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Conhecer o crescimento do tomateiro e de seus frutos, medido através do acúmulo de biomassa ao longo do tempo, são fundamentais para o manejo adequado e a detecção de problemas no desenvolvimento das culturas. Este crescimento pode ser estudado por meio de vários modelos de regressão não linear que podem ser usados para facilitar a interpretação dos processos envolvidos no sistema de produção vegetal. Entre os modelos empíricos usados frequentemente para estimar o crescimento de plantas, e seus componentes, encontra-se a função logística. Um dos métodos utilizados para estimar os parâmetros das curvas de crescimento é o método bayesiano. Este estudo teve como objetivo aplicar a metodologia bayesiana na descrição dos dados – reais e simulados - de crescimento do diâmetro de tomates, utilizando o modelo não linear logístico. Os algoritmos para o amostrador de Gibbs e o Metropolis-Hastings foram implementados utilizando-se a linguagem R. A condição de convergência das cadeias foi verificada por meio do critério de Raftery & Lewis, que está disponível no pacote BOA (“Bayesian Output Analysis”) do software R. A metodologia bayesiana mostrou-se eficiente na estimação dos parâmetros da curva de crescimento, e as estimativas mostraram-se coerentes com os valores relatados na literatura.

The aim of this study is to describe the productive behavior of salad tomato genotypes using adjusted growth models. Data were obtained from field experiments performed in 2015/2016 using the Cordillera, Ellen and Santa Clara genotypes, and in 2016/2017 using the Cordillera and Gaucho genotypes. Five and nine harvests were carried out in 2015/2016 and 2016/2017 respectively, and the variables measured were number and weight of fruit per plant. The Brody, Gompertz, logistic and von Bertalanffy models were adjusted using the accumulated values per plant for each harvest, with the dependent variables being those measured and the independent variable being the number of days after the seedlings had been transplanted. Using the model that best fit the data, the confidence interval of the inflection point was estimated and the similarity of the parameters between the genotypes was measured. The logistic model fit best for both variables. Using the estimates for the biologically interpreted parameters and the inflection point, it was possible to compare the final production of the genotypes and increase the inferences that could be made regarding production over time, differentiating these in terms of productive precocity. In the first experiment, the Cordillera and Ellen genotypes were more premature, while in the second the most premature was the Gaucho genotype. Therefore, the use of growth models can increase the inferences that can be made in terms of the productive behavior of other crops in multiple harvests.

In this paper we provide an alternative to create reference growth curves for female Hereford cattle breed based on the generalized additive models for location, scale and shape (GAMLSS) framework. The proposed methodology avoids some known problems present in the quantile regression, such as crossing quantiles and unsuitability in extreme centiles. Since GAMLSS are semi-parametric regression-type models, any statistical distribution can be considered to explain the behaviour of a given response variable (e.g., body weight) and we are able to model any and all of the parameters of the response variable distribution, it can easily deal with highly complex growth curves (e.g., presenting multiple cycles), heteroskedasticity and skewed data issues, commonly present in this field. We apply the abovementioned methodology, showing that the animal age directly affects median, variability and skewness characteristics of its growth curve. Finally, this approach may be applied in any other animal or plant growth, and it can be used as a powerful decision-making tool by producers.

The aim of the work was to evaluate the adjustment of the logistic and gompertz model with structure of first-order autoregressive errors in the study on the ‘Dwarf green’ coconut fruit growth based on longitudinal and cross-sectional internal cavity diameter data (DLCI and DTCI). Model adjustments showed positive residual autocorrelation, according to the Durbin-Watson test and for both variables, DLCI and DTCI, the residue was modeled according to first-order autoregressive process (AR1). The analysis was performed using the least squares method in the PROC MODEL of the SAS software and results indicated that for both characteristics under study, the logistic model was the most appropriate in describing fruit growth and, according to the model, fully developed ‘Dwarf green’ coconut fruits have longitudinal and cross-sections internal cavity diameter of approximately 7.39 cm and 7.60 cm, respectively. RESUMO O objetivo do trabalho foi avaliar o ajuste do modelo logístico e gompertz com estrutura de erro autoregressiva de primeira ordem no estudo do crescimento de frutos de coqueiro anão verde, com base nos dados de diâmetro longitudinal e transversal da cavidade interna (DLCI e DTCI). Os ajustes dos modelos apresentaram autocorrelação residual positiva, de acordo com o teste de Durbin-Watson e para ambas as variáveis, DLCI e DTCI, o resíduo foi modelado segundo um processo autorregressivo de primeira ordem (AR1). A análise foi feita por meio do método de mínimos quadrados no PROC MODEL do programa SAS e os resultados indicaram que para as duas características em estudo, o modelo logístico foi o mais adequado na descrição do crescimento do fruto e de acordo com o modelo, o fruto do coqueiro anão verde, totalmente desenvolvido, tem diâmetro longitudinal e transversal da cavidade interna aproximadamente de 7,39 cm e 7,60 cm, respectivamente.

Classical methods of analysis of nonlinear models are widely used in studies of ruminal degradation kinetics. As this type of study involves repeated measurements in the same experimental unit, the use of mixed nonlinear models (MNLM) is proposed, in order to solve problems of heterogeneity of variances of the responses, correlation among repeated measurements and consequent lack of sphericity in the covariance matrix. The aims of this work are to present an evaluation of the applicability of MNLM in the estimation of parameters to describe the in situ ruminal degradation kinetics of the dry matter of Tifton 85 hay and to compare the results with those obtained from the usual analysis in two-phases. The steers used in the trial were fed diets composed of three different combinations of roughage and concentrate and two hays with different nutritional qualities. The proposed approach was proven as effective as the traditional one for estimating model parameters. However, it adequately models the correlation among the longitudinal data, which can affect the estimates obtained, the standard error associated with them and potentially change the results of the inferences. It is quite attractive when the research seeks to understand the behavior of the process of food degradation throughout the incubation times. Resumo Métodos clássicos de análise de modelos não lineares são amplamente utilizados em estudos da cinética de degradação ruminal. Como esse tipo de estudo envolve medidas repetidas na mesma unidade experimental, propõe-se o uso de modelos não lineares mistos (MNLM), buscando resolver os problemas de heterogeneidade de variâncias das respostas, de correlação entre as medidas repetida se a consequente falta de esfericidade da matriz de covariâncias. Os objetivos deste trabalho envolvem apresentar uma avaliação da aplicabilidade dos MNLM na estimação de parâmetros para descrever a cinética de degradação ruminal in situ da matéria seca de fenos de capim-Tifton 85 e comparar os seus resultados com os obtidos da análise usual realizada em duas fases. Os novilhos utilizados no ensaio foram alimentados com rações compostas por três diferentes combinações de volumoso e concentrado e dois fenos com diferentes qualidades nutricionais. A abordagem proposta mostrou-se tão efetiva quanto à tradicional para a estimação dos parâmetros do modelo. Contudo, ela modela de forma adequada a correlação entre os dados longitudinais, o que pode afetar as estimativas obtidas, o erro padrão associado a elas e, potencialmente, alterar os resultados das inferências. É bastante atraente quando a pesquisa busca entender o comportamento do processo da degradação dos alimentos ao longo dos tempos de incubação.

The growth of plants and animals can be described through a growth curve. This curve is given by the equation of a nonlinear model, such as the Logistic model and the Gompertz model. The objective of this study was to adjust the Chanter model, as well as Logistic and Gompertz, using a set of cocoa (clone Sial-105) fruit whose length and diameter measurements were evaluated from 30 to 180 days after pollination, every 15 days. The Chanter model is a hybrid between the Logistic model and Gompertz model whose parameters can be interpreted similarly. A comparison of the quality of fit between the models was made using the following statistical measures: the Akaike’s information criterion (AIC), the Akaike’s weights criterion, Bayesian information criterion (BIC), residual standard deviation (RSD),the adjusted coefficient of determination (R²aj) and the measures of non-linearity Box’s bias and curvature of Bates and Watts. It was verified that the Chanter model is the most suitable one among the studied models for modeling the cocoa data. RESUMO: O crescimento de plantas e animais pode ser descrito por meio de uma curva. Essa curva é dada pela equação de um modelo não linear, como o modelo Logístico e o modelo Gompertz. O objetivo deste trabalho foi ajustar o modelo Chanter, assim como o Logístico e Gompertz, utilizando um conjunto de dados do fruto do cacaueiro do clone SIAL - 105, cujas medidas de comprimento e diâmetro foram avaliadas de 30 até 180 dias após a polinização, a cada 15 dias. O modelo Chanter é um híbrido entre o modelo Logístico e o modelo Gompertz cujos parâmetros podem ser interpretados similarmente. A avaliação da qualidade do ajuste entre os modelos foi feita utilizando as seguintes medidas estatísticas: o critério de informação de Akaike (AIC), o critério Peso de Akaike, o critério de informação de Bayes (BIC), o desvio padrão residual (DPR), o coeficiente de determinação ajustado (R²aj) e as medidas de não linearidade, vício de Box e curvatura de Bates e Watts. Verificou-se que o modelo Chanter dentre os modelos estudados neste trabalho é o mais adequado para o ajuste aos dados do fruto do cacaueiro.

The aim of this study was to investigate the effect of using different reforestation woods (Acacia mearnsii and Eucalyptus citriodora) on the formation of volatile organic compounds and to evaluate the changes in the lipid fraction (peroxide value and thiobarbituric acid reactive substances), microbiological counts and overall liking in bacons stored for 60 days at 5 ± 1 °C. Smoking with Eucalyptus citriodora wood increased the total phenolic content and, consequently, reduced the concentration of hexanal, TBARS, and PV values. Although smoking with different reforestation woods did not impact negatively on the liking of products, no changes on antimicrobial activity was observed in the developed products. Thus, the use of Eucalyptus citriodora wood may be an alternative for smoking meat products as it reduced lipid oxidation and improved the volatile compounds profile, and provided higher antioxidant activity. The information generated herein can be used as a platform for companies to test the viability of producing meat products smoked with reforestation woods.

The cultivation of sugar cane has been gaining great focus in several countries due to its diversity of use. The modernization of agriculture has allowed high productivity, which is affected by the...

O objetivo desta pesquisa consistiu em avaliar a formação de biofilme em aço inoxidável por Aeromonas hydrophila e Staphylococcus aureus usando leite e diferentes condições de cultivo. As variáveis em estudo consistem no cultivo monoespécie e combinado, dos referidos microrganismos e nas temperaturas de 4, 7 e 18 °C. Recipientes contendo 1000 mL de leite, densidade populacional de 10(5) UFC.mL-1 de cada microrganismo e 10 cupons de aço inoxidável (10 × 20 mm) foram lacrados e armazenados, sob agitação de 60 rpm, por um período de 10 dias. As análises ocorreram a cada 48 horas. Células sésseis de A.hydrophila e S. aureus foram enumeradas através do plaqueamento seletivo em ágar m-Aeromonas selective e Baird-Parker, respectivamente. Estudos sobre o tempo de geração, enumeração de células planctônicas e observação dos cupons através da microscopia eletrônica de varredura foram conduzidos. S. aureus, em monocultivo, formou biofilme a 18 °C e a 7 °C. Para 4 °C, foi observado um processo de adesão. A presença de A. hydrophila reduziu o desempenho de S. aureus. Nesta condição de cultivo multiespécie houve formação de biofilme a 18 °C. A. hydrophila, tanto em monocultivo quanto em presença de S. aureus, formou biofilme em todas as condições pesquisadas.The aim of this research was to verify the capability of biofilm formation on stainless steel by Aeromonas hydrophila and Staphylococcus aureus using milk and different conditions of cultivation. The variables consisted in mono and multi-species cultivation of these microorganisms and in the temperatures of 4, 7 and 18 °C. Containers containing 1000 mL of milk, population density of 10(5) CFU.mL-1 of each microorganism, and ten suspended chips of stainless steel AISI 304 (10 × 20 mm) were used to seal up and storage, under 60 rpm of agitation for 10 days. The analyses were conducted every 48 hours. Sessile cells of A. hydrophila and S. aureus and were enumerated by plating in m-Aeromonas selective agar and Baird-Parker agar. Complementary studies included the generation time calculation, enumeration of planktonic cells, and visualization of chips by scanning electron microscopy. S. aureus, in mono-cultivation, formed biofilm at 18 °C and at 7 °C. At 4 °C was observed attachment. The presence of A. hydrophila reduced the performance of S. aureus. In this condition, S. aureus formed biofilm at 18 °C. A. hydrophila formed biofilm under all conditions.

Degradation models exhibit a non-linear behavior and the selection of a model to describe the degradability depends on the coherence of the model with the involved biological events. The purpose of this study is to evaluate the behavior of the parameters of the degradation model proposed by Mertens & Loften, adjusted to the results of an in situ degradability trial. The experiment evaluated the potential degradable residue of neutral detergent fiber (NDF) of coastcross grass (Cynodon dactylon × Cynodon nlemfuensis) submitted to two cutting ages (30 and 90 days), with three replicates. For each cutting age, the potentially degradable residue of NDF was studied using fifteen incubation times (0; 0,5; 1; 3; 6; 9; 12; 18; 34; 35; 48; 56; 72; 96 e 120 hours). The experimental unit comprised one non-lactating cow with a permanent ruminal fistula. Mean and individual adjustments were obtained for the animals in three different configurations: inverse variance weight without autoregressive errors; unweighted with autoregressive errors, and unweighted without autoregressive errors. Variances of parameter estimators were also obtained by means of the mean parameter covariance matrix, providing expressions for the estimation of the confidence age for the parameters of the model. A weighting of the model by the inverse variance resulted in estimates statistically equal to zero for the colonization time. The use of a structure of second order autoregressive errors improved the fit of the model of Mertens & Loften, providing more precise estimates of the parameters.

The objective of this work was to fit the degradation model proposed by Orskov & McDonald (1979) to data of an in situ degradability trial. Neutral detergent fiber degradations (NDF) of coast cross grass (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfunensis) were submitted to twelve cutting ages (30, 60, 90, 120, 150, 180, 210, 240, 270, 300, 330 and 360 days) in a complete block design. At each cutting age, NDF degradation was investigated using nine incubation times (0, 3, 6, 12, 24, 48, 72, 96 and 120 hours) in a split-plot design, taking cutting age as main plots and incubation time as subplots. Each plot comprised a non-lactating cow with a permanent ruminal fistula. Variances of the parameter estimates were also obtained, as well as expressions for the estimation of confidence intervals for parameters in the model. A good fit of the model to the data of neutral detergent fiber degradability in the most cutting ages was found. The cutting ages of the coast cross grass influenced the degradability of different fractions, benefiting early stages. In advanced cutting ages the parameters estimates were less precise. Objetivou-se com este trabalho ajustar o modelo de degradação proposto por Orskov & McDonald (1979) aos dados de um experimento de degradabilidade in situ. Foi avaliada a degradação da fibra em detergente neutro (FDN) da gramínea Coast Cross (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfunensis) submetida a doze idades de corte (30, 60, 90, 120, 150, 180, 210, 240, 270, 300, 330 e 360 dias) em um delineamento em blocos casualizados. Em cada idade de corte a degradação da FDN foi avaliada em nove tempos de incubação (0, 3, 6, 12, 24, 48, 72, 96 e 120 horas) em um esquema de parcela subdividida, com as idades de corte na parcela e os tempos de incubação na subparcela. Cada parcela foi constituída por uma vaca não-lactante com fístula ruminal permanente. O ajuste do modelo foi avaliado através da interpretação biológica dos parâmetros, coeficiente de determinação, quadrado médio do resíduo e teste de aderência (lack of fit). As variâncias dos estimadores dos parâmetros também foram obtidas por meio da matriz de covariância dos parâmetros fornecendo expressões para estimação do intervalo de confiança dos parâmetros do modelo. O modelo se ajustou bem aos dados de degradabilidade da fibra em detergente neutro na maioria das idades de corte. As idades de corte da gramínea Coast Cross influenciaram a degradabilidade das diferentes frações, favorecendo os cortes mais precoces. Nas idades de corte avançadas as estimativas dos parâmetros foram menos precisas.

Neste experimento, objetivou-se comparar os efeitos dos métodos de cocção: cozimento em água (CA); em óleo (FO); em grelha (GR); em forno convencional (FC) e em forno de microondas (MO), sobre a perda no cozimento (PPC), composição centesimal (CC), taxas de retenção aparente, taxa de retenção verdadeira da gordura e colesterol dos cortes peito e coxa de frangos. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado, com 5 tratamentos e 5 repetições, totalizando 25 parcelas experimentais. Os métodos de cocção influenciaram (P

Com o presente trabalho, objetivou-se determinar a composição centesimal e o teor de colesterol presente dos diferentes cortes comerciais da carne de capivara. A umidade, proteína, extrato etéreo e cinzas foram determinados segundo a AOAC (1990). O colesterol foi determinado por colorimetria. Os cortes comerciais apresentaram média de 75,80% de umidade; 21,74% de proteína; 0,74% de lipídios; 0,90% de cinzas; e 23,3 mg/100g de colesterol. Houve diferença (P

Com o presente trabalho teve-se como objetivo determinar o perfil de ácidos graxos (AG) em diferentes cortes comerciais da carne de capivaras. Cinco capivaras adultas foram abatidas por tiro na região temporo-occiptal, sangradas, depeladas, evisceradas, divididas em 2 meias carcaças e resfriadas a 5ºC por 24horas. A desossa e os cortes comerciais foram realizados às 24 horas post mortem. O percentual da gordura foi determinado segundo a AOAC (1990), e para a determinação dos AG, a gordura foi extraída segundo Folch et al. (1957) e submetida à cromatografia gasosa. Os diferentes cortes mostraram variações significativas (P

O objetivo desse trabalho foi avaliar os efeitos de métodos de abate (MA) (humanitário (MH) e por tiro (MT)) e sexo na composição centesimal, perfil de ácidos graxos (AG) e colesterol da carne de capivara (Hydrochaeris hydrochaeris L. 1766). Foram abatidos 20 animais (13 machos (M) e 7 fêmeas (F)) com peso médio de 45,71kg. No músculo longissimus dorsi (LD) foram determinados: umidade, lipídios totais (LT), proteína e cinzas e no semimembranosus (SM), o colesterol por colorimetria e o perfil de AG por cromatografia gasosa. O LD apresentou: 75,87% de umidade, 1,37% de LT, 22,11% de proteínas e 1,09% de cinzas. Houve diferença (p

The objective was to examine the effects of immunocastration on carcass traits and meat quality of Nellore and Nellore×Aberdeen Angus male animals finished in feedlot. Surgically castrated, immunocastrated, and intact animals were finished in feedlot for 90 days. The animals were harvested, and carcass traits were evaluated. Carcasses were chilled, and one 2.5-cm steak was fabricated from Longissimus thoracis muscle. The steaks were individually vacuum packaged and frozen at -18 °C. Frozen steaks were thawed, and pH, instrumental color, cooking loss, and shear force were determined. Immunocastrated animals demonstrated greater (P

A taxa de mineralização do nitrogênio (N) varia de um resíduo orgânico para outro, evidenciando-se dependente da sua composição química e interação do material orgânico com o solo. Este estudo foi realizado com o objetivo de avaliar a dinâmica de mineralização de N de resíduos orgânicos incubados em Latossolos. O experimento foi conduzido no período de julho de 2007 a abril de 2008, sendo incubadas amostras de estercos, lodos, compostos, substrato e turfa em areia lavada, Latossolo Vermelho-Amarelo (LVA) e Latossolo Vermelho distroférrico (LVdf), com 240 e 670 g kg-1 de argila, respectivamente. O N mineralizado foi avaliado medindo-se os teores de N-NH4+ e N-NO3- em lixiviados coletados aos 15, 30, 45, 60, 75, 90, 120, 150, 180, 210, 240 e 270 dias de incubação. A mineralização de N ocorreu a maiores taxas nos períodos iniciais de incubação. O N mineralizado (33 a 199,2 mg kg-1) após 270 dias de incubação é regulado pelos teores de N total e de carbono solúvel em água dos resíduos orgânicos. Independentemente do meio utilizado para incubação, os estercos de galinha e de codorna propiciaram os maiores teores de N mineralizado nos Latossolos. À exceção dos estercos de galinha e codorna, há imobilização líquida de N no LVA; mineralização líquida de N é verificada no LVdf, para todos os resíduos orgânicos. Em relação às formas de N disponibilizadas pelos resíduos, predomina o N-nitrato, sendo a proporção N-nítrico/N-amoniacal dependente da mistura solo-resíduo estudada. The N mineralization rate varies from one organic residue to another, and depends on the chemical composition of a residue and its interaction with the soil. This study assessed the dynamics of N mineralization of organic residues incubated in Oxisols. The experiment was carried out from July 2007 to April 2008. Samples of manures, sludges, composts, peat, and substrate were incubated in washed sand, in a Red Yellow Latosol (RYL), and in a Red Latosol (RL), with 240 and 670 g kg-1 of clay, respectively. Mineralized N was assessed by measuring the contents of N-NH4+ and N-NO3- in leachates (after 15, 30, 45, 60, 75, 90, 120, 150, 180, 210, 240, and 270 days of incubation). N mineralization occurs at higher rates in the initial periods of incubation and the mineralized N (33 - 199.2 mg kg-1) after 270 days is regulated by the total N and water-soluble carbon contents in organic residue. Regardless of the medium used for incubation, chicken and quail manures resulted in the highest levels of mineralized N in both Oxisols. Aside from quail and chicken manures, the other fertilizers resulted in net immobilization of N in the RYL; all organic residues studied resulted in net N mineralization in the RL. Nitrate is the main N form released by the organic residues; the proportion N-nitrate/N-ammonium depends on the soil-residue mixture.

O objetivo do trabalho foi estudar o ajuste dos modelos não-lineares, gompertz e logístico, na descrição do desenvolvimento de frutos de coqueiro da variedade anão verde, com base nos dados de diâmetros externos, longitudinal e transversal. Os resultados indicaram que tanto para o diâmetro longitudinal externo (DEL) como para o diâmetro transversal externo (DET), o modelo logístico foi o mais adequado na descrição do crescimento do fruto. O ajuste dos modelos, para ambas as variáveis, apresentou autocorrelação residual positiva. Para o DEL o resíduo foi modelado segundo um processo autoregressivo de primeira ordem (AR1) e para a variável DET o processo autoregressivo considerado foi de segunda ordem (AR2). A consideração do processo autoregressivo (AR1 ou AR2) resultou em estimativas dos parâmetros mais precisas. De acordo com o modelo logístico, o fruto do coqueiro anão verde, totalmente desenvolvido, tem diâmetros externos longitudinal e transversal, respectivamente, de 21,56cm e 15,35cm. The aim of this study was to evaluate the quality fit of nonlinear models, gompertz and logistic data outside diameter, longitudinal (DEL) and transverse (DET) fruits of green dwarf coconut trees, as well as verification of the existence of residual autocorrelation. The results showed that for both, DEL and DET, the logistic model is most appropriate for describing the fruits growth. The fit of the models, for both variables, showed positive residual autocorrelation. For DEL, the residual was modeled by a first order autoregressive process, and for DET, the autoregressive process was considered of second order. Consideration of the autoregressive process resulted in more accurate estimates of the parameters. According to the logistic model, the fruit of the dwarf green, fully developed, have external diameters, longitudinal and transverse, respectively, of 21.56cm and 15.35cm.

Dentro do contexto nutricional, a suplementação de microminerais em rações para aves frequentemente é feita em quantidades superiores às exigidas na tentativa de assegurar o bom desempenho dos animais. Os experimentos do tipo dose resposta são muito comuns na determinação de níveis ótimos dos nutrientes na ração e contemplam a utilização de modelos de regressão para atingir tal objetivo. Porém, na análise de regressão usual, geralmente, não se usa uma informação a priori sobre uma possível relação de ordem na variável resposta. A regressão isotônica é um método de estimação por mínimos quadrados que gera estimativas que satisfazem a mesma ordenação dos dados. Na teoria da regressão isotônica, essa informação é utilizada de forma essencial e espera-se que a eficiência do ajuste seja aumentada quando se faz uso dela. Diante do exposto, o presente trabalho tem como objetivo utilizar uma metodologia de regressão isotônica, como uma forma alternativa para analisar dados de deposição de zinco (Zn) na tíbia de aves machos da linhagem Hubbard. No estudo, foram considerados os modelos de platô de resposta polinomial quadrático e não linear exponencial. Além desses modelos, também foi proposto o ajuste de um modelo logarítmico para os dados e a eficiência da metodologia foi avaliada por meio de um estudo de simulação Monte Carlo, considerando diferentes cenários para os valores paramétricos. A isotonização dos dados propiciou uma melhora em todos os avaliadores de qualidade de ajuste considerados no trabalho. Dentre os modelos utilizados, o logarítmico apresentou estimativas dos parâmetros mais coerentes com os valores relatados na literatura, para os dados de deposição de Zn na tíbia de aves machos. Within the nutritional context, the supplementation of microminerals in bird food is often made in quantities exceeding those required in the attempt to ensure the proper performance of the animals. The experiments of type dosage x response are very common in the determination of levels of nutrients in optimal food balance and include the use of regression models to achieve this objective. Nevertheless, the regression analysis routine, generally, uses a priori information about a possible relationship between the response variable. The isotonic regression is a method of estimation by least squares that generates estimates which preserves data ordering. In the theory of isotonic regression this information is essential and it is expected to increase fitting efficiency. The objective of this work was to use an isotonic regression methodology, as an alternative way of analyzing data of Zn deposition in tibia of male birds of Hubbard lineage. We considered the models of plateau response of polynomial quadratic and linear exponential forms. In addition to these models, we also proposed the fitting of a logarithmic model to the data and the efficiency of the methodology was evaluated by Monte Carlo simulations, considering different scenarios for the parametric values. The isotonization of the data yielded an improvement in all the fitting quality parameters evaluated. Among the models used, the logarithmic presented estimates of the parameters more consistent with the values reported in literature.

This study aimed to examine the sensory characteristics of the grains of 21 cultivars of Coffea arabica L. and Coffea canephora Pierre from the essays of genetic improvement of EPAMIG, located in Patrocínio Municipality, Minas Gerais State, where they were collected through cloths stripping method and washed. Subsequently to dry (11 to 12% moisture b.u.), we obtained the coffee designated as "natural". The evaluated varieties were: Acaiá Cerrado MG 1474; Bourbon Vermelho DATERRA; Catiguá MG 1; Catiguá MG 2; Catuaí Amarelo IAC 62; Catuaí Vermelho IAC 15; H 419-3-1-4-2; H 419-6-2 -5-2; H 419-6-2-5-3; H 419-6-2-7-3 Vermelho; H 493-1-2-10; H 514-7-10-1 Vermelho; H 514-7-10-6; H 515-4-2-2; H 518-3-6-1; Icatú Amarelo IAC 3282; Mundo Novo 379-19; Mundo Novo IAC 376-4; Rubi MG 1192; Sacramento MG 1 and Topázio MG 1190, from 2005/2006 and 2006/2007 seasons. The cultivars according to the first principal component with notes above 80 points, regarded as superior drink according to attributes with the highest scores (flavor, sweetness, balance, acidity, clean drink, and aspect) were: Catiguá MG2, Rubi MG 1192, 514-7-10-6 H, H 419-3-1-4-2, H 419-6-2-5-2, 493-1-2-10 H, H 514-7-10-1 Vermelho, Catiguá MG1, Sacramento MG1, 419-6-2-5-3 H, H 515-9-2-2 and Catuaí Amarelo IAC 62. O objetivo deste trabalho foi verificar as características sensoriais dos grãos de 21 cultivares de (Coffea arabica L.) provenientes do ensaio de melhoramento genético da Epamig, Fazenda Experimental de Patrocínio, Estado de Minas Gerais. Posteriormente à secagem (11 a 12% de umidade b.u.), obteve-se o café designado como natural. Os frutos avaliados correspondiam às cultivares e progênies Acaiá Cerrado MG 1474; Bourbon Vermelho DATERRA; Catiguá MG 1; Catiguá MG 2; Catuaí Amarelo IAC 62; Catuaí Vermelho IAC 15; H 419-3-1-4-2; H 419-6-2-5-2; H 419-6-2-5-3; H 419-6-2-7-3 Vermelho; H 493-1-2-10; H 514-7-10-1 Vermelho; H 514-7-10-6; H 515-4-2-2; H 518-3-6-1; Icatu Amarelo IAC 3282; Mundo Novo 379-19; Mundo Novo IAC 376-4; Rubi MG 1192; Sacramento MG 1; Topázio MG 1190, das safras 2005/2006 e 2006/2007. As cultivares, em ordem decrescente segundo a primeira componente principal com notas acima de 80 pontos, portanto consideradas como de bebida superior de acordo com os atributos com os maiores escores (sabor, doçura, balanço, acidez, bebida limpa e aspecto), foram: Catiguá MG2, Rubi MG 1192, H 514-7-10-6, H 419-3-1-4-2, H 419-6-2-5-2, H 493-1-2-10, H 514-7-10-1 Vermelho, Catiguá MG1, Sacramento MG1, H 419-6-2-5-3, H 515-9-2-2 e Catuaí Amarelo IAC 62.

O objetivo desta pesquisa consistiu em avaliar a formação de biofilme em aço inoxidável por Aeromonas hydrophila e Staphylococcus aureus usando leite e diferentes condições de cultivo. As variáveis em estudo consistem no cultivo monoespécie e combinado, dos referidos microrganismos e nas temperaturas de 4, 7 e 18 °C. Recipientes contendo 1000 mL de leite, densidade populacional de 10(5) UFC.mL-1 de cada microrganismo e 10 cupons de aço inoxidável (10 × 20 mm) foram lacrados e armazenados, sob agitação de 60 rpm, por um período de 10 dias. As análises ocorreram a cada 48 horas. Células sésseis de A.hydrophila e S. aureus foram enumeradas através do plaqueamento seletivo em ágar m-Aeromonas selective e Baird-Parker, respectivamente. Estudos sobre o tempo de geração, enumeração de células planctônicas e observação dos cupons através da microscopia eletrônica de varredura foram conduzidos. S. aureus, em monocultivo, formou biofilme a 18 °C e a 7 °C. Para 4 °C, foi observado um processo de adesão. A presença de A. hydrophila reduziu o desempenho de S. aureus. Nesta condição de cultivo multiespécie houve formação de biofilme a 18 °C. A. hydrophila, tanto em monocultivo quanto em presença de S. aureus, formou biofilme em todas as condições pesquisadas. The aim of this research was to verify the capability of biofilm formation on stainless steel by Aeromonas hydrophila and Staphylococcus aureus using milk and different conditions of cultivation. The variables consisted in mono and multi-species cultivation of these microorganisms and in the temperatures of 4, 7 and 18 °C. Containers containing 1000 mL of milk, population density of 10(5) CFU.mL-1 of each microorganism, and ten suspended chips of stainless steel AISI 304 (10 × 20 mm) were used to seal up and storage, under 60 rpm of agitation for 10 days. The analyses were conducted every 48 hours. Sessile cells of A. hydrophila and S. aureus and were enumerated by plating in m-Aeromonas selective agar and Baird-Parker agar. Complementary studies included the generation time calculation, enumeration of planktonic cells, and visualization of chips by scanning electron microscopy. S. aureus, in mono-cultivation, formed biofilm at 18 °C and at 7 °C. At 4 °C was observed attachment. The presence of A. hydrophila reduced the performance of S. aureus. In this condition, S. aureus formed biofilm at 18 °C. A. hydrophila formed biofilm under all conditions.

Neste estudo, utilizou-se a metodologia bayesiana para ajustar os modelos de ORSKOV & MCDONALD (1979) e MCDONALD (1981) a conjuntos de dados simulados e a um conjunto de dados de porcentagem de degradação da fibra em detergente neutro da gramínea coastcross (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfuensis), ao longo do tempo. As amostras das distribuições marginais a posteriori dos parâmetros foram obtidas por meio dos métodos de Monte Carlo com cadeias de Markov (MCMC), especificamente, os algoritmos Amostrador de Gibbs e Metropolis-Hastings. A metodologia bayesiana mostrou-se eficiente, sendo avaliada e comprovada pelo estudo de simulação, que apresentou estimativas bem próximas ao valor paramétrico. As estimativas obtidas para os parâmetros dos modelos por meio da abordagem bayesiana mostraram-se bastante coerentes com os valores relatados na literatura. O modelo de Orskov e McDonald foi mais plausível que o modelo de McDonald na descrição dos dados de degradação. The bayesian methodology was used to estimate the parameters of ORSKOV & MCDONALD (1979) and MCDONALD (1981) models. A study was conducted by using both simulated and real data percentage of coastcross grass (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfuensis) fiber degradation with neutral detergent fiber degradation over the time. The posterior marginal samples distributions for the parameters were obtained by Gibbs Sampler and Metropolis-Hastings algorithms. The bayesian approach, evaluated and verified by the simulation studied, has proved to be efficient and the parameter estimated were quite close to the parametric values. The parameters estimated for both models using bayesian approach from real data were fairly consistent with the values reported in the literature. The Orskov and McDonald model was more plausible than the description degradation data made by the McDonald model.

O presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito de dois métodos de abate (MA) e do sexo sobre a qualidade de carne de capivaras. Os métodos de abate avaliados foram o humanitário (MH) e por tiro (MT), sendo utilizados 2 lotes de 10 animais, um deles contendo 5 machos e 5 fêmeas e outro com 8 machos e 2 fêmeas, nos quais foram avaliados os valores de pH na 1ª, 3ª, 5ª, 7ª, 9ª, 11ª e 24ª horas após o abate e a perda de peso por cozimento (PPC), a cor e a força de cisalhamento (FC), em porções do músculo longissimus dorsi, retiradas entre a 10ª e 12ª vértebras. Os resultados obtidos indicaram que as médias de pH não foram influenciadas pelo MA e pelo sexo. Os valores médios foram: 6,24; 6,05; 6,01; 6,01; 6,03; 6,04 e 5,96 às 1, 3, 5, 7, 9, 11 e 24 horas, respectivamente. Em relação à cor, o MT apresentou valor de L* (32,40) superior (P

A teoria clássica dos modelos de regressão é baseada na média da distribuição da variável resposta. Em comparação aos métodos convencionais, a regressão quantílica pode caracterizar toda a distribuição da variável dependente, por meio da análise de diferentes quantis. Baseada na minimização dos erros absolutos e pertencente a uma família de modelos robustos, essa metodologia não impõe nenhuma suposição distributiva sobre o erro do modelo, exceto exigir que este tenha um quantil condicional igual a zero, sendo eficiente na estimação dos parâmetros, mesmo em casos de assimetria ou heterogeneidade de variâncias. Os objetivos do presente trabalho foram analisar a metodologia dos modelos de regressão quantílica, bem como avaliar e motivar seu uso em dados de crescimento. Com essa finalidade, foi realizada uma aplicação da metodologia apresentada utilizando dados referentes a pesos em kg de 28 bezerros, por um período de 26 semanas após o nascimento. Esse conjunto apresenta heterogeneidade de variâncias ao longo do tempo e leve assimetria. A regressão quantílica mostrou-se adequada para descrever o peso como uma função do tempo, e para compreender como o tempo afeta sua variação e assimetria. Por meio das curvas de crescimento em diferentes quantis, foi possível classificar os bezerros em grupos de diferentes potenciais de crescimento e identificar animais com padrões de crescimentos distintos, como menores e maiores pesos corporais ao longo do tempo. The classical theory of regression models is based on the mean of the response variable distribution. In comparison to conventional methods, quantile regression can characterize the entire distribution of the dependent variable, through the analysis of different quantiles. Based on the minimization of absolute errors and belonging to a family of robust models, this methodology does not impose any distributive assumption about the model error, except requiring that it has a conditional quantile equal to zero, being efficient in estimating parameters, even in cases asymmetry or heterogeneity of variances. The objectives of the present work were to analyze the methodology of the quantile regression models, as well as to evaluate and motivate its use in growth data. For this purpose, an application of the presented methodology was carried out using data referring to weights in kg of 28 calves, for a period of 26 weeks after birth. This set presents heterogeneity of variances over time and slight asymmetry. Quantile regression proved to be adequate to describe weight as a function of time, and to understand how time affects its variation and asymmetry. Through growth curves in different quantiles, it was possible to classify calves into groups of different growth potentials and to identify animals with different growth patterns, such as lower and higher body weights over time.

Neste trabalho, apresentamos os modelos de regressão spline de nós-livres como uma alternativa aos modelos não lineares utilizados em curvas de crescimento multifásico. Estudaremos o algoritmo de busca cega a través da seção dourada para escolher a melhor quantidade de nós e suas respectivas localidades. O pacote freeknotspline do software livre R foi utilizado para ajustar os modelos propostos. O critério de informação de Akaike foi usado para escolher o melhor modelo para diferentes graus do polinômio associados ao spline. Estudos de simulação foram realizados para entender melhor a posição dos nós, localidade e grau do polinômio relacionado aos modelos de regressão spline de nós-livres e como isto pode afetar a qualidade de ajuste do modelo. Com base no nosso estudo de simulação, propomos uma forma empírica de determinar o numero de nós, deixando que o algoritmo de busca escolha a posição dos nós. A metodologia é aplicada aos dados de crescimento multifásico de vacas da raça Hereford. In this work, we present the free-knot spline regression models as an alternative to the nonlinear models used in multiphase growth curves. We will study the blind search algorithm through the gold section to choose the best number of knot and their respective locations. The package freeknotspline of the free software R was used to fit the proposed models. The Akaike information criterion was used to choose the best model for different degrees of the polynomial associated with the spline. Simulation studies were performed to better understand the position of the knot, location and degree of the polynomial related to spline regression models of free-knots, and how this may affect the goodness of fit of the model. Based on our simulation study, we propose an empirical way of determining the number of knots, letting the search algorithm choose the position of the knots. The methodology is applied to the multiphase growth data of Hereford breed females.

A introdução de sistemas automáticos de pesagem tem possibilitado a mensuração do peso vivo em tempo real, sem a necessidade de remover os animais de piquetes e manejá-los em currais com tronco de contenção e balanças. Embora estes equipamentos estejam disponíveis, sua contribuição para tomadas de decisões e gestão da produção de bovinos de corte é ainda pequena, principalmente em função de seu custo e da falta do desenvolvimento de metodologias para processamento e análise do volume de dados produzido. Neste contexto, o presente estudo teve como objetivo central testar e propor metodologias de análise para os dados de peso vivo provenientes de sistemas automáticos de pesagem, que possibilitem a percepção das relações não lineares entre o desempenho dos animais e o tempo. Para isso, este estudo foi subdividido em duas etapas: i) a primeira caracterizou-se pela avaliação do uso do sistema de plataformas de pesagem corporal automática (modelo VW 1000, Intergado®, Brasil) em fazenda comercial de bovinos Nelore P.O., sendo verificado a coerência biológica dos dados e analisado o grau de concordância entre este sistema e o sistema convencional de pesagem. ii) A segunda etapa caracterizou-se pela busca de ferramentas computacionais que permitissem mensurar o ganho de peso diário de modo a acompanhar suas variações em tempo real. Para isso, dois métodos de suavização foram analisados: a) Suavizador de gráfico de dispersão localmente ponderado (do inglês, Locally-Weighted Scatterplot Smoother, LOWESS) e b) B-spline penalizada (do inglês, Penalized B-splines, PB-splines). Ambos os métodos apresentaram bons ajustes aos dados de peso vivo, mas LOWESS estimou curvas menos suaves, as quais resultaram, por sua vez, em trajetórias de ganho de peso com maior variabilidade. Por outro lado, o método de suavização PB-splines estimou curvas com estruturas mais rígidas às flutuações que ocorrem com o peso vivo, não distorcendo, porém, a relação de dependência entre as variáveis. Assim, o presente estudo possibilitou afirmar que sistemas automáticos de pesagem, quando integrados aos métodos de suavização de dados aqui explorados, permitem estimar a relação entre o peso vivo e o tempo sem o estabelecimento prévio de uma função. Com isso, permitem também a construção de trajetórias de ganho de peso diário passíveis de serem utilizadas para a identificação de problemas tanto de lote quanto de indivíduos. As ferramentas aqui exploradas poderão auxiliar os futuros estudos de identificação das variações do ganho de peso inerentes aos animais ou ao ambiente, permitindo, assim, melhorar a identificação de problemas em sistemas de pecuária de precisão. The introduction of automatic weighing systems presents opportunities to record cattle body weight multiple times per day without the need to remove them from pens or paddocks and handling them in squeeze-chute equipped with static weighing systems. Although these systems are available, its contribution to decision making in beef cattle management is still rather small. This area remains uninvestigated partially because the steps to data processing and analysis are not well defined, reducing the potential of this system to monitoring changes in animal performance. In this context, the main objective of this study was to develop an approach for analyzing the body weight records by an automatic weighing system that describes and shows the nonlinearity of the animal performance as a function of time. For this, the study was subdivided in two steps; First, daily body weight of Nelore cattle were collected in a commercial farm and analyzed in relation its biological coherence and to understand the agreement of such weighing systems to the conventional system. Second, characterization was performed, by the search for computational tools that allowed to measure the daily weight gain to follow its real variations. For this, two smoothing techniques were analyzed: a) Locally-Weighted Scatterplot Smoother (LOWESS), and b) penalized B-spline (PB-spline). Both techniques fitted well the body weight data, but LOWESS estimated curves less smoothed, which resulted in daily body weight gain trajectories with greater variability. On the other hand, the penalized PB-spline estimated curves that had structures more rigid to fluctuations that occur with body weight. But the form of the regression function not distorted the dependence relationship between the two variables. Thus, the present study concluded that automatic weighing systems when integrated with the smoothing techniques used allowed us to estimate the structural form between body weight and time without the reference to a specific model. Hence, it allowed the construction of daily weight gain trajectories that may be used to identify problems in pens or in individual animals. The tools used here may help future studies to identify the inherent and unnatural variations of daily weight gain, thus improving the efficiency of identifying problems in animal performance.

Estudos para estabelecer níveis de nutrientes adequados em dietas de animais são bastante comuns no meio científico. Tais estudos são realizados utilizando a média da variável resposta nos diferentes níveis da variável independente e, geralmente, por meio de abordagem frequentista. Sendo assim, muita informação é perdida ou até mesmo as médias influenciadas por valores extremos nos resultados das repetições. O objetivo do presente trabalho foi realizar um estudo de simulação de modelos de regressão com platô de resposta, considerando diversos cenários de diferentes tamanhos amostrais, além da homogeneidade e heterogeneidade de variância entre níveis do fator dosagem levando em consideração as repetições em cada dosagem, por meio de abordagem bayesiana. Também foi realizado ajustes dos modelos de regressão quadrático com platô de resposta e do não linear com platô de resposta utilizando a metodologia bayesiana para estimar os parâmetros dos modelos. Os dados simulados representavam o teor de Zinco (Zn) depositado na tíbia de frangos, que receberam as dosagens 0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105 e 120 ppm de Zn na ração. Nos cenários 1, 2 e 3 foi atribuído variância constante, com tamanhos amostrais de n=16, n=30 e n=100, respectivamente. Nos cenários 4, 5 e 6, foram considerados também os tamanhos amostrais n=16, n=30 e n=100, respectivamente, mas com diferentes variâncias ao longo do fator dose. Os dados utilizados para o estudo sobre os modelos de regressão com platô de resposta são referentes ao teor de Zinco (Zn), em ppm, na tíbia de frangos e frangas de corte como variável resposta. A análise de simulação mostrou que é adequada a utilização dos modelos com platô de resposta considerando a repetição das amostras em cada dose para estimar o nível adequado de um nutriente na ração animal. No ajuste dos modelos aos dados reais, o modelo de regressão quadrático com platô de resposta considerando a heterogeneidade de variâncias foi o que apresentou melhor ajuste, em que obteve-se uma estimativa de x̂0 = 73, 26 ppm para o nível de Zn aplicado na ração para uma deposição de Zn na tíbia dos frangos de P̂ = 290, 12 ppm. Studies to establish adequate levels of nutrients in animal diets are quite common in the scientific world. Such studies are performed using the mean of the response variable in the different levels of the independent variable and, generally, through a frequentist approach. Thus, much information is lost or even the means influenced by extreme values in the results of the repetitions. The objective of the present work was to perform a simulation study of regression models with response plateau, where as different scenarios of different sample sizes, besides the homogeneity and heterogeneity of variance between levels of the dosage factor taking the repetitions in each dosage into account, through Bayesian approach. Fits were also made to the quadratic regression models with response plateau and nonlinear regression with response plateau using Bayesian methodology to estimate the parameters of the models. The simulated data represented the zinc content (Zn) deposited in the tibia of broilers, which received the dosages 0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105 and 120 ppm of Zn in the feed. In the scenarios 1, 2 and 3 were attributed constant variance with sample sizes of n = 16, n = 30 and n = 100, respectively. In the scenarios 4, 5 and 6 the sample sizes were, respectively, n = 16, n = 30 and n = 100, but with different variances along the dose factor. The data used for the study on the regression models with response plateau refer to the Zn content, in ppm, in the tibia of male and female broilers as response variable. The simulation analysis showed that it is appropriate to use the models with response plateau considering the repetition of the samples at each dose to estimate the adequate level of a nutrient in the animal feed. In the fit of the models to the real data, the quadratic regression model with response plateau considering the heterogeneity of variances was the one that presented the best fit, which an estimate of x̂0 = 73.26 ppm for the level of Zn applied to the feed for a Zn deposition in the chicken tibia of P̂ = 290.12 ppm.

Understanding the causal architecture underlying complex systems biology has a great value in agriculture production for the development of optimal management strategies and selective breeding. So far, most studies in this area use only prior knowledge to propose causal networks and/or do not consider the possible genetic confounding factors on the structure search, which may hide important relationships among phenotypes and also bias the resulting inferred causal network. In this dissertation, we explore many structural learning algorithms and present a new one, called PolyMaGNet (Polygenic traits with Major Genes Network analysis), to search for recursive causal structures involving complex phenotypic traits with polygenic inheritance and also allowing the possibility of major genes affecting the traits. Briefly, a multiple-trait animal mixed model is fitted using a Bayesian approach considering major genes as covariates. Next, posterior samples of the residual covariance matrix are used as input for the Inductive Causation algorithm to search for putative causal structures, which are compared to each other using the Akaike information criterion. The performance of PolyMaGNet was evaluated and compared with another widely used approach in a simulated study considering a QTL mapping population. Results showed that, in the presence of major genes, our method recovered the true skeleton structure as well as the causal directions with a higher rate of true positives. The PolyMaGNet approach was also applied to a real dataset of an F2 Duroc × Pietrain pig resource population to recover the causal structure underlying on carcass, meat quality and chemical composition traits. Results corroborated with the literature regarding the cause-effect relationships between these traits and also provided new insights about phenotypic causal networks and its genetic architectures in complex systems biology. Compreender a arquitetura causal subjacente à sistemas biológicos complexos é de grande valia na produção agrícola para o desenvolvimento de estratégias de manejo e seleção genética. Até o momento, a maior parte dos estudos neste contexto utiliza apenas conhecimento prévio para propor redes causais e/ou não considera fatores de confundimento genético na busca de estruturas, fato que pode ocultar relações importantes entre os fenótipos e viesar inferências sobre a rede causal. Nesta tese, exploramos alguns algoritmos de aprendizagem de estruturas e apresentamos um novo, chamado PolyMaGNet (do inglês, Polygenic traits with Major Genes Network analysis), para buscar estruturas causais recursivas entre características fenotípicas poligênicas complexas e permitindo, também, a possibilidade de efeitos de genes maiores que as afetam. Resumidamente, um modelo misto de múltiplas características é ajustado usando abordagem Bayesiana considerando os genes maiores como covariáveis no modelo. Em seguida, amostras posteriores da matriz de covariância residual são usadas como entrada para o algoritmo de causação indutiva para pesquisar estruturas causais putativas, as quais são comparadas usando o critério de informação de Akaike. O desempenho do PolyMaGNet foi avaliado e comparado com outra abordagem bastante utilizada por meio de um estudo simulado considerando uma população de mapeamento de QTL. Os resultados mostraram que, na presença de genes maiores, o método PolyMaGNet recuperou a verdadeira estrutura do esqueleto, bem como as direções causais, com uma taxa de efetividade maior. O método é ilustrado também utilizando-se um conjunto de dados reais de uma população de suínos F2 Duroc × Pietrain para recuperar a estrutura causal subjacente à características fenotípicas relacionadas a qualidade da carcaça, carne e composição química. Os resultados corroboraram com a literatura sobre as relações de causa-efeito entre os fenótipos e também forneceram novos conhecimentos sobre a rede fenotípica e sua arquitetura genética.

Modelos não lineares como o Logístico e o Gompertz são amplamente usados para descrever vários processos biológicos por meio da curva de crescimento dada pela equação do modelo. O objetivo deste trabalho foi ajustar o modelo Chanter, assim como o Logístico e o Gompertz, utilizando um conjunto de dados do fruto do cacaueiro. O modelo Chanter é um híbrido entre o modelo Logístico e o modelo Gompertz cujos parâmetros podem ser interpretados similarmente. A comparação sobre a qualidade do ajuste entre os modelos foi feita utilizando as seguintes medidas estatísticas: o critério de informação de Akaike (AIC), o critério Peso de Akaike, o critério de informação de Bayes (BIC), o desvio padrão residual (DPR) e as medidas de não linearidade vício de Box e curvatura de Bates e Watts além de um estudo de simulação. Verificou-se que o modelo Chanter dentre os modelos estudados neste trabalho é o mais adequado para o ajuste dos dados do fruto do cacaueiro. Nonlinear models such as Logistic and Gompertz are widely used to describe several biological processes using a growth curve given by the equation of the model. The objective of this work was to adjust the Chanter model, as well as the Logistic and the Gompertz, using a data set of cocoa fruit. The Chanter model is a hybrid between the Logistic model and the Gompertz model whose parameters can be interpreted similarly. A comparison of the quality of fit between the models was made using the following statistical measures: the Akaike information criterion (AIC), the Akaike weight criterion, Bayes information criterion (BIC), residual standard deviation (RSD), and measures of non-linearity Box addiction and Bates and Watts curvature as well as a simulation study. It was verified that the Chanter model is the most suitable one among the studied models for modeling the cocoa data.

Atualmente o Brasil é o quinto maior produtor de cacau no mundo e a sua produção está diretamente ligada ao ponto certo da colheita, colher frutos verdes ou verdoengos faz com que suas sementes tenham menor peso, em 1000 frutos maduros as amêndoas secas pesam em média 40 kg, colher frutos verdoengos, ou seja, frutos que estão parcialmente maduros, faz com que esse peso caia para 36 kg em média uma perda verificada de 10%, já quando os frutos estão verdes o peso passa a ser em média de 32 kg, possuindo uma perda de 20%, por isso é importante conhecer as fases de crescimento, que permite estabelecer formas adequadas de manejo, adubação e irrigação. Dentre as características biométricas do fruto do cacaueiro as que tem maior relevância econômica são o comprimento, o diâmetro e o volume. Uma forma de explicar relações de crescimento e produtividade de plantas, árvores, frutos ou animais é por meio da utilização de modelos de crescimento, pois possuem parâmetros com interpretação biológica. Os mais utilizados nestas áreas são os modelos: Logístico, Gompertz, Von Bertalanffy, Richards e Brody, sendo os dois últimos mais utilizados para descrever o crescimento animal. O objetivo do trabalho é avaliar a qualidade de ajuste e de predição dos modelos não lineares, Logístico, Gompertz e Von Bertalanffy, para medidas de comprimento e diâmetro do fruto do cacau, com a finalidade de predizer o seu volume. Para predizer o volume do fruto foi utilizado a fórmula de volume do esferoide prolato. Os critérios AIC e BIC foram utilizados para verificar qual dos modelos se ajusta melhor à essas medidas, já para verificar qual modelo se ajusta melhor na predição do volume do fruto, foram relacionadas as estatísticas: viés médio, índice de concordância, eficiência da modelagem e o desdobramento do quadrado médio do erro de predição. Currently Brazil is the fifth largest producer of cocoa in the world and its production is directly linked to the right point of harvest, harvesting green or green fruits makes their seeds have less weight, in 1000 mature fruits dry almonds weight on average 40 kg, harvested green fruits, that is, fruits that are partially ripe, causes this weight to fall to 36 kg on average a verified loss of 10%, when the fruits are green the weight becomes an average of 32 kg, with a loss of 20%, so it is important to know the growth phases, which allows to establish appropriate forms of management, fertilization and irrigation. Among the biometric characteristics of the cacao fruit, the most economically important are length, diameter and volume. One way to explain growth and productivity relationships of plants, trees, fruits or animals is through the use of growth models, since they have parameters that with biological interpretation are the most used in these areas: Logistics, Gompertz, Von Bertalanffy, Richards and Brody, the last two being most used to describe animal growth. The objective of this work is to evaluate the quality of fit and prediction of the non linear models, Logistic, Gompertz and Von Bertalanffy, for measures of length and diameter of the fruit of the cocoa, in order to predict its volume. To predict the volume of the fruit, the volume formula of the prolate spheroid was used. The AIC and BIC criteria were used to verify which model best fits these measures, and to verify which model best fits the fruit volume prediction, the statistics were related: mean bias, concordance index, modeling efficiency, and the unfolding of the mean square of the prediction error.

As distribuições de probabilidade gama, normal inversa, Weibull, log-normal e exponencial são uma boa alternativa para modelar observações associadas ao tempo, pois, em geral, a variável tempo possui assimetria à esquerda ou à direita, o que caracteriza as distribuições citadas anteriormente. O objetivo deste trabalho constitui-se em avaliar o comportamento dos predadores, Euborellia annulipes (\"Tesourinha\") e Harmonia axyridis (\"Joaninha\"), em relação à praga conhecida como Aphis gossypii (\"Pulgão\"). Outra pretensão deste trabalho é a aplicação da modelagem estatística, dando ênfase as técnicas dos modelos lineares generalizados e análise de sobrevivência, as quais foram aplicadas aos dados provenientes de um experimento, instalado no Laboratório de Ecologia de Insetos da Escola Superior de Agricultura \"Luiz de Queiroz\" (ESALQ). O experimento foi composto por 21 repetições, sendo cada repetição efetuada por meio de uma placa de Petri medido 60 X 15 mm. Em cada placa foi liberado um pulgão adulto áptero na parte central, tendo três pesquisadores responsáveis por observar a varável definida como tempo de ataque. Inicialmente, foram ajustados os modelos com distribuição gama e diferentes funções de ligação, e o modelo com a distribuição normal inversa com função de ligação canônica. Esses modelos foram ajustados aos dados desconsiderando as censuras, em que por meio do gráfico half-normal plot e testes de hipóteses, verificou que o modelo com a distribuição normal inversa com função de ligação canônica, apresentou o melhor ajuste. Posteriormente, foram ajustados os modelos exponencial, Weibull e log-normal para os dados considerando as censuras, os quais foram avaliados mediante o teste de razão de verossimilhança, sendo o modelo log-normal mais apropriado aos dados. The probability density function of gamma, inverse normal, Weibull, log-normal and exponential distributions are good alternatives for modelling observations related with time, since, in general, the time variable has left or right asymmetry, which characterizes the distributions previously mentioned . The aim of this work is the application of statistical modeling, emphasizing the techniques of generalized linear models and survival analysis, which were applied to data from an experiment, installed in the Laboratory of Insect Ecology of the \"Luiz de Queiroz\" College of Agriculture (ESALQ), in which the goal of this experiment was to evaluate the behavior of predators, Euborellia annulipes (\"ring-legged earwig\") and Harmonia axyridis (\"Ladybird\"), in relation to the pest known as Aphis. The experiment was composed of 21 replicates, each replicate being done by means of a petri dish measured 60 X 15 mm. On each plate an adult aphid was released in the central part, with three researchers responsible. The model with distribution was used to determine the variance, which was defined as the attack time. Normal distribution with canonical link function. These models were adjusted to the data disregarding censorship, in which through the half-normal plot and hypothesis tests, verified that the model with the normal inverse distribution with canonical link function, presented the best fit. Subsequently, the exponential, Weibull and log-normal models were adjusted for the data considering the censorship, which were evaluated by the likelihood ratio test, the log-normal model being more appropriate to the data.

Processos estocásticos complexos são muitas vezes utilizados em modelagem, com o intuito de capturar uma maior proporção das principais características dos sistemas biológicos. A descrição do comportamento desses sistemas tem sido realizada por muitos amostradores baseados na distribuição a posteriori de Monte Carlo. Modelos probabilísticos que descrevem esses processos podem levar a funções de verossimilhança computacionalmente intratáveis, impossibilitando a utilização de métodos de inferência estatística clássicos e os baseados em amostragem por meio de MCMC. A Computação Bayesiana Aproximada (ABC) é considerada um novo método de inferência com base em estatísticas de resumo, ou seja, valores calculados a partir do conjunto de dados (média, moda, variância, etc.). Essa metodologia combina muitas das vantagens da eficiência computacional de processos baseados em estatísticas de resumo com inferência estatística bayesiana uma vez que, funciona bem para pequenas amostras e possibilita incorporar informações passadas em um parâmetro e formar uma priori para análise futura. Nesse trabalho foi realizada uma comparação entre os métodos de estimação, clássico, bayesiano e ABC, para estudos de simulação de modelos simples e para análise de dados de dinâmica populacional. Foram implementadas no software R as distâncias modular e do máximo como alternativas de função distância a serem utilizadas no ABC, além do algoritmo ABC de rejeição para equações diferenciais estocásticas. Foi proposto sua utilização para a resolução de problemas envolvendo modelos de interação populacional. Os estudos de simulação mostraram melhores resultados quando utilizadas as distâncias euclidianas e do máximo juntamente com distribuições a priori informativas. Para os sistemas dinâmicos, a estimação por meio do ABC apresentou resultados mais próximos dos verdadeiros bem como menores discrepâncias, podendo assim ser utilizado como um método alternativo de estimação. Complex stochastic processes are often used in modeling in order to capture a greater proportion of the main features of natural systems. The description of the behavior of these systems has been made by many Monte Carlo based samplers of the posterior distribution. Probabilistic models describing these processes can lead to computationally intractable likelihood functions, precluding the use of classical statistical inference methods and those based on sampling by MCMC. The Approxi- mate Bayesian Computation (ABC) is considered a new method for inference based on summary statistics, that is, calculated values from the data set (mean, mode, variance, etc.). This methodology combines many of the advantages of computatio- nal efficiency of processes based on summary statistics with the Bayesian statistical inference since, it works well for small samples and it makes possible to incorporate past information in a parameter and form a prior distribution for future analysis. In this work a comparison between, classical, Bayesian and ABC, estimation methods was made for simulation studies considering simple models and for data analysis of population dynamics. It was implemented in the R software the modular and maxi- mum as alternative distances function to be used in the ABC, besides the rejection ABC algorithm for stochastic differential equations. It was proposed to use it to solve problems involving models of population interaction. The simulation studies showed better results when using the Euclidean and maximum distances together with informative prior distributions. For the dynamic systems, the ABC estimation presented results closer to the real ones as well as smaller discrepancies and could thus be used as an alternative estimation method.

Sistemas intensivos de produção de peixes demandam o uso de dietas completas e manejo alimentar e nutricional precisos. O principal objetivo da nutrição dos peixes é melhorar a eficiência da utilização da energia e dos nutrientes da ração. Alta eficiência, na realidade, significa maior retenção de nutrientes e energia, i.e., maior crescimento, com menor descarga de nutrientes nos corpos d\'água. O objetivo deste trabalho foi estudar a eficiência de utilização da energia e a proteína da ração para o pacu, Piaractus mesopotamicus. Em um primeiro ensaio foram caracterizadas as propriedades físicoquímicas e os coeficientes de digestibilidade aparente da proteína e da energia de 28 amostras de rações para peixes onívoros comercializadas na região de Piracicaba, estado de São Paulo. Os dados obtidos foram utilizados no ajuste de modelos de regressão linear múltipla para predizer os conteúdos de energia digestível (ED) e proteína digestível (PD) das rações comerciais para a espécie. Uum segundo grupo de ensaios foi dedicado ao estudo da eficiência metabólica da utilização da energia e da proteína. Utilizando-se a técnica de respirometria de fluxo intermitente, foi quantificada a taxa metabólica padrão em peixes de diferente tamanho (17 g - 1050 g) em cinco temperaturas (19, 23, 26, 29 e 33°C). O coeficiente oxi-calórico para oxidação de gordura (13,72 J mg-1 O2) foi utilizado para converter os dados de consumo de oxigênio em taxas de produção de calor. O coeficiente alométrico da produção de calor em jejum foi próximo a 0,8, valor usual para outras espécies de peixes. A partir da aplicação do método fatorial de análise foram estimadas as exigências de energia digestível e proteína digestível para mantença e para o crescimento do pacu e o efeito do nível de lipídeos dietéticos (alto - AL, ou baixo - BL) sobre as exigências nutricionais. O nível de lipídeos da ração não influenciou a estimativa de exigência de energia para mantença (26,57 kJ de ED kg-0,8 dia-1 e 0,076 g de PD kg-0,7 dia-1). A exigência de energia digestível para crescimento (kJ de ED por kJ de energia retida) foi maior para a ração BL (1,387) do que para a ração AL (1,285). A exigência em proteína digestível (g de PD por g de proteína depositada) foi maior para peixes alimentados com a ração BL do que com a ração AL (1,7015 vs. 1,583). Intensive fish farming systems entail the use of complete feeds and accurate feeding and nutrition management. The main objective of fish feeding and nutrition practices is the efficient use of feed energy and nutrients. High efficiency actually means increased retention of nutrients and energy, i.e., improved growth ratio and reduced discharge of nutrients in the water. This work aimed at studying the efficiency of use of feed energy and protein of pacu, Piaractus mesopotamicus. A first trial characterized physicochemical properties and apparent digestibility coefficients of protein and energy of 28 commercial, omnivorous fish feeds sampled in the region of Piracicaba, state of São Paulo. The data were used to set multiple linear regression models predicting the digestible energy (DE) and digestible protein (DP) contents of commercial, sampled feeds. A second group of trials studied the metabolic efficiency of use of energy and protein. The intermittent flow respirometry technique was used to quantify the standard metabolic rate of different fish size classes (17 g - 1050 g) at five temperatures (19, 23, 26, 29 and 33 ° C). The coefficient for oxy-caloric fat oxidation (13.72 J mg-1 O2) was used to convert the oxygen consumption data to heat production ratios. The allometric coefficient of heat production in fasting condition was 0.8, a typical value for other fish species. Digestible energy and digestible protein requirements for maintenance and growth and effects of dietary lipids (high - AL, or low - BL) contents on nutritional requirements of pacu were then studied with the aid of factorial analysis method. Dietary lipid contents did not affect energy requirements for maintenance (26.57 kJ DE kg-0.8 day-1 and 0.076 g DP kg-0.7 day-1). The digestible energy requirement for growth (kJ of ED per kJ of energy retained) was higher for BL feeds (1.387) than for AL feeds (1.285). The requirements of digestible protein (g DP per g of deposited protein) was higher for the BL than for the AL feed (1.7015 vs. 1.583).

Por meio do monitoramento da evolução da temperatura da mistura cimento-madeira, pode-se utilizar esta informação como uma série temporal. O objetivo deste estudo foi utilizar modelos de séries temporais para descrever as séries de temperatura do experimento constituído por diferentes espécies associadas a resíduos de Candeia na produção de painéis particulado e compara-las duas a duas para averiguar se foram geradas pelo mesmo processo estocástico. Inicialmente foi realizado um estudo para avaliar a estacionariedade das séries utilizando o correlograma e o teste da raiz unitária de Dickey-Fuller, na qual todas as séries apresentaram não estacionariedade, para o tratamento de 25% Candeia e Eucalipto com tratamento prévio de água foi dita uma série I(2) e pelos critérios AIC, BIC e MAPE o melhor modelo foi ARIMA(2, 2, 2), para o tratamento de 50% Candeia e Eucalipto também com tratamento prévio de água foi dita uma série I(1) e pelos critérios o melhor modelo foi ARIMA(4, 2, 2), para o tratamento de 75% Candeia e Eucalipto com tratamento prévio de água foi dita uma série I(1) com o modelo ARIMA(5, 1, 0), e para o tratamento de 25% Candeia e Eucalipto sem tratamento prévio de água foi dita uma série I(1) com o modelo ARIMA(2, 1, 2). Em relação à comparação das séries temporais contempladas neste trabalho é possível concluir que as mesmas são diferentes entre si, ou seja, não foram geradas pelo mesmo processo estocástico. By monitoring the temperature evolution of the cement-wood mixture, one can utilize this information as a time series. The objective of this study was to utilize time series models to describe the temperature series from an experiment, consisting of different species associated to Candeia residuals in the production of particleboard panels, and do a pairwise comparison to verify if they were generated from the same stochastic process. Initially it was realized the Dickey-Fuller unit root test to verify series stationarity, which indicated that all series were not stationary. For the 25% Candeia and Eucalyptus treatment with previous water treatment the series was best modelled by an ARIMA(2, 2, 2) as evidenced by the AIC, BIC and MAPE criteria. For the 50% Candeia and Eucalyptus treatment also with previous water treatment the series was best modelled by an ARIMA(4, 2, 2) as indicated by the same criteria. Finally for the 75% Candeia and Eucalyptus treatment with previous water treatment and the 25% Candeia and Eucalyptus treatment without previous water treatment the best models were the ARIMA(5, 1, 0) and the ARIMA(2, 1, 2) respectively. In relation to the comparison of the time series contemplated in this study it is possible to conclude that they are different, that is, they were not generated by the same stochastic process.