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8 results on '"Tavaud-Pirra, Muriel"'

2. Genetic architecture of semolina yield and of its components in durum wheat (Triticum turgidum spp. durum)

Author

TAVAUD-PIRRA, Muriel, Ardisson, Morgane, Compan, Frederic, David, Jacques, Rocher, Aline, Sanchez, Dimitri, Roumet, Pierre, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
Vegetal Biology, sélection génétique, architecture génétique, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, triticum turgidum durum, Biologie végétale, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, amélioration des plantes
Abstract

International audience

Published
2018

3. Exploiter la diversité génétique pour comprendre les mécanismes de l’adaptation

Author

Ronfort, Joelle, Burgarella, Concetta, Chantret, Nathalie, David, Jacques, Ecarnot, Martin, Fréville, Hélène, Gay, Laurène, Gouesnard, Brigitte, Loridon, Karine, Muller, Marie-Helene, Prosperi, Jean-Marie, Ranwez, Vincent, Roumet, Pierre, Santoni, Sylvain, Tavaud-Pirra, Muriel, Vigouroux, Yves, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Diversité, adaptation, développement des plantes (UMR DIADE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Biologie et Amélioration des Plantes (0459)., and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2014

4. Insights into the evolutionary history of sweet cherry (prunus avium L.)

Author

MARIETTE, Stéphanie, ARUNYAWAT, Uraiwan, TAVAUD-PIRRA, Muriel, ProdInra, Migration, Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2014

5. Genotyping by sequencing polyploidy wheat using RNAseq: Pitfalls and perspectives

Author

TAVAUD-PIRRA, Muriel, Ranwez, Vincent, Ardisson, Morgane, Sarah, Gautier, Santoni, Sylvain, David, Jacques, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and ProdInra, Archive Ouverte

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], transcriptomics, polyploids, NGS, [SDV]Life Sciences [q-bio], food and beverages, durum wheat, GBS
Abstract

A composite durum wheat population (Triticum turgidum, 2n=4X=28, A and B genomes) was created by crossing elite durum lines with wild (T. dicoccoides) and primitive emmer (T. dicoccum) accessions. A recessive male sterility gene was used in order to monitor the outcrossing rate in the population. Since 1997, this population is experiencing each year natural and anthropic selection with an outcrossing rate of 10 %. The EPO project aims at identifying SNPs from 100 fixed lines extracted from this important resource of diversity and to evaluate the potential of RNA seq for Genotyping by sequencing purposes. [br/] We obtained transcriptomics data for 50 individuals and built contigs using those data and standard NGS pipelines. As expected for a allotetraploid species, this first rough analysis demonstrated that for a large number of detected SNPs an excess of heterozygosity was observed. This seems to indicate that the simultaneous expression of the two A and B homeologous copies of many genes resulted in an erroneously merge of paralogous/homeologous sequences. This clearly pinpoints that such standard assembly protocols are not adapted do deal with polyploid species. [br/] We thus developed a dedicated assembly strategy that exploits strict and accession specific assemblies and Triticum monococcum and Aegilops speltoides diploids genomes to identify paralogs and homeologs in the durum wheat A and B genomes. This approach significantly increases the number of unambiguous within genome polymorphisms and offer promising perspective for genotyping by sequencing durum wheat and other polyploids of agronomic importance.

Published
2013

6. La sélection du soja en France : Quel état des lieux ?

Author

Roumet, Pierre, Rooryck, S., TAVAUD-PIRRA, Muriel, Diversité et adaptation des plantes cultivées (UMR DIAPC), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2), Gie Soja, Partenaires INRAE, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
création variétale, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, sélection, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, génétique, diversité
Abstract

National audience; Cultivated soybean [Glycine max (L.) Merr.], one of the major crops used as animal and human foods, is mainly cultivated in Argentina, Brazil, China and USA. In France, cultivated area remains low despite the interest of research and development institutes and the request of industry for non GMO seeds. After a presentation of the evolutionary history of this species, this paper is focused on the plant breeding effort realised in France in connection with research works. Special attention was paid to plant physiology knowledge development, plant stress tolerance which impacted the development of new raw material for plant breeding. The effort done by GIE Soja to continue soybean breeding programme is illustrated through 2 examples: hybridization to create new segregating populations and the improvement of seed protein content.; Alors que le soja est une culture de première importance dans les échanges mondiaux, cette espèce reste peu développée en France malgré les efforts mis en oeuvre par la recherche, le développement et la demande croissante des transformateurs de graines non OGM en alimentation humaine et animale. Après avoir revu quelques traits d’histoire évolutive de cette espèce, cette présentation va s’attacher au développement de l’offre variétale en France et à la nature des programmes des recherches ayant impacté cette création variétale. Les travaux liés à la connaissance de la physiologie de la plante, à sa réponse adaptative à différents stress sont résumés. L’effort réalisé par le GIE soja pour intégrer ces connaissances afin de maintenir et améliorer l’efficience des programmes de sélection sur cette espèce est illustré à partir de 2 exemples : la création de nouvelles populations et l’amélioration de la teneur en protéines.

Published
2010

7. Soybean Breeding in France; state of art

Author

Roumet, Pierre, Rooryck, S., TAVAUD-PIRRA, Muriel, Diversité et adaptation des plantes cultivées (UMR DIAPC), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Gie Soja, Partenaires INRAE, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
alimentation humaine, alimentation animale, qualité de la graine, ogm, glycine max, rendement, physiologie de la plante, génétique, résistance à la verse, stress, productivité, programme d'amélioration, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, sélection, diversité, création variétale, méthode de sélection, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, soja, bilan génétique, protéagineux, évolution historique, réponse adaptative, facteur de régulation, teneur en protéines, diversité génétique, programme de sélection, france, gamme variétale
Abstract

Alors que le soja est une culture de première importance dans les échanges mondiaux, cette espèce reste peu développée en France malgré les efforts mis en oeuvre par la recherche, le développement et la demande croissante des transformateurs de graines non OGM en alimentation humaine et animale. Après avoir revu quelques traits d’histoire évolutive de cette espèce, cette présentation va s’attacher au développement de l’offre variétale en France et à la nature des programmes des recherches ayant impacté cette création variétale. Les travaux liés à la connaissance de la physiologie de la plante, à sa réponse adaptative à différents stress sont résumés. L’effort réalisé par le GIE soja pour intégrer ces connaissances afin de maintenir et améliorer l’efficience des programmes de sélection sur cette espèce est illustré à partir de 2 exemples : la création de nouvelles populations et l’amélioration de la teneur en protéines., Cultivated soybean [Glycine max (L.) Merr.], one of the major crops used as animal and human foods, is mainly cultivated in Argentina, Brazil, China and USA. In France, cultivated area remains low despite the interest of research and development institutes and the request of industry for non GMO seeds. After a presentation of the evolutionary history of this species, this paper is focused on the plant breeding effort realised in France in connection with research works. Special attention was paid to plant physiology knowledge development, plant stress tolerance which impacted the development of new raw material for plant breeding. The effort done by GIE Soja to continue soybean breeding programme is illustrated through 2 examples: hybridization to create new segregating populations and the improvement of seed protein content.

Published
2010

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