Određivanje komponenata izračuna trošarina na duhanske prerađevine ponekad rezultira neskladom ciljeva i učinaka fiskalne politike, a osobito kontradikcijom u odnosu prema politici zaštite zdravlja. Iako se povećanjem trošarina nastoji prikupiti što više sredstava u državni proračun, visina trošarine utječe na smanjivanje baze korisnika zbog štetnih utjecaja konzumacije takvih proizvoda. Posebice se ističe značaj prevencije bolesti uzrokovanih konzumacijom duhanskih prerađevina i njihovih supstituta, kao i biljnih proizvoda za pušenje. Iako se Republika Hrvatska uskladila sa zakonodavstvom Europske unije u okviru direktiva koje reguliraju predmetno područje, neusklađenost stopa još se uvijek ističe kao problem. Novim je zemljama članicama Europske unije, pa tako i Republici Hrvatskoj omogućeno prijelazno razdoblje u kojem se stope moraju približiti propisanima. Učinak dosad poduzetih mjera trošarinske politike očituje se povećanom konzumacijom duhanskih prerađevina oporezivanih nižim stopama, ali i porastom ilegalne trgovine, što inicira potrebu za intervencijom države pooštrenim preventivnim i represivnim mjerama fiskalne, kaznene i ekonomske politike., Determination of the components of calculating excise value for tobacco products may result in mismatch of goals and fiscal policy effects, and in particular contradiction relating to health protection. Although an increase in excise value seeks to raise as much money as possible into national budget, excise value affects the reduction of customer base due to harmful effects of consumption such products. Importance of prevention diseases caused by the consumption of tobacco products and substitutes, as well as herbal products intended for smoking, is highlighted. Though Republic of Croatia has harmonised legislation within the framework directive of European Union regarding regulating the subject area, non-compliance rates still stand out as a problem. To new European Union member states, including Croatia, transitional period is granted, during which the rates must be brought closer to the assigned ones. The result of the excise policy measures taken so far is reflected in the increased consumption of tobacco products taxed lower rates, but also increase in illegal trade, which raises the need for state intervention strengthening preventive and repressive measures, fiscal, criminal and economic policy.