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RESUMO Neste trabalho se avaliou o padrão espacial de divergência, em populações de Eugenia dysenterica, com a finalidade de conservar esta espécie nativa. Verificou-se através da autocorrelação espacial das freqüências alélicas, com sete marcadores microssatélites, contendo 73 alelos, a divergência genética e o padrão da variabilidade alélica espacial das populações. Utilizou-se os índices I de Moran estimados em quatro classes de distâncias geográficas. A correlação entre matriz de distâncias geográficas e genéticas (r=0,872), indica que as distâncias geográficas possuem um padrão espacial de variabilidade. O correlograma mostrou que a divergência genética está estruturada no espaço em um padrão clinal de variação. Observou-se um fluxo a curtas distâncias e deriva genética dentro das populações locais, sugerindo desta forma o modelo de isolamento-por-distância.

Dipteryx alata (Fabaceae) is a threatened tropical tree of the Brazilian Savanna. Due to deforestation of its biome, many individuals and populations are now spatially isolated in forest fragments, pastures, and along roads. Plans for in situ and ex situ conservation of the species are urgently needed. To support conservation, the mating system and pollen dispersal patterns must be better understood as they determine the levels of genetic diversity, inbreeding, and effective size of seed generations. Microsatellite were used to investigated the mating system, pollen dispersal, genetic diversity, spatial genetic structure (SGS), and inbreeding in isolated trees in pastures and along roads from two populations with different densities in the Brazilian Savanna. Our aim is to determine the potential of these trees to contribute to seed collection for genetic conservation. We found that the species presents a mixed mating system, strong individual variation in outcrossing rate (0.01-1.0), and non-random mating. Low population density resulted in lower levels of outcrossing (tm = 0.45) and mating among relatives (tm - ts = 0.12), but longer pollen dispersal distances (δ = 6,572 m) than in the higher density populations (tm = 0.90, tm - ts = 0.26, δ = 1,395 m). Mating among relatives was explained by SGS detected in the populations, associated with near-neighbor pollinator foraging behavior. Correlated mating indicates that a low effective number of pollen donors (1.5-10.3) fertilized the trees. Thus, open-pollinated seedling families present mixtures of different levels of relatedness and inbreeding. Our results are discussed in light of strategies for in and ex situ conservation.

The aim of this study was to evaluate the genetic diversity among native plants and some individuals obtained from crosses with unknown genealogy of C. walkeriana as well as C. loddigesii and C. nobilior and to advance towards solving the question of the genetic purity of the “Orchidglade” clone. Eight microsatellite loci were used to evaluate the genetic diversity between individuals of C. walkeriana. Microsatellites were not efficient in determining the genetic diversity between C. walkeriana groups (native and improved). The difficulty in determining the genetic distance between the different genotypes can be attributed to the complex mating system of the species and to a weak genetic barrier that facilitates the development of hybrids. Our analysis revealed smaller genetic distances between the “Orchidglade”, “Equilab”, “Kenny” and “Pedentive” clones and the species C. loddigesii and C. nobilior. Native C. walkeriana plants were genetically more distant from the C. loddigesii and C. nobilior species.

The tall coconut palm was introduced in Brazil in 1553, originating from the island of Cape Verde. The aim of the presentstudy was to evaluate the genetic diversity of ten populations of Brazilian tall coconut by 13 microsatellite markers. Samples werecollected from 195 individuals of 10 different populations. A total of 68 alleles were detected, with an average of 5.23 alleles perlocus. The mean expected and observed heterozygosity value was 0.459 and 0.443, respectively. The number of alleles per populationranged from 36 to 48, with a mean of 40.9 alleles. We observed the formation of two groups, the first formed by the populationsof Baía Formosa, Georgino Avelino and São José do Mipibu, and the second by the populations of Japoatã, Pacatuba and Praia doForte. These results reveal a high level of genetic diversity in the Brazilian populations.

The study of the genetic structure of wild plant populations is essential for their management and conservation. Several DNA markers have been used in such studies, as well as isozyme markers. In order to provide a better comprehension of the results obtained and a comparison between markers which will help choose tools for future studies in natural populations of Oryza glumaepatula, a predominantly autogamous species, this study used both isozymes and microsatellites to assess the genetic diversity and genetic structure of 13 populations, pointing to similarities and divergences of each marker, and evaluating the relative importance of the results for studies of population genetics and conservation. A bulk sample for each population was obtained, by sampling two to three seeds of each plant, up to a set of 50 seeds. Amplified products of eight SSR loci were electrophoresed on non-denaturing polyacrylamide gels, and the fragments were visualized using silver staining procedure. Isozyme analyses were conducted in polyacrylamide gels, under a discontinuous system, using six enzymatic loci. SSR loci showed higher mean levels of genetic diversity (A=2.83, p=0.71, A P=3.17, Ho=0.081, He=0.351) than isozyme loci (A=1.20, p=0.20, A P=1.38, Ho=0.006, He=0.056). Interpopulation genetic differentiation detected by SSR loci (R ST=0.631, equivalent to F ST=0.533) was lower than that obtained with isozymes (F ST=0.772). However, both markers showed high deviation from Hardy-Weinberg expectations (F IS=0.744 and 0.899, respectively for SSR and isozymes). The mean apparent outcrossing rate for SSR ( =0.14) was higher than that obtained using isozymes ( =0.043), although both markers detected lower levels of outcrossing in Amazonia compared to the Pantanal. The migrant number estimation was also higher for SSR (Nm=0.219) than isozymes (Nm=0.074), although a small number for both markers was expected due to the mode of reproduction of this species, defined as mixed with predominance of self fertilization. No correlation was obtained between genetic and geographic distances with SSR, but a positive correlation was found between genetic and geographic distances with isozymes. We conclude that these markers are divergent in detecting genetic diversity parameters in O. glumaepatula and that microsatellites are powerful for detecting information at the intra-population level, while isozymes are more powerful for inter-population diversity, since clustering of populations agreed with the expectations based on the geographic distribution of the populations using this markerEl estudio de la estructura genética de poblaciones de plantas silvestres es esencial para su manejo y conservación. Varios marcadores de ADN e isoenzimas se han utilizado en este tipo de análisis. Con el fin de proporcionar una mejor comprensión de los resultados obtenidos y saber que marcador codominante elegir para futuros estudios en poblaciones naturales de Oryza glumaepatula, este trabajo busco evaluar y comparar dos marcadores de ADN, isoenzimas y microsatélites, en la diversidad y estructura genética de 13 poblaciones, destacando las similitudes y divergencias de cada marcador, así como la importancia relativa de los resultados en genética de poblaciones y conservación. Para los SSR, ocho loci SSR fueron evaluados, y los fragmentos se visualizaron utilizando el procedimiento de coloración con plata. Los análisis de isoenzimas se realizaron en geles de poliacrilamida, en los seis loci enzimáticos. Los loci SSR mostraron mayores niveles de diversidad genética que los loci isoenzimáticos, en promedio. La diferenciación genética entre los loci SSR (R ST=0.631, equivalente a F ST=0.533) fue inferior a la obtenida con las isoenzimas (F ST=0.772). Ambos marcadores mostraron alta desviación del equilibrio de Hardy-Weinberg (F IS=0.744 y 0.899, respectivamente, para SSR e isoenzimas). La tasa media aparente de cruzamiento para SSR ( =0.14) fue mayor que la obtenida con isoenzimas ( =0.043), aunque ambos marcadores detectaron niveles más bajos en la tasa de fecundación cruzada para la Amazonia, en comparación con la región del Pantanal. La estimación de número de migrantes también fue mayor para los SSR (Nm=0.219) que en isoenzimas (Nm=0.074). No se obtuvo ninguna correlación entre las distancias genéticas y geográficas para los SSR, y para las isoenzimas se obtuvo una correlación positiva entre las distancias genéticas y geográficas. Llegamos a la conclusión de que estos marcadores son divergentes en la detección de los parámetros de la diversidad genética en O. glumaepatula y que los microsatélites son más eficientes para detectar la información a nivel intra-poblacional, mientras que las isoenzimas son más potentes para detectar la diversidad entre poblaciones.

The purpose of this article is to show how quantitative genetics has contributed to the huge genetic progress obtained inplant breeding in Brazil in the last forty years. The information obtained through quantitative genetics has given Brazilian breedersthe possibility of responding to innumerable questions in their work in a much more informative way, such as the use or not of hybridcultivars, which segregating population to use, which breeding method to employ, alternatives for improving the efficiency of selectionprograms, and how to handle the data of progeny and/or cultivars evaluations to identify the most stable ones and thus improverecommendations.

The purpose of this study was to investigate inbreeding depression (DE) in castor bean. From a population derived from the Guarani cultivar, 60 mother plants were sampled. Three types of progenies were obtained from each one: from self-pollination (AU), from crosses (CR) and from open pollination (PL). Grain yield of the progenies was evaluated in two locations. There was a strong interaction of progenies x locations, which led to obtaining estimates within each location. Broad variation was observed in inbreeding depression, with mean values of 6.7% and 13.4%, comparing AU progenies with PL progenies. It was observed that the population has high potential for selecting promising inbred lines. The frequency of mother plants generating progenies with simultaneous high general combination capacity and low inbreeding depression was low. Recurrent selection will increase the occurrence of parent plants associating these two properties, which is necessary for obtaining superior synthetic varieties.

Studies on genetic diversity and genetic structure of natural populations are important in order to define strategies for in situ and ex situ conservation actions and for plant pre-breeding programs. Aiming to assess the genetic diversity and genetic structure of three wild American Oryza species with isozyme markers, 14 populations of the diploid O. glumaepatula (AglAgl), 11 populations of the tetraploid O. grandiglumis (CCDD) and five populations of the also tetraploid O. latifolia (CCDD) were studied. They were all originated from Rio Paraguay hydrographic basin and the Amazon. Four enzymes were used and they gave 40 polymorphic bands. The most polymorphic species was O. glumaepatula, followed by O. latifolia and O. grandiglumis. A cluster analysis with the Jaccard similarity coefficient separated the diploid from the two tetraploid species, and also the two tetraploid species. This separation was also evident on a scatter plot from a principal component analysis, suggesting that they should be treated as two separate species, although further studies are necessary to provide support for this affirmative. The AMOVA analyses showed a high intrapopulational variability for O. latifolia (67.6%) and O. grandiglumis (52.2%), when compared to their interpopulational variability (32.4% and 47.8%, respectively), which suggests the hypothesis of a higher degree of outcrossing events within these species. When studying the correlation between the Jaccard dissimilarity coefficient and geographic distances, a spatial genetic structure was observed for O. glumaepatula only. These results are important for defining strategies of both in situ and ex situ conservation.

A multilocus mixed-mating model was used to evaluate the mating system of a population of Couratari multiflora, an emergent tree species found in low densities (1 individual/10 ha) in lowland forests of central Amazonia. We surveyed and observed phenologically 41 trees in an area of 400 ha. From these, only four mother trees were analyzed here because few of them set fruits, which also suffered high predation. No difference was observed between the population multilocus outcrossing rate (t mp = 0.953 ± 0.040) and the average single locus rate (t sp = 0.968 ± 0.132). The four mother trees were highly outcrossed (t m ~ 1). Two out of five loci showed departures from the Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) expectations, and the same results occurred with the mixed-mating model. Besides the low number of trees analyzed, the proportion of loci in HWE suggests random mating in the population. However, the pollen pool was heterogeneous among families, probably due to both the small sample number and the flowering of trees at different times of the flowering season. Reproductive phenology of the population and the results presented here suggest, at least for part of the population, a long-distance pollen movement, around 1,000 m.Foi utilizado um modelo de cruzamento misto multilocos para analisar o sistema de cruzamento de uma população de Couratari multiflora, espécie arbórea emergente encontrada em baixas densidades (1 indivíduo/10 ha) nas florestas de "terra firme" da Amazônia central. Inventariamos e observamos fenologicamente 41 árvores em uma área de 400 ha. Dessas, somente quatro árvores-mãe foram analisadas, pois poucas árvores produziram frutos, os quais também sofreram alta predação. Não foi observada diferença entre a taxa de cruzamento multilocos (t mp = 0,953 ± 0,040) e a taxa média de loco único (t sp = 0,968 ± 0,132). As quatro árvores-mãe apresentaram alta taxa de cruzamento (t m ~ 1). Dois dos cinco locos analisados mostraram desvios das expectativas do Equilíbrio de Hardy-Weinberg (EHW), e os mesmos resultados ocorreram para o modelo misto de cruzamento. Apesar do baixo número de árvores analisadas, a alta proporção de locos em EHW sugere que a população tenha um sistema de cruzamento aleatório. Entretanto, o conjunto polínico foi heterogêneo entre famílias, provavelmente pelo pequeno número e florescimento das árvores analisadas em diferentes fases da estação de florescimento. A fenologia reprodutiva da população e os resultados apresentados neste estudo sugerem que ao menos parte da população cruza via movimento de pólen de longa distância, em torno de 1.000 m.

O objetivo do trabalho foi relacionar a diversidade genética medida a partir de três diferentes marcadores moleculares, com a variação genética quantitativa de caracteres poligênicos, estimada em ensaio de progênies, sob condições controladas. As progênies, oriundas de dez subpopulações naturais de cagaiteira do sudeste de Goiás, foram avaliadas em experimento em blocos completos casualizados, com quatro repetições e uma planta por parcela. Foram estimadas a herdabilidade ao nível de média de progênies (h mi ²) e o coeficiente de variação genética (CVgi) de cada subpopulação para a altura da planta e o diâmetro do fuste, por quatro anos, bem como para as respectivas taxas de crescimento. Estimativas da diversidade gênica (Hei) e do índice de fixação (f i) foram obtidas com dados de marcadores codominantes e dominantes. Correlação linear e regressão múltipla foram usadas para inferir sobre a associação entre a divergência quantitativa e molecular nos níveis intra e interpopulacional, A fraca correlação entre as medidas de divergência obtidas com marcadores moleculares dominantes e codominantes reduziu a expectativa de correlação positiva entre essas medidas e a diversidade quantitativa. Em geral, não foi confirmada a possibilidade de usar com segurança medidas de divergência molecular intrapopulacional para inferir a variação genética de caracteres quantitativos no nível de precisão que prevaleceu. Com o marcador baseado em maior número de locos (RAPD), verificou-se a possibilidade de uma inferência desse tipo. Em nível interpopulacional, encontrou-se associação mais pronunciada entre a divergência molecular e a quantitativa.

Dipteryx alata is a native fruit tree species of the cerrado (Brazilian savanna) that has great economic potential because of its multiple uses. Knowledge of how the genetic variability of this species is organized within and among populations would be useful for genetic conservation and breeding programs. We used nine simple sequence repeat (SSR) primers developed for Dipteryx odorata to evaluate the genetic structure of three populations of D. alata located in central Brazil based on a leaf sample analysis from 101 adults. The outcrossing rate was evaluated using 300 open-pollinated offspring from 25 seed-trees. Pollen dispersal was measured by parentage analysis. We used spatial genetic structure (SGS) to test the minimal distance for harvesting seeds in conservation and breeding programs. Our data indicate that the populations studied had a high degree of genetic diversity and population structure, as suggested by the high level of divergence among populations . The estimated outcrossing rate suggested a mixed mating system, and the intrapopulation fixation index was influenced by SGS. We conclude that seed harvesting for genetic conservation and breeding programs requires a minimum distance between trees of 196 m to avoid collecting seeds from related seed-trees.

Coconut palms of the Tall group were introduced to Brazil from the Cape Verde Islands in 1553. The present study sought to evaluate the genetic diversity among and within Brazilian Tall coconut populations. Samples were collected of 195 trees from 10 populations. Genetic diversity was accessed by investigating 13 simple sequence repeats (SSR) loci. This provided a total of 68 alleles, ranging from 2 to 13 alleles per locus, with an average of 5.23. The mean values of gene diversity (He) and observed heterozygosity (Ho) were 0.459 and 0.443, respectively. The genetic differentiation among populations was estimated at θ = 0.1600 and the estimated apparent outcrossing rate was t a = 0.92. Estimates of genetic distances between the populations varied from 0.034 to 0.390. Genetic distance and the corresponding clustering analysis indicate the formation of two groups. The first consists of the Baía Formosa, Georgino Avelino, and São José do Mipibu populations and the second consists of the Japoatã, Pacatuba, and Praia do Forte populations. The correlation matrix between genetic and geographic distances was positive and significant at a 1% probability. Taken together, our results suggest a spatial structuring of the genetic variability among the populations. Geographically closer populations exhibited greater similarities.

The objective of this study was to evaluate whether the REML/BLUP can be useful for predicting the genotypicvalues of maize hybrids in a group of unbalanced experiments. A set of 256 single-crosses were evaluated in 13 environmentsfor grain yield, plant height and plant lodging. Sets of hybrids within environments and sets of environments were withdrawnfrom the experiments to simulate unbalanced data, and the hybrid predictions of the unbalanced data were computed by theREML/BLUP, simulated using the bootstrap resampling procedure. The coefficients of determination and percentage ofselection coincidence were computed for the predicted genotypic values of unbalanced data and their means from the balanceddata. The REML/BLUP method accurately predicted the genotypic values of missing hybrids under losses of up to 20% ofhybrids within environments or a reduction of 23% of the environments, even in the presence of significant and complexhybrid x environment interaction.

Plant breeders often carry out genetic trials in balanced designs. That is not always the case with animal genetic trials. In plant breeding is usual to select progenies tested in several environments by pooled analysis of variance (ANOVA). This procedure is based on the global averages for each family, although genetic values of progenies are better viewed as random effects. Thus, the appropriate form of analysis is more likely to follow the mixed models approach to progeny tests, which became a common practice in animal breeding. Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) is not a "method" but a feature of mixed model estimators (predictors) of random effects and may be derived in so many ways that it has the potential of unifying the statistical theory of linear models (Robinson, 1991). When estimates of fixed effects are present is possible to combine information from several different tests by simplifying BLUP, in these situations BLP also has unbiased properties and this lead to BLUP from straightforward heuristics. In this paper some advantages of BLP applied to plant breeding are discussed. Our focus is on how to deal with estimates of progeny means and variances from many environments to work out predictions that have "best" properties (minimum variance linear combinations of progenies' averages). A practical rule for relative weighting is worked out.Os melhoristas de plantas em geral conduzem testes genéticos em delineamentos balanceados, ao contrário do que ocorre com o melhoramento animal. É possível selecionar progênies pela ANAVA conjunta, com base nas médias gerais de cada família. Sabe-se, no entanto, que os valores genéticos de progênies são melhor representados por efeitos aleatórios. As formas de análise dos testes de progênie que parecem mais apropriadas são as que seguem a metodologia de modelos mistos, como no melhoramento animal. Segundo Robinson (1991) o Melhor Preditor Linear Não-Viesado (do inglês, BLUP) não é um método, mas uma propriedade dos estimadores (preditores) dos efeitos aleatórios e pode ser derivada de tantas maneiras diferentes que tem o potencial de unificar as teorias estatísticas de modelos lineares. A presença de bons estimadores para os efeitos fixos e componentes da variância torna possível combinar informações de diferentes testes por algumas simplificações do BLUP. Este trabalho exemplifica as vantagens do Melhor Preditor Linear (BLP) aplicado ao melhoramento de plantas. Procurou-se ilustrar como proceder com estimativas de médias e de variâncias de progênies obtidas em diferentes ambientes para produzir preditores que tenham propriedades "melhor" (no sentido de variância mínima entre todas as combinações lineares entre as médias de progênies). Derivou-se uma regra prática para a produção dos pesos relativos de cada ambiente. O BLP, em alguns casos, é também não-viesado produzindo BLUPs a partir de lógica mais direta.

Com o objetivo de avaliar o controle genético da regeneração direta in vitro a partir de plântulas de Eucalyptus grandis, foram utilizadas sementes de 10 progênies de polinização aberta da população base, origem Atherton, localizada em Anhembi, Estado de São Paulo. Vinte dias de cultivo após a germinação, 196 segmentos distais dos hipocótilos por progênie foram inoculados in vitro num Delineamento em Blocos Completos Aleatorizado Generalizado, com duas unidades experimentais por bloco e sete repetições por bloco, usando a interação blocos por progênie como estimadora do erro experimental. Após 14 semanas de cultivo, foram feitas avaliações da regeneração. Houve diferenças significativas de regeneração entre as progênies (PThe genetic control of in vitro direct regeneration was tested on seedlings of ten open-pollinated progenies from the base population of Atherton origin of Eucalyptus grandis at University of São Paulo (Brazil). Seeds were germinated in vitro, after twenty days, distal hypocotyls segments from 196 seedlings per progeny were inoculated in culture media at Generalized Complete Randomized Block Design, with two experimental units per block and seven repetitions, using the interaction blocks by progenies as an estimate of the experimental error. At week 14 from the inoculation bud induction was evaluated. Regeneration among progenies were significantly different (P

To assess the genetic diversity and genetic structure parameters, nine populations of Oryza glumaepatula from the Amazon biome, four from the Pantanal biome, and one collected at Rio Xingu, Mato Grosso, totaling 14 populations and 333 individuals were studied with isozyme markers. Six loci were evaluated showing a moderate allozyme variability (A = 1.21, P = 20.7%, Ho = 0.005, He = 0.060). The populations from the Pantanal biome showed higher diversity levels than the Amazon biome. High genetic differentiation among the populations, expected for self-fertilizing species, was observed (F ST=0.763), with lower differentiation found among the Pantanal populations (F ST=0.501). The average apparent outcrossing rate was higher for the Pantanal populations (t a = 0.092) than for the Amazonian populations (t a = 0.003), while the average for the 14 populations was 0.047, in accordance with a self-fertilization mating system.Utilizando marcadores isoenzimáticos, foram avaliadas nove populações de Oryza glumaepatula originárias da Amazônia, quatro do bioma do Pantanal, e uma coletada no Rio Xingu, Mato Grosso, totalizando 14 populações e 333 indivíduos, com o objetivo de avaliar a diversidade genética e a estrutura genética dessas populações. Seis locos foram avaliados, mostrando variabilidade alozímica moderada (A = 1.21, P = 20.7%, Ho = 0.005, He = 0.060). As populações do bioma Pantanal apresentaram níveis de diversidade mais altos que as da Amazônia. Alta diferenciação genética entre populações, esperada para espécies autógamas, foi observada (F ST=0.763), com menor diferenciação encontrada entre populações do Pantanal (F ST=0.501). A taxa média de cruzamento aparente foi maior para as populações do Pantanal (t a = 0.092) que da Amazônia (t a = 0.003), enquanto que a taxa media para as 14 populações foi 0.047, em concordância com o sistema reprodutivo por autogamia.

The objectives of this study were: to quantify environmental variation and genotype-environment effects inmaize hybrids, within and between two macro-environments in the state of Paraná; and to group the environments accordingto the hybrid performance and determine the most adequate locations for selection in the state in the main crop season. Thetrials were carried out in the 2003/2004 growing season at six locations: Campo Largo (CL), Ponta Grossa (PG), FazendaRio Grande (FZ), Londrina (LD), Centenário do Sul (CS) and Palotina (PL). The effects of location (L), macro-environments(ME), locations within macro-environments (WME), hybrids (H), and the interactions (H x L), (H x ME), (H x WME) weresignificant (at 0.1 % probability). Two clusters were formed, contrasting with the macro-environment zoning: (CL, FZ) and(PG, CS, LD). PL was excluded from both. Under the average conditions of the state, environments appropriate for high yieldswere most suitable for selection as well.

O objetivo deste trabalho foi avaliar as relações entre os caracteres tecnológicos (variáveis independentes explicativas) e a produtividade de fibra do algodão (variável dependente) e identificar seus efeitos diretos e indiretos pela análise de trilha. Os caracteres tecnológicos foram: finura, resistência, comprimento, uniformidade de comprimento, alongamento e índice de fiabilidade do fio. Avaliaram-se 12 cultivares de algodoeiro herbáceo, no Estado do Mato Grosso, no ano agrícola 2000/2001. Estimaram-se as correlações, e fez-se a análise de trilha pelo método proposto por Wright. O caráter finura apresenta o maior efeito direto sobre a produtividade da fibra. A resistência, o comprimento e o alongamento têm efeito secundário. A uniformidade de comprimento e a fiabilidade apresentaram efeito indireto via finura. Um esquema de seleção restrito é necessário, para se eliminarem os efeitos indiretos negativos do índice de fiabilidade sobre a finura.The purpose of this work was to study the relations between technological properties (independent variables) and the lint yield of cotton (dependent variable). The technological properties analyze were: micronaire, strength, length, uniformity of length, elongation and index of thread spinning. Twelve cotton cultivars were evaluated, in Mato Grosso State, during the 2000/2001 crop season. Correlations and other parameters for path analysis were estimated, according to Wright. The trait micronaire showed the highest direct effect on lint yield; in addition, strength, length and elongation were secondary effects. The uniformity of length and the spinning inder showed indirect effect on micronaire. A restricted selection is necessary to eliminate the negative indirect effect of the spinning index on micronaire.

Foram avaliados oito genótipos de algodoeiro herbáceo, sendo três linhagens e cinco cultivares, com o objetivo de estimar a adaptabilidade e estabilidade fenotípica para o caráter produtividade de algodão em caroço, pelo método Eberhart e Russell. Foram conduzidos 12 experimentos em 11 locais no Estado do Mato Grosso, sob um delineamento de blocos ao acaso com oito repetições, no ano agrícola 2000/2001. Praticamente todos os genótipos apresentaram coeficiente de determinação acima de 85%, exceto Delta Opal. As estimativas de adaptabilidade indicam que todos os genótipos apresentaram adaptação ampla (b i = 1). Quanto à estabilidade, os genótipos CNPA ITA 90, BRS Antares, CNPA 96-124, CNPA 96-283 e BRS Aroeira revelaram-se estáveis (S²d i= 0). Os melhores genótipos, caracterizados pela maior produtividade, estabilidade e adaptabilidade ampla foram CNPA ITA 90, BRS Aroeira e CNPA 96-124.Eight cotton genotypes, three lines and five cultivars, were evaluated for estimation of phenotypic adaptability and stability parameters relative to cotton yield using the method proposed by Eberhart and Russell. Twelve yield trials, in randomized complete blocks, comprising eight replications, were carried out in 11 locations of the Mato Grosso State, during the 2000/2001 crop season. All the genotypes showed determination coefficient above of 85%, except Delta Opal. For the estimates of adaptability, all the genotypes presented broad adaptation (b i = 1). The genotypes CNPA ITA 90, BRS Antares, CNPA 96-124, CNPA 96-283 and BRS Aroeira showing hight stability (S²d i= 0). The best genotypes, characterized by higher yield, stability and broad adaptability, were CNPA ITA 90, BRS Aroeira and CNPA 96-124.

Knowledge of the genetic structure and diversity of natural populations is important in developing strategies for in situ and ex situ conservation. We used eight microsatellite loci to estimate genetic structure and investigate within and between population genetic variation in eleven Brazilian wild rice (Oryza glumaepatula) populations. The study showed the following genetic diversity parameters: average number of 3.1 alleles per locus; 77.3% polymorphic loci; 0.091 observed heterozygosity and 0.393 gene diversity. F-statistics detected by microsatellite loci were: F ST = 0.491 (and R ST = 0.608), F IS = 0.780 and F IT = 0.888. No population was in Hardy-Weinberg equilibrium. The estimated apparent outcrossing rate (0.143) indicated a predominance of self-fertilization. The gene flow values were low (Nm = 0.259 and 0.161 for F ST and R ST, respectively). Populations were spatially structured but without a correlation between genetic and geographic distances. Five populations (PG-4, PG-2, PU-1, SO-4, NE-18) were identified as priorities for conservation strategies. Populations from the Amazon biome showed heterogeneity with respect to intrapopulation diversity. The high level of genetic differentiation between populations and the high number of private alleles suggested that sampling should be carried out on a large number of O. glumaepatula populations for ex situ conservation purposes.

The pepper species C. chinense has been considered one of the most important resistance sources to powdery mildew Capsicum spp. However, the inheritance in this species was unknown. The purpose of this work was to study its reaction inheritance. Two powdery mildew resistant parents, 'Pimenta Cheiro' 1 and PI 152225 and two moderately susceptible ones, 'Pimenta Doce' IH-1761 and 'Pimenta Índio', were used to obtain three F1 and their respective F2 generations: 'Pimenta Doce' IH-1761 ´ 'Pimenta Cheiro' 1, 'Pimenta Índio' ´ PI 152225 and 'Pimenta Doce' IH-1761 ´ PI 152225. The powdery mildew epidemy was natural using inoculum from a highly-sporulating susceptible pepper host. Powdery mildew host reaction evaluations were carried out during the fruiting stage using a rating system based on disease severity scales varying from 1 (resistant) to 5 (highly susceptible). The experimental design was completely randomized. The following genetic parameters were estimated: gene action, heritability coefficient and expected selection gain in the F3 generation. The transgressive segregation in F2 indicated oligogenic inheritance. Results show the presence of additive, dominant, and epistatic gene action. The dominant and epistatic effects detected in crosses presented negative values, tending towards susceptibility. The heritability and selection gain estimates were moderate, with values of 35.5% and 1.7% for 'Pimenta Doce' IH 1761 ´ 'Pimenta Cheiro' 1, from 50.4% to 3.5% for 'Pimenta Índio' ´ PI 152225, and 49% and 2.7% for the 'Pimenta Doce' IH 1761 ´ PI 152225 crosses, respectively. These gene action results are favorable for breeding programs and exploration of hybrids.

We presented an alternative way to verify the relative contribution to the total variance, of the sources of variation due to populations (P), individuals within populations (I), the (P*I) interaction, and the standard error of the following parameter estimates: total (F) and intrapopulation (f) fixation indices, and divergence among populations (q). The knowledge of this relative contribution is important to establish sampling strategies of natural populations. To attain these objectives, the bootstrap method was used to resample simultaneously populations and individuals, considering different combinations of P and I. This procedure was repeated five times for a given combination of each analyzed data set. For each data set, five estimates of these variances were obtained for each combination of P and I, and a given parameter estimate. These variance estimates were submitted to an analysis of variance, considering a factorial structure. The sources of variation considered in this analysis were P, I and P*I. The coefficient of determination (R²) was calculated for each source of variation. Sources of variation with greater R² are responsible for bigger errors of the estimates. The method applied was efficient for answering the questions initially proposed, and the results indicated that there are no ideal sample sizes for a species, but rather for a specific data set, because each data set has its own particularities. However, for investigations on the genetic structure of natural populations using population parameters, the number of populations to be sampled is a critical factor. Thus, more efforts should be made to increase the number of sampled populations, rather than the number of individuals within populations. A sampling strategy is given as a guide for investigations of this kind, when there is no previous knowledge about the genetic structure and the mating system of the populations.

Microsatellites, or simple sequence repeats (SSRs), have been the most widely applied class of molecular markers used in genetic studies, with applications in many fields of genetics including genetic conservation, population genetics, molecular breeding, and paternity testing. This range of applications is due to the fact that microsatellite markers are co-dominant and multi-allelic, are highly reproducible, have high-resolution and are based on the polymerase chain reaction (PCR). When first introduced, the development of microsatellite markers was expensive but now new and efficient methods of repetitive sequence isolation have been reported, which have led to reduced costs and microsatellite-technology has been increasingly applied to several species, including non-model organisms. The advent of microsatellite markers revolutionized the use of molecular markers but the development of biometric methods for analyzing microsatellite data has not accompanied the progress in the application of these markers, with more effort being need to obtain information on the evolution of the repetitive sequences, which constitute microsatellites in order to formulate models that fit the characteristics of such markers. Our review describes the genetic nature of microsatellites, the mechanisms and models of mutation that control their evolution and aspects related to their genesis, distribution and transferability between taxa. The implications of the use of microsatellites as a tool for estimating genetic parameters are also discussed.

This study was carried out to assess the genetic variability of ten "cagaita" tree (Eugenia dysenterica) populations in Southeastern Goiás. Fifty-four randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) loci were used to characterize the population genetic variability, using the analysis of molecular variance (AMOVA). A phiST value of 0.2703 was obtained, showing that 27.03% and 72.97% of the genetic variability is present among and within populations, respectively. The Pearson correlation coefficient (r) among the genetic distances matrix (1 - Jaccard similarity index) and the geographic distances were estimated, and a strong positive correlation was detected. Results suggest that these populations are differentiating through a stochastic process, with restricted and geographic distribution dependent gene flow.Este trabalho teve por objetivo o estudo da variabilidade genética em 10 populações de cagaiteiras (Eugenia dysenterica), da região Sudeste do Estado de Goiás. Foram identificados 54 locos marcadores RAPD, para a caracterização da variabilidade genética, avaliada por meio da análise da variância molecular (AMOVA). Foi verificado que 27,03% da variabilidade genética está entre populações, e 72,97% dentro de populações, índices obtidos a partir do valor de fiST igual a 0,2703. Foi estimado o coeficiente de correlação de Pearson (r) entre a matriz de distâncias genéticas (1 - índice de similaridade de Jaccard) e de distâncias geográficas, tendo sido encontrada forte correlação positiva. Os resultados sugerem que essas populações estão se diferenciando por um processo estocástico havendo fluxo restrito dependente da distribuição geográfica.

The objective of this study was to evaluate the efficiency of spatial statistical analysis in the selection of genotypes in a plant breeding program and, particularly, to demonstrate the benefits of the approach when experimental observations are not spatially independent. The basic material of this study was a yield trial of soybean lines, with five check varieties (of fixed effect) and 110 test lines (of random effects), in an augmented block design. The spatial analysis used a random field linear model (RFML), with a covariance function estimated from the residuals of the analysis considering independent errors. Results showed a residual autocorrelation of significant magnitude and extension (range), which allowed a better discrimination among genotypes (increase of the power of statistical tests, reduction in the standard errors of estimates and predictors, and a greater amplitude of predictor values) when the spatial analysis was applied. Furthermore, the spatial analysis led to a different ranking of the genetic materials, in comparison with the non-spatial analysis, and a selection less influenced by local variation effects was obtained.O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência da análise estatística espacial na seleção de genótipos de plantas num programa de melhoramento. Buscou-se demonstrar os benefícios potenciais dessa abordagem quando as observações experimentais não são espacialmente independentes. O material consistiu de um ensaio de competição de linhagens de soja, com cinco cultivares testemunhas (de efeitos fixos) e 110 novos genótipos (de efeitos aleatórios), delineado em blocos aumentados. O ajuste espacial foi feito pelo modelo linear de campo aleatório (RFLM), com função de autocovariância estimada a partir dos resíduos da análise sob erros independentes. Os resultados apontaram uma autocorrelação residual de magnitude e alcance significativos, o que garantiu à abordagem espacial uma melhoria considerável na discriminação dos tratamentos genéticos - aumento do poder dos testes estatísticos, redução nos erros padrão de estimativas e de preditores e alargamento na amplitude das predições genotípicas. A análise espacial levou a um diferente ordenamento das linhagens em relação à análise não espacial e, finalmente, a uma seleção menos influenciada por efeitos da variação local.

The use of fungicides to control powdery mildew in sweet pepper has been ineffective and genetic resistance is the best alternative. Resistance sources identified in Capsicum annuum L. are rare and unsatisfactory. The purpose of this work was to study the inheritance of C. annuum reaction to powdery mildew. Three homozygous powdery mildew resistant parents, HV-12, Chilli and #124 and three susceptible lines, 609, 442 and 428 were used to obtain seven F1's and respectively their generations F2: HV-12 x 609, 442 × HV-12, 428 × HV-12, Chilli × 609, #124 × 609, Chilli × HV-12 and #124 × HV-12. The powdery epidemic was natural using inoculum from highly sporulating susceptible pepper host. Powdery mildew host reaction evaluations were carried out during the fruit production using a rating system based on disease severity scales varying from 1 (resistant) to 5 (highly susceptible). The experimental design was completely randomized. The following genetic parameters were estimated: locus numbers, gene action, heritability coefficient, expected selection gain and observed progress in F3 generation, and possibly allelic relationship among resistance genes of different resistance sources. The HV-12×609 cross was the only one that showed absence of dominance. Other genetically analyzed crossings showed dominant and epistatic effects. Resistance was characterized as being due to at least four pairs of genes. The heritability and selection gains estimates were high. The resistance mechanisms of #124, Chilli and HV-12 showed differences in their expression.O uso de fungicidas no controle do oídio do pimentão tem se mostrado ineficaz, sendo a resistência genética a melhor alternativa. As fontes de resistência identificadas em Capsicum annuum L. são raras e não satisfatórias. O objetivo deste trabalho foi estudar a herança da reação de C. annuum ao oídio. Três progenitores resistentes e homozigóticos, HV-12, Chilli e #124 e três suscetíveis, 609, 442 e 428 foram usados na obtenção de sete híbridos e respectivas gerações F2: HV-12 × 609, 442 × HV-12, 428 × HV-12, Chilli × 609, #124 × 609, Chilli × HV-12 e #124 × HV-12. A epidemia de oídio ocorreu de maneira natural a partir de inóculo mantido em plantas de pimentão suscetíveis. As avaliações das reações ao oídio foram feitas na fase de frutificação, através de uma escala de notas de 1 (resistente) a 5 (altamente suscetível). O delineamento experimental utilizado foi inteiramente casualizado. Foram estimados, os números de locos, ação gênica, coeficiente de herdabilidade, ganho de seleção esperado e o progresso observado em F3 e possíveis relações de alelismo entre os genes que governam a resistência. O cruzamento HV-12 × 609 foi o único em que a reação de resistência mostrou ausência de dominância. Nos demais cruzamentos detectaram-se efeitos dominantes e epistáticos. A herança foi caracterizada sendo governada por no mínimo quatro pares de genes. As herdabilidades e ganhos de seleção estimados foram altos. O mecanismo de resistência dos progenitores resistentes #124, Chilli e HV-12 mostraram diferenças de expressão e natureza genética.

The ''cagaita tree'' (Eugenia dysenterica) is a plant found widespread in the Brazilian Cerrado. Its fruit is used for popular consumption and for industrial purposes. This study opens a new perspective for the generation of population genetic data and parameters estimates for devising sound collection and conservation procedures for Eugenia dysenterica. A battery of 356 primer pairs developed for Eucalyptus spp. was tested on the ''cagaita tree''. Only 10 primer pairs were found to be transferable between the two species. Using a polyacrilamide gel, an average of 10.4 alleles per locus was detected, in a sample of 116 individuals from 10 natural ''cagaita tree'' populations. Seven polymorphic loci allowed estimation of genetic parameters, including expected average heterozygosity He = 0,442, among population diversity, R ST = 0,268 and gene flow Nm = 0,680. Results indicated a potential of SSR locus transferability developed for Eucalyptus to other species of different genera, such as in the case of the ''cagaita tree''. The high genetic diversity among populations detected with SSR markers indicated that these markers are highly sensitive to detect population structure. Estimated Nm values and the existence of private alleles indicated reduced gene flow and consequently possible damage to the metapopulation structure.

Studying the genetic structure of natural populations is very important for conservation and use of the genetic variability available in nature. This research is related to genetic population structure analysis using real and simulated molecular data. To obtain variance estimates of pertinent parameters, the bootstrap resampling procedure was applied over different sampling units, namely: individuals within populations (I), populations (P), and individuals and populations simultaneously (I, P). The considered parameters were: the total fixation index (F or F IT), the fixation index within populations (f or F IS) and the divergence among populations or intrapopulation coancestry (theta or F ST). The aim of this research was to verify if the variance estimates of , and , found through the resampling over individuals and populations simultaneously (I, P), correspond to the sum of the respective variance estimates obtained from separated resampling over individuals and populations (I+P). This equivalence was verified in all cases, showing that the total variance estimate of , and can be obtained summing up the variances estimated for each source of variation separately. Results also showed that this facilitates the use of the bootstrap method on data with hierarchical structure and opens the possibility of obtaining the relative contribution of each source of variation to the total variation of estimated parameters.

The intrapopulation fixation index ( f ) is inversely related to the outcrossing rate (t). Results obtained from data on molecular markers of natural populations have shown that these values are highly variable, even when measured in the same group of individuals. It is thus suggested that factors besides those described in Wright's genetic equilibrium must be operating. Using simulated data sets this study shows that the finite size condition of a population is sufficient to spread the estimated f values along a range at equilibrium, as opposed to keeping them at the theoretical equilibrium point. The variation in outcrossing rates can amplify this range considerably. Correlation between estimated f values obtained from different loci in this condition showed to be negatively related to the outcrossing rates, and positively related to the variance of these rates along generations. The finite size of populations associated to small fluctuations in t mean values over time may explain the usually reported high variation among estimated f values of different loci.

In order to verify whether genetic distance (GD) is associated with population mean (PM), genetic variance (GV) and the proportion of superior progenies generated by each cross in advanced generations of selfing (PS), the genetic distances between eight soybean lines (five adapted and three non-adapted) were estimated using 213 polymorphic RAPD markers. The genetic distances were partitioned according to Griffing's Model I Method 4 for diallel analysis, i.e., GDij = GD+ GGDi+ GGDj + SGDij. Phenotypic data were recorded for seed yield and plant height for 25 out of 28 populations of a diallel set derived from the eight soybean lines and evaluated from F2:8 to F2:11 generations. No significant correlation for seed yield was detected between GD and GV, while negative correlations were detected between GD and PM and between GD and PS (r = -0.74** and -0.75**, respectively). Similar results were observed for the correlation between GGDi + GGDj and PM and between GGDi + GGDj and PS (r = -0.78** and -0.80**, respectively). No significant correlation was detected for plant height. The magnitudes of the correlations for seed yield were high enough to allow predictions of the potential of the populations based on RAPD markers.

O mapeamento de locos envolvidos no controle gênico de caracteres quantitativos, QTL's, difere dos demais tipos de experimentos conduzidos em genética, por tratar-se, basicamente, de um procedimento de testes múltiplos. Um problema decorrente deste tipo de análise refere-se ao nível de significância conjunto e, consequentemente ao poder da mesma. Em vistas disto avaliou-se, via simulação computacional de dados, o poder de detecção de QTL's da análise de marcas simples, utilizando os critérios da razão de falsas descobertas (FDR) e de Bonferroni para determinação nível de significância conjunto alfa* e da regressão linear múltipla, empregando o procedimento "stepwise" para seleção das marcas. O procedimento baseado em regressão múltipla foi mais poderoso em identificar as marcas associadas a QTL's, do que os procedimentos baseados em testes individuais, utilizando tanto o critério FDR, quanto o de Bonferroni para o controle do nível de significância conjunto. Mesmo nos casos em que esse procedimento apresentou poder ligeiramente inferior aos demais, mostrou a grande vantagem de selecionar apenas as marcas mais fortemente ligadas a QTL's, devendo, portanto, ser preferido para seleção das marcas a serem utilizadas como covariáveis no processo de mapeamento por intervalo múltiplo. Dentre os critérios FDR e de Bonferroni, que são aplicáveis aos métodos de mapeamento por intervalo, o primeiro mostrou-se mais poderoso, devendo portanto ser preferido.

Este trabalho teve como objetivo estimar as capacidades geral (CGC) e específica (CEC) de combinação e os efeitos recíprocos (ER) em relação à precocidade, componentes de produção e características do fruto em sete populações de melancia. As populações foram intercruzadas em dialelo, incluindo os recíprocos. Todas as variáveis avaliadas, com exceção do número de frutos por planta, apresentaram efeitos da CGC, CEC e ER significativos. Efeitos gênicos aditivos foram importantes em relação ao número e peso de frutos por planta, assim como em relação à cor, espessura e teor de sólidos solúveis da polpa. Quanto ao número de dias para o aparecimento da primeira flor feminina e número de sementes por fruto, ocorreu predominância de efeitos gênicos não-aditivos. Foram identificadas algumas populações e algumas combinações híbridas superiores, que podem ser exploradas em programas de melhoramento. As populações tradicionais P14 e B9, coletadas no Nordeste do Brasil, são promissoras para serem empregadas em programas que visem melhorar o número e o peso dos frutos, ao passo que a M7 é promissora em relação à precocidade. As variedades comerciais Charleston Gray e Crimson Sweet poderão ser empregadas para melhorar o teor de açúcar e a cor da polpa.

O objetivo deste trabalho foi comparar dois métodos de regressão empregados para avaliar a estabilidade fenotípica em plantas de cana-de-açúcar, o linear, de Cruz et al., e o não-linear, de Toler & Burrows. Utilizaram-se as informações do ensaio de caracterização de 1994 do programa de melhoramento genético da Copersucar, compreendendo 13 locais e 20 genótipos de cana-de-açúcar no Estado de São Paulo. Os resultados permitiram concluir que ambos os modelos se ajustaram satisfatoriamente aos dados. As estimativas da qualidade ambiental pelos dois modelos mostraram diferenças entre seus valores, porém foram concordantes para inferir sobre os melhores e piores ambientes. Ao classificar os genótipos com base na produtividade e no padrão de resposta, no entanto, apenas dez foram coincidentes nos dois métodos. As vantagens estatísticas do método não-linear torna-o recomendável para pesquisa sobre estabilidade.The purpose of this work was to compare the regression methods used for evaluating phenotypic stability in plants. The methods of Cruz et al. based on a linear model and of Toler & Burrows based on a non-linear model were considered. Data of the sugarcane 1994 characterization trial coordinated by the genetic improvement program of Copersucar were used. Experiments were set up in 13 locations of the State of São Paulo, in Brazil for evaluation of 20 sugarcane genotypes. The fitting of the models to the data was obtained for both methods. Measures of environmental quality were numerically different but agreed in general terms for the ranking of locations. However, when genotypes were classified on the bases of yield and pattern of response only ten coincided for both methods. The statistical advantages of the non-linear model makes it recommendable for studies on stability.

O principal objetivo deste trabalho foi avaliar a variação fenotípica e genética da produção de folhas de amoreira e de outros caracteres de importância na sericicultura, bem como comparar o potencial de híbridos selecionados com o de uma variedade testemunha, de longo emprego comercial no Estado de São Paulo Paralelamente, desenvolveu.se uma investigação sobre a adequação do delineamento empregado, que é o padrão na experimentação com a amoreira. Os caracteres considerados foram: a) peso das folhas: b) peso dos galhos; c) comprimento e largura das folhas e d) comprimento dos pecíolos. O experimento foi dei meado em blocos ao acaso com quatro repetições, quatro plantas por parcela e doze tratamentos, a saber: onze híbridos selecionados previamente e a variedade calabresa como testemunha. Os dados foram tomados de cada planta, em três cortes, realizados num intervalo de três meses, o que provocou a subdivisão das parcelas no tempo. O experimento, instalado em março de 1976, foi conduzido no Posto Experimental de Sericicultura de Limeira (SP). Pôde-se verificar que os caracteres foliares foram menos influenciados por efeitos ambientais do que a produção de folhas. Assim, num programa de melhoramento visando ao aumento da área foI iar, aqueles devem dar respostas mais rápidas à seleção. Os híbridos investigados ainda apresentam diferenças genotípicas entre si, indicando que aia seleção prévia não foi totalmente eficiente. Em relação à testemunha, os híbridos mais promissores foram o 13/6 e o 19/13, aparecendo o 19/1 como o de mais baixa produção. Essas conclusões, no entanto, foram multo enfraquecidas pelos altos coeficientes de variação obtidos, principalmente para a produção de folhas. A presença significativa de interação tratamentos x cortes evidenciou a dificuldade de identificação de genótipos superiores precocemente, ou seja, com poucos cortes. Foi visto que a baixa precisão experimental da unidade de seleção pode ser parcialmente contornada, aumentando-se o número de repetições e diminuindo-se o de plantas por parcela, para dada área experimental.

Marcadores isoenzimáticos ou moleculares têm sido empregados em estudos da estrutura genética e do sistema reprodutivo de populações naturais. Parâmetros genéticos populacionais de interesse são estimados, porém, há pouca informação sobre o erro associado a essas estimativas em função dos diferentes níveis de amostragem. Neste trabalho, o método de reamostragem bootstrap foi aplicado sobre locos, indivíduos, populações e indivíduos e populações concomitantemente, em dados de populações naturais. Para os parâmetros índice de fixação total (F ), índice de fixação intrapopulacional ( f ), diversidade entre populações (teta) e taxa aparente de cruzamento (t a) foram obtidos, em função das fontes de reamostragem, os erros associados às estimativas desses parâmetros, a distribuição de empírica dessas estimativas e intervalos de confiança para tais parâmetros. Geralmente, os menores erros estão associados a , e verificou-se que apenas as distribuições empíricas de e tendem à normalidade quando indivíduos estão envolvidos na reamostragem. Foram feitas reamostragens com tamanho variável de amostras bootstrap, visando obter o número necessário de locos, indivíduos e populações para atingir um dado nível de precisão na estimação de F, f e teta. Em geral, os tamanhos amostrais utilizados nas pesquisas com populações naturais foram suficientes apenas para estimar teta, com a precisão estabelecida. A fonte de variação de locos foi responsável pelos maiores erros associados a e , sendo recomendável aumentar o número de locos em pesquisas dessa natureza. A amostragem de populações também deverá merecer atenção no planejamento de pesquisas futuras.

O objetivo do trabalho foi comparar, por meio de simulação, as estimativas de componentes de variância produzidas pelos métodos ANOVA (análise da variância), ML (máxima verossimilhança), REML (máxima verossimilhança restrita) e MIVQUE(0) (estimador quadrático não viesado de variância mínima), no delineamento de blocos aumentados com tratamentos adicionais (progênies) de uma ou mais procedências (cruzamentos). Os resultados indicaram superioridade relativa do método MIVQUE(0). O método ANOVA, embora não tendencioso, apresentou as estimativas de menor precisão. Os métodos de máxima verossimilhança, sobretudo ML, tenderam a subestimar a variância do erro experimental () e a superestimar as variâncias genotípicas (), em especial nos experimentos de menor tamanho (n/>0,5. Contudo, o método produziu as piores estimativas de variâncias genotípicas quando as progênies vieram de diferentes cruzamentos e os experimentos foram pequenos.This work compares by simulation estimates of variance components produced by the ANOVA (analysis of variance), ML (maximum likelihood), REML (restricted maximum likelihood), and MIVQUE(0) (minimum variance quadratic unbiased estimator) methods for augmented block design with additional treatments (progenies) stemming from one or more origins (crosses). Results showed the superiority of the MIVQUE(0) estimation. The ANOVA method, although unbiased, showed estimates with lower precision. The ML and REML methods produced downwards biased estimates for error variance (), and upwards biased estimates for genotypic variances (), particularly the ML method. Biases for the REML estimation became negligible when progenies were derived from a single cross, and experiments were of larger size with ratios />0.5. This method, however, provided the worst estimates for genotypic variances when progenies were derived from several crosses and the experiments were of small size (n

Marcadores moleculares têm sido sugeridos como ferramentas úteis em programas de melhoramento de plantas. Assim, este trabalho teve como objetivo propor um índice de seleção de linhagens visando a geração de populações sintéticas de milho, baseado em marcadores moleculares e dados de campo. Para tanto foram utilizados valores fenotípicos e genotípicos, oriundos de experimentos convencionais de campo e através da genotipagem das plantas-mãe das linhagens por marcadores RFLP, respectivamente. O índice foi examinado quanto à sua capacidade de originar sintéticos com alta freqüência de alelos favoráveis, em comparação com os obtidos baseando-se na seleção convencional. Utilizaram-se inicialmente 157 locos marcadores com distância média de 15,30 cM entre eles. Sessenta e oito linhagens S2, provenientes da geração F2 do cruzamento entre duas linhagens homozigóticas foram cruzadas em topcross e avaliadas em quatro locais de Iowa, EUA, em 1996. Dos 157 locos foram selecionados 18 que explicaram 74,70% da variância genética entre progênies, na média dos locais. O índice proposto leva em conta o comportamento próprio (per se) das linhagens e a complementaridade genotípica entre elas, o que não é conseguido utilizando-se apenas dados dos topcrosses. O uso do índice proposto permite obter homólogo de tabela dialélica tendo-se apenas dados de médias de topcrosses. O índice levou à seleção de sintéticos com propriedades superiores às esperadas pela seleção baseada apenas nas médias das progênies topcross. Essa conclusão, no entanto, só é válida para os QTL's abrangidos pelas marcas. A metodologia proposta permite monitoramento muito adequado e útil das propriedades genéticas dos sintéticos a serem obtidos.

O objetivo deste estudo foi organizar acessos das espécies Paspalum guenoarum e Paspalum plicatulum, em grupos de similaridade, a partir de características reprodutivas, vegetativas e agronômicas utilizando três métodos de análise de agrupamento hierárquico. Visou à obtenção de conhecimentos básicos para o melhoramento genético do gênero Paspalum cujas espécies contém opções importantes de forrageiras com alta produtividade e boa adaptação. As análises envolveram 5 acessos de Paspalum guenoarum e 21 de Paspalum plicatulum, utilizando um total de 44 descritores, sendo 15 descritores reprodutivos, 22 vegetativos e 7 agronômicos para a avaliação anual. Também foi realizada uma análise considerando um conjunto reduzido de 8 descritores, os quais foram previamente selecionados com base em análises de componentes principais. A construção de dendrogramas mostrou que o método da ligação média não ponderada (UPGMA) foi superior aos demais métodos utilizados, apresentando grupos de acessos mais coerentes e com um menor grau de encadeamento entre espécies, assim como um alto valor do coeficiente de correlação cofenética. O conjunto reduzido de descritores principais demonstrouse eficiente para quantificar as similaridades e realizar o agrupamento dos acessos, fornecendo grupos coerentes com as espécies a que os acessos pertencem e também com seus locais de coleta. As medidas de distância revelaram a existência de uma ampla gama de diversidades genéticas, não só entre as espécies como dentro delas. Vários acessos coletados em locais próximos mostraram-se muito similares, indicando tratar-se de réplicas ou de materiais com base genética muito semelhante.

Foram avaliados 15 descritores reprodutivos, 22 vegetativos e 21 agronômicos, em que os agronômicos compreenderam sete descritores para a avaliação anual, sete descritores para a avaliação de inverno e sete descritores para a avaliação de verão, com o objetivo de selecionar os melhores descritores botânico-agronômicos para caracterizar acessos das espécies Paspalum guenoarum e Paspalum plicatulum. Utilizou-se a análise de componentes principais para descartar os descritores considerados redundantes ou não-discriminantes. Este método permitiu redução de 53, 68 e 43% dos descritores reprodutivos, vegetativos e agronômicos, respectivamente, do conjunto inicialmente considerado. Foi possível selecionar, por intermédio desta técnica, oito descritores, considerados mais importantes na descrição da variabilidade presente na coleção de acessos do germoplasma estudado.

For tropical areas like Brazil, genotype x environment interaction is an important source of variation. Our objectives were to examine the combining abilities and their interaction with environments in ten selected maize (Zea mays L.) inbred lines in diallel crosses and to identify candidates for promising hybrid combinations. Crosses and checks were evaluated through a 7 x 7 triple lattice design at three locations during the 1984/85 season. Several agronomic traits were evaluated, but here only data on ear yield are discussed. Yield data were adjusted for stand variation (correction to 50 plants per plot) and grain moisture (15.5%). Data for ear yield were analysed using an adaptation of Griffing’s method IV for complete diallel crosses, and experiments were repeated in several environments. The means of the crosses over all environments ranged from 6.6 t/ha to 10.3 t/ha. The combining ability analysis of diallel data across environments showed highly significant (P

Compararam-se diferentes formas de análise de experimentos em blocos incompletos, abordadas como casos particulares de modelos mistos, quais sejam: (a) análise intrablocos, em que apenas o efeito do erro experimental é suposto aleatório; (b) análise interblocos (látice), com efeitos de blocos supostos aleatórios; (c) análise BLUP, com os efeitos de tratamentos supostos aleatórios, e (d) modelo aleatório. Além disso, montou-se a ANAVA, considerando duas alternativas: (e) usando o quadrado médio de tratamentos ajustados para blocos e o quadrado médio do erro efetivo do látice; (f) tomando as repetições como blocos completos. Um exemplo de análise de um teste de progênies de Eucalyptus grandis (Hill) Maiden ilustra as implicações da escolha dos modelos para fins de seleção e de caracterização genética de populações. Observou-se que em geral o ordenamento dos tratamentos sofreu maiores alterações ao se mudar a alternativa de análise do que as estimativas do progresso esperado pela seleção. Tendência que se reforça com a seleção mais intensa. As formas de análise que consideram a restrição da casualização (blocos incompletos) foram as mais precisas, e dentre estas, a análise BLUP de tratamentos é conceitualmente a melhor, pois os tratamentos eram progênies de polinização livre, sendo a que mais difere da análise usual do látice. Isto indica ser possível minorar os erros de seleção nas análises de blocos incompletos no melhoramento vegetal.

Cinco novas variedades de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.), recomendadas para cultivo comercial pelo Programa de Melhoramento da Copersucar em 1997, foram avaliadas quanto ao nível de produtividade, estabilidade produtiva e adaptação ambiental, mediante metodologia para estimativa da estabilidade fenotípica. Os dados foram comparados com a variedade-padrão RB72454. Observou-se alta linearidade da produção em relação à melhoria ambiental, além de ótima estabilidade e nível de resposta nas variedades SP80-185, SP80-1816 e SP80-3280. A variedade SP83-5073, precoce e de alto teor de sacarose, também foi bastante estável. A variedade SP80-3480 apresentou maior dispersão dos dados, porém com alta produtividade. A variedade SP80-185 passa a ser indicada como padrão de estabilidade em futuros ensaios, sendo estável nos piores ambientes e responsiva nos melhores.Five sugarcane (Saccharum officinarum L.) varieties recently released by the Copersucar Breeding Program were evaluated for yield, stability and environmental adaptability, using a methodology for phenotypic stability estimation. New varieties were compared with the check RB72454. Yield was highly related with environmental improvement. Varieties SP80-185, SP80-1816 and SP80-3280 were the most stable ones, showing high productivity on the best environments. SP83-5073, a variety with high sugar content and earliness, was also very stable, whereas, SP80-3480 showed higher scattering, but with high yield. Based on the parameters estimated the variety SP80-185 should be indicated as check for future trials, since it was the most adapted to poorer environments and the most responsive on better ones.

The partial circulant diallel cross mating scheme of Kempthorne and Curnow (Biometrics 17: 229-250, 1961) was adapted for the evaluation of genotypes in crosses at the interpopulation level. Considering a random sample of n lines from base population I, and that each line is crossed with s lines from opposite population II, there will be ns sampled crosses that are evaluated experimentally. The means of the ns sampled crosses and the remaining n(n - s) crosses can be predicted by the reduced model where Yij is the mean of the cross between line i (i = 1,2,...,n) of population I and line j (j = 1',2',...,n') of population II; µ is the general mean, and gi and gj refer to general combining ability effects of lines from populations I and II, respectively. Specific combining ability (Sij) is estimated by the difference . The sequence of crosses for each line (i) is [i x j], [i x (j + 1)], [i x (j + 2)], ..., [i x (j + s -1)], starting with i = j = 1 for convenience. Any j + s -1 > n is reduced by subtracting n. A prediction procedure is suggested by changing gi and gj by the contrasts i = i. - .. and j = .j - ..; the correlation coefficient (r) was used to compare the efficiency of 's and 's for selection of lines and crosses. The analysis of variance is performed with the complete model Yij = µ + gi + gj + sij + ij, and the sum of squares due to general combining ability is considered for each population separately. An alternative analysis of variance is proposed for estimation of the variance components at the interpopulation level. An analysis of ear length of maize in a partial diallel cross with n = 10 and s = 3 was used for illustration. For the 30 interpopulation crosses analyzed the coefficient of determination (R2), involving observed and estimated hybrid means, was high for the reduced (g) model [R2 (ij, Yij) = 0.960] and smaller for the simplified () model [R2 (ij, Yij) = 0.889]. Results indicated that the proposed procedure may furnish reliable estimates of means of hybrids not available in the partial diallel.O esquema de cruzamento dialélico parcial de Kempthorne e Curnow (Biometrics 17: 229-250, 1961) foi adaptado para avaliação de linhagens ou genótipos em cruzamento no nível interpopulacional. Considerando uma amostra aleatória de n linhagens de cada população base e que cada uma é cruzada com s linhagens da população contrastante, resultarão ns cruzamentos amostrados que são avaliados experimentalmente. As médias dos ns e dos demais n(n-s) híbridos não amostrados podem ser preditas pelo modelo reduzido , onde Yij é a média do híbrido entre a linhagem i (i = 1, 2,..., n) da população I e a linhagem j (j = 1', 2',..., n') da população II; m é a média geral e gi e gj referem-se aos efeitos de capacidade geral de combinação das populações I e II, respectivamente. A capacidade específica de combinação (sij) é estimada por diferença . A seqüência de cruzamentos para cada linhagem (i) é [i x j], [i x (j + 1)] , [i x (j + 2)], ..., [i x (j + s - 1)]. Qualquer (j + s - 1) > n é reduzido por subtração de n. Um processo de predição é sugerido por substituição de gi e gj pelos contrastes i = i. - .. e j = .j - ..; o coeficiente de correlação foi utilizado para comparar 's e 's para a seleção de linhagens e híbridos. A análise de variância é realizada com o modelo Yij = m + gi + gj + sij + ij , e a soma de quadrados devida à capacidade geral de combinação é considerada para cada população separadamente. Uma análise de variância alternativa é proposta para estimativa dos componentes da variância no nível interpopulacional. A análise de dados de comprimento da espiga de milho em um cruzamento dialélico parcial com n = 10 e s = 3 é dada para ilustração. Para os 30 híbridos analisados, o coeficiente de determinação (R2) envolvendo as médias observadas e estimadas dos híbridos foi alto para o modelo reduzido [R2 (ij, Yij) = 0.960] e menor para o modelo simplificado () [R2 (Yij, ij) = 0.889]. Os resultados indicaram que o procedimento proposto pode fornecer estimativas confiáveis das médias de híbridos não disponíveis no dialelo parcial.

A prevalência de hipovitaminose A foi determinada pelos níveis séricos de retinol por cromatografia líquida de alta eficiência (Clae) em 131 crianças com idade entre 3 e 10 anos, residentes em 18 favelas do Município de Campinas, São Paulo, no período de abril de 1991 a fevereiro de 1992. A prevalência encontrada foi 17,6% com níveis entre 0,35 e 0,70 µmol/L (IC=11,1-24,1; 95%), o que indica a existência de certo risco de saúde pública. Entretanto, exames clínicos oftalmológicos não detectaram nenhum caso de xeroftalmia. Informações complementares sobre as características da amostra foram obtidas para 341 crianças. A renda per capita mostrou-se surpreendentemente alta. O consumo alimentar, segundo os critérios da FAO/WHO, só foi adequado para proteínas (133,96%), sendo os menores valores de adequação aqueles encontrados para energia (87,76%) e, principalmente, para vitamina A (66,13%) e ferro (42,14%). Os indicadores altura/idade e peso/altura identificaram muitas crianças abaixo de -1 desvio padrão.The prevalence of hypovitaminosis A among children of the peripheral districts of the city of Campinas, São Paulo, Brazil, was estimated by determining serum retinol levels by High Performance Liquid Chromatography (HPLC) in a sample of 131 children aged between three and ten years, between April 1991 and February 1992. A prevalence of 17.6% and retinol concentrations in the range of 0.35 to 0.70 µmol/L were found (CI=11.1-24.1; 95%), indicating the existence of public health risk Ophthalmological examinations, however, failed to detect any cases of xerophthalmy. Additional characterization of the sample was obtained from 341 children. The per capita incorre of the average household was surprisingly high for low-income areas. According to FAO-WHO standards, food consumption was adequate only for protein (133.96%). Adequacy levels were low for energy (87.76%) and particularly for vitamin A (66.13%) and iron (42.14%). Height for-age and weight-for-height anthropometric indices revealed that many children were located below -1 standard deviation.

Mangaba tree (Hancornia speciosa Gomes) is a fruit species with a great potential for commercial exploitation, found in nearly all regions of Brazil and frequently found in the Cerrado biome. Information on the genetic variability of the populations in this biome is scarce. The purpose of this study was to characterize the genetic structure of eight subpopulations located in the states of Goiás, Bahia and Minas Gerais by using RAPD markers. The structure of genetic variability was evaluated by the analysis of variance of molecular data. The geographic distribution pattern of the variation among subpopulations was investigated based on the correlation between the matrices of geographic and genetic distances. A highly significant proportion of genetic variance was found among subpopulations, corresponding to 19.6 % of the total variation. The correlation between the matrices of geographic and genetic distances was not significant, showing that there is no spatial structure of the genetic variability among the subpopulations, with the RAPD marker loci used here. The high variability found among the subpopulations suggests that a strategy for in situ, as well as ex situ conservation, must be based on sampling a large number of local populations.

A mangabeira (Hancornia speciosa Gomez) é uma frutífera freqüentemente encontrada no cerrado brasileiro, bioma para o qual são escassas informações sobre a variabilidade genética de populações naturais. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi a identificação de marcadores RAPD polimórficos que possibilitem a caracterização da estrutura genética de populações da espécie. A partir do DNA extraído de seis genótipos, foram analisados 45 "primersâ€?, sendo 10 deles polimórficos, com os quais foram obtidos 60 locos polimórficos. Para se determinar o número mínimo de locos necessários para estudos moleculares em populações naturais de H. speciosa, utilizou-se o procedimento bootstrap para estimar o coeficiente de variação associado a número crescente de bandas. Tal parâmetro é estimado a partir do coeficiente de similaridade "simple matchingâ€? e suas respectivas dissimilaridades procedendo-se 1000 permutações. Os coeficientes de variação (y) obtidos foram relacionados com o número de locos (x) ajustando-se uma função potência do tipo y = axb. O número mínimo de locos foi determinado encontrando-se o valor de x correspondente ao ponto de curvatura máxima da equação ajustada. Verificou-se que, em pesquisas visando o número adequado de locos para alcançar uma dada precisão e tendo-se medidas de dissimilaridade ou similaridade, é recomendável utilizar, sempre a de maior média. Estes estudos permitirão investigar a divergência genética entre populações, contribuindo assim para pesquisas futuras sobre sua preservação e domesticação.

Dados de oito caracteres morfológicos referentes a sessenta indivíduos de duas populações de gonçalo-alves localizadas nas margens de rodovias, obtidos através de um teste de progênie, foram submetidos à análise de autocorrelação espacial. Os oitos correlogramas obtidos suportam as hipóteses de migração aleatória, levando à inexistência de padrão espacial, e de que as duas populações consideradas são estruturadas de forma aleatória. Dessa forma, a análise de autocorrelação sugere que os processos estocásticos, tais como migração (principalmente através da colonização), são os mais indicados para explicar a falta de padrão espacial encontrado nas populações ou indivíduos de gonçalo-alves. A inexistência de padrão espacial na variação genética é importante para compreender como está ocorrendo a dinâmica de alelos entre os indivíduos dessa espécie, gerando uma importante informação para otimizar a amostragem da variabilidade genética. Dada a inexistência de padrão de estruturação espacial da variação genética nas populações estudadas, em uma escala de 1 a 78km, sugere-se que a amostragem dentro destes limites pode ser realizada de maneira aleatória. UNITERMOS: Conservação genética; Estrutura espacial; Fatores evolutivos

Vinte e seis cultivares de soja pertencentes ao grupo de maturação tardio foram avaliados com base em 85 locos RAPD, obtidos de 27 primers, submetendo-se os dados obtidos à técnica de bootstrap para determinar o número mínimo de locos necessários para se ter uma boa precisão nos estudos de diversidade genética. O procedimento de bootstrap dos locos foi utilizado para estimar o coeficiente de variação (CV) do índice de similaridade de Jaccard, utilizando-se 1000 permutações. O número mínimo de locos foi encontrado através da expressão xc= [ a2b2(2b-1)/(b-2)] 1/(2-2b) onde xc é o ponto de máxima curvatura da função, e corresponde à quantidade mínima de locos a ser amostrado no genoma. Foi obtido um coeficiente de determinação de 0,98, indicando um bom ajuste da curva estimada aos dados observados. Para este conjunto de dados, o ponto de curvatura máxima foi xc = 12,41, que corresponde a um CV de 33 %, e indica que o uso de 12 a 13 locos marcadores proporcionaria a precisão obtida para as estimativas. O parâmetro b da equação representa uma medida da heterogeneidade entre bandas. O valor encontrado neste estudo, de b = 0,426, mostra uma alta heterogeneidade entre bandas, já que o valor máximo esperado para este parâmetro é de 0,5. UNITERMOS: RAPD, Glycine max, diversidade genética

O objetivo deste estudo foi organizar acessos das espécies Paspalum guenoarum e Paspalum plicatulum, em grupos de similaridade, a partir de características reprodutivas, vegetativas e agronômicas utilizando três métodos de análise de agrupamento hierárquico. Visou à obtenção de conhecimentos básicos para o melhoramento genético do gênero Paspalum cujas espécies contém opções importantes de forrageiras com alta produtividade e boa adaptação. As análises envolveram 5 acessos de Paspalum guenoarum e 21 de Paspalum plicatulum, utilizando um total de 44 descritores, sendo 15 descritores reprodutivos, 22 vegetativos e 7 agronômicos para a avaliação anual. Também foi realizada uma análise considerando um conjunto reduzido de 8 descritores, os quais foram previamente selecionados com base em análises de componentes principais. A construção de dendrogramas mostrou que o método da ligação média não ponderada (UPGMA) foi superior aos demais métodos utilizados, apresentando grupos de acessos mais coerentes e com um menor grau de encadeamento entre espécies, assim como um alto valor do coeficiente de correlação cofenética. O conjunto reduzido de descritores principais demonstrouse eficiente para quantificar as similaridades e realizar o agrupamento dos acessos, fornecendo grupos coerentes com as espécies a que os acessos pertencem e também com seus locais de coleta. As medidas de distância revelaram a existência de uma ampla gama de diversidades genéticas, não só entre as espécies como dentro delas. Vários acessos coletados em locais próximos mostraram-se muito similares, indicando tratar-se de réplicas ou de materiais com base genética muito semelhante.