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2. Contrôle mécanique de l'ajonc Ulex europaeus : facteurs affectants la capacité de repousse
- Author
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Thevenoux, Romain, Tarayre, Michèle, Atlan, Anne, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Espaces et Sociétés (ESO), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (Nantes Univ - IGARUN), Nantes Université - pôle Humanités, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Humanités, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Institut Agro Rennes Angers, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
ajonc ,[SHS.ENVIR]Humanities and Social Sciences/Environmental studies ,Resprouting ,Life history traits ,Rejet de souche ,[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology ,Biological invasion ,Ulex europaeus ,gorse ,Taits d'histoire de vie ,Invasions biologiques - Abstract
Cutting is frequently used to control invasive species, but the ability of plants to produce stump sprouts is little studied, even though it has strong consequences on the efficiency of this management, and a structural effect on ecosystems. Here we have studied the intraspecific variability of resprouting capacities of the common gorse, (Ulex europaeus) by comparing regions of its native and invaded areas. We conducted a comparative study in an experimental garden between two invaded regions (Reunion, New Zealand) and two native regions (Scotland, Brittany). Results show that (1) regrowth is mainly governed by the basal architecture of individuals (2) there are differences in resprouting capacity depending on the geographic regions, but no clear trend within native and invasive areas (3) life-history traits linked with resprouting capacity also vary depending on geographic regions. These results show large intraspecific variation in the resprouting capacity of gorse, and provide guidance for the management of gorse in invaded areas.; La coupe est fréquemment utilisée pour contrôler les espèces envahissantes, mais la capacité des plantes à produire des rejets de souche est peu étudiée alors qu’elle a de fortes conséquences sur l'efficacité de cette gestion, et un effet structurel sur les écosystèmes. Ici, nous avons étudié la variabilité intraspécifique des capacités de repousse de l'ajonc commun, (Ulex europaeus) en comparant des régions de ses zones d'origine et envahies. Nous avons mené une étude comparative dans un jardin expérimental entre deux régions envahies (Réunion, Nouvelle-Zélande) et deux régions natives (Ecosse, Bretagne). Les résultats montrent que (1) la repousse est principalement gouvernée par l'architecture basale des individus (2) il existe des différences dans la capacité de repousse selon les régions géographiques, mais pas de tendance claire entre des régions natives et envahies (3) les traits d'histoire de vie liés à la capacité de repousse dépendent de la région. Ces résultats montrent une grande variation intraspécifique dans la capacité de repousse de l'ajonc, et fournissent des indications pour la gestion de l'ajonc dans les zones envahies.
- Published
- 2022
3. Le contrôle des ajoncs : Repousse d'Ulex europaeus après coupe sur des plantes issues de régions d'origines et envahies
- Author
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Thevenoux, Romain, Tarayre, Michèle, Atlan, Anne, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Espaces et Sociétés (ESO), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Nantes Université - pôle Humanités, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Humanités, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (Nantes Univ - IGARUN), and Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Institut Agro Rennes Angers
- Subjects
[SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment ,[SHS.ENVIR]Humanities and Social Sciences/Environmental studies ,Resprouting ,Life history traits ,Biological invasion ,gorse ,Ulex europaeus - Abstract
Cutting is currently used to control invasive species. The ability of plants to produce stump sprouts, following the total or partial destruction of their aerial biomass, has strong consequences on the efficiency of this management. Here we have studied the intraspecific variability of resprouting capacities of the common gorse (Ulex europaeus, ssp. europaeus) in a common garden. We conducted a comparative study between two invaded regions (Reunion, New Zealand) and two native regions (Scotland, Brittany). Results show large intra-specific variation in the resprouting capacity of gorse, and that (1) regrowth is mainly governed by the basal architecture of individuals (2) there are differences in resprouting capacity depending on the geographic regions, but no clear trend within native and invasive areas (3) life-history traits linked with resprouting capacity also vary depending on geographic regions. These results may provide guidance for the management of gorse in invaded areas.; La lutte physique par la coupe est souvent utilisée pour contrôler les espèces envahissantes. La capacité des plantes à produire des rejets de souche, suite à la destruction totale ou partielle de leur biomasse aérienne, a de fortes conséquences sur l'efficacité de cette gestion. Nous avons étudié la variabilité intraspécifique des capacités de repousse de l'ajonc commun, (Ulex europaeus, ssp. europaeus) en jardin experimental. Nous avons mené une étude comparative entre deux régions envahies (La Réunion, Nouvelle-Zélande) et deux régions d’origine (Ecosse, Bretagne). Les résultats montrent une grande variation intraspécifique dans la capacité de repousse de l'ajonc, et (1) que la repousse est principalement gouvernée par l'architecture basale des individus, (2) qu’il existe des différences dans la capacité de repousse selon les régions, mais pas de tendance claire entre zones natives et envahies, (3) que les traits d'histoire de vie liés à la capacité de repousse varient selon les régions. Ces résultats peuvent fournit des indications pour la gestion de l'ajonc dans les zones envahies.
- Published
- 2022
4. Mise en évidence et première caractérisation d'une espèce cryptique au sein du complexe Globodera pallida
- Author
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Thevenoux, Romain, Laboratoire de santé des végétaux (LSV), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agrocampus Ouest, Éric Grenier, Laurent Folcher, STAR, ABES, Laboratoire de santé des végétaux (LSV Angers), Laboratoire de la santé des végétaux (LSV), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
[SDV.BV.AP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding ,Automatic morphometry ,Diversité génétique ,Nématode à kyste ,Morphométrie automatisée ,Cyst nematodes ,Integrative taxonomy ,[SDV.BV.AP] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding ,Genetic diversity ,Taxonomie intégrative - Abstract
Cyst Nematodes of the genus Globodera are among the most studied plant parasitic nematodes because of their economic impact on crop production. Originated from high plains of the Andes, this genus would have been imported in Europe during the late XIXth century. The existence of a cryptic species complex within G. pallida – one of the most damaging species in the genus – is questioned. The taxonomic revision of this species could have major consequences on both risk assessment and management. During this work, an integrative taxonomic approach was implemented and has involved three disciplinary fields: genetics, morphometry and biology. Genetic diversity investigation revealed two groups differing from G. pallida. This study also raises the question of the processes implied in this divergence, apparently distinct for these two groupsMorphological differentiation was also demonstrated with an automatic image analysis tool. This tool was specifically developed for this work and is an innovative approach in studying the morphometry of this genus. This differentiation is based on the combined integration of three metrics adapted to automatic morphometry. Differential study of each entity ‘s host-range showed differences between studied groups. This differentiation is observed thanks to the investigation of the quantitative aspect of the nematode multiplication. Overall, these results bring the necessary evidence to claim the existence of a new species. This discovery questions the need for adapting surveillance and management methods against nematodes of the genus Globodera., Les nématodes à kyste du genre Globodera sont parmi les phytoparasites les plus étudiés de par l’impact économique qu’ils peuvent engendrer sur les productions agricoles. Originaire des hauts plateaux de la cordillère des Andes ce genre aurait été importé en Europe à la fin du XIX siècle. L’existence d’un complexe d’espèce cryptique chez G. pallida, nématode phytoparasites d’importance au sein du genre, est questionnée. La révision taxonomique de cette espèce peut avoir des conséquences fortes en termes d’épidémiologie, d’évaluation et de gestion des risques. Durant ce travail une approche de taxonomie intégrative impliquant trois champs disciplinaires, génétique, morphométrique et biologique, a été développée sur un panel de populations sud-américaines pour délimiter de nouvelles frontières au sein de cette espèce. L’exploration de la diversité génétique a permis de révéler l’exitence de deux groupes fortement distants de G. pallidaCette étude questionne aussi les processus impliqués dans cette divergence qui semblent distincts pour ces deux groupes. L’existence d’une différenciation morphologique a été observée grâce à un outil d’analyse d’image automatisé créé spécifiquement pour ce travail. Le développement de l’outil constitue une approche novatrice pour l’étude de la morphométrie dans ce genre et plus généralement chez les nématodes. Cette différenciation s’appuie sur l’intégration combinée de trois métriques adaptées à la morphométrie automatisée. Enfin, l’étude de la capacité de ces entités à se développer aux dépens de certaines plantes a elle aussi rapporté des
- Published
- 2020
5. The hidden diversity of the potato cyst nematode Globodera pallida in the south of Peru
- Author
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Thevenoux, Romain, primary, Folcher, Laurent, additional, Esquibet, Magali, additional, Fouville, Didier, additional, Montarry, Josselin, additional, and Grenier, Eric, additional
- Published
- 2019
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6. Biological Invasion Theories: Merging Perspectives from Population, Community and Ecosystem Scales
- Author
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Chabrerie, Olivier, primary, Massol, François, additional, Facon, Benoit, additional, Thevenoux, Romain, additional, Hess, Manon, additional, Ulmer, Romain, additional, Pantel, Jelena H, additional, Braschi, Julie, additional, Amsellem, Laurent, additional, Baltora-Rosset, Sylvie, additional, Tasiemski, Aurélie, additional, Grandjean, Frédéric, additional, Gibert, Patricia, additional, Chauvat, Matthieu, additional, Affre, Laurence, additional, Thiébaut, Gabrielle, additional, Viard, Frédérique, additional, Forey, Estelle, additional, Folcher, Laurent, additional, Boivin, Thomas, additional, Buisson, Elise, additional, Richardson, David M., additional, and Renault, David, additional
- Published
- 2019
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7. The hidden diversity of the potato cyst nematode Globodera pallida in the south of Peru.
- Author
-
Thevenoux, Romain, Folcher, Laurent, Esquibet, Magali, Fouville, Didier, Montarry, Josselin, and Grenier, Eric
- Subjects
- *
GOLDEN nematode , *GLOBODERA pallida , *CYST nematodes , *SOYBEAN cyst nematode , *NEMATODES , *POPULATION differentiation , *GENETIC distance - Abstract
Our knowledge of the diversity of potato cyst nematodes in their native areas still remains patchy and should be improved. A previous study based on 42 Peruvian Globodera pallida populations revealed a clear south to north phylogeographic pattern, with five well‐supported clades and maximum diversity observed in the south of Peru. In order to investigate this phylogeographic pattern more closely, we genotyped a larger collection of Peruvian populations using both cathepsin L gene sequence data and a new set of 13 microsatellite loci. Using different genetic analyses (STRUCTURE, DAPC), we consistently obtained the same results that led to similar conclusions: the presence of a larger genetic diversity than previously known suggesting the presence of cryptic species in the south of Peru. These investigations also allowed us to clarify the geographic borders of the previously described G. pallida genetic clades and to update our knowledge of the genetic structure of this species in its native area, with the presence of additional clades. A distance‐based redundancy analysis (dbRDA) was also carried to understand whether there was a correlation between the population genetic differentiation and environmental conditions. This analysis showed that genetic distances observed between G. pallida populations are explained firstly by geographic distances, but also by climatic and soil conditions. This work could lead to a revision of the taxonomy that may have strong implications for risk assessment and management, especially on a quarantine species. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2020
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