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The state of São Paulo is the largest peanut producer in the country, accounting for more than 90% of national production. This work aimed to evaluate the agronomic potential and the response to viruses of breeding lines developed by assisted selection for resistance to the root-knot nematode. Sixty- two lines were evaluated for yield, 200-kernelweight and pod yield, in Federer's augmented blocks with the cultivars IAC OL 3 and IAC 503 as regular treatments. These genotypes were also planted in the municipalities of Bastos/SP and Santa Adélia/SP, at locations where virus occurrence has increased in peanut crops along recent years, causing significant damages. In Bastos, the plots consisted of 3 lines of 10 m in length. In Santa Adélia, the lines were evaluated in randomized blocks with three replications, in plots with a single row of 20 m. It was concluded that the nematode resistant selected lines have diversity for virus tolerance and agronomic potential for yield and kernel quality. El estado de São Paulo es el mayor productor de maní del país, siendo responsable por más del 90% de la producción nacional. Este trabajo tuvo como objetivo evaluar el potencial agronómico y la posible tolerancia a virus de líneas desarrolladas por selección asistida por marcadores moleculares para resistencia al nematodo de las agallas. Las líneas fueron evaluadas para rendimiento, peso de 200 granos y rendimiento de grano, en bloques aumentados de Federer con ‘IAC OL 3’ e ‘IAC 503’ como tratamientos regulares. En ensayos de resistencia del virus, las 62 líneas fueron evaluadas en Bastos/SP y Santa Adélia/SP, localidades donde el virus ha infectado los cultivos de maní de forma creciente en los últimos años. En Bastos, las parcelas constaban de 3 filas de 10 m de largo. En Santa Adélia, las líneas fueron evaluadas en bloques al azar con tres repeticiones y en parcelas con fila de 20 m. Se concluyó que las líneas resistentes a nematodos tienen diversidad para tolerancia a virus y potencial agronómico para la producción y calidad de granos. O estado de São Paulo é o maior produtor de amendoim do país, sendo responsável por mais de 90% da produção nacional. Este trabalho teve como objetivo avaliar o potencial agronômico e possível tolerância a vírus em linhagens desenvolvidas por seleção assistida por marcadores moleculares para resistência ao nematoide das galhas. Sessenta e duas linhagens assim selecionadas foram avaliadas em Ribeirão Preto quanto à produtividade, peso de 200 grãos e rendimento de grãos, em blocos aumentados de Federer, tendo ‘IAC OL3’ e ‘IAC 503’ como tratamentos regulares. Realizaram-se também ensaios para avaliação do potencial de resistência à virose, nas 62 linhagens nos municípios de Bastos/SP e Santa Adélia/SP, localidades onde o vírus tem infectado lavouras de amendoim de forma crescente nos últimos anos. Em Bastos, as parcelas foram constituídas por 3 linhas de 10 m de comprimento. Em Santa Adélia, as linhagens foram avaliadas em blocos casualizados com três repetições, em parcelas com uma linha de 20 m. Concluiu-se que as linhagens resistentes ao nematoide possuem diversidade para tolerância à virose e potencial agronômico para produção e qualidade de grãos.

The world population is expected to be larger and wealthier over the next few decades and will require more animal products, such as milk and beef. Tropical regions have great potential to meet this growing global demand, where pasturelands play a major role in supporting increased animal production. Better forage is required in consonance with improved sustainability as the planted area should not increase and larger areas cultivated with one or a few forage species should be avoided. Although, conventional tropical forage breeding has successfully released well-adapted and high-yielding cultivars over the last few decades, genetic gains from these programs have been low in view of the growing food demand worldwide. To guarantee their future impact on livestock production, breeding programs should leverage genotyping, phenotyping, and envirotyping strategies to increase genetic gains. Genomic selection (GS) and genomewide association studies play a primary role in this process, with the advantage of increasing genetic gain due to greater selection accuracy, reduced cycle time, and increased number of individuals that can be evaluated. This strategy provides solutions to bottlenecks faced by conventional breeding methods, including long breeding cycles and difficulties to evaluate complex traits. Initial results from implementing GS in tropical forage grasses (TFGs) are promising with notable improvements over phenotypic selection alone. However, the practical impact of GS in TFG breeding programs remains unclear. The development of appropriately sized training populations is essential for the evaluation and validation of selection markers based on estimated breeding values. Large panels of single-nucleotide polymorphism markers in different tropical forage species are required for multiple application targets at a reduced cost. In this context, this review highlights the current challenges, achievements, availability, and development of genomic resources and statistical methods for the implementation of GS in TFGs. Additionally, the prediction accuracies from recent experiments and the potential to harness diversity from genebanks are discussed. Although, GS in TFGs is still incipient, the advances in genomic tools and statistical models will speed up its implementation in the foreseeable future. All TFG breeding programs should be prepared for these changes. Made available in DSpace on 2021-08-10T02:06:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Genomic-selection-tropical.pdf: 2481038 bytes, checksum: c1c166bd9f912ae4d0970aee8c98aa94 (MD5) Previous issue date: 2021

Background: Tilapia is the most farmed fish in Colombia. However, the genetic diversity and structure of broodstocks in the hatcheries of Antioquia province remains unknown. Objective: To analyze the genetic diversity and structure of one Nile and three red tilapia broodstocks in Antioquia, Colombia. Methods: Fish were genotyped using 24 microsatellite markers of 13 linkage groups in five multiple reactions. Genetic diversity metrics were estimated and null alleles were detected. Analysis of Molecular Variance and analysis of number of clusters were used to describe the relationship between broodstocks. Results: Two microsatellites could not be amplified, and 22 were polymorphic. Average number of alleles per locus ranged 5.77 to 7.91. Locus UNH211 had the most alleles (17), whereas OMO032 had the fewest (4). Except for GM234 and OMO032, the analyzed loci had at least one private allele per population. Average effective number of alleles (3.37-4.03) was always less than the number of observed alleles. Significant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium with heterozygote deficiencies were registered. Nine markers showed evidence of null alleles. The expected heterozygosity (0.65 to 0.67 per broodstock) was significantly higher than the observed heterozygosity (0.601 to 0.649) in the four populations. The fixation index for all broodstocks (excluding null alleles) was 0.0766 (95% confidence interval, 0.05092 to 0.10289). According to the molecular variance analysis, the greatest variation was between individuals rather than between groups of broodstocks or individuals within broodstocks. The genetic distance between the Nile and red broodstocks ranged from 0.43 to 0.54. Conclusions: Overall, these findings provide baseline information about the genetic diversity and structure of tilapia broodstocks in Antioquia, Colombia, useful for the management of hatcheries. Resumen Antecedentes: La tilapia es el pez más cultivado en Colombia; sin embargo, hay gran desconocimiento sobre la estructura genetica actual de los reproductores. Objetivo: Analizar la diversidad y estructura genética de los reproductores de tres granjas de tilapia roja y una de tilapia Nilótica en Antioquia, Colombia. Métodos: Se utilizaron 24 microsatélites de 13 grupos de ligamiento amplificados en cinco reacciones múltiples. Se calcularon diferentes medidas de diversidad y se detectaron alelos nulos. Se utilizó un análisis de varianza molecular y uno de número de grupos para describir las relaciones entre las granjas de reproductores. Resultados: Dos marcadores no fueron amplificados y los 22 restantes fueron polimórficos. El promedio de alelos por locus varió entre 5,77 y 7,91. El mayor número de alelos (17) se encontró en el locus UNH 211, mientras que el menor se observó en OMO032 (cuatro). Veinte loci presentaron por lo menos un alelo privado. El número de alelos efectivos promedio fue menor al número de alelos observado y estuvo entre 3,37 y 4,03. Se registraron desviaciones significativas en el equilibrio Hardy-Weinberg, en su mayoría con deficiencias de heterocigotos. Se encontraron evidencias de alelos nulos en nueve marcadores. La heterocigosidad observada estuvo entre 0,601 y 0,649. El índice de fijación fue de 0.0766 (intervalo de confianza de 95%, entre 0,05092 y 0,10289). Según el análisis de varianza molecular, la mayor fuente de variación se encontró entre individuos. El valor de la distancia de Nei entre los reproductores Nilóticos y rojos estuvo entre 0,43 y 0,54. Conclusión: Los resultados de la presente investigación proveen una línea base acerca de la diversidad y estructura genética de los reproductores de tilapia en Antioquia, Colombia, y son útiles para el manejo de granjas dedicadas a la reproducción de tilapia. Resumo Antecedentes: A tilápia é o peixe mais cultivado na Colômbia. É importante examinar a diversidade genética de peixes reprodutores. Objetivo: Avaliar a diversidade e estrutura genética de três estoques de reprodutores de tilápias vermelhas e um de tilápia Nilótica em Antioquia, Colômbia. Métodos: Utilizaram-se 24 microssatélites de 13 grupos de ligação em cinco reações múltiplas. Métricas de diversidade genética foram estimadas e alelos nulos foram detectados. Análise da Variância Molecular e análise do número de clusters foram utilizados para descrever a relação entre os estoques. Resultados: Dois marcadores não foram amplificados e vinte e dois microssatélites analisados mostraram-se polimórficos. O número médio de alelos por locus variou entre 5,77 e 7,91. O Locus UNH211 apresentou o maior número de alelos (17), enquanto o OMO032 apresentou o menor número (4). Exceto GM234 e OMO032, os loci analisados mostrou um pelo menos um alelo privado por população. O número efetivo médio de alelos (3,37-4,03) foi sempre menor do que o número de alelos observados. Foram observados desvios significativos do equilíbrio Hardy-Weinberg e deficiência de heterozigotos. Nove loci mostraram evidências de alelos nulos. A heterozigosidade esperada (0,6504-0,6748 por população) foi significativamente maior do que a heterozigosidade observada (0,601-0,649). O índice de fixação foi de 0,0766 (intervalo de confiança de 95%, 0,05092-0,10289). De acordo com a análise da variância molecular, a maior variação foi entre indivíduos. Adistância genética entre o Nilo e os reprodutores vermelhos variou de 0,43 a 0,54. Conclusão: No geral, esses resultados fornecem informação básica sobre sobre diversidade e estrutura genética de reprodutores de tilápia em Antioquia, Colômbia, e são significativos para o manejo de plantéis de reprodutores.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi elaborar e validar um protocolo de detecção simultânea, via reação em cadeia da polimerase multiplex (PCR multiplex), de regiões genômicas do tomateiro (Solanum lycopersicum) associadas a fatores de resistência às três raças fisiológicas de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (FOL). Os pares de iniciadores empregados foram SSR-67 (específico para o gene I-1), TFusrr (específico para o gene I-2) e SSRD (específico para o gene I-3). Os resultados de genotipagem com marcadores moleculares foram comparados aos resultados de fenotipagem de uma coleção de germoplasma de tomateiro, em bioensaios de inoculação de isolados das três raças de FOL em plântulas, pelo método de imersão das raízes. A resistência ou a suscetibilidade foi confirmada por PCR, por meio de visualização dos âmplicons específicos para as regiões-alvo ligadas aos fatores de resistência às distintas raças de FOL. O protocolo elaborado para o uso conjunto dos marcadores moleculares, em PCR multiplex, permite a seleção de acessos de tomateiro resistentes às raças 1, 2, e 3 de F. oxysporum f. sp. lycopersici de maneira similar à realizada com a utilização de cada um separadamente. O PCR multiplex representa uma ferramenta viável para monitorar a incorporação desses fatores de resistência em linhagens de tomateiro. Abstract: The objective of this work was to develop and validate a protocol for simultaneous detection by multiplex polymerase chain reaction (multiplex PCR) of tomato (Solanum lycopersicum) genomic regions associated with factors of resistance to three physiological races of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (FOL). The employed primer pairs were SSR-67 (specific to the I-1 gene), TFusrr (specific to the I-2 gene), and SSRD (specific to the I-3 gene). Genotyping results with molecular markers were compared with the phenotyping ones of a tomato germplasm collection, in bioassays of isolate inoculation of the three FOL races in seedlings by root dipping. The resistance or susceptibility was confirmed by PCR, through the visualization of specific amplicons corresponding to the target regions linked to the factors of resistance to distinct FOL races. The elaborated protocol for the joint use of the molecular markers, by multiplex PCR, allows of the selection of tomato accessions that are resistant to the races 1, 2, and 3 of F. oxysporum f. sp. lycopersici in a similar way to that done with each one separately. PCR multiplex is a viable tool to monitor the incorporation of these resistance factors into tomato inbred lines.

Com o crescimento nos estudos do melhoramento genético e análises de DNA, novas técnicas para a reprodução comercial foram inventadas. Com o advento dos marcadores moleculares, criou-se a possibilidade de selecionar genótipos superiores encontrando a associação do genótipo com o fenótipo desejado. Marcadores moleculares são ferramentas utilizadas para auxiliar na busca do loci de caracterí­sticas quantitativas (QTL). O QTL são regiões cromossômicas no genoma animal, que definem caracterí­sticas quantitativas. Caracterí­sticas as quais, são de interesse comercial e difí­ceis de serem mensuradas. A localização do QTL é realizada por uma varredura no genoma animal, com o uso de diversos marcadores distribuí­dos por todo o genoma, para se localizar e avaliar associações com os fenótipos observados. Com a localização do QTL no genoma de espécies da aquicultura, pode-se utilizar-se dessa informação para o uso da Seleção Assistida por Marcadores (SAM). A SAM consiste, através do uso de marcadores moleculares e a localização do QTL, selecionar caracterí­sticas que são difí­ceis de mensurar e utilizar dessa informação na reprodução, para assim conseguir controlar caracterí­sticas de interesse comercial como: tolerância a salinidade e temperatura, ganho de peso corporal e resistência a doenças. Através do uso da SAM na aquicultura comercial, possibilitou-se a criação de uma população de Paralichthys olivaceus resistente a doença linfocí­tica, a qual é um doença viral que causa nódulos e diminui o valor comercial do animal acometido. Apesar de pouco utilizada na aquicultura, a SAM é de grande utilidade e importância, por se tratar de uma ferramenta que visa sempre o aumento do desempenho da produção. Porém, necessita-se de mais pesquisas e investimentos na área, para uma melhor utilização da SAM na aquicultura comercial.

O escurecimento dos grãos de feijão (Phaseolus vulgaris L.) ocorre após a colheita e gera perda no valor comercial do produto. Esse caráter é controlado por um gene com dominância do alelo que confere o escurecimento normal em feijões do tipo carioca e pinto. Em feijões do tipo pinto esse gene foi denominado Sd (Slow darkening). Entretanto, não existem relatos de que o gene identificado no tipo pinto é o mesmo do tipo carioca. Existem marcadores moleculares identificados como ligados ao gene Sd e validados em populações de feijão carioca: Pvsd-1158 (SSR) e PvbHLHp12804 (SNP). Assim, esse estudo objetivou verificar se o gene que controla o escurecimento dos grãos em diferentes genótipos de feijão com diferentes origens é o mesmo; avaliar a eficiência dos marcadores Pvsd-1158 e PvbHLHp12804 em um grupo de genótipos com grãos carioca e mulatinho; e estimar a divergência genética entre esses genótipos. Para isso, foram utilizados 17 genótipos de feijão, cultivados em dois experimentos em telado. Os grãos colhidos foram armazenados por 135 dias e avaliados fenotipicamente quanto ao escurecimento. Paralelamente, esses genótipos foram avaliados genotipicamente com os marcadores Pvsd-1158 e PvbHLHp12804 e também com um painel de 24 marcadores microssatélites para estimação da diversidade genética. Também foram realizados cruzamentos entre os genótipos 1533-15, AN512666-0 e BRSMG Madrepérola, que apresentam escurecimento lento dos grãos, para confirmar se o gene responsável pelo escurecimento nesses genótipos é o mesmo. Para isso, foram avaliadas progênies F2:3 por meio de testes de segregação a partir dos dados obtidos da avaliação fenotípica do escurecimento. Considerando as 17 linhagens, 13 apresentaram escurecimento lento, três apresentaram escurecimento normal e uma não apresentou escurecimento. Os marcadores Pvsd-1158 e PvbHLHp12804 apresentaram os alelos esperados de acordo com a avaliação fenotípica em 14 dos 16 genótipos que apresentaram algum escurecimento, representando 87,5% de coincidência com os dados fenotípicos e indicando que o gene Sd é o responsável pelo escurecimento dos grãos nesses genótipos. A linhagem CNFM11940, com grãos mulatinho e a cultivar TAA Dama, com grãos carioca apresentaram escurecimento lento e alelos relativos ao escurecimento normal para os dois marcadores. Isso indica que houve recombinação nessa região genômica, provocando a separação entre os marcadores e o gene Sd, ou que existe outro gene conferindo o escurecimento lento nesses genótipos. As estimativas de divergência genética entre os genótipos forneceram informações adicionais para comparação dos genótipos. Adicionalmente, todas as progênies F2:3 oriundas das três populações, apresentaram escurecimento lento e, portanto, não houve segregação. Assim, o gene que controla o escurecimento dos grãos em feijão pinto e carioca é o gene Sd. The darkening of bean grains (Phaseolus vulgaris L.) occurs after harvest and leads to loss of commercial value of the product. This trait is controlled by one gene, in which the dominant allele confers the normal grain darkening of the carioca and pinto type. In the pinto type, this gene was denominated Sd (Slow darkening). However, there are no reports that the gene identified in pinto is the same as in the carioca type. Molecular markers linked to the Sd gene have been identified and validated in carioca type populations: Pvsd-1158 (SSR) and PvbHLHp12804 (SNP). Thus, this study aimed to verify if the gene that controls the darkening of the grains in different genotypes is the same; evaluate the efficiency of the markers Pvsd-1158 and PvbHLHp12804 in a group of genotypes with carioca and mulatinho (cream) grains; and estimate the genetic divergence among these genotypes. For this, 17 bean genotypes were used, which were grown in two experiments in greenhouse. The harvested grains were stored for 135 days and phenotypically evaluated for darkening. In parallel, these genotypes were evaluated genotypically with the markers Pvsd-1158 and PvbHLHp12804 and also with a panel of 24 microsatellite markers for estimation of genetic diversity. Crossings were also performed between genotypes 1533-15, AN512666-0 and BRSMG Madrepérola, which present slow darkening of the grains, to confirm if the gene responsible for the slow darkening is the same. For this, progenies F2:3 were evaluated by segregation tests from the data obtained from the phenotypic evaluation of the darkening. Considering the 17 lines,, 13 lines showed slow darkening, three presented normal darkening and one presented no darkening. The Pvsd-1158 and PvbHLHp12804 markers presented the expected alleles according to the phenotypic evaluation in 14 of the 16 genotypes that presented some darkening, representing 87.5% coincidence with the phenotypic data, indicating that the Sd gene is responsible for the darkening the grains in these genotypes. The line CNFM11940, with grains mulatinho (cream) and the cultivar TAA Dama, with carioca grains presented slow darkening and alleles linked to normal darkening for the two markers. This indicates that there were recombination in this genomic region, taunting the separation between the markers and the Sd gene, or that there is another gene conferring the slow darkening in these genotypes. Estimation of genetic divergence among the genotypes provided additional information for comparison of the genotypes. Additionally, all the progenies F2:3 originating from the three populations showed slow darkening and, therefore, there was no segregation. Thus, the gene that controls the darkening of the grains in beans pinto and carioca is the Sd gene.

The melon (Cucumis melo L.) is a cucurbit crop with worldwide prominence. In Brazil, it has relevant socioeconomic importance in the Northeast region. The leafminer, Liriomyza spp. (Diptera: Agromyzidae), is the main pest of the crop, causing serious damages to the plant and, consequently, reducing the production and the quality of the fruits. The use of resistant genotypes is the most efficient and sustainable method of insect control, however, few sources of resistance to this insect have been identified in melon germplasm. The elucidation of genetic inheritance and the use of molecular markers are tools that aid in the introgression of leafminer resistance in melon hybrids. Considering two new sources of resistance to leafminer in melon, the objective was to elucidate the genetic control in line A915.34.01.08 and to identify microsatellite markers (SSR) associated with resistance in line A56.10.04. For the study of inheritance, each lineage (P1), resistant by antibiosis, was crossed with a susceptible lineage (P2), forming their respective hybrid (F1), which were self-pollinated and backcrossed with both parents obtaining the progeny (F2) and backcrosses (RC1 and RC2), respectively. The trials were conducted in a greenhouse and under field conditions, using natural populations of L. sativae, using a completely randomized design, with six treatments (P1, P2, F1, F2, RC1, RC2), different number of plants per replications, totaling 300 plants each experiment. The number of mines in leaves was counted and larval development were quantified, in which the plants were classified as resistant (without pupal development) or susceptible (at least one pupal development). Regarding the association of SSR markers with the resistance, a total of 328 primers were evaluated for the polymorphism in the P1, P2 and F1 generations and, later, the F2 generation was genotyped with the markers identified as polymorphic. Generation analysis demonstrated that four genes control leafminer resistance in line A915.34.01.08. Two SSR markers, CM321 and CM333, are associated with the L. sativae resistance gene in line A56.10.04. Therefore, the A915.34.01.08 lineage has an oligogenic inheritance, and can be used for the introgression of resistance in elite lines of melon, and the markers CM321 and CM333 are linked to the Ls gene, being able to be used in the selection assisted to the leafminer in the melon breeding program. O meloeiro (Cucumis melo L.) é uma hortaliça com destaque mundial. No Brasil, tem relevante importância socioeconômica na região Nordeste. A mosca-minadora, Liriomyza spp. (Diptera: Agromyzidae), é a principal praga da cultura, ocasionando sérios danos à planta e, consequentemente, reduzindo a produção e a qualidade dos frutos. O uso de genótipos resistentes constitui o método mais eficiente e sustentável de controle, entretanto, poucas fontes de resistência a esse inseto já foram identificadas em germoplasma de meloeiro. A elucidação da herança genética e o uso de marcadores moleculares são ferramentas que auxiliam na introgressão da resistência à mosca-minadora em híbridos comerciais de meloeiro. Considerando duas fontes de resistência à mosca-minadora em meloeiro, objetivou-se elucidar o controle genético na linhagem A915.34.01.08 e identificar marcadores microssatélites (Simple Sequence Repeats - SSR) associados à resistência na linhagem A56.10.04. Para o estudo de herança, cada linhagem (P1), resistente por antibiose, foi cruzada com uma linhagem suscetível (P2), formando suas respectivas primeiras gerações filiais (F1), as quais foram autofecundadas e retrocruzadas com ambos os genitores obtendo as segundas gerações filiais (F2) e retrocruzamentos (RC1 e RC2), respectivamente. As populações foram submetidas a ensaios em gaiola e em campo, sob infestação de L. sativae, utilizando o delineamento inteiramente casualizado, com seis tratamentos (P1, P2, F1, F2, RC1, RC2), distinto número de plantas por repetição, totalizando 300 plantas por experimento. Foram quantificados o número de minas nas folhas e o desenvolvimento larval, no qual as plantas foram classificadas em resistentes (sem desenvolvimento pupal) ou susceptíveis (pelo menos um desenvolvimento pupal). Com relação à associação de marcadores SSR à resistência, um total de 328 primers foram avaliados quanto ao polimorfismo nas gerações P1, P2 e F1 e, posteriormente, a geração F2 foi genotipada com os marcadores identificados como polimórficos. A análise de gerações demonstrou que quatro genes controlam a resistência à mosca-minadora na linhagem A915.34.01.08. Dois marcadores SSR, CM321 e CM333, estão associados ao gene de resistência à L. sativae na linhagem A56.10.04. Portanto, a linhagem A915.34.01.08 apresenta herança oligogênica, podendo ser utilizada na introgressão da resistência em linhagens-elite de meloeiro e, os marcadores CM321 e CM333 estão ligados ao gene Ls, estando aptos a serem utilizados na seleção assistida à mosca-minadora no programa de melhoramento genético do meloeiro.

O uso de marcadores moleculares tem crescido exponencialmente nos ultimos anos, principalmente em estudos de genetica de populacoes de plantas, quando se trata da conservacao de especies importantes ou que estao inseridas em biomas que precisam ser preservados. A exemplo disso, tem-se a cultura do feijao (Phaseolus vulgaris) cultivado no bioma Cerrado, sendo exposto a diferentes tipos de solos, climas e patogenos. Dentre os patogenos radiculares, os nematoides de galha se destacam, sendo considerados pragas do feijoeiro. Diante disso, o objetivo foi desenvolver e caracterizar marcadores microssatelites que confiram resistencia ao nematoide Meloidogyne spp. em feijao comum. Para isso, sequencias de QTLs foram selecionadas no banco de dados NCBI, por apresentarem genes homologos aos da soja por possuirem resistencia ao patogeno em questao, sendo identificadas para o feijao, usando o programa “BLAST” no site Phytozome. Nove primers foram desenhados utilizando o programa Primer3. Foi feita a extracao de DNA de sementes de feijao comum, utilizando protocolo de extracao pelo metodo SDS 10%. A quantificacao foi feita em eletroforese em gel de agarose a 1,2%, corado com brometo de etideo (0,5%/ml) em solucao tampao (TBE) 1x. Para amplificacao e otimizacao por PCR, o DNA de um unico genotipo foi usado, utilizando termociclador. As PCRs funcionais foram submetidas a eletroforese vertical em geis de poliacrilamida (4%) e corados com nitrato de prata. A transferibilidade permite aumentar a eficiencia na transferencia de informacao genomica atraves da homologia de EST de genes de interesse. Nove de 26 EST-SSR candidatos em feijao distribuidos em sete diferentes genes que conferem resistencia a nematoide de galha em soja estao disponiveis para validacao.

RESUMO: O estudo visou inferir sobre a estabilidade genética, com base na viabilidade polínica, em genótipos de triticale hexaploide utilizados no bloco de cruzamentos do programa de melhoramento genético da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Trigo). O experimento foi conduzido em delineamento inteiramente casualizado. Para cada genótipo, foram avaliadas cinco repetições e cada repetição foi constituída por uma planta. Analisaram-se, por meio de microscopia óptica e pela técnica de Squash com corante carmim acético 1%, 200 grãos de pólen por lâmina, totalizando 1.000 grãos de pólen por genótipo. As variáveis analisadas foram: grãos de pólen binucleados e trinucleados, com pouco amido, vazios, com mais de um poro e de tamanhos diferentes. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey a 1%. Houve diferença significativa entre todas as variáveis. A porcentagem de grãos de pólen binucleados e/ou trinucleados variou de 74 a 97%. Concluiu-se que 66% dos genótipos avaliados apresentaram viabilidade polínica acima de 90%, sendo indicados a continuar fazendo parte do programa de melhoramento genético de triticale, tanto na seleção de parentais como durante os cruzamentos e retrocruzamentos. Portanto, os estudos citogenéticos representam excelente ferramenta de apoio ao melhorista na escolha dos genótipos mais estáveis. ABSTRACT: The study aimed to infer about the genetic stability from the pollen viability in hexaploid triticale genotypes used in block crossings breeding program from Brazilian Company of Agriculture Research (Embrapa Wheat). The experiments were conducted in a randomized design. For each genotype five repetitions were assessed. Each replication consisted of one plant and each replication consisted of one plant. Two hundred pollen grains were analyzed by optical microscopy and by the squash technique with 1% acetic carmine dye per slide, totalizing 1,000 pollen grains per genotype. The variables analyzed were: binucleate and trinucleate pollen grains, with little starch, empty, with more than one pore and with different sizes. The data were submitted to analysis of variance and compared by Tukey test at 1%. There were significant differences between all variables. The percentage of binucleate and/or trinucleate grains ranged from 74 to 97%. We conclude that 66% of genotypes present pollen viability above 90% and they are indicated to remain of the breeding program of triticale, both in the selection of parenting as during the crossing and backcrossing. Therefore, the cytogenetic studies represent excellent support tool for breeder in selecting the most stable genotypes.

O objetivo deste trabalho foi determinar a presença do alelo Pvr4, que confere resistência contra o PepYMV (Pepper yellow mosaic virus), em genótipos de pimentão comunmente encontrados no mercado brasileiro, com uso de um marcador molecular codominante tipo CAPS. A resistência ao PepYMV, nos genótipos CM?334?INRA, Myr?29 e em genótipos derivados do híbrido comercial Mônica?R, foi detectada como associada à banda de 444 pb, ligada ao alelo de resistência Pvr4. As plantas resistentes homozigotas (pvr4/pvr4) mostraram uma banda de 444 pb, as suscetíveis (Pvr4+/Pvr4+) uma banda de 458 pb e as resistentes heterozigotas (Pvr4+/Pvr4) mostraram as duas bandas. No entanto, no acesso resistente CM?334?UFV, nos híbridos Magali?R e Martha?R, assim como em populações derivadas desse acesso e desses híbridos, a resistência ao PepYMV não esteve associada ao marcador CAPS. O acesso CM?334?UFV ('Criollo de Morelos?334', de Viçosa, MG) distinguiu-se do CM?334?INRA ('Criollo de Morelos?334', da França); embora ambos os acessos tenham sido resistentes ao PepYMV, apenas em CM?334?INRA foi encontrada a associação da resistência com a banda de 444 pb. Made available in DSpace on 2017-06-09T00:04:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Selecaoassistida.pdf: 698044 bytes, checksum: a132e8141bc1aa887f573ed98bf0f9dd (MD5) Previous issue date: 2012-09-20

A hipótese mais bem aceita atualmente para explicar a genética complexa da estenoespermocarpia, observada na videira, indica que a expressão deste fenótipo é controlada por três genes recessivos, independentemente herdados e controlados por um gene regulador dominante (sdI). Em estudo anterior, Lahogue et al. (1998) identificaram um marcador RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) ligado ao gene sdI e utilizaram-no para desenvolver um SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) co-dominante denominado SCC8, que pode distinguir, em uma progênie, indivíduos com semente como também selecionar indivíduos apirênicos. Neste trabalho, são apresentados resultados da avaliação do potencial de aplicação do marcador molecular SCAR SCC8 para seleção assistida do caráter da apirenia no melhoramento de uvas de mesa sem sementes. A utilização deste marcador na seleção assistida para apirenia em uvas de mesa mostrou-se viável, e as conseqüências da sua utilização no programa de melhoramento da Embrapa Uva e Vinho são discutidas. The inheritance of seedlessness in grapevine is based on a complex genetic system, where the expression of three independently inherited recessive genes is controlled by a dominant regulator gene (sdI). In a previous study, Lahogue et al. (1998) identified a random amplified polymorphic DNA marker, tightly linked to the sdI gene and developed a codominant SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) marker named SCC8, that allows the distinction of seeded and seedless plants in a segregating progeny. The aim of the present work was to evaluate the usefullness of the SCAR marker SCC8 for assisted selection of the seedlessness character in grape breeding. According to our results, the use of the SCC8 marker is economically viable and the consequences of its use in the grapevine breeding program at Embrapa Uva e Vinho are discussed.

Made available in DSpace on 2015-02-02T12:39:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-01Bitstream added on 2015-02-02T13:07:50Z : No. of bitstreams: 1 S0100-204X2014000500364.pdf: 590812 bytes, checksum: 012b6a959a6ff3c8f354677cb78be96a (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O objetivo deste trabalho foi estimar as frequências de polimorfismos alélicos em genes de bovinos Nelore e associá-los às características de carcaça e qualidade da carne. Seiscentos machos foram genotipados quanto aos seguintes polimorfismos: DGAT1 (VNTR com 18 nucleotídeos na região promotora); ANK1, novo polimorfismo, identificado no presente estudo e mapeado na região gênica regulatória NW_001494427.3; TCAP (AY428575.1:g.346G>A); e MYOG (NW_001501985:g.511G>C). No estudo de associação, foram utilizados os dados fenotípicos de massa da carcaça quente, área de olho do lombo, espessura de gordura subcutânea, percentagem de gordura intramuscular, força de cisalhamento, índice de fragmentação miofibrilar, coloração da carne (L*, a*, b*) e perdas por cocção. O alelo B do gene ANK1 foi associado ao aumento da coloração vermelha (a*) da carne. No gene DGAT1, os alelos 5R, 6R e 7R foram associados ao aumento de gordura intramuscular, à redução das perdas por cocção e ao aumento da área de olho de lombo, respectivamente. O SNP (polimorfismo de nucleotídeo único) do gene TCAP não apresentou polimorfismo, e os alelos do gene MYOG não foram associados a nenhuma das características avaliadas. Os resultados indicam que os genes ANK1 e DGAT1 podem ser utilizados na seleção de animais Nelore quanto à qualidade de carne e carcaça. The objective of this work was to estimate the allele polymorphism frequencies of genes in Nellore cattle and associate them with meat quality and carcass traits. Six hundred males were genotyped for the following polymorphisms: DGAT1 (VNTR with 18 nucleotides at the promoter region); ANK1, a new polymorphism, identified and mapped here at the gene regulatory region NW_001494427.3; TCAP (AY428575.1:g.346G>A); and MYOG (NW_001501985:g.511G>C). In the association study, phenotype data of hot carcass weight, ribeye area, backfat thickness, percentage of intramuscular fat, shear force, myofibrillar fragmentation index, meat color (L*, a*, b*), and cooking losses were used. Allele B from the ANK1 gene was associated with greater redness (a*). Alleles 5R, 6R, and 7R from the DGAT1 VNTR gene were associated with increased intramuscular fat, reduced cooking losses and increased ribeye area, respectively. The single nucleotide polymorphism (SNP) of the TCAP gene was not polymorphic, and MYOG alleles were not associated with any of the evaluated characteristics. These results indicate that ANK1 and DGAT1 genes can be used in the selection of Nellore cattle for carcass and meat quality. Universidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Unesp Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Melhoramento e Nutrição Animal Universidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Unesp Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Melhoramento e Nutrição Animal

The objective of this work was to estimate the allele polymorphism frequencies of genes in Nellore cattle and associate them with meat quality and carcass traits. Six hundred males were genotyped for the following polymorphisms: DGAT1 (VNTR with 18 nucleotides at the promoter region); ANK1, a new polymorphism, identified and mapped here at the gene regulatory region NW_001494427.3; TCAP (AY428575.1:g.346G>A); and MYOG (NW_001501985:g.511G>C). In the association study, phenotype data of hot carcass weight, ribeye area, backfat thickness, percentage of intramuscular fat, shear force, myofibrillar fragmentation index, meat color (L*, a*, b*), and cooking losses were used. Allele B from the ANK1 gene was associated with greater redness (a*). Alleles 5R, 6R, and 7R from the DGAT1 VNTR gene were associated with increased intramuscular fat, reduced cooking losses and increased ribeye area, respectively. The single nucleotide polymorphism (SNP) of the TCAP gene was not polymorphic, and MYOG alleles were not associated with any of the evaluated characteristics. These results indicate that ANK1 and DGAT1 genes can be used in the selection of Nellore cattle for carcass and meat quality. O objetivo deste trabalho foi estimar as frequências de polimorfismos alélicos em genes de bovinos Nelore e associá-los às características de carcaça e qualidade da carne. Seiscentos machos foram genotipados quanto aos seguintes polimorfismos: DGAT1 (VNTR com 18 nucleotídeos na região promotora); ANK1, novo polimorfismo, identificado no presente estudo e mapeado na região gênica regulatória NW_001494427.3; TCAP (AY428575.1:g.346G>A); e MYOG (NW_001501985:g.511G>C). No estudo de associação, foram utilizados os dados fenotípicos de massa da carcaça quente, área de olho do lombo, espessura de gordura subcutânea, percentagem de gordura intramuscular, força de cisalhamento, índice de fragmentação miofibrilar, coloração da carne (L*, a*, b*) e perdas por cocção. O alelo B do gene ANK1 foi associado ao aumento da coloração vermelha (a*) da carne. No gene DGAT1, os alelos 5R, 6R e 7R foram associados ao aumento de gordura intramuscular, à redução das perdas por cocção e ao aumento da área de olho de lombo, respectivamente. O SNP (polimorfismo de nucleotídeo único) do gene TCAP não apresentou polimorfismo, e os alelos do gene MYOG não foram associados a nenhuma das características avaliadas. Os resultados indicam que os genes ANK1 e DGAT1 podem ser utilizados na seleção de animais Nelore quanto à qualidade de carne e carcaça.

As ferrugens são as moléstias mais danosas para os cereais, sendo capazes de provocar grandes perdas no rendimento de grãos. O melhoramento de cereais para resistência às ferrugens tem feito uso de um ou poucos genes de grande efeito. Contudo, o curto intervalo de tempo que o patógeno leva para superar este tipo de resistência tem suscitado a questão do uso de estratégias alternativas para aumentar a sua durabilidade. O objetivo desta revisão é discutir aspectos relacionados ao processo de piramidização de genes para prolongar a durabilidade da resistência às ferrugens. A piramidização e a resistência durável são discutidas em relação à efetividade dos genes utilizados e as limitações práticas para o uso desta estratégia. A atual disponibilidade de marcadores de DNA é apontada como uma ferramenta promissora para tornar viável a combinação de vários genes de resistência e mum genótipo. Exemplos de resistência durável são apresentados e sua relação com a piramidização de genes de resistência é discutida. The rusts are the most damaging diseases of cereal crops, being capable of causing big yield tosses. Cereal breeding for rust resistance has made use of resistance conditioned by one or few major genes. However, the short time which pathogens break this type of host resistance has raised the question ofusing alternative strategies to increase resistance durability. The objective of this review is to discuss aspects of the process of pyramiding genes as a way to increase rust resistance durability. The pyramiding process and durable resistance are discussed in relation to the effectivity of the genes used and the practical limitations of this strategy. The use of DNA markers is pointed as a promising tool for combining several resistance genes in one genotype. Examples of durable resistance are presented and their relation with pyramiding is discussed.

O objetivo deste trabalho foi selecionar famílias de milho derivadas do retrocruzamento entre o composto "NAP Corn Stunt" (genitor doador) e linhagens-elite (genitores recorrentes), quanto à produtividade de grãos e à resistência a enfezamentos, e avaliar a eficiência do emprego de marcadores moleculares para avaliação fenotípica na seleção de genótipos com alta produtividade de grãos. Foram avaliados 100 genótipos, em cinco condições ambientais, na safra agrícola 2009/2010. Foram selecionadas famílias RC1F2, que aliam a alta produtividade dos genitores recorrentes à resistência aos enfezamentos, presente no genitor doador. As famílias selecionadas quanto ao desempenho agronômico e à resistência aos enfezamentos foram: L228-3-324-S, L228-3-237-R, L228-3-109-R, que foram indicadas para cruzamentos com linhagens do grupo heterótico duro; e L3-422-R e L3-586-R, que foram indicadas para cruzamentos com linhagens do grupo heterótico dentado. Na seleção de genótipos de alta produtividade de grãos, a seleção assistida por marcadores moleculares não é eficiente para a recuperação do genótipo do pai recorrente, em comparação à avaliação fenotípica. The objective of this work was to select maize families derived from backcrossing between the composite NAP Corn Stunt (donor parent) and inbreed lines (recurrent parents), as to grain yield and resistance to corn stunt, and to evaluate the efficiency of the use of molecular markers in the phenotypic evaluation for the selection of genotypes with high grain yield. One hundred genotypes were evaluated in five environmental conditions in the 2009/2010 crop season. We selected RC1F2 families, which combine high grain yield present in the recurrent parents to resistance to corn stunt present in the donor parent. The selected maize families for agronomic performance and resistance to corn stunt were: L228-3-324-S, L228-3-237-R, L228-3-109-R, which were indicated for crosses with lines of the flint heterotic group; and L3-422-R and L3-586-R, which were indicated for crosses with lines of the dent heterotic group. For selecting genotypes with high grain yield, the molecular marker-assisted selection is not efficient for the recovery of the recurrent parent genotype, when compared to the phenotypic evaluation.

The rice cultivar Cica-8 exhibit differential reaction to several pathotypes of Magnaporthe oryzae. The objective of the present investigation was to determine the number of alleles involved in the expression of resistance to leaf blast and identify microsatellite markers linked to these alleles. A cross between cultivar Metica-1 and Cica-8 susceptible and resistant, respectively, to pathotype IB-1 (Py1049) was made to obtain F1, F2, BC1:1 and BC1:2 progenies. Greenhouse tests for leaf blast reaction showed that resistance is controlled by a monogenic dominant gene. For testing microsatellite markers, DNA of both resistant and susceptible parents and F1 and F2 populations was extracted. As expected for single dominant gene the F2 populations segregated at a ratio of 3:1. Of the 11 microsatellite markers tested, one marker RM 7102 was found to be closely linked to the resistant allele at a distance of 2.7 cM, in the cultivar Cica-8 to pathotype IB-1. A cultivar de arroz Cica-8 apresenta reação diferencial a vários patótipos de Magnaporthe oryzae. Este trabalho teve como objetivo determinar o número de alelos envolvidos na expressão de resistência do arroz à brusone e identificar marcadores microssatélites ligados a estes alelos. Foi realizado um cruzamento entre as cultivares Metica-1 e Cica-8, resistente e suscetível, respectivamente, ao patotipo IB-1 (Py1049) para obtenção de progênies F1, F2, RC1:1 e RC1:2. Testes fenotípicos realizados em casa de vegetação para reação da brusone nas folhas mostrou que a resistência é controlada por um gene dominante. Para testar marcadores microssatélites selecionados, foram feitas extrações de DNA de cada genitor e das populações F1 e F2. Como esperado para um gene dominante, a população F2 segregou em razão 3:1. Entre 11 marcadores microssatélites testados, um marcador, RM7102, encontrou-se ligado ao alelo de resistência à distancia de 2.7 cM na cultivar Cica-8 para o patótipo IB-1.

O objetivo deste trabalho foi determinar a presença do alelo Pvr4, que confere resistência contra o PepYMV (Pepper yellow mosaic virus), em genótipos de pimentão comunmente encontrados no mercado brasileiro, com uso de um marcador molecular codominante tipo CAPS. A resistência ao PepYMV, nos genótipos CM-334-INRA, Myr-29 e em genótipos derivados do híbrido comercial Mônica-R, foi detectada como associada à banda de 444 pb, ligada ao alelo de resistência Pvr4. As plantas resistentes homozigotas (pvr4/pvr4) mostraram uma banda de 444 pb, as suscetíveis (Pvr4+/Pvr4+) uma banda de 458 pb e as resistentes heterozigotas (Pvr4+/Pvr4) mostraram as duas bandas. No entanto, no acesso resistente CM-334-UFV, nos híbridos Magali-R e Martha-R, assim como em populações derivadas desse acesso e desses híbridos, a resistência ao PepYMV não esteve associada ao marcador CAPS. O acesso CM-334-UFV ('Criollo de Morelos-334', de Viçosa, MG) distinguiu-se do CM-334-INRA ('Criollo de Morelos-334', da França); embora ambos os acessos tenham sido resistentes ao PepYMV, apenas em CM-334-INRA foi encontrada a associação da resistência com a banda de 444 pb. The objective of this work was to determine the presence of the Pvr4 allele, which controls the resistance to the PepYMV (Pepper yellow mosaic virus), in sweet pepper genotypes commonly available in the Brazilian market, using a CAPS codominant molecular marker. The resistance to PepYMV, in the genotypes CM-334-INRA, Myr-29, and in genotypes derived from the hybrid Mônica-R, was found to be associated with the 444 bp band linked to the resistance allele Pvr4. Homozygous resistant plants (pvr4/pvr4) showed a single band of 444 bp, the susceptible ones (Pvr4+/Pvr4+) showed a band of 458 bp, and the heterozygous resistant plants (Pvr4+/Pvr4) showed both bands. However, in the resistant accession CM-334-UFV, and in the hybrids Magali-R and Martha-R, as well as in populations derived from this accession and these hybrids, the resistance to PepYMV was not associated to the CAPS marker. The accession CM-334-UFV ('Criollo de Morelos-334' from Viçosa, MG, Brazil) was distinct from CM-334-INRA ('Criollo de Morelos-334', from France); although both accessions were resistant to PepYMV, the association of resistance with the 444 bp band was found only in CM-334-INRA.

O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial genético de famílias endogâmicas de feijão carioca provenientes de cinco populações oriundas de cruzamentos envolvendo linhagens elites e uma fonte de resistência a doenças (Rudá-R), bem como avaliar a eficiência de marcadores moleculares SCAR na seleção de plantas resistentes a antracnose e mancha angular, por ocasião da abertura dos bulks. Foram avaliadas a arquitetura da planta, a produtividade e o aspecto de grãos. Observou-se efeito significativo entre famílias dentro de populações, indicando ampla variabilidade genética para os caracteres avaliados. Foram selecionadas 26 famílias superiores e que reuniam maior número de marcas, identificadas por marcadores SCAR na geração F4. Dessas, 18 famílias foram resistentes às raças 65 e 453 de Colletotrichum lindemuthianum e cinco resistentes à raça 63.23 de Pseudocercospora griseola. Assim, a seleção assistida por marcadores SCAR, na geração F4, mostrou ser uma ferramenta importante no melhoramento do feijoeiro. The objective of the present study was to assess the genetic potential of inbred carioca common bean families from five populations derived from crossings involving elite lines and a disease-resistant line (Rudá-R), and to assess the efficiency of SCAR molecular markers in selecting plants resistant to anthracnose and angular leaf spot, at the time of bulk formation. Plant architecture, yield and grain type were assessed. Significant effect among families within population was observed, suggesting wide genetic variability for the characters assessed. Twenty-six superior families were selected. The families contained the greatest number of markers, identified by SCAR molecular markers in the F4 generation. Eighteen of these families were resistant to the races 65 and 453 of Colletotrichum lindemuthianum and five were resistant to the race 63.23 of Pseudocercospora griseola. Thus selection assisted by SCAR markers, in the F4 generation, was an important tool in common bean breeding.

The objective of the present study was to assess the genetic potential of inbred carioca common bean families from five populations derived from crossings involving elite lines and a disease-resistant line (Rudá-R), and to assess the efficiency of SCAR molecular markers in selecting plants resistant to anthracnose and angular leaf spot, at the time of bulk formation. Plant architecture, yield and grain type were assessed. Significant effect among families within population was observed, suggesting wide genetic variability for the characters assessed. Twenty-six superior families were selected. The families contained the greatest number of markers, identified by SCAR molecular markers in the F4 generation. Eighteen of these families were resistant to the races 65 and 453 of Colletotrichum lindemuthianum and five were resistant to the race 63.23 of Pseudocercospora griseola. Thus selection assisted by SCAR markers, in the F4 generation, was an important tool in common bean breeding. O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial genético de famílias endogâmicas de feijão carioca provenientes de cinco populações oriundas de cruzamentos envolvendo linhagens elites e uma fonte de resistência a doenças (Rudá-R), bem como avaliar a eficiência de marcadores moleculares SCAR na seleção de plantas resistentes a antracnose e mancha angular, por ocasião da abertura dos bulks. Foram avaliadas a arquitetura da planta, a produtividade e o aspecto de grãos. Observou-se efeito significativo entre famílias dentro de populações, indicando ampla variabilidade genética para os caracteres avaliados. Foram selecionadas 26 famílias superiores e que reuniam maior número de marcas, identificadas por marcadores SCAR na geração F4. Dessas, 18 famílias foram resistentes às raças 65 e 453 de Colletotrichum lindemuthianum e cinco resistentes à raça 63.23 de Pseudocercospora griseola. Assim, a seleção assistida por marcadores SCAR, na geração F4, mostrou ser uma ferramenta importante no melhoramento do feijoeiro.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:38:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_marco_andre_paldes_da_costa.pdf: 3629797 bytes, checksum: cb9f7519cccc3939652d2f7422468afc (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 Cattle (Bos taurus) represent an important phylogenetic resource for understanding of evolutionary aspects and complex traits. On its genome, microsatellites repeats constituted the basis for genotyping in different studies as the genetic mapping. So, this study has by aim to describe the distribution of these sequences along of the taurine bovine genome, ascribing to them structural and functional annotation, besides supply a resource for that such information may assist future investigations on these regions. With a genomic coverage estimated at 0.8%, around 1.3 million loci were identified, of which 90.5% classified as perfect. Monomers occurred in greater number and frequency, followed by tetramers, dimers, trimers, pentamers and hexamers. However dimers and pentamers contributed in density more than tetramers. Regardless of the type of repetition, always the largest proportion of repetitive stretches distributed on IG, Introns and GPG regions. Nevertheless, density and frequency on PR and 5'UTR overcame IG. Through of these descriptors similarities could be observed between IG, Introns and 3'UTR, as too for PR and 5'UTR. Annotation for biological process, molecular function and cellular component were super-represented in genes harboring repetitive sequences. Using mapping references, as gene annotation, STS, SNPs and other repetitive elements already described, the Pampeano Animal Genetic Resources online platform provides an important resource for that the information gathered can to assist the planning of new approaches, in especial to obtaining molecular markers destinated to selection of traits of interest to the genetic improvement of the species. Bovinos (Bos taurus) representam um importante recurso filogenético para compreensão de aspectos evolutivos e características complexas. Sobre seu genoma, repetições microssatélites constituíram a base para genotipagem em diferentes estudos, como o mapeamento genético. Assim, esse trabalho teve por objetivo descrever a distribuição destas sequências ao longo do genoma bovino taurino, atribuindo a elas anotação estrutural e funcional, além de disponibilizar um recurso para que tal informação possa auxiliar investigações futuras sobre tais regiões. Com uma cobertura genômica estimada em 0,8%, cerca de 1.3 milhões de loci foram identificados, dos quais 90,5% classificados como perfeitos. Monômeros ocorreram em maior número e frequência, seguidos por tetrâmeros, dímeros, trímeros, pentâmeros e hexâmeros. Contudo dímeros e pentâmeros contribuíram em densidade mais que tetrâmeros. Independente do tipo de repetição, sempre a maior proporção dos trechos repetitivos distribuíram-se sobre regiões IG, Introns e GPG. Apesar disso, densidade e frequência em 5 UTR e PR superaram IG. Através desses descritores semelhanças puderam ser evidenciadas entre IG, Introns e 3 UTR, como também para PR e 5 UTR. Anotações para processo biológico, função molecular e componente celular estavam super-representadas em genes abrigando sequências repetitivas. Utilizando referências de mapeamento, como anotação gênica, STS, SNPs e outros elementos repetitivos já descritos, a plataforma on-line Pampeano Animal Genetic Resources fornece um importante recurso para que a informação reunida possa auxiliar o planejamento de novas abordagens, em especial para obtenção de marcadores moleculares destinados a seleção de características de interesse ao melhoramento genético da espécie.

Diseases, especially those caused by plant parasites nematode, are among the factors that limit the achievement of high yields in soybeans. The attack of nematodes, particularly the species Meloidogyne incognita and M. javanica, are widely spread and responsible for significant losses in soybean crops. The objective of this work was to study the inheritance of resistance to M. Incognita, and to identify microsatellite molecular markers promising for use in Marker Assisted Selection (MAS). Crosses were performed between cultivar BRS 133 (susceptible) and CD 201 (resistant). The phenotypic evaluation of F2:3 population was conducted in a greenhouse under controlled conditions. Plants were inoculated, and after thirty days were scored from 1 to 5 for each plant, depending on the number of galls formed on the roots. The results obtained were consistent with the hypothesis of three genes/QTL for resistance, being two dominant and one recessive. The parental varieties were evaluated with 384 markers, and 48 microsatellite loci were polymorphic. Extreme phenotypes for resistance and susceptibility ware analyzed with this markers. Twenty- three plants of each group (resistant and susceptible) were evaluated with each polymorphic marker, and the marker/QTL association was tested by regression analysis. The marker Satt358 was significantly associated with resistance to M. incognita when tested with the population of 129 F2:3 families. This marker explained 9.9% of resistance to this nematode in soybean. The results support the usefulness of the marker Satt358 on molecular marker-assisted selection for resistance to M. incognita. As doenças, destacando-se as causadas por nematóides fitoparasitas, estão entre os fatores que mais limitam a obtenção de alta produtividade para a cultura da soja. O ataque de fitonematóides, particularmente as espécies Meloidogyne incognita e M. javanica, são de ampla ocorrência e responsáveis por perdas significativas em lavouras de soja. Este trabalho foi realizado com o objetivo de estudar a herança da resistência a M. incognita e identificar marcadores moleculares do tipo microssatélite promissores para o uso em seleção assistida por marcadores (SAM). Foram realizados cruzamentos entre a cultivar BRS 133 (susceptível) com a cultivar CD 201 (resistente). A avaliação fenotípica das famílias F2:3 foi realizada em casa de vegetação. As plantas foram inoculadas e, após trinta dias, foi atribuída nota de 1 a 5 para cada planta, em função do número de galhas formadas nas raízes. Os resultados obtidos foram condizentes com a hipótese de três genes/QTLs de resistência, sendo dois dominantes e um recessivo. As variedades parentais foram avaliadas com 384 primers de microssatélites, sendo identificados 48 locos polimórficos. Estes foram testados nos fenótipos extremos para análise dos marcadores na população. A associação marcador/QTL foi testada por análise de regressão. O marcador Satt358 apresentou associação significativa com a resistência à M. incognita quando testado na população de 129 famílias F2:3. Este marcador explicou 9,9% da resistência da soja a este nematóide. Os resultados obtidos reforçam a utilidade do marcador Satt358 na seleção assistida por marcadores moleculares para resistência à M. incognita. x, 28 f

A brusone (Magnaporthe oryzae) é considerada a doença mais importante dos arrozais. Devido à alta variabilidade da população do patógeno, cultivares de arroz rapidamente tem sua resistência à brusone sucumbida. A identificação e incorporação de diferentes genes de resistência em cultivares melhoradas e adaptadas, com o auxílio de técnicas moleculares, constitui-se em uma das estratégias na busca de resistência estável a serem adotadas. Tendo em vista o desafio acima colocado, este trabalho teve como objetivo determinar o número de alelos envolvidos na expressão de resistência do arroz a brusone, identificar marcadores microssatélites ligados a estes alelos e caracterizar a ação de duas enzimas relacionadas à patogênese. Os experimentos foram conduzidos sob condições controladas de casa de vegetação e laboratório. As gerações F1, F2, RC1:1 e RC1:2 foram semeadas em bandejas plásticas. Cada bandeja continha oito linhas, sendo dez plantas por linha. Cada patótipo de M. oryzae foi inoculado em trinta plantas do genitor resistente, trinta plantas do genitor suscetível, duzentas plantas da população F2, cem plantas da população RC1:1 e cem plantas da população RC1:2. Os isolados 1049, patótipo IB-1 e 435, patótipo IB-9, foram cultivados em meio de cultura aveia-dextrose-ágar para produção de solução de inóculo, à concentração de 3.105 conídios.mL-1. As plantas inoculadas foram mantidas sob alta condição de umidade e temperatura média de 28ºC, durante sete dias. As avaliações foram feitas identificando a proporção de plantas resistentes e suscetíveis. Para testar onze marcadores microssatélites selecionados, foram feitas extrações de DNA de cada genitor e das populações F1 e F2. As reações de PCR assim como os ciclos de amplificação foram montadas de acordo com a característica de cada microssatélite. As reações foram submetidas a gel poliacrilamida desnaturante (6%) para identificação de polimorfismo entre os genitores e as populações F1 e F2. A caracterização enzimática foi estudada através da extração de proteínas, antes e depois da inoculação, durante cinco dias consecutivos para a determinação da atividade enzimática de β-1,3-glucanase (PR1) e peroxidase. A segregação em ambas as populações F2 apresentou proporção de três plantas resistentes para uma planta suscetível. Foi identificado um marcador microssatélite, RM7102, ligado ao alelo de resistência da cultivar Cica-8 ao patótipo IB-1. Não foi possível detectar diferenças entre as populações F2 resistentes e F2 suscetível quanto atividade de peroxidase. A população F2 suscetível, para ambos os patótipos, apresentou alta atividade de β-1,3-glucanase, enquanto a atividade da mesma enzima nos genitores e população F2 resistente não mostrou aumento significativo. Blast (Magnaporthe oryzae) is considered the most important disease of rice fields. Due to the high variability of the pathogen's population, rice cultivars quickly have its race-specific resistance to blast broken. The identification for incorporating different resistance genes in improved and adapted cultivars, utilizing molecular tools, is one breeding strategy to find stable resistance in short period. The goal of this research was to identify the number of resistance genes and SRR molecular markers to the pathotypes IB-1 and IB-9 of M. oryzae, and characterize some enzymes related to the expression of resistance. The experiments were conducted under controlled conditions of green house and laboratories. After crossing cultivar Cica-8 and cultivar Metica-1, the populations F1, F2, BC1:1 and BC2:2 were sown in plastic trays containing five kg of soil fertilized. Each tray contained eight lines with ten plants per row. Each pathotype of M. oryzae inoculated thirty plants of resistant parents, thirty plants of susceptible parents, two hundred plants of F2 population, one hundred plants of BC1:1 population and one hundred plants of BC1:2 population. The isolates 1049 (IB-1) and 435 (IB-9) were cultivated on oat medium to produce the inoculum solution (3.105 conidia.mL-1). The inoculated plants were kept under high humidity condition at 28°C, during seven days. Evaluations were made identifying the number of resistant and susceptible plants. Eleven microsatellite markers were tested by PCR strategies, utilizing DNA of each parent (resistance and susceptible), F1 and F2 populations. PCR reactions were assembled according to the characteristic of each SSR prime. The fragments were separated by denature polyacrylamide (6%) gel to identify polymorphism. Linkage analysis of the RM7102 microssatelite marker was estimated using the MAP MAKER III software. The enzymatic characterization was studied through the extraction of proteins, before and after inoculation, during five consecutive days for the determination of the activity of β-1,3-glucanase (PR1) and peroxidase. Segregation in populations F2 resistant and susceptible presented ratio of 3 plants resistant to 1 plant susceptible. An SSR marker has been identified, RM7102, and linked to the resistance gene of cultivar Cica-8 to the pathotype IB-1. Peroxidase had little activity in all populations. The F2 populations, susceptible to both isolates, presented high β-1,3- glucanase activity. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

Submitted by Guilherme Lemeszenski (guilherme@nead.unesp.br) on 2013-08-22T18:47:04Z No. of bitstreams: 1 S0100-204X2008001200013.pdf: 404504 bytes, checksum: 3fccd8535dc90a715e78e2da9a2c1e93 (MD5) Made available in DSpace on 2013-08-22T18:47:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 S0100-204X2008001200013.pdf: 404504 bytes, checksum: 3fccd8535dc90a715e78e2da9a2c1e93 (MD5) Previous issue date: 2008-12-01 Made available in DSpace on 2013-09-30T17:58:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0100-204X2008001200013.pdf: 404504 bytes, checksum: 3fccd8535dc90a715e78e2da9a2c1e93 (MD5) S0100-204X2008001200013.pdf.txt: 32026 bytes, checksum: 567b2354fc41a59b838afe6e727b5959 (MD5) Previous issue date: 2008-12-01 Submitted by Vitor Silverio Rodrigues (vitorsrodrigues@reitoria.unesp.br) on 2014-05-20T13:16:53Z No. of bitstreams: 2 S0100-204X2008001200013.pdf: 404504 bytes, checksum: 3fccd8535dc90a715e78e2da9a2c1e93 (MD5) S0100-204X2008001200013.pdf.txt: 32026 bytes, checksum: 567b2354fc41a59b838afe6e727b5959 (MD5) Made available in DSpace on 2014-05-20T13:16:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0100-204X2008001200013.pdf: 404504 bytes, checksum: 3fccd8535dc90a715e78e2da9a2c1e93 (MD5) S0100-204X2008001200013.pdf.txt: 32026 bytes, checksum: 567b2354fc41a59b838afe6e727b5959 (MD5) Previous issue date: 2008-12-01 Os objetivos deste trabalho foram confirmar a herança da resistência da PI 459025 (Rpp4) à ferrugem-asiática-da-soja e identificar marcadores moleculares do tipo RAPD, ligados a este gene de resistência, em populações de soja. Pelo cruzamento dos genitores contrastantes PI 459025 x Coodetec 208 obteve-se uma população, cujas populações das gerações F2 e F2:3 foram artificialmente infectadas e avaliadas quanto à reação ao fungo Phakopsora pachyrhizi, pelo tipo de lesão (RB - resistente e TAN - suscetível). Com os resultados da avaliação fenotípica, dois bulks foram obtidos com DNA de plantas homozigóticas resistentes e suscetíveis, respectivamente, pela análise de bulks segregantes. de 600 iniciadores RAPD aleatórios, foram identificados três com fragmentos polimórficos entre os bulks e parentais contrastantes quanto à resistência. Pela análise do qui-quadrado, confirmaram-se: a herança monogênica, com dominância completa quanto à resistência ao patógeno, e a segregação 3:1 para a presença de banda dos três marcadores. Os três marcadores são ligados respectivamente a 5,1, 6,3 e 14,7 cM de distância do loco de resistência, em fase de repulsão no grupo de ligação G, o que foi confirmado pela utilização do marcador microssatélite Satt288. Estes marcadores são promissores na seleção assistida para resistência à ferrugem-asiática-da-soja. The objectives of this work were to confirm the PI 459025 inheritance of resistance (Rpp4) to Asian soybean rust pathogen and to detect RAPD markers linked to this resistance gene in soybean populations. Through the cross of the distint parental lines PI 459025 x Coodetec 208, a population was obtained, whose F2 and F2:3 generations had their populations artificially infected and evaluated for the reaction to Phakopsora pachyrhizi, by lesion type classification (RB - resistant and TAN - susceptible). Using the phenotypic results, the bulked segregant analysis was performed and two DNA bulks were obtained from homozygous resistant and homozygous susceptible plants, respectively. Out of the 600 random RAPD primers analyzed, three were identified as polymorphic fragments related to resistance, between contrasting bulks and parents. Through chi-square test, confirmations were obtained for the monogenic inheritance, with complete dominance segregation for resistance to the pathogen, and the 3:1 segregation of band presence for the markers. The three markers are linked to the resistance locus, in repulsion phase, at 5.1, 6.3 and 14.7 cM from it, in the linkage group G, which was confirmed by using the microsatellite marker Satt288. These makers are promising in assisted selection for Asian soybean rust resistance. Universidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de Produção Vegetal Faculdade de Tecnologia de Jaboticabal Universidade de São Paulo Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Departamento de Genética Tropical Melhoramento e Genética Ltda Universidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de Produção Vegetal

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-08-04Bitstream added on 2014-06-13T20:03:25Z : No. of bitstreams: 1 morceli_tgs_dr_jabo.pdf: 699244 bytes, checksum: f1671e3db3a2b611f86d79aaccfe36e0 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A ferrugem asiática da soja, causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi (Sidow & P. Sidow) foi relatada no Brasil ao final da safra 2001 e já nas safras seguintes, ocasionou severas perdas de produtividade. Cinco genes de resistência à ferrugem asiática da soja (Rpp1 a Rpp5) estão descritos na literatura. O objetivo geral deste trabalho foi identificar marcadores moleculares microssatélites ligados ao gene de resistência a P. pachyrhizi presente na linhagem de soja PI 200526. Uma população de plantas F2 derivada do cruzamento entre esta linhagem e a cultivar suscetível Coodetec 208, foi artificialmente inoculada e avaliada quanto à sua reação de resistência à ferrugem. Marcadores microssatélites foram testados nos genitores e em dois bulks contrastantes para possibilitar a identificação de possíveis marcadores ligados. Os três marcadores polimórficos que foram caracterizados como potencialmente associados com a resistência à ferrugem asiática foram, posteriormente, avaliados em toda a população. A resistência comportou-se como governada por um gene com dominância completa. O gene de resistência da PI 200526 foi mapeado no grupo de ligação N da soja, estando próximo ao marcador Sat_166. Existe grande possibilidade de que o gene mapeado neste estudo corresponda ao novo loco de resistência à ferrugem asiática da soja, denominado de Rpp5, recentemente descrito. The Asian soybean rust caused by the Phakopsora pachyrhizi (Sidow & P. Sidow) fungus was related in Brazil at the end of 2001 crop year, and already in the following seasons, caused severe losses in productivity. Five distinct resistance genes to Asian rust (Rpp1 to Rpp5) are described. The main objective of this work was to identify microsatellite markers linked to a resistance gene to P. pachyrhizi present in the soybean line PI 200526. One population of F2 plants originated from the cross between this resistant line and the suscetible cultivar Coodetec 208 was artificially inoculated and evaluated for the Asian rust resistance. Microsatellite markers were tested on parents and in the two contrasting bulks to enable the identification of linked markers. The three polymorphic markers that were identified potentially associated with resistance to Asian rust were then evaluated throughout the progeny. The resistance showed to be governed by a gene with complete dominance. The resistance gene of PI 200526 was mapped on the soybean linkage group N, being close to Sat_166 marker. Possibly, the gene mapped on this linkage group is part of the new locus of resistance to Asian soybean rust, called Rpp5, recently described.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Due to difficulties in the performance of the phenotypic selection for the resistance to the soybean cyst nematode (NCS), the need to implant the marker-assisted selection to this pathogen, and the little knowledge about the genetic diversity of the resistant cultivars developed by the Brazilian breeding programs, the objectives of this work were (1) to use marker-assisted selection strategies to evaluate the efficiency of the selection of the QTL (Quantitative trait loci) near microsatellites of the linkage groups (GL) G and A2 in populations come from the crossing between isolines from the cultivars CD201 and Vmax and (2) to evaluate the genetic diversity in NCS resistant soybean cultivars developed by six Brazilian breeding programs and in sources of resistance to NCS, by means of QTL near microsatellites, which give resistance to the pathogen. As to the first objective, seven F5 populations were selected based on the microsatellite marker polymorphism of GL G and A2. These populations were phenotypically evaluated as to the resistance to the race 3 of the NCS (HG type 5.7). Families F6:7 of the populations selected by the GL A2 were susceptible and those selected by the GL G and A2 achieved four resistant families and four moderately resistant families, thus demonstrating that the QTL of greater effect of the GL A2 is not present in the source of resistance of the present study. The microsatellites of the GL G presented high selection efficiency and can be used with success in the assisted selection for the resistance to race 3 and in populations come from Vmax. As to the second objective, 36 genotypes were used, including Brazilian resistant cultivars and original genotypes (sources of resistance to NCS and the cultivar Lee, used as a standard of susceptibility). 24 QTLs near microsatellites were used of NCS resistance present in the linkage groups G, A2, D2, E, J and M. The genetic diversity of each microsatellite was evaluated by the polymorphism index content (PIC) and by the average dissimilarity of a genotype in relation to the other genotypes evaluated. Genotype grouping analyses were carried out by the Tocher method and graphic dispersion. A total of 77 alleles, with an average of 3.2 alleles per locus, was achieved for the 36 cultivars. The PIC varied from 0.11 to 0.71, with an average of 0.36. A greater number of alleles were found in the original sources, in comparison to the commercial varieties. The GL D2 was very important in the discrimination of genotypes which are resistant and moderately resistant to the race 14. The genetic basis as to the NCS resistance in the commercial variety developed by the Brazilian breeding programs is very narrow, and it is necessary to increase the diversity of the genes used, by introducing different accesses. Diante da dificuldade na realização da seleção fenotípica para a resistência ao nematóide de cisto da soja (NCS), da necessidade da implantação da seleção assistida por marcadores a este patógeno e do pouco conhecimento da diversidade genética das cultivares resistentes desenvolvidas pelos programas de melhoramento do Brasil, este trabalho teve como objetivos: (1) utilizar estratégias de seleção assistida por marcadores para avaliar a eficiência de seleção de microssatélites próximos a QTLs (Quantitative trait loci) dos grupos de ligação (GL) G e A2 em populações originadas do cruzamento entre isolinhas derivadas das cultivares CD201 e Vmax; e (2) avaliar a diversidade genética entre cultivares de soja resistentes ao NCS desenvolvidas por seis programas de melhoramento do Brasil e entre fontes de resistência ao NCS, por meio de marcadores microssatélites próximos a QTLs que conferem resistência ao patógeno. Em relação ao primeiro objetivo, foram selecionadas sete populações F5 com base no polimorfismo de marcadores microssatélites dos GL G e A2, as quais foram avaliadas fenotipicamente quanto à resistência à raça 3 do NCS (HG tipo 5.7). Famílias F6:7 das populações selecionadas pelo GL A2 foram suscetíveis, e as selecionadas pelos GL G e A2 tiveram quatro famílias resistentes e quatro moderadamente resistentes, evidenciando que o QTL de efeito maior do GL A2 não está presente na fonte de resistência do presente estudo. Os microssatélites do GL G apresentaram alta eficiência de seleção e podem ser utilizados com sucesso na seleção assistida para a resistência à raça 3 e em populações derivadas de Vmax. Em relação ao segundo objetivo, foram utilizados 36 genótipos, incluindo cultivares resistentes do Brasil e genótipos originais (fontes de resistência ao NCS e a cultivar Lee, utilizada como padrão de suscetibilidade). Foram utilizados 24 microssatélites próximos aos QTLs de resistência ao NCS presentes nos grupos de ligação (GL) G, A2, D2, E, J e M. A diversidade genética de cada loco microssatélite foi avaliada pelo conteúdo da informação de polimorfismo (PIC) e pela dissimilaridade média de um genótipo em relação aos demais genótipos avaliados. Foram realizadas análises de agrupamento dos genótipos pelo método de Tocher e dispersão gráfica. Um total de 77 alelos, com uma média de 3,2 alelos por loco, foi obtido para as 36 cultivares. O PIC variou de 0,11 a 0,71, com uma média de 0,36. Entre as fontes originais encontrou-se um número de alelos maior que entre as variedades comerciais. O GL D2 foi muito importante na discriminação entre genótipos resistentes e moderadamente resistentes à raça 14. A base genética quanto à resistência ao NCS nas variedades comerciais desenvolvidas pelos programas de melhoramento no Brasil é muito estreita, sendo necessário aumentar a diversidade de genes utilizados, por meio da introdução de diferentes acessos.

O Brasil é o maior produtor de cana-de-açúcar que é uma das principais biomassas. O etanol, obtido da fermentação do caldo de cana-de-açúcar, é um combustível potencialmente global, por amenizar dois problemas mundiais, a escassez do petróleo e o efeito estufa. O melhoramento da cana-de-açúcar requer muitas avaliações (diferentes anos e locais), assim sendo o uso de marcadores moleculares pode auxiliar esse processo. A técnica de AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphisms), de caráter multiplex, é ótima para geração de um grande número de marcadores a partir de poucas combinações de iniciadores. Este trabalho teve por objetivo detectar associações fenótipo-marcador em progênie (234/96) de híbridos de clones elites do melhoramento nacional de cana-deaçúcar, a partir de marcadores AFLP e os caracteres Fibra%Cana, PCC (POL%Cana) e TCH (tonelagem de cana por hectare), oriundos de oito ensaios, que avaliaram os dois ciclos da cultura (cana-planta e cana-soca) em duas localidades (Piracicaba e Jaú, ambas em SP). Foram detectados marcadores associados a prováveis QTLs (locos controladores de caracteres quantitativos), tanto de efeitos positivos quanto negativos, e para os três caracteres, individualmente. Alguns marcadores apresentaram também associação conjunta significativa (p < 0.05) para mais de um caráter. A seqüência de DNA de um marcador AFLP possibilitou o desenho de iniciadores específicos que amplificaram via PCR, com DNAs da progênie 234/96, três marcadores de efeitos negativos associados com Fibra%Cana, sendo um deles também associado com TCH e de efeito positivo. Esses marcadores foram considerados promissores para uso em Seleção Assistida, auxiliando os programas de melhoramento

RESUMO - A hipótese mais bem aceita atualmente para explicar a genética complexa da estenoespermocarpia, observada na videira, indica que a expressão deste fenótipo é controlada por três genes recessivos, independentemente herdados e controlados por um gene regulador dominante (sdI). Em estudo anterior, Lahogue et al. (1998) identificaram um marcador RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) ligado ao gene sdI e utilizaram-no para desenvolver um SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) co-dominante denominado SCC8, que pode distinguir, em uma progênie, indivíduos com semente como também selecionar indivíduos apirênicos. Neste trabalho, são apresentados resultados da avaliação do potencial de aplicação do marcador molecular SCAR SCC8 para seleção assistida do caráter da apirenia no melhoramento de uvas de mesa sem sementes. A utilização deste marcador na seleção assistida para apirenia em uvas de mesa mostrou-se viável, e as conseqüências da sua utilização no programa de melhoramento da Embrapa Uva e Vinho são discutidas. Termos para indexação: Vitis, marcador molecular, seleção assistida, apirenia. PRACTICAL USE OF MOLECULAR MARKERS FOR SEEDLESSNESS ASSISTED SELECTION IN GRAPEVINE BREEDING ABSTRACT - The inheritance of seedlessness in grapevine is based on a complex genetic system, where the expression of three independently inherited recessive genes is controlled by a dominant regulator gene (sdI). In a previous study, Lahogue et al. (1998) identified a random amplified polymorphic DNA marker, tightly linked to the sdI gene and developed a codominant SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) marker named SCC8, that allows the distinction of seeded and seedless plants in a segregating progeny. The aim of the present work was to evaluate the usefullness of the SCAR marker SCC8 for assisted selection of the seedlessness character in grape breeding. According to our results, the use of the SCC8 marker is economically viable and the consequences of its use in the grapevine breeding program at Embrapa Uva e Vinho are discussed. Index terms: Vitis, molecular marker, assisted selection, seedlessness Made available in DSpace on 2019-04-14T00:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 29703.pdf: 627443 bytes, checksum: 05e66933c08e5d9a8630d33aac058da5 (MD5) Previous issue date: 2006