Search

Objective: The plants, which grow wild in the Eastern Anatolia Region and are known as kari (Arum elongatum;Ae) and mende (Chaerophyllum macrospermum;Cm), are used for treatment purposes such as pain reliever and wound healing properties. It is aimed to determine some biological properties of these plants, which are also used medicinally. Material-Method: Firstly, hexane(H), ethanol(E) and acetone(A) extracts of dried plants were prepared and antimicrobial activities of extracts against 13 indicator microorganisms were determined by agar well diffusion method. Antioxidant activities were determined by DPPH and ABTS analyses and the total phenolic component contents were determined by the Folin-Ciocalteu method. Results: The maximum extract yield was obtained in the ethanol extracts of the plants (AeE;10.4011% CmE;2.4898%), the minimum extract yield was obtained in the acetone extracts (AeA;0.8422% CmA;0.3510%). The hexane extract of A. elongatum has no inhibition activity against E. faecalis and L. monocytogenes, but it has inhibition activity against other indicator microorganisms. The other extracts of A. elongatum and all extracts of C. macrospermum were found to have inhibitory activity against all indicator microorganisms. Furthermore, the highest phenolic content was calculated as 54.60±0.486 µg mL-1 (AeE) and the lowest content as 3.47±0.001 µg mL-1 (CmA). As a result of the DPPH method the highest IC50 was calculated as 32.4140 µg mL-1 (CmH) and the lowest IC50 as 12.7876 µg mL-1 (AeA) and ABTS method the highest IC50 was calculated as 10.3203 µg mL-1 (CmE), and the lowest IC50 as 0.2744 µg mL-1 (CmA). Conclusion: These results show that the plant extracts have strong antimicrobial activity and antioxidant activity.

Bu çalışmada, katılımcı öğrencilerin, mikroorganizmalar konusunda farkındalık kazanması amaçlanmıştır. Bu amaç doğrultusunda, mikroorganizmaların tanımı, mikroorganizmaların fayda ve zararları, zararları durumunda alınması gereken tedbirler ve faydaları durumunda mikrobiyal biyoteknolojik üretim teknikleri konularında teorik ve uygulamalı etkinlik temelli bir öğreti modeli tasarlanmıştır. Çalışma süresince uygulanan bu etkinliklerin, katılımcıların bilimsel düşünme becerilerinin gelişmesine olan etkisi araştırılmıştır. Çalışmada katılımcı olarak hem kentsel hem de kırsal kesimden ilköğretim dönemi dördüncü sınıf gönüllü öğrenciler yer almıştır. Çalışma, iki hafta süresince, 13 erkek 17 kız olmak üzere toplam 30 katılımcı ile yürütülmüştür. Katılımcılara etkinliklerin öncesinde ve sonrasında mikroorganizmalarla ilgili mevcut bilgilerini ölçmeye yönelik 38 sorudan oluşan çoktan seçmeli başarı testi uygulanmıştır. Yapılan ölçme ve değerlendirme analiz sonuçlarına göre katılımcıların mikroorganizmalar hakkındaki bilgilerinin istatiksel olarak anlamlı bir şekilde farklılaştığı görülmüştür. Bu çalışma kapsamında öğrencilerin mikroorganizmalar ile ilgili hazır bulunuşluk düzeyi farklılıklarının, katılımcı okulların yerleşim yerlerinin farklı olmasından kaynaklı olduğu görülmüştür. Yaşanan COVID-19 Pandemi süreci, toplumun mikroorganizmalar konusunda bilinç sahibi olmadığını ve mikroorganizmaların hayatımızda ne denli ciddi sonuçlar doğurabileceğini ortaya çıkarmıştır. Bu bağlamda, pandemi sürecinde yürütülen bu çalışma, toplumdaki bireylerin mikroorganizmalar hakkında doğru bilgiler edinmesine öncülük etmekte ve bu bireylerde farkındalık oluşturmaktadır. Toplum sağlığını tehdit eden durumlarda, yüksek bilinçle hassasiyet gösteren, sürece olumlu katkılar sağlayan bireyleri topluma kazandırması açısından, böylesi çalışmalar büyük önem taşımaktadır.

Yazıcı böceklerden, Xyleborinus saxesenii Ratzeburg (Coleoptera: Curculionidae) Doğu Karadeniz bölgesinde fındık bahçelerinde ciddi zararlara neden olmaktadır. Zararlı böceklere karşı biyolojik mücadele ajanı geliştirmek için böceklerden izole edilen bakteriler tanımlanmaktadır. Bu çalışmada, X. saxesenii’den izole edilen bakteriler morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal, yağ asit analizi ve moleküler olarak incelenmiştir. Sonuç olarak, bakteriler Rahnella aquatilis (Xs1), Pseudomonas putida (Xs2), Sphingobacterium multivorum (Xs3), Serratia liquefaciens (Xs4), Aeromonas sp. (Xs5), Hafnia alvei (Xs6, Xs7), Acinetobacter calcoaceticus (Xs8), Pseudomonas sp. (Xs9), Pseudomonas fluorescens (Xs10, Xs13), Pantoea agglomerans (Xs11) ve Serratia marcescens (Xs12) olarak tanımlanmıştır.

WOS: 000418508400001 Honeybees are considered as a key species in nature for their vital role in the maintenance of almost all life on earth. However, the massive death of honeybee stocks worldwide, largely due to colony collapse disorder, is causing international concern. In order to avoid these losses, new approaches must be sought. In previous studies, the probiotic properties of the bacteria found in the bodies of honeybees are thought to have an active role in providing resistance against pathogens. Consequently, in this study, it is aimed to isolate probiotic lactic acid bacteria from honey stomachs of the healthy honeybee, to examine the effect of these bacteria against pathogenic bacteria and to use these bacteria to boost the immune system of bees. For this purpose, between 2015 and 2016, probiotic bacteria were screened from honey bees that provided by DAGEM (Duzce University, Beekeeping Research, Development and Application Center, Yigilca, DUZCE). The inhibitory activity of the obtained bacteria against the bee pathogen Melissococcus plutonius (Truper and de 'Clari, 1998) (Enterococcaceae) was determined by in vitro agar well diffusion. The bacterium with the desired characteristics were identified by biochemical, physiological and 16s rDNA analysis as Lactobacillus kunkeei (Edwards, 1998) (Lactobacillaceae) and its probiotic nature was investigated. With the evaluation of these findings, future preparations of the isolate are expected to support the bee immune system and, as a result, to produce resistant honeybees without resorting to treatment with antibiotics. Scientific and Technological Research Council of Turkey (TUBITAK)Turkiye Bilimsel ve Teknolojik Arastirma Kurumu (TUBITAK) [114Z723] This work was supported by the Scientific and Technological Research Council of Turkey (TUBITAK, Project No. 114Z723). The authors thank Assistant Professor Dr. Meral KEKECOGLU, Director of the Duzce University Beekeeping Research, Development and Application Center (DAGEM) for her help in providing bees for the project, Hacer DURSUN for her assistance in the isolation of bacteria, and veterinarian Yunus GUR for the gift of the M. plutonius culture.

The aim of this investigation was to determine, purify, and characterize an antibacterial substance produced by Serratia marcescens Mm3 (Sm-Mm3) isolated from a common pest of hazelnut in Turkey, Melolontha melolontha, which is also a significant pest all over the world. A highly active antibacterial substance produced by Sm-Mm3 was purified by ammonium sulfate precipitation and high-performance liquid chromatography, respectively, and identified by spectrometric analysis (TOF-MS). Finally, we showed that this molecule is heat-stable, stable in the pH range of 5-9, and insensitive to organic solvents and proteinase K. The molecular mass was determined as 479 Da. Plasmid elimination demonstrated that the gene responsible for this antibacterial substance of the Sm-Mm3 strain is located on the plasmid. Based on the determined characteristics, the antibacterial substance was identified as a bacteriocin-like substance. Although this active substance is similar to bacteriocin because of many features such as mode of action and physicochemical properties, it differs by having a low molecular weight and by being insensitive to proteinase K. This active substance has potential to control many different pathogenic bacteria in various areas, particularly in agriculture, against plant pathogenic bacteria.

In this study, 13 different bacteria were isolated from the surface mucus layer of Oncorhynchus mykiss ra- inbow trout . These bacteria were identified as Exiguobacterium sp. Om1 , Acinetobacter sp. Om2, Om7 , Microbacterium sp. Om3 , Arthrobacter sp. Om4 , Sphingobacterium sp. Om5 , Stenotrophomonas sp. Om6, 10 and 11 , Pseudomanas sp. Om8 , Corynebacterium sp. Om12 Aeromonas sp. Om14 and Psychrobacter sp. Om15 based on morphological, physiological, and biochemical characteristics, as well as phylogenetic analy- sis using 16S rDNA sequences. We report that isolate Om15 produces a cold-active lipase enzyme. The lipase enzyme was partially purified from the bacterial supernatant and its specific activity was calculated as 64.393 U g–1. Optimal performance of the enzyme occurred at pH 8.0 and 20°C using p-nitrophenyl dodecanoate as a substrate. SDS-PAGE indicated that the lipase enzyme is composed of 2 subunits 58-60 kDa, and that it is possible that the active lipase enzyme is the heterodimer of the subunits, which was confirmed via Native- PAGE. Furthermore, the lipase activity decreased in response to application of Co2+ and Cu2+ ions; however, no significant difference in the lipase activity was observed via application of other ions., B u çalışmada Oncorhynchus mykiss gökkuşağı alabalığı ’in yüzey mukus tabakasından 13 farklı bakteri izole edildi. Bu bakteriler; morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal ve 16S rDNA analiz sonuçları dikkate alınarak; Exiguobacterium sp. Om1 , Acinetobacter sp. Om2 ve Om7 , Microbacterium sp. Om3 , Arthrobacter sp. Om4 , Sphingobacterium sp. Om5 , Stenotrophomonas sp. Om6, 10 ve 11 , Pseudomanas sp. Om8 , Corynebacterium sp. Om12 Aeromonas sp. Om14 ve Psychrobacter sp. Om15 olarak tanımlandı. Om15 izolatının soğukta aktif lipaz enzimi ürettiği tespit edildi. Lipaz enzimi bakteri süpernatantından kısmi olarak saflaştırıldı ve özgül aktivitesi 64.393 U g–1 olarak hesaplandı. Enzimin optimum performansı substrat olarak p-nitrofenil dodekanat kullanıldığında, pH 8.0’de ve 20°C’de gösterdiği tespit edildi. SDS-PAGE analizi ile lipaz enzimin 5860 kDa büyüklüğünde iki alt birime sahip olduğu tespit edildi. Aktif lipaz enziminin bu alt birimlerin heterodimer yapıları ile oluştuğu Native-PAGE ile tespit edildi. Bunların yanısıra lipazın aktivitesinin Co+2 ve Cu+2 iyonları uygulaması ile azaldığı diğer iyon uygulamalarının ise aktivitede önemli değişikliklere sebep olmadığı belirlendi