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Natural microbial communities can often be spatially structured, with different species that interact and grow in a heterogeneous manner. Even among clonal colonies, nutrient uptake, inhibitory chemicals excretion or chemical communication considerably affect the individual cell microenvironment leading to cell-to-cell phenotypic differentiation. In both microbial ecology and evolution, spatial organization plays a key role in the population fate. While recent works are progressing in the rational design of microbial communities, there are few established methodologies to control, especially spatially, the functioning and development of microbial ecosystems. My PhD aims to get new insights in the role of spatial organisation in the interactions of microbial communities.To this end I designed and optimised a Saccharomyces cerevisiae yeast strain for optogenetic control of the SUC2 invertase production, allowing to induce the local production of public goods with blue light. I built a custom experimental device to create with light and observe through time patterns of cooperator/cheater cells and used it to investigate the influence of spatial organisation on the development of such consortia. I found that this cooperator/cheater consortium acts as a spatial bandpass filter, filtering out short spatial fluctuations of cheater/cooperator phenotypes but also large areas of identical phenotypes. The results presented in this work show the importance of the spatiotemporal structuration in a cooperative system, due to gradients of diffusive molecules and phenotypic heterogeneity in the cell population. This represents a step toward better characterisations of microbial interaction length scales which can serve to deepen our understanding of natural microbiomes and to help designing synthetic ones.; Les communautés microbiennes naturelles sont souvent structurées spatialement, avec différentes espèces qui interagissent et se développent de manière hétérogène. Même dans le cas des colonies clonales, le microenvironnement individuel des cellules est affecté par la consommation des nutriments, l’excrétion de molécules inhibitrices ou les communications chimiques, menant à une différentiation phénotypique entre les cellules. Dans les domaines de l’écologie et de l’évolution microbienne, l’organisation spatiale joue un rôle déterminant dans le destin d’une population. Malgré les récents travaux portant sur le design rationnelde communautés microbiennes, il y a par contre peu de méthodologies établies pour contrôler, surtout dans l’espace, ces associations microbiennes.L’objectif de ma thèse est de mieux comprendre le rôle de l’organisation spatiale dans les interactions des communautés microbiennes.Pour se faire j’ai construit et optimisé une souche de levure Saccharomyces cerevisiae pour le control optogénétique de la production d’invertase SUC2, permettant d’induire la production locale de bien commun avec de la lumière bleue. J’ai construit un équipement expérimental sur mesure pour créer avec la lumière et observer au fil du temps des patterns de cellules coopératrices/tricheuses et je l’ai utilisé pour étudier l’influence de l’organisation spatiale sur le développement de ce genre de consortia. J’ai trouvé que ce consortium decoopérateur/tricheur se comporte comme un filtre spatial passe-bande, filtrant les fluctuations spatiales courtes de phénotypes coopérateur/tricheur mais aussi les larges régions de phénotypes identiques. Les résultats présentés dans ce travail montrent l’importance de la structuration spatiotemporelle dans les systèmes coopératifs, due aux gradients de molécules diffusibles et à l’hétérogénéité phénotypique dans la population de cellules. Cela représente un pas vers une meilleure caractérisation des échelles spatiales des interactions microbiennes qui peut servir à approfondir notre compréhension des microbiomes naturels et à aider le design de microbiomes synthétiques.

Parasites are an acute threat to plant, animal and human populations. To effectively manage infectious diseases, we need to predict the evolution of critical parasite traits, such as transmission and virulence. Among the environmental factors that may affect pathogens evolution, the use of prophylactic treatments, which may exert strong selective pressures on pathogens, must be considered. In addition, spatio-temporal variations in treatment distribution, coupled with the increased mobility of parasites and hosts, are key factors affecting the evolutionary epidemiology of host-parasite interactions. The goal of this thesis was to develop theory to study the short- and long-term evolutionary epidemiology of structured host-parasite interactions in the presence of treatments, taking into account different types of treatments that fluctuate in both time and space. This theory can be applied to pathogens life-history traits evolution (such as virulence in the first two parts), or to resistance traits evolution (such as vaccine escape in the third part).In a first part, we have developed a theoretical model of a heterogeneous population of hosts, under a periodic treatment coverage. Using the adaptive dynamics framework and the concept of reproductive values, we have highlighted the impact of periodicity in treatment coverage on the short-term epidemiology and on the long-term evolution of pathogens life-history traits. Our results suggest that periodic treatment strategies can limit both disease spread and virulence evolution, depending on the type of treatment.In a second part, we have developed a spatial metapopulation model, with two subpopulations characterised by different treatment coverages and connected by pathogen migration. In this part we study the effects of migration and of the differences in coverage on the long-term virulence evolution. We have shown that the spatial structure of the host population and the selective pressure of treatments on pathogens may yield bistability or evolutionary branching points, which can lead to the coexistence of different pathogenic strains.Finally, the third part is an extension of the previous metapopulation model, broadly inspired by the Covid-19 pandemic. However, in contrast to the previous part, we focus on short-term pathogen evolution and study the speed of emergence of a vaccine escape mutant in a two-population model connected by pathogen migration. This model allows for the study of several scenarios inspired by the management of the pandemic. For instance, different vaccination strategies between connected countries, or the impact of border opening and closure on the speed of emergence of a vaccine escape mutant can be explored.Our models aim to remain general and conclusions could be adapted to specific host-pathogen interactions. Thus, our results have interesting implications for the management of infectious disease in animal and public health, and in agriculture.; Les parasites constituent une menace sévère pour les populations humaines, animales et végétales. Dans une perspective de gestion des maladies infectieuses, il est nécessaire de prédire l'évolution de certains traits critiques des parasites, comme la transmission et la virulence. Parmi les facteurs environnementaux qui peuvent affecter l'issue de l'évolution, l'utilisation de traitements prophylactiques, qui peuvent exercer des pressions de sélection fortes sur les pathogènes, doit être considérée. En outre, les variations spatio-temporelles dans la distribution des traitements, couplées à la mobilité accrue des parasites et des hôtes, sont des facteurs-clés à considérer dans l'épidémiologie évolutive des interactions hôte-parasite. Le but de cette thèse a été de développer une approche théorique pour étudier l'épidémiologie évolutive à court et long terme des interactions hôte-parasite structurées, en considérant différents types de traitements qui fluctuent dans le temps et l'espace. Cette approche théorique peut être appliquée à l'évolution des traits d'histoire de vie des pathogènes (comme la virulence dans les deux premières parties), ou à celle de traits de résistance (comme l'échappement aux vaccins dans la troisième partie).Dans une première partie, nous avons développé un modèle théorique d'une population d'hôte hétérogène, sous une distribution périodique de traitements. Grâce au cadre de la dynamique adaptative et au concept des valeurs reproductives, nous avons mis en évidence l'impact de la périodicité dans la distribution des traitements sur l'épidémiologie à court terme et sur l'évolution des traits d'histoire de vie des pathogènes à long terme. Nos résultats suggèrent qu'une utilisation périodique des traitements peut limiter à la fois la propagation de la maladie et l'évolution de la virulence, en fonction du type de traitement.Dans une seconde partie, nous avons développé un modèle spatial de metapopulation, avec deux sous populations caractérisées par des couvertures en traitements différentes, et connectées par la migration du pathogène. Dans cette partie nous avons étudié les effets de la migration et des différences de couvertures sur l'évolution de la virulence à long terme. Nous montrons que la structuration spatiale des populations d'hôtes ainsi que la pression de sélection exercée par les traitements sur les pathogènes peuvent mener à de la bistabilité ou à des points de branchements évolutifs, entrainant potentiellement la coexistence de souches de pathogènes différentes.Finalement, la troisième partie est une extension du précédent modèle de métapopulation, inspirée par les problèmes posés par la pandémie de Covid-19. Cependant, à l'inverse de la partie précédente, nous nous concentrons sur l'évolution des pathogènes à court-terme. En effet, nous avons étudié la vitesse d'émergence d'un mutant d'échappement au vaccin dans un modèle à deux populations connectées par la migration du pathogène. Ce modèle permet d'étudier plusieurs scénarios inspirés par la gestion de la pandémie. Par exemple, différentes stratégies de vaccination entre des pays connectés, ou l'impact des fermetures et ouvertures successives des frontières peuvent être explorées.Nos modèles se veulent généraux et les conclusions peuvent être adaptées à des interactions hôtes-pathogènes spécifiques. Ainsi, nos résultats ont des implications dans la gestion des épidémies en agriculture et en santé animale et publique.

The solution of many issues of rational land use management is based on information about the state of the landscape complexes. The possibilities of obtaining reliable information on the spatial structure of permafrost landscapes become especially relevant for state assessment and evolution trends. Increasing environmental changes in the cryolithozone zone are associated with trends in climate change and vulnerability to anthropogenic impacts. The aim of this dissertation is to study the spatial structure of the permafrost landscapes of Yakutia on the basis of geoinformation modeling, taking as the object of research the middle taiga permafrost landscapes of Central Yakutia and the mountain permafrost landscapes of the Verkhoyansk region. To achieve this aim, the methods of the analysis and the processing of the time series of multi-sensor remote sensing data and digital elevation model has been developed. The methods allow modeling to map the visible morphological features of permafrost landscapes (relief and vegetation) with the implementation of ontological properties with the permafrost and lithogenic base. Time series of Sentinel 2 and Landsat 8 OLI images for the period 2015-2020 are used to map vegetation classes and analyze the state of vegetation cover. The vegetation classes are recognized by the variation in the photosynthetic activity of plant associations on the spectral reflectance characteristics. This allows us to use differences in phenological phases to increase the recognizable classes of plant associations. The accuracy assessments of the classification results are calculated by the comparison with high resolution images and field data to ensure a high level of validation confidence. Based on the ASTER GDEM relief data, we determined the genetic type of Quaternary sediments according to the landform classification calculated by the Topographic Position Index (TPI) and GIS analysis. Thus, modeling these two morphological features allows the development of a geospatial database of test study area. The database includes information on the existence of intensity transformation factors for the identified landscape complexes. The GIS models of permafrost landscapes provide information on the type of soil cover, soil conditions (moisture, temperature) and cryogenic texture. Obtaining such data demonstrates the effectiveness of the modeling for assessing the spatial structure of permafrost landscape in local level.; La solution de nombreux problèmes de gestion rationnelle de l'utilisation des terres repose sur des informations sur l'état des ensembles paysagers. Les possibilités d'obtenir des informations fiables sur la structure spatiale des paysages de pergélisol deviennent particulièrement pertinentes pour l'évaluation de l'état et les tendances d'évolution. Les changements environnementaux croissants dans la zone cryolithozone sont associés aux tendances du changement climatique et à la vulnérabilité aux impacts anthropiques. L'objectif de cette thèse est d'étudier la structure spatiale des paysages de pergélisol de Yakoutie sur la base de la modélisation de la géoinformation, en prenant comme objet de recherche les paysages de pergélisol de la taïga moyenne de la Yakoutie centrale et les paysages de pergélisol de montagne de la région de Verkhoyansk. Pour atteindre cet objectif, les méthodes d'analyse et de traitement des séries temporelles de données de télédétection multi-capteurs et de modèle numérique d'élévation ont été développées. Les méthodes de modélisation permettent de cartographier les caractéristiques morphologiques visibles des paysages de pergélisol (relief et végétation) avec la mise en œuvre de propriétés ontologiques avec le pergélisol et la base lithogène. Des séries temporelles d'images Sentinel 2 et Landsat 8 OLI pour la période 2015-2020 sont utilisées pour cartographier les classes de végétation et analyser l'état du couvert végétal. Les classes de végétation sont reconnues par la variation de l'activité photosynthétique des associations végétales sur les caractéristiques de réflectance spectrale. Cela nous permet d'utiliser les différences dans les phases phénologiques pour augmenter les classes reconnaissables d'associations de plantes. Les évaluations de précision des résultats de classification sont calculées par comparaison avec des images haute résolution et des données de terrain pour assurer un niveau élevé de confiance de validation. Sur la base des données de relief ASTER GDEM, nous avons déterminé le type génétique des sédiments quaternaires selon la classification des reliefs calculée par l'indice de position topographique (TPI) et l'analyse SIG. Ainsi, la modélisation de ces deux caractéristiques morphologiques permet le développement d'une base de données géospatiale de la zone d'étude test. La base de données comprend des informations sur l'existence de facteurs de transformation d'intensité pour les complexes paysagers identifiés. Les modèles SIG des paysages de pergélisol fournissent des informations sur le type de couverture du sol, les conditions du sol (humidité, température) et la texture cryogénique. L'obtention de telles données démontre l'efficacité de la modélisation pour évaluer la structure spatiale du paysage de pergélisol au niveau local.; Решение многих вопросов рационального землепользования основано на информации о состоянии ландшафтных комплексов. Возможности получения достоверной информации о пространственной структуре мерзлотных ландшафтов становятся особенно актуальными для оценки состояния и тенденций развития. Усиление экологических изменений в зоне криолитозоны связано с тенденциями изменения климата и уязвимостью к антропогенным воздействиям. Целью данной диссертации является изучение пространственной структуры криолитозоны Якутии на основе геоинформационного моделирования, взяв в качестве объекта исследования среднетаежные мерзлотные ландшафты Центральной Якутии и горные мерзлотные ландшафты Верхоянского района. Для достижения этой цели были разработаны методы анализа и обработки временных рядов данных многосенсорного дистанционного зондирования и цифровой модели рельефа. Методы моделирования позволяют отображать видимые морфологические особенности многолетнемерзлых ландшафтов (рельеф и растительность) с реализацией онтологических свойств с многолетнемерзлым и литогенным основанием. Временные ряды изображений Sentinel 2 и Landsat 8 OLI за период 2015-2020 гг. Используются для картирования классов растительности и анализа состояния растительного покрова. Классы растительности распознаются по вариации фотосинтетической активности растительных ассоциаций по спектральным характеристикам отражения. Это позволяет нам использовать различия в фенологических фазах для увеличения узнаваемых классов растительных ассоциаций. Оценка точности результатов классификации рассчитывается путем сравнения с изображениями с высоким разрешением и полевыми данными, чтобы обеспечить высокий уровень достоверности проверки. Основываясь на данных рельефа ASTER GDEM, мы определили генетический тип четвертичных отложений в соответствии с классификацией рельефа, рассчитанной с помощью индекса топографического положения (TPI) и анализа ГИС. Таким образом, моделирование этих двух морфологических особенностей позволяет разработать геопространственную базу данных тестовой области исследования. База данных включает информацию о наличии коэффициентов трансформации интенсивности для выделенных ландшафтных комплексов. ГИС-модели многолетнемерзлых ландшафтов предоставляют информацию о типе почвенного покрова, почвенных условиях (влажность, температура) и криогенной структуре. Получение таких данных демонстрирует эффективность моделирования для оценки пространственной структуры и ландшафтного разнообразия на локальном уровне.

Palmyrah trees (Borassus aethiopum Mart., Arecaceae) are more or less concerned by threat in their ecological area. This work aims to determine the spatial structure and dynamics of Palmyrah population in Lamto reserve, in the transition area of forest-savannah.Land cover characterization by the neural net algorithm was carried out. Environmental characterization was possible thanks to ground temperature like (LST, Land Surface Temperature), ground moisture (NDWI, Normalized Difference Water Index) algorithms on LANDSAT data (TM 1988, ETM+ 2002 & OLI+ 2015) and Elevation digital model of SRTM data, and formulated using ENVI 5.1 software. Pattern analysis like multidistances Ripley Function K (d) and neighbors distances (Average Nearest Neighbor) were applied to determine the extrinsic structure of Palmyrah trees. Cluster and outlier analysis (Local Anselin Moran’s I) was used for intrinsic structuring. The crossing in GIS of environmental data of Cluster and Outlier Analysis makes it possible to emphasize the environmental influence through clusters responses pace and the plants abundances. Detection and delineation of Palmyrah foliar crown on a very high resolution multispectral image data (GeoEye 1) were carried out using rule classification (rule-based classification) in ENVI. This study shows that forests area is increase of 240 ha. It passed from 21.42 % (610.42 ha) in 1988 to 29.85% (850.67 ha) in 2015, in spite of the bush fires. Palmyrah trees are aggregated and heterogeneous at seedling stage. Adults’ structure shows a random distribution with a homogeneous character. Palmyrah trees are more abundant with unimodal responses paces. Favorable ground temperatures and moistures to palmyrah trees abundance are function to the savannah type which shelters it. This analysis shows that the environmental factors control Palmyrah trees distribution. The detection assessment of Palmyrah trees to the search threshold for 10 meters made it possible to obtain a good precision according to the biological stage. It is more than 90% among palmyrah adult’s trees and nearly 50% at the juvenile’s stages.; Les rôniers (Borassus aethiopum Mart., Arecaceae) sont plus ou moins concernés par la menace dans leur milieu écologique. Ce travail vise à déterminer la structure spatiale et la dynamique de la population des rôniers à la réserve de Lamto, en zone de transition forêt-savane. La caractérisation de l’occupation du sol par l’algorithme des réseaux de neurones a été effectuée. La caractérisation environnementale a été possible grâce aux algorithmes de la empérature de surface (LST, Land Surface Temperature), de l’humidité de surface (NDWI, Normalized Difference Water Index) sur des images LANDSAT (TM 1988, ETM+ 2002 & OLI+ 2015) et du modèle numérique d’altitude de l’image SRTM, formulés à l’aide du logiciel ENVI 5.1. Les modèles d’analyses dont les multidistances (Fonction K(d) de Ripley) et les plus proches voisins (Average Nearest Neighbor) ont été appliqués pour déterminer la structure extrinsèque des rôniers. L’appariement de grappes et des valeurs arbitraires (Anselin Local Moran’s I) a été utilisé pour la structuration intrinsèque. Le croisement dans le SIG des données environnementales à l’appariement de grappes permet de faire ressortir l’influence environnementale à travers l’allure des réponses des grappes et l’abondance des plantes. La détection et délinéation de la couronne foliaire des rôniers sur une image multispectrale (GeoEye 1) de très haute résolution ont été effectuées à l’aide de la classification à base de règle (rule-based classification) dans ENVI. Il ressort de cette étude que la superficie des forêts est en hausse de 240 ha, malgré les feux de brousses. Elle est passée de 21,42% (610,42 ha) en 1988 à 29,85% (850,67 ha) en 2015. Les rôniers sont répartis au niveau plantule en agrégat, de caractère hétérogène. Celle des adultes présente une répartition aléatoire avec un caractère homogène. Les rôniers sont plus abondants avec des allures de réponses unimodales. Les températures et humidités de surface favorables à l’abondance des rôniers sont fonction de la formation de savane qui l’abrite. Cette analyse montre que les facteurs environnementaux contrôlent la répartition des rôniers. L’évaluation de la détection des rôniers au seuil de recherche de 10 mètres a permis d’obtenir une bonne précision en fonction du stade de développement. Elle est de plus de 90% chez les rôniers adultes et près de 50% chez les juvéniles.

L’article a pour but de montrer que le grand magasin est un lieu à la fois public et domestique avec des endroits hybrides destinés à diluer cette opposition. Inspirée d’une anthropologie de l’espace, l’analyse porte sur les univers fictionnels de Au Bonheur des dames de Zola et deux de ses adaptations, le film de Julien Duvivier et la série télévisée The Paradise (BBC One). Ces œuvres permettent au final de discerner comment l’hybridité spatiale peut être représentée dans différents médias.

Les statistiques agricoles permettent d’aborder de façon intéressante la production de structures spatiales par l’agriculture à l’échelle d’une région, la Basse-Normandie. Les recensements agricoles proposent un grand nombre de variables qui offrent la possibilité de traiter à la fois la structuration de l’espace agricole (principales cultures, surfaces toujours en herbe, etc.) mais aussi les différentes configurations technico-économiques dans lesquelles se trouvent les exploitations agricoles (nomenclature des OTEX, cheptels, UTA). Le recours aux traitements statistiques multivariés permet d’effectuer un travail de typologie qui met en évidence d’importantes différenciations entre les espaces agricoles, des continuités, des discontinuités spatiales et des espaces de transition. Ce type de travail implique cependant une réflexion critique à propos du caractère normatif des nomenclatures statistiques utilisées par le recensement agricole. Par ailleurs, si l’on souhaite aborder pleinement la diversité des exploitations agricoles au sein d’une aire géographique restreinte et leur impact sur l’espace et l’environnement, l’enquête de terrain demeure une étape incontournable pour interpréter et compléter les résultats issus des traitements réalisés à partir des statistiques agricoles. Agricultural statistics could be an interesting way to work about the spatial structures produced by agriculture on regional scale, in this case Normandy. The agricultural census gives a choice of a large panel of data which allow approaching the agricultural land patterns (main crops, permanent grass, etc.) and the economic configurations of the production system (farm type, cattle and worker). Statistic studies, through multivarious methods, allow a typological work which is interesting because it shows important spatial differentiations, continuities, discontinuities and transitions spaces between agricultural areas. This type of work implies obviously a critical reflexion about the normative character of the data from the agricultural census. In addition, if the researcher wishes to have a global approach for the farming system diversity and the agricultural impacts on space and environment in a small area, the local survey is an essential step for understanding and completing results from the statistical approach.

Highlights:• Many forests have an heterogeneous structure not accounted for in models.• We developed NOTG, a 3D, individual-based model of carbon and water budgets.• The model was parameterized for a mixed Mediterranean forest.• 3D simulation was more consistent with observations than 1D simulation.• Results show the importance of above- and below-ground spatial structures.Abstract:Many natural terrestrial ecosystems, agroforestry systems, and, increasingly, forest plantations, are made of a mixture of species and display significant structural heterogeneity. Yet most carbon-based biophysical models are limited to homogeneous, monospecific canopies. We explored whether the spatial structure at the Font-Blanche experimental site, located in a mixed Mediterranean forest of Aleppo pine and holm oak in south-east France, could affect the components of the carbon and water cycles. We used NOTG, a new 3D, process-based, and individual-based model specifically developed to study the importance of the spatial structure on the carbon and water cycles of complex ecosystems. It incorporates processes involved in the energy, carbon, and water cycles at the tree (radiation interception, photosynthesis, phenology, allocation, senescence, transpiration), and soil (soil moisture, soil organic matter decomposition) levels. It is designed to handle various plant phenological types (deciduous, non opportunistic evergreen, and opportunistic evergreen), and a comprehensive description of plant C pools. The model is designed to study water and carbon fluxes at the stand scale over one to a few years. In this study, NOTG was parameterized for the Font-Blanche forest and two five-year simulations were made using either the full 3D representation, or a simplified 1D representation. Comparison of model outputs against observations at the tree, soil, and ecosystem scales, showed a much better accuracy when using the 3D representation. This illustrates the dependence of plant and ecosystem function to the above- and below-ground spatial structures, and the usefulness of such detailed models when dealing with structurally complex ecosystems.

We study the spatial and evolutionary dynamics of a population by using probabilistic and deterministic tools. In the first part of this thesis, we are concerned with the influence of a heterogeneous environment on the evolution of species. The population is modeled by an individual-based process with some interactions and which describes the birth, the death, the mutation and the spatial diffusion of each individual. The rates of those events depend on the characteristics of the individuals : their phenotypic trait and their spatial location. First, we study the system of partial differential equations that describes the spatial and demographic dynamics of a population composed of two traits in a large population limit. We characterize precisely the conditions of extinction and long time survival for this population. Secondly, we study the initial individual-based model under two asymptotic: large population and rare mutations such as demographic and mutational timescales are separated. Thus, when a mutant appears, the resident population has reached its demographic balance. We characterize the survival probability of the population descended from this mutant. Then, by studyingthe process in the mutational scale, we prove that the microscopic process converges to a jump process which describes the successive fixations of the most advantaged traits and the spatial distribution of populations carrying these traits. We then extend the model to introduce mutualistic interactions between two species. We study this model in a limit of large population. We also give numerical results and a detailed biological behavior analysis around two issues: the co-evolution of phenotypic and spatial niches of mutualistic species and the invasion dynamics of a homogeneous space by these species. In the second part of this thesis, we develop a probabilistic model to study the effect of the sexual preference on the speciation. Here, the population is structured on two patches and the individuals, characterized by a trait, are ecologically and demographically similar and differ only in their sexual preferences: two individuals of the same trait are more likely to reproduce than two individuals of distinct traits. We show that in the absence of any other ecological differences, the sexual preferences lead to reproductive isolation between the two patches., Cette thèse porte sur l'étude des dynamiques spatiales et évolutives d'une population à l'aide d'outils probabilistes et déterministes. Dans la première partie, nous cherchons à comprendre l'effet de l'hétérogénéité de l'environnement sur l'évolution des espèces. La population considérée est modélisée par un processus individu-centré avec interactions qui décrit les événements de naissances, morts, mutations et diffusions spatiales de chaque individu. Les taux des événements dépendent des caractéristiques des individus : traits phénotypes et positions spatiales. Dans un premier temps, nous étudions le système d'équations aux dérivées partielles qui décrit la dynamique spatiale et démographique d'une population composée de deux traits dans une limite grande population. Nous caractérisons précisément les conditions d'extinction et de survie en temps long de cette population. Dans un deuxième temps, nous étudions le modèle individuel initial sous deux asymptotiques : grande population et mutations rares de telle sorte que les échelles de temps démographiques et mutationnelles sont séparées. Ainsi, lorsqu'un mutant apparaît, la population résidente est à l'équilibre démographique. Nous cherchons alors à caractériser la probabilité de survie de la population issue de ce mutant. Puis, en étudiantle processus dans l'échelle des mutations, nous prouvons que le processus individu-centré converge vers un processus de sauts qui décrit les fixations successives des traits les plus avantagés ainsi que la répartition spatiale des populations portant ces traits. Nous généralisons ensuite le modèle pour introduire des interactions de type mutualiste entre deux espèces. Nous étudions ce modèle dans une limite de grande population. Nous donnons par ailleurs des résultats numériques et une analyse biologique détaillée des comportements obtenus autour de deux problématiques : la coévolution de niches spatiales et phénotypiques d'espèces en interaction mutualiste et les dynamiques d'invasions d'un espace homogène par des espèces mutualistes. Dans la deuxième partie de cette thèse, nous développons un modèle probabiliste pour étudier finement l'effet d'une préférence sexuelle sur la spéciation. La population est ici structurée sur deux patchs et les individus, caractérisés par un trait, sont écologiquement et démographiquement équivalents et se distinguent uniquement par leur préférence sexuelle: deux individus de même trait ont plus de chance de se reproduire que deux individus de traits distincts. Nous montrons qu'en l'absence de toute autre différence écologique, la préférence sexuelle mène à un isolement reproductif entre les deux patchs.

Le peuplier noir (Populus nigra L.) est une espèce clef de l’écosystème riverain ligérien et représente un marqueur biologique de la dynamique morphosédimentaire du fleuve. Cette espèce est menacée par les activités anthropiques. L’objectif de cette étude est de rechercher une éventuelle structuration génétique spatiale de semis de P. nigra, qui sont apparus sur une barre sédimentaire nouvelle à la suite de travaux d’entretien du lit de la Loire. Cette étude a été réalisée au sein de la mosaïque de cinq ilots de Mareau-aux-prés (13 hectares, inclus dans l’Unité Conservatoire des ressources génétiques de P. nigra, Loiret, France). En septembre 2012, la végétation de l’ilot central a été détruite, les souches ont été extraites et l’ilot a été arasé. Pendant le printemps et l’été 2013, une nouvelle barre sédimentaire est apparue et a été explorée régulièrement pour répertorier les zones de germination de semis de P. nigra. En septembre 2013, 1550 jeunes plantules (31 x 50 zones) ont été collectées pour des analyses génétiques via 11 marqueurs ADN microsatellites. La diversité génétique a été estimée via le taux de polymorphisme, la richesse allélique, l’hétérozygotie observée et attendue et la différenciation génétique neutre (Fst). Bien que significativement différent de zéro, le Fst des 50 zones est faible, et le niveau de diversité est comparable aux populations parentales des berges. Ces résultats sont discutés en termes de microtopographie de la barre, de la fluctuation de la nappe, de la période de libération des graines et de la texture sédimentaire., Black poplar (Populus nigra L.) is a key species of the Loire riverine ecosystem and represents one biological marker of the sediment morphodynamics and fluvial metamorphosis of the river. This species is threatened by human impacts. The main objective of this work is to study small-scale spatial genetic structure of P. nigra seedlings on a new sandy-gravelly bar appeared after fluvial maintenance operations in a mosaic of five islands (13 hectares, included in the Conservation Unit of genetic resources of P. nigra, Loire River, Loiret, France). In September 2012, the vegetation of the central island was uprooted and the level lowered in order to maintain the flow capacity of the river. During 2013 spring and summer, the fresh sediments of the new bar were regularly surveyed to identify and geocode successive regeneration zones. In September 2013, 1550 seedlings (31 seedlings x 50 zones) were collected for genetic analysis using 11 microsatellites DNA markers. Genetic diversity was expressed in terms of percentage of polymorphic loci, observed and effective number of alleles, observed and expected heterozygosity and genetic differentiation (Fst). Although significantly different from zero, Fst within the 50 regeneration zones is very low and level of genetic diversity is comparable to parental populations (mature trees on the river banks). These results are discussed in terms of microtopography, water level fluctuation, phenology of seed dehiscence and sediment texture.

Les forêts tropicales renferment des peuplements arborescents dont la gestion et l’aménagement nécessitent des connaissances sur leur organisation spatiale et leur dynamique. Les analyses de la structure spatiale des espèces arborescentes peuvent être utilisées en forêts naturelles pour identifier les mécanismes sous-jacents qui structurent les peuplements forestiers afin d’améliorer la compréhension des relations entre les espèces. Cette étude a été menée dans la Réserve Forestière de Yoko (RFY) aux environs de Kisangani à l’est de la RD Congo (R.D.C). Elle consiste à analyser la structure spatiale horizontale des espèces les plus abondantes et à tenter d’identifier, à l’échelle locale, les facteurs et/ou processus écologiques potentiellement explicatifs pour en retirer des enseignements utiles à la gestion des massifs forestiers situés à proximité de Kisangani. Pour ce faire, une parcelle d’échantillonnage de 25 ha (500m 500m) a été délimitée dans le bloc sud de la RFY constitué d’une végétation ligneuse mixte et semi-décidue. Un inventaire forestier a permis d’analyser la composition floristique et structurale de la zone. Trois techniques (ou modèles statistiques) relevant de l’écologie spatiale pour l’analyse de la structure horizontale des espèces ont été utilisées :la méthode du voisin le plus proche de Clark & Evans (1954), la méthode d’échantillonnage aléatoire de Hines & Hines (1979), ces deux méthodes reposant sur une analyse à échelle unique de la parcelle d’étude, et la méthode de Ripley (1977) permettant non seulement une analyse multi-échelle mais aussi l’étude des relations intra et interspécifiques. Concernant ce point précis, les arbres ont été catégorisés en trois stades de développement sur la base de leurs diamètres (les jeunes, les immatures et les adultes). Une analyse comparative et théorique des trois méthodes a été effectuée. Un total de 169 espèces appartenant à 36 familles dont 114 genres ont été identifiées, et la famille des Fabaceae dont la majorité des espèces appartiennent à la sous famille des Caesalpinioideae est apparue prépondérante. Trois espèces se sont révélées les plus abondantes et les plus représentatives du peuplement, et ont pour cette raison fait l’objet de toutes les analyses :Gilbertiodendron dewevrei J. Léonard (De Wild), Scorodophloeus zenkeri Harms et Uapaca guineensis Mull. Arg. Elles ont toutes les trois montré une structure agrégée, et cela à toutes les échelles d’analyse. Les agrégats observés présentent un rayon d’environ 25 m de distance. L’analyse en fonction du diamètre a indiqué une structure agrégée pour les plus petits diamètres et régulière pour les plus grands, et que l’agrégation diminue avec le diamètre. Les résultats montrent également que les structures spatiales observées dépendent de l’échelle d’analyse considérée et de la méthode utilisée. La méthode de Clark & Evans est sensible à la variation de l’étendue. À cet égard, l’échantillonnage aléatoire de Hines & Hines est apparu plus adaptée que celui de Clark & Evans. Les fonctions de Ripley et dérivées sont des outils efficaces et apportent plus d’information. Les analyses ont montré des associations positives entre G. dewevrei et S. zenkeri, ainsi qu’entre G. dewevrei et U. guineensis. Par contre, une indépendance a été constatée entre S. zenkeri et U. guineensis. Il apparaît également que les jeunes sont associés positivement aux adultes supposés reproducteurs, et que les immatures sont indépendants par rapport aux adultes. La dispersion faible ou limitée des graines à proximité des arbres parents en est le principal facteur endogène responsable. Ce facteur explique également les associations positives entre les jeunes et les adultes de la même espèce. La compétition entre des individus pour les besoins en espace, en lumière ou en nutriments dans le sol, explique la structure régulière observée ainsi que l’indépendance des immatures envers les adultes. La dispersion limitée n’est cependant pas le seul facteur explicatif de l’agrégation spatiale des arbres, d’autres facteurs tels que l’hétérogénéité environnementale (sol, topographie,…) ou la perturbation sont vraisemblablement aussi impliqués. La perturbation anthropique ou naturelle est un processus écologique qui devrait avoir joué un rôle déterminant dans l’organisation spatiale des communautés de la forêt. Combinée au phénomène de masting, aux effets de Janzen-Connell et aux ectomycorhizes, elle est très probablement à la base des structures spatiales et des relations spatiales observées entre les espèces de la RFY. / Tropical forests contain tree-stands with management and planning requires knowledge of their spatial organization and dynamics. Analyses of the spatial structure of tree species can be used in natural forests to identify the underlying mechanisms that structure of forest stands to improve the understanding of the relationships between species. This study was conducted in the Yoko Forest Reserve (YFR) around Kisangani in eastern DR Congo (DRC). It is to analyze the horizontal spatial structure of the most abundant species and to try to identify, on a local scale, factors and / or potentially explicative ecological processes to draw valuable lessons for the management of forest areas nearby Kisangani. To do this, a sample plot of 25 ha (500m x 500m) was delineated in the southern block of the YFR consists of a mixed woody vegetation and semi-deciduous. A forest inventory was used to analyze the floristic and structural composition of the area. Three techniques (or statistical models) under spatial ecology for the analysis of the horizontal structure of the species were used: the nearest neighbor method of Clark & Evans (1954), the random sampling method Hines & Hines (1979), these two methods based on a single scale analysis of the study plot, and the method of Ripley (1977) allows not only a multi-scale analysis, but also the study of intra- and inter-relationships. Regarding this point, the trees were categorized into three stages of development on the basis of their diameters (young, immature and adult). A comparative and theoretical analysis of the three methods was performed. A total of 169 species belonging to 36 families with 114 genera have been identified and the family Fabaceae which the majority of species belong to the subfamily Caesalpinioideae appeared decisive. Three species have proved the most abundant and the most representative of the stand, and for this reason the subject of all analyzes Gilbertiodendron dewevrei J. Léonard (De Wild) Scorodophloeus zenkeri Harms and Uapaca guineensis Mull. Arg. They all three showed an aggregated structure, and that all scales of analysis. Observed aggregates have a radius of about 25 m distance. The analysis based on the diameter indicated an aggregated structure for smaller diameters and regular for larger and that aggregation decreases with diameter. The results also show that the observed spatial structures depend on the considered analysis of scale and the method used. The method of Clark & Evans is sensitive to the variation in the extent. In this regard, the random sampling of Hines & Hines appeared more suitable than that of Clark & Evans. Ripley's functions and derivatives are effective tools and provide more information. Analyses showed positive associations between G. dewevrei and S. zenkeri, and between G. dewevrei and U. guineensis. By against, independence was found between S. zenkeri and U. guineensis. It also appears that young people are positively associated with the supposed breeding adults and immatures are independent compared to adults. The low or limited seed dispersal near parent trees is the main endogenous factor responsible. This factor also explains the positive associations between youth and adults of the same species. The competition between individuals to space requirements, light or nutrients in the soil, explains the observed regular structure and the independence of immature towards adults. Limited dispersal, however, is not the only factor explaining the spatial aggregation trees, other factors such as environmental heterogeneity (soil, topography, ) or disturbance are probably also involved. Anthropogenic or natural disturbance is an environmentally friendly process that should have played a decisive role in the spatial organization of forest communities. Combined with masting phenomenon, the effects of Janzen-Connell and Ectomycorrhizae, it is very probably the basis of spatial structures and spatial relationships observed between species of the YFR., Doctorat en Sciences agronomiques et ingénierie biologique, info:eu-repo/semantics/nonPublished

Les forêts tropicales renferment des peuplements arborescents dont la gestion et l’aménagement nécessitent des connaissances sur leur organisation spatiale et leur dynamique. Les analyses de la structure spatiale des espèces arborescentes peuvent être utilisées en forêts naturelles pour identifier les mécanismes sous-jacents qui structurent les peuplements forestiers afin d’améliorer la compréhension des relations entre les espèces. Cette étude a été menée dans la Réserve Forestière de Yoko (RFY) aux environs de Kisangani à l’est de la RD Congo (R.D.C). Elle consiste à analyser la structure spatiale horizontale des espèces les plus abondantes et à tenter d’identifier, à l’échelle locale, les facteurs et/ou processus écologiques potentiellement explicatifs pour en retirer des enseignements utiles à la gestion des massifs forestiers situés à proximité de Kisangani. Pour ce faire, une parcelle d’échantillonnage de 25 ha (500m 500m) a été délimitée dans le bloc sud de la RFY constitué d’une végétation ligneuse mixte et semi-décidue. Un inventaire forestier a permis d’analyser la composition floristique et structurale de la zone. Trois techniques (ou modèles statistiques) relevant de l’écologie spatiale pour l’analyse de la structure horizontale des espèces ont été utilisées :la méthode du voisin le plus proche de Clark & Evans (1954), la méthode d’échantillonnage aléatoire de Hines & Hines (1979), ces deux méthodes reposant sur une analyse à échelle unique de la parcelle d’étude, et la méthode de Ripley (1977) permettant non seulement une analyse multi-échelle mais aussi l’étude des relations intra et interspécifiques. Concernant ce point précis, les arbres ont été catégorisés en trois stades de développement sur la base de leurs diamètres (les jeunes, les immatures et les adultes). Une analyse comparative et théorique des trois méthodes a été effectuée. Un total de 169 espèces appartenant à 36 familles dont 114 genres ont été identifiées, et la famille des Fabaceae dont la majorité des espèces appartiennent à la sous famille des Caesalpinioideae est apparue prépondérante. Trois espèces se sont révélées les plus abondantes et les plus représentatives du peuplement, et ont pour cette raison fait l’objet de toutes les analyses :Gilbertiodendron dewevrei J. Léonard (De Wild), Scorodophloeus zenkeri Harms et Uapaca guineensis Mull. Arg. Elles ont toutes les trois montré une structure agrégée, et cela à toutes les échelles d’analyse. Les agrégats observés présentent un rayon d’environ 25 m de distance. L’analyse en fonction du diamètre a indiqué une structure agrégée pour les plus petits diamètres et régulière pour les plus grands, et que l’agrégation diminue avec le diamètre. Les résultats montrent également que les structures spatiales observées dépendent de l’échelle d’analyse considérée et de la méthode utilisée. La méthode de Clark & Evans est sensible à la variation de l’étendue. À cet égard, l’échantillonnage aléatoire de Hines & Hines est apparu plus adaptée que celui de Clark & Evans. Les fonctions de Ripley et dérivées sont des outils efficaces et apportent plus d’information. Les analyses ont montré des associations positives entre G. dewevrei et S. zenkeri, ainsi qu’entre G. dewevrei et U. guineensis. Par contre, une indépendance a été constatée entre S. zenkeri et U. guineensis. Il apparaît également que les jeunes sont associés positivement aux adultes supposés reproducteurs, et que les immatures sont indépendants par rapport aux adultes. La dispersion faible ou limitée des graines à proximité des arbres parents en est le principal facteur endogène responsable. Ce facteur explique également les associations positives entre les jeunes et les adultes de la même espèce. La compétition entre des individus pour les besoins en espace, en lumière ou en nutriments dans le sol, explique la structure régulière observée ainsi que l’indépendance des immatures envers les adultes. La dispersion limitée n’est cependant pas le seul facteur explicatif de l’agrégation spatiale des arbres, d’autres facteurs tels que l’hétérogénéité environnementale (sol, topographie,…) ou la perturbation sont vraisemblablement aussi impliqués. La perturbation anthropique ou naturelle est un processus écologique qui devrait avoir joué un rôle déterminant dans l’organisation spatiale des communautés de la forêt. Combinée au phénomène de masting, aux effets de Janzen-Connell et aux ectomycorhizes, elle est très probablement à la base des structures spatiales et des relations spatiales observées entre les espèces de la RFY. / Tropical forests contain tree-stands with management and planning requires knowledge of their spatial organization and dynamics. Analyses of the spatial structure of tree species can be used in natural forests to identify the underlying mechanisms that structure of forest stands to improve the understanding of the relationships between species. This study was conducted in the Yoko Forest Reserve (YFR) around Kisangani in eastern DR Congo (DRC). It is to analyze the horizontal spatial structure of the most abundant species and to try to identify, on a local scale, factors and / or potentially explicative ecological processes to draw valuable lessons for the management of forest areas nearby Kisangani. To do this, a sample plot of 25 ha (500m x 500m) was delineated in the southern block of the YFR consists of a mixed woody vegetation and semi-deciduous. A forest inventory was used to analyze the floristic and structural composition of the area. Three techniques (or statistical models) under spatial ecology for the analysis of the horizontal structure of the species were used: the nearest neighbor method of Clark & Evans (1954), the random sampling method Hines & Hines (1979), these two methods based on a single scale analysis of the study plot, and the method of Ripley (1977) allows not only a multi-scale analysis, but also the study of intra- and inter-relationships. Regarding this point, the trees were categorized into three stages of development on the basis of their diameters (young, immature and adult). A comparative and theoretical analysis of the three methods was performed. A total of 169 species belonging to 36 families with 114 genera have been identified and the family Fabaceae which the majority of species belong to the subfamily Caesalpinioideae appeared decisive. Three species have proved the most abundant and the most representative of the stand, and for this reason the subject of all analyzes Gilbertiodendron dewevrei J. Léonard (De Wild) Scorodophloeus zenkeri Harms and Uapaca guineensis Mull. Arg. They all three showed an aggregated structure, and that all scales of analysis. Observed aggregates have a radius of about 25 m distance. The analysis based on the diameter indicated an aggregated structure for smaller diameters and regular for larger and that aggregation decreases with diameter. The results also show that the observed spatial structures depend on the considered analysis of scale and the method used. The method of Clark & Evans is sensitive to the variation in the extent. In this regard, the random sampling of Hines & Hines appeared more suitable than that of Clark & Evans. Ripley's functions and derivatives are effective tools and provide more information. Analyses showed positive associations between G. dewevrei and S. zenkeri, and between G. dewevrei and U. guineensis. By against, independence was found between S. zenkeri and U. guineensis. It also appears that young people are positively associated with the supposed breeding adults and immatures are independent compared to adults. The low or limited seed dispersal near parent trees is the main endogenous factor responsible. This factor also explains the positive associations between youth and adults of the same species. The competition between individuals to space requirements, light or nutrients in the soil, explains the observed regular structure and the independence of immature towards adults. Limited dispersal, however, is not the only factor explaining the spatial aggregation trees, other factors such as environmental heterogeneity (soil, topography, ) or disturbance are probably also involved. Anthropogenic or natural disturbance is an environmentally friendly process that should have played a decisive role in the spatial organization of forest communities. Combined with masting phenomenon, the effects of Janzen-Connell and Ectomycorrhizae, it is very probably the basis of spatial structures and spatial relationships observed between species of the YFR., Doctorat en Sciences agronomiques et ingénierie biologique, info:eu-repo/semantics/published

À l'aide de données inédites du recensement de 1991 de Statistique Canada, nous examinons les différences femmes-hommes, pour cinq catégories professionnelles, quant aux structures spatiales des déplacements résidence-travail, au moyen de mesures de dissimilarité appliquées à des matrices origine-destination. Compte tenu des particularités de Montréal, nos données sont en accord avec plusieurs conclusions communément admises dans la littérature. En ce qui concerne plus spécifiquement la structure des déplacements pendulaires, nous examinons deux hypothèses : (1) le comportement des femmes est plus nettement distinct de celui des hommes de la même catégorie professionnelle que de celui des femmes d'autres catégories; (2) la structure des déplacements pendulaires des femmes est plus nettement distincte de celle des hommes pour les catégories professionnelles de statut supérieur que pour les autres. Nos résultats sont mitigés : si les hypothèses ne sont pas catégoriquement rejetées, elles sont pour le moins mises en doute., We use unpublished 1991 Statistics Canada Census data to examine male-female differences in the spatial structure of home-to-work commuting, for five occupational categories, by applying dissimilarity measures to origin-destination matrices. After allowing for the particular characteristics of Montréal, our data agree with several findings found in the literature. Regarding more specifically the spatial structure of commuting, we consider two hypotheses : (1) the behavior of women is more dissimilar from that of men of the same occupational category than from that of women of other categories; (2) women's spatial structure of commuting is more dissimilar from that of men for higher-status occupational categories than for lower-status ones. Results are mixed. While the hypotheses are not clearly rejected, they are definitely challenged.

An agent-based model (AMB) used to simulate the spread of Human African Trypanosomiasis is presented together with the results of simulations of a focus of the disease. This model is a completely spatialized approach taking into account a series of often overlooked parameters such as human behaviour (activity-related movements), the density and mobility of the disease vectors – tsetse flies (Glossina spp.) – and the influence of other tsetse feeding hosts (livestock and wild animal populations). The agents that represent humans and tsetse flies move in a spatially structured environment managed by specialized location agents. Existing compartmental mathematical models governed by differential equations fail to incorporate the spatial dimension of the disease transmission. Furthermore, on a small scale, transmission is unrealistically represented by entities less than one. This ABM was tested with data from one village of the Bipindi sleeping sickness focus (southern Cameroon) and with obtained realistic simulations of stable transmission involving an animal reservoir. In varying different spatial configurations, we observe that the stability of spread is linked to the spatial complexity (number of heterogeneous locations). The prevalence is very sensitive to the human densities and to the number of tsetse flies initially infected in a given location. A relatively low and durable prevalence is obtained with shortening the phase I. In addition, we discuss some upgrading possibilities, in particular the linkage to a Geographical Information System (GIS). The agent-based approach offers new ways to understanding the spread of the disease and a tool to evaluate risk and test control strategies. To cite this article: G. Muller et al., C. R. Biologies 327 (2004).

Black poplar is a key species of the Loire riverine ecosystem, and in addition to its important genetic intra and interpopulation diversity, represents one biological marker of the sediment morphodynamics and fluvial metamorphosis of the river. This species is threatened by human impacts, notably because of fluvial management works. The main objective of this work is to study small-scale spatial genetic structure of Populus nigra 2013 seedlings on a new sandy-gravelly bar appeared after fluvial maintenance operations in the Loire River (France). Our study focuses in a mosaic of islands (13 hectares) constituting the Conservation Unit Mareau/St-Mesmin of the national programme of conservation of genetic resources of P. nigra. In september 2012, the vegetation (black poplar) of the central island was uprooted and the bar level lowered in order to maintain the flow capacity of the river. During 2013 spring and summer, the fresh sediments of the new island has been regularly surveyed to identify and geocode successive regeneration zones. In September 2013, 31 seedlings of 50 different zones were collected for genetic analysis using 11 microsatellites DNA markers (total 1550 seedlings). Genetic diversity was expressed in terms of : percentage of polymorphic loci, observed and effective number of alleles, observed and expected heterozygosity and genetic differentiation (Fst). Although significantly different from zero, Fst within the 50 regeneration zones is very low and level of genetic diversity is comparable to putative parental populations (mature trees on the river banks). The low level of structure was further investigated using Structure software. The results will be presented and discussed in terms of microtopography, water level fluctuation, phenology of seed dehiscence and sediment texture. Such research work will lead to recommendations for future management of the Loire river, in terms of genetic diversity of Populus nigra populations.

Rice yellow mottle virus (RYMV) is a major pathogen that dramatically reduces rice production in many African countries. RYMV belongs to the genus sobemovirus, one group of plant viruses with icosahedral capsids and single-stranded, positive-sense RNA genomes.The structure of RYMV was determined and refined to 2.8 A resolution by X-ray crystallography. The capsid contains 180 copies of the coat protein subunit arranged with T = 3 icosahedral symmetry. Each subunit adopts a jelly-roll beta sandwich fold. The RYMV capsid structure is similar to those of other sobemoviruses. When compared with these viruses, however, the betaA arm of the RYMV C subunit, which is a molecular switch that regulates quasi-equivalent subunit interactions, is swapped with the 2-fold-related betaA arm to a similar, noncovalent bonding environment. This exchange of identical structural elements across a symmetry axis is categorized as 3D domain swapping and produces long-range interactions throughout the icosahedral surface lattice. Biochemical analysis supports the notion that 3D domain swapping increases the stability of RYMV.The quasi-equivalent interactions between the RYMV proteins are regulated by the N-terminal ordered residues of the betaA arm, which functions as a molecular switch. Comparative analysis suggests that this molecular switch can also modulate the stability of the viral capsids.

ENG: Geography, time and spatial change. — In contrast to the linear, cumulative concept of time in conventional geography, spatial analysis and a spatial systems approach offer a way of taking into account the multiple and discontinuous temporalities that punctuate geographical space. These are the variable durations of spatial structures, spatial events and phases of territorial transition, and phenomena of resilience that contribute to spatial change., En opposition avec la conception linéaire et cumulative du temps dans la géographie classique, l'approche par l'analyse spatiale et les systèmes spatiaux propose de prendre en compte les temporalités multiples et discontinues qui animent l'espace géographique. Ce sont les durées variables des structures spatiales, les événements spatiaux, les phases de transition territoriale et les phénomènes de resilience qui contribuent au changement spatial., Elissalde BernardElissalde Bernard. Géographie, temps et changement spatial. In: L'Espace géographique, tome 29, n°3, 2000. pp. 224-236.

From the point of view of human density, the classical contrast between coastal areas and inland areas in Brittany, cannot be considered as an unchanging element of spatial organization. During the last two centuries, this spatial structure has had increasing or waning phases according to changing processes., L'opposition classique entre le littoral et l'intérieur pour définir l'occupation humaine en Bretagne ne constitue pas un élément immuable de l'organisation de l'espace breton. Cette structure forte connaît depuis deux siècles des phases d'accentuation ou d'atténuation, au gré des processus de polarisation, de dispersion ou de desserrement du peuplement., Elissalde Bernard. Temporalités et contraste Armor/ Arcoat en Bretagne. In: Travaux de l'Institut Géographique de Reims, vol. 26, n°101-104, 1999. Temporalités spatiales, sous la direction de Jean Domingo . pp. 179-200.

Despite its small size, New Caledonia has a flora which includes 43 endemic species of conifer. This study examines the stand structure of the New Caledonian conifer, Araucaria laubenfelsii Corbasson, a species which occurs on ultramafic soils as an emergent tree in rainforest and in an unusual structural association with maquis vegetation. Fire and cyclone blow-down are the primary disturbances in the maquis, but fire is infrequent in the rainforests which is evident from the low proportion of fire scarred trees. Preliminary results show abundant seedlings and saplings of A. laubenfelsii both in maquis and forest. Size class distributions of individuals suggest that the species is continuously regenerating in the maquis and immature forests. Variability in the stand structure in maquis communities reflects the probable patchy nature of disturbance from small-scale fires and blow-down from tropical cyclones. In mature forests, Nothofagus codonandra (Baillon) Steenis is the dominant canopy species and 'other tree species' are continuously regenerating, while the size class distributions and basal area of A. laubenfelsii suggest that there is, at present, limited regeneration of this species. Tree ring counts indicate that individuals in forest areas grow at a slower rate than those in maquis, but attain greater age, probably as a result of greater protection from fire.

The present work is based on a set of bottom trawl surveys performed in the Gulf of Lions between 1983 and 1992. A new method which couples the STATIS multitable approach with the logic of correspondence analysis (CoA) is proposed to study the stability of spatial organization of demersal assemblages in terms of species composition. This CoA version of STATIS has provided a clear representation of the stable part of the spatial structure of the assemblages. In addition, it gave an insight into the interannual variations of the distribution of each population around the reference structure. Our results showed that the demersal assemblages of the Gulf of Lions exhibited strong spatial structuring, mainly orientated along a bathymetric gradient. This gradient is structured around three major regions: the coast, the continental shelf and the continental slope. Despite sampling variations that occurred during the course of the study, the analysis showed a high degree of reproducibility for this spatial pattern. With the exception of Mullus surmuletus, the species considered in this investigation exhibit limited variations in their spatial distribution. Finally, in the absence of log-books covering the activities of commercial fishing vessels, these findings constitute a base of reference for the analysis of the dynamics of fishing fleets exploiting the demersal resources of the Gulf of Lions., Ce travail porte sur une série de campagnes de chalutage de fond réalisé dans le golfe du Lion entre 1983 et 1992. Une nouvelle méthode fondée sur le couplage de la technique multitableaux STATIS et de l'analyse factorielle des correspondances (AFC) est proposée afin d'étudier l'organisation spatio-temporelle des assemblages démersaux, poissons et quelques céphalopodes, en terme de composition spécifique. Cette version AFC de STATIS a fourni une représentation claire de la part stable de l'organisation spatiale des assemblages. De plus, elle nous a permis d'appréhender les variations interannuelles de la distribution de chaque population autour de la structure de référence. Nos résultats montrent que les assemblages démersaux du golfe du Lion présentent une forte structuration spatiale, principalement orientée selon un gradient bathymétrique. Ce dernier est structuré en trois grandes régions: la côte, le plateau continental et le talus continental. En dépit des variations d'échantillonnage survenues au cours de la période d'étude, l'analyse a mis en évidence une forte reproductibilité de ce schéma d'organisation. A l'exception de Mullus surmuletus, les espèces considérées dans ce travail présentent des variations limitées de leur distribution spatiale. Enfin, en l'absence de livres de bord sur l'activité des navires professionnels, ces résultats constituent une base de référence pour l'analyse de la dynamique des flottilles exploitant les ressources démersales dans le golfe du Lion.

By means of cartographic and graphic representations, this article illustrates the spatial structures developed at sea for oil and gas production. Despite the difference in environment, the sea is appropriated and occupied in the same way as the continent, except that installations are arranged vertically at sea, whereas they are spread over the surface of the continent., L’article montre, au moyen de représentations cartographiques et graphiques, les structures spatiales développées en mer pour l’exploitation des hydrocarbures. Malgré les différences de milieu, l’appropriation et l’occupation territoriales du domaine maritime s’effectue selon les mêmes principes que sur le continent, à ceci près que ce qui s’étale en surface sur le continent se développe à la verticale en mer., Gracias a representaciones cartográficas y gráficas, el estudio revela las estructuras espaciales desplegadas en el mar para la explotación de los hidrocarburos. A pesar de las diversidades de medioambiental, la adaptación y la ocupación territorial del dominio marítimo se hace conforme a las mismas normas que en el continente. Sin embargo, lo que se extiende al superficie en el continente se desarrolla a la vertical en el mar., Le Berre Maryvonne, Maillardet Joëlle. Sur terre comme sur mer : organisations spatiales en mer du nord et mer de Norvège. In: Mappemonde 51, 1998/3. pp. 17-22.

The rapid development of IC technologies and in parallel the increasing demand for more information and knowledge from the actors of economy, institutions and members of society created the ICT-sector into the core of “new economy” and information society. This process got an important role in the major research topics in economic and social geography, thanks to the high innovation capacity of the sector, the new forms of organizing economic activities and the discussed spatial and social effects of the development. The rising ICT sector and new elements of information society implied a special interest not only from basic research, but even applied research areas, for example the emerging role of ICTs in regional development and regional policies and some sectoral policies (economy, education, health etc.). This process had a special role in the former COMECON area. The info-intensive activities had a crucial role in building up a new, market-led model of economy in the transition period. The new forms of communication offer to re-organize the personal connections, the local societies and created new “spaces and places” for new communities. The double modernisation effect of ICTs in converging countries in the period of transition (1989/1990 – 2004) had a serious impact on spatial processes. In our paper we concentrate on the role of ICTs in transforming Hungarian economy, increasing the competitiveness of the country. We try to describe the spatial structure of the sector and its part in forming the new regional structure of the country. Le développement rapide des TIC a engendré la création d’une « nouvelle économie » étudiée de plus en plus en géographie, en interrogeant notamment la forte capacité d’innovation du secteur, les nouvelles formes organisationnelles et ses effets socio-spatiaux. Au niveau régional, les questions sont vivaces lorsqu’on s’intéresse à la dimension politique. Les effets des TIC dans les pays en convergence durant la période de transition (1989/1990 – 2004) ont été nombreux sur le développement régional en Hongrie. En particulier, ils ont largement contribué à transformer l’économie hongroise, avec un impact important sur l’accroissement de la compétitivité du pays.

The aim of the study is (1) to identify ecological factors that determine the presence of mixed oak stand in North East from the IFN database; and (2) to characterize Quercus petraea and Quercus robur spatial structure in a natural regeneration and to compare different measurement methods (quadrat method, line intersect method and nearest neighbor method). Models of probability of presence have the same set of explanatory variables for mixed and for pure stands. The most important variables are permanent flooding, temporary flooding and pH. The model for mixed stands is close to a model obtained by multipliying the two specific (pure stand) models. In the regeneration plot, pedunculate oak was the most abundant species and sessile oak showed an aggregate distribution that depended from pedunculate oak distribution. Weak or no correlations with environmental factors (canopy closure, waterlogging) were observed. Finally, a strategy to characterize seedling distribution in mixed oak regenerations is proposed.; L'objectif de cette étude est (1) d'identifier les facteurs écologiques qui déterminent la présence des peuplements mélangés de chêne sessile et de chêne pédonculé dans le Nord Est de la France, à partir des données IFN ; et (2) de caractériser, la structure spatiale du Chêne sessile et du Chêne pédonculé dans une parcelle en régénération et de comparer différentes méthodes de mesure (méthode des quadrats, méthode d'intersection et méthode des plus proches voisins). Les modèles de probabilité de présence obtenus pour les mélanges et pour les deux espèces font intervenir les mêmes variables. Les variables les plus importantes sont l'engorgement permanent et temporaire, puis le pH. les méthodes testés mettent en évidence un phénomène d'agrégation du CS et d'attraction du CS envers le CP. Le modèle pour les mélanges est proche d'un modèle obtenu par multiplication des deux modèles spécifiques. Dans la parcelle en régénération, le chêne pédonulé était très fortement majortaire, et le chêne sessile a montré une distribution agregré et dépendente de la distribution du chêne pédonculé. Des correlations faibles ou inexistantes avec les facteurs environnementaux (couvert adulte, hydromorphie) ont été observées. Une stratégie de mesure pour la caractérisation des régénérations de chêne mélangées est présentée.

Juniperus excelsa is the second most widespread conifer tree in Lebanon. It grows in sites where no other conifer can survive. Despite its high ecological value, until now no field study was made in order to characterize these woodlands in Lebanon. We gathered data on the density, size structure, regeneration rate, cone production, proportion of filled seeds (using radiography) and spatial structure. The study was based on the monitoring of eight plots located in contrasted bioclimatic zones in Lebanon. We showed that the overall density of the Lebanese stands of J. excelsa is low and does not exceed 257 trees/ha. Moreover, the regeneration rate of these stands is lower than one and the percentage of filled seeds does not exceed 40%. The main threat affecting the survival of the Lebanese populations differs among sites including woodcutting, expansion of agricultural lands, overgrazing and the coupling with the hydric stress. This makes the future of the Juniper woodland in Lebanon largely uncertain., Juniperus excelsa pousse dans des sites où aucun autre conifère ne survit et souffre d’une forte pression anthropique. Il est cependant le second, Cheikha Douaihy Bouchra, Restoux Gwendal, Machon Nathalie, Bou Dagher-Kharrat Magda. Ecological characterization of the Juniperus excelsa stands in Lebanon. In: Ecologia mediterranea, tome 39 n°1, 2013. Actes du IVe Colloque international sur le Genévrier thurifère. 5-8 octobre 2011 Mont-Dauphin et Saint-Crépin (Hautes-Alpes, France) pp. 169-180.

[Departement_IRSTEA]Territoires [TR1_IRSTEA]SEDYVIN; Spatial pattern has a key role in the interactions between species in plant communities. These interactions influence ecological processes involved in the species dynamics: growth, regeneration and mortality. In this study, we investigated the effect of spatial pattern on productivity in mature mixed forests of sessile oak and Scots pine. We simulated tree locations with point process models and tree growth with spatially explicit individual growth models. The point process models and growth models were fitted with field data from the same stands. We compared species productivity obtained in two types of mixture: a patchy mixture and an intimate mixture. Our results show that the productivity of both species is higher in an intimate mixture than in a patchy mixture. Productivity difference between the two types of mixture was 11.3% for pine and 14.7% for oak. Both species were favored in the intimate mixture because, for both, intraspecific competition was more severe than interspecific competition. Our results clearly support favoring intimate mixtures in mature oak-pine stands to optimize tree species productivity; oak is the species that benefits the most from this type of management. Our work also shows that models and simulations can provide interesting results for complex forests with mixtures, results that would be difficult to obtain through experimentation.

L’origine géographique des footballeurs professionnels montre que ce sport de haut niveau possède des structures spatiales fortes. Les régions de «production» et de «consommation» des joueurs se recoupent et engendrent notamment des politiques de recrutement spatialement différenciées.

The interplay of environment, heritability, and stochasticity results in the development of different individuals starting from a given genotype. This phenotypic variability affects how natural selection acts on genetic variability. From a general perspective, I aim at studying the impact of phenotypic variability on adaptive dynamics. In the first chapter, I report on the design of an evolutionary experiment in a structured environment using Escherichia coli. The trait under selection is resistance to high temperature. In particular, we study the effects of high temperature on chemotaxis, as well as the impact of acclimation on growth and survival at high temperature. The second chapter is about the development of a microbial population measurement device dedicated to diluted populations. This continuous, non-invasive measurement has a low detection limit that depends on the species. For the model species Escherichia ecoli, the limit is ca. 5000/mL which represents a 100-fold improvement compared to classical photometric methods. In the third chapter, we study the distribution of pyoverdine between individuals of a clonal population of Pseudomonas aeruginosa. The variability of the concentration of this siderophore is much greater than expected. Although pyoverdine is considered to be a public good, neither spatial heterogeneity nor heritability provide a meaningful description of the variability. Instead we characterize rapid fluctuations in pyoverdine concentration, and propose a model based on a phenotypic switch in pyoverdine metabolism that is in good agreement with the experimental data., Les différents facteurs que sont l'environnement, l'héritabilité et la stochasticité contribuent au développement d'individus différents à partir d'une information génétique donnée. Cette variabilité phénotypique modifie l'action de la sélection naturelle sur la variabilité génétique. Un fil conducteur de ce travail est l'étude de l'impact de la variabilité phénotypique sur les dynamiques d'adaptation. Le premier chapitre expose la conception d'une expérience d'évolution de Escherichia coli dans un environnement structuré. Le trait sélectionné est la resistance aux hautes températures. En particulier, nous étudions les effets de la température sur le chimiotactisme ainsi que l'impact de l'acclimatation sur la croissance et la survie à haute température. Le deuxième chapitre porte sur la réalisation d'un dispositif de mesure de population microbienne à basse concentration. Cette mesure est continue et non invasive et sa limite de détection varie selon l'espèce. Pour l'espèce modèle Escherichia ecoli, la limite est environ 5000/mL soit une amélioration d'un facteur 100 par rapport à la photométrie classique. Dans le troisième chapitre, nous étudions la distribution de la pyoverdine entre les individus d'une population clonale de Pseudomonas aeruginosa. La variabilité de la concentration de ce sidérophore considéré comme un "bien commun'' est beaucoup plus grande que celle attendue et ne peut être expliquée en terme de répartition spatiale ou d'héritabilité. Après avoir caractérisé des fluctuations rapides de la concentration en pyoverdine, nous proposons un modèle de switch phénotypique dans le métabolisme de la pyoverdine qui est en très bonne adéquation avec les observations.

http://cybergeo.revues.org/23634 mis en ligne le 18 mai 2011; International audience; In this article, we compare two databases, one providing mobility data for 34 European cities (UITP database), and the other database providing population density grid cells for these cities at 200m scale. Looking towards sustainable urban forms, we assess explanatory power of socio-economic and morphological indicators, with respect to seven mobility indicators, including the energy consumption per inhabitant due to transport (base year 2001). We conclude that classical urban indicators (GDP per inhabitant, population density) and more precise morphological indicators (entropy, rank-size slope) are complementary towards such objectives.; Dans cet article, nous confrontons deux bases de données, l'une portant sur la mobilité dans 34 villes européennes et l'autre donnant une grille fine (au pas de 200 mètres) de densité de population pour ces mêmes villes. Dans la perspective d'un développement urbain soutenable, nous mettons en évidence la complémentarité d'indicateurs urbains classiques (PIB par habitant, densité de population) et d'indicateurs morphologiques plus fins (entropie, pente de la loi rang-taille) pour expliquer les différences inter urbaines de sept indicateurs de mobilité quotidienne, mettant en particulier l'accent sur la consommation d'énergie par personne due aux transports (en 2001).

International audience; Les disparités économiques sont un thé me récurrent chez les analystes des affaires territoriales (Royer, 2008; OCDE, 2008). Elles retiennent l'attention, tant à cause des politiques à mettre en place pour les juguler, qu'en raison des effets économiques et sociaux indésirables qu'elles peuvent induire, notamment la hausse des taxes qui provoque l'expulsion des populations locales, des conflits, etc.

International audience; The classical approaches for modelling spatial structures address aggregation through a set of distributional hypotheses. They require a large number of data and the definition of a spatial distance for the characterisation of spatial correlations. When only scarce abundance data and no Euclidean distance are available, we propose a method to explore the structuring patterns by the association of a hierarchical/proximity description of the space under study (units formed by subunits) and a multiple permutation test battery capturing the similarity between units (permutation being applied at subunits or units level). No Euclidean distances being available among the elements of a hierarchical level, proximity will be used instead of distance and will be defined by the structural relationships of units or subunits. The multiple test aims to assess different types of structuring, determined either by occupancy or by abundance or by both, at unit or subunit level. We address the relevancy of this approach with a simulation study where samples, formed by ordered subunits and units, are designed to exhibit the different types of structuring. The method is also illustrated with a case study (distribution of aphids on Citrus branches). It results from this application a decomposition of the complexity of pattern structuring and the evidence, for a single species in its natural environment, to develop diverse types of pattern structuring. Additionally to their direct implications, the results of the test battery may provide valuable preliminary hypotheses and could serve as a constraining context for the next step of modelling

National audience

In the English Channel, the gulf of Saint-Malo is characterized by several environmental peculiarities including the occurrence of several residual gyres around the Channel Islands, one of the largest tidal flat in Europe in the Bay of Mont-Saint-Michel due to a high tidal range, and numerous human threats linked to tourism, shellfish farming and local fisheries. With regards to its great ecological and economical interest, the gulf is one of the main French coastal zone for which rapid enforcement of a coordinated conservation policy integrating the impact of human activities is necessary. In this context, to assess the impact of natural and anthropogenic environmental constraints on the macrobenthic community structure, two systems at two different scales were studied (i) the coarse sand Glycymeris glycymeris community in the gulf of Saint-Malo, and (ii) the intertidal flat of the bay of Mont-Saint-Michel. The main questions that we addressed were: (1) How do the hydrodynamic features of the Gulf of Saint Malo (i.e. permanent gyres) affect the structure and dynamics of benthic communities? (2) What is the relative role of environmental gradients and shellfish farming on benthic communities in the Bay of Mont-Saint-Michel? What is the ecological state of the bay? At the large scale of the gulf of Saint-Malo, a weak relationship was reported between the five principal gyres (i.e. Flamanville, Guernsey, Jersey, Saint-Brieuc bay and the Mont-Saint-Michel bay) and the structure of the coarse sand G. glycymeris community. The homogenization of the benthic structure was favored by the permeability of the local gyres and species distribution is mainly governed by thermal fronts. However, differences were obtained on the demographic structure of the three main bivalves (i.e. Paphia rhomboides, G. glycymeris and Timoclea ovata) in relation to these gyres suggesting that connectivity between gyres is reduced. In spite of a clear elevation of temperature estimated to 1.5 °C over the last three decades, a comparative study on the distribution of some benthic species between our data and earlier sampling (i.e. 70's) did not reveal strong modifications, excepted for few cases. At this scale, the temperature rising effect may be associated with fishing effort to explain decrease or proliferation of some species. At the scale of the bay of Mont-Saint-Michel, the distributions of the benthic assemblages and the four main bivalves (i.e. Abra alba, Cerastoderma edule, Macoma balthica and Spisula ovalis) followed a typical vertical gradient. They were strongly influenced by environmental factors (i.e. tidal height, sediment grain size) while the shellfish activity played only a minor role: locally, it may favour the development of opportunistic species including mainly oligochaetes and cirratulid polychaetes. The main environmental consequence of shellfish farming is probably the introduction of the alien gastropod Crepidula fornicata which greatly controls primary production within the bay. The analysis of the demographic structure of the bivalves suggests that sediment instability may affect the spatial pattern of recruitment of some species. The ecological quality status of the Mont-Saint-Michel Bay was determined using six biotic indices defined under European Water Framework Directive (H', AMBI, BOPA, M-AMBI, UK index, DK index). The bay is classified as non-polluted and in good or high state although the ecological status values calculated with the various indices were different. For example, some indices accuracy was down weighted by the influence of environmental constraints typical of tidal flat which strongly affect species richness or total densities. Finally, an additional map was done based on the Natura 2000 habitat criteria.; En Manche, le golfe normano-breton se distingue par plusieurs particularités environnementales telles que la présence de structures hydrodynamiques tourbillonnaires autour des îles anglo-normandes, un des plus large estran européen en baie du Mont-Saint-Michel en raison d'un marnage exceptionnel, et de nombreuses activités humaines liées au tourisme, à la conchyliculture ou à la pêche artisanale. Au regard de son grand intérêt écologique et économique, le golfe constitue ainsi l'une des principales zones côtières pour laquelle des mesures coordonnées de gestion prenant en considération les impacts des activités humaines existantes est nécessaire. Dans ce contexte, afin d'évaluer l'impact des contraintes environnementales naturelles ou anthropiques sur la structure des communautés benthiques, deux systèmes à deux échelles spatiales différentes ont été étudiés : la communauté des sédiments grossiers à Glycymeris glycymeris du golfe normano-breton et l'estran de la baie du Mont-Saint-Michel. Les principales questions que nous avons traitées sont : (1) Comment les spécificités hydrodynamiques du golfe (i.e. structures ourbillonnaires) influencent la structure et la dynamique des communautés benthiques ? Quel est le rôle relatif des gradients environnementaux et de la conchyliculture sur les communautés benthiques de la baie ? Quel est le statut écologique de la baie ? A l'échelle du golfe, une très faible relation a été observée entre les cinq principales structures tourbillonnaires (i.e. Flamanville, Jersey, Guernesey, la baie de Saint-Brieuc et la baie du Mont-Saint-Michel) et la structure de la communauté des sables grossiers à G. glycymeris. La relative homogénéité de cette communauté est ainsi favorisée par la relative perméabilité des tourbillons et la distribution des espèces est plutôt contrôlée par la présence de fronts thermiques. Toutefois, des différences ont été observées dans les structures démographiques des principales espèces de bivalves (i.e. Paphia rhomboides, G. glycymeris et Timoclea ovata) entre les gyres, suggérant que la connectivité entre eux peut-être réduite. En dépit d'une élévation de la température d'environ 1,5°C au cours des 30 dernières années, une étude comparative de la distribution de quelques espèces entre nos données et des données acquises dans les années 70 ne met pas en évidence de profondes modifications à de rares exceptions près. A cette échelle, l'effet du réchauffement peut être associé aux perturbations induites par la pêche pour expliquer le déclin ou le développement des espèces. A l'échelle de la baie du Mont-Saint-Michel, les distributions des assemblages benthiques et des 4 principales espèces de bivalves (i.e. Abra alba, Cerastoderma edule, Macoma balthica et Spisula ovalis) suivent un gradient altitudinal conventionnel. Elles sont fortement contrôlées par des facteurs environnementaux naturels (i.e. hauteur sur l'estran, granulométrie) alors que la conchyliculture joue un rôle mineur : celle-ci favorise uniquement localement le développement d'espèces opportunistes, en particulier des oligochètes et des polychètes cirratulidae. La principale conséquence environnementale de la conchyliculture a vraisemblablement été l'introduction du gastéropode Crepidula fornicata qui régule fortement la production primaire au sein de la baie. L'analyse des structures démographiques des bivalves suggère que l'instabilité du sédiment influence fortement les patrons de recrutement de certaines espèces. Le statut écologique de la baie du Mont-Saint-Michel a été déterminé à partir de 6 indices biologiques développés dans le cadre de la Directive Cadre sur l'Eau (i.e. H', AMBI, BOPA, M-AMBI, UK index, DK index). La baie apparaît globalement classée dans un statut ‘bon' ou ‘fort' bien que les valeurs du statut écologique calculées par les différents indices puissent différer. Par exemple, dans un milieu soumis à de fortes contraintes environnementales naturelles qui influencent fortement la richesse spécifique ou les densités totales, la qualité de certains indices est altérée. Finalement, une carte des habitats de la baie a été dressée sur la base des cahiers d'habitats mise en place avec Natura 2000.

The Geography of Mortality in the Province of Quebec. This paper proposes a schematic view of the spatial organization of mortality in the province of Quebec. It is based on an extended analysis of the 1974 to 1983 mortality data and several factors from the physical and the social environment. It reveals the presence of 6 binary oppositions : between the poor and the rich sectors within the main cities, between the regional capitals and their satellites, between cities engaged in mining, forestry, heavy industries... and those engaged in services, between the urban and the rural environments, between the north and the south parts of the province of Quebec and, finally, between the west and the east parts of the province., Nous présentons ici de façon schématique les traits dominants d'une structure spatiale de la mortalité au Québec, Canada. Cette structure repose sur une analyse extensive de la mortalité survenue de 1974 à 1983 ainsi que d'un grand nombre de facteurs de l'environnement physique et social. Elle révèle la présence de 6 oppositions binaires : entre les quartiers pauvres et les quartiers riches, entre les capitales régionales et leurs satellites, entre les villes de ressources et les villes de services, entre l'urbain et rural, entre le nord et le sud du Québec et, finalement, entre l'ouest et l'est du Québec., Pampalon Robert. Géographie de la mortalité au Québec. In: Espace, populations, sociétés, 1991-1. Les inégalités géographiques de la mortalité (II) The Geographical Inequalities of Mortality (II) pp. 215-221.

Spacing structure between the Loja and Piura areas: continuity, transition and borderline differentiation The spacing structure between Loja and Piura has been approached with a long historical perspective. All inherited and/or actual dynamics affecting such structures are briefly analyzed while special emphasis is given to the details of a transition and contact territory where natural, cultural continuities, and ruptures occurred. A contemporary spacing is recollected particularly in the borderline continuity of the urban network or associated fields, which combined, constitute the environment of the regional system., Les structures de l'espace entre Loja et Piura sont envisagées ici dans la perspective du temps long. Les dynamiques, héritées ou actuelles, qui les affectent sont brièvement analysées, comme sont aussi soulignées les spécificités d'un territoire de transitions et de contacts, où interfèrent continuités et ruptures, naturelles ou culturelles. L'espace contemporain est plus spécialement resitué dans la continuité transfrontalière du réseau urbain ou celle des champs associés et combinés qui constituent l'environnement du système régional., Estructura del espacio entre Loja y Piura: continuidad, transición y diferenciación transfronteriza Las estructuras del espacio entre Loja y Piura han sido abordadas en una larga perspectiva histórica. Heredadas o actuales, las dinámicas que las afectan son brevemente analizadas, mientras que se da énfasis a la especificidad de un territorio de transiciones y contactos, donde interfieren continuidades y rupturas, tanto naturales como culturales. El espacio contemporáneo está más bien resituado en la continuidad transfronteriza de la red urbana o de los campos asociados y combinados que constituyen el entorno del sistema regional., Deler Jean-Paul. Structures de l'espace entre Loja et Piura : continuités, transitions et différentiation transfrontalière. In: Bulletin de l'Institut Français d'Études Andines, tome 20, N°2, 1991. Piura et sa région. pp. 279-294.

La répartition dans l’espace et la succession dans le temps de différentes procédures d’aménagement rural ont été étudiées, entre 1970 et 1987, dans la région Midi-Pyrénées. Des hypothèses sur la signification des structures spatiales observées, comme révélateur possible du dynamisme des territoires, ont été formulées. Cette démarche peut servir d’outil pour raisonner sur les possibilités de développement et d’aménagement d’une région.

How does geographical approach explain the past and the next future in the late Eastern Europe ? Long and short historical waves have produced defined geographical patterns. These patterns which are the matrix of cultural identities and have played a great part as signal for socio-politic hanges, may be also the bridle for the future., Comment une approche géographique de «feu l'Europe de l'Est» peut-elle éclairer les orientations et l'évolution prochaine de l'espace qui se dégage de la tutelle soviétique directe ? Des structures géographiques sont définies à travers une dialectique des mutations et des permanences : Europe intermédiaire à l'intersection d'influences extérieures, réseaux urbains et espaces ruraux spécifiés par le régime socialiste, région individualisées par leur dégradation environnementale... Ces structures géographiques, de moyenne et longue durée, portant sur de petits ou de grands espaces, ne sont pas de simples héritages. Elles sont les matrices spatiales des identités collectives. Elles peuvent jouer le rôle de détonateur des changements socio-politiques en cours, mais en être aussi les freins., Rey Violette. Feu l'Europe de l'Est ? . In: Annales de Géographie, t. 99, n°555, 1990. pp. 564-578.

L’étude quantitative d’un réseau d’infrastructure en géographie conduit souvent à évaluer des indicateurs sur les nœuds et les tronçons de ce réseau. Pour ce faire, le réseau est modélisé par un graphe dont les sommets et les arêtes sont respectivement associés aux infrastructures nodales et linéaires du réseau. Ce graphe est alors étudié grâce à des outils de théorie des graphes, essentiellement fondés sur les caractéristiques des plus courts chemins. Les indicateurs les plus classiques sont l’accessibilité (mesure de l’éloignement d’un sommet du graphe à l’ensemble de tous les autres sommets par résumé des longueurs de plus court chemin) et la centralité intermédiaire (mesure de la sollication d’un sommet ou d’une arête du graphe par comptage des plus courts chemins qui y transitent). De ce fait, les propriétés d’accessibilité et de centralité d’un sommet sont dictées par l’organisation des plus courts chemins sur le réseau et donc par la situation relative du sommet à l’intérieur de ce réseau. Cela étant, la localisation spatiale des sommets prédispose ceux-ci à être accessibles et centraux avant même de considérer les potentialités relationnelles offertes par le réseau : un sommet situé au centre géographique (resp. en périphérie) de la zone d’emprise du réseau aura ainsi plus (resp. moins) de chances d’être accessible et central. Sur la base de ce constat, il apparaît pertinent d’isoler les avantages procurés par le réseau pour rendre les sommets accessibles et centraux, indépendamment des facilités dont ceux-ci bénéficient compte-tenu de leur positionnement spatial a priori. Nous montrons alors qu’il est possible d’isoler les « effets réseau » et les « effets spatiaux » associés en comparant les plus courts chemins traditionnellement utilisés pour calculer ces indicateurs avec une classe de chemins optimaux appelés « chemins de Delaunay ». Outre l’étude des indicateurs d’éloignement et de centralité, la méthode que nous proposons peut être généralisée à l’étude de tout indicateur (structurel ou non), pourvu que celui-ci soit calculé à partir des plus courts chemins sur le réseau. La mise en évidence des effets réseau ainsi obtenue offre alors un outil utile pour nuancer l’interprétation des indicateurs mesurés sur le réseau et pour comprendre in fine la contribution réelle du réseau dans les phénomènes décrits par ces indicateurs. The quantitative study of an infrastructure network in geography often consists in assessing indicators on the network components (nodes and sections). In that respect, the network is modelled by a graph whose vertices and edges respectively correspond to the nodal and linear network infrastructures. Then, such a graph can be studied thanks to tools provided by the graph theory and mainly based on the shortest paths features. The most typical indicators are accessibility (closeness from a given vertex to the others graph vertices, computed in summarizing the shortest path lengths) and centrality or “betweenness” (contribution of a given vertex or edge to the origin-destination paths, computed in counting the shortest paths passing through this component). For this reason, accessibility and centrality features of a vertex depend on the shortest paths distribution on the network, and also on the relative location of the vertex inside the network. However, the spatial location of vertices predisposes them to be accessible and central, regardless of the relational potentialities provided by the network structure. Actually, a vertex located at the centre (resp. on the periphery) of the network area is more (resp. less) likely to be accessible and central. Therefore, it seems relevant to highlight how the network makes the vertices accessible and central, independently on the advantages only provided by their spatial location. Then, we show that it is possible to make allowances for the corresponding “network and spatial effects” by comparing the shortest paths traditionnally taken into account to compute these indicators with a set of optimal paths called “Delaunay paths”. Besides the study of accessibility and centrality indicators, our method can be extended to the study of any indicator (structural or not), as long as such an indicator is usually computed from shortest paths. It finally provides a useful tool to interpret indicators on a network and to understand the networks contribution to the phenomena described by these indicators.