8 results on '"Serter Koçoğlu, Sema"'
Search Results
2. Long-term cognitive effects of uridine treatment in a neonatal rat model of hypoxic-ischemic encephalopathy
- Author
-
Goren, Bulent, Cakir, Aysen, Ocalan, Busra, Serter Kocoglu, Sema, Alkan, Tulin, Cansev, Mehmet, and Kahveci, Nevzat
- Published
- 2017
- Full Text
- View/download PDF
3. Erianin as a Promising Novel Agent in the Treatment of Neuroblastoma: The Anticancer Effects and Underlying Molecular Mechanisms
- Author
-
Serter Koçoğlu, Sema, primary, Seçme, Mücahit, additional, and Sunay, Fatma Bahar, additional
- Published
- 2023
- Full Text
- View/download PDF
4. Effects of Monensin on Caspase-10 Mediated Apoptosis in Glioblastoma Multiforme
- Author
-
SERTER KOÇOĞLU, Sema and SEÇME, Mücahit
- Subjects
monensin,U373,apoptosis ,monensin,U373,apoptozis ,Biochemistry and Molecular Biology ,Biyokimya ve Moleküler Biyoloji - Abstract
Glioblastoma multiforme (GBM), en kötü huylu primer merkezi sinir sistemi tümörüdür. Şu anda, GBM için iyileştirici tedavi seçenekleri yoktur ve 5 yıllık hayatta kalma oranı %5’den daha azdır. Monensin, ‘’Streptomyces cinnamonensis’’ den elde edilen antibakteriyal ve antiparazitik etkileri bilinen iyonofor bir antibiyotiktir. Literatürde monensinin GBM hücrelerinin apoptoz mekanizması üzerine etki gösterdiği bir çalışmaya rastlanmadığından yapılan bu çalışmanın amacı monensinin U373 GBM hücrelerinde apoptoz aracılı hücre proliferasyonu üzerine etkilerini araştırmaktır. Monensinin U373 hücre canlılığı üzerine etkileri XTT ile apoptoz üzerine etkileri ise RT-PCR ve Annexin V ile araştırılmıştır. Monensinin U373 GBM hücrelerinde IC50 değeri 48’inci saatte 4 μM olarak bulunmuştur. Monensin U373 GBM hücrelerinde apoptoz oranında 6 katlık bir artışa neden olmuştur. Bununla birlikte monensin kaspaz-10 gen ekspresyonunu arttırarak apoptozu anlamlı olarak aktive etmiştir. Sunulan çalışma monensinin GBM hücrelerinin kaspaz-10 aracılı apoptoz mekanizması üzerine etkilerini gösteren ilk çalışmadır. Bizim sonuçlarımız monensinin GBM kanserinde güçlü apoptotik etkileri olan terapötik bir antikanser ilaç bileşiği olabileceğini önermektedir., Glioblastoma multiforme (GBM) is the most malignant primary central nervous system tumor. Currently, there are no curative treatment options for GBM and the 5-year survival rate is less than 5%. Therefore, further studies are needed to identify effective markers and therapeutic targets for GBM treatment. Monensin is an ionophore antibiotic obtained from Streptomyces cinnamonensis with known antibacterial and antiparasitic effects. In the literature, no study has been found that shows an effect of monensin on the apoptosis mechanism of GBM cells. The aim of the present study was to investigate the effects of monensin on apoptosis-mediated cell proliferation in U373 GBM cells. The effects of monensin on U373 cell viability were investigated by XTT and its effects on apoptosis were investigated by RT-PCR and Annexin V. The IC50 value of monensin in U373 GBM cells was 4 μM at 48 hours. Monensin caused a 6-fold increase in the rate of apoptosis in U373 GBM cells. Monensin also significantly triggered apoptosis by increasing caspase-10 gene expression. The present study is the first to demonstrate the effects of monensin on the caspase-10-mediated apoptosis mechanism of GBM cells. Our results suggest that monensin may be a therapeutic anticancer drug compound with potent apoptotic effects in GBM cancer.
- Published
- 2021
5. Monensinin Glioblastoma Multiformede Kaspaz-10 Aracılı Apoptoz Üzerine Etkileri
- Author
-
SERTER KOÇOĞLU, Sema, primary and SEÇME, Mücahit, additional
- Published
- 2021
- Full Text
- View/download PDF
6. Erianinin HT29 kolorektal kanser hücrelerinin proliferasyonu ve koloni oluşumu üzerine etkilerinin araştırılması
- Author
-
SERTER KOÇOĞLU, Sema, primary, ELMAS, Levent, additional, and SEÇME, Mücahit, additional
- Published
- 2021
- Full Text
- View/download PDF
7. Testisin stereolojik metodlar ile incelenmesinde farklı fiksatiflerin etkilerinin karşılaştırılması
- Author
-
Turhan, Gülden, Sunay, Fatma Bahar, Serter Koçoğlu, Sema, and Histoloji ve Embriyoloji Anabilim Dalı
- Subjects
Volume ,Histology and Embryology ,Stereology ,Testis ,Testicular diseases ,Histochemistry ,Histoloji ve Embriyoloji ,Fixation - Abstract
Testis dokusunun, histolojik açıdan değerlendirilip stereolojik metodlar ile ölçülmesi ve doku morfolojisini en iyi koruyan fiksatifi belirleyerek PAS (Periyodik Asit Shchiff), MTC (Masson Trichrom) ve TUNEL (TdT mediated dUTP Nick end Labeling) boyaları ile dokunun histolojik özelliklerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Çalışmamız da Sprague Dawley cinsi 20 adet sıçanın testis dokuları dört farklı fiksatif [%10 NTF (Nötral Tamponlu Formaldehit), BF (Bouin Fiksatifi), mDF (Modifield Davidson Fiksatifi) ve Stieve's Fiksatifi] ile fikse edildi. Fiksasyonun ardından testis dokuları, rutin doku takip işlemine alınıp, parafin bloklara gömüldü. Parafin bloklardan elde edilen 5 mikron kalınlığındaki seri kesitler HE (Hematoksilen-Eozin) boyandı. Her testis bloğundan birkaç lam PAS, MTC ve TUNEL boyaları ile boyanarak mikroskobik incelemeleri yapıldı. Seri kesitlerden elde edilen lamlar Cavalier Yöntemi ile testis dokularının hacim hesaplaması yapıldı.Çalışma sonucunda, mDF ve Stieve's Fiksatifleri ile çok az miktarda germ hücreleri arasında ve seminifer tübüllerde çok küçük bir büzülme artefaktı görülmüştür. Bouin Fiksatifi ile testisin merkezi alanlarında büzülme artefaktları görülmüştür. %10 NTF Fiksatifinin seminifer tübül yapılarında belirgin doku büzülme artefaktları görüldü. BF, mDF ve Stieve's Fiksatifleri tespit edilen testis dokularının nükleer detayları %10 NTF ile karşılaştırıldığında daha iyi sonuç alınmıştır. Testis dokusunun PAS, MTC ve TUNEL boyaları ile boyanması sonucu en iyi mDF ve Stieve's Fiksatifleri sağlamıştır alternatif olarak BF'yi tercih edilebilir. Testis dokusunun morfolojik korunumu ve boyanma özellikleri açısından mDF ve Stieve's Fiksatifleri ile daha iyi korunmanın sağlandığı gözlenmiştir. BF ile doku büzülme artefaktı daha belirgin gözlenmiş olsada sonuçların güvenilirliği açısından sorun belirtmediği için alternatif olarak tercih edilebilir. Testis dokusu %10 NTF fiksatifi hücresel korumasının kalitesi daha düşük olduğunu görülmüştür. Anahtar Kelimeler: Fiksatif, Hacim, Histokimyasal Boyama, Stereoloji, Testis. The aim of this study was to determine the histological properties of testis tissue by histological evaluation and stereological methods and to determine the fixative that best preserves tissue morphology and to determine the histological properties of tissue with PAS (Periodic Acid Shchiff), MTC (Masson Trichrom) and TUNEL (TdT mediated dUTP Nick end Labeling) dyes.In our study, testicular tissues of 20 Sprague Dawley rats were fixed with four different fixatives [10% NTF (Neutral Buffer Formaldehyde), BF (Bouin Fixative), mDF (Modifield Davidson Fixative) and Stieve's Fixative] and saline. Following fixation, the testes were embedded in paraffin. Routine tissue was taken to follow-up. Serial sections of 5 micron thickness obtained from paraffin blocks were stained with HE (Hematoxylin-Eosin). Microscopic examination of each testis block was performed by staining with several PAS, MTC and TUNEL stains. The volume of the testicular tissues was calculated with the slides obtained from serial sections and Cavalier Method which is the Stereological Method.As a result of the study showed a very small shrinkage artifact between mDF and Stieve's Fixatives and a small amount of germ cells and seminiferous tubules. Shrinkage artifacts were observed in the central areas of the testis with Bouin Fixative. Significant tissue shrinkage artifacts were observed in seminiferous tubule structures of 10% NTF Fixative. BF, mDF and Stieve's Fixatives showed better nuclear results compared to 10% NTF. PAS, MTC and TUNEL staining of the testis resulted in the best mDF and Stieve's Fixatives. Alternatively, BF could be preferred.It was shown that mDF and Stieveındans fixatives are more protected in terms of morphological preservation and staining properties of testis tissue. Although tissue shrinkage artifact was more prominent with BF, we supported it with stereological measurement, which is not a problem in terms of the reliability of the results and could be preferred as an alternative. The quality of testicular tissue 10% NTF fixative cellular protection was lower.Key Words: Fixative, Volume, Histochemical Staining, Stereology, Testis. 108
- Published
- 2019
8. Sperm hareketliliğinin belirlenmesinde makler sayım kamarası ve ıslak preparat ile elde edilen sonuçların tutarlılık düzeyleri
- Author
-
Durmuş, Elif, Sunay, Fatma Bahar, Serter Koçoğlu, Sema, Histoloji ve Embriyoloji Anabilim Dalı, and Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Subjects
Embryology ,Histology ,Makler Counting Chamber ,Wet Preparate ,Histology and Embryology ,Sperm mobility ,Bland-Altman ,Spermatozoa ,Semen Analysis ,Makler Sayım Kamarası ,Semen Analizi ,Islak Preparat ,Semen ,Sperm Motility ,Camera ,Histoloji ve Embriyoloji ,Sperm Hareketliliği - Abstract
Balıkesir Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı, İnfertilite vakalarının yaklaşık yarısından erkeğe bağlı nedenler sorumludur. Erkek üreme işlevinin değerlendirilmesinde en sık kullanılan yöntem spermiyogramdır. Semen analizi sonuçlarının hem rutin klinik uygulamada hem de bilimsel araştırmalarda fayda sağlayabilmesinin ilk şartı testin tüm laboratuvarlarca aynı şartlarda ve biçimde gerçekleştiriliyor olmasıdır. Bu çalışmanın amacı; semen analizi sırasında sperm hareketliliğini belirlemek amacıyla kullanılan iki farklı yöntem olan Makler Sayım Kamarası ve Islak Preparat yöntemlerinden elde edilen sonuçları karşılaştırmaktır. Makler Sayım Kamarası rutinde laboratuvarlarca çok sık tercih edilen yöntemdir, Islak Preparat ise Dünya Sağlık Örgütü (WHO)‟nün yayınladığı Laboratuvar El Kitabı‟nda önerdiği hareket belirleme yöntemidir. Çalışmaya, Balıkesir Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Hastanesi Androloji Laboratuvarı‟na semen analizi için başvuran 100 gönüllü dahil edildi. Hareketli sperm oranı Makler Sayım Kamarası sonuçlarına göre % 50.68 (±19.13), Islak Preparat yöntemine göre % 57.83 (±15.6) olarak bulundu. iki farklı yöntemden elde edilen veriler karşılaştırıldığında aralarında pozitif korelasyon olduğu (r=0.86) görüldü. Ancak, sonuçlar arasındaki tutarlılık Bland-Altman yöntemi ile analiz edildiğinde, Makler Sayım Kamarasının Islak Preparata oranla, sperm hareketliliğini yaklaşık %7.15 daha düşük bulduğu belirlendi. Sonuç olarak, sperm hareketliliği Makler Sayım Kamarası ile belirlendiğinde, Islak Preparata oranla, daha düşük değerler elde edildiği bu nedenle WHO tarafından önerilen yöntem olan Islak Preparatın kullanılmasının tercih edilmesi gerektiği sonucuna varıldı. Güvenilir sonuçlar elde etmenin önemi açısından tekrarlanabilir yöntemin seçilmesi ve örnek sayısının arttırılması elde edilen verilerin karşılaştırılması için yararlı olacaktır., Males are responsible from almost half of the infertility problems. Semen analysis is the most common method used to evaluate male reproductivity function. One of the first requirements for semen analysis to provide reliable results for both clinic and scientific use is to realize the testing under the same conditions in the same way. The objective of this study is to compare the results obtained from two different methods used to specify sperm motility which are Makler Counting Chamber and Wet Preperate. Makler Counting Chamber is a common method preferred by most of the laboratories and the Wet Preparate is advised by World Health Organization in the their publication Laboratory Handbook. The study includes 100 volunteers who applied to Balıkesir University Hospital for semen analysis. Sperm motility rate was found as 50.68 % (±19.13) by applying Makler Counting Chamber method and 57.83 % (±15.6) by applying Wet Preparate method. A positive correlation was found between the methods after comparing the results obtained from the them. However, it was spotted that the sperm motility result obtained by Makler Counting Chamber was found 7.15 % less than Wet Preparate in comparison when analyzed by Bland-Altman method for verification. In conclusion, lower sperm motility rates were found when Makler Counting Chamber method applied in comparison to the Wet Preparate method, so Wet Preparate method that was advised by WHO should be preferred as a method. In terms of obtaining reliable results, preference of iterative methods and increasing number of samples will be beneficial to compare the outputs obtained.
- Published
- 2019
Catalog
Discovery Service for Jio Institute Digital Library
For full access to our library's resources, please sign in.