Santos, Luciano Henrique Braz dos, 1988, Souza, Anete Pereira de, 1962, Vigna, Bianca Baccili Zanotto, Laborda, Prianda Rios, Maluf, Mirian Perez, Zucchi, Maria Imaculada, Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, and UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
Orientador: Anete Pereira de Souza Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: A seringueira (Hevea brasiliensis), espécie originária da região amazônica, possui grande importância econômica por ser a maior fonte de borracha natural. Tal polímero possui características que não podem ser obtidas de materiais sintéticos, tais como resistência à abrasão, isolamento elétrico e de gases e resiliência, sendo utilizado para as mais diferentes finalidades, tais como fabricação de pneumáticos e equipamentos médicos hospitalares. Contudo, devido à ocorrência de uma doença em sua região de origem, originada pela contaminação de folhas jovens pelo fungo Pseudocercospora ulei, tornou-se necessária a implementação dessa cultura em regiões não favorecidas climaticamente para o desenvolvimento de tal organismo. Por tal motivo, a adaptação da espécie em regiões contrastantes quando comparadas a seu centro de origem, também conhecidas como áreas de escape, tornou-se necessária, sendo um dos principais objetivos de programas de melhoramento, especialmente aqueles desenvolvidos pelo Instituto Agronômico de Campinas. Por possuir um longo ciclo de melhoramento, cerca de 30 anos, o emprego de novas técnicas pode representar numa diminuição deste tempo. Neste contexto, os marcadores moleculares SNPs (single nucleotide polymorphisms), podem auxiliar programas de melhoramento a partir da técnica de genotipagem-por-sequenciamento (GBS), a qual permite a descoberta e genotipagem simultânea de SNPs em grande quantidade. O mapa genético da população de mapeamento proveniente do cruzamento de PB217 com PR255, contrastantes para as características de tolerância ao frio e alta produtividade foi construído, utilizando-se marcadores desenvolvidos em outros trabalhos com aqueles baseados na técnica de GBS. Foi obtido um mapa composto por 18 grupos de ligação e comprimento de 4693 cM, contendo um total de 1062 marcadores, dos quais 576 são baseados em GBS. Utilizando-se 368 indivíduos de um painel genotipados pela mesma técnica, utilizando-se análise de coordenadas principais para 2221 marcadores, foi descoberta a separação dos genótipos em dois grupos distintos, aqueles correspondentes a majoritariamente indivíduos com algum ciclo de melhoramento e selvagens. Tais grupos foram então utilizados para a avaliação de desequilíbrio de ligação (DL), sendo evidenciados diferentes padrões de DL, nos quais os melhorados apresentaram DL médio de 0,49 contra 0,02 no grupo sem melhoramento. Outro mapa de ligação foi criado a partir de população de mapeamento proveniente dos genitores GT1 e RRIM701, obtendo-se mapa de ligação com 3779,3 cM e 1079 marcadores, sendo em seguida realizada a detecção de QTLs, sendo identificados 38 dos quais 24 identificados para diâmetro do caule, sete para altura e sete para número de nós Abstract: The rubber tree (Hevea brasiliensis), species originating in the Amazon region, has great economic importance because it is the largest source of natural rubber. Such polymer has properties that cannot be obtained from synthetic materials, such as abrasion resistance, electrical and gas insulation and resilience, being used for the most different purposes, such as the manufacture of tires and hospital medical equipment. However, due to the occurrence of a disease in its region of origin, caused by the contamination of young leaves by the fungus Pseudocercospora ulei, it became necessary to implement this culture in regions favored climatically for the development of such an organism. For this reason, the adaptation of the species in contrasting regions when compared to its center of origin, also known as escape areas, became necessary, being one of the main objectives of breeding programs, especially those developed by the Agronomic Institute of Campinas. Because it has a long improvement cycle of about 30 years, the use of new techniques can represent a reduction in this time. In this context, the molecular markers SNPs (single nucleotide polymorphisms) appear, they can assist breeding programs using the technique of genotyping-by-sequencing (GBS), which allows the discovery and simultaneous genotyping of large amounts of SNPs. Genetic map of the mapping population from the crossing of PB217 with PR255, contrasting for the characteristics of cold tolerance and high productivity was constructed, using markers developed in other works together with those based on the GBS technique. A map composed of 18 linkage groups and a length of 4693 cM was obtained, containing a total of 1062 markers, of which 576 are based on GBS. Using 368 individuals from a genotyped panel using the same technique, using principal coordinate analysis for 2221 markers, the separation of individuals into two distinct groups was found, those corresponding to mostly breeding individuals and wild individuals, which they were then used for the evaluation of linkage disequilibrium (LD), with different patterns of LD being evidenced, the breeding individuals presented an average LD of 0.49 against 0.02 of the wild individuals. Another linkage map was created from a mapping population from the genitors GT1 and RRIM701, obtaining a linkage map with 3779.3 cM and 1079 markers, then detecting QTLs, 38 of which 24 were identified for stem diameter, seven for height and seven for number of nodes Doutorado Genética Vegetal e Melhoramento Doutor em Genética e Biologia Molecular FAPESP 2017/07908-9 CNPQ 0141403/2016-0 CAPES 0