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Objective: Multilevel heterogeneity is known to be characteristic for glioblastoma. With epigenetic tumor features are getting into focus as prognostic markers, it is likely that such heterogeneity is also to be found correspondingly. Whether intra-tumoral heterogeneity in these epigenetic characteristics [for full text, please go to the a.m. URL]

Additional file 6: Fig. S3. Kaplan���Meier survival plots including p values obtained from Cox regression model analysis and confidence intervals (blue/red); (A) average DNA methylation of CpG -48, CpG -61 and CpG -64, (B) TCGA 450K array-based DNA methylation of CpG -48 (cg01341123), (C) DNA methylation of CpG +18 in the presented cohort, (D) TCGA 450K array-based DNA methylation of CpG +18 (cg12981137).

Additional file 4: Fig. S2. (A) DNA methylation heatmap of all CpGs in the MGMTup amplicon in malignant astrocytoma samples; CpGs are numbered relative to the TSS; grey lines represent missing data for the respective sample; CpGs present on the 450K/850K(EPIC) BeadChip arrays are indicated on top. CpGs grouped into five methylation domains (D1-D5) are highlighted in different colors with D1 and D2 represented by single CpGs (CpG -68 and CpG -67). Samples were ordered according to the sample clustering in MGMTe1 for clarity reasons. (B) Scatter plot with trend lines and confidence intervals based on local regression analysis; each dot represents the averaged DNA methylation of a sample per sequenced amplicon. Dots are colored based on the average methylation state in the exon 1 region: red=highly methylated (>30%), purple=intermediately methylated (between 9% and 30%), blue= lowly methylated (

Additional file 3: Fig. S1. MSP on human PBL and EpiTect Control methylated bisulfite-treated DNA with proposed primer pairs designed based on methylation domain modelling; electrophoretic separation of MSP reactions on a LONZA FlashGel system using 2.2% gels (Flash GelTM DNA cassettes, #57032, Biozym Scientific GmbH, Germany); Marker = Flash GelTM DNA marker (50bp���1.5kb #57033), PBL = peripheral blood leukocytes, bisulfite-converted DNA, EpiTect = EpiTect Control DNA (human), methylated and bisulfite-converted (Qiagen #59655); NTC = no template control.

Automatisiertes Fahren wird die zukünftige Mobilität grundlegend verändern. Die fortschreitende Digitalisierung bildet die Grundlage für technische Innovationen und Automatisierung der Fahraufgabe. Zahlreiche medienwirksame Auftritte verschiedener Firmen und Forschungsgruppen zeigen die technische Machbarkeit automatisierter Fahrfunktionen. Vor allem die steigende Komplexität zukünftiger Fahrfunktionen beinhaltet große Herausforderungen für die Entwicklung, Test und Freigabe. Derartige Systeme sollen die Fahraufgabe in definierten Verkehrsdomänen komplett übernehmen. Die Fahrfunktion muss alle auftretenden Situationen sicher beherrschen. Die Identifikation aller dafür relevanten Verkehrssituationen kann mit bekannten Methoden der Situationsanalyse nicht bewerkstelligt werden. Etwaige Methoden fokussieren nicht auf typische, normale und unkritische Verkehrssituationen, wenngleich diese für die Anforderungsanalyse und Spezifikation automatisierter Fahrfunktionen notwendig sind. Um die steigende Komplexität zu bewältigen, werden von der Forschung und Fachliteratur szenarienbasierte Methoden für die Entwicklung automatisierter Fahrfunktionen vorgeschlagen. Die vorliegende Arbeit präsentiert eine Methode zur Identifikation typischer Verkehrssituationen. Die Methodik basiert auf einem menschlichen Entscheidungsfindungsmodell und beinhaltet ein systematisches Vorgehen. Sie berücksichtigt Expertenwissen, sowie funktions- und entwicklungsspezifisch relevante Situationsmerkmale. Das systematische Vorgehen nutzt Simulationsmethoden zur Datenerhebung sowie Constraint-Programmierung. Somit wird das Constraint-Erfüllungs-Problem zur Suche nach relevanten Situationen in einer deklarativen Weise beschrieben. Die Validierung zeigt, dass relevante und typische Situationen identifiziert werden können, an die in einem unstrukturierten Vorgehen während der Anforderungsanalyse und Spezifikation des Zielsystems unter Umständen nicht gedacht wird. Zusammen mit dem durchgängigen szenarienbasierten Entwicklungsansatz SBSE zeigt die Situationsidentifikation großes Potential für die Entwicklung automatisierter Fahrfunktionen. Zudem bildet der vorgestellte Ansatz die Grundlage für weitere Forschung im Bereich der szenarienbasierten Entwicklung. Automated driving will fundamentally change future mobility. The progressive digitalisation forms the basis for technological innovation and automation of the driving task. Numerous media-effective presentations of various companies and research groups prove the technical feasibility of automated driving functions. Especially the growing complexity of future driving functions holds enormous challenges for development, test and release procedure. The aim of such systems is to completely assume the driving task in a defined environment. The driving function must control all upcoming traffic situations in a reliable way. The identification of all relevant traffic situations cannot be achieved with known methods for situation analysis. Those methods do not focus on typical, normal and non-critical traffic situations, although they are relevant for requirement analysis and specification of the target system. To overcome the complexity of developing automated driving functions, research and literature propose scenario-based methods. This contribution presents a method for identifying typical traffic situations. On the basis of a model for human decision making, the method implies a systematic approach for situation identification. Expert knowledge, as well as function- and development-specific relevant situational attributes are taken into account. The systematic approach utilises simulation methods for data collection as well as the usage of constraint programming. Thus, the constraint-satisfaction-problem for searching relevant situations is described in a declarative manner. The validation of the proposed method shows, that relevant situations can be identified, which may not be found in an unstructured procedure for requirement analysis and specification of the target system. Together with the scenario-based development approach SBSE, the method for situation identification shows great potential for developing automated driving functions. Moreover, the presented method constitutes the basis for further research in scenario-based development.

Objective: Glioblastoma is the most common malignant brain tumor in adults and has a very poor prognosis. The microRNAs (miRNA) -26a, -24, and -21 have been reported as regulators of the p15/p16/RB1/E2F pathway which play a major role in glioblastoma progression. The present study aimed[for full text, please go to the a.m. URL], 70. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Neurochirurgie (DGNC), Joint Meeting mit der Skandinavischen Gesellschaft für Neurochirurgie

Objective: Pilocytic astrocytomas are WHO grade I gliomas occurring mainly during childhood and adolescence. Promoter hypermethylation of tumor suppressor genes is a very common mechanism in CNS neoplasms which is generally associated with their transcriptional silencing. Method: Using MS-PCR, we[for full text, please go to the a.m. URL], 67. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Neurochirurgie (DGNC), 1. Joint Meeting mit der Koreanischen Gesellschaft für Neurochirurgie (KNS)