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A espondiloartrite axial (axSpA) é uma doença reumática inflamatória, caracterizada principalmente pelo envolvimento da coluna e articulações sacroilíacas, e geralmente apresenta-se como dor crónica nas costas e rigidez. À medida que a doença progride, a mobilidade da coluna vertebral e a função física são prejudicadas podendo afetar as atividades da vida diária. A genética e os fatores ambientais (microbiota e microtrauma) são as causas conhecidas da suscetibilidade e progressão da doença. Esta tese teve como objetivo melhorar o nosso conhecimento atual da fisiopatologia da axSpA, caracterizando as propriedades musculares axiais e periféricas e identificando biomarcadores genéticos e proteicos que possam explicar tais propriedades. Realizamos um estudo transversal com 54 participantes: 27 pacientes com axSpA e 27 controles saudáveis (HC), pareados por idade, sexo e nível de atividade física. Dados epidemiológicos, clínicos e de caracterização muscular (propriedades físicas musculares, força, massa e desempenho) foram registados e comparados entre pacientes com axSpA e HC. Foi ainda colhido sangue periférico para abordagens ómicas. A transcriptómica e a proteómica foram realizadas por sequenciação de RNA e tecnologias de espectrometria de massa, respectivamente. Os nossos resultados indicam que pacientes com axSpA (idade média de 36,5 (DP 7,5) anos, 67% do sexo masculino e duração média da doença de 6,5 (3,2) anos) não apresentaram diferença significativa na rigidez muscular segmentar em comparação com os HC, apesar de apresentarem uma discreta menor rigidez lombar. Pacientes com axSpA, comparados com os HC, apresentaram menor força total, bem como menor força nos membros superiores e inferiores, independentemente das propriedades físicas dos músculos. Os pacientes também apresentaram velocidades de marcha significativamente menores do que o HC. As características da marcha podem representar um potencial biomarcador em pacientes com axSpA. A análise de enriquecimento de genes expressos diferencialmente permitiu revelar vias metabólicas significativas (como sinalização de IL6 e vias do sistema imunológico) com papel patológico para esse grupo de pacientes. Salienta-se ainda que níveis séricos aumentados de várias citocinas pró-inflamatórias em pacientes com axSpA foram observados em correlação adequada com os parâmetros de atividade da doença. Além disso, foram identificados genes expressos diferencialmente associados ao músculo (como NACA, FRG1 e ARPC5L) desempenham papeis no desenvolvimento de miotubos e montagem de actina, afetando eventualmente a força muscular em pacientes com axSpA. Finalmente, a integração dos resultados da transcriptómica e da proteómica mostra que a análise dos genes e proteínas diferencialmente expressos permite obter uma clara discriminação entre pacientes com axSpA e HCs, possibilitando ainda avançar no diagnóstico, prognóstico e eventuais opções terapêuticas para esse grupo de pacientes. Globalmente, os resultados aqui obtidos permitem oferecer algumas possibilidades interessantes para explicar o papel do músculo na patogénese da axSpA. Axial spondylarthritis (axSpA) is an inflammatory rheumatic disease, characterized primarily by the involvement of the spine and sacroiliac joints, and usually presenting as chronic back pain and stiffness. As the disease progresses, impaired spinal mobility and physical function may impact activities of daily living. Genetics and environmental factors (microbiota and microtrauma) are the known causes of disease susceptibility and progression. This thesis aimed to improve our current knowledge of axSpA physiopathology by characterizing axial and peripheral muscle properties and identifying genetic and protein biomarkers that might explain such properties. We performed a cross-sectional study on 54 participants: 27 patients with axSpA and 27 healthy controls (HC), matched by age, gender, and level of physical activity. Epidemiological, clinical, and muscle characterization (muscle physical properties, strength, mass, and performance) data were registered and compared between patients with axSpA and HC. Peripheral blood was collected for omics approaches. Transcriptomics and proteomics were performed by RNA-sequencing, RT q-PCR, and mass spectrometry technologies, respectively. Our results indicate patients with axSpA (mean age 36.5 (SD 7.5) years, 67% males, and mean disease duration of 6.5 (3.2) years) had no significant difference in segmental muscle stiffness compared with the HC, despite showing a slight numerically higher lower lumbar stiffness. Patients with axSpA, compared to the HC, had lower total strength as well as lower strength in the upper and lower limbs, independently of muscle physical properties. Patients also had significantly lower gait speeds than the HC. Gait characteristics may represent a potential biomarker in patients with axSpA. Enrichment analysis of differentially expressed genes reveals significant pathways (such as IL6 signaling and immune system pathways) with a pathological role for this group of patients. Notably, increased serum levels of various pro-inflammatory cytokines in patients with axSpA have been observed in proper correlation with disease activity parameters. Moreover, differentially muscle-associated expressed genes (such as NACA, FRG1, and ARPC5L) play roles in the development of myotubes and actin assembly, eventually affecting muscle strength in patients with axSpA. Worth of note, the integration of transcriptomic’s and proteomic’s results shows number of genes and proteins causes a clear discrimination between patients with axSpA and HCs that may advance diagnosis, prognosis, and therapeutic options for this group of patients. This work, taken together, provides some interesting possibilities to explain the role of muscle in the pathogenesis of axSpA.