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23 results on '"Sánchez Plà A"'

3. A mixture of four dietary fibres ameliorates adiposity and improves metabolic profile and intestinal health in cafeteria-fed obese rats: an integrative multi-omics approach

Author

Estanyol-Torres, Núria, Domenech-Coca, Cristina, González-Domínguez, Raúl, Miñarro, Antonio, Reverter, Ferran, Moreno-Muñoz, Jose Antonio, Jiménez, Jesús, Martín-Palomas, Manel, Castellano-Escuder, Pol, Mostafa, Hamza, García-Vallvé, Santi, Abasolo, Nerea, Rodríguez, Miguel A., Torrell, Helena, del Bas, Josep M, Sanchez-Pla, Alex, Caimari, Antoni, Mas-Capdevila, Anna, Andres-Lacueva, Cristina, and Crescenti, Anna

Published
2023
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4. Epigenetic landscape in the kick-and-kill therapeutic vaccine BCN02 clinical trial is associated with antiretroviral treatment interruption (ATI) outcome

Author

Oriol-Tordera, Bruna, Esteve-Codina, Anna, Berdasco, María, Rosás-Umbert, Míriam, Gonçalves, Elena, Duran-Castells, Clara, Català-Moll, Francesc, Llano, Anuska, Cedeño, Samandhy, Puertas, Maria C., Tolstrup, Martin, Søgaard, Ole S., Clotet, Bonaventura, Martínez-Picado, Javier, Hanke, Tomáš, Combadiere, Behazine, Paredes, Roger, Hartigan-O'Connor, Dennis, Esteller, Manel, Meulbroek, Michael, Calle, María Luz, Sanchez-Pla, Alex, Moltó, José, Mothe, Beatriz, Brander, Christian, and Ruiz-Riol, Marta

Published
2022
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6. Distance based Inference for Gene-Ontology Analysis of Microarray Experiments

Author

Sanchez-Pla, Alex, Salicru, Miquel, and Ocanya, Jordi

Subjects
Quantitative Biology - Genomics, Quantitative Biology - Quantitative Methods
Abstract

The increasing availability of high throughput data arising from gene expression studies leads to the necessity of methods for summarizing the available information. As annotation quality improves it is becoming common to rely on the Gene Ontology (GO) to build functional profiles that characterize a set of genes using the frequency of use of each GO term or group of terms in the array. In this work we describe a statistical model for such profiles, provide methods to compare profiles and develop inferential procedures to assess this comparison. An R-package implementing the methods is available., Comment: Submitted to Journal of Statistical Planning and Inference

Published
2006

15. Integrative Multi-omics Analysis to Characterize Human Brain Ischemia

Author

Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Economía y Competitividad (España), Generalitat de Catalunya, European Commission, Ramiro Pascual, Laura, García-Berrocoso, Teresa, Briansó, Ferran, Goicoechea, Leire, Simats, Alba, Llombart, Víctor, Gonzalo, Ricardo, Hainard, Alexandre, Martínez-Sáez, Elena, Canals, Francesc, Sanchez, Jean-Charles, Sánchez-Plà, Álex, Montaner, Joan, Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Economía y Competitividad (España), Generalitat de Catalunya, European Commission, Ramiro Pascual, Laura, García-Berrocoso, Teresa, Briansó, Ferran, Goicoechea, Leire, Simats, Alba, Llombart, Víctor, Gonzalo, Ricardo, Hainard, Alexandre, Martínez-Sáez, Elena, Canals, Francesc, Sanchez, Jean-Charles, Sánchez-Plà, Álex, and Montaner, Joan

Abstract

Stroke is a major cause of death and disability. A better comprehension of stroke pathophysiology is fundamental to reduce its dramatic outcome. The use of high-throughput unbiased omics approaches and the integration of these data might deepen the knowledge of stroke at the molecular level, depicting the interaction between different molecular units. We aimed to identify protein and gene expression changes in the human brain after ischemia through an integrative approach to join the information of both omics analyses. The translational potential of our results was explored in a pilot study with blood samples from ischemic stroke patients. Proteomics and transcriptomics discovery studies were performed in human brain samples from six deceased stroke patients, comparing the infarct core with the corresponding contralateral brain region, unveiling 128 proteins and 2716 genes significantly dysregulated after stroke. Integrative bioinformatics analyses joining both datasets exposed canonical pathways altered in the ischemic area, highlighting the most influential molecules. Among the molecules with the highest fold-change, 28 genes and 9 proteins were selected to be validated in five independent human brain samples using orthogonal techniques. Our results were confirmed for NCDN, RAB3C, ST4A1, DNM1L, A1AG1, A1AT, JAM3, VTDB, ANXA1, ANXA2, and IL8. Finally, circulating levels of the validated proteins were explored in ischemic stroke patients. Fluctuations of A1AG1 and A1AT, both up-regulated in the ischemic brain, were detected in blood along the first week after onset. In summary, our results expand the knowledge of ischemic stroke pathology, revealing key molecules to be further explored as biomarkers and/or therapeutic targets. Graphical abstract: [Figure not available: see fulltext.].

Published
2021

16. Covid-19: la malinterpretación de los datos de la pandemia daña la confianza del público

Author

Saez, Marc, Figueiras Guzmán, Adolfo, Alústiza Galarza, Ainhoa, Ruiz Cantero, Alberto, Medeiros de Figueiredo, Alexandre, Sánchez-Plà, Álex, Forte, Anabel, Cabrera-León, Andrés, Daponte Codina, Antonio, Tobías, Aurelio, Sánchez-Cantalejo Garrido, Carmen, Tebé, Cristian, Fernández Martínez, Daniel, Blanco de Tena-Dávila, David, Royé, Dominic, Cobo Valeri, Erik, Molist, Gemma, Gómez Melis, Guadalupe, Mateo Rodríguez, Inmaculada, Casillas, Jorge, Mateu, Jorge, Martínez, José A., González Alastrué, José Antonio, Caylà, Joan A., Guàrdia Olmos, juan, Barceló, Maria Antònia, Rueda García, María del Mar, Casals, Martí, Fuente Sánchez, Miguel de la, Fonseca i Casas, Pau, Macip, Salvador, Trias-Llimós, Sergi, Riffe, Tim, Cortés, Ulises, Consejo Superior de Investigaciones Científicas (España), Universidad de Valencia, Universidad de Barcelona, Universitat Oberta de Catalunya, Universidad de Granada, Universidad de Vic, Universitat Politècnica de Catalunya, Universidad Internacional de Cataluña, and Universidad de Santiago de Compostela

Subjects
Pandemia, COVID-19
Abstract

Dos cartas publicadas en The Lancet y The Lancet Public Health en los últimos meses defienden la necesidad de evaluar de forma independiente la respuesta española ante la covid-19. Estamos de acuerdo, pero nos gustaría complementarlas con tres puntos que nos acercan a la ciencia abierta. Nos referimos a la confusión terminológica, la calidad de los datos y su disponibilidad. Según las cartas, una de las razones por las que España se ha visto más afectada por la pandemia es la poca confianza que hay en el asesoramiento científico. Creemos que gran parte de esta desconfianza está ocasionada por una importante confusión terminológica. Esta se produce en prácticamente todos los medios de comunicación (con notables excepciones), y conduce a una malinterpretación de los datos y, como consecuencia, a una pérdida de confianza en los sistemas de información sanitaria, en la investigación y la epidemiología., Consejo Superior de Investigaciones Científicas aporta financiación como institución fundacional de The Conversation ES. Universitat de València, Universitat de Barcelona, UOC - Universitat Oberta de Catalunya, Universidad de Granada, Universitat de Vic - Universitat Central de Catalunya , Universitat Politècnica de Catalunya · BarcelonaTech, Universitat Internacional de Catalunya y Universidade de Santiago de Compostela aportan financiación como miembros de The Conversation ES.

Published
2020

17. Covid-19: la malinterpretación de los datos de la pandemia daña la confianza del público

Author

Consejo Superior de Investigaciones Científicas (España), Universidad de Valencia, Universidad de Barcelona, Universitat Oberta de Catalunya, Universidad de Granada, Universidad de Vic, Universitat Politècnica de Catalunya, Universidad Internacional de Cataluña, Universidad de Santiago de Compostela, Saez, Marc, Figueiras Guzmán, Adolfo, Alústiza Galarza, Ainhoa, Ruiz Cantero, Alberto, Medeiros de Figueiredo, Alexandre, Sánchez-Plà, Álex, Forte, Anabel, Cabrera-León, Andrés, Daponte Codina, Antonio, Tobías, Aurelio, Sánchez-Cantalejo Garrido, Carmen, Tebé, Cristian, Fernández Martínez, Daniel, Blanco de Tena-Dávila, David, Royé, Dominic, Cobo Valeri, Erik, Molist, Gemma, Gómez Melis, Guadalupe, Mateo Rodríguez, Inmaculada, Casillas, Jorge, Mateu, Jorge, Martínez, José A., González Alastrué, José Antonio, Caylà, Joan A., Guàrdia Olmos, juan, Barceló, Maria Antònia, Rueda García, María del Mar, Casals, Martí, Fuente Sánchez, Miguel de la, Fonseca i Casas, Pau, Macip, Salvador, Trias-Llimós, Sergi, Riffe, Tim, Cortés, Ulises, Consejo Superior de Investigaciones Científicas (España), Universidad de Valencia, Universidad de Barcelona, Universitat Oberta de Catalunya, Universidad de Granada, Universidad de Vic, Universitat Politècnica de Catalunya, Universidad Internacional de Cataluña, Universidad de Santiago de Compostela, Saez, Marc, Figueiras Guzmán, Adolfo, Alústiza Galarza, Ainhoa, Ruiz Cantero, Alberto, Medeiros de Figueiredo, Alexandre, Sánchez-Plà, Álex, Forte, Anabel, Cabrera-León, Andrés, Daponte Codina, Antonio, Tobías, Aurelio, Sánchez-Cantalejo Garrido, Carmen, Tebé, Cristian, Fernández Martínez, Daniel, Blanco de Tena-Dávila, David, Royé, Dominic, Cobo Valeri, Erik, Molist, Gemma, Gómez Melis, Guadalupe, Mateo Rodríguez, Inmaculada, Casillas, Jorge, Mateu, Jorge, Martínez, José A., González Alastrué, José Antonio, Caylà, Joan A., Guàrdia Olmos, juan, Barceló, Maria Antònia, Rueda García, María del Mar, Casals, Martí, Fuente Sánchez, Miguel de la, Fonseca i Casas, Pau, Macip, Salvador, Trias-Llimós, Sergi, Riffe, Tim, and Cortés, Ulises

Abstract

Dos cartas publicadas en The Lancet y The Lancet Public Health en los últimos meses defienden la necesidad de evaluar de forma independiente la respuesta española ante la covid-19. Estamos de acuerdo, pero nos gustaría complementarlas con tres puntos que nos acercan a la ciencia abierta. Nos referimos a la confusión terminológica, la calidad de los datos y su disponibilidad. Según las cartas, una de las razones por las que España se ha visto más afectada por la pandemia es la poca confianza que hay en el asesoramiento científico. Creemos que gran parte de esta desconfianza está ocasionada por una importante confusión terminológica. Esta se produce en prácticamente todos los medios de comunicación (con notables excepciones), y conduce a una malinterpretación de los datos y, como consecuencia, a una pérdida de confianza en los sistemas de información sanitaria, en la investigación y la epidemiología.

Published
2020

23. [Characterization of patients with rheumatoid arthritis according to the health care level].

Author

Roig Vilaseca D, Núñez Juárez M, Núñez Juárez E, Del Val García JL, Sánchez Plà A, and Bonet Llorach M

Abstract

Objective: To characterize rheumatoid arthritis patients seen in Rheumatology Units at different health care levels., Material and Methods: Questionnaire and clinical examination of rheumatoid arthritis patients seen as outpatients in Rheumatology Units from Primary Care, county Hospitals and Reference Hospitals. Demographic, social, labour and disease data were collected. Statistical study included a description of the variables and a multiple correspondence analysis to define patient profiles., Results: Eight hundred and twelve patients with rheumatoid arthritis were included. There were significant differences in patient profiles at the different care level. In Primary Care, patients were older, with basic studies, and with short duration and generally mild rheumatoid arthritis. In local hospitals the typical patient was a man, qualified worker, with low income, and an erosive disease with extraarticular manifestations. At reference Hospitals prevailing patients were young women with a long duration disease and requiring biological therapy., Conclusion: There are significant differences in rheumatoid arthritis patient profiles at different health care levels., (Copyright © 2008 Elsevier España, S.L. All rights reserved.)

Published
2009
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