials was investigated under in-vitro conditions. The effect of tempratures on incubation duration of Heterodera avenae cysts was studied on two different incubation stages. First incubation exposured to all cysts was set up 66 days at 4 degrees C after each samples transfered different temperatures (5, 10, 15, 20 and 25 degrees C). The cumulative hatching percent was significantly effected by different temperatures at the end of 252 days. Hatching was greater at lower temperatures (5, 10 15 degrees C) compared to at higher temperatures of (20, 25 degrees C) ranging between 46.7, 82.3 and 45.9% vs and 30.7 and 19.0%, respectively. Although the highest cumulative hatching of 82.3% was obtained at a constant 10 degrees C at 252 days, the lowest cumulative hatching of 19.0% was obtained to 25 degrees C at 252 days. The most suitable soil type for the in-vitro conditions was found the sandy soil (70% sand: 29% field soil: 1% organic matter), best inoculation rate was 2,5 second stage juveniles per gram soil and inoculation time at planting day.

The root lesion nematode, Pratylenchus thornei (Sher et Allen) is a polyphagous and economically important nematode in wheat production systems, particularly in rainfed environments. Chemical management of this nematode is not economically or environmentally sound, leaving cultural practices like crop rotation as the most widely accepted option. Long-term control is best achieved in established wheat monoculture systems through genetic improvement, which provides both economic and environmental benefits to the growers. Intensive screening under controlled conditions can facilitate and accelerate the identification of resistance and its subsequent deployment in commercial wheat cultivars. In this study, a number of variables were assessed to optimize P. thornei screening, including initial nematode density, soil type, container size, reference cultivars, harvest time and watering regime with perlite. Growth room experiments showed clear separation between the resistant and susceptible cultivars, using sandy growth medium (70:29:1 sand, field soil and organic matter), small container (15 mm diameter x 100 mm in long), inoculation density with 400 individuals per plant, 9 week growing period and bottom perlite irrigation system., Kök yara nematodları, Pratylenchus thornei (Sher et Allen) polifag bir zararlı olup, özellikle kurak alanlarda yapılan buğday üretiminde çok önemli ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Buğday ıslah programlarında dayanıklı çeşit geliştirebilmek için ıslah materyalinin hızlı ve doğru şekilde kontrollü koşullarda test edilmesi gerekmektedir. Kök yara nematodlarına karşı dayanıklı çeşit elde etmek amacıyla laboratuvar koşullarında yürütülecek nematod bitki interaksiyonu çalışmalarında öncelikli olarak en uygun in-vitro koşulların belirlenmesi gerekmektedir. Bu amaçla 2 farklı toprak tipi, 2 hasat zamanı, 2 çeşit, 2 sulama sistemi, 3 saksı tipi, 2 inokulum miktarı araştırılmış ve 7 tekerrürlü olarak denemeye alınmıştır. Çalışmada P. thornei’ye karşı dayanıklılık denemelerinde en uygun parametrelerin; kumlu toprak tipi (70:29:1 kum:tarla toprağı:organik madde), küçük boy saksı (boru tipi, çap: 15 mm, yükseklik:100 mm), inokulum yoğunluğu 400 birey, 9 hafta hasat süresi, alttan perlitle yapılan sulama sistemi olduğu belirlenmiştir

Bu çalışmada Kök yara nematodu (Pratylenchus thornei Sher et Allen)'nun tarla koşullarında oluşturduğu verim kaybı, 181 yazlık buğday çeşit ve hattının dayanıklılığı ile dayanıklılık denemelerinde kullanılacak en uygun çalışma metodları araştırılmıştır. Ayrıca iki farklı dayanıklılık kaynağı AUS 4930 7.2 ve sentetik hexaploid buğday çeşidi olan CROC_1/AE.SQUARROSA (224)//OPATA' nın P. thornei'ye karşı gösterdiği dayanıklılığın moleküler tanımlanması yapılmıştır.P. thornei ile bulaşık tarlada yürütülen denemede, en yüksek verim kaybının % 19,85 ile duyarlı Gatcher çeşidinde meydana geldiği saptanmıştır. P. thornei'ye karşı dayanıklılık denemelerinde en uygun parametrelerin; kumlu toprak tipi (70:29:1 kum:tarla toprağı:organik madde), küçük boy saksı (boru tipi, çap: 15 mm, yükseklik:100 mm), 9 hafta hasat süresi, inokulum yoğunluğu 400 birey (P.thornei)/bitki, alttan perlitle yapılan sulama sistemi, olduğu belirlenmiştir P. thornei'ye karşı kısmi dayanıklı olduğu bilinen iki farklı buğday çeşidinin (AUS 4930 7.2 ve CROC_1/AE.SQUARROSA (224)//OPATA) duyarlı pastor çeşidi ile oluşturduğu populasyonların P. thornei'nin Çukurova populasyonuna karşı reaksiyonunun denendiği çalışmada; AUS 4930 7.2 x Pastor populasyonunda dayanıklı bölgelerin, 1B, 2B ve 4D kromozomunda, CROC x Pastor populasyonunda ise 1B ve 3B kromozomunda bulunduğu saptanmıştır. Daha önce farklı çeşitlerde dayanıklılığın bulunduğu bildirilen 6 D kromozom bölgesi AUS 4930 7.2 ve CROC_1/AE.SQUARROSA (224)//OPATA çeşitlerinde bulunamamıştır. In this study the yield loss of root lesion nematode (Pratylenchus thornei Sher et Allen) was investigated under natural field conditions in Adana. Under controlled laboratory conditions a P. thornei resistance assay for wheat was optimized, and 181 spring wheat varieties/lines were screened. The genetic control and location of two known different resistant sources (AUS4930 7.2 and the synthetic hexaploid wheat line, CROC_1/AE.SQUARROSA (224)//OPATA) was investigated using phenotypic and molecular methods.Under field conditions P. thornei caused a maximum of 19.85% yield loss on susceptible wheat variety Gatcher. Greenhouse resistant assay experiments showed clear differentiation between the resistance and susceptible cultivars 9 weeks after inoculation with an initial density of 400 P. thornei/plant in sandy based soil (70:29:1 sand: field soil: organic matter) in small tubes (1.5 x 100 mm) using a bottom up irrigation system with perlite. The genetic study using molecular tools revealed the resistance in both sources is quantitative and additive. The chromosomal location of P. thornei resistance in AUS4930 7.2 was found on chromosomes 1B, 2B and 6D. Similarly, the 1B chromosome was found in the CROC_1/AE.SQUARROSA (224)//OPATA, in addition to 3B, however no resistance locus located on chromosome 6D was detected. 131

YÜKSEK LİSANS TEZİ ADANA'DA TURUNÇGIL BAHÇELERİNDE TURUNÇGİL NEMATODU (TYLENCHVLUS SEMIPENETRANS COBB)'NUN POPULASYON DALGALANMASI VE VERİME OLAN ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI HALİL TOKTAY ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ BİTKİ KORUMA ANA BİLİM DALI Danışman: Prof. Dr. İ. Halil ELEKÇİOĞLU Yıl: 2001, Sayfa:33 Jüri: Prof. Dr. İ. Halil ELEKÇİOĞLU Prof. Dr. Nedim UYGUN Prof Dr. Turgut YEŞİLOĞLU Turunçgil nematodu (Tylenchulus semipenetrans Cobb)'nun Nisan 1998- Mart 2000 tarihlerinde populasyon dalgalanmasını incelemek amacıyla Adana ilinde iki farklı bölgede Turunçgil nematoduyla bulaşık turunç üzerine aşılı Washington Navel ve Yafa portakal çeşitlerinin (Citrus cinensis (L.) Osbeck) bulunduğu iki bahçe belirlenmiştir. Washington Navel çeşidi portakal bahçesinde aynı zamanda Turunçgil nematodunun verim üzerine etkisi araştırılmıştır. Turunçgil nematodunun populasyonu her iki bahçede yılın aralık ve ocak aylarında en düşük düzeye, temmuz ayında en yüksek düzeye ulaşmıştır. Nematisit uygulaması sonucu meyve veriminde kontrole göre 1998 yılı hasat döneminde % 0.9, 1999 yılı hasat döneminde ise % 9.2 oranında verim artışı olduğu tespit edilmiştir. Ancak bu artış istatistiksel olarak önemli bulunmamıştır. Anahtar Kelimeler: Turunçgil, Tylenchulus semipenetrans, Populasyon dalgalanması, meyve verimi. ABSTRACT MSc. THESIS POPULATION DYNAMICS OF CITRUS NEMATODE {TYLENCHULUS SEMIPENETRANS COBB) AND ITS EFFECT ON THE NAVEL ORANGE YIELD IN ADANA HALİL TOKTAY DEPARTMENT OF PLANT PROTECTION INSTITUTE OF NATURAL AND APPLIED SCIENCES UNIVERSITY OF ÇUKUROVA Supervisor: Prof. Dr. İ. Halil ELEKÇİO?LU Yıl: 2001, Sayfa:32 Jury: Prof. Dr. İ. Halil ELEKÇİO?LU Prof. Dr. Nedim UYGUN Prof. Dr. Turgut YEŞİLO?LU Population dynamics of citrus nematode, Tylenchulus semipenetrans Cobb, was studied in two different citrus orchards infested with the nematode where Yafa and Navel orange varieties {Citrus cinensis (L.) Osbeck) grown as grafted on sour orange rootstocks in Adana, from April 1998 to March 2000. Also, the effect of citrus nematode on the yield of Navel orange variety was examined. Nematode population, in both orchards, remained at its lowest level during December and January whereas it reached its highest level in July. After nematicide applications, yield increase for both years were 0.9 % and 9.2 %, respectively; however, the values were statistically insignificant. Key Words: Citrus, Tylenchulus semipenetrans, Population dynamics, Yield. II 41