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Pullorum disease is described worldwide and is caused by Salmonella enterica subspecies enterica serovar Gallinarum biovar Pullorum (S. Pullorum). S. Pullorum infection is important in commercial poultry, provoking a systemic disease with high mortality rates. Its occurrence requires notification, and when it is diagnosed in commercial breeding flocks, its eradication is demanded. The aim of this study was to report a severe outbreak of Pullorum disease in young Guinea fowl (Numida meleagris), resulting in 100% mortality of keets (n=290) within the first two weeks of age. All examined keets had enlarged liver, kidneys and spleen (5/5), and the affected tissues were submitted to histological and bacteriological examination. On histopathology, random paratyphoid nodules characterized by areas of necrosis with fibrin and a moderate infiltrate of macrophages and heterophils were observed in the liver. In kidneys, discrete areas of necrosis associated with moderate multifocal infiltrates of lymphocytes, and plasma cells were observed. In the spleen, a moderate infiltrate of macrophages was noticed. Isolation of colonies suggestive of S. Pullorum from liver and spleen was performed in selective agars and, after biochemical tests, confirmed by specific duplex-PCR. The antimicrobial susceptibility test of the isolated strain revealed resistance to only sulfamethoxazole + trimethoprim among the tested antimicrobials. The S. Pullorum isolate recovered in the present study was highly pathogenic to N. meleagris and may represent a risk to other avian species, including industrial poultry. RESUMO: A pulorose é descrita mundialmente e é causada por Salmonella enterica subespécie enterica sorovar Gallinarum biovar Pullorum (S. Pullorum). A infecção por S. Pullorum é importante em aves comerciais, provocando doença sistêmica com altas taxas de mortalidade. Sua ocorrência requer notificação e quando diagnosticada em aves de criação comercial resulta na erradicação do plantel. O objetivo deste estudo foi relatar um surto grave de pulorose em filhotes de galinhas-d’Angola (Numida meleagris), resultando em 100% de mortalidade das aves (n=290) nas primeiras duas semanas de idade. Os pintinhos recebidos tinham hepato, espleno e nefromegalia (5/5). Os tecidos dos cinco indivíduos recebidos foram submetidos a exame histológico e bacteriológico. Na histopatologia, foram observados nódulos paratifoides aleatórios caracterizados por áreas de necrose com fibrina e infiltrado moderado de macrófagos e heterófilos no fígado. Nos rins, foram observadas áreas discretas de necrose associadas a infiltrados multifocais moderados de linfócitos e plasmócitos. No baço, foi observado infiltrado moderado de macrófagos. O isolamento de colônias sugestivas de S. Pullorum de fígados e baços foi realizado em ágares seletivos e, após testes bioquímicos, confirmado por duplex-PCR específico. A susceptibilidade antimicrobiana da cepa isolada revelou resistência apenas ao sulfametoxazol + trimetoprim entre os antimicrobianos testados. O isolado de S. Pullorum recuperado no presente estudo foi altamente patogênico para N. meleagris e pode representar um risco para outras espécies de aves, incluindo aves industriais.

A Salmonelose é uma doença de grande impacto na saúde única, ou seja, saúde humana, animal e ambiental. Por ser uma zoonose, é necessário controlar a sua disseminação devido a sua associação aos casos de Doenças transmitidas por Alimentos (DTA’s). O Brasil é o maior exportador da carne de frango no mundo, sendo assim, a identificação da presença de carne contaminada com Salmonella spp. pode trazer grande prejuízos à agroindústria. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento de artigos publicados na base de dados da Scielo relacionados ao controle de Salmonella spp. em frangos de corte. Como estratégia de pesquisa dos dados, utilizou-se a seguinte frase no item palavras-chave: Controle de Salmonella em frangos de corte. No total, 14 artigos oriundos do Brasil foram encontrados. No entanto, apenas 12 artigos foram analisados, visto que dois artigos não abordavam tratamentos contra a Salmonela spp. Verificaram-se resultados positivos para o controle de Salmonella spp. com probióticos, ácidos orgânicos, flagelina recombinante, óleos essenciais e prebióticos, no entanto, variações nos resultados podem estar relacionados com o produto utilizado, tempo de tratamento e cepa bacteriana utilizada no desafio.

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2022-09-26T23:08:33Z No. of bitstreams: 2 Dissertacão -Edinan-Cirilo_FINAL.pdf: 3479414 bytes, checksum: f1c96fca2e0bd08a9285af0972bb1bf6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2022-09-26T23:08:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacão -Edinan-Cirilo_FINAL.pdf: 3479414 bytes, checksum: f1c96fca2e0bd08a9285af0972bb1bf6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2022-06-22 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES The objective of this work was to evaluate the use of probiotics in the bedding and diets of broilers challenged with Salmonella Heidelberg (SH) on performance, carcass and cuts yield, relative liver and fat weight, blood biochemical parameters, intestinal morphometry, cecal contamination by SH and litter quality. For that, 640 one-day-old male broiler chicks were used, distributed in a completely randomized design with five treatments, eight replications and 16 birds per experimental unit (UE). The treatments consisted of: a positive control (CP – basal chow with the use of enramycin and salinomycin), a negative control (CN – basal chow without enramycin and salinomycin), a third treatment with CN chow plus inclusion of 1 kg ton-1 of probiotic in the ration, a fourth treatment with CN ration plus application of 20 g m-2 of probiotic in the litter and a fifth treatment with CN ration with the inclusion of 1 kg ton-1 of probiotic in the ration and the application of 20 g m- 2 probiotic in bed. The application of the probiotic in the bed was carried out 5 days before the accommodation. At 3 days of age, 4 birds per UE received a SH culture inoculum solution (106 UFC bird-1) by gavage. Performance at 21 and 42 days (weight gain, feed intake and feed conversion), carcass and cuts yield, relative liver and fat weight at 42 days, blood biochemical profile at 40 days, jejunum morphometry at 28 days were evaluated. days, Salmonella spp. count in the cecum at 14 and 28 days and litter quality parameters at 28 and 40 days (dry matter, pH and ammonia). Data were submitted to analysis of variance and Tukey's test at 5% probability was used to compare significant variables. The results of counting Salmonella spp. showed no normal distribution, so the Kruskal-Wallis test was used. In the initial phase (1 to 21 days) it was observed that the birds that received antibiotic ration and those that received probiotic in the ration presented better results (P

A suinocultura representa uma atividade muito relevante para o Brasil, gerando empregos, renda e desenvolvimento. Atualmente, o mercado nacional e internacional vem exigindo um status sanitário de rebanho cada vez mais qualificado. Dentro disso, a salmonelose é uma enfermidade que merece destaque. A Salmonella é um agente etiológico de grande envolvimento em surtos alimentares em seres humanos, e vem apresentando um forte aumento no condizente à resistência antimicrobiana devido ao uso indiscriminado de antibióticos em animais de produção e pacientes, tornando-se uma ameaça à saúde pública por todo o globo. O surgimento de isolados de Salmonella com tal resistência foi descrito em humanos, alimentos e animais para consumo. Por esse motivo, foi realizada uma revisão de literatura no condizente à Salmonella spp. e sua resistência frente à utilização de antibioticoterapia na suinocultura, com consulta de instruções normativas, teses e artigos científicos de diversas bases de dados, tais como Scielo, ScienceDirect e PubMed. Pôde-se constatar a grande resistência antimicrobiana de Salmonella frente aos inúmeros princípios ativos utilizados na antibioticoterapia na suinocultura ao longo dos anos. Foi constatado também, que para os próximos anos a tendência é da utilização de alternativas à antibióticos, como óleos essenciais, ácidos orgânicos e inorgânicos, entre outros. Swine farming represents a very relevant activity for Brazil, generating jobs, income and development. Currently, the national and international market has been demanding an increasingly qualified herd health status. Within this, salmonellosis is a disease that deserves to be highlighted. Salmonella is an etiological agent of great involvement in food outbreaks in humans, and has shown an elevated increase in antimicrobial resistance due to the indiscriminate use of antibiotics in treating livestock and humans, becoming a global threat to public health. The emergence of isolation of Salmonella with such resistance has been described in humans, food and animals for consumption. For this reason, this paper conducted a literature review on Salmonella spp. and its resistance to the use of antibiotic therapy in swine farming, with consultation of normative instructions, dissertations, and scientific articles from several databases such as Scielo, ScienceDirect, and PubMed. It was possible to verify the great antimicrobial resistance of Salmonella against the countless active principles used in antibiotic therapy in swine farming over the years. It was also found that for the upcoming years there is a trend in using alternatives to antibiotics, such as essential oils, organic and inorganic acids, among others. La porcicultura representa una actividad muy relevante para Brasil, generadora de empleo, renta y desarrollo. En la actualidad, los mercados internacionales y el nacional pasaron a exigir un rebaño cada vez más calificado en estado sanitario. Sobre este tema, la salmonelosis es una enfermedad que merece ser destacada. Salmonella es un agente etiológico de gran implicación en brotes alimentarios en humanos, y ha mostrado un fuerte aumento de la resistência antimicrobiana debido al uso indiscriminado de antibióticos en animales de producción y en pacientes, convirtiéndose en una amenaza para la salud pública en todo el globo. Se ha percibido la aparición de aislamientos de Salmonella con tal resistencia en humanos, alimentos y animales para consumo. Por tal motivo, se realizó una revisión bibliográfica sobre Salmonella spp. y su resistencia al uso de la antibioticoterapia en porcicultura, con consulta de instructivos normativos, tesis y artículos científicos de múltiples bases de datos, como Scielo, ScienceDirect y PubMed. Se pudo comprobar la gran resistencia antimicrobiana de la Salmonella frente a los numerosos principios activos utilizados em la antibioticoterapia en porcinos a lo largo de los años. También se encontró que para los próximos años la tendencia es utilizar alternativas a los antibióticos, como aceites esenciales, ácidos orgánicos e inorgánicos, entre otros.

Submitted by Camila De Souza Oro (camila.oro@unesp.br) on 2021-12-03T11:55:14Z No. of bitstreams: 1 TESE - Camila Oro.pdf: 1018923 bytes, checksum: 84e55911e43815e8697e0e1764452bbc (MD5) Approved for entry into archive by Elida Daniele de Antonio null (elida_daniele@btu.unesp.br) on 2021-12-03T12:56:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 oro_cs_dr_bot.pdf: 1018923 bytes, checksum: 84e55911e43815e8697e0e1764452bbc (MD5) Made available in DSpace on 2021-12-03T12:56:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 oro_cs_dr_bot.pdf: 1018923 bytes, checksum: 84e55911e43815e8697e0e1764452bbc (MD5) Previous issue date: 2021-11-05 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) A Salmonella Heidelberg (SH) é uma bactéria que resulta em grande prejuízo econômico à produção avícola brasileira e, o uso não adequado de antibióticos na criação das aves pode induzir a seleção de cepas resistentes. Desta forma, produtos naturais são alternativas para substituição de antibióticos, contribuindo também para a manutenção da saúde intestinal das aves. O objetivo do estudo foi avaliar a eclodibilidade e o efeito profilático de um probiótico com cinco cepas de Lactobacillus reuteri e da glutamina in ovo em frangos de corte desafiados com SH. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com sete tratamentos. Os ovos foram vacinados in ovo com os aditivos avaliados (probiótico, glutamina e antibiótico) misturados à vacina para a doença de Marek e Gumboro. O desafio com SH ocorreu 24 horas após o alojamento e cada ave recebeu 0,5 mL do inóculo com SH contendo 4 x 106 UFC/mL. Os parâmetros avaliados foram: quantificação molecular de bactérias totais e de Lactobacillus spp., eclodibilidade, quantificação das colônias de SH, análise biométrica do intestino e análise morfológica da mucosa intestinal. Os dados foram submetidos a análise de variância, teste de Tukey e Dunn com nível de significância de 5%. Todos os tratamentos que receberam glutamina in ovo apresentaram melhor eclodibilidade que o grupo controle. Os embriões que receberam o tratamento com probiótico + glutamina obtiveram maior quantidade de bactérias totais no trato digestório do que aqueles que receberam antibiótico. O tratamento com o probiótico, associado ou não com a glutamina, apresentou menor quantidade de SH quando comparado com os demais tratamentos. Após três dias do desafio o tratamento que recebeu o probiótico apresentou maior altura de vilo e maior profundidade de cripta no duodeno jejuno e íleo comparado ao tratamento que recebeu o antibiótico. Portanto, a glutamina in ovo melhora a eclodibilidade e, o probiótico in ovo reduz a quantidade de SH, além de aumentar a altura de vilo e a profundidade de cripta em frangos de corte. Salmonella Heidelberg (SH) is a bacterium that causes great economic damage to Brazilian poultry production and, the indiscriminate use of antibiotics in poultry farming may induce the selection of resistant strains. In this way, natural products are alternatives for replacing antibiotics, also contributing to the maintenance of the intestinal health of birds. Thus, the objective of the experiment was to evaluate the hatchability and the effect of probiotic with five strains of Lactobacillus reuteri and glutamine in ovo in broiler chickens exposed to SH. The experimental design was completely randomized with seven treatments. The in ovo treatments evaluated (probiotic, glutamine, and an antibiotic) were mixed with the vaccine against Marek and Gumboro disease. The exposure to SH occurred 24 hours after chick placement and each chick received 0.5 mL of the inoculum with SH containing 4 x 106 UFC/mL. The parameters evaluated were: molecular quantification of total bactéria and Lactobacillus spp., hatchability, quantification of SH colonies, biometric analysis of the intestine and morphological analysis of the intestinal mucosa. Data was subjected to analysis of variance, Tukey, and Dunn test, with a significance level of 5%. All treatments that received glutamine in ovo showed better ability to hatch. Embryos that received the treatment with probiotic + glutamine had a greater number of total bacteria in the digestive tract than those that received antibiotics. The treatment with the probiotic, associated or not, with glutamine, showed a lower amount of SH when compared to the other treatments. Three days after exposure, the treatment that received the probiotic showed greater villus height and greater crypt depth in the duodenum, jejunum, and ileum compared to the treatment that received the antibiotic. Therefore, glutamine in ovo improves the hatchability and probiotic in ovo reduces the amount of SH, in addition to increasing the villus height and crypt depth in broilers. CNPQ 170179/2018-4

The objective of this study was to identify and to describe the main diseases that affect free-range chickens, sent to the Laboratório Regional de Diagnóstico of the Faculty of Veterinary Medicine of the Universidade Federal de Pelotas (LRD/UFPel), between the years 2000 and 2020. The necropsy protocols of domestic chickens referred to the LRD/UFPel in the last 20 years were reviewed. During this period, 565 samples were received corresponding to cadavers and organs of domestic chickens, 229 of which from free-range poultry farms. Out of 229 cases, 203 (88,64%) had a conclusive diagnosis. The main diagnosed diseases were bacterial with 79/203 (38,92%) cases, followed by parasitic 59/203 (29,06%). Among bacterial diseases, salmonellosis was the most frequent with 26/79 cases, with 22/26 Gallinarum and 4/26 Pullorum biovars isolated. Parasitic diseases, mixed parasitosis were the most prevalent with 37/59 cases, mainly associated with the intestinal nematode Ascaridia galli. The main causes of death in free-range chickens in this study were mixed parasitosis, followed by avian salmonellosis (fowl typhoid and pullorum disease). The breeding system and inadequate sanitary management, both for chickens and for the environment, were the main factors related to the occurrence of infectious diseases diagnosed in the LRD/UFPel. El objetivo de este estudio fue identificar y describir las principales enfermedades que afectaron a los pollos criados en sistemas alternativos, enviados al Laboratorio Regional de Diagnóstico de la Facultad de Medicina Veterinaria de la Universidad Federal de Pelotas (LRD/UFPel), entre 2000 y 2020. Se revisaron los protocolos de necropsia de pollos domésticos enviados al LRD/UFPel en los últimos 20 años. Durante este período se recibieron 565 muestras correspondientes a cadáveres y órganos de pollos domésticos, de los cuales 229 fueron de cría alternativa. De los 229 casos, 203 (88,64%) tuvieron un diagnóstico concluyente. Las principales enfermedades diagnosticadas fueron bacterianas con 79/203 (38,92%) casos, seguidas de las parasitarias 59/203 (29,06%). Entre las enfermedades bacterianas, la salmonelosis fue la más frecuente con 26/79 casos, aislándose 22/26 biovars Gallinarum y 4/26 Pullorum. Entre las enfermedades parasitarias, los parásitos mixtos fueron los más prevalentes con 37/59 casos, principalmente asociados con el nematodo intestinal Ascaridia galli. Las principales causas de muerte en las aves de este estudio fueron la parasitosis mixta, seguida de la salmonelosis aviar (tifosis aviar y pullorosis). El sistema de cría y el inadecuado manejo sanitario, tanto de las aves como del medio ambiente, fueron los principales factores relacionados con la ocurrencia de enfermedades infecciosas diagnosticadas en la LRD/UFPel. O objetivo desse estudo foi identificar e descrever as principais doenças que acometeram galinhas criadas em sistemas alternativos, encaminhadas ao Laboratório Regional de Diagnóstico da Faculdade de Veterinária da Universidade Federal de Pelotas (LRD/UFPel), entre os anos de 2000 e 2020. Foram revisados os protocolos de necropsia de galinhas domésticas encaminhadas ao LRD/UFPel, nos últimos 20 anos. Nesse período foram recebidas 565 amostras correspondentes a cadáveres e órgãos de galinhas domésticas, sendo 229 de criações alternativas. Dos 229 casos, 203 (88,64%) tinham diagnóstico conclusivo. As principais doenças diagnosticadas foram bacterianas com 79/203 (38,92%) casos, seguidas das parasitárias 59/203 (29,06%). Dentre as doenças bacterianas, as salmoneloses foram as mais frequente com 26/79 casos, sendo isolados 22/26 biovares Gallinarum e 4/26 Pullorum. Das doenças parasitárias, as parasitoses mistas foram as mais prevalentes com 37/59 casos, associadas principalmente ao nematódeo intestinal Ascaridia galli. As principais causas de morte nas aves desse estudo foram as parasitoses mistas, seguidas das salmoneloses aviárias (tifo aviário e pulorose). O sistema de criação e o manejo sanitário inadequado, tanto das aves quanto do ambiente, foram os principais fatores relacionados à ocorrência das doenças infecciosas diagnosticadas no LRD/UFPel.

Poultry farming has spread widely across the country. Despite their rustic characteristics, these birds are susceptible to serious diseases such as salmonellosis and avian coccidiosis. The objective was to investigate the infectious agents of these diseases in free-range chickens destined for school feeding in the city of São Luís, MA. A clinical examination of 198 birds was carried out, which consisted of observing the appearance of the plumage, beak, ridges, cloaca region and body condition. The samples were analyzed for Salmonella spp. following the methodology of the Ministry of Agriculture, Livestock and Supply . Of the 99 samples of cloaca (group of two birds), collected for investigation of Salmonella spp., 10 (10.1%) samples were suspected of the bacterium in biochemical tests, however all were negative (0%) due to antigenic serotyping. The survey and enumeration of Eimeria spp. The centrifugal flotation method was used in a sucrose solution. In the count of Eimeria spp. Oocysts, Of the 124 samples collected from the intestine during evisceration, 92 (74.19%) presented oocysts of the parasite, with counts ranging from 100 to 18,800 oocysts. The results were considered expected since, in a free-range chicken breeding system, where cocciostatic drugs are not used, the prevalence of Eimeria spp. it is often high. Therefore, it can be concluded that free-range chickens destined for slaughter in the municipality of São Luís did not present isolation for Salmonella spp., But did have a high incidence of infection by Eimeria spp. La avicultura se ha extendido ampliamente por todo el país. A pesar de sus características rústicas, estas aves son susceptibles a enfermedades graves como la salmonelosis y la coccidiosis aviar. El objetivo fue investigar los agentes infecciosos de estas enfermedades en pollos de corral destinados a alimentación escolar en la ciudad de São Luís, MA. Se realizó un examen clínico de 198 aves, que consistió en observar la apariencia del plumaje, pico, crestas, región cloaca y condición corporal. Las muestras fueron analizadas para Salmonella spp. siguiendo la metodología del Ministerio de Agricultura, Ganadería y Abastecimiento. De las 99 muestras de cloaca (grupo de dos aves), recolectadas para la investigación de Salmonella spp., 10 (10.1%) muestras fueron sospechosas de la bacteria en pruebas bioquímicas, sin embargo todas fueron negativas (0%) debido a serotipificación antigénica. La prospección y enumeración de Eimeria spp. Se utilizó el método de flotación centrífuga en una solución de sacarosa. En el recuento de oocistos de Eimeria spp., De las 124 muestras recolectadas del intestino durante la evisceración, 92 (74,19%) presentaron ooquistes del parásito, con recuentos que variaron de 100 a 18.800 ooquistes. Los resultados se consideraron esperados ya que, en un sistema de cría de pollos de corral, donde no se utilizan fármacos cocciostáticos, la prevalencia de Eimeria spp. a menudo es alto. Por lo tanto, se puede concluir que los pollos de corral destinados al sacrificio en el municipio de São Luís no presentaron aislamiento para Salmonella spp., Pero sí tuvieron una alta incidencia de infección por Eimeria spp. A avicultura de frango tipo caipira difundiu-se de forma ampla em todo país. Apesar das características de rusticidade, essas aves são suscetíveis a doenças graves como as salmoneloses e a coccidiose aviária. Objetivou-se pesquisar os agentes infecciosos dessas doenças em frangos caipiras destinados a alimentação escolar no município de São Luís, MA. Procedeu-se o exame clínico de 198 aves, que consistiu na observação da aparência da plumagem, bico, cristas, região da cloaca e condição corporal. As amostras foram analisadas para pesquisa de Salmonella spp. seguindo a metodologia do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento. Das 99 amostras de cloaca (pool de duas aves), coletadas para pesquisa de Salmonella spp., 10 (10,1%) amostras foram suspeitas para a bactéria nas provas bioquímicas, porém todas foram negativas (0%) por sorotipificação antigênica. Na pesquisa e contagem de oocistos de Eimeria spp. foi utilizado o método de centrífugo–flutuação em solução de sacarose. Na contagem de oocistos de Eimeria spp., das 124 amostras coletadas de intestino durante a evisceração, 92 (74,19%) amostras apresentaram oocistos do parasita, com contagens variando de 100 a 18.800 oocistos. Os resultados foram considerados esperados visto que em sistema de criação de frangos caipiras, onde não se utiliza drogas cocciostáticas, a prevalência de Eimeria spp. é frequentemente elevada. Portanto, pode-se concluir que os frangos de corte tipo caipira destinados ao abatedouro no município de São Luís não apresentaram isolamento para Salmonella spp., porém tiveram alta ocorrência de infecção por oocisto de Eimeria spp.

Animal origin flours is the non-edible by-product resulting from the processing of waste from the slaughter of animals, not intended for human consumption. In addition to taking advantage of waste, this process aims to reduce environmental damage. However, during some stage of the process of its elaboration may occur contamination by antimicrobials resistant microorganisms such as Salmonella spp. When serving as food for these animals, these products can spread pathogens on farms, causing flock infection. Food contaminated with Salmonella spp. antimicrobial resistant has a direct negative impact on poultry performance, as well as a risk to consumer health through carcass consumption. Thus, the aim of the present study was to investigate the antimicrobial resistance profile in Salmonella spp. isolated from non-edible animal from slaughterhouses located in Bahia and Pernambuco states, Brazil. From biochemical tests for isolation and identification of Salmonella spp., 81 isolates were randomly selected to be submitted to antimicrobial susceptibility testing using the plate diffusion method. Most of the isolates was sensitive to the antimicrobials tested. Nalidixic acid showed the highest percentage among those that were resistant, one of the antimicrobials used in the treatment of salmonellosis. This fact can be considered worrying, since the food production chain of animal origin can be an important carrier of resistant strains, especially since it is at the beginning of the production process. La harina de origen animal es el subproducto no comestible resultante del procesamiento de los desechos del sacrificio de animales de carnicería, no destinados al consumo humano. Además de aprovechar los residuos, este proceso tiene como objetivo reducir el daño ambiental. Sin embargo, durante alguna etapa del proceso de su elaboración, la contaminación por microorganismos resistentes a los antimicrobianos como Salmonella spp. que, al servir de alimento a estos animales, pueden propagar patógenos en las granjas provocando la infección de los rebaños, además de causar un impacto negativo directo en el rendimiento productivo de las aves, así como un riesgo para la salud del consumidor a través de el consumo de productos avícolas. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio fue investigar el perfil de resistencia antimicrobiana en Salmonella spp. aislado de harina animal no comestible utilizada en la formulación de raciones y también de raciones producidas a partir de estos subproductos animales no comestibles en mataderos ubicados en Bahía y Pernambuco (Brasil). A partir de pruebas bioquímicas para aislamiento e identificación de Salmonella spp. Se seleccionaron aleatoriamente 81 aislamientos para someterlos a pruebas de susceptibilidad antimicrobiana mediante el método de difusión en placa. La mayoría de los aislados fueron sensibles a los antimicrobianos probados. Entre los antimicrobianos que resultaron resistentes, el ácido nalidíxico presentó el mayor porcentaje, que es uno de los antimicrobianos utilizados en el tratamiento de la salmonelosis. La cadena de producción de alimentos de origen animal puede desempeñar un papel en la propagación de cepas resistentes. Por lo tanto, es preocupante el desarrollo de resistencia antimicrobiana en microorganismos transmitidos por alimentos. Farinha de origem animal é o subproduto não comestível resultante do processamento de resíduos do abate de animais de açougue, não destinados ao consumo humano. Além de se aproveitar resíduos esse processo tem o objetivo de reduzir danos ambientais. No entanto, durante alguma etapa do processo de sua elaboração pode ocorrer contaminação por microrganismos resistentes a antimicrobianos como Salmonella spp. que, ao servir de alimento para estes animais, podem disseminar patógenos nas granjas acarretando infecção dos lotes, além de causar impacto negativo direto no desempenho produtivo das aves, bem como risco à saúde do consumidor por meio do consumo dos produtos avícolas. Assim, o objetivo do presente estudo foi investigar o perfil de resistência a antimicrobianos em Salmonella spp. isoladas de farinhas de origem animal não comestíveis utilizadas na formulação de rações e também de rações produzidas a partir destes subprodutos de origem animal não comestíveis em abatedouros frigoríficos localizados na Bahia e Pernambuco (Brasil). A partir de testes bioquímicos para isolamento e identificação de Salmonella spp. foram selecionados aleatoriamente 81 isolados para serem submetidos a teste de sensibilidade antimicrobiana através do método de difusão em placa. A maioria dos isolados foi sensível aos antimicrobianos testados. Dentre os antimicrobianos que se apresentaram resistentes, o ácido nalidíxico apresentou maior percentual, sendo este um dos antimicrobianos usados no tratamento de salmoneloses. A cadeia de produção de alimentos de origem animal pode ter papel na dispersão de cepas resistentes. Assim, é preocupante o desenvolvimento de resistência a antimicrobianos em microrganismos veiculados por alimentos.

Salmonellosis is a bacterial disease that affects several domestic animal species, and is commonly diagnosed in cattle, horses, and pigs. This study aimed to describe the epidemiological and pathological findings of eleven cases of enteric salmonellosis and two cases of salmonellosis with pulmonary involvement in cattle in Rio Grande do Sul State, Brazil. Clinical signs included fever, yellow diarrhea, sometimes with blood streaks, and dyspnea, with a clinical course ranging from 1 to 30 days. Eight cases occurred as outbreaks, whereas five cases occurred individually. Risk factors included inadequate handling practices, such as overcrowded facilities and comorbidities, including anaplasmosis. The main gross finding of the enteric presentation was fibrinonecrotic enterocolitis, occasionally associated with button ulcers, mesenteric lymphadenomegaly, splenomegaly, cholecystitis and hepatomegaly. In addition, one steer with a chronic clinical progression presented severe segmental thickening of the ileum, associated with intestinal rupture and peritonitis. In the respiratory system, the main findings were reddened, non-collapsed lungs, with multifocal areas of atelectasis. The main microscopic findings were observed in the small and large intestines, and these were characterized by severe necrosis and mucosal ulceration, associated with marked inflammatory infiltrate of neutrophils and fibrin deposition intermixed by rod-shaped bacterial aggregates, and fibrosis, as well as interstitial pneumonia. Seven cases yielded positive bacterial cultures for Salmonella spp. and three serovars, namely Typhimurium, Dublin, and Panama were identified. All cases exhibited immunolabeling for Salmonella spp. using immunohistochemistry. RESUMO: Salmonelose é uma doença bacteriana que afeta inúmeras espécies animais, especialmente os bovinos, os equinos e os suínos. O presente estudo teve como objetivo descrever os aspectos epidemiológicos e patológicos de onze casos de salmonelose entérica e dois de salmonelose pulmonar em bovinos no estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Os sinais clínicos incluíram febre, diarreia amarelada, por vezes com estrias de sangue, anorexia, perda de peso e dispneia, com curso clínico que variou de um a 30 dias. Em oito casos, a doença ocorreu em forma de surtos e cinco foram individuais. Identificou-se fatores de risco relacionados ao manejo inadequado com os bovinos, como alta lotação, além de comorbidades associadas, como anaplasmose. Os principais achados macroscópicos da forma entérica consistiram em enterocolite fibrinonecrótica, por vezes associada a formação de úlceras botonosas, linfonodos mesentéricos e baço aumentados, colecistite e hepatomegalia. Ainda, um bovino com quadro clínico crônico apresentou acentuado espessamento segmentar da parede do íleo associado a ruptura intestinal e peritonite. Na forma respiratória, os principais achados incluíram pulmões não colabados, avermelhados, com áreas multifocais de atelectasia. Os principais achados microscópicos foram observados no intestino delgado e grosso e foram caracterizados por acentuada necrose e ulceração da mucosa, associada a acentuado infiltrado inflamatório de neutrófilos e deposição de fibrina entremeada por agregados bacterianos cocobacilares e fibrose, além de pneumonia intersticial. Sete casos foram positivos para Salmonella sp. no cultivo bacteriano, com identificação dos sorovares Typhimurium, Dublin e Panama. Ao exame imuno-histoquímico para Salmonella sp. todos os casos apresentaram marcação positiva nos órgãos avaliados.

Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais Salmonella Enteritidis, S. Typhimurium e S. Infantis estão frequentemente associados a casos de infecções humanas no mundo todo, sendo transmitidas pelo consumo de alimentos contaminados, principalmente aqueles de origem animal, com destaque para a carne de frango. A tese foi fracionada em três capítulos, sendo o primeiro referente às considerações gerais dos tópicos abordados nos demais capítulos. O segundo capítulo objetivou avaliar características de virulência, resistência antimicrobiana e a similaridade genética de 51 cepas de S. Infantis isoladas em amostras de origem avícola, provenientes de uma empresa localizada no Estado de São Paulo, Brasil, durante o período de 2009 a 2010. O terceiro capítulo teve por objetivo analisar 111 cepas de S. Enteritidis, 45 de Salmonella Typhimurium e 31 de Salmonella Typhimurium variante monofásica I 4,[5],12:i:-, isoladas de carcaças de frango em diferentes frigoríficos brasileiros de 2009 a 2011, e estimar o risco que representam para a saúde humana, baseado na presença de genes de virulência e resistência aos antimicrobianos, e além de correlacionar os perfis de patogenicidade (resistência antimicrobiana e presença de genes de virulência e resistência) com o perfil genético (ribogrupo) dos isolados. Para avaliação da sensibilidade antimicrobiana foi realizado o teste de disco difusão para todos os sorovares de Salmonella e, apenas para S. Enteritidis e S. Typhimurium, foi também verificada a concentração inibitória mínima para os antibióticos ciprofloxacina e ceftazidima. Foi avaliada a presença dos genes de virulência invA (invasão), lpfA (fímbria-adesão), agfA (fímbria-biofilme) e sefA (fímbria-adesão) pela técnica de PCR. As cepas que apresentaram resistência aos antibióticos da classe dos β-lactâmicos foram avaliadas quanto a presença dos genes de resistência blaTEM, blaSHV, blaCTX-M e blaAmpC. Para as cepas resistentes aos antibióticos da classe das quinolonas e fluoroquinolonas foram pesquisados os genes qnrA e qnrS. A relação filogenética entre os isolados foi determinada pelo método de RAPD para cepas de S. Infantis, e pela técnica de ribotipagem para S. Enteritidis e S. Typhimurium. Salmonella Enteritidis, S. Typhimurium and S. Infantis are often associated with cases of human infections worldwide and is transmitted through consumption of contaminated food, particularly those of animal origin, especially chicken meat. This thesis was fractionated into three chapters, the first one relating to general considerations about the topics discussed in the following chapters. The second chapter aimed to evaluate virulence characteristics, antimicrobial resistance and the genetic similarity of 51 strains of S. Infantis isolated in samples of poultry origin from an industry located in the state of São Paulo, Brazil, during the 2009 to 2010 period. The third chapter aimed to analyze 111 strains of S. Enteritidis, 45 of Salmonella Typhimurium and 31 of Salmonella Typhimurium monophasic variant I 4, [5], 12:i:- isolated from chicken carcasses in different brazilian slaughterhouses from 2009 to 2011, and to estimate the risk to human health, based on the presence of virulence genes and antimicrobial resistance, correlating to the pathogenicity profiles (antimicrobial resistance and presence of virulence and resistance genes) with the genetic profile (ribogroup) of the isolates. To evaluate the antimicrobial susceptibility was performed the disk diffusion test for all serotypes of Salmonella, and exclusively to S. Enteritidis and S. Typhimurium, was also verified the minimum inhibitory concentration for ciprofloxacin and ceftazidime antibiotics. The presence of virulence genes invA (invasion), lpfA (fimbriae-adhesion), agfA (fimbriae-biofilm) and sefA (fimbriae-adhesion) were evaluated by PCR. The strains that showed resistance to antibiotics of β-lactams class were evaluated for the presence of resistance genes blaTEM, blaSHV, blaCTX-M and blaAmpC. For resistant strains to quinolones and fluoroquinolones antibiotics classes were searched the qnrA and qnrS genes. The phylogenetic relationship among the isolates was determined by RAPD method for S. Infantis strains, and by ribotyping technique to S. Enteritidis and S. Typhimurium. Tese (Doutorado)

RESUMO Objetivou-se avaliar características de virulência, perfil de resistência antimicrobiana e padrão de similaridade genética de 71 cepas de Salmonella Minnesota isoladas na cadeia produtiva de frangos de corte, entre 2009 e 2010, em duas unidades de uma empresa (A e B). Os isolados foram sorotipificados e submetidos ao teste de susceptibilidade antimicrobiana pelo teste de difusão em disco. Utilizando-se PCR, foi avaliada a presença dos genes invA, lpfA, agfA e sefA e os genes de resistência aos betalactâmicos (bla TEM , bla SHV e bla CTX-M ). A relação filogenética foi determinada por RAPD-PCR. Os maiores percentuais de resistência foram para tetraciclina e sulfonamida. Foram reconhecidos oito perfis de resistência aos antimicrobianos entre as cepas isoladas na indústria A, e 11 perfis de resistência na indústria B. Do total de cepas, 100% foram positivas para o gene invA, 98,6% para o gene agfA, 49,3% para o gene lpfA e nenhuma para o gene sefA. Três cepas foram positivas para o gene bla TEM (4,2%) e 11 (15,5%) para o gene bla CTX-M . A avaliação filogenética demonstrou a presença de sete clusters com similaridade superior a 80% e três perfis distintos. Com base no dendrograma, observou-se a disseminação de um mesmo perfil em ambas as empresas. ABSTRACT The aim of this study was to evaluate virulence characteristics, antimicrobial resistance profile and the pattern of genetic similarity of 71 strains of Salmonella Minnesota isolated in the production chain of broilers between 2009 and 2010, into two units of a company (A and B). Isolates were serotyped and submitted to antimicrobial susceptibility by disk diffusion test. Using PCR, the presence of genes invA, lpfA, agfA and sefA and the genes conferring resistance to beta-lactam (blaTEM, blaSHV and blaCTX-M) were evaluated. The phylogenetic relationship was determined by the RAPD-PCR method. The highest percentages of resistance were to tetracycline and sulfonamide. Eight antimicrobial resistance profiles were recognized among strains isolated in industry A, and 11 resistance profiles in industry B. Of all strains of both industries, 100% were positive for the invA gene, 98.6% to agfA gene, 49.3% for lpfA gene, and no strain showed the sefA gene. Three strains were positive for the gene blaTEM (4.2%), 11 (15.5%) for the blaCTX-M gene. Phylogenetic evaluation showed the presence of seven clusters with similarity greater than 80% and three distinct profiles. Based on the dendrogram we observed the spread with similar profiles in both companies.

Salmonella enterica causes a high number of human infections annually worldwide. Among the foods involved in outbreaks, minimally processed vegetables stand out. Minimally processed pepper a world market commodity and its involvement in salmonellosis outbreaks has increased. The present study aimed to evaluate the survival of Salmonella Typhimurium and Salmonella Enteritidis in minimally processed peppers as a function of temperature and relative humidity (RH). Combinations of 7, 14 and 21 ºC and 15, 50, 100% RH were evaluated for inoculum at 4.5 log CFU/g and 2.5 log CFU/g. After 0, 12, 24, 48, 72, 96, 120 and 144 h, viable Salmonella cells of each serovar were enumerated. S. Typhimurium and S. Enteritidis showed similar behavior in cut-peppers during storage at evaluated conditions and data were combined a single set (S. enterica) for extraction of kinetic parameters using using the Baranyi and Roberts equation for 4.5 log CFU/g inoculum and linear model for 2.5 log CFU/g inoculum. The kinetic parameters extracted from these models were adjusted in a polynomial equation for secondary models capable of predicting the growth of S. enterica in sweet pepper as a function of the tested parameters. S. enterica presented a maximum growth rate (µmax) ranging from - 0.0047 to 0.0681 1/h. The highest µmax was observed at 14 and 21 ºC and at the highest tested RH (100%), while the growth of S. enterica was not supported at the lowest temperatures and tested RH, regardless of the size of the inoculum. In the lowest temperature and highest RH tested, the pathogen showed a maximum growth rate of 0.0123 ± 0.0016 1/h when tested at 2.5 log CFU/g. In most of the conditions tested at 2.5 log CFU/g growth was observed however, in the inoculum of 4.5 log CFU/g only the conditions that comprise the highest temperatures and RH tested supported the growth of S. enterica over 144 h of storage. Linear regressions based on experimental data showed R2 close to 0.99 and a good prediction of µmax as a function of temperature (T) and relative humidity. The interaction of T and RH showed effects (p < 0.05) on the growth of S. enterica in cut-peppers inoculated at 4.5 log CFU/g. The quadratic term of RH showed effects (p < 0.05) when S. enterica was inoculated at 2.5 log CFU/g. The results describe the behavior of S. enterica in cut-peppers in a range of temperature and RH conditions and show the impact of the initial size. The generated models would be useful tools to manage the risk of this pathogen in cut-peppers. Nenhuma Salmonella enterica causa um elevado número de infecções humanas anualmente em todo o mundo. Dentre os alimentos envolvidos em surtos destacam-se os vegetais minimamente processados. O pimentão minimamente processado é comercializado mundialmente e seu envolvimento em surtos tem sido recorrente. O presente estudo teve como objetivo avaliar a sobrevivência de Salmonella Typhimurium e Salmonella Enteritidis em pimentão minimamente processado em função da temperatura e da umidade relativa de armazenamento. Foram avaliadas combinações de umidade relativa (UR) de 15, 50, 100% em temperaturas de 7, 14 e 21 ºC para inóculos em concentrações de 4,5 e 2,5 log UFC/g. Após 0, 12, 24, 48, 72, 96, 120 e 144 h, as células viáveis de cada sorovar foram enumeradas em amostras de pimentão minimamente processado. S. Typhimurium e S. Enteritidis demonstraram comportamento semelhante durante o armazenamento nas condições analisadas e foram combinados em um único conjunto (S. enterica) de dados para extração dos parâmetros cinéticos a partir dos modelos primários de Baranyi e Roberts para o inóculo 4,5 log UFC/g e linear para 2,5 log UFC/g. Os parâmetros cinéticos extraídos desses modelos foram ajustados em uma equação polinomial para modelos secundários capazes de prever a taxa de crescimento de S. enterica em pimentão em função dos parâmetros testados. S. enterica apresentou taxa máxima de crescimento (µmax) variando de - 0,0047 a 0,0681 1/h. A maior µmax foi observada em 14 e 21 ºC na maior UR testada (100%), enquanto o crescimento de S. enterica não foi suportado nas temperaturas e UR mais baixas testadas, independentemente do tamanho do inóculo. Na temperatura mais baixa (7 ºC) na condição mais alta da UR, o patógeno apresentou uma taxa máxima de crescimento de 0,0123 ± 0,0016 1/h quando testado a 2,5 log UFC/g. Na maioria das condições testadas a 2,5 log UFC/g houve crescimento de S. enterica, entretanto, para o inóculo de 4,5 log UFC/g apenas as condições que compreenderam as temperaturas e UR mais elevadas suportaram o crescimento de S. enterica ao longo de 144 h de armazenamento. As regressões lineares baseadas nos dados experimentais exibiram R2 próximo a 0,99 e uma boa previsão do µmax em função da temperatura (T) e da umidade relativa. A interação de T e UR mostrou efeitos (p < 0,05) no crescimento de S. enterica em pimentões inoculados a 4,5 log UFC/g, enquanto o termo quadrático de UR apresentou efeitos (p < 0,05) no crescimento quando S. enterica foi inoculada a 2,5 log UFC/g. Os resultados descrevem o comportamento de S. enterica em pimentões armazenados em uma gama de condições de temperatura e UR e o impacto do tamanho inicial do inóculo. Os modelos gerados podem ser considerados ferramentas úteis para análise de risco da ocorrência deste patógeno em pimentões minimamente processados.

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior A salmonelose é uma das doenças transmitidas por alimentos mais prevalentes no mundo, com impacto na economia e saúde pública. Dentre os vários sorovares, destacamos S. Typhimirum por ser um dos mais envolvidos em surtos de origem alimentar e S. Heidelberg por ser um sorovar emergente associado a surtos humanos. A tese foi dividida em três capítulos. O primeiro, considerações gerais, relata os temas gerais e considerados importantes para contextualização do leitor sobre o que foi abordado nos capítulos seguintes. As cepas analisadas nos capítulos II e III foram isoladas de alimentos e pacientes humanos em diversos estados do Brasil entre 2011 e 2017, provenientes da coleção de culturas de Enteropatógenos Bacterianos do Instituto Oswaldo Cruz (IOC/FIOCRUZ-RJ), que também forneceu as informações sobre a sua origem. No segundo capítulo foram avaliadas 43 cepas de S. Typhimurium quanto a presença de genes de virulência (sefA, invA, agfA, avrA, lpfA, sivH, hilA, spvC, sopE) e genes associados a resistência aos antimicrobianos (qnrS e qnrA – fluoroquinolonas; blaTEM e blaSHV - β-lactâmicos) pela técnica de PCR. A concentração inibitória mínima (CIM) determinou a resistência fenotípica às classes de antimicrobianos consideradas importantes: meropenem: β lactâmicos/ carbapenêmicos; colistina: polimixinas; ciprofloxacina: fluoroquinolonas; ceftriaxona: β-lactâmicos/cefalosporinas de 3ª geração. Os resultados da PCR e CIM foram utilizados para construção de perfis de virulência e resistência. A disseminação e associação dos perfis de resistência e virulência foram discutidas após a genotipagem pela técnica do Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). No terceiro capítulo foram analisadas 36 cepas de S. Heidelberg, com objetivos e metodologia idênticas às do capítulo II, adicionado do sequenciamento do genoma completo de duas cepas filogeneticamente distintas realizado pelo Illumina HiSeq 2500, com o intuito de identificar o potencial virulento, de resistência, dificuldades de tratamento e risco a saúde pública. Salmonellosis is one of the most prevalent foodborne diseases in the world, with an impact on the economy and public health. Among the various serovars, we highlight S. Typhimirum for being one of the most involved in food-borne outbreaks and S. Heidelberg for being an emerging serovar associated with human outbreaks. The thesis was divided into three chapters. The first, general considerations, reports the general themes considered important for the reader's contextualization of what was discussed in the following chapters. The strains analyzed in chapters II and III were isolated from food and human patients in several states of Brazil, between 2011 and 2017, from the collection of Bacterial Enteropathogens cultures of the Oswaldo Cruz Institute (IOC / FIOCRUZ-RJ), which also provided the information about its origin. In the second chapter, 43 strains of S. Typhimurium were evaluated for the presence of virulence genes (sefA, invA, agfA, avrA, lpfA, sivH, hilA, spvC, sopE) and genes associated with antimicrobial resistance (qnrS and qnrA - fluoroquinolones; blaTEM and blaSHV - β-lactams) by the PCR technique. The minimum inhibitory concentration (MIC) determined the phenotypic resistance to the classes of antimicrobials considered important: meropenem: β lactam / carbapenem; colistin: polymyxins; ciprofloxacin: fluoroquinolones; ceftriaxone: β-lactams / 3rd generation cephalosporins. The PCR and CIM results were used to build virulence and resistance profiles. The dissemination and association of resistance and virulence profiles were discussed after genotyping using the Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) technique. In the third chapter, 36 strains of S. Heidelberg were analyzed, with objectives and methodology identical to those of chapter II, added by the sequencing of the complete genome of two phylogenetically distinct strains carried out by Illumina HiSeq 2500, in order to identify the virulent, resistance potential, treatment difficulties and public health risk. Tese (Doutorado) 2022-03-31

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No. of bitstreams: 1 barbosa_fo_dr_jabo.pdf: 2796648 bytes, checksum: a5517652fb5614defbd8dc774394ec10 (MD5) Previous issue date: 2020-03-02 Submitted by FERNANDA DE OLIVEIRA BARBOSA null (feobarbosa@hotmail.com) on 2020-04-13T12:42:52Z No. of bitstreams: 1 TESE FERNANDA BARBOSA.pdf: 2796648 bytes, checksum: a5517652fb5614defbd8dc774394ec10 (MD5) Submitted by FERNANDA DE OLIVEIRA BARBOSA null (feobarbosa@hotmail.com) on 2020-04-13T12:08:16Z No. of bitstreams: 1 TESE FERNANDA BARBOSA.doc: 6828032 bytes, checksum: ce18ff7e94b34a7320eef8977fe2613e (MD5) Submitted by FERNANDA DE OLIVEIRA BARBOSA null (feobarbosa@hotmail.com) on 2020-04-13T12:42:52Z No. of bitstreams: 1 TESE FERNANDA BARBOSA.pdf: 2796648 bytes, checksum: a5517652fb5614defbd8dc774394ec10 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-13T18:57:09Z (GMT). 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No. of bitstreams: 1 barbosa_fo_dr_jabo.pdf: 2796648 bytes, checksum: a5517652fb5614defbd8dc774394ec10 (MD5) Previous issue date: 2020-03-02 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium causam infecções em seres humanos e animais que são frequentemente associadas à extensa colonização intestinal e excreção fecal. A presença de estrutura flagelar no patógeno está relacionada à indução de inflamação intestinal e atenuação de infecção sistêmica no hospedeiro. Por outro lado, a infecção por estirpes aflageladas resulta em pouca inflamação e consequente infecção sistêmica grave. No presente estudo, foi avaliada a hipótese de que a síntese de maior quantidade de flagelina em estirpes de Salmonella geneticamente modificadas poderia levar a infecção sistêmica menos intensa em aves. Para investigar as conseqüências da superprodução de flagelina, foram construídas estirpes de Salmonella Enteritidis e Typhimurium contendo deleções nos genes clpP e fliD (que levam à superexpressão de flagelina) e patogenicidade e imunogenicidade foram comparadas com as respectivas estirpes selvagens em aves infectadas. Os resultados indicaram que o aumento da síntese de flagelina por SE ΔclpPΔfliD e STM ΔclpPΔfliD culmina em déficit da taxa de multiplicação bacteriana. Porém, tais alterações não interferiram na capacidade de colonização cecal e excreção fecal das estirpes mutantes. O mesmo foi observado em fígado e baço, mas após 14 dpi as estirpes mutantes tendem a serem eliminadas destes órgãos. Mesmo com síntese mais elevada de flagelina, as estirpes mutantes recrutaram quantidades semelhantes de linfócitos e macrófagos em tonsila cecal, baço e fígado que as estirpes selvagens. Infecções por STM ΔclpPΔfliD produziram sinais clínicos mais brandos em comparação à STM, e alta produção de IL22 em 7 dpi. Enquanto que SE ΔclpPΔfliD desencadeou sinais clínicos semelhantes aos induzidos por SE, porém, com níveis mais elevados de IL22 e IL18, porém com repressçao de CCl4, CXCLi2 e IL17 em no intestino no início da infecção. Ao que tudo indica a maior produção de flagelina por ambas as estirpes mutantes alteraram a patogenicidade, possivelmente por alterarem a ativação e modulação do sistema imune da ave. Salmonella Enteritidis and Salmonella Typhimurium cause infections in humans and animals that are often associated with extensive intestinal colonization and faecal shedding. The presence of flagellar structure in the pathogen is related to the induction of intestinal inflammation and attenuation of systemic infection in the host. On the other hand, the absence of flagellin results in severe systemic infection as a result of mild inflammatory intestinal responses provoked by aflagellated strains. The hypothesis that higher flagellin production by Salmonella strains could induce immunogenic response during infection in chickens was evaluated in the present study. To investigate the consequences of flagellin overproduction, strains of Salmonella Enteritidis and Typhimurium containing clpP and fliD deletions (which lead to flagellin overexpression) were constructed, and pathogenicity and immunogenicity were compared with their respective wild-type strains in infected chickens. The results suggested that the increase in flagellin synthesis by SE ΔclpPΔfliD and STM ΔclpPΔfliD culminates in a deficit in the bacterial multiplication rate. However, that changes did not interfere with the capacity for caecal colonization and faecal excretion of mutant strains. The same was observed in the liver and spleen, but after 14 dpi, mutant strains tend to be eliminated from these organs. Even with higher flagellin synthesis, the mutant strains recruited similar amounts of lymphocytes and macrophages in the caecal tonsil, spleen and liver than wild-type strains. and high IL22 production at 7 dpi. While SE ΔclpPΔfliD triggered clinical signs similar to those induced by SE, but with higher levels of IL22 and IL18, but with repression of CCl4, CXCLi2 and IL17 in the intestine at the beginning of the infection. Apparently, the higher production of flagellin by both mutant strains altered the pathogenicity, possibly by altering the activation and modulation of the chicken's immune system. 2016/18340-0 2018/04883-8

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No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_rosimeri_zamboni.pdf: 2742746 bytes, checksum: 1fee1b1f72a4517b1d9f1851082645a5 (MD5) Previous issue date: 2020-02-28 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES A avicultura brasileira é classificada em industrial e alternativa, de acordo com o sistema de produção utilizado. A avicultura industrial consiste em um sistema intensivo de produção, enquanto a avicultura alternativa ou colonial é baseada em sistemas de criação semi-intensivos (galinha caipira industrial) ou extensivos (galinha de fundo de quintal). Nas criações alternativas as aves são consideradas mais adaptadas ao modo de criação livre, utilizando pouca ou nenhuma instalação e baixo controle sanitário, tornando esses animais e o ambiente no qual vivem potenciais reservatórios e fontes de infecção para diversos patógenos. Assim, o objetivo desta tese foi determinar as principais doenças que ocorrem em galinhas domésticas criadas em sistemas alternativos no sul do Brasil. Foram, portanto, incluídos quatro trabalhos científicos nesta tese. No primeiro artigo foi realizado um levantamento nos arquivos do Laboratório Regional de Diagnóstico da Faculdade de Veterinária da Universidade Federal de Pelotas (LRD/FV/UFPel), sendo selecionados os protocolos de necropsia de galinhas domésticas (Gallus gallus domesticus) de criações alternativas, encaminhadas de janeiro de 2000 a dezembro de 2019. Dos 565 materiais correspondentes a cadáveres e órgãos de galinhas domésticas, 229 aves foram oriundas de criações alternativas. Destas, 203/229 (88,64%) casos tinham diagnóstico conclusivo e em 26/229 (11,36%) o diagnóstico foi inconclusivo. Este estudo demonstrou que as doenças infecciosas corresponderam a 88,18% (179/203) dos diagnósticos em galinhas de criação colonial no LRD/FV/UFPel nos últimos 20 anos. As causas bacterianas foram as mais frequentes, com 79 casos (38,92%), seguidas das doenças parasitárias com 59 (29,06%) casos e, doenças virais com 29 (14,29%) diagnósticos. Dentre as doenças bacterianas a salmonelose aviária foi o diagnóstico de maior ocorrência (26/79), com 22/26 casos de tifo aviário (Salmonella Gallinarum) e 4/26 de pulorose (S. Pullorum). No segundo artigo foi realizada uma pesquisa de Salmonella spp. em galinhas de criação colonial nos municípios de Pelotas e Piratini, no estado do Rio Grande do Sul. Foram realizadas análises microbiológicas e moleculares, de amostras de necropsia encaminhadas ao LRD/FV/UFPel e suabes cloacais coletados em criações avícolas alternativas. Das 12 amostras analisadas de necropsia e dos 136 pools coletados de galinhas coloniais, foram confirmadas pela técnica de PCR, 12 amostras positivas para Salmonella spp., sendo 11 confirmadas dos isolados de órgãos e uma dos suabes cloacais. Na análise microbiológica dessas amostras, 10 corresponderam a S. Gallinarum e duas a S. Pullorum. No terceiro artigo descreveuse um surto de aspergilose em aves de criação colonial na região sul do Rio Grandedo Sul, destacando os aspectos epidemiológicos e patológicos dessa patologia. E por fim, no quarto artigo relatou-se a ocorrência de dois surtos de histomoníase como causa de morte em aves oriundas de criações coloniais dos municípios de Pelotas e Santa Vitória do Palmar, no estado do Rio Grande do Sul. Dentre todas as patologias discutidas nesta tese o sistema de criação alternativo e o manejo sanitário inadequado, tanto das aves quanto do ambiente, foram considerados os principais fatores relacionados à ocorrência dessas enfermidades. Brazilian aviculture is classified as industrial and alternative, according to the production system used. Industrial aviculture consists of an intensive production system, while alternative or colonial poultry farming is based on semi-intensive (industrial free-range chicken) or extensive (backyard chicken) systems. In alternative breeding, poultry are considered more adapted to the free-breeding mode, using little or no installation and low sanitary control, making these animals and the environment in which potential reservoirs and sources of infection live for various pathogens. Thus, the objective of this thesis was to determine the main diseases that occur in poultry reared in alternative systems in southern Brazil. Therefore, four scientific papers were included in this thesis. In the first article, a survey was carried out in the archives of the Laboratório Regional de Diagnóstico of the Faculdade de Veterinária of the Universidade Federal de Pelotas (LRD/FV/UFPel), and the necropsy protocols of domestic chickens (Gallus gallus domesticus) of alternative creations were selected, forwarded from january 2000 to december 2019. Of the 565 materials corresponding to body and organs of domestic chickens, 229 birds came from alternative breeding. Of these, 203/229 (88.64%) cases had a conclusive diagnosis and in 26/229 (11,36%) the diagnosis was inconclusive. This study demonstrated that infectious diseases accounted for 88, 18% (179/203) of diagnoses in colonial hens in LRD/FV/UFPel in the last 20 years. Bacterial causes were the most frequent, with 79 cases (38,92%), followed parasitic diseases with 59 (29.06%) cases, and viral diseases with 29 (14.29%) diagnoses. Among the bacterial diseases, salmonellosis was the most common diagnosis (26/79), with 22/26 cases of fowl typhoid (Salmonella Gallinarum) and 4/26 cases of pullorum disease (S. Pullorum). In the second article, a survey of Salmonella spp. in colonial hens in the municipalities of Pelotas and Piratini, in the state of Rio Grande do Sul. For this study, microbiological and molecular analyzes were performed, of necropsy samples sent to LRD/FV/UFPel and of swabs collected in alternative poultry farms. Of the 12 analyzed necropsy samples and 136 pools collected from colonial hens, 12 positive samples for Salmonella spp. were confirmed by the PCR, 11 of which were confirmed from organ isolates and one from cloacal swabs. In the microbiological analysis of these samples, 10 corresponded to S. Gallinarum and two to S. Pullorum. In the third article an outbreak of aspergillosis in birds of colonial breeding in the southern region of Rio Grande do Sul was described, highlighting the epidemiological and pathological aspects. Finally, in the fourth article, two outbreaks of histomoniasis were reported as a cause of death in birds from colonial farms in the municipalities ofPelotas and Santa Vitória do Palmar, in the state of Rio Grande do Sul. Among all the pathologies discussed in this thesis, the alternative breeding system and inadequate sanitary management, both for poultry and the environment, were considered the main factors related to the occurrence of these diseases.

The objective of this study was to investigate the sanitary and management characteristics of live-bird resellers as well as identify and undertake an antigenic characterization of Salmonella enterica and its sensitivity to antimicrobials. Structured questionnaires were applied and 627 samples were collected from the cages, consisting 209 samples of excreta, 209 of feed and 209 drinker swabs. These were processed by conventional bacteriology. The obtained isolates were subjected to the susceptibility test and to 12 antimicrobial tests by the disk diffusion method. Of the studied resellers, 91.7% house Gallus gallus domesticus, together with other animal species; sell birds with little zoosanitary documentation; have unsatisfactory active surveillance; and use and sell antimicrobials indiscriminately. The presence of Salmonella enterica was detected in 1.4% (9/627) of the samples analyzed in the cages, with 1.9% (4/209) found in excreta, 0.95% (2/209) in feed and in 1.4% (3/209) in drinker swabs. These were characterized antigenically as Salmonella Heidelberg, Gallinarum, Risen, Ndolo, Saint Paul, Mbandaka and subsp enterica O:6,7. When susceptibility to antimicrobials was determined, 44.4% resistance (4/9) was detected for trimethoprim-sulfamethoxazole, 33.3% (3/9) for enrofloxacin, 22.2% (2/9) for ciprofloxacin, ceftiofur and amoxicillin and 11.1% (1/9) for tetracycline and fosfomycin. Salmonella Heidelberg, as well as serovars Gallinarum, Risen, Saint Paul and Mbandaka, showed resistance to at least one of the tested antimicrobials. Trimethoprim-sulfamethoxazole and enrofloxacin were the antimicrobials that showed the least efficacy. Serovars such as Heidelberg, Gallinarum and Mbandaka have multiresistance to antimicrobials commonly used in human and veterinary medicine, implying potential risks to One Health. Resumo Objetivou-se com este trabalho investigar as características sanitárias e de manejo das revendas de aves vivas, bem como a identificação e caracterização antigênica de Salmonella enterica e sua sensibilidade a antimicrobianos. Foram aplicados questionários estruturados, além de 627 amostras coletadas nas gaiolas, sendo 209 de excretas, 209 de ração e 209 suabes de bebedouros. Essas amostras foram processadas por bacteriologia convencional. Os isolados obtidos foram submetidos ao teste de suscetibilidade e a 12 antimicrobianos pelo método de difusão em disco. Verificou-se que 91,7% das revendas estudadas alojam Gallus gallus domesticus juntamente a outras espécies animais, comercializam aves com escassa documentação zoosanitária, a vigilância ativa é insatisfatória e utilizam e comercializam antimicrobianos de forma indiscriminada. Detectou-se a presença da Salmonella enterica em 1,4% (9/627) das amostras analisadas nas gaiolas, sendo 1,9% (4/209) em excretas, 0,95% (2/209) em ração e em 1,4% (3/209) em suabes de bebedouros, as quais foram caracterizadas, antigenicamente, como Salmonella Heidelberg, Gallinarum, Risen, Ndolo, Saint Paul, Mbandaka e subesp enterica O:6,7. Na determinação da suscetibilidade aos antimicrobianos, obteve-se resistência de 44,4% (4/9) para Trimetoprim-sulfametoxazol, 33,3% (3/9) para enrofloxacina, 22,2% (2/9) para ciprofloxacina, ceftiofur, amoxicilina e 11,1% (1/9) para tetraciclina e fosfomicina. Salmonella Heidelberg, além dos sorovares Gallinarum, Risen, Saint Paul e Mbandaka, todos mostraram resistência a pelo menos um dos antimicrobianos testados. Trimetoprim-sulfametoxazol e enrofloxacina foram os antimicrobianos que apresentaram menor eficácia. Sorovares como Heidelberg, Gallinarum e Mbandaka apresentam multirresistência aos antimicrobianos de uso comum em medicina humana e veterinária, o que implica em riscos potenciais para saúde única.

Orientador: Prof. Dr. Luciano dos Santos Bersot Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor Palotina, Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal. Defesa : Palotina, 27/10/2020 Inclui referências Área de concentração: Saúde Animal Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito do modulador biológico BAC TRAT 2A® adicionado na cama frente a sobrevivência e multiplicação de Salmonella sp. durante o alojamento de frangos de corte em dois estudos: um em infectório experimental, realizado entre fevereiro e agosto de 2019 e outro a campo, realizado entre março de 2018 e agosto de 2019. O primeiro estudo foi subdividido em duas partes, uma primeira com dois tratamentos: E1T1- sem inoculação de Salmonella Heidelberg e sem inoculação de BAC TRAT A® na cama e E1T2 - sem inoculação de Salmonella Heidelberg e com inoculação de BAC TRAT A® na cama; a segunda parte também com dois tratamentos: E2T1 - com inoculação de Salmonella Heidelberg e sem inoculação de BAC TRAT A® na cama e E2T2 - com inoculação de Salmonella Heidelberg e com inoculação de BAC TRAT A® na cama. O segundo estudo, realizado a campo, foi composto por dois barracões, sendo que a cama utilizada no barracão 1 foi o controle negativo (C) e a cama do barracão 2 foi o tratamento (T), sendo tratada com o modulador biológico BAC TRAT A®. Além da avaliação do efeito do modulador biológico, no segundo estudo ainda foram avaliados perfil genotípico e fenotípico dos isolados obtidos, além da análise de resistência antimicrobiana. No primeiro estudo, o modulador biológico apresentou resultados positivos apenas na primeira parte, observando-se uma redução significativa nas contagens de Salmonella tanto para a cama (P

Para alcançar controle da contaminação por Salmonella em carcaças suínas, intervenções na produção primária precisam ser melhor compreendidas. Estratégias complementares requerem não só pesquisas acerca da sua efetividade, mas também dos custos implicados no uso de tais tecnologias. Para tanto, foi avaliada a razão de custo-efetividade incremental de dois tratamentos para reduzir a soroprevalência de Salmonella em rebanhos suínos comerciais. O uso de um prebiótico e de uma vacina foram comparados com um controle sem tratamento. Cada estratégia foi aplicada em três lotes de suínos em um sistema comercial de integração. Os animais foram acompanhados da maternidade até o abate e suas sorologias no dia do alojamento na terminação e quatro dias antes do abate foram avaliadas. Também, em cada estratégia, amostras de suabe de carcaça foram coletadas para avaliação da contaminação superficial. A soroprevalência no dia do alojamento na terminação foi menor do que 3% em todos os grupos, sendo que nos grupos controle e vacina a soroprevalência aumentou mais de 90 pontos percentuais quatro dias antes do abate. Apenas o uso do prebiótico levou a um efeito significativo na redução da Soroprevalência pré-abate (49 pontos percentuais), quando comparado com o controle. A contaminação das carcaças no grupo prebiótico foi 0%, 18,33% no controle e 29,16 no grupo vacinado. Assim, apenas o prebiótico foi capaz de reduzir a soroprevalência nos rebanhos estudados com razão incremental de custo-efetividade de 1,92 USD para redução de 10 pontos percentuais na soroprevalência por tonelada de carcaça. To achieve control of Salmonella contamination in pig carcasses, on-farm measures need to be better understood. Complementary strategies require research not only on their effectiveness but also on their financial impact. In this study, we evaluated the incremental cost-effectiveness ratio of two treatments for reducing Salmonella seroprevalence in commercial swine herds. Pigs treated with a prebiotic or a vaccine were studied and compared with pigs in an untreated control group. Each strategy was applied to three batches of pigs in a commercial integration system; the animals were followed from farrowing to the slaughterhouse, and their serologies upon arrival at finishing farms and before slaughter were evaluated. Additionally, carcass surface contamination was assessed for each strategy. The seroprevalence upon arrival at the finishing farm was lower than 3% in all groups. In the control and vaccine groups, the seroprevalence increased by more than 90 percentage points from the day of arrival at the finishing farm to four days before slaughter. Only the prebiotic treatment yielded a significant effect on preslaughter seroprevalence (a 49 percentage points reduction from that in the control). Carcass contamination was 0% in the prebiotic group, 18.33% in the control group and 29.16% in the vaccine group. Only prebiotics significantly reduced the seroprevalence of Salmonella in the studied herds, and the incremental cost-effectiveness ratio associated with prebiotic use was 1.92 USD to reduce seroprevalence by 10 percentage points per carcass ton.

A produção e o modo de comercialização de galinhas caipiras em feiras são importantes fatores na transmissão de infecções como a salmonelose ao ser humano. Este trabalho foi realizado com o objetivo de pesquisar a ocorrência de Salmonella enterica em produtos avícolas comercializados em feiras livres de Goiânia dos quais foram colhidas 100 amostras de carcaças de frangos, 100 de excretas e 50 dúzias de ovos. Foram empregadas a pesquisa bacteriológica, a sorotipificação e a determinação do perfil de resistência aos antimicrobianos e a análise do perfil genético dos isolados. Houve o isolamento em seis amostras das excretas; cinco das carcaças e três dos ovos. Quanto à sorotipificação foram identificados na carcaça Salmonella Cerro, Salmonella Panama, Salmonella Corvallis além das amostras antigênicas O:4,5; O:3,10 e uma cepa rugosa; nas amostras de excretas Salmonella Typhimurium, S. Agona, S. Anatun e uma cepa rugosa e nas amostras de ovos Salmonella Corvallis. Na análise do perfil de resistência foram testados 12 antibióticos; para os isolados das carcaças dois não apresentaram resistência a nenhum antibiótico, dois a dois antibióticos, um a apenas um antibiótico e outro apresentou multirresistência às drogas; os isolados das excretas três foram sensíveis a todos os antibióticos, um isolado a apenas um antibiótico e outro com multirresistência (três antibióticos), enquanto que os três isolados dos ovos não apresentaram resistência a nenhum dos antibióticos testados. O resultado da Reação em Cadeia da Polimerase – PCR, além de confirmar a presença de Salmonella nas mostras positivas na bacteriologia convencional identificou ainda a presença em três amostras de excretas, duas de carcaças e três de ovos. Ainda pela PCR foi detectada a presença do gene blaTEM em quatro amostras, o gene qnrS em cinco amostras e o aadA2 em nenhuma das amostras inicialmente positivas para Salmonella spp. Por meio da Eletroforese em Campo Pulsado – PFGE, foi possível identificar que quatro isolados de Salmonella Corvallis fazem parte do mesmo grupo clonal assim como os dois de S. Anatum, enquanto que os demais sorotipos identificados pertencem a diferentes grupos clonais entre si e dos anteriormente citados. A partir destes resultados infere-se que o sistema de produção tipo caipira representa um importante papel na epidemiologia da salmonelose, mesmo com baixa ocorrência pode se apresentar como mantenedor ou disseminador de diversos sorovares de Salmonella enterica, indicando preocupação para a avicultura industrial e para a saúde pública. The production and way of selling free-range chickens in fairs are important factors in the transmission of infections such as salmonellosis to humans. This work was carried out with the aim of investigating the occurrence of Salmonella enterica in poultry products sold at free fairs in Goiânia from which 100 samples of chicken carcasses, 100 samples of excretes and 50 dozen eggs were collected. In this study were used bacteriological research, serotyping and determination of antimicrobial resistance profile, and analysis of the genetic profile of the isolates. There was isolation in six excrete samples; five in the carcasses and three in the eggs. Regarding serotyping, there were identified in the carcass Salmonella Cerro, Salmonella Panama, Salmonella Rugosa, Salmonella Corvallis, besides the antigenic samples O:4,5; O:3,10 in the samples of excretes were identified Salmonella Typhimurium, Salmonella Agona, Salmonella Rugosa, Salmonella Anatun and a rough strain; and Salmonella Corvallis in the egg samples. In the analysis of the Resistance Profile 12 antibiotics were tested. For the isolates from the carcasses two did not present resistance to any antibiotics, two showed resistance to two antibiotics, one to just one antibiotic and another one presented multiresistance to drugs. The isolates from excretes three were sensitive to all antibiotics, one isolated to only one antibiotic and one with multiresistance (three antibiotics), while the three isolates from the eggs did not present resistance to any of the antibiotics tested. The result of polymerase chain reaction – PCR, besides confirming the presence of Salmonella in the positive samples from conventional bacteriology also identified the presence in three excrete samples, two carcasses and three of eggs. In addition, PCR also detected the presence of the blaTEM gene in four samples, the qnrS gene in five samples and aadA2 in any of the samples initially positive for Salmonella spp. Using Electrophoresis in Pulsed Field - PFGE, it was possible to identify that four Salmonella Corvallis isolates are part of the same clonal group as well as the two of S. Anatum, while the other identified serotypes belong to different clonal groups among themselves and those previously mentioned. From these results, it is infered that the system of free-range chicken productions, represents an important role in the epidemiology of salmonellosis, either as maintainer or as a disseminator of several Salmonella Enterica serovars, representing a concern for industrial poultry farming and public health. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES