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181 results on '"Ratiney, H."'

1. Optimal control theory for applications in magnetic resonance imaging

Author: Van-Reeth, E., Ratiney, H., Lapert, M., Glaser, S. J., and Sugny, D.
Subjects: Quantum Physics
Abstract: We apply innovative mathematical tools coming from optimal control theory to improve theoretical and experimental techniques in Magnetic Resonance Imaging (MRI). This approach allows us to explore and to experimentally reach the physical limits of the corresponding spin dynamics in the presence of typical experimental imperfections and limitations. We study in this paper two important goals, namely the optimization of image contrast and the maximization of the signal to noise per unit time. We anticipate that the proposed techniques will find practical applications in medical imaging in a near future to help the medical diagnosis., Comment: 19 pages, 7 figures, to be published in Pacific Journal of Mathematics for Industry
Published: 2017

2. Estimation of metabolite T1 relaxation times using tissue specific analysis, signal averaging and bootstrapping from magnetic resonance spectroscopic imaging data.

Author: Ratiney, H, Noworolski, SM, Sdika, M, Srinivasan, R, Henry, RG, Nelson, SJ, and Pelletier, D
Subjects: Brain, Humans, Nerve Tissue Proteins, Image Interpretation, Computer-Assisted, Magnetic Resonance Imaging, Metabolic Clearance Rate, Magnetic Resonance Spectroscopy, Tissue Distribution, Algorithms, Signal Processing, Computer-Assisted, Adult, Female, Male, MR spectroscopic imaging, relaxation time T-1 estimation, bootstrap, Monte Carlo simulation, Image Interpretation, Computer-Assisted, Signal Processing, Clinical Research, Neurosciences, Biomedical Imaging, Nuclear Medicine & Medical Imaging
Abstract: ObjectA novel method of estimating metabolite T1 relaxation times using MR spectroscopic imaging (MRSI) is proposed. As opposed to conventional single-voxel metabolite T1 estimation methods, this method investigates regional and gray matter (GM)/white matter (WM) differences in metabolite T1 by taking advantage of the spatial distribution information provided by MRSI.Material and methodsThe method, validated by Monte Carlo studies, involves a voxel averaging to preserve the GM/WM distribution, a non-linear least squares fit of the metabolite T1 and an estimation of its standard error by bootstrapping. It was applied in vivo to estimate the T1 of N-acetyl compounds (NAA), choline, creatine and myo-inositol in eight normal volunteers, at 1.5 T, using a short echo time 2D-MRSI slice located above the ventricles.ResultsWM-T 1,NAA was significantly (P < 0.05) longer in anterior regions compared to posterior regions of the brain. The anterior region showed a trend of a longer WM T1 compared to GM for NAA, creatine and myo-Inositol. Lastly, accounting for the bootstrapped standard error estimate in a group mean T1 calculation yielded a more accurate T1 estimation.ConclusionThe method successfully measured in vivo metabolite T1 using MRSI and can now be applied to diseased brain.
Published: 2007

3. Computational Reproducibility in Metabolite Quantification Applied to Short Echo Time In Vivo MR Spectroscopy

Author: Vila, G., primary, Bonnet, A., additional, Chauveau, F., additional, Gaillard, S., additional, Durand-Dubief, F., additional, Pop, S., additional, and Ratiney, H., additional
Published: 2023
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4. Analyzing Magnetic Resonance Spectroscopic Signals with Macromolecular Contamination by the Morlet Wavelet

Author: Suvichakorn, A., Ratiney, H., Bucur, A., Cavassila, S., Antoine, J. -P., Magjarevic, R., editor, Nagel, J. H., editor, Vander Sloten, Jos, editor, Verdonck, Pascal, editor, Nyssen, Marc, editor, and Haueisen, Jens, editor
Published: 2009
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5. 3D localized 2D ultrafast J-resolved magnetic resonance spectroscopy: In vitro study on a 7T imaging system

Author: Roussel, T., Giraudeau, P., Ratiney, H., Akoka, S., and Cavassila, S.
Published: 2012
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6. Comparison of Fitting Approaches for Diffusion-weighted MRI Models in Liver Simulation

Author: Huang, Jiqing, Ratiney, H., Leporq, Benjamin, beuf, olivier, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2021

7. Application of Deep Leaning Model for Quality Control of Short-echo 7T MRSI with Various Disease Types

Author: Liu, Huawei, Xie, Emilie, Ratiney, H., Sdika, Michaël, Li, Yan, Department of Radiology and Biomedical Imaging [San Francisco], University of California [San Francisco] (UCSF), University of California-University of California, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Modeling & analysis for medical imaging and Diagnosis (MYRIAD)
Subjects: [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2021

8. Estimation of metabolite T 1 relaxation times using tissue specific analysis, signal averaging and bootstrapping from magnetic resonance spectroscopic imaging data

Author: Ratiney, H., Noworolski, S. M., Sdika, M., Srinivasan, R., Henry, R. G., Nelson, S. J., and Pelletier, D.
Published: 2007
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9. Spurious Phase Correction in Multi-Shot MRSI

Author: Sabbagh, N, Chassain, C, Ratiney, H, Pages, G, Bonny, J, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Pages, Guilhem, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Subjects: [CHIM.ANAL] Chemical Sciences/Analytical chemistry, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry
Abstract: International audience; IntroductionSpectral multi-shot (MS) MRSI sequences are used essentially to decrease the scan time and enlarge the spectral width. Here, the spectral information is encoded by acquiring several experiments while shifting the readout position relative to the echo time (TE). These techniques are highly exposed to phase errors with the phase evolution being indirectly sampled through the different echo time increments. During this sampling, phase coherency is crucial. Nowadays, MS techniques can lead up to image distortion because of the loss of phase coherency between the shots. The purpose of this work is to present theoretically and experimentally how to overcome this phase problem.Subjects/MethodsWe demonstrated that during the extra delay to shift the echo time for a 2D slice selection, the phase evolvesdepending on the chemical shift with respect to the excitation frequency. The latter is generally significantlyhigher than the chemical shift, and the phase will mostly depend on it. This phase shift can be corrected oneither the acquired signal or the reconstructed image by subtracting the additional frequency excitationapplied when shifting the slice position. These methods were applied to rapid metabolic imaging (1) of a 13Cphantom and on the particular case of B0 mapping.Results/DiscussionResults showed phase errors in MS MRSI, leading to image distortion, therefore incorrect and inefficientstudies. However, applying one of the provided correction methods cancels the phase errors, improving theimage quality.Unwanted phase shifts are susceptible to be accumulated in MS techniques during different echo timeincrements, especially when the slice position is shifted from a null resonance frequency. We were able tocorrect the phase-shifting through post-processing in the k-space dimension, by image phase correctionaccording to the Nyquist frequency rule or even during a particular experimental case. The three proposedcorrection approaches were able to discard the spurious phase and then to reconstruct parametric mapsaccurately.
Published: 2020

10. Time-domain quantitation of 1H short echo-time signals: background accommodation

Author: Ratiney, H., Coenradie, Y., Cavassila, S., van Ormondt, D., and Graveron-Demilly, D.
Published: 2004
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11. Dynamic magnetic resonance imaging with radial scanning: a post-acquisition keyhole approach

Author: Lethmate, R., Ratiney, H., Wajer, F. T. A. W., Crémillieux, Y., van Ormondt, D., and Graveron-Demilly, D.
Published: 2003
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12. Wavelet-based Techniques in MRS

Author: Suvichakorna, A., primary, Ratiney, H., additional, Cavassila, S., additional, and Antoine, J.-P, additional
Published: 2010
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13. ACCELERATED SPIRAL CHEMICAL SHIFT IMAGING FOR PROTON DENSITY AND T2*FAT-WATER QUANTIFICATION

Author: Karkouri, Jabrane, Millioz, Fabien, Troalen, Thomas, Prost, Rémy, Viallon, Magalie, Ratiney, H., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Radiology, University Hospital of Geneva, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [INFO.INFO-TS]Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, [PHYS.PHYS.PHYS-MED-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Medical Physics [physics.med-ph]
Abstract: International audience; As an alternative to fat-water chemical shift encoding MRI, an accelerated spiral chemical shift imaging method is proposed for fat-water and T2* quantification.
Published: 2019

14. Design d'impulsions RF par contrôle optimal pour l'optimisation du contraste en IRM : applications in vivo

Author: Van Reeth , E., Ratiney , H., Gaillard , S., Beuf , O., Tesch , M., Glaser , S., Sugny , D., 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Plateforme d'Imagerie Multimodale LyonTech ( PILoT ), Department of Chemistry [Munich], Technische Universität München [München] ( TUM ), Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne ( LICB ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plateforme d'Imagerie Multimodale LyonTech (PILoT), Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM), Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne (LICB), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Rayet, Béatrice
Subjects: [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging
Abstract: National audience; But : Le design d’impulsions radio-fréquence (RF) par contrôle optimal pour l’optimisation du contraste a récemment été proposé [1]. Ces impulsions garantissent un certain degré d’optimalité sur le contraste obtenu, qui s’approche de la borne théorique. Jusqu’alors, leur utilisation a été validée sur IRM lors d’expériences in vitro uniquement [2]. Cette étude étend ces résultats in vivo sur cerveaux de rat et souris.Méthode : Le problème de contrôle optimal, via la résolution du Principe du Maximum de Pontryagin [3] (PMP), consiste à calculer le contrôle qui optimise une fonction de coût, connaissant la dynamique du système à optimiser. Appliqué à l’IRM, il s’agit de calculer les composantes réelles et imaginaires du champ RF qui amène l’aimantation, dont l’évolution est régie par les équations de Bloch, dans un état souhaité. Pour l’optimisation du contraste, l’état d’aimantation souhaité depend du contraste désiré. Soient Ma(t) et Mb(t) l’aimantation des spins a et b. L’optimisation du contraste (maximisation du signal du spin b et minimisation de a), revient à minimiser : C(w) = ||Ma(tf)||2 - ||Mb(tf)||2 avec w = (wx, wy) le champ RF et tf la durée du champ RF au bout de laquelle le contraste souhaité est atteint. Cette durée est généralement assez longue pour permettre la combinaison des phénomènes d’excitation et de relaxation (centaine de ms). La résolution numérique de ces équations est effectuée grâce à l’algorithme GRAPE [4], qui réduit itérativement la fonction de coût par descente de gradient tout en respectant les contraintes imposées par le PMP. Enfin, les inhomogénéités de champ sont prises en compte dans la dynamique du système, afin que le champ RF soit robuste aux déviations par rapport à la fréquence de Larmor.Résultats : Les acquisitions in vivo ont été réalisées sur cerveaux de rat et souris, sur un IRM Bruker petit animal 4.7T, avec des antennes en quadrature. Dans les deux expériences, le champ RF optimal est calculé de sorte à préparer le contraste sur l’axe longitudinal MZ (impulsion non sélective). L’aimantation est ensuite basculée dans le plan transverse en utilisant un schéma d’excitation classique, ici une séquence RARE. Le TE est fixé le plus court possible (8 ms) afin d’assurer la préservation du contraste au moment de l’acquisition. Le TR est fixé suffisamment long (5 s) pour assurer la repouse complète de l’aimantation, contrainte de l’implémentation actuelle de l’algorithme GRAPE. Le calcul des champs RF nécessite la connaissance des temps de relaxation des tissus à contraster. Ces derniers sont estimés à partir de régressions exponentielles du pic d’eau dans des voxels de spectroscopie acquis à plusieurs TE et TR. L’expérience sur souris consiste à saturer le signal du cerveau ([T1c T2c] = [920, 66] ms) et maximiser le signal des muscles pariétaux ([T mT2m] = [1011, 30] ms) situés de part et d’autre du cerveau. La Figure 1 montre l’amplitude du champ RF optimal calculé, ainsi que l’évolution de l’aimantation du cerveau et des muscles pendant l’application de ce champ. L’image acquise est montrée en Figure 2. L’expérience sur rat consiste à maximiser le signal de l’hippocampe ([T1h T2h] = [921, 68] ms) et minimiser celui du thalamus ([T1t T2t] = [832, 63] ms). La Figure 3 montre une comparaison entre l’image acquise au TE maximisant le contraste T2 (65.4 ms) et l’image obtenue grâce au champ optimal.Discussion : Notons tout d’abord que les images obtenues avec les champs RF calculés ne souffrent pas d’artefacts dus aux inhomogénéités de champ malgré la proximité des canaux auditifs. La Figure 2 illustre la flexibilité sur le contraste qu’offrent les champs calculés par contrôle optimal. Il est en effet difficile de reproduire ce contraste avec les pondérations classiques T1 ou T2 car (T2c > T2m) et (T1c ≈ T m). La Figure 3 montre que l’on peut obtenir un contraste meilleur que le simple contraste T2, et que la visualisation du lemnisque médian est nettement améliorée.Remerciements : ANR-DFG (14-CE35-0013-01), Labex PRIMES (ANR-11-LABX-0063/ANR-11-IDEX-0007).1. Lapert M, et al. Exploring the physical limits of saturation contrast in magnetic resonance imaging” Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2012, 22. Van Reeth E, et al. Optimizing MRI Contrast with B1 pulses using optimal control theory, IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 20163. Pontryagin L S, Mathematical theory of optimal processes, CRC Press, 1987.4. Khaneja N, et al. “Optimal control of coupled spin dynamics: design of nmr pulse sequences by gradient ascent algorithms,” Journal of Magnetic Resonance, 172(2), 2005.
Published: 2017

15. SRM in vivo pour l’étude de la composition tissulaire colorectale : résultats préliminaires

Author: Dorez, H., Ratiney, H., Gaillard, S., Moussata, D., Sablong, R., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme d'Imagerie Multimodale LyonTech (PILoT), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), and Hospices Civils de Lyon (HCL)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Labex PRIMES
Abstract: International audience
Published: 2017

16. 2D Correlated MRS as a quantitative method to asses liver fatty acid composition of ob/ob mouse

Author: Martel , D., Langlois , J.-B., Friboulet , Denis, Beuf , O., Ratiney , H., Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'Exploration et de Recherche Médicales par Émission de Positons ( CERMEP ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-CHU Grenoble-Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -CHU Saint-Etienne-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), 2 - Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Etude et de Recherche Multimodal Et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant (CERMEP - imagerie du vivant), Université de Lyon-Université de Lyon-CHU Grenoble-Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU Saint-Etienne-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and RMN et optique : De la mesure au biomarqueur
Subjects: [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging
Abstract: International audience; Magnetic Resonance Spectroscopy (MRS) is a well suited method for in vivo characterization of lipid content. However, due to short T2relaxation time and B0 field inhomogeneity, classical methods such as STEAM/PRESS MRS, with clinical or medium preclinical B0 field (B0
Published: 2015

17. Non uniform sampling for sparse 2D correlated MRS: a quantitative point of view

Author: Martel, D., Merhej, D., Prost, R., Friboulet, Denis, Ratiney, H., Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut supérieur des sciences appliquées et économiques - CNAM Liban (ISSAE-CNAM Liban), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), Images et Modèles, Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Rayet, Béatrice, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Supérieur des Sciences Appliquées et Économiques - CNAM Liban ( ISSAE ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), 2 - Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), and 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs
Subjects: [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging
Abstract: International audience; 2D MR spectroscopy has the advantage to increase spectral resolution by unraveling the spectral information along a second dimension and resultsin a gain in quantification precision at the cost of increased acquisition time. To overcome this issue, non uniform sampling (NUS) allowing acquisition acceleration has recently been revisited as a solution in combination with the compressed sensing (CS) reconstruction or maximum entropy. NUS scheme is generally designed with randomly chosen indirect dimension step (t1). Besides, by taking advantage of the prior knowledge on the spectral support of sparse spectra, one can optimize the indirect dimension NUS regarding the reconstructed spectral information in COSY (Correlation spectroscopy) type spectra. The 2D time domain signal is a sum of separable terms resulting in separable spectrum with same spectral support in the two frequency domains. The sequential backward selection (SBS) algorithm can be used for choosing the indirect dimension step leading to decreasing noise and error in the reconstruction of the spectrum. The aim of this work is to demonstrate and study the feasibility of time domain quantification for NUS applied on Localized COSY (L-COSY) spectra by using this SBS approach.
Published: 2015

18. Spectroscopie 2D de corrélation : acquisition et méthode de quantification pour la détermination lipidique du foie dans un modèle de souris obèse

Author: Martel , D., Langlois , J.-B., Friboulet , Denis, Beuf , O., Ratiney , H., Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'Exploration et de Recherche Médicales par Émission de Positons ( CERMEP ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-CHU Grenoble-Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -CHU Saint-Etienne-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), 2 - Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Etude et de Recherche Multimodal Et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant (CERMEP - imagerie du vivant), Université de Lyon-Université de Lyon-CHU Grenoble-Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU Saint-Etienne-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and RMN et optique : De la mesure au biomarqueur
Subjects: [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging
Abstract: International audience
Published: 2015

19. Imagerie Spectroscopique par multiple échos de gradient entrelacés : application à l’imagerie abdominale

Author: Ratiney, H., Gambarota, Giulio, Martel, D., Saint-Jalmes, Hervé, Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image ( LTSI ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging
Abstract: International audience; Les troubles métaboliques impliqués dans l’obésité, le syndrome métabolique ou les complications liées à la stéatose hépatiques sont liés. Leur étude nécessite d’analyser de façon non invasive les graisses abdominales, accumulées dans le foie ou dans les tissus adipeux. Différentes méthodologies en IRM et en spectroscopie se sont développées tout récemment dans ce but. Nous présentons ici une méthode simple fondée sur l’entrelacement de multiple échos de gradient permettant après reconstruction dédiée d’obtenir une image spectroscopique des graisses abdominales.
Published: 2015

20. Quantification de signaux de spectroscopie 2D de corrélation échantillonnés irrégulièrement

Author: Martel, D., Merhej, D., Friboulet, Denis, Prost, R., Ratiney, H., Rayet, Béatrice, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut supérieur des sciences appliquées et économiques - CNAM Liban (ISSAE-CNAM Liban), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), Images et Modèles, Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Supérieur des Sciences Appliquées et Économiques - CNAM Liban ( ISSAE ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), 2 - Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), and 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs
Subjects: [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SPI.SIGNAL] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing
Abstract: International audience; La spectroscopie 2D permet d’augmenter la résolution spectrale en déroulant l’information spectrale le long d’une dimension supplémentaire, et ainsi d’obtenir une meilleure discrimination des composantes du spectre et une quantification plus précise. Cependant le temps d’acquisition augmente. Pour diminuer ce dernier, il existe des méthodes d’échantillonnage irrégulier avec reconstruction par échantillonnage compressé ou par maximum d’entropie permettant d’acquérir moins de lignes en dimension indirecte t1. Le choix de ces incréments est généralement fait de manière aléatoire. En prenant appui sur le support spectral de spectres parcimonieux de type COSY, le choix de ces lignes peut être optimisé [2]. Le signal 2D acquis est composé d’une somme de termes séparables résultant en une somme de spectres séparables le long des deux directions fréquentielles du spectre. L’algorithme SBS (sequential backward selection) permet de choisir les lignes en t1 pour diminuer le bruit et l’erreur de reconstruction du spectre. Ce travail étudie la possibilité d’une quantification dans le domaine temporel des spectres localisés COSY acquis irrégulièrement via un choix des lignes t1 par l’algorithme SBS
Published: 2015

21. Evaluation of 2D L-COSY to study lipid composition in mouse fatty liver at 7T

Author: Martel, D., Langlois, J.-B., Friboulet, Denis, Beuf, O., Ratiney, H., 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'Exploration et de Recherche Médicales par Émission de Positons ( CERMEP ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-CHU Grenoble-Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -CHU Saint-Etienne-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), 2 - Images et Modèles, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Etude et de Recherche Multimodal Et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant (CERMEP - imagerie du vivant), Université de Lyon-Université de Lyon-CHU Grenoble-Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU Saint-Etienne-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), and Images et Modèles
Subjects: [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing
Abstract: International audience; Recent studies have demonstrated the ability of 1D MRS to assess in vivo hepatic fatty composition. In this study, we evaluate the use of the 2D Localized Correlation Spectroscopy (LCOSY) to analyze lipid composition of fatty liver of ob/ob mice and compare it to 1D MRS . Our results show that LCOSY can be used for the study of fatty liver to derive quantitative indexes in a more robust way than 1D MRS
Published: 2014

22. Fast multidimensional NMR spectroscopy for sparse spectra

Author: Merhej , D., Ratiney , H., Diab , C., Khalil , M., Sdika , M., Prost , R., Institut supérieur des sciences appliquées et économiques - CNAM Liban (ISSAE-CNAM Liban), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), EDST Azm Research Center, Lebanese University [Beirut] (LU), Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Service Informatique et développements, Institut Supérieur des Sciences Appliquées et Économiques - CNAM Liban ( ISSAE ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Lebanese University [Beirut], and 2 - Images et Modèles
Subjects: [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging
Abstract: International audience; Multidimensional NMR spectroscopy is widely used for studies of molecular and biomolecular structure. A major disadvantage of multidimensional NMR is the long acquisition time which, regardless of sensitivity considerations, may be needed to obtain the final multidimensional frequency domain coefficients. In this article, a method for under-sampling multidimensional NMR acquisition of sparse spectra is presented. The approach is presented in the case of two-dimensional NMR acquisitions. It relies on prior knowledge about the support in the two-dimensional frequency domain to recover an over-determined system from the under-determined system induced in the linear acquisition model when under-sampled acquisitions are performed. This over-determined system can then be solved with linear least squares. The prior knowledge is obtained efficiently at a low cost from the one-dimensional NMR acquisition, which is generally acquired as a first step in multidimensional NMR. If this one-dimensional acquisition is intrinsically sparse, it is possible to reconstruct the corresponding two-dimensional acquisition from far fewer observations than those imposed by the Nyquist criterion, and subsequently to reduce the acquisition time. Further improvements are obtained by optimizing the sampling procedure for the least-squares reconstruction using the sequential backward selection algorithm. Theoretical and experimental results are given in the case of a traditional acquisition scheme, which demonstrate reliable and fast reconstructions with acceleration factors in the range 3-6. The proposed method outperforms the CS methods (OMP, L1) in terms of the reconstruction performance, implementation and computation time. The approach can be easily extended to higher dimensions and spectroscopic imaging.
Published: 2014

23. Evaluation of Localized 2D-MRS (Correlation and J-Resolved) methods with respect to quantification purposes

Author: Martel , D., Friboulet , Denis, Grenier , D., Ratiney , H., 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), 2 - Images et Modèles, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Images et Modèles
Subjects: [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging
Abstract: International audience; 2D Magnetic Resonance Spectroscopy (2D-MRS) has proved to improve the detection and quantification of metabolite in vivo at medium clinical field [1,2]. Various 2D-MRS methods can be applied and this work evaluates, for COSY and J-resolved like sequences, important characteristics with respect to model-based quantification purposes, namely signal to noise ratio (SNR) -for similar acquisition time- and Cramér Rao lower bounds (CRLB).
Published: 2013

24. Simultaneous Two-Channel Mr Imaging, Single Voxel Spectroscopy And Chemical Shift Imaging By Reconfiguration Of A 'Standard' Biospec Spectrometer

Author: Perrier, A.-L., Ratiney, H., Rengle, A., Grenier, D., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme d'Imagerie Multimodale LyonTech (PILoT), 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, Computer Science::Information Theory
Abstract: International audience; Simultaneous two channel array proton imaging, single voxel PRESS and CSI acquisitions were demonstrated after reconfiguration and minimum hardware modification of a standard 4.7T BioSpec® spectrometer. Validation of the reconfiguration was assessed in phantoms and in a mouse brain. The modified configuration used the X channel exhibiting similar SNR performances compared to the 1H channel. The SNR gain for the two channel array coil was up to 1.3 compared to the SNR obtained with a reference surface coil. Compared to regular two element coil with quadrature combination, the SNR was improved with an additional gain of 1.3. These modifications could also be applied for any X nucleus
Published: 2013
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25. In vivo Transverse Relaxation Time measurements from Localized CT-COSY and JPRESS: a validation study

Author: Martel, D., Friboulet, D., Grenier, D., Ratiney, H., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Images et Modèles
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee, Labex PRIMES
Abstract: International audience
Published: 2013

26. Abdominal fat segmentation using T1- and T2*- corrected images and characterization by proton spectroscopy: preliminary study

Author: Monnier, F., Ratiney, H., Leporq, B., Laville, M., Seyssel, Kévin, Valette, P-J., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Nutrition Humaine Rhône-Alpes (CRNH-RH), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-CHU Saint-Etienne-Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Ratiney, Helene, Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Nutrition Humaine Rhône-Alpes (CRNH-RA), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-CHU Saint-Etienne-Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU Grenoble, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Labex PRIMES
Abstract: International audience
Published: 2013

27. Utilisation d'une carte d'inhomogénéités du champ statique BO comme connaissance a priori en spectroscopie de résonnance magnétique quantitative bidimentionnelle

Author: Martel, D., Roussel, T., Friboulet, D., Grenier, D., Ratiney, H., 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), 2 - Images et Modèles, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Images et Modèles
Subjects: [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2012

28. B0 field Mapping to improve prior knowledge in quantitative 2D-MR Spectroscopy

Author: Martel, D., Roussel, T., Friboulet, D., Grenier, D., Ratiney, H., 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), 2 - Images et Modèles, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Images et Modèles, and Plateforme d'Imagerie Multimodale LyonTech (PILoT)
Subjects: [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

29. Metabolic profile of inflammation in the hippocampus

Author: Combaz , X., Cayre , M., Le Fur , Y., Pecchi , E., Courtes , S., Confort-Gouny , S., Ratiney , H., Cozzone , P.J., Viola , A., Centre de résonance magnétique biologique et médicale ( CRMBM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie du Développement de Marseille ( IBDM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de recherche en neurobiologie - neurophysiologie de Marseille ( CRN2M ), 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche en neurobiologie - neurophysiologie de Marseille (CRN2M), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing
Abstract: International audience; Purpose/Introduction: Intracerebral injections are used in animal models of brain pathologies to evaluate the therapeutic impact of drugs, which cannot cross the blood brain barrier. These procedures not only cause lesions at the site of injection, but also may affect brain metabolism as a consequence of inflammation even in distant locations. In order to identify these perturbations we performed an in vivo 1H-MRS study of mice receiving an intracerebroventricular (icv) injection of saline and analyzed the metabolic profile of the dendate gyrus, a neurogenic niche in the adult brain.
Published: 2012

30. 3D Localized 2D J-Resolved MR Spectrum in a single scan

Author: Roussel , T., Giraudeau , P., Ratiney , H., Akoka , S., Cavassila , S., 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation ( CEISAM ), Université de Nantes ( UN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

31. 2D ultrafast J-resolved MRS sequence with 3D Localization: an in vitro validation on a 7T imaging system

Author: Akoka , S., Roussel , T., Giraudeau , P., Ratiney , H., Cavassila , S., Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation ( CEISAM ), Université de Nantes ( UN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: stomatognathic diseases, health care facilities, manpower, and services, education, [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, health care economics and organizations
Abstract: Présentation orale; International audience
Published: 2012

32. MR-liver steatosis assessment using a magnitude-based technique with independent fat and water T2* estimations, T1-related bias correction and accounting for spectral complexity of fa

Author: Leporq, B., Ratiney, H., Pilleul, F., Beuf, O., 5 - RMN et optique : De la mesure aux biomarqueurs, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Departement d'imagerie Digestive, Hospices Civils de Lyon ( HCL ), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Hospices Civils de Lyon (HCL)
Subjects: [ SPI.SIGNAL ] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2012

33. Metabolic Profile of Inflammation in the hyppocampus

Author: Combaz, X., Cayre, M., Le Fur, Y., Pecchi, E., Courtes, S., Confort-Gouny, Sylviane, Ratiney, H., Cozzone, P.J., Viola, A., Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche en neurobiologie - neurophysiologie de Marseille (CRN2M), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

34. MR-liver fat volume fraction quantification using a magnitude-based technique with independent fat and water T2* estimations, T1-related bias correction and accounting for fat multiple resonances

Author: Leporq, B., Ratiney, H., Saint Jalmes, H., Pilleul, F., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Departement d'imagerie Digestive, Hospices Civils de Lyon (HCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2012

35. Undersampled MRSI k-space for spectra with limited support

Author: Merhej, D, Ratiney, H., Diab, C., Khalil, M, Prost, R., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut supérieur des sciences appliquées et économiques - CNAM Liban (ISSAE-CNAM Liban), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), EDST Azm Research Center, Lebanese University [Beirut] (LU), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, reseau_international, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Images et Modèles, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

36. Towards a biochemical and structure specific quantitative analysis of the mouse brain using Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging at 11.7T

Author: Ratiney, H., Sdika, Michaël, Beuf, O., Le Fur, Y., Cavassila, S., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, gdr, reseauₙational, imagerie_RMN_optique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

37. Towards in vivo Ultrafast 2D Localized Magnetic Resonance Spectroscopy

Author: Roussel, T., Giraudeau, P., Ratiney, H., Akoka, S., Cavassila, S., Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee
Abstract: International audience
Published: 2011

38. Undersampling for fast multidimensional spectroscopy with sparse frequency domain

Author: Merhej, Dany, Ratiney, H., Diab, Chaouki, Khalil, Mohamad, Prost, R., Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut supérieur des sciences appliquées et économiques - CNAM Liban (ISSAE-CNAM Liban), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), Université Libanaise, and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, reseau_international, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Images et Modèles, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

39. Quantitative MRS lipid composition follow-up of a GSD1 mouse model subject to a diet change

Author: Ramamonjisoa, N., Ratiney, H., Guillou, H., Mutel, E., Mithieux, G., Pilleul, F., Rajas, F., Beuf, O., Cavassila, S., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), The Inositide Laboratory, Babraham Institute, Nutrition et cerveau (U1213, U855), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Departement d'imagerie Digestive, and Hospices Civils de Lyon (HCL)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

40. Accurate Quantication for in vivo 2D J-Resolved Spectroscopy in rat brain at 7T

Author: Roussel, T., Cavassila, S., Langlois, JB., Grenier, D., Ratiney, H., Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, commₒrale, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, commₐffichee
Abstract: International audience
Published: 2011

41. Wavelet-based Techniques in MRS

Author: Suvichakorna, A., Ratiney, H., Cavassila, S., and Antoine, J.-P
Published: 2010

42. Classification des différents états physiologiques d\textquoterightun organisme aquatique: la daphnie (Daphnia magna) d\textquoterightaprès son spectre RMN HRMAS proton in vivo

Author: Bunescu, A., Fauvelle, F., Ratiney, H., Garric, J., Synthèse et étude de systèmes à intêret biologique (SEESIB), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biophysique Cellulaire et Moléculaire, Centre Recherche Service Santé Armée, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, reseauₙational, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

43. Stratégies de quantification en spectroscopie 2D J-résolue in vivo

Author: Roussel, T., Cavassila, S., Ratiney, H., Ratiney, Helene, Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

44. Sampling strategy effects on in vivo 2D J-Resolved spectroscopy quantification

Author: Roussel, T., Cavassila, S., Ratiney, H., Ratiney, Helene, Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

45. In vivo hepatic localized proton magnetic resonance spectroscopy at 7T in a glycogen storage disease mouse model

Author: Ramamonjisoa, N., Ratiney, H., Rajas, F., Mutel, E., Pilleul, F., Beuf, O., Cavassila, S., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition et cerveau (U1213, U855), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

46. Fat content quantification errors using multiple gradient echo imaging: A phantom and simulation study

Author: Leporq, B., Ratiney, H., Cavassila, S., Pilleul, F., Beuf, O., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₘixte, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

47. Short Echo Time H1 Chemical Shift Imaging data quantification in the mouse brain at 11.7T using a constrained parametric macromolecular model

Author: Ratiney, H., Le Fur, Y., Sdika, Michaël, Cavassila, S., Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ratiney, Helene
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

48. Spectroscopie de resonance magnetique in vivo d\textquoterightun modele murin de glycogenose 1a a 7 T dans le foie

Author: Ramamonjisoa, N., Ratiney, H., Rajas, F., Mutel, E., Pilleul, F., Beuf, O., Cavassila, S., RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition et cerveau (U1213, U855), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2010

49. Novel quantification strategy for in vivo 2D J-Resolved spectroscopy

Author: Roussel, T., Cavassila, S., Ratiney, H., Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille (CINaM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ratiney, Helene, Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

50. Beyond lipid quantification of in vivo clinical hepatic 1.5T 1H MRS signals

Author: Bucur, A., Ratiney, H., Beuf, O., Pilleul, F., Cavassila, S., Ratiney, Helene, Centre de Recherche et d'Application en Traitement de l'Image et du Signal (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École Supérieure Chimie Physique Électronique de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Méthodes et systèmes en IRM et optique, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, categₛt2i, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, imagerie_RMNₒptique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2009

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