Search

Dengue is a which spread rapidly attracted the attention of public authorities in Brazil in the 1990s. The arboviruses are transmitted by mosquitoes of the genus Aedes such as Aedes aegypti, are associated with serious epidemics of febrile diseases in tropical regions of the world. This virus has become a worrying public health problem, due to the high annual incidence. Infections are generally asymptomatic but when symptomatic, they evolve to cure or to hemorrhagic / neurological conditions. This study aimed to verify the prevalence of Dengue transmission through the Aedes aegypti vector in the years 2015 to 2019 in Piauí. The research is descriptive, quantitative, retrospective and transversal. Data were collected in the Sistema Nacional de Informação de Agravos de Notificação (SINAN). Based on the collected data, 28.219 cases of Dengue were reported with no significant difference in percentages in relation to gender, as for the age group, there was a prevalence of people from 20 to 39 years old. Regarding classification, most notifications did not specify the serotype. A predominance of cases of cure was identified with some blank notification fields. It is concluded that the susceptibility to the Dengue virus is universal, with a prevalence value of 8.57/1000 population with studies and discussions of epidemiological data about it and reinforcement of prevention. Are appointed as reflections the raise of awareness from the professionals in charge of doing the notifications of Diseases of Compulsory Notification in SINAN, as being mandatory to fill in all fields of the form. La dengue es una dolencia, cuya diseminación rápida llamó la atención de las autoridades públicas de Brasil en la década de 1990. Los arbovirus transmitidos por el mosquito, del género Aedes, como Aedes aegypti, estan asociados a las epidemias serias de dolencias febril en las regiones tropicales del mundo. Estos virus se convirtieron en un preocupante problema de la salud pública, a causa de su elevada incidencia anual. Las infecciones son generalmente sin síntomas; cuando sintomáticos, evolucionan para cura o para cuadros hemorrágicos neurológicos. Este trabajo objetivó averiguar la prevalencia de la transmisión de la Dengue a través del vector Aedes Aegypti en los años de 2015 hasta 2019 en Piauí. La pesquisa es descriptiva, de carácter cuantitativo, retrospectivo y trasversal. La recolecta de datos fue hecha en el Sistema Nacional de Informação de Agravos de Notificação - SINAN. Fueron notificados 28.219 casos de Dengue sin diferencias significativas de porcentuales en relación al género. Cuanto al rango de edad, hubo prevalencia de personas entre los 20 hasta 39 años. Con relación a la clasificación, no especificaron la tipología. Se identificó el predominio de casos de cura, con algunos huecos de notificación no rellenados. Se concluye que la susceptibilidad al virus de la Dengue sea universal, con un valor de prevalencia de 8.57/1000 habitantes siendo necesario estudios y discusiones de los datos epidemiológicos sobre esta, y refuerzo de la prevención. Se presenta la reflexión para la sensibilización de los profesionales en la realización de las notificaciones de la dolencia de notificación compulsoria en el SINAN, por lo tanto obligatoria rellenar por completo todos los datos en la ficha. A dengue é uma doença, cuja disseminação rápida atraiu atenção das autoridades públicas do Brasil na década de 1990. Os arbovírus transmitidos por mosquitos do gênero Aedes, como Aedes aegypti, estão associados a epidemias sérias de doenças febris nas regiões tropicais do mundo. Este vírus se tornou um preocupante problema de saúde pública, devido elevada incidência anual. As infecções são geralmente assintomáticas e quando sintomáticas, evoluem para uma situação de cura ou de quadros hemorrágicos/neurológicos. Este trabalho objetivou verificar a prevalência da transmissão da Dengue através do vetor Aedes aegypti nos anos de 2015 a 2019 no Piauí. A pesquisa é do tipo descritiva, de caráter quantitativo, retrospectivo e transversal. Coletaram-se os dados no Sistema Nacional de Informação de Agravos de Notificação (SINAN). Com base nos dados coletados foram notificados 28.219 casos de Dengue, sem diferenças significativas de percentuais em relação ao gênero, mas quanto à faixa etária, houve prevalência de pessoas de 20 a 39 anos. Em relação à classificação, a maioria das notificações não especificou o sorotipo. Identificou-se predomínio de casos de cura, com alguns campos de notificação não preenchidos. Conclui-se que a suscetibilidade ao vírus da Dengue seja universal, com um valor de prevalência de 8,57/000 habitantes, cabendo estudos e discussões dos dados epidemiológicos e reforço da prevenção. Apontam-se reflexões para sensibilização dos profissionais na realização das notificações das Doenças de Notificação Compulsória no SINAN propondo obrigatoriedade no preenchimento de todos os campos da ficha.

Este estudo teve o objetivo de avaliar, dentre as cepas invasivas de Streptococcus pneumonias, o perfil de sorotipos e as implicações na formulação de vacinas pneumocócicas, a suscetibilidade aos antimicrobianos e, também, aspectos clínico- epidemiológicos de pacientes com doença pneumocócica invasiva, fontes de recuperação do pneumococo. As cepas isoladas no Laboratório de Análises Clínicas do Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia, MG, a partir de amostras clínicas de pacientes com doença invasiva, foram identificadas e enviadas ao Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, SP, para confirmação da identificação, sorotipagem e determinação da suscetibilidade aos antimicrobianos. De abril de 1999 a março de 2003, foram isoladas 148 cepas invasivas, sendo 84 (56,7%) provenientes de pacientes do sexo masculino. A idade variou de um dia a 88,8 anos, com média de 21,3 ± 25,8 anos e mediana de 4,4 anos. Os diagnósticos clínicos mais comuns foram pneumonia [91 casos (61,4%)], meningite [32 casos (21,6%)] e bacteremia sem foco evidente [15 casos (10,1%)]. As principais fontes de recuperação foram sangue [76 amostras (51,3%)], líquido pleural [39 (26,3%)] e líquor [30 (20,2%)]. A morte ocorreu em 22,3% dos pacientes, com cifras significantemente mais elevadas naqueles acima de 64 anos. Um total de 23 diferentes sorotipos foram identificados entre 143 amostras testadas e os mais comuns foram 14, 1, 3, 5, 6A, 6B e 18C. As cifras de cobertura para a vacina 7-valente, atualmente disponível, foram de 46,7% dos sorotipos e 63,6% das cepas obtidas de crianças com até cinco anos de idade. Dentre 30 (20,2%) cepas oxacilina-resistentes, 23 (15,5%) confirmaram a resistência à penicilina (12,8% com nível intermediário e 2,7% com nível pleno), que esteve restrita aos sorotipos 14, 23F, 19A e 6B, e predominou em indivíduos até dois anos de idade (p= 0,0008). Houve elevada concordância dos valores da concentração inibitória mínima da penicilina entre os dois métodos empregados. Foi detectada suscetibilidade diminuída ao cotrimoxazol (63,4%), à eritromicina (8,3%), à clindamicina (8,7%) e à ofloxacina (0,8%). A resistência à cefotaxima foi detectada em três das 30 cepas testadas (2% das 148), todas elas com resistência confirmada à penicilina. Não foi observada resistência ao cloranfenicol, à rifampicina ou à vancomicina. The aim of this study was to evaluate, among invasive streptococcus pneumonia strains, the profile of serotypes and the implications for the formulation of pneumococcal vaccines, susceptibility to antimicrobials and also clinical and epidemiological aspects of patients with invasive pneumococcal disease. pneumococcal recovery. The strains isolated from the Clinical Analysis Laboratory of the Clinical Hospital of the Federal University of Uberlândia, MG, from clinical samples of patients with invasive disease, were identified and sent to the Adolfo Lutz Institute, São Paulo, SP, for confirmation of identification. serotyping and antimicrobial susceptibility determination. From April 1999 to March 2003, 148 invasive strains were isolated, 84 (56.7%) from male patients. The age ranged from one day to 88.8 years, with a mean of 21.3 ± 25.8 years and a median of 4.4 years. The most common clinical diagnoses were pneumonia [91 cases (61.4%)], meningitis [32 cases (21.6%)] and bacteremia without overt focus [15 cases (10.1%)]. The main sources of recovery were blood [76 samples (51.3%)], pleural fluid [39 (26.3%)] and cerebrospinal fluid [30 (20.2%)]. Death occurred in 22.3% of patients, with significantly higher numbers in those over 64 years. A total of 23 different serotypes were identified among 143 samples tested and the most common were 14, 1, 3, 5, 6A, 6B and 18C. Coverage figures for the currently available 7-valent vaccine were 46.7% of serotypes and 63.6% of strains obtained from children up to five years old. Of 30 (20.2%) oxacillin-resistant strains, 23 (15.5%) confirmed resistance to penicillin (12.8% at intermediate level and 2.7% at full level), which was restricted to serotypes 14, 23F, 19A and 6B, and predominated in individuals up to two years old (p = 0.0008). There was a high agreement of the penicillin minimum inhibitory concentration values ​​between the two methods employed. Decreased susceptibility to cotrimoxazole (63.4%), erythromycin (8.3%), clindamycin (8.7%) and ofloxacin (0.8%) were detected. Cefotaxime resistance was detected in three of the 30 strains tested (2% of 148), all with confirmed penicillin resistance. No resistance to chloramphenicol, rifampicin or vancomycin was observed. Dissertação (Mestrado)

A salmonelose é uma causa conhecida de distúrbios entéricos em bezerros. Porém, casos na forma septicêmica podem não apresentar manifestação entérica, o que leva o médico veterinário a não suspeitar de salmonelose, comprometendo o diagnóstico. Este estudo descreve os aspectos epidemiológicos, clínicos, patológicos e imuno-histoquímicos da salmonelose septicêmica em bezerros sem lesões entéricas. O estudo foi realizado a partir dos protocolos referentes a materiais de bovinos enviados para diagnóstico ao Laboratório de Anatomia Patológica (LAP) da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FAMEZ) da Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS) de janeiro de 1995 a julho de 2018. Foram selecionados os casos de bezerros confirmados ou sugestivos de salmonelose septicêmica sem lesões entéricas. Fragmentos de fígado, pulmão e baço embebidos em parafina foram submetidos ao exame de imuno-histoquímica (IHQ). Somente foram incluídos neste estudo casos em que houve marcação positiva na IHQ ou isolamento da bactéria em cultura. De um total de 5.550 bovinos examinados no período, dez apresentaram salmonelose septicêmica sem lesão entérica. Os sinais clínicos incluíram palidez de mucosas, apatia, hipertermia e dispneia. Apenas três bezerros apresentaram diarreia e dois foram encontrados mortos sem terem sido observadas alterações clínicas. Os achados mais frequentes de necropsia foram hepatoesplenomegalia, fígado amarelado, alaranjado ou acastanhado, palidez de mucosas, pulmões inflados e, por vezes, vermelhos, fibrina ou líquido nas cavidades do organismo e vesícula biliar repleta de bile grumosa. Icterícia foi observada em três bezerros que apresentavam infecção concomitante por Anaplasma sp. Microscopicamente, os nódulos paratifoides hepáticos e pneumonia intersticial foram as manifestações mais encontradas, seguidas por trombose e colônias bacterianas no baço, pulmão, fígado e encéfalo. Na IHQ, marcação fortemente positiva foi observada, predominantemente, no pulmão e, em menor intensidade, no fígado. A técnica de reação em cadeia de polimerase (PCR) tipificou o sorotipo Dublin como agente etiológico nas amostras dos quatro bezerros submetidos a este procedimento. Em bezerros, a forma septicêmica foi a principal responsável pelas mortes por salmonelose. Na maioria das vezes essa forma não estava acompanhada por diarreia. Os sinais clínicos da forma septicêmica são inespecíficos e de pouco auxílio no direcionamento do diagnóstico. A IHQ mostrou-se eficiente na detecção do agente principalmente no pulmão e especialmente nas situações em que não é possível a realização da cultura bacteriana. Salmonellosis is a known cause of enteric disorders in calves. However, cases in the septicemic form may not present enteric lesions, which may lead the veterinary practitioner to not suspect salmonellosis, compromising the diagnosis. The current study describes the epidemiological, clinical, pathological and immunohistochemical aspects of septicemic salmonellosis in calves without enteric lesions. The protocols involving bovine material submitted to the Pathology Laboratory (LAP) of the “Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia” (FAMEZ) of the “Universidade Federal do Mato Grosso do Sul” (UFMS) from January 1995 to July 2018 were studied. Cases confirmed or suggestive of septicemic salmonellosis in calves without enteric manifestations were selected. Fragments of the liver, lung, and spleen embedded in paraffin were submitted to immunohistochemistry (IHC). Only cases in which there was positive marking on the IHC or culture isolation of Salmonella were included in this study. Of a total of 5,550 cattle examined in the period, ten presented septicemic salmonellosis without enteric lesions. Clinical signs included mucosal pallor, apathy, hyperthermia, and dyspnea. Only three calves presented diarrhea, and two were found dead before clinical changes were observed. The most common necropsy findings were hepatosplenomegaly; yellow, orange or brown discolored livers; pale mucous membranes; inflated and sometimes red lungs; fibrin or fluid within body cavities; and gallbladder filled with inspissated bile. Jaundice was observed in three calves that had a concomitant infection with Anaplasma sp. Microscopically, paratyphoid hepatic nodules and interstitial pneumonia were the most frequent manifestations, followed by thrombosis and bacterial colonies in the spleen, lung, liver, and brain. A strong positive marking was observed in IHC, predominantly in the lung and to a lesser extent in the liver. Polymerase chain reaction (PCR) indicated the Dublin serotype as the causative agent in the samples of the four calves submitted to this procedure. In calves, the septicemic form was the major cause of death due to salmonellosis. Septicemic salmonellosis was usually not accompanied by diarrhea. The clinical signs of septicemia are nonspecific and of little assistance in the diagnosis. IHC has been shown to be efficient in the detection of the agent, mainly in the lung and especially in situations where it is not possible to perform bacterial culture.

The diagnosis of dengue cases in Central Laboratories of Public Health (LACEN) of the country includes the research of NS1 protein and only in positive cases, diagnostic confirmation occurs by identifying the serotype. Data provided by the Epidemiological Surveillance of Sergipe revealed that the first half of 2016 all suspected cases that reached the LACEN / SE were negative on screening tests, even in the thirty-first epidemiological week of the same year, Sergipe has reached the seventh place in the racking of dengue cases in the Northeast region and the third in the Quick Survey Infestation Index by Aedes aegypti. This study aimed to identify the serotypes and the epidemiological profile of suspected dengue cases in the first half of 2016. The 437 suspected dengue patients from January to June of this year were registered in LACEN / SE. After exclusion criteria, 382 serum samples of these patients diagnosed and negative for dengue by ELISA NS1 Antigen Platelia kit method were analyzed by RT-PCR in real time on the multiplex system for confirmation of suspected cases of dengue. The distribution of patients according to epidemiological and demographic variables revealed that there was a predominance of cases in the south central region of the state and large Aracaju (53.5%) inferring the ease in access to outpatient and laboratory service in the region the most affected gender was female (62.8%) and the age group of highest incidence was 20-59 years (59.3%). The highest rate was in urban areas (84.9%) and the first three days of symptoms (63.9%) with higher sampling rate. The prevalence of dengue in cases initially presented as a suspect was 22.5% (86) distributed among serotypes DENV4 82.5% (71), DENV1 9.3% (8) and DENV3 8.1% (7). Compared to official data reported that there were no cases of dengue in the period, this study reveals the positive for dengue with cocirculation of three distinct serotypes being DEV4 the predominant. As also, reports the first evidence of the last ten years of DENV3 serotype circulating in the state. Data analysis enabled to view an underreporting of cases screened and thus suggest a reassessment of the methods used as diagnostic screening so that they can take control measures to the potential for severe disease in a population. O diagnóstico de casos de dengue nos Laboratórios Centrais de Saúde Pública (LACEN) do país contempla a pesquisa da proteína NS1 e, somente em casos positivos, a confirmação diagnóstica ocorre pela identificação do sorotipo. Dados disponibilizados pela Vigilância epidemiológica de Sergipe revelaram que no primeiro semestre de 2016 todos os casos suspeitos que chegaram ao LACEN/SE foram considerados negativos nos testes de triagem, ainda que na trigésima primeira semana epidemiológica do mesmo ano, Sergipe tenha alcançado o sétimo lugar no racking de casos de dengue da região Nordeste e o terceiro no Levantamento Rápido do Índice de Infestação por Aedes aegypti. O presente trabalho teve como objetivo conhecer da dengue no estado de Sergipe no primeiro semestre de 2016 relacionando-os com alguns parâmetros epidemiológicos. Os 437 pacientes suspeitos de dengue, de janeiro a junho do presente ano, foram cadastrados no LACEN/SE. Após critérios de exclusão, 382 amostras séricas destes pacientes com diagnóstico e resultado negativo para dengue através da metodologia ELISA NS1 Antígeno do kit Platelia foram analisadas pela técnica de RT-PCR em tempo real no sistema multiplex para a confirmação dos casos suspeitos de dengue. A distribuição dos pacientes de acordo com as variáveis epidemiológicas e demográficas revelou que houve predominância dos casos na região centro-sul do estado e da grande Aracaju (53,5%) podendo-se inferir a facilidade no acesso ao atendimento ambulatorial e laboratorial nessa região, o gênero mais acometido foi o feminino (62,8%) e a faixa etária de maior incidência foi 20 a 59 anos (59,3%). A maior frequência foi na zona urbana (84,9%) e os três primeiros dias dos sintomas (63,9%) com maior índice de coletas. A incidência de dengue nos casos que incialmente se apresentaram como suspeita foi de 22,5% (86) distribuídas entre os sorotipos DENV4 82,5% (71), DENV1 9,3% (8) e DENV3 8,1% (7). Em comparação aos dados oficias que informavam que não houve casos de dengue no referido período, este estudo revela a positividade para dengue com co-circulação de três sorotipos distintos sendo o DENV4 o predominante. Ademias, relata a primeira evidência, dos últimos dez anos, de circulação do sorotipo DENV3 no estado. A análise dos dados permitiu visualizar uma subnotificação dos casos triados e, assim, sugerir uma reavaliação dos métodos utilizados como triagem diagnóstica para que se possam tomar medidas de controle para riscos potenciais de formas graves da doença numa população. Lagarto, SE

This study aims to assess the prevalence of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) in ground beef collected in two cities located in the State of São Paulo, Brazil. A total of 250 samples of raw ground beef were collected in local grocery stores during the period of March to December 2002 in the cities of Ribeirão Preto (114 samples) and Campinas (136 samples), São Paulo State, Brazil. The samples were processed according to standard methods. The resulting 591 E.coli colonies were screened for STEC by hybridization assays using the specific DNA probes, stx1,stx2 and eae. Further characterization of STEC isolates included the search for the ehxA sequence, detection of enterohemolysin and expression of Shiga toxin using the Vero cell assay. STEC isolates belonging to serotypes O93:H19, ONT:HNT, ONT:H7, and O174:HNT we recovered from four samples (3.5%) collected in Ribeirão Preto. All samples from Campinas were negative for STEC. Three of the strains carried stx2 and ehxA sequences while one harbored stx1,stx2 and ehxA sequences. Considering that among foods of animal origin, ground beef is an important vehicle for STEC transmission, these data emphasize the need of a closer surveillance of these microorganisms. They can survive in unfavorable conditions specially when the products are refrigerated or frozen for long periods of time and can be the cause of outbreaks affecting a great number of consumers.O objetivo deste estudo foi verificar a ocorrência de Escherichia coli produtora de toxina Shiga (STEC) em amostras de carne moída crua comercializadas em duas cidades do Estado de São Paulo, Brasil. Um total de 250 amostras de carne moída crua foi coletado de açougues locais durante o período de Março a Dezembro de 2002, nas cidades de Ribeirão Preto (114 amostras) e de Campinas (136 amostras), Estado de São Paulo, Brasil. As amostras foram processadas de acordo com os métodos de referência. Um total de 591 colônias de E.coli foi submetido à técnica de hibridização de colônias usando sondas específicas de DNA para a detecção das seqüências stx1,stx2 e eae. Caracterizações adicionais das cepas STEC incluíram a pesquisa da seqüência ehxA, a detecção da enterohemolisina e a pesquisa da expressão de toxina Shiga utilizando testes com células Vero. Em quatro amostras (3,5%) coletadas em Ribeirão Preto, foram encontradas cepas STEC, mas todas aquelas da região de Campinas foram negativas. As cepas de STEC pertenciam aos sorotipos O93:H19, ONT:HNT, ONT:H7, e O174:HNT. Três cepas tinham o perfil stx2 ehxA e uma era portadora das seqüências stx1,stx2 e ehxA. Considerando que entre os alimentos de origem animal, a carne moída ainda representa um importante veículo de transmissão de STEC, estes dados alertam para a necessidade de uma vigilância da presença destes microrganismos capazes de sobreviver em condições desfavoráveis, especialmente quando os produtos são refrigerados ou congelados por longos períodos, podendo ser causas de importantes surtos afetando grande número de consumidores.

From a total of 187 fecal samples from children with ages between 0 and 5 years, collected in the Hospital Universitário -USP, Brazil, from 1994 to 1996, 54 (28.9%) were positive for rotavirus. Positive samples were characterized by electropherotyping, subgrouping, G serotype and genotype and P genotype. Rotavirus electropherotypes were characterized in four different long genome patterns (38.9%), one short genome pattern (34.0%) and 18.0% were characterized as an unusual pattern. Subgroup I was found in 38.9% strains, subgroup II in 50.0% and 7.7% was subgroup nonI-nonII. For G serotypes, G2 was found in 59.3%, G1 was identified in 33.3% of strains, two samples showed mixtures of G1+G2 and one sample was G1+G3. Ten samples characterized as serotype G2 showed a long eletropherotype. Genotype G2 was the most frequently and was found in 37 (44.0%) samples (23 samples as a single genotype and 14 as mixtures of genotypes). G1 was found in 15 samples. G3 and G4 was detected mainly in mixtures of genotypes and G5, G6 and G9 were identified only in mixtures. A total of 20 (38.5%) samples were characterized as G genotype mixtures and P mixtures were found in 16 (29.6%) samples. P[4] was found in 55.6% of samples, P[8] in 51.9% and P[6-M37 like] in 22.3% of cases. P[6-Gottfried like] and P[11] were detected only in mixtures. One sample with G6 specificity, mixed with a G2 rotavirus and a P[11] strain, mixed with P[4] and P[8]strain was described for the first time in Latin America.De um total de 187 amostras fecais de crianças com idades entre 0 e 5 anos, coletadas no Hospital Universitário -USP, Brasil, de 1994 a 1996, 54 (28.9%) foram positivas para rotavírus. As amostras positivas foram caracterizadas quanto ao eletroferótipo, subgrupo, sorotipo G e genotipo G e P. Foram identificados quatro diferentes eletroferótipo longos em 38.9% das amostras, um eletroferótipo curto (34,0%) e 18,0% foram caracterizadas como um eletroferótipo não usual. O subgrupo I foi encontrado em 38,9% amostras, o subgrupo II em 50,0% e nãoI-nãoII em 7,7%. O sorotipo G2 foi encontrado em 59,3% e G1 em 33,3%. Duas amostras apresentaram misturas de G1+G2 e outra amostra G1+G3. Dez amostras caracterizadas como sorotipo G2 mostraram perfil eletroferótico longo. O genotipo G2 foi o mais freqüente, encontrado em 37 amostras (23 como único genotipo e 14 associados a outro genotipo). G1 foi encontrado em 15 amostras; G3 e G4 foram detectados principalmente em misturas e G5, G6 e G9, identificados somente em misturas. Um total de 20 (38,5%) amostras foram identificadas como misturas de genotipo G e foram encontradas 16 (29,6%) amostras com misturas de genotipo P. P[4] foi encontrado em 55,6% das amostras, P[8] em 51,9% e P[6-M37 like], em 5,5% das amostras. P[6-Gottfried like] e P[11] foram detectados somente em misturas. Uma amostra com especificidade G6, associada ao genotipo G2 e outra P[11] misturada com P[4] e de P[8] foram identificadas pela primeira vez na América Latina.

Avaliaram-se 40 amostras de ostras (Crassostrea rhizophorae) servidas in natura em 15 restaurantes da Cidade do Rio de Janeiro, a fim de investigar a presença de Vibrio spp. As amostras de ostras foram analisadas e submetidas a enriquecimento em água peptonada alcalina adicionada de 1 e 3% de NaCl, incubadas a 37°C por 24 horas. Em seguida, os cultivos foram semeados em agar tiossulfato citrato bile sacarose e as colônias suspeitas foram submetidas à caracterização bioquímica. Vibrio parahaemolyticus, Vibrio carchariae, Vibrio alginolyticus e Vibrio vulnificus representaram as principais espécies (> 60%) isoladas a partir das ostras in natura.

Streptococcus pneumoniae é o patógeno responsável pelas maiores taxas de morbidade e mortalidade em crianças, principalmente em países em desenvolvimento. A colonização da nasofaringe é a chave para o desenvolvimento das doenças pneumocócicas, bem como para a transmissão horizontal desse patógeno na comunidade. Crianças são o principal reservatório de S. pneumoniae e atuam como vetores dentro da cadeia de transmissão desse microrganismo. As vacinas pneumocócicas conjugadas (PCV) protegem contra as doenças pneumocócicas causadas pelos sorotipos vacinais, atuando também na proteção contra a colonização pelos mesmos sorotipos. Em 2010, o Brasil introduziu a PCV10 no programa de imunização infantil. Este trabalho é um estudo de base populacional que foi conduzido imediatamente após a introdução da PCV10 para determinar a taxa de portador desse patógeno em crianças não vacinadas que frequentam creches no município de Goiânia. Esses dados poderão ser utilizados como linha de base epidemiológica para avaliação da dinâmica dos sorotipos circulantes na comunidade após a introdução da vacina. Foram coletados, nos meses de outubro e novembro de 2010, 853 swabs de secreção da nasofaringe em crianças entre 36 a 59 meses que frequentavam creches no município de Goiânia. Para o isolamento e identificação de S. pneumoniae as amostras foram incubadas por 6 h em caldo enriquecido e semeadas em ágar sangue. Colônias α-hemolíticas sensíveis à optoquina e à bile foram identificadas como S. pneumoniae. Os isolados foram sorotipados por PCR multiplex convencional. A base de dados foi construída com o programa estatístico SPSS (Chicago, IL, USA) versão 18.0. Os possíveis fatores de risco foram avaliados por regressão de Poisson multivariada. O nível de probabilidade de 0,05 (bi-caudal) foi utilizado para determinar a significância estatística. A prevalência de portador do pneumococo foi de 57,6% (IC95%: 54,2% - 60,9%). De acordo com a análise multivariada crianças com idade entre 36-47 meses de idade (IRR: 1,117; IC95%:1,007 – 1,238; p= 0,035) e crianças em cujos domicílios haviam quatro ou mais pessoas residentes (IRR: 1,1214; IC95%: 1,078 – 1,368; p= 0,001) foram considerados fatores de risco independentemente associados para a colonização pneumocócica. A variável renda familiar igual ou superior a três salários mínimos foi considerada um fator protetor independentemente associado para a colonização pneumocócica (IRR: 0,787; IC95%: 0,627 – 0,990; p= 0,041). Os sorotipos/sorogrupos mais prevalentes foram 6A/6B/6C/6D (n=80; 16,3%), 14 (n=47; 9,6%), 23F (n=46; 9,4%), 19F (n=43; 8,8%), 15B/15C (n=30; 6,1%), 11A/11D (n=28; 5,7%), 3 (n=22; 4,5%) e 19A (n=16; 3,3%). Nossos resultados mostraram uma alta prevalência de colonização por pneumococo entre a população estudada, indicando que a colonização por esse microrganismo é comum entre crianças, principalmente em ambientes que favorecem a aglomeração. Os principais sorotipos/sorogrupos encontrados são contemplados pela PCV10. Streptococcus pneumoniae remains as a major cause of childhood morbidity and mortality worldwide, especially in developing countries. Nasopharyngeal colonization is the key of the development of pneumococcal diseases as well as for horizontal spread of this pathogen in the community. Children are the main reservoir of S. pneumoniae and act as vectors in the transmission chain of this microorganism. Pneumococcal conjugate vaccines protect against pneumococcal disease caused by vaccine serotypes, also contributes to the protection against colonization by the same serotypes. In 2010, PCV10 was introduced in the childhood immunization program of Brazil. This is a population-based study that was conducted immediately after the introduction of the vaccine in order to determine the carriage rate of this pathogen in children attending in day care centers in Goiania. These data may be used as a predictor for evaluating the dynamic of the circulating serotypes into the community after the vaccine introduction. Between October and November 2010, nasopharyngeal swabs were collected from 853 children ranging from 36 to 59 months attending in day care centers in Goiania. Isolation and identification of S. pneumoniae were done after the incubation step on broth-enriched for 6 h and posterior plating on blood agar. Isolates that were α-haemolytic, optochin-sensitive and soluble in bile were identified as S. pneumoniae. The isolates were serotyped by cmPCR. The database had been built with the statistical program SPSS (Chicago, IL, USA) version 18.0. The possible risk factors were assessed by multivariate Poisson regression. The level of probability of 0.05 (two-tailed) was used to determine statistical significance. The prevalence of pneumococcus carrier was 57.6% (CI95%: 54.2% - 60.9%). According to the multivariate Poisson regression analysis, children aged 36-47 months (IRR: 1.117; CI95%: 1.007-1.238; p: 0.035) and children in whose houses had four or more residents (IRR: 1.1214; CI95%: 1.078-1.368; p 0.001) were considered risk factors independently associated to pneumococcal colonization. The variable family income equal to or greater than three minimum wages was considered a protective factor independently associated to pneumococcal colonization (IRR: 0.787; CI95%: 0.627-0.990; p 0.041). The most prevalent serotypes and serogroups founded were 6A/6B/6C/6D (n=80; 16.3%), 14 (n=47; 9.6%), 23F (n=46; 9.4%), 19F (n=43; 8.8%), 15B/15C (n=30; 6.1%), 11A/11D (n=28; 5.7%), 3 (n=22; 4.5%) and 19A (n=16; 3.3%). Our results showed a high prevalence of pneumococcal colonization among the study population, indicating that colonization by this microrganism is common among children, especially in environments that favor crowding. The main serotypes/serogroups are cover by PCV10. Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq

OBJETIVOS: descrever resistência antimicrobiana e sorotipos de cepas de pneumococo. MÉTODOS: durante 57 meses, foi conduzida uma vigilância de cepas invasivas de pneumococo de pacientes com idade

Foram realizadas a identificação e a sorotipagem de C. albicans isoladas de fezes de bovinos em amamentação natural. Para o isolamento, utilizou-se o meio seletivo e diferencial de Pagano Levin, adicionado de bifenilo na concentração final de 0,1%. De 210 bovinos inicialmente considerados, 70 adultos, 68 bezerros após o desmame e 72 bezerros em fase de amamentação natural, observou-se positividade para C. albicans somente em nove amostras de fezes de bezerros em fase de amamentação (12,5%). A determinação do sorotipo por meio de provas de aglutinação direta em lâmina, com soros monoespecíficos, revelou que a totalidade das amostras isoladas pertencia ao sorotipo A. O bifenilo na concentração de 0,1% mostrou-se inibitório para a maioria dos bolores sem, aparentemente, afetar a viabilidade de C. albicans. O isolamento de C. albicans somente a partir de fezes de bezerros em amamentação, provavelmente, está relacionado à dieta láctea. The identification and serotyping of C. albicans isolated from the bovine feces of suckling calves were performed. For isolation, the selective and differential Pagano Levin medium with biphenyl added to a final concentration of 0.1% was used. The experiment was conducted with 70 adult animals, 68 calves after weaning and 72 suckling calves. The positivity for C. albicans was observed in nine samples of feces from this last group (12.5%). The determination of serotype of the isolates through the direct agglutination test with monoespecific serum revealed that all samples belong to serotype A. The biphenyl in a concentration of 0.1% proved to be inhibitory for the majority of moulds, without affecting the viability and multiplication of C. albicans. The isolation of Candida albicans from the feces of suckling calves is probably associated in cattle to milk diet.

Foram colhidas amostras de fezes de lote de suínos em 10 granjas terminadoras do Estado do Rio Grande do Sul para pesquisa de Salmonella sp. Duas granjas consideradas negativas (N1 e N2) e uma positiva (P1) nesta primeira etapa foram escolhidas para colheita de amostras de fezes individuais de 25 animais escolhidos aleatoriamente. No abatedouro foram coletados swab retal, conteúdo intestinal e linfonodos mesentéricos dos mesmos animais amostrados na granja. Após a introdução de novos animais nas granjas N1 e P1, outros 25 animais foram amostrados em cada granja, da mesma forma descrita acima. Três granjas tiveram amostras de fezes de lote positivas, sendo que em duas foi constatado um alto nível de contaminação. Foram encontrados 8 sorotipos de Salmonella (Agona, Bredeney, Lexington, London, Mbandaka, Panama, Schwartzengrund, Salmonella sp), sendo os sorotipos Agona e Bredeney os mais encontrados. Na colheita individual realizada, todas as granjas amostradas foram positivas. Em 6,4% das amostras de fezes colhidas na granja, 5,3% das amostras de conteúdo intestinal e 5,6% dos linfonodos mesentéricos foi possível isolar Salmonella. O antibiograma das linhagens de Salmonella isoladas demonstrou 97,8% de resistência à sulfonamida, 82,6% à estreptomicina, 36,9% à tetraciclina e 15,2% à sulfazotrim.

INTRODUCTION: To detect dengue virus, eggs of Aedes sp were collected in the city of Belo Horizonte, Brazil, in 2007. METHODS: Egg samples were subsequently hatched and the larvae were tested for the presence of dengue virus RNA by RT-PCR. RESULTS: Among the Aedes aegypti larvae samples, 163 (37.4%) out of 435 were positive, including 32 (10.9%) of 293 individual larvae samples concomitantly positive for two serotypes. CONCLUSIONS: Virological surveillance detecting coinfected vectors in the field could represent an important strategy for understanding the numerous factors involved in the transmission and clinical presentation of dengue.

Introdução: A primeira notificação de dengue no estado de Minas Gerais ocorreu em 1987. Em maio de 1996 foram confirmados os primeiros casos na região metropolitana do Estado. A partir daí ocorre uma rápida dispersão da doença, culminando com a primeira grande epidemia no ano de 1998, com 147.418 casos notificados. A região metropolitana de Belo Horizonte respondeu por 87% dos casos notificados. Em 1999 ocorre uma diminuição significativa dos casos, porém já o ano seguinte apresenta nova tendência de aumento, culminando com novo aumento do número de casos no ano de 2002. Mais recentemente o Estado apresentou duas grandes epidemias em 2010 e 2013, com aproximadamente 250.000 e 500.000 casos notificados respectivamente. Apesar do expressivo número de casos no Estado, pouco se sabe da epidemiologia e das tendências da doença no território mineiro. O objetivo deste trabalho foi descrever e analisar as tendências epidemiológicas da doença no estado de Minas Gerais com ênfase no período de 2001 a 2010 e avaliar possíveis fatores associados ao óbito por dengue. Métodos: (i) Estudo ecológico com análises espacial e de séries temporais e estudo de série de casos realizados a partir dos dados coletados pela vigilância da dengue no estado de Minas Gerais com ênfase nos anos de 2001 a 2010, (ii) estudo de caso e (iii) série de casos de pacientes admitidos em unidades de terapia intensiva. Foram usados como fonte secundária de dados o Sistema de Informação de Agravos de Notificação (SINAN), o Sistema de Informação Hospitalar (SIH), e dados oriundos de investigações de prontuários. Resultados: Dengue, no estado de Minas Gerais, apresenta história relativamente recente com três maiores epidemias (1998, 2010, 2013). Durante o período de 2001 a 2010 ocorreram 683.190 casos de dengue notificados com 237 óbitos por dengue. Os casos de dengue notificados ocorreram durante todo o ano com tendência a aumento nos meses de novembro e dezembro, e maior número de notificações nos meses de março e abril. O Estado apresentou uma estimativa de 3,79 (IC95%: 2,97; 4,71) casos de óbito por dengue para cada 10.000 casos notificados. Ocorreu um aumento de incidência em todas as faixas etárias, entretanto o aumento de incidência foi mais intenso em menores de 15 anos. Enquanto os sorotipos 1 e 2 predominaram até 2002, durante o período de 2003 a 2008 houve um predomínio do sorotipo 3. Adultos jovens apresentaram as maiores incidências durante o período, entretanto, pacientes com idade maior ou igual a 65 anos apresentaram maior risco de óbito. Em 2011 é introduzido pela primeira vez o sorotipo 4 no Estado culminando com a epidemia de 2013. Em dezembro de 2012 ocorre o primeiro óbito por dengue do sorotipo 4 no Estado, uma criança de 11 anos com história de púrpura autoimune. Durante o ano de 2013 o Estado conhece sua maior epidemia com importante contribuição do emergente DENV-4. O perfil dos óbitos mostra uma alta freqüência de comorbidades e elevado risco de óbito para pacientes com idade maior ou igual a 65 anos. No período de 2008 a 2013, 370 casos suspeitos de dengue em adultos foram admitidos em unidades de terapia intensiva. Entre os 97 casos confirmados laboratorialmente incluídos neste estudo, a letalidade foi de 19,6%. A mortalidade hospitalar esteve associada aos escores APACHE II (Acute Physiology and Chronic Health Evaluation II) e SOFA (Sequential Organ Failure Assessment). Conclusão: o Estado apresenta aumento crescente nas incidências de casos de dengue anualmente. Apesar de aumento na proporção de crianças menores de 15 anos com dengue, os idosos ainda são a população de mais alto risco de óbito. Introduction: The first reported case of dengue in the state of Minas Gerais occurred in 1987. In May 1996 the first cases were confirmed in the metropolitan region of the state. The disease spread fast resulting in the first major epidemic in 1998, with 147,418 reported cases. The metropolitan region of Belo Horizonte accounted for 87% of the reported cases. In 1999, the cases reduced greatly, but in the following year there was an increase, resulting in a greater occurrence of cases in 2002. The state had two major epidemics; 2010 and 2013, with approximately 250,000 and 500,000 reported cases. Despite the significant number of cases in the state, little is known of the epidemiology and disease trends. The objective of this study was to describe and analyze epidemiological trends in the state of Minas Gerais with emphasis on 2001-2010 period and assess potential factors associated with death by dengue. Methods: (i) ecological study of spatial analysis, time series, and case-series study conducted from data collected from Minas Gerais surveillance system, from 2001 to 2010, (ii) case study and (iii) case series of patients admitted to intensive care units. Secondary data source from the Information System for Notifiable Diseases (SINAN), Hospital Information System (SIH), and data from medical records were used. Results: Dengue, which is relatively recent in Minas Gerais, has resulted in three major epidemics (1998, 2010, 2013). From 2001 to 2010, 683,190 dengue cases were registered with 237 deaths. Dengue cases occur throughout the year with a tendency to increase in the months of November and December, with more notified cases in the months of March and April. The state presented an estimate of 3.79 (95% CI: 2.97; 4.71) deaths per 10,000 dengue cases reported. An increasing incidence occurred in all age groups, however the rate was greater in children under 15 years of age. While serotypes 1 and 2 predominated until 2002, from 2003-2008 there was a predominance of serotype 3. Young adults showed the highest occurrence during this period, however, patients 65 years or older had a higher risk of death. In 2011, serotype 4 was introduced for the first time in the state resulting in an outbreak in 2013. The first death due to dengue serotype 4 occurred in December 2012. The child was 11 years old with a history of autoimmune purpura. In 2013, the state reported its greatest epidemic, with significant DENV-4 contribution. The profile of deaths shows a high frequency of comorbidities and a higher risk of death in elderly groups ( 65 years old). From 2008 to 2013, 370 suspected cases of dengue in adults were admitted to the intensive care units. Mortality was 19.6% among the 97 laboratory confirmed cases included in this study. In-hospital mortality was significantly associated with Acute Physiology and Chronic Health Evaluation II and the Sequential Organ Failure Assessment score. Conclusion: The state has had annual increases in incidences of dengue cases. Although there has been a rise in the proportion of children affected with dengue under 15, the elderly still pose the highest risk of death.

The adherence of Candida albicans is considered an important virulence factor since it determines the colonization of the yeast in various regions of the host, being the initial cause of the infection. In this work we studied the adherence of C. albicans (serotypes A and B) to HeLa and Vero cells after culture for 18 h and 30 h in chemically defined medium (YNB) plus carbohydrate sources such as glucose, sucrose, maltose, galactose and mannose (500 mM). Each assay was performed in triplicate. The best results were obtained with the medium containing glucose. The adherence was greatest in 18 h cultures at 37ºC and at 1 h contact time. The interaction of yeast cells with the host cells was studied by scanning microscopy.A aderência é considerada como um importante fator de virulência de Candida albicans por determinar a colonização dessas leveduras em diversas regiões do hospedeiro. É a causa inicial da infecção. Neste trabalho estudamos a aderência de C. albicans (sorotipos A e B) em culturas de células Hela e Vero, com leveduras cultivadas por 18 e 30 horas em meio YNB adicionado de fontes de carboidrato como glicose, sacarose, maltose, galactose e manose (500 mM). Cada ensaio foi realizado em triplicata. Os melhores resultados foram obtidos no meio adicionado de glicose. A aderência foi maior em culturas de 18 horas, incubadas a 37ºC no tempo de contato com as células de 1 hora. O estudo da interação entre as leveduras e a cultura de células foi realizado utilizando-se a microscopia eletrônica de varredura.

The adherence of Candida albicans is considered an important virulence factor since it determines the colonization of the yeast in various regions of the host, being the initial cause of the infection. In this work we studied the adherence of C. albicans (serotypes A and B) to HeLa and Vero cells after culture for 18 h and 30 h in chemically defined medium (YNB) plus carbohydrate sources such as glucose, sucrose, maltose, galactose and mannose (500 mM). Each assay was performed in triplicate. The best results were obtained with the medium containing glucose. The adherence was greatest in 18 h cultures at 37ºC and at 1 h contact time. The interaction of yeast cells with the host cells was studied by scanning microscopy. A aderência é considerada como um importante fator de virulência de Candida albicans por determinar a colonização dessas leveduras em diversas regiões do hospedeiro. É a causa inicial da infecção. Neste trabalho estudamos a aderência de C. albicans (sorotipos A e B) em culturas de células Hela e Vero, com leveduras cultivadas por 18 e 30 horas em meio YNB adicionado de fontes de carboidrato como glicose, sacarose, maltose, galactose e manose (500 mM). Cada ensaio foi realizado em triplicata. Os melhores resultados foram obtidos no meio adicionado de glicose. A aderência foi maior em culturas de 18 horas, incubadas a 37ºC no tempo de contato com as células de 1 hora. O estudo da interação entre as leveduras e a cultura de células foi realizado utilizando-se a microscopia eletrônica de varredura.

In this work, the prevalence of enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) in children in Londrina-PR, Brazil, was evaluated by means of digoxigenin-labelled DNA probes which identify the plasmid responsible for EPEC adherence factor (EAF), and virulence genes for EPEC as bundle-forming pilus (bfp) and E. coli attaching-effacing factor (eae). In addition, the isolated strains were serotyped and tested for adherence to HEp-2 cells. From 102 children with diarrhoea, 19 strains hybridized with at least one probe, and eleven of them were identified as typical EPEC because they hybridized with the three probes used, showed a localized adherence (LA) pattern, and presented no genes for enterotoxins (ST and LT) or invasion as detected by PCR. Six of the typical EPEC strains belonged to the classical serotype O119:H6 (43%); in four strains O antigens could not be determined using antisera against O1 to O173, they were all ONT:H7 (29%); one strain belonged to O111:H6. Three strains were classified as atypical EPEC: O26H-, O111:H9 and O119:HNT. Strains O26H- and O111:H9 hybridized with the eae probe only and showed localized adherence like (LAL) pattern; strain O119:HNT hybridized with the bfp and eae probes, and showed a localized adherence/diffuse adherence (LA/DA) pattern after 6 h. A DA pattern was observed in two strains isolated from children with diarrhoea (ONT:H11 and O142:H34), which hybridized with the eae probe. From 46 controls, five strains hybridized with one or two probes, but none hybridized with all probes or presented the LA pattern. Three strains with the DA pattern hybridized with the eae probe. No EPEC strain belonging to classical EPEC serotypes was isolated from faeces of control children.A prevalência de Escherichia coli enteropatogênica (EPEC) em crianças em Londrina-PR, Brazil, foi avaliada através de sondas de DNA marcadas com digoxigenina, as quais identificam o plasmidio EAF (EPEC adherence factor) e os genes de virulência para EPEC, bfp (bundle-forming pilus) e eae (E. coli attaching and effacing). As amostras de E. coli foram também sorotipadas e testadas para a aderência às células HEp-2. Das 102 crianças com diarréia, 19 colonias de E. coli hibridizaram com pelo menos uma sonda, e destas, 11 foram identificadas como EPEC típica pois hibridizaram com as 3 sondas testadas. Todas as EPEC típicas apresentaram o padrão de aderência localizada e não apresentaram os genes para enterotoxinas (ST e LT) e invasão por PCR. Seis EPEC típica (43%) pertenceram ao sorotipo clássico O119:H6, uma ao sorotipo O111:H6 e em quatro amostras (29%) o antígeno O não foi determinado com os soros contra O1-O173 (ONT:H7). Três amostras foram classificadas como EPEC atípicas: O26H-, O111:H9 e O119:HNT. E. coli O26H- e O111:H9 hibridizaram somente com eae e mostraram padrão de aderência localizada "like" (LAL); O119:HNT hibridizou com as sondas bfp e eae, e mostrou padrão de aderência localizada/difusa (LA/DA) após 6 h. O padrão DA foi observado em duas amostras (ONT:H11 e O142:H34) isoladas de crianças com diarréia, as quais hibridizaram com eae. Dos 46 controles, cinco colônias hibridizaram com pelo menos uma sonda, mas nenhuma hibridizou com as 3 sondas testadas ou apresentou LA. Três amostras com padrão DA hibridizaram com sonda eae. Nenhuma EPEC com sorotipo clássico foi encontrada nas fezes de crianças controle.

En Colombia no es obligatoria la notificación de L. monocytogenes en alimentos, pero se vigilan los alimentos de alto riesgo. Clínicamente se reportan como microorganismo Gram-positivo sólo cuando causan meningitis. L. monocytogenes es un patógeno intracelular, transmitido por alimentos, letal para humanos y animales, que causa Listeriosis; enfermedad que genera varios brotes en el mundo, con pérdidas humanas y económicas. Pocos trabajos en Colombia han logrado identificar y serotipificar molecularmente los aislamientos, lo que sólo permite distribuir teóricamente los serotipos en linajes. Esta revisión se limita a mostrar características del patógeno, su importancia en salud pública y en la industria de alimentos, generalidades de la PFGE-CHEF; identificando el protocolo estandarizado de trabajo y las enzimas de restricción adecuadas para cortar el ADN. Se encontró que la combinación de enzimas Xbal-AscI, seguida de ApaI es la que ofrece mejores resultados en la diferenciación de los aislamientos; agrupándolos por linajes; mostrando variaciones intra-serotipo y que en varios países latinoamericanos se analizan los resultados a través de PulseNet, lo que garantiza la comparación de los patrones de PFGE en igualdad de condiciones. The reporting of L monocytogenes in food in Colombia is not a mandatory; however, foods considered high-risk are monitored, and the organism is only reported clinically as Gram-positive when it causes meningitis. L. monocytogenes is a foodborne, intracellular, pathogen which causes listeriosis, a disease lethal to humans and animals. Outbreaks of this disease worldwide can bring about human and economic losses. Only a few studies in Colombia have been able to identify and molecularly serotype isolates allowing only the theoretical distribution of serotypes by lineage. This review explains the characteristics of the pathogen, its importance in public health and in the food industry, and provides an overview of PFGE-CHEF; identifying the standard work protocol and the appropriate restriction enzymes to cut DNA. We found that the enzyme combination, Xbal-AscI, followed by ApaI offers the best results to differentiate isolates, by grouping them by lineages, and displaying intra-serotype variations. Additionally, we found that in several Latin American countries the results are analyzed using PulseNet; this ensures the comparison of PFGE patterns in equivalent conditions. Na Colômbia não há uma notificação compulsória de L. monocytogenes em alimentos, mas alimentos de alto risco são monitorados. Clinicamente, são relatados como organismos Gram-positivos apenas quando eles causam meningite. L. monocytogenes é um patógeno intracelular de origem alimentar, letal para seres humanos e animais, que causa a listeriose, que gera surtos em todo o mundo, com perdas humanas e económicas. Poucos trabalhos na Colômbia identificaram e sorotipificaram molecularmente os isolados, que só permite a distribuição de sorotipos teoricamente em linhagens. Esta avaliação é limitada a mostrar características do patógeno, sua importância na saúde pública e na indústria de alimentos, e uma visão geral do PFGE-CHEF; identificar o protocolo-padrão de trabalho e enzimas de restrição apropriadas para cortar o ADN. Verificou-se que a combinação de enzimas Xbal-AscI, seguido por ApaI representa a combinação de enzimas que ofereceu melhores resultados na diferenciação dos isolados, agrupando-a por linhagens, mostrando a variação intra-serotipo e que, em muitos países da América Latina, os resultados são analisados através PulseNet, que assegura a comparação de padrões de PFGE em igualdade de condições.

Submitted by Hiolanda Rêgo (hiolandarego@gmail.com) on 2014-10-21T17:15:11Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Talita de Jesus Caldas Nunes.pdf: 1705477 bytes, checksum: db29ce9e44a8eae162753f3c1c22e8d9 (MD5) Made available in DSpace on 2014-10-21T17:15:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Talita de Jesus Caldas Nunes.pdf: 1705477 bytes, checksum: db29ce9e44a8eae162753f3c1c22e8d9 (MD5) A criptococose é uma micose sistêmica causada por leveduras pertencentes ao gênero Cryptococcus, cujas principais espécies de importância clínica são C. neoformans e C. gattii. Essas duas espécies são divididas em cinco sorotipos (A, B, C, D e AD) e mais raramente têm sido relatados os sorotipos BD e AB. O gênero possui dois mating types (α e a) determinados em um único locus MAT, com dois alelos. Diferenças genéticas têm sido detectadas através de métodos moleculares e tem sido essenciais para se entender a biologia do fungo. Nesse sentido, o objetivo dessa dissertação foi avaliar a variabilidade genética, através de extração de DNA por fervura, de amostras de Cryptococcus isolados de casos de meningite, diagnosticados no Hospital Especializado Couto Maia, Salvador-BA, no período de 2006 a 2011. A extração de DNA foi realizada através da fervura de suspensão fúngica e a determinação do mating type, das variedades e do sorotipo através da técnica da Reação em Cadeia da Polimerase associada ao Polimorfismo do Tamanho do Fragmento de Restrição (PCR-RFLP). A técnica de extração do DNA genômico por fervura foi bem reproduzida e, após ter sido empregada diretamente na reação da PCR, foi possível observar que nenhuma diferença houve com relação aos produtos da PCR com DNA extraído pela técnica tradicional. Dos 94 isolados analisados, a determinação de mating types e da ploidia mostrou que todos apresentaram padrão compatível com mating type α, assim como haploidia. A técnica molecular de sorotipagem permitiu observar que 88% dos isolados eram da variedade grubii (sorotipo A) e 12% da variedade gattii (sorotipo B). Nossos resultados mostram como se pode facilitar a PCR de leveduras com uma técnica que envolve um menor tempo de execução e menor custo, além de contribuir para a epidemiologia da criptococose, no que se refere à importância de se ter um diagnóstico diferencial entre as variedades envolvidas no processo infeccioso.

Submitted by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2015-08-26T20:29:07Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Avaliação da relação da densidade de vetores e da presença de A.aegypti infectados com a ocorrência de dengue na cidade de Vitória.pdf: 1488499 bytes, checksum: 862637f184216da84704652db2813d9f (MD5) Approved for entry into archive by Morgana Andrade (morgana.andrade@ufes.br) on 2015-11-17T17:28:48Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Avaliação da relação da densidade de vetores e da presença de A.aegypti infectados com a ocorrência de dengue na cidade de Vitória.pdf: 1488499 bytes, checksum: 862637f184216da84704652db2813d9f (MD5) Made available in DSpace on 2015-11-17T17:37:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Avaliação da relação da densidade de vetores e da presença de A.aegypti infectados com a ocorrência de dengue na cidade de Vitória.pdf: 1488499 bytes, checksum: 862637f184216da84704652db2813d9f (MD5) Previous issue date: 2013 A dengue é uma doença febril aguda causada pelo DENV, o qual agrupa quatro sorotipos distintos. Sua transmissão se dá pela picada de fêmeas de mosquitos do gênero Aedes, sendo o Aedes aegypti o principal vetor de importância epidemiológica. O controle do vetor e a vigilância epidemiológica são as principais ferramentas para a contenção de novas epidemias. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar a correlação entre densidade de vetores e presença de A. aegypti infectados com a ocorrência de dengue em Vitória, durante a epidemia de 2011. Para isso, foram analisados casos confirmados laboratorialmente e notificados no SINAN, bem como os dados fornecidos pelo programa MI – DENGUE. Para a identificação dos sorotipos circulantes, foram realizados ensaios de RT – PCR. Foi também realizado o geoprocessamento, por bairro, dos casos humanos, da densidade de vetores e das armadilhas contendo A. aegypti infectados. Os resultados mostraram uma ligeira predominância do sexo feminino na amostra analisada e que 64,18% dos casos ocorreram em pessoas acima de 18 anos. A maioria dos casos de dengue observados foi classificada como dengue clássica, enquanto cerca 10% foram classificados como as formas mais graves de dengue, como “dengue com complicações” ou “febre hemorrágica da dengue”. Em 8,23% dos casos houve a ocorrência de internação e dois óbitos foram contabilizados durante o período. Por meio da análise temporal, foi visto que o aumento da densidade de vetores ocorreu nas épocas mais quentes e chuvosas, e precedia o aumento do número de casos humanos. Não foi encontrada correlação entre a densidade de vetores e a incidência de dengue nos bairros (p=0.848) porém foi visto que os bairros onde foram encontrados mosquitos infectados possuíam maior incidência de dengue que os bairros sem mosquitos infectados (p=0.009). O principal sorotipo circulante em Vitória, em 2011, foi o DENV-1 seguido pelo o DENV-2. Portanto, este estudo demonstra que, tão importante quanto monitorar a densidade de vetores, é investigar a presença de vetores infectados nas cidades com o objetivo de predizer possíveis epidemias de dengue. Dengue is an acute febrile disease caused by dengue virus (DENV), which groups four serotypes. It is transmitted by the bite of female mosquitoes of the gender Aedes, being the Aedes aegypti the principal vector with epidemiologic importance. Vector control and epimiological surveillance are the principal tools for epidemic’s contention. So, the objective of this study was to observe the relationship between vector density or infection of the vectors by DENV with the cases of dengue in Vitória. Confirmed and notified cases on SINAN and data from the programme MI –Dengue were analised. For the identification of virus serotypes, it was made RT-PCR. Also, it was described the spatial distribution of human cases of dengue, as well the spatial distribution of vector’s density and the traps where infected mosquitoes were found. As a result, it was found a small predominance of women in the sample analised (54,27%) and 64,18% of the cases occurred in people with more than 18 years old. 90,74% were classified as dengue fever, while 6,60% were classified as “dengue with complications” and 2,66% as “dengue haemorrhagic fever”. In 8,23% of the cases, there was the necessity of hospitalization and 2 deaths were contabilized during the period. Trough the temporal analysis, it was observed that the increase in vector’s density occurred in the warm and rainy times, and it preceeded the increase in human cases. During all the year of 2011, A. aegypti’s density in the city was considered as “moderate” or “critical”. It was not observed a correlation between vector’s density and incidence of dengue in the neighborhoods (p = 0.848), but the neighborhoods where it was found infected mosquitoes had greater incidence of dengue than the neighborhoods without infected vectors (0.009). By the RT-PCR assay, it was observed that the major serotype found in human samples and in vector samples was DENV-1 (96,56% e 82,35%, respectively). DENV-2 was also found in circulation, but in smaller rates.

Submitted by Pós graduação Farmácia (ppgfar@ufba.br) on 2017-05-25T21:38:30Z No. of bitstreams: 1 RIOS RSR-UFBA.pdf: 2890961 bytes, checksum: fae1486048636d899ff4db4f5903144f (MD5) Approved for entry into archive by Patricia Barroso (pbarroso@ufba.br) on 2017-05-29T17:23:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RIOS RSR-UFBA.pdf: 2890961 bytes, checksum: fae1486048636d899ff4db4f5903144f (MD5) Made available in DSpace on 2017-05-29T17:23:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RIOS RSR-UFBA.pdf: 2890961 bytes, checksum: fae1486048636d899ff4db4f5903144f (MD5) CAPES Streptococcus pneumoniae é um dos principais agentes causadores de doenças invasivas graves como: pneumonia, meningite e septicemia. Estima-se o óbito em cerca de 2,0 milhões de crianças em países em desenvolvimento. O padrão ouro para diagnóstico é a cultura, mas a sua sensibilidade é baixa e por isso o aprimoramento no diagnóstico dos casos continua um desafio. O objetivo do presente estudo foi avaliar o uso de técnicas moleculares diretamente em líquor visando detectar e caracterizar genotipicamente Streptococcus pneumoniae em casos de meningite. Um estudo prospectivo de corte transversal foi realizado no Hospital Couto Maia, no período entre abril de 2006 a dezembro de 2010. As amostras de líquor foram selecionadas de acordo com critérios de inclusão como celularidade superior a 100 células/mm3 e/ou Glicorraquia inferior a 40 mg/dl e/ou Proteinorraquia superior a 65 mg/dl, e foram submetidas a análises de rotina do hospital, e posteriormente testadas por técnica de PCR em tempo real para detecção de S. pneumoniae, usando como alvo o gene lytA e a reação de PCR-Multiplex para a dedução do sorotipo capsular. A caracterização genotípica foi realizada através da técnica de Multilocus Sequence Typing (MLST). Foram analisadas 1141 amostras de líquor provenientes de pacientes com suspeita clínica de meningite bacteriana. Destas, 92 amostras foram positivas para S. pneumoniae por PCR em tempo real. Das quais, 68 amostras (73,9%) foram cultura positiva e 24 (26,1%) cultura negativa. Os sorotipos de 21 dos 24 casos cultura negativa foram deduzidos. Cerca de 46% dos sorotipos encontrados nos casos cultura negativa, foram não vacinais. Dentre os sorotipos vacinais mais frequentes estavam o 6A/B/C com 6 casos (25%), 14 com 3 casos (12,5%), 23F com 2 (8,3%), 18A/B/C com 1 caso (4,2%) e 4 com 1 caso (4,2%). Do total de 24 casos cultura negativa, três casos (12,5%) não apresentaram positividade para qualquer dos 40 sorotipos testados, embora tenham apresentado positividade para o gene cpsA, permanecendo então como não determinados. Seis amostras (25%) tiveram genótipo caracterizado por MLST, sendo definidos os STs 750, 6403 e 2814. Este estudo conclui que as técnicas moleculares de PCR em tempo real e Multiplex PCR podem ser bastante úteis quando aplicadas diretamente em espécimes clínicos, possibilitando uma melhor detecção e diagnóstico dos casos, mesmo quando todas as outras técnicas diagnósticas convencionais não são capazes de fazê-lo, além de proporcionar um ganho de informações epidemiológicas que não seriam possíveis de serem obtidos por métodos convencionais, devido à ausência de positividade das culturas bacteriológicas. Streptococcus pneumoniae is a major cause of severe invasive diseases such as pneumonia, meningitis and bacteremia. It is estimated death in about 2.0 million children in developing countries. The gold standard for diagnosis of this agent is the culture, but its sensitivity is low and therefore the accurate diagnosis of cases of pneumococcal meningitis remains a challenge. The aim of this study was to evaluate the use of molecular techniques to detect directly in CSF samples, and genotype Streptococcus pneumoniae in meningitis cases. A prospective cross-sectional study was conducted at Hospital Couto Maia, in the period from April 2006 to December 2010. The CSF samples were selected according to inclusion criteria as cellularity above 100 cells/mm3 and / or CSF glucose less than 40 mg/dl and / or protein levels over than 65 mg / dl, and were submitted to routine hospital and subsequently tested by PCR in real time for the detection of S. pneumoniae, using targeting the lytA gene and PCR-Multiplex for the deduction of capsular serotype. The genotypic characterization was performed by Multilocus Sequence Typing technique (MLST). One amount of 1141 CSF samples were collected from patients with suspected bacterial meningitis and submitted for analysis. Of these, 92 samples were positive for S. pneumoniae by real-time PCR. Of which, 68 samples (73.9%) were culture positive and 24 (26.1%) culture negative. The serotypes of 21 of the 24 culture-negative cases were found. About 46% of the serotypes found in culture-negative cases were non vaccine types. Among the most common vaccine serotypes were the 6A/B/C with 6 cases (25%), 14 with 3 cases (12.5%), 23F with 2 (8.3%), 18A/B/C with one case (4.2%) and 4 with 1 case (4.2%). Of the total of 24 culture-negative cases, three cases (12.5%) showed positivity for any of the 40 serotypes tested, although they presented positive result for the gene CPSA amplification and remain as not determined. Six samples (25%) had the genotype characterized by MLST, the STs being set 750, 6403 and 2814. This study concludes that the molecular techniques of real-time PCR and multiplex PCR can be useful when applied directly on clinical specimens, enabling better detection and diagnosis of cases, even when all other conventional diagnostic techniques are not able to do it, and provide a gain of epidemiological information that would not be possible to obtain by conventional methods, due to the absence of positive bacterial cultures.

Submitted by Pós graduação Farmácia (ppgfar@ufba.br) on 2017-05-25T21:38:30Z No. of bitstreams: 1 RIOS RSR-UFBA.pdf: 2890961 bytes, checksum: fae1486048636d899ff4db4f5903144f (MD5) Approved for entry into archive by Patricia Barroso (pbarroso@ufba.br) on 2017-05-29T17:23:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RIOS RSR-UFBA.pdf: 2890961 bytes, checksum: fae1486048636d899ff4db4f5903144f (MD5) Made available in DSpace on 2017-05-29T17:23:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RIOS RSR-UFBA.pdf: 2890961 bytes, checksum: fae1486048636d899ff4db4f5903144f (MD5) CAPES Streptococcus pneumoniae é um dos principais agentes causadores de doenças invasivas graves como: pneumonia, meningite e septicemia. Estima-se o óbito em cerca de 2,0 milhões de crianças em países em desenvolvimento. O padrão ouro para diagnóstico é a cultura, mas a sua sensibilidade é baixa e por isso o aprimoramento no diagnóstico dos casos continua um desafio. O objetivo do presente estudo foi avaliar o uso de técnicas moleculares diretamente em líquor visando detectar e caracterizar genotipicamente Streptococcus pneumoniae em casos de meningite. Um estudo prospectivo de corte transversal foi realizado no Hospital Couto Maia, no período entre abril de 2006 a dezembro de 2010. As amostras de líquor foram selecionadas de acordo com critérios de inclusão como celularidade superior a 100 células/mm3 e/ou Glicorraquia inferior a 40 mg/dl e/ou Proteinorraquia superior a 65 mg/dl, e foram submetidas a análises de rotina do hospital, e posteriormente testadas por técnica de PCR em tempo real para detecção de S. pneumoniae, usando como alvo o gene lytA e a reação de PCR-Multiplex para a dedução do sorotipo capsular. A caracterização genotípica foi realizada através da técnica de Multilocus Sequence Typing (MLST). Foram analisadas 1141 amostras de líquor provenientes de pacientes com suspeita clínica de meningite bacteriana. Destas, 92 amostras foram positivas para S. pneumoniae por PCR em tempo real. Das quais, 68 amostras (73,9%) foram cultura positiva e 24 (26,1%) cultura negativa. Os sorotipos de 21 dos 24 casos cultura negativa foram deduzidos. Cerca de 46% dos sorotipos encontrados nos casos cultura negativa, foram não vacinais. Dentre os sorotipos vacinais mais frequentes estavam o 6A/B/C com 6 casos (25%), 14 com 3 casos (12,5%), 23F com 2 (8,3%), 18A/B/C com 1 caso (4,2%) e 4 com 1 caso (4,2%). Do total de 24 casos cultura negativa, três casos (12,5%) não apresentaram positividade para qualquer dos 40 sorotipos testados, embora tenham apresentado positividade para o gene cpsA, permanecendo então como não determinados. Seis amostras (25%) tiveram genótipo caracterizado por MLST, sendo definidos os STs 750, 6403 e 2814. Este estudo conclui que as técnicas moleculares de PCR em tempo real e Multiplex PCR podem ser bastante úteis quando aplicadas diretamente em espécimes clínicos, possibilitando uma melhor detecção e diagnóstico dos casos, mesmo quando todas as outras técnicas diagnósticas convencionais não são capazes de fazê-lo, além de proporcionar um ganho de informações epidemiológicas que não seriam possíveis de serem obtidos por métodos convencionais, devido à ausência de positividade das culturas bacteriológicas. Streptococcus pneumoniae is a major cause of severe invasive diseases such as pneumonia, meningitis and bacteremia. It is estimated death in about 2.0 million children in developing countries. The gold standard for diagnosis of this agent is the culture, but its sensitivity is low and therefore the accurate diagnosis of cases of pneumococcal meningitis remains a challenge. The aim of this study was to evaluate the use of molecular techniques to detect directly in CSF samples, and genotype Streptococcus pneumoniae in meningitis cases. A prospective cross-sectional study was conducted at Hospital Couto Maia, in the period from April 2006 to December 2010. The CSF samples were selected according to inclusion criteria as cellularity above 100 cells/mm3 and / or CSF glucose less than 40 mg/dl and / or protein levels over than 65 mg / dl, and were submitted to routine hospital and subsequently tested by PCR in real time for the detection of S. pneumoniae, using targeting the lytA gene and PCR-Multiplex for the deduction of capsular serotype. The genotypic characterization was performed by Multilocus Sequence Typing technique (MLST). One amount of 1141 CSF samples were collected from patients with suspected bacterial meningitis and submitted for analysis. Of these, 92 samples were positive for S. pneumoniae by real-time PCR. Of which, 68 samples (73.9%) were culture positive and 24 (26.1%) culture negative. The serotypes of 21 of the 24 culture-negative cases were found. About 46% of the serotypes found in culture-negative cases were non vaccine types. Among the most common vaccine serotypes were the 6A/B/C with 6 cases (25%), 14 with 3 cases (12.5%), 23F with 2 (8.3%), 18A/B/C with one case (4.2%) and 4 with 1 case (4.2%). Of the total of 24 culture-negative cases, three cases (12.5%) showed positivity for any of the 40 serotypes tested, although they presented positive result for the gene CPSA amplification and remain as not determined. Six samples (25%) had the genotype characterized by MLST, the STs being set 750, 6403 and 2814. This study concludes that the molecular techniques of real-time PCR and multiplex PCR can be useful when applied directly on clinical specimens, enabling better detection and diagnosis of cases, even when all other conventional diagnostic techniques are not able to do it, and provide a gain of epidemiological information that would not be possible to obtain by conventional methods, due to the absence of positive bacterial cultures.

INTRODUCTION: To detect dengue virus, eggs of Aedes sp were collected in the city of Belo Horizonte, Brazil, in 2007. METHODS: Egg samples were subsequently hatched and the larvae were tested for the presence of dengue virus RNA by RT-PCR. RESULTS: Among the Aedes aegypti larvae samples, 163 (37.4%) out of 435 were positive, including 32 (10.9%) of 293 individual larvae samples concomitantly positive for two serotypes. CONCLUSIONS: Virological surveillance detecting coinfected vectors in the field could represent an important strategy for understanding the numerous factors involved in the transmission and clinical presentation of dengue. INTRODUÇÃO: Para a detecção do vírus da dengue, ovos de Aedes sp foram coletados em Belo Horizonte, Brasil, em 2007. MÉTODOS: Amostras de ovos eclodiram e suas larvas foram testadas para a presença de RNA do vírus dengue por RT-PCR. RESULTADOS: Das amostras de larvas de Aedes aegypti, 163 (37,4%) de 435 foram positivas, incluindo 32 (10,9%) das 293 amostras individuais que foram concomitantemente positivas para dois sorotipos. CONCLUSÕES: A vigilância virológica de vetores no campo poderia representar uma estratégia importante para a compreensão dos diversos fatores envolvidos na transmissão e apresentação clínica da dengue.

Objetivos: (i) Apresentar uma revisão focando as vacinas pneumocócicas e o portador de S. pneumoniae na nasofaringe; (ii) realizar a tipagem capsular de pneumococos colonizadores de nasofaringe de crianças de creches pela técnica de multiplex PCR; (iii) identificar o perfil MLST dos pneumococos isolados na nasofaringe; (iv) identificar os tipos capsulares de múltiplas colônias de S. pneumoniae isolados de uma única amostra de secreção da nasofaringe de crianças que frequentam creches do município de Goiânia pela técnica de multiplex PCR. Material e Métodos: Um estudo de prevalência de portador de pneumococo foi conduzido de agosto a dezembro de 2005, em crianças de dois a 59 meses de idade, atendidas em 62 creches em Goiânia. Os procedimentos laboratoriais para isolamento e identificação dos pneumococos foram realizados de acordo com as técnicas recomendadas pela Organização Mundial de Saúde. Foram selecionados 217 isolados (resistentes e sensíveis à penicilina) para a tipagem capsular pela técnica de multiplex PCR. O perfil MLST foi realizado para 55 isolados, representando os sorotipos detectados e os diferentes perfis de suscetibilidade à penicilina. A reação de Quellung foi usada para tipar os sorotipos 6A, 6B e 18C e os isolados não tipados pelo multiplex PCR. Para a análise de múltiplas colônias de S. pneumoniae, utilizou-se 28 amostras positivas para pneumococo, das quais se recuperou 3 colônias de cada placa de ágar sangue, totalizando 84 colônias, que foram submetidas aos testes de tipagem fenotípica e caracterização capsular pela técnica de multiplex PCR. Resultados: Cento e setenta e sete sorotipos em duzentos e dezessete (177/217), totalizando 81,6% dos pneumococos foram tipados. Os sorotipos mais freqüentes foram 14, 6, 23F, 19F e 18. Foram identificadas múltiplas colônias em 13 amostras de nasofaringe. Foram observados 19 tipos MLST e dois novos tipos de seqüência (ST). Quarenta (18,4%) dos isolados não foram tipados pelo multiplex PCR e todos não tipados pela reação de Quellung. A análise de múltiplas colônias de S. pneumoniae pela técnica de multiplex PCR permitiu a detecção de mais de um tipo em 25% (7/28) das amostras. Conclusões: (i) O método de multiplex PCR mostrou-se seguro e simples na detecção de diferentes tipos capsulares incluídos na reação, além de mais barato; (ii) representou uma valiosa ferramenta em investigações de vigilância de pneumococos; (iii) Aplicação da técnica multiplex PCR permitiu o conhecimento da diversidade genética de pneumococos colonizadores da nasofaringe, detectando a dinâmica da colonização desta bactéria na população, incluindo a colonização por múltiplos sorotipos; a substituição ou mudança de sorotipo como resultado da vacinação; como também vigilância das doenças pneumocócicas invasivas. Objectives (i) Present review article focusing on pneumococcal vaccines and carriage; (ii) to validate sequential multiplex PCR for identifying pneumococcal capsular serotypes from children attending day-care centers; (iii) determine the multilocus sequence typing; (iv) to identify the capsular types of multiple colonies of S. pneumoniae isolates from a single sample of nasopharyngeal secretions of children attending day-care centers in Goiânia. Materials and Methods S. pneumoniae was obtained from health children less than 5 years old attending 62 day care centers of Goiânia. The laboratory procedures were performed according to WHO recommendations. Were selected 217 isolates (penicillin resistant and sensitive) for capsular typing by multiplex PCR technique. MLST was performed for 55 isolates representing the serotypes detected and the different susceptibility patterns for penicillin. Quellung reaction was used for typing isolates serotypes 6A, 6B, 18C and the isolates not typed by multiplex PCR. For 28 presumptive pneumococcal positive NP swabs, 3 colonies were picked to acess possible serotype diversity. Eighty four pneumococci were identified by conventionally procedure and multiplex PCR was performed. Results Serotypes were deduced for 177/217 (81.6%) of the pneumococcal. The most frequent serogroups/serotypes were 14, 6, 23F, 19F and 18. Multiple serotypes were detected in 13 specimens. Were found 19 MLST types and two new ST. Forty (18.4%) were not serotyped by the multiplex PCR and quellung reaction. The analysis of three colonies from the same NP permitted the detection of differente serotypes in 7/28 (25%) NP samples. Conclusion (i) The multiplex PCR is simple and cost-effective method for detecting multiple serotypes in nasopharyngeal isolates; (ii) and thus might be useful for the monitoring of pneumococcal colonization over time; (iii) the use of multiplex PCR can further broaden our understanding of the dynamics of pneumococcal carriage, including multiple serotypes, the effect of vaccination on carriage, and transmission, as well as surveillance of IPD and co-colonization.

Submitted by Guilherme Lemeszenski (guilherme@nead.unesp.br) on 2013-08-22T18:50:53Z No. of bitstreams: 1 S0100-736X2010000200010.pdf: 91339 bytes, checksum: 156e2744591442d8c036ae8f05e682d0 (MD5) Made available in DSpace on 2013-08-22T18:50:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 S0100-736X2010000200010.pdf: 91339 bytes, checksum: 156e2744591442d8c036ae8f05e682d0 (MD5) Previous issue date: 2010-02-01 Made available in DSpace on 2013-09-30T18:24:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0100-736X2010000200010.pdf: 91339 bytes, checksum: 156e2744591442d8c036ae8f05e682d0 (MD5) S0100-736X2010000200010.pdf.txt: 29231 bytes, checksum: 2a7a3f29d73850f93be2a994302831a7 (MD5) Previous issue date: 2010-02-01 Submitted by Vitor Silverio Rodrigues (vitorsrodrigues@reitoria.unesp.br) on 2014-05-20T13:33:10Z No. of bitstreams: 2 S0100-736X2010000200010.pdf: 91339 bytes, checksum: 156e2744591442d8c036ae8f05e682d0 (MD5) S0100-736X2010000200010.pdf.txt: 29231 bytes, checksum: 2a7a3f29d73850f93be2a994302831a7 (MD5) Made available in DSpace on 2014-05-20T13:33:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0100-736X2010000200010.pdf: 91339 bytes, checksum: 156e2744591442d8c036ae8f05e682d0 (MD5) S0100-736X2010000200010.pdf.txt: 29231 bytes, checksum: 2a7a3f29d73850f93be2a994302831a7 (MD5) Previous issue date: 2010-02-01 Foram caracterizados os sorotipos, o perfil de sensibilidade microbiana e os achados clínico-epidemiológicos em 53 linhagens do gênero Salmonella isoladas de 41 cães, nove equinos e três bovinos, acometidos por diferentes manifestações clínicas entre 1997 e 2007. Salmonella Typhimurium (45,3%), Salmonella enterica (22,6%), Salmonella Enteritidis (7,5%), Salmonella enterica subsp enterica 4,5,12i (5,7%), Salmonella Newport (5,7%), Salmonella Dublin (3,8%), Salmonella Agona (3,8%), Salmonella Glostrup (3,8%), Salmonella Saintpaul (1,8%) foram os sorotipos encontrados. Ciprofloxacina (100,0%), norfloxacina (100,0%) e gentamicina (100,0%) foram os antimicrobianos mais efetivos, enquanto a maior resistência das linhagens foi observada para ceftiofur (28,5%) e florfenicol (7,0%). As linhagens foram isoladas de animais com enterite, infecção do trato urinário, septicemia, piometra, pneumonia e conjuntivite. Ressalta-se para o predomínio do sorovar Typhimurium nas diferentes manifestações da salmonelose nos animais. Destaca-se, também, a identificação de sorotipos nos animais que também são observados em casos de salmonelose em humanos The serotype characterization, antimicrobial susceptibility profile, and clinical-epidemiological findings were evaluated in 53 Salmonella spp. strains isolated from 41 dogs, nine horses and three cattle presenting different clinical manifestations between 1997 at 2007. Salmonella Typhimurium (45.3%), Salmonella enterica (22.6%), Salmonella Enteritidis (7.5%), Salmonella enterica subsp. enterica 4,5,12i (5.7%), Salmonella Newport (5.7%), Salmonella Dublin (3.8%), Salmonella Agona (3.8%), Salmonella Glostrup (3.8%), Salmonella Saintpaul (1.8%) were the more common serotypes. Ciprofloxacin (100.0%), norfloxacin (100.0%) and gentamicin (100.0%) were more effective drugs while resistance of isolates was observed to ceftiofur (28.5%) and florfenicol (7.0%). The strains were isolated from animals with enteritis, urinary tract infections, septicaemia, pyometra, pneumonia and conjuntivits. The results showed the high frequency of Salmonella Typhimurium serotype in different animals studied. The study highlighted also the presence of serotypes in our animals that also have been identified in humans with salmonellosis. Universidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Higiene Veterinária e Saúde Pública Unesp Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Clínica Veterinária Universidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Higiene Veterinária e Saúde Pública Unesp Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Clínica Veterinária

INTRODUÇÃO: O fator reumatoide (FR), apesar de suas limitações, ainda é o marcador sorológico mais utilizado para diagnóstico da artrite reumatoide (AR) inicial. Há controvérsias sobre sensibilidade, especificidade, correlação com prognóstico radiológico e variação ao longo do tempo dos títulos dos sorotipos IgG, IgM e IgA. OBJETIVO: Avaliar o comportamento dos diferentes sorotipos de FR (IgG, IgM e IgA), em avaliações seriadas, e sua correlação com a ocorrência de erosões radiográficas. PACIENTES E MÉTODOS: Foram avaliados 40 pacientes com o diagnóstico de AR inicial (menos de 12 meses de sintomas) durante três anos de acompanhamento. A titulação dos sorotipos de FR foi feita por ELISA, na avaliação inicial, e seriadamente ao longo de 36 meses. Aplicou-se um modelo de regressão de efeitos mistos, considerando-se como desfecho a ocorrência de erosões radiográficas (radiografia de mãos e punhos, pés e tornozelos anuais). RESULTADOS: Na avaliação inicial, 30%, 42,5% e 50% dos pacientes foram positivos para FR IgG, IgA e IgM, respectivamente. Os títulos de FR IgA e FR IgM foram maiores nos pacientes que apresentaram erosões radiográficas durante o acompanhamento (10-220 UI/dL contra 0 a 10 UI/dL nos pacientes sem erosões, P < 0,05). Os títulos de FR IgM e IgG não variaram ao longo dos três anos de acompanhamento. Por outro lado, em relação aos títulos de FR IgA houve uma tendência linear positiva ascendente significativa (P = 0,0013) apenas no grupo que apresentou erosões radiográficas. CONCLUSÃO: 1) Pesquisa dos sorotipos FR IgA e FR IgG não aumenta a frequência de positividade do FR e, portanto, não contribui para o diagnóstico de AR; 2) a estabilidade observada do FR IgM ao longo do tempo não justifica solicitações repetidas do FR durante a evolução da AR; 3) títulos mais altos de FR IgA e FR IgM são observados nos pacientes mais graves, com erosões radiográficas; 4) FR IgA apresenta um comportamento claramente distinto nos pacientes que apresentam ou não erosões radiográficas, o que pode ter implicações na fisiopatogenia e na avaliação prognóstica da doença. INTRODUCTION: Rheumatoid factor (RF), despite its limitations, is still the most applied serological marker for diagnosis of early rheumatoid arthritis (RA). Sensitivity, specificity, correlation with prognosis and radiological progression, as well as variation over time of serotypes titers IgG, IgM and IgA, are yet controversial. OBJECTIVE: To evaluate the pattern of the different RF serotypes (IgG, IgM, and IgA) in serial evaluations during the first 36 months after RA diagnosis and their correlation with occurrence of radiographic erosions. PATIENTS AND METHODS: Forty patients with diagnosis of RA (less than 12 months of symptoms) were evaluated during 3 years of follow-up. Titers of RF serotypes were analyzed by ELISA at the initial evaluation and after 12, 24 and 36 months of follow-up. A mixed-effect regression model was applied, considering the presence of radiographic erosions as outcome (annual radiography of hands and wrists, feet and ankles). RESULTS: At the initial evaluation, 30%, 42.5% and 50% of the patients were positive for IgG, IgA and IgM RF, respectively. The titers of IgA and IgM RF were higher for patients who had radiographic erosions during the follow-up period (10-220 IU/dL versus 0 to 10 IU/dL in patients without erosions, P < 0,05). The titers of IgM and IgG RF remained unchanged over the three years of follow-up. On the other hand, there was a positive linear increasing trend for titers of IgA RF (P = 0.0013) only in the group with radiographic erosions. CONCLUSION: 1) Search of RF serotypes IgA and IgG does not increase the frequency of RF positivity and therefore it does not contribute to the RA diagnosis; 2) IgM RF stability observed over time does not justify repeated requests of RF during RA follow-up; 3) higher titers of IgA and IgM RF are observed in more severe patients, with radiographic erosions; 4) IgA RF presents a clearly distinct behavior in patients with or without radiographic erosions, which may have implications for pathophysiology and prognostic evaluation of the disease.

The epidemic aspects of swine infections caused by Streptococcus suis were studied, focusing mainly on the occurrence of several serotypes. A total of 323 samples of S. suis were isolated from clinically ill animals, serotyped according to the co-agglutination procedure, and analyzed. The serotyping revealed that S. suis was present in several Brazilian states. The largest number was isolated from the states of Minas Gerais (62.5%), São Paulo (10.8%), and Paraná (9.3%). Serotype 2 was the most frequent (61.0%), followed by the serotypes 1, 3, 4, 7, and 8. The largest number of isolations was obtained from the brain (60.1%), followed by the lungs (10.4%). About 9.4% of the cases were due to septicemia. Estudaram-se os aspectos epidêmicos das infecções de suínos causadas por Streptococcus suis, enfocando, principalmente, a ocorrência de diferentes sorotipos. Foram analisadas 323 amostras isoladas de animais clinicamente doentes, as quais foram sorotipadas de acordo com o procedimento de co-aglutinação. Foi verificado que S. suis está presente em vários estados brasileiros e o maior número de isolados originou-se dos estados de Minas Gerais (62,5%), São Paulo (10,8%) e Paraná (9,3%). O sorotipo 2 foi o mais freqüente (61.0%), seguido pelos sorotipos 1, 3, 4, 7 e 8. Os isolamentos foram obtidos principalmente de cérebro (60,1%) e pulmões (10,4%). Os casos de septicemia representaram 9,4%.

Background: Adenoviruses (AdVs) are important cause of acute respiratory disease (ARD), gastroenteritis, conjunctivitis and urinary infections in humans. Objectives: Detection of AdVs by immunofluorescence assay (IFA) and by polymerase chain reaction (PCR) in nasopharyngeal aspirates of children less than 5 years old presenting ARD in Uberlândia, MG, as well as, comparison of two PCR assays and identification of serotypes that circulated in this region. Study Design: A total of 468 clinical specimens was collected from November 2000 to April 2007 and tested by IFA for adenovirus detection and other viruses. After that, the DNA of the 126 in natura negative/inconclusive samples by IFA which were also negative for rhinovirus by RT-PCR, were extracted by Trizol® and tested by PCRAraújo (Araújo et al, 2001) for adenovirus detection. The positive specimens for adenovirus were inoculated into HEp-2 and A-549 continuous cell lineages. In addition, the DNA of either, in natura samples and cell culture-scrapped samples, were extracted by using the QIAmp DNA Mini Kit (QIAGENTM Valencia, CA) and tested again by PCRAraujo and by PCRAllard (Allard et al., 2001) in order to compare the sensitivity/specificity of both tests. In addition, the serotypes were identified from the nucleotide sequencing of PCR products positive for adenovirus. Results: From the 468 samples, 33 (7.1%) were positive for AdVs, 14 by IFA and 19 by PCRAraujo. From the 32 specimens inoculated in cell culture, it was possible to isolate AdVs in 16. The comparison of the results obtained from the DNA of the 33 in natura samples extracted by the QIAmp DNA Mini Kit (QIAGENTM Valencia, CA) showed that the sensibility of PCRAraujo was a little higher than PCRAllard (92.9% and 90.0%, respectively). However, the first PCR presented a lower specificity than the second one (57.9% and 91.3%, respectively). The serotype AdV2 was detected in almost 60.0% (7/12) of those identified. Conclusions: AdVs were detected in 7.1% of the clinical samples in children with ARD throught the combination of two methods, IFA and PCR. The analysis of the sensibility and specificity of the two PCR assays, showed that PCRAllard presented a little lower sensibility than PCRAraujo and higher specificity. The serotype AdV2 was identified in 7 of the 12 AdVs sequenced samples. Introdução: Adenovírus (AdVs) constituem importante causa de doença respiratória aguda (DRA), gastroenterites, conjuntivites e infecções urinárias em humanos. Objetivos: Detecção de AdVs por imunofluorescência indireta (IFI) e por reação em cadeia pela polimerase (PCR) em aspirados de nasofaringe de crianças menores de 5 anos de idade, com DRA, atendidas em Uberlândia, MG, assim como, comparação de dois testes de PCR e identificação de sorotipos de AdVs circulantes na região. Material e Métodos: Um total de 468 espécimes clínicos obtidos de novembro de 2000 a abril de 2007 foi testado pela IFI para detecção de AdVs e outros vírus respiratórios. Em seguida, o DNA das 126 amostras in natura que obtiveram resultado negativo /inconclusivo pela IFI e que também foram negativas para rinovírus pela RT-PCR, foi extraído por Trizol® e testado pela PCRAraújo (Araújo et al., 2001) para os AdVs. Os espécimes positivos para AdVs foram inoculados em células HEp-2 e A549. Além disso, o DNA das amostras positivas, tanto in natura quanto do raspado de cultura de células, foi extraído utilizando-se o kit QIAmp DNA Mini Kit (QIAGENTM Valencia, CA) e testado novamente pela PCRAraujo e pela PCRAllard (Allard et al., 2001), afim de comparar a sensibilidade/especificidade dos dois testes. Além disso, os sorotipos foram identificados a partir do seqüenciamento dos nucleotídeos de produtos de PCR positivos para AdVs. Resultados: Das 468 amostras, 33 (7,1%) foram positivas para AdVs, sendo 14 pela IFI e 19 pela PCRAraujo. De 32 espécimes inoculados em cultura de células, foi possível isolar os AdVs de 16. A comparação dos resultados obtidos a partir do DNA das 33 amostras in natura, extraídas por coluna, mostrou que a sensibilidade da PCRAraujo foi ligeiramente superior à da PCRAllard (92,9% and 90,0%, respectivamente). Entretanto, a primeira PCR apresentou uma especificidade consideravelmente menor que a segunda PCR (57,9% and 91,3% respectivamente). O sorotipo AdV2 foi detectado em quase 60,0% (7/12) dos identificados. Conclusões: Os AdVs foram detectados em 7,1% das amostras clínicas de crianças com DRA mediante a combinação de dois métodos, IFI e PCR. A análise da sensibilidade e da especificidade dos dois métodos de PCR empregados, mostrou que a PCRAllard, apresentou sensibilidade ligeiramente inferior à PCRAraujo e especificidade consideravelmente superior. O sorotipo AdV2 foi identificado em 7 das 12 amostras de AdVs seqüenciadas. Palavras-chave: adenovírus, sorotipos, doença respiratória aguda, crianças. Mestre em Genética e Bioquímica

Since 1977, the Instituto Adolfo Lutz (IAL) is having interest in the scrotyping of S. pneumoniae or pneumococcus from infections caused by this bacteria. The isolated strains have been sent to the WHO Pneumococcal Reference Center, Pennsylvania, U.S.A.. From 1977 to 1988, 1.000 pneumococcus strains isolated from cerebrospinal fluid were typed, according to Danish nomenclature, and 60 serotypes were identified. The most frequent serotypes were 1, 6B, 18C, 14, 5, 3, 6A, 23F, 19F, and 38. Among different age groups, they showed a variable incidence, with serotype 6B in the ages of zero to almost 2 years old, serotype 1 in the age group of 2 to 50 years old, and serotype 3 in the ages over 50. During the 12 years study, 25 serotypes showed some uniformity in the frequency, the same as with the seasonal fluctuations. Concerning the severity of the pneumococcal infections, chiefly meningitis, and the few information related to pneumococcus serotypes which occur in the area, it was considered of high relevance to have the information of serotypes, once polyssacharide vaccines have been employed with success to prevent these infections. Desde 1977, o Instituto Adolfo Lutz (IAL) vem promovendo a sorotipagem do S. pneumoniae ou pneumococo de infecções causadas por esta bacteria. As cepas isoladas têm sido encaminhadas ao WHO Pneumococcal Reference Center, Pensilvania, E.U.A.. De 1977 a 1988, 1.000 cepas de pneumococo isoladas de LCR foram sorotipadas, de acordo com a nomenclatura dinamarquesa, e 60 sorotipos foram identificados. A maior freqüência foi do sorotipo 1, secundado por 6B, 18C, 14, 5, 3, 6A, 23F, 19F e 38. Estes sorotipos distribuídos segundo faixas etárias demonstraram incidência variável, notando-se uma certa peculiaridade, ou seja, a predominância do sorotipo 6B na faixa de zero a menos de dois anos; do sorotipo 1 na faixa de 2 até 50 anos e do sorotipo 3 no grupo acima de 50 anos. Nos 12 anos considerados, 25 sorotipos apresentaram uma certa uniformidade na freqüência e o mesmo foi observado com relação às estações climáticas, apenas com um número maior de infecções meníngeas nos meses mais frios. Considerando a gravidade das infecções pneumocócicas notadamente as meningites, e a pouca informação relativa aos sorotipos pneumocócicos que ocorrem na região, julgamos importante essa informação relativa aos sorotipos, uma vez que tem sido usadas, com sucesso, vacinas polissacarídicas na prevenção dessas infecções.

This study aims to assess the prevalence of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) in ground beef collected in two cities located in the State of São Paulo, Brazil. A total of 250 samples of raw ground beef were collected in local grocery stores during the period of March to December 2002 in the cities of Ribeirão Preto (114 samples) and Campinas (136 samples), São Paulo State, Brazil. The samples were processed according to standard methods. The resulting 591 E.coli colonies were screened for STEC by hybridization assays using the specific DNA probes, stx1,stx2 and eae. Further characterization of STEC isolates included the search for the ehxA sequence, detection of enterohemolysin and expression of Shiga toxin using the Vero cell assay. STEC isolates belonging to serotypes O93:H19, ONT:HNT, ONT:H7, and O174:HNT we recovered from four samples (3.5%) collected in Ribeirão Preto. All samples from Campinas were negative for STEC. Three of the strains carried stx2 and ehxA sequences while one harbored stx1,stx2 and ehxA sequences. Considering that among foods of animal origin, ground beef is an important vehicle for STEC transmission, these data emphasize the need of a closer surveillance of these microorganisms. They can survive in unfavorable conditions specially when the products are refrigerated or frozen for long periods of time and can be the cause of outbreaks affecting a great number of consumers. O objetivo deste estudo foi verificar a ocorrência de Escherichia coli produtora de toxina Shiga (STEC) em amostras de carne moída crua comercializadas em duas cidades do Estado de São Paulo, Brasil. Um total de 250 amostras de carne moída crua foi coletado de açougues locais durante o período de Março a Dezembro de 2002, nas cidades de Ribeirão Preto (114 amostras) e de Campinas (136 amostras), Estado de São Paulo, Brasil. As amostras foram processadas de acordo com os métodos de referência. Um total de 591 colônias de E.coli foi submetido à técnica de hibridização de colônias usando sondas específicas de DNA para a detecção das seqüências stx1,stx2 e eae. Caracterizações adicionais das cepas STEC incluíram a pesquisa da seqüência ehxA, a detecção da enterohemolisina e a pesquisa da expressão de toxina Shiga utilizando testes com células Vero. Em quatro amostras (3,5%) coletadas em Ribeirão Preto, foram encontradas cepas STEC, mas todas aquelas da região de Campinas foram negativas. As cepas de STEC pertenciam aos sorotipos O93:H19, ONT:HNT, ONT:H7, e O174:HNT. Três cepas tinham o perfil stx2 ehxA e uma era portadora das seqüências stx1,stx2 e ehxA. Considerando que entre os alimentos de origem animal, a carne moída ainda representa um importante veículo de transmissão de STEC, estes dados alertam para a necessidade de uma vigilância da presença destes microrganismos capazes de sobreviver em condições desfavoráveis, especialmente quando os produtos são refrigerados ou congelados por longos períodos, podendo ser causas de importantes surtos afetando grande número de consumidores.

From a total of 187 fecal samples from children with ages between 0 and 5 years, collected in the Hospital Universitário -USP, Brazil, from 1994 to 1996, 54 (28.9%) were positive for rotavirus. Positive samples were characterized by electropherotyping, subgrouping, G serotype and genotype and P genotype. Rotavirus electropherotypes were characterized in four different long genome patterns (38.9%), one short genome pattern (34.0%) and 18.0% were characterized as an unusual pattern. Subgroup I was found in 38.9% strains, subgroup II in 50.0% and 7.7% was subgroup nonI-nonII. For G serotypes, G2 was found in 59.3%, G1 was identified in 33.3% of strains, two samples showed mixtures of G1+G2 and one sample was G1+G3. Ten samples characterized as serotype G2 showed a long eletropherotype. Genotype G2 was the most frequently and was found in 37 (44.0%) samples (23 samples as a single genotype and 14 as mixtures of genotypes). G1 was found in 15 samples. G3 and G4 was detected mainly in mixtures of genotypes and G5, G6 and G9 were identified only in mixtures. A total of 20 (38.5%) samples were characterized as G genotype mixtures and P mixtures were found in 16 (29.6%) samples. P[4] was found in 55.6% of samples, P[8] in 51.9% and P[6-M37 like] in 22.3% of cases. P[6-Gottfried like] and P[11] were detected only in mixtures. One sample with G6 specificity, mixed with a G2 rotavirus and a P[11] strain, mixed with P[4] and P[8]strain was described for the first time in Latin America. De um total de 187 amostras fecais de crianças com idades entre 0 e 5 anos, coletadas no Hospital Universitário -USP, Brasil, de 1994 a 1996, 54 (28.9%) foram positivas para rotavírus. As amostras positivas foram caracterizadas quanto ao eletroferótipo, subgrupo, sorotipo G e genotipo G e P. Foram identificados quatro diferentes eletroferótipo longos em 38.9% das amostras, um eletroferótipo curto (34,0%) e 18,0% foram caracterizadas como um eletroferótipo não usual. O subgrupo I foi encontrado em 38,9% amostras, o subgrupo II em 50,0% e nãoI-nãoII em 7,7%. O sorotipo G2 foi encontrado em 59,3% e G1 em 33,3%. Duas amostras apresentaram misturas de G1+G2 e outra amostra G1+G3. Dez amostras caracterizadas como sorotipo G2 mostraram perfil eletroferótico longo. O genotipo G2 foi o mais freqüente, encontrado em 37 amostras (23 como único genotipo e 14 associados a outro genotipo). G1 foi encontrado em 15 amostras; G3 e G4 foram detectados principalmente em misturas e G5, G6 e G9, identificados somente em misturas. Um total de 20 (38,5%) amostras foram identificadas como misturas de genotipo G e foram encontradas 16 (29,6%) amostras com misturas de genotipo P. P[4] foi encontrado em 55,6% das amostras, P[8] em 51,9% e P[6-M37 like], em 5,5% das amostras. P[6-Gottfried like] e P[11] foram detectados somente em misturas. Uma amostra com especificidade G6, associada ao genotipo G2 e outra P[11] misturada com P[4] e de P[8] foram identificadas pela primeira vez na América Latina.

Avaliaram-se 40 amostras de ostras (Crassostrea rhizophorae) servidas in natura em 15 restaurantes da Cidade do Rio de Janeiro, a fim de investigar a presença de Vibrio spp. As amostras de ostras foram analisadas e submetidas a enriquecimento em água peptonada alcalina adicionada de 1 e 3% de NaCl, incubadas a 37°C por 24 horas. Em seguida, os cultivos foram semeados em agar tiossulfato citrato bile sacarose e as colônias suspeitas foram submetidas à caracterização bioquímica. Vibrio parahaemolyticus, Vibrio carchariae, Vibrio alginolyticus e Vibrio vulnificus representaram as principais espécies (> 60%) isoladas a partir das ostras in natura. Forty oyster samples (Crassostrea rhizophorae) served raw in 15 restaurants in the city of Rio de Janeiro were evaluated in order to investigate the presence of Vibrio spp. The oyster samples were analyzed and subjected to enrichment in alkaline peptone water with the addition of 1 and 3% NaCl and incubated at 37°C for 24 hours. Following this, the cultures were seeded onto thiosulfate citrate bile sucrose agar (TCBS) and the suspected colonies were subjected to biochemical characterization. Vibrio parahaemolyticus, Vibrio carchariae, Vibrio alginolyticus and Vibrio vulnificus were the main species (> 60%) isolated from raw oysters.