15 results on '"Selmi, Sonia-Yuki"'
Search Results
2. Validating the Transfer of Skills Acquired on a Prostate Biopsy Simulator: A Prospective, Randomized, Controlled Study
- Author
-
Fiard, Gaelle, Selmi, Sonia-Yuki, Maigron, Manon, Bellier, Alexandre, Promayon, Emmanuel, Descotes, Jean-Luc, and Troccaz, Jocelyne
- Published
- 2020
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3. Initial validation of a virtual-reality learning environment for prostate biopsies: realism matters!
- Author
-
Fiard, Gaelle, Selmi, Sonia-Yuki, Promayon, Emmanuel, Vadcard, Lucile, Descotes, Jean-Luc, and Troccaz, Jocelyne
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Computer Science - Computers and Society - Abstract
: Introduction-objectives: A virtual-reality learning environment dedicated to prostate biopsies was designed to overcome the limitations of current classical teaching methods. The aim of this study was to validate reliability, face, content and construct of the simulator. Materials and methods: The simulator is composed of a) a laptop computer, b) a haptic device with a stylus that mimics the ultrasound probe, c) a clinical case database including three dimensional (3D) ultrasound volumes and patient data and d) a learning environment with a set of progressive exercises including a randomized 12-core biopsy procedure. Both visual (3D biopsy mapping) and numerical (score) feedback are given to the user. The simulator evaluation was conducted in an academic urology department on 7 experts and 14 novices who each performed a virtual biopsy procedure and completed a face and content validity questionnaire. Results: The overall realism of the biopsy procedure was rated at a median of 9/10 by non-experts (7.1-9.8). Experts rated the usefulness of the simulator for the initial training of urologists at 8.2/10 (7.9-8.3), but reported the range of motion and force feedback as significantly less realistic than novices (p=0.01 and 0.03 respectively). Pearson's r correlation coefficient between correctly placed biopsies on the right and left side of the prostate for each user was 0.79 (p<0.001). The 7 experts had a median score of 64% (59-73), and the 14 novices a median score of 52% (43-67), without reaching statistical significance (p=0,19). Conclusion: The newly designed virtual reality learning environment proved its versatility and its reliability, face and content were validated. Demonstrating the construct validity will require improvements to the realism and scoring system used.
- Published
- 2013
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4. Using CamiTK for rapid prototyping of interactive Computer Assisted Medical Intervention applications
- Author
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Promayon, Emmanuel, Fouard, Celine, Bailet, Mathieu, Deram, Aurelien, Fiard, Gaelle, Hungr, Nikolai, Luboz, Vincent, Payan, Yohan, Sarrazin, Johan, Saubat, Nicolas, Selmi, Sonia Yuki, Voros, Sandrine, Cinquin, Philippe, and Troccaz, Jocelyne
- Subjects
Computer Science - Other Computer Science - Abstract
Computer Assisted Medical Intervention (CAMI hereafter) is a complex multi-disciplinary field. CAMI research requires the collaboration of experts in several fields as diverse as medicine, computer science, mathematics, instrumentation, signal processing, mechanics, modeling, automatics, optics, etc.
- Published
- 2013
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5. Hybrid 2D–3D ultrasound registration for navigated prostate biopsy
- Author
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Selmi, Sonia-Yuki, Promayon, Emmanuel, and Troccaz, Jocelyne
- Published
- 2018
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6. 3D Interactive Ultrasound Image Deformation for Realistic Prostate Biopsy Simulation
- Author
-
Selmi, Sonia-Yuki, Promayon, Emmanuel, Sarrazin, Johan, Troccaz, Jocelyne, Hutchison, David, Series editor, Kanade, Takeo, Series editor, Kittler, Josef, Series editor, Kleinberg, Jon M., Series editor, Kobsa, Alfred, Series editor, Mattern, Friedemann, Series editor, Mitchell, John C., Series editor, Naor, Moni, Series editor, Nierstrasz, Oscar, Series editor, Pandu Rangan, C., Series editor, Steffen, Bernhard, Series editor, Terzopoulos, Demetri, Series editor, Tygar, Doug, Series editor, Weikum, Gerhard, Series editor, Bello, Fernando, editor, and Cotin, Stéphane, editor
- Published
- 2014
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7. 3D Interactive Ultrasound Image Deformation for Realistic Prostate Biopsy Simulation
- Author
-
Selmi, Sonia-Yuki, primary, Promayon, Emmanuel, additional, Sarrazin, Johan, additional, and Troccaz, Jocelyne, additional
- Published
- 2014
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8. Validation du transfert des compétences acquises sur un simulateur de biopsies prostatiques : une étude prospective randomisée
- Author
-
Fiard, Gaelle, Selmi, Sonia-Yuki, Maigron, Manon, Bellier, Alexandre, Promayon, Emmanuel, Descotes, Jean-Luc, Troccaz, Jocelyne, Service d'urologie [CHU Grenoble], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Gestes Medico-chirurgicaux Assistés par Ordinateur (TIMC-GMCAO), Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525 (TIMC ), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA), Registre des cancers de l’Isère [CHU de Grenoble], and Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Université Grenoble Alpes (UGA)
- Subjects
Prostate cancer ,Computer-assisted training ,education ,surgical education ,Surgical education COMPETENCIES: Medical Knowledge ,[SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer ,[SDV.MHEP.CHI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery ,simulation ,[SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology ,[INFO.INFO-GR]Computer Science [cs]/Graphics [cs.GR] ,Prostate biopsy ,Systems-Based Practice ,[INFO.EIAH]Computer Science [cs]/Technology for Human Learning ,Patient Care ,Practice-Based Learn- ing and Improvement - Abstract
International audience; Objectives: To evaluate the ability of students to reproduce the skills acquired on a prostate biopsy simulator in a real-life situation. Design: A prospective randomized controlled study was conducted. Medical students with no experience of prostate biopsy were randomized between arm A « conventional training » and arm B « simulator-enhanced training. » The training was performed for both groups on the simulator. The students in arm B were provided with visual and numerical feedback. The transfer of skills was assessed by recording the position of the 12 biopsies performed by each student on an unembalmed human cadaver using a 3D ultrasound mapping device. Setting: The study was conducted in an academic urology department and the cadaver experiments in the adjoining anatomy laboratory. 2 Results: Twenty-four students were included, and 22 completed the study. The median score obtained on the simulator at the end of the training was 57% (53-61) for arm A and 66% (59-71) for arm B. The median score obtained on the cadaver by students trained with the simulator was 75% (60-80), statistically superior to the score obtained by students trained conventionally of 45% (30-60), p
- Published
- 2020
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9. Simulation-based training for prostate biopsies: towards the validation of the Biopsym simulator
- Author
-
Fiard, Gaelle, primary, Selmi, Sonia-Yuki, additional, Promayon, Emmanuel, additional, Descotes, Jean-Luc, additional, and Troccaz, Jocelyne, additional
- Published
- 2019
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10. Navigation en temps-réel pour la biopsie de prostate
- Author
-
Selmi, Sonia Yuki, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Grenoble Alpes, Jocelyne Troccaz, and Emmanuel Promayon
- Subjects
Biopsies ,Biopsy ,Prostate ,[INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging ,[SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology ,Navigation - Abstract
Prostate cancer is the most common cancer world-wide for males and the second leading cause of cancer death in France. Prostate biopsy procedures, performed to obtain and analyze tissue samples of the gland, are required for diagnosis. The clinical standard protocol is currently performed under UltraSound (US) control following a systematic protocol. Unfortunately, prostate cancer diagnosis is complicated by the lack of image quality and the low intrinsic contrast between tumor and non-tumor on US images. Conventional biopsies are performed under Transrectal UltraSound (TRUS) guidance. Precisely localizing the biopsy sites is challenging because the gland has a symmetric shape and because the prostate moves and is deformed by the patient motion and the TRUS probe pressure.This work aims at designing a system for navigated prostate biopsies combining a low-cost tracking system and a 2D-3D US registration method. To achieve this objective, our approach is based on hybrid 2D-3D ultrasound (US) rigid registration method for navigated prostate biopsy that enables continuous localization of the biopsy trajectory during the exam.Accuracy and robusteness was evaluated on a significant patient data set recorded in routine uncontrolled conditions from two different hospitals. The results show that 75% of the cases with error less than 5mm, which is clinically acceptable.Thereafter, we developed experiments to evaluate the tracking. The method was tested in a prostate phantom and a probe tracking by a inertial sensor. It was shown that it can do a better localization than and inertial measurement unit. Those first results obtained by our tracking method have established a proof of concept for a future clinical application. We highlighted that the sensor data are complex to exploit in optimal conditions. Additional experiments sould be performed in more realistic conditions.The method adjustment and the computing time-enhancement are the two main approaches to develop to create a first prototype of real-time tracking for navigated prostate biopsy. The long-standing cooperation between clinicians and researchers is an essential asset for a future clinical validation.; Le cancer de la prostate est devenu depuis deux décennies le cancer le plus fréquent de l’homme dans le monde et représente la troisième cause de décès par cancer chez l’homme en France. La biopsie de prostate est l’examen de confirmation diagnostique standard de ce cancer. Elle permet, par des prélèvements systématisés ou dirigés vers une cible, l’analyse anatomopathologique du tissu prostatique. Guidée par échographie transrectale, l’objectif de la biopsie est de réaliser une cartographie prostatique avec une série de prélèvements multiples bien distribués dans le volume de la prostate. Cependant, la réalisation de biopsies de prostate présente de nombreuses difficultés pour le clinicien car le geste demande une représentation 3D d’un organe très déformable et mobile. Ainsi l’accès à une cartographie précise des biopsies effectuées a un intérêt pour l’amélioration de la qualité des biopsies, la traçabilité des biopsies et l’apprentissage du geste.En partant de ce constat clinique, l’objectif de cette thèse est la conception d’un système de suivi pour la navigation et le guidage de la biopsie de prostate écho-guidée par voie rectale compatible avec une application clinique. Notre approche se base sur une méthode de recalage 2D-3D rigide, qui met en correspondance une image 2D échographique et un volume échographique de référence acquis en début de procédure. Le recalage 2D-3D d’images échographiques est complexe parce que l’information hors-plan n’est pas présente dans l’image 2D et les images échographiques sont très bruitées. Nous avons développé une méthode, dite hybride, qui consiste en la mise en correspondance de caractéristiques de l’image à partir d’une distance basée sur les intensités de pixels/voxels et sur une proximité euclidienne. La précision et robustesse de l’algorithme ont été évaluées sur des données de 20 patients acquises durant des procédures de biopsies de prostate dans deux centres hospitaliers français. Nous avons montré que l’amélioration de la TRE avant et après recalage est statistiquement significative. Près de 75% des TRE obtenues étaient inférieures à 5mm, qui est le seuil clinique de significativité des tumeurs.Par la suite, nous avons mis en application la méthode de recalage dans le cadre du suivi. Une expérimentation sur fantôme prostatique intégrant une sonde équipée d’un capteur de localisation est réalisée pour déterminer la faisabilité et l’apport en termes de précision pour la navigation pour la biopsie de prostate. Les premiers résultats obtenus par notre méthode de suivi montrent une preuve de concept approfondie pour une application clinique. L’information donnée par le capteur inertiel est difficile à exploiter de manière optimale. De nouvelles expérimentations dans des conditions plus favorables devraient être réalisées. Les premiers résultats du suivi sont malgré tout prometteurs dans l’objectif d’une application clinique.La perspective principale pour la méthode de suivi est son intégration dans la plateforme MIRAS, (commercialisée par Koelis) pour continuer l’évaluation. L’ajustement de la méthode et l’amélioration des temps de calcul sont les deux axes majeurs à approfondir pour faire naı̂tre un premier prototype de guidage temps-réel pour la biopsie de prostate. La collaboration de longue date entre les cliniciens et chercheurs de ce projet est un atout essentiel pour la future validation clinique.
- Published
- 2017
11. Surgical navigation for prostate biopsy
- Author
-
Selmi, Sonia Yuki, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Grenoble Alpes, Jocelyne Troccaz, Emmanuel Promayon, and STAR, ABES
- Subjects
Biopsies ,Biopsy ,[INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging ,Prostate ,[INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging ,[SDV.MHEP.UN] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology ,[SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology ,Navigation - Abstract
Prostate cancer is the most common cancer world-wide for males and the second leading cause of cancer death in France. Prostate biopsy procedures, performed to obtain and analyze tissue samples of the gland, are required for diagnosis. The clinical standard protocol is currently performed under UltraSound (US) control following a systematic protocol. Unfortunately, prostate cancer diagnosis is complicated by the lack of image quality and the low intrinsic contrast between tumor and non-tumor on US images. Conventional biopsies are performed under Transrectal UltraSound (TRUS) guidance. Precisely localizing the biopsy sites is challenging because the gland has a symmetric shape and because the prostate moves and is deformed by the patient motion and the TRUS probe pressure.This work aims at designing a system for navigated prostate biopsies combining a low-cost tracking system and a 2D-3D US registration method. To achieve this objective, our approach is based on hybrid 2D-3D ultrasound (US) rigid registration method for navigated prostate biopsy that enables continuous localization of the biopsy trajectory during the exam.Accuracy and robusteness was evaluated on a significant patient data set recorded in routine uncontrolled conditions from two different hospitals. The results show that 75% of the cases with error less than 5mm, which is clinically acceptable.Thereafter, we developed experiments to evaluate the tracking. The method was tested in a prostate phantom and a probe tracking by a inertial sensor. It was shown that it can do a better localization than and inertial measurement unit. Those first results obtained by our tracking method have established a proof of concept for a future clinical application. We highlighted that the sensor data are complex to exploit in optimal conditions. Additional experiments sould be performed in more realistic conditions.The method adjustment and the computing time-enhancement are the two main approaches to develop to create a first prototype of real-time tracking for navigated prostate biopsy. The long-standing cooperation between clinicians and researchers is an essential asset for a future clinical validation., Le cancer de la prostate est devenu depuis deux décennies le cancer le plus fréquent de l’homme dans le monde et représente la troisième cause de décès par cancer chez l’homme en France. La biopsie de prostate est l’examen de confirmation diagnostique standard de ce cancer. Elle permet, par des prélèvements systématisés ou dirigés vers une cible, l’analyse anatomopathologique du tissu prostatique. Guidée par échographie transrectale, l’objectif de la biopsie est de réaliser une cartographie prostatique avec une série de prélèvements multiples bien distribués dans le volume de la prostate. Cependant, la réalisation de biopsies de prostate présente de nombreuses difficultés pour le clinicien car le geste demande une représentation 3D d’un organe très déformable et mobile. Ainsi l’accès à une cartographie précise des biopsies effectuées a un intérêt pour l’amélioration de la qualité des biopsies, la traçabilité des biopsies et l’apprentissage du geste.En partant de ce constat clinique, l’objectif de cette thèse est la conception d’un système de suivi pour la navigation et le guidage de la biopsie de prostate écho-guidée par voie rectale compatible avec une application clinique. Notre approche se base sur une méthode de recalage 2D-3D rigide, qui met en correspondance une image 2D échographique et un volume échographique de référence acquis en début de procédure. Le recalage 2D-3D d’images échographiques est complexe parce que l’information hors-plan n’est pas présente dans l’image 2D et les images échographiques sont très bruitées. Nous avons développé une méthode, dite hybride, qui consiste en la mise en correspondance de caractéristiques de l’image à partir d’une distance basée sur les intensités de pixels/voxels et sur une proximité euclidienne. La précision et robustesse de l’algorithme ont été évaluées sur des données de 20 patients acquises durant des procédures de biopsies de prostate dans deux centres hospitaliers français. Nous avons montré que l’amélioration de la TRE avant et après recalage est statistiquement significative. Près de 75% des TRE obtenues étaient inférieures à 5mm, qui est le seuil clinique de significativité des tumeurs.Par la suite, nous avons mis en application la méthode de recalage dans le cadre du suivi. Une expérimentation sur fantôme prostatique intégrant une sonde équipée d’un capteur de localisation est réalisée pour déterminer la faisabilité et l’apport en termes de précision pour la navigation pour la biopsie de prostate. Les premiers résultats obtenus par notre méthode de suivi montrent une preuve de concept approfondie pour une application clinique. L’information donnée par le capteur inertiel est difficile à exploiter de manière optimale. De nouvelles expérimentations dans des conditions plus favorables devraient être réalisées. Les premiers résultats du suivi sont malgré tout prometteurs dans l’objectif d’une application clinique.La perspective principale pour la méthode de suivi est son intégration dans la plateforme MIRAS, (commercialisée par Koelis) pour continuer l’évaluation. L’ajustement de la méthode et l’amélioration des temps de calcul sont les deux axes majeurs à approfondir pour faire naı̂tre un premier prototype de guidage temps-réel pour la biopsie de prostate. La collaboration de longue date entre les cliniciens et chercheurs de ce projet est un atout essentiel pour la future validation clinique.
- Published
- 2017
12. Simulation-based training for prostate biopsies: towards the validation of the Biopsym simulator.
- Author
-
Fiard, Gaelle, Selmi, Sonia-Yuki, Promayon, Emmanuel, Descotes, Jean-Luc, and Troccaz, Jocelyne
- Subjects
- *
BIOPSY , *PROSTATE tumors , *DESCRIPTIVE statistics , *MAGNETIC resonance imaging , *SIMULATION methods in education , *LONGITUDINAL method , *SURVEYS , *RESEARCH methodology , *COMPUTER assisted instruction , *USER-centered system design - Abstract
Objectives: The Biopsym simulator, a virtual-reality simulator for prostate biopsies, was designed to offer enhanced teaching of the biopsy procedure. The objectives of the present article are to describe the new version of the simulator and report the results of a new validation study. Material and methods: A prospective validation study was conducted between January and March 2017. The new version of the simulator, with improved physical realism, ultrasound image deformation, and a new scoring system, was evaluated by novice and confirmed users. Results: Twenty-one users evaluated the simulator, including ten novices and 11 confirmed users. The overall realism of the biopsy procedure was rated at 7.7/10 (IQR 5.7–9). The differences between the rates given by confirmed users and novices were not statistically significant. The median overall score obtained for the performance of 12 systematic ultrasound-guided biopsies was 43% (IQR 33–55). The median score obtained by confirmed users was 54% (IQR 46–62), and the median score obtained by novices was 31% (IQR 20–35). The difference between the scores was statistically significant (p = 0.005). Conclusions: This study allowed us to gather evidence towards the validation, and particularly towards the construct validation of the new version of the Biopsym simulator. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2020
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13. Initial Validation of a Virtual-Reality Learning Environment for Prostate Biopsies: Realism Matters!
- Author
-
Fiard, Gaelle, primary, Selmi, Sonia-Yuki, additional, Promayon, Emmanuel, additional, Vadcard, Lucile, additional, Descotes, Jean-Luc, additional, and Troccaz, Jocelyne, additional
- Published
- 2014
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14. Using CamiTK for rapid prototyping of interactive Computer Assisted Medical Intervention applications
- Author
-
Promayon, Emmanuel, primary, Fouard, Celine, additional, Bailet, Mathieu, additional, Deram, Aurelien, additional, Fiard, Gaelle, additional, Hungr, Nikolai, additional, Luboz, Vincent, additional, Payan, Yohan, additional, Sarrazin, Johan, additional, Saubat, Nicolas, additional, Selmi, Sonia Yuki, additional, Voros, Sandrine, additional, Cinquin, Philippe, additional, and Troccaz, Jocelyne, additional
- Published
- 2013
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15. A virtual reality simulator combining a learning environment and clinical case database for image-guided prostate biopsy
- Author
-
Selmi, Sonia-Yuki, primary, Fiard, Gaelle, additional, Promayon, Emmanuel, additional, Vadcard, Lucile, additional, and Troccaz, Jocelyne, additional
- Published
- 2013
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