625 results on '"Ranjard , Lionel"'
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2. Sols, sciences et recherches participatives : comment consolider et fédérer le foisonnement d’initiatives en France ?
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Gascuel Chantal, Loiseau-Dubosc Philippe, Auclerc Apolline, Bougon Nolwenn, Caquet Thierry, Lerouyer Valérie, Pierart Antoine, Ranjard Lionel, Resche-Rigon Frédérique, Roturier Christophe, Sauter Joëlle, and Serin Ludovic
- Subjects
sol ,sciences participatives ,science ,société ,Science ,Social Sciences - Abstract
Dans le contexte du développement des sciences et recherches participatives (SRP), de plus en plus d’initiatives sur les sols ont été engagées ces dernières années. Les sols sont des objets particulièrement intéressants pour les SRP car, en tant qu’écosystème en interface directe avec les hommes et d’autres écosystèmes, ils sont affectés par les activités humaines et ils sont des leviers de transformation, que ce soit du point de vue de l’agroécologie, de la biodiversité, de l’alimentation ou du climat. Cet article présente : i) les résultats d’une enquête réalisée auprès de la vingtaine de porteurs de projets identifiés en France, une analyse des propriétés et contextes ciblés ainsi que du niveau d’association des acteurs de la recherche et de la société ; ii) les enseignements d’un colloque rassemblant les acteurs des projets de SRP sur les sols, notamment à propos des attentes, des productions pour la recherche et la société, des difficultés et pépites, des mutualisations possibles. Ce colloque a rassemblé une centaine de personnes et a jeté les bases d’une mise en réseau national des acteurs concernés.
- Published
- 2023
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3. Impact of biogas digestates on soil microbiota in agriculture: a review
- Author
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Karimi, Battle, Sadet-Bourgeteau, Sophie, Cannavacciuolo, Mario, Chauvin, Camille, Flamin, Cyril, Haumont, Adeline, Jean-Baptiste, Vincent, Reibel, Aurélie, Vrignaud, Grégory, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2022
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4. Biogéographie bactérienne des sols à l’échelle de la France
- Author
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KARIMI, Battle, primary and RANJARD, Lionel, additional
- Published
- 2022
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5. Impact of farming systems on soil ecological quality: a meta-analysis
- Author
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Christel, Amélie, Maron, Pierre-Alain, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2021
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6. Ecotoxicity of copper input and accumulation for soil biodiversity in vineyards
- Author
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Karimi, Battle, Masson, Vincent, Guilland, Charles, Leroy, Emmanuel, Pellegrinelli, Sylvain, Giboulot, Emmanuel, Maron, Pierre-Alain, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2021
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7. Impacts of national scale digital soil mapping programs in France
- Author
-
Arrouays, Dominique, Richer-de-Forges, Anne C., Héliès, Florence, Mulder, Vera Leatitia, Saby, Nicolas P.A., Chen, Songchao, Martin, Manuel P., Román Dobarco, Mercedes, Follain, Stéphane, Jolivet, Claudy, Laroche, Bertrand, Loiseau, Thomas, Cousin, Isabelle, Lacoste, Marine, Ranjard, Lionel, Toutain, Benoît, Le Bas, Christine, Eglin, Thomas, Bardy, Marion, Antoni, Véronique, Meersmans, Jeroen, Ratié, Céline, and Bispo, Antonio
- Published
- 2020
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8. Correction to: Impact of biogas digestates on soil microbiota in agriculture: a review
- Author
-
Karimi, Battle, Sadet-Bourgeteau, Sophie, Cannavacciuolo, Mario, Chauvin, Camille, Flamin, Cyril, Haumont, Adeline, Jean-Baptiste, Vincent, Reibel, Aurélie, Vrignaud, Grégory, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2023
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9. A meta-analysis of the ecotoxicological impact of viticultural practices on soil biodiversity
- Author
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Karimi, Battle, Cahurel, Jean-Yves, Gontier, Laure, Charlier, Laurent, Chovelon, Marc, Mahé, Héloise, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2020
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10. Short-Term PE Generation Processes in the Soils of a Farmer Plots Network in the Madagascar Highlands: Actors and Drivers
- Author
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Razanamalala, Kanto, primary, Razafimbelo, Tantely, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Ranjard, Lionel, additional, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Becquer, Thierry, additional, Trap, Jean, additional, Blanchart, Eric, additional, and Bernard, Laetitia, additional
- Published
- 2023
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11. Biogeographical patterns of the soil fungal:bacterial ratio across France
- Author
-
Djemiel, Christophe, primary, Dequiedt, Samuel, additional, Bailly, Arthur, additional, Tripied, Julie, additional, Lelièvre, Mélanie, additional, Horrigue, Walid, additional, Jolivet, Claudy, additional, Bispo, Antonio, additional, Saby, Nicolas, additional, Valé, Matthieu, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Ranjard, Lionel, additional, and Terrat, Sébastien, additional
- Published
- 2023
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12. Reply to the comment by Imfeld et al. on ‘Ecotoxicity of copper input and accumulation for soil biodiversity in vineyards’ by Karimi et al. (2021)
- Author
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Karimi, Battle, Maron, Pierre-Alain, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2021
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13. Unraveling biogeographical patterns and environmental drivers of soil fungal diversity at the French national scale
- Author
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Djemiel, Christophe, primary, Dequiedt, Samuel, additional, Horrigue, Walid, additional, Bailly, Arthur, additional, Lelièvre, Mélanie, additional, Tripied, Julie, additional, Guilland, Charles, additional, Perrin, Solène, additional, Comment, Gwendoline, additional, Saby, Nicolas, additional, Jolivet, Claudy, additional, Bispo, Antonio, additional, Boulonne, Line, additional, Pierart, Antoine, additional, Wincker, Patrick, additional, Cruaud, Corinne, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Terrat, Sébastien, additional, and Ranjard, Lionel, additional
- Published
- 2023
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14. BIOCOM-PIPE: a new user-friendly metabarcoding pipeline for the characterization of microbial diversity from 16S, 18S and 23S rRNA gene amplicons
- Author
-
Djemiel, Christophe, Dequiedt, Samuel, Karimi, Battle, Cottin, Aurélien, Girier, Thibault, El Djoudi, Yassin, Wincker, Patrick, Lelièvre, Mélanie, Mondy, Samuel, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, and Terrat, Sébastien
- Published
- 2020
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15. Soil parameters, land use, and geographical distance drive soil bacterial communities along a European transect
- Author
-
Plassart, Pierre, Prévost-Bouré, Nicolas Chemidlin, Uroz, Stéphane, Dequiedt, Samuel, Stone, Dorothy, Creamer, Rachel, Griffiths, Robert I., Bailey, Mark J., Ranjard, Lionel, and Lemanceau, Philippe
- Published
- 2019
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16. Unraveling biogeographical patterns and environmental drivers of soil fungal diversity at the French national scale.
- Author
-
Djemiel, Christophe, Dequiedt, Samuel, Horrigue, Walid, Bailly, Arthur, Lelièvre, Mélanie, Tripied, Julie, Guilland, Charles, Perrin, Solène, Comment, Gwendoline, Saby, Nicolas P. A., Jolivet, Claudy, Bispo, Antonio, Boulonne, Line, Pierart, Antoine, Wincker, Patrick, Cruaud, Corinne, Maron, Pierre-Alain, Terrat, Sébastien, and Ranjard, Lionel
- Subjects
SOIL ecology ,FOREST soils ,SOIL sampling ,SURFACE of the earth ,FUNGI - Abstract
The fungal kingdom is among the most diversified kingdoms on Earth, with estimations of up to 12 million species. However, it remains poorly understood, with only 150 000 fungal species currently described. Given the major ecological role of fungi in ecosystem functioning, these numbers stress the importance of investigating fungal diversity description across different ecosystem types. Here, we explored the spatial distribution of the soil fungal diversity on a broad geographical scale, using the French Soil Quality Monitoring Network that covers the whole French territory (2171 soils sampled along a systematic grid). Fungal alpha diversity was assessed directly from soil DNA using a meta-barcoding approach by targeting the 18S rDNA gene. The total accumulated fungal diversity across France included 136 219 operational taxonomic units (OTUs), i.e., about 1 % of worldwide soil fungal diversity (based on a maximum diversity estimate of 12 million) for a territory representing only 0.3 % of the terrestrial surface on Earth. Based on this dataset, the first extensive map of fungal alpha diversity was drawn and showed a heterogeneous and spatially structured distribution in large biogeographical patterns of 231 km radius for richness (Hill diversity of order 0) and smaller patterns of 36 km radius for dominant fungi (Hill diversity of order 2). As related to other environmental parameters, the spatial distribution of fungal diversity (Hill numbers based on different orders of diversity) was mainly influenced by local filters such as soil characteristics and land management and also by global filters such as climate conditions with various relative influences. Interestingly, cropped soils exhibited the highest pool of fungal diversity relative to forest and vineyard soils. To complement this, soil fungal OTU network interactions were calculated for the different land uses across France. They varied hugely and showed a loss of 75 % of the complexity in crop systems and grasslands compared to forests and up to 83 % in vineyard systems. Overall, our study revealed that a nationwide survey with a high spatial-resolution approach is relevant for deeply investigating the spatial distribution and determinism of soil fungal diversity. Our findings provide novel insights for a better understanding of soil fungal ecology across the 18S rDNA gene and upgrade biodiversity conservation policies by supplying representative repositories dedicated to soil fungi. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2024
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17. Soil microbial diversity drives the priming effect along climate gradients: a case study in Madagascar
- Author
-
Razanamalala, Kanto, Razafimbelo, Tantely, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, Chemidlin, Nicolas, Lelièvre, Mélanie, Dequiedt, Samuel, Ramaroson, Volaniaina H, Marsden, Claire, Becquer, Thierry, Trap, Jean, Blanchart, Eric, and Bernard, Laetitia
- Published
- 2018
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18. Bilan et Analyse du mandat 2019-2022 du CSO R&I (Ecophyto II+)
- Author
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Reboud, Xavier, De Tarlé, Sibylle, Lequin, Sonia, Bonato, Olivier, Bordin, Thierry, De Lapeyre de Bellaire, Luc, Durlin, Christian, Fontaine, Laurence, Galindo, Sabine, Le Bellec, Fabrice, Malausa, Thibaut, Messéan, Antoine, Moreau, Jérôme, Nicot, Philippe, Ranjard, Lionel, Thibierge, Jérôme, Van Baaren, John, Baldi, Isabelle, Bemadac, Gérard, Gallien, Marc, Payrastre, Laurence, Mortaud, Stéphane, Salles, Bernard, Goutte, Aurélie, Graber, Marianne, Kammerer, Martine, Le Gall, Philippe, Richard, Freddie-Jeanne, Rouïl, Laurence, Barthélémy, Carole, Bureau-Point, Eve, Carpentier, Alain, Dumat, Camille, Fleury-Bahi, Ghozlane, Gibert, Caroline, Jourjon, Frédérique, Miralles, André, Temple, Ludovic, Marchand, Philippe, Cousinié, Philippe, Bottou, Caroline, Reboud, Xavier, De Tarlé, Sibylle, Lequin, Sonia, Bonato, Olivier, Bordin, Thierry, De Lapeyre de Bellaire, Luc, Durlin, Christian, Fontaine, Laurence, Galindo, Sabine, Le Bellec, Fabrice, Malausa, Thibaut, Messéan, Antoine, Moreau, Jérôme, Nicot, Philippe, Ranjard, Lionel, Thibierge, Jérôme, Van Baaren, John, Baldi, Isabelle, Bemadac, Gérard, Gallien, Marc, Payrastre, Laurence, Mortaud, Stéphane, Salles, Bernard, Goutte, Aurélie, Graber, Marianne, Kammerer, Martine, Le Gall, Philippe, Richard, Freddie-Jeanne, Rouïl, Laurence, Barthélémy, Carole, Bureau-Point, Eve, Carpentier, Alain, Dumat, Camille, Fleury-Bahi, Ghozlane, Gibert, Caroline, Jourjon, Frédérique, Miralles, André, Temple, Ludovic, Marchand, Philippe, Cousinié, Philippe, and Bottou, Caroline
- Abstract
Les objectifs de réduction des produits phytopharmaceutiques portés par le plan Ecophyto Il+ apportent de nouveaux défis à I' Agriculture. L'enjeu de l'Axe 2 Recherche & Innovation est de mobiliser l'ensemble du système de recherche-innovation afin d'apporter les connaissances nécessaires pour les relever et d'appuyer les politiques publiques dans la transition vers un modèle agroécologique des cultures. Cet axe est piloté et orienté par un Comité Scientifique d'Orientation {CSO R&I). Le document " Héritage CSO R&I " dresse un bilan et une analyse synthétiques des actions conduites par les membres du CSO R&I lors du mandat 2019-2022. Il met en perspective les réflexions scientifiques stratégiques, leurs concrétisations en actions (appels à projets, animation scientifique, valorisation ... ), les freins rencontrés et les perspectives pour le prochain mandat 2023-2026.
- Published
- 2023
19. Ultrahigh-resolution FT-ICR mass spectrometry for molecular characterisation of pressurised hot water-extractable organic matter in soils
- Author
-
Guigue, Julien, Harir, Mourad, Mathieu, Olivier, Lucio, Marianna, Ranjard, Lionel, Lévêque, Jean, and Schmitt-Kopplin, Philippe
- Published
- 2016
20. Biogeography of Soil Bacterial Networks along a Gradient of Cropping Intensity
- Author
-
Karimi, Battle, Dequiedt, Samuel, Terrat, Sébastien, Jolivet, Claudy, Arrouays, Dominique, Wincker, Patrick, Cruaud, Corinne, Bispo, Antonio, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2019
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21. Biogeographical patterns of the soil fungal: bacterial ratio across France.
- Author
-
Djemiel, Christophe, Dequiedt, Samuel, Bailly, Arthur, Tripied, Julie, Lelièvre, Mélanie, Horrigue, Walid, Jolivet, Claudy, Bispo, Antonio, Saby, Nicolas, Valé, Matthieu, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, and Terrat, Sébastien
- Published
- 2023
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22. Handbook to establish a large-scale soil biodiversity monitoring: the French experience of the RMQS-Biodiversity
- Author
-
Imbert, Camille, primary, Santorufo, Lucia, additional, Ortega, Carole, additional, Jolivet, Claudy, additional, Auclerc, Apolline, additional, Bougon, Nolwenn, additional, Capowiez, Yvan, additional, Chauvel, Bruno, additional, Cheviron, Nathalie, additional, Cluzeau, Daniel, additional, Cortet, Jérôme, additional, Hedde, Mickael, additional, Lévêque, Antoine, additional, Maunoury-Danger, Florence, additional, Mougin, Christian, additional, Palka, Laurent, additional, Pérès, Guénola, additional, Ranjard, Lionel, additional, Villenave, Cécile, additional, and Bispo, Antonio, additional
- Published
- 2023
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23. Short-Term Impact of Different Biogas Digestates on Three Soil Microbial Communities
- Author
-
VAUTRIN, Florian, primary, Piveteau, Pascal, additional, Cannavacciuolo, Mario, additional, Barré, Pierre, additional, Chauvin, Camille, additional, Villenave, Cécile, additional, Cluzeau, Daniel, additional, Hoeffner, Kevin, additional, Mulliez, Pierre, additional, Jean-Baptiste, Vincent, additional, Tripied, Julie, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Vrignaud, Grégory, additional, Ranjard, Lionel, additional, and Sadet-Bourgeteau, Sophie, additional
- Published
- 2023
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24. Microbiologie des sols au service d’une agriculture durable
- Author
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Ranjard, Lionel and EL Mjiyad, Noureddine
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] - Published
- 2023
25. Review of the impact of biogas digestates on the microbiological quality of agricultural soils
- Author
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Karimi, Battle, Sadet-Bourgeteau, Sophie, Cannavacciuolo, Mario, Chauvin, Camille, Flamin, Cyril, Haumont, Adeline, Jean-Baptiste, Vincent, Reibel, Aurélie, Vrignaud, Grégory, Ranjard, Lionel, and Dijon (Kevin Oudard), Institut Agro
- Subjects
Soil ,Meta-analysis ,[SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences ,sol ,micro-organismes ,Digestat ,Microorganisms ,Biogas ,Agriculture ,méta-analyse ,biogaz ,[SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology ,Anaerobic digestate - Abstract
The global production of biogas has increased threefold during the last decade to partly replace fossil fuels, yet biogas production by anaerobic digestion generates substantial amounts of by-products named digestates. These biogas digestates can be recycled in soils to fertilize crops and to sequester carbon. However, the impact of digestates on the soil biological is actually poorly known. Here we reviewed the impact of digestates published in 56 articles reporting 23 microbial parameters. Half of the articles show neutral effects of biogas digestates and 7% showed negative effects. 25% of the articles show more stimulation of biogas digestates for the soil microbial quality, compared to other organic fertilizers; whereas 17% of the articles show less stimulation. Beyond these general results, our study pointed the lack of long-term and field experiments, including a large range of agro-pedological contexts. Some questions, such as the effect of feedstock type or the vulnerability of specific soil types, remain unsolved and need more intense research effort., Au cours des deux dernières décennies, la production mondiale de biogaz a triplé avec pour objectif de remplacer une partie des combustibles fossiles. Cette production réalisée par digestion anaérobie génère d'importants volumes de sous-produits appelés digestats. Ces derniers peuvent être recyclés dans les sols afin de fertiliser les cultures et de séquestrer du carbone. Leurs répercussions sur la biologie du sol restent toutefois méconnues. Nous proposons une synthèse des connaissances scientifiques actuelles concernant l’impact des digestats de méthanisation sur la biodiversité du sol, et plus particulièrement sur le compartiment microbien. Cinquante-six articles publiés depuis 2008 ont été recensés et analysés afin de tirer des tendances générales et des pistes de recherche qui nécessitent d’être explorées. Ils renseignent les effets des digestats sur 23 paramètres microbiens. La moitié des résultats recensés indiquent un effet neutre des digestats, et 7 % un effet négatif. Un quart des résultats montre un effet plus stimulant des digestats sur la qualité microbiologique du sol que d’autres fertilisations organiques, alors que 17 % signalent une stimulation inférieure. Au-delà de ces résultats, notre étude a mis en évidence un manque important d’études à long terme et au terrain dans des conditions agro-pédologiques variées. Certaines questions, comme l’effet du type d’intrants ou la vulnérabilité de certains types de sol, restent en suspens et nécessitent des efforts de recherche.
- Published
- 2023
26. Spécificité des besoins de recherche sur la qualité des sols en Agriculture Biologique. Bilan d’un séminaire transdisciplinaire INRA-ITAB
- Author
-
Jouany, Claire, Vertès, Francoise, Fourrié, Laeticia, Nesme, Thomas, Peigné, Josephine, Ranjard, Lionel, Tchamitchian, Marc, Penvern, Servane, VERTES, Françoise, and AFES
- Subjects
[SDE] Environmental Sciences ,Organic farming ,diagnosis ,diagnostic ,Agriculture biologique ,fertilidad del suelo ,ciclo biogeoquímico ,community forum ,résilience ,servicio ecosistémico ,soil quality ,resilience ,Agricultura orgánica ,soil fertility ,forum communautaire ,service écosystémique ,biogeochemical cycle ,co-construcción ,foro comunitario ,co-construction ,ecosystem service ,diagnóstico ,fertilité du sol ,resiliencia ,calidad del suelo ,qualité du sol ,cycle biogéochimique - Abstract
In November 2018, ITAB (Institute of Agriculture and Organic Food) and INRA (National Institute for Agronomic Research) organized a transdisciplinary seminar to bring together stakeholders to: i) share issues associated with soil management in Organic Farming (OF) systems, ii) collectively define the main research questions to be addressed; and iii) facilitate the construction of networks or projects. More than 150 participants attended the seminar, which was designed using the method of citizen facilitation of the community forum type (Town Hall Meeting) allowing all parties to express themselves and a live summary by experts. The seminar identified important knowledge gaps on soils in OF systems and research needs. The 20 questions resulting from these exchanges relate to: i) the overall functioning of soils, more particularly the major biogeochemical cycles Carbon, Nitrogen, Phosphorus (CNP) and biological interactions; ii) the long-term effects of agricultural practices more or less specific to OF systems; (iii) soil protection; and iv) soil diagnostic and management tools. Most of the issues identified are generic and require multidisciplinary research, especially when responding to systemic issues. The seminar identified needs in terms of device and research observatory that provide the references necessary to validate or adapt to OF systems the tools and methods of evaluation and soil management available for conventional systems. The main questions identified during the seminar are discussed and confronted with recent dynamics in terms of soil research and development., En noviembre de 2018, el ITAB (Instituto de Agricultura y Alimentos Orgánicos) y el INRA (Instituto Nacional de Investigaciones Agronómicas) organizaron un seminario transdisciplinario para reunir a las partes interesadas para: i) compartir problemas asociados con el manejo del suelo en Agricultura Orgánica (AO) sistemas, ii) definir colectivamente las principales preguntas de investigación que se abordarán; y iii) facilitar la construcción de redes o proyectos. Más de 150 participantes asistieron al seminario, que fue diseñado utilizando el método de facilitación ciudadana del tipo foro comunitario (Town Hall Meeting) que permite que todas las partes se expresen y un resumen en vivo por parte de expertos. Los resultados confirmaron las importantes lagunas de conocimiento sobre los suelos en los sistemas de AO y las necesidades de investigación. Las 20 preguntas resultantes de estos intercambios se relacionan con: i) el funcionamiento general de los suelos, más particularmente los principales ciclos biogeoquímicos Carbono, Nitrógeno, Fósforo (CNP) e interacciones biológicas; ii) los efectos a largo plazo de las prácticas agrícolas más o menos específicas de los sistemas de AO; iii) protección del suelo; y iv) herramientas de diagnóstico y manejo de suelos. La mayoría de los problemas identificados son genéricos y requieren una investigación multidisciplinaria, especialmente cuando se trata de responder a problemas sistémicos. El seminario identificó necesidades en cuanto a dispositivo y observatorio de investigación para obtener las referencias necesarias para validar o adaptar, en sistemas de AO, las herramientas y métodos de evaluación y manejo de suelos disponibles para sistemas convencionales. Las principales cuestiones dentificadas durante el seminario son discutidas y confrontadas con la dinámica reciente en términos de investigación y desarrollo de suelos., En novembre 2018, l'ITAB (Institut de l’agriculture et de l’alimentation biologiques) et l’INRA (Institut national de la recherche agronomique) ont organisé un séminaire transdisciplinaire pour : i) partager les enjeux associés à la gestion des sols dans les systèmes en Agriculture Biologique (AB), ii) définir collectivement les principales questions de recherche à traiter ; et iii) faciliter la construction de réseaux ou de projets. Plus de 150 participants ont assisté au séminaire qui a été conçu à partir de la méthode d’animation citoyenne de type forum communautaire (Town Hall Meeting), permettant à l’ensemble des parties de s’exprimer et à une synthèse en direct par des experts d’être réalisée. Les résultats identifient des manques importants de connaissances sur les sols dans les systèmes en AB et les besoins de recherche. Les 20 questions issues de ces échanges portent sur : i) le fonctionnement global des sols, plus particulièrement les grands cycles biogéochimiques Carbone, Azote, Phosphore (CNP), et les interactions biologiques ; ii) les effets à long terme des pratiques agricoles plus ou moins spécifiques aux systèmes en AB ; iii) la protection des sols ; et iv) les outils de diagnostic et de gestion des sols. La plupart des questions identifiées sont génériques et nécessitent des recherches multidisciplinaires, en particulier lorsqu’elles répondent à des enjeux systémiques. Le séminaire identifie des besoins en matière de dispositif et observatoire de recherche afin d’obtenir les références qui sont nécessaires pour valider ou adapter sur les systèmes en AB les outils et méthodes d’évaluation et de gestion des sols disponibles pour les systèmes agricoles conventionnels. Les principales questions identifiées lors du séminaire sont discutées et confrontées aux dynamiques récentes de la recherche et du développement sur les sols.
- Published
- 2023
27. Atlas français des champignons du sol
- Author
-
Djemiel, Christophe, Terrat, Sébastien, Dequiedt, Samuel, Jolivet, Claudy, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, and EL Mjiyad, Noureddine
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,pédologie ,Champignon ,Biodiversité du sol - Abstract
Un seul gramme de sol peut contenir plusieurs millions de champignons microscopiques !Depuis un milliard d’années d’évolution et d’adaptations, le règne des champignons est un acteur incontournable de la biodiversité de notre planète. Les champignons sont souvent observés grâce à leurs sporophores qui se développent au-dessus du sol. Ces derniers représentent pourtant seulement la pointe de l’iceberg de leur diversité car les champignons sont en réalité majoritairement présents sous forme microscopique dans nos sols. Dans cet atlas, les auteurs, qui sont des chercheurs INRAE spécialistes en écologie microbienne et en sciences du sol, dévoilent une nouvelle vision des champignons. Ils ont réalisé le premier inventaire national complet des communautés de champignons du sol sur l’ensemble du territoire national. Ceci a été rendu possible grâce à l’utilisation des dernières technologies de séquençage massif de l’ADN environnemental sur les 2 200 sols du Réseau de mesures de la qualité des sols, couvrant l’ensemble de l’hexagone. Cet atlas synthétise l’ensemble des connaissances scientifiques et représente le premier guide naturaliste sur la distribution et l’écologie des communautés de champignons du sol à l’échelle de la France, à destination du grand public. Il cartographie l’abondance, la diversité et la composition des communautés de champignons du sol à grande échelle et permet d’identifier les paramètres de l’environnement (e.g., type de sol, climat, mode d’usage, géomorphologie) qui conditionnent cette distribution.Il aborde aussi plus précisément la distribution des grands taxa fongiques présents dans les sols français, permettant de mieux comprendre leur écologie en termes de sensibilité à certaines conditions environnementales et d’implication dans les grandes fonctions et services rendus par les sols. L’Atlas conclut par des démonstrations opérationnelles de l’utilisation des champignons en tant que bio-indicateurs de la qualité des sols pour évaluer l’impact et la durabilité de certaines pratiques agricoles, industrielles et urbaines. Un ouvrage unique, tant par le sujet traité que par des représentations originales permettant d’appréhender le monde mystérieux et incroyable de ce règne invisible des champignons du sol. L’ouvrage est en cours de rédaction, sa parution est prévue en début d’année 2024.
- Published
- 2023
28. Microbial diversity and ecological networks as indicators of environmental quality
- Author
-
Karimi, Battle, Maron, Pierre Alain, Chemidlin-Prevost Boure, Nicolas, Bernard, Nadine, Gilbert, Daniel, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2017
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29. Biogeography of Soil Microbial Communities: A Review and a Description of the Ongoing French National Initiative
- Author
-
Ranjard, Lionel, Dequiedt, Samuel, Jolivet, Claudy, Saby, Nicolas P. A., Thioulouse, Jean, Harmand, Jérome, Loisel, Patrice, Rapaport, Alain, Fall, Saliou, Simonet, Pascal, Joffre, Richard, Bouré, Nicolas Chemidlin-Prévost, Maron, Pierre-Alain, Mougel, Christophe, Martin, Manuel P., Toutain, Benoît, Arrouays, Dominique, Lemanceau, Philippe, Lichtfouse, Eric, editor, Hamelin, Marjolaine, editor, Navarrete, Mireille, editor, and Debaeke, Philippe, editor
- Published
- 2011
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30. Unraveling biogeographical patterns and environmental drivers of soil fungal diversity at the French national scale.
- Author
-
Djemiel, Christophe, Dequiedt, Samuel, Horrigue, Walid, Bailly, Arthur, Lelièvre, Mélanie, Tripied, Julie, Guilland, Charles, Perrin, Solène, Comment, Gwendoline, Saby, Nicolas, Jolivet, Claudy, Bispo, Antonio, Boulonne, Line, Pierart, Antoine, Wincker, Patrick, Cruaud, Corinne, Maron, Pierre-Alain, Terrat, Sébastien, and Ranjard, Lionel
- Subjects
SOIL ecology ,FOREST soils ,SOILS ,SURFACE of the earth ,SOIL sampling ,SOIL microbiology - Abstract
The fungal kingdom is among the most diversified kingdoms on earth with estimations up to 12 million species. Yet, it remains poorly understood with only 150,000 fungal species currently described. Given the major ecological role of fungi in ecosystem functioning, these numbers stress the importance of investigating fungal diversity description across different ecosystem types. Here, we explored the spatial distribution of the soil fungal diversity on a broad geographical scale, using the French Soil Quality Monitoring Network that covers the whole French territory (2,171 soils sampled along a systematic grid). Fungal alpha-diversity was assessed directly from soil DNA using a metabarcoding approach. Total cumulated fungal diversity across France included 136,219 OTUs, i.e., about 1 % of the global soil fungal diversity for a territory representing only 0.3 % of terrestrial surface on Earth. Based on this dataset, the first extensive map of fungal alpha-diversity was drawn and evidenced a heterogeneous and spatially structured distribution in large biogeographical patterns of 231 km radius for richness (Hill number q=0) and smaller patterns of 36 km radius for dominant fungi (Hill number q=2). As related to other environmental parameters, the spatial distribution of fungal diversity was mainly influenced by local filters such as soil characteristics and land management, but also by global filters such as climate conditions. The spatial distribution of abundant and rare fungi was determined by distinct or similar filters with various relative influences. Interestingly, cropped soils exhibited the highest pool of fungal diversity relatively to forest and vineyard soils. In complement, soil fungal OTUs network interactions were calculated under the different land uses across France. They varied hugely and showed a loss of 75 % of the complexity in crop systems and grasslands compared to forests, and up to 83 % in vineyard systems. Overall, our study revealed that a nation-wide survey with a high spatial resolution approach is relevant to deeply investigate the spatial distribution and determinism of soil fungal diversity. Our findings provide novel insights for a better understanding of soil fungal ecology and upgrade biodiversity conservation policies by supplying representative repositories dedicated to soil microorganisms in a context of global change. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2023
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31. Adding a soil biodiversity monitoring to the French National Soil Quality Monitoring Network :the RMQS-Biodiversity
- Author
-
Imbert, Camille, Santorufo, Lucia, Ortega, Carole, Jolivet, Claudy, Auclerc, Appoline, Bougon, Nolwenn, Capowiez, Yvan, Cheviron, Nathalie, Cluzeau, Daniel, Cortet, Jérôme, Deronzier, Gaëlle, Hedde, Mickael, Lévêque, Antoine, Maunoury-Danger, Florence, Mougin, Christian, Palka, Laurent, Pérès, Guénola, Ranjard, Lionel, Roucaute, Marc, Vanhee, Benoît, Villenave, Cécile, Wroza, Stanislas, Bispo, Antonio, InfoSol (InfoSol), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Naples, Université de Lorraine (UL), Office français de la biodiversité (OFB), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plateforme BIOCHEM-ENV, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Patrimoine naturel (PatriNat), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Office français de la biodiversité (OFB), Centre d'Ecologie et des Sciences de la COnservation (CESCO), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon, Université catholique de Lille (UCL), Elisol Environnement, and Mougin, Christian
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[SDE] Environmental Sciences ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDE]Environmental Sciences ,Earthworms - Abstract
International audience
- Published
- 2022
32. Positive effect of the Miscanthus bioenergy crop on microbial diversity in wastewater-contaminated soil
- Author
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Bourgeois, Emilie, Dequiedt, Samuel, Lelièvre, Mélanie, van Oort, Folkert, Lamy, Isabelle, Maron, Pierre-Alain, and Ranjard, Lionel
- Published
- 2015
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33. Miscanthus bioenergy crop stimulates nutrient-cycler bacteria and fungi in wastewater-contaminated agricultural soil
- Author
-
Bourgeois, Emilie, Dequiedt, Samuel, Lelièvre, Mélanie, van Oort, Folkert, Lamy, Isabelle, Ranjard, Lionel, and Maron, Pierre Alain
- Published
- 2015
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34. Potential of Meta-Omics to Provide Modern Microbial Indicators for Monitoring Soil Quality and Securing Food Production
- Author
-
Djemiel, Christophe, primary, Dequiedt, Samuel, additional, Karimi, Battle, additional, Cottin, Aurélien, additional, Horrigue, Walid, additional, Bailly, Arthur, additional, Boutaleb, Ali, additional, Sadet-Bourgeteau, Sophie, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, additional, Ranjard, Lionel, additional, and Terrat, Sébastien, additional
- Published
- 2022
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35. Legacy of land-cover changes on soil microbiology in Burgundy vineyards (Pernand-Vergelesses, France)
- Author
-
Quiquerez, Amélie, primary, Garcia, Jean-Pierre, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Djemiel, Christophe, additional, Terrat, Sébastien, additional, Mathieu, Olivier, additional, Sassi, Audrey, additional, and Ranjard, Lionel, additional
- Published
- 2022
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36. Stimulation of Different Functional Groups of Bacteria by Various Plant Residues as a Driver of Soil Priming Effect
- Author
-
Pascault, Noémie, Ranjard, Lionel, Kaisermann, Aurore, Bachar, Dipankar, Christen, Richard, Terrat, Sébastien, Mathieu, Olivier, Lévêque, Jean, Mougel, Christophe, Henault, Catherine, Lemanceau, Philippe, Péan, Michel, Boiry, Séverine, Fontaine, Sébastien, and Maron, Pierre-Alain
- Published
- 2013
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37. Understanding and managing soil biodiversity: a major challenge in agroecology
- Author
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Lemanceau, Philippe, Maron, Pierre-Alain, Mazurier, Sylvie, Mougel, Christophe, Pivato, Barbara, Plassart, Pierre, Ranjard, Lionel, Revellin, Cécile, Tardy, Vincent, and Wipf, Daniel
- Published
- 2015
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38. Correction: Mapping and predictive variations of soil bacterial richness across France
- Author
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Terrat, Sébastien, primary, Horrigue, Walid, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Saby, Nicolas P. A., additional, Lelièvre, Mélanie, additional, Nowak, Virginie, additional, Tripied, Julie, additional, Régnier, Tiffanie, additional, Jolivet, Claudy, additional, Arrouays, Dominique, additional, Wincker, Patrick, additional, Cruaud, Corinne, additional, Karimi, Battle, additional, Bispo, Antonio, additional, Maron, Pierre Alain, additional, Prévost-Bouré, Nicolas Chemidlin, additional, and Ranjard, Lionel, additional
- Published
- 2022
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39. GenoSol Platform: A Logistic and Technical Platform for Conserving and Exploring Soil Microbial Diversity
- Author
-
Dequiedt, Samuel, primary, Maron, Pierre-Alain, additional, and Ranjard, Lionel, additional
- Published
- 2016
- Full Text
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40. Radioecological Risk Assessment of Low Selenium Concentrations through Genetic Fingerprints and Metabolic Profiling of Soil Bacterial Communities
- Author
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Colinon-Dupuich, Céline, Février, Laureline, Ranjard, Lionel, Coppin, Frédéric, Cournoyer, Benoit, and Nazaret, Sylvie
- Published
- 2011
41. SOIL MICROBIOLOGICAL QUALITY: STATE OF THE ART AND IMPORTANCE OF MICROBIAL COMMUNITIES FOR FRENCH AGRICULTURAL SOILS
- Author
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Terrat, Sébastien, Djemiel, Christophe, Dequiedt, Samuel, Cottin, Aurélien, Karimi, Battle, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, and TERRAT, Sebastien
- Subjects
[SDE] Environmental Sciences ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,co-occurring networks ,microbial richness ,national scale ,microbial diversity ,habitats ,land use ,microbial community ,biogeography ,soil - Abstract
Soils are one of the major reservoirs of biological diversity on our planet, hosting a huge diversity of microorganisms. Numerous studies have demonstrated the role of microbial diversity in soil functions, such as nutrient cycling or pathogen management. Given the key role of soil microorganisms in the regulation of soil ecosystem functions, the environmental factors driving soil microbial diversity need to be understood. In France, we have the opportunity to benefit from a national soil survey (called the French Soil Quality Monitoring Network), which represents one of the most extensive and without a priori soil sampling survey available to date. Through several funded projects, we were able to decipher the spatial distribution of microbial diversity at the scale of France. These analyses provided extensive maps of microbial diversity, structure and composition and reveals the heterogeneous and spatially structured distribution of microbial communities at the nationwide scale. We also identified the ecological processes involved in the biogeographical patterns of microbial diversity, and develop co-occurring networks identified within the relative abundance of bacterial taxa dataset to the scale of France in order to better understand the processes involved in community assembly. From an operational point of view, innovative diagnosis tools were developed with obtained datasets, using statistical predictive models according to environmental parameters. They provide reference values fitted for a given pedoclimatic condition, which is to be compared to the corresponding measured data for a robust diagnosis of soil biological quality. These innovative tools allow a robust diagnosis of soil biological quality.
- Published
- 2022
42. Table ronde : Quelles perspectives pour la construction et l’usage d’indicateurs de qualité des sols adaptés aux trajectoires de transition des systèmes agricoles ?
- Author
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Ranjard, Lionel, Villenave, Cécile, Laurent, François, Guilbaud, Pascal, and EL Mjiyad, Noureddine
- Subjects
[SHS] Humanities and Social Sciences - Published
- 2022
43. Agro-Eco Sol, un outil de diagnostic des fonctions du sol basé sur des bioindicateurs bioindicateurs - Structure et règles générales d’interprétation
- Author
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Le Souder, Christine, Valé, Matthieu, Ranjard, Lionel, Maron, Pierre‐alain, Dequiedt, Samuel, Hedde, Mickael, Cortet, Jérôme, Cheviron, Nathalie, Mougin, Christian, Saby, Nicolas P. A., Villenave, Cécile, Dizien, Caroline, Soenen, Baptiste, and Mougin, Christian
- Subjects
[SDE] Environmental Sciences ,[SDV] Life Sciences [q-bio] - Published
- 2022
44. Impact des modes de production économes en pesticides de synthèse sur la qualité microbiologique des sols viticoles
- Author
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Zappelini, Cyril, Dequiedt, Samuel, Masson, Vincent, Masson, Jean, Maron, Pierre‐alain, Ranjard, Lionel, and EL Mjiyad, Noureddine
- Subjects
sol viticols ,[SDE] Environmental Sciences ,ecologie-microbienne ,mode de production durable ,science participative ,pratique viticole - Abstract
La viticulture est un secteur d‘activité agricole stratégique pour la France carelle représente le 1er poste exportateur du secteur agroalimentaire pourseulement 3% de la SAU Française. Toutefois, elle est aussi une forteconsommatrice de produits phytosanitaires avec 20% des pesticides utilisés enFrance à elle seule, couplé aussi a une forte mécanisation. Tout ceci entraîne unedégradation de la qualité des sols, qu’elle soit physique (Quiquerez et al., 2008),ou biologique (Dequiedt et al., 2011). Une baisse importante de la biodiversitédu sol altère ses grandes fonctions d’intérêts telles que la décomposition de lamatière organique et la fourniture d’éléments minéraux, l’effet barrière auxpopulations exogènes de pathogènes, l’amélioration de la structure du sol, ladégradation des polluants (Maron et Ranjard, 2019).Face à ces constats, la viticulture biologique (AB, 9% de la SAU viticole), voirebiodynamique (BD, 1% de la SAU viticole) se développent fortement avec untaux moyen de conversion de 1-2% par an. Toutefois, à ce jour nous manquonsencore de connaissances sur les impacts de ces modes de production et sur lespratiques associées notamment sur la qualité des sols viticoles. Il est doncencore difficile de conclure sur l’intérêt et la légitimité de ces modes deproduction dans un contexte de transition agroécologique. Dans ce contexte,l’INRAE Dijon a lancé une étude à grande échelle impliquant directement lesviticulteurs en pratiques stabilisées dans différents modes de production. Ceprojet, appelé EcoVitiSol, est financé par l’Office Français de la Biodiversité et leBureau Interprofessionnel des Vins de Bourgogne. L’objectif d’EcoVitiSol estd’étudier scientifiquement l’impact des modes de production (conventionnelle,50e congrès du Groupe Français de recherche sur les Pesticides, 18-20 mai 2022, NAMUR24 OralAB, BD) sur la qualité écologique et plus particulièrement microbiologique dessols.
- Published
- 2022
45. Short-term impact of biogas digestates on soils microbial communities
- Author
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Sadet-Bourgeteau, Sophie, Vautrin, Florian, Piveteau, Pascal, Cannavacciuolo, M, Barré, P, Chauvin, C, Villenave, C, Cluzeau, D, Hoeffner, Kevin, Mulliez, P, Jean-Baptiste, V, Vrignaud, G, Tripied, Julie, Dequiedt, Samuel, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, EL Mjiyad, Noureddine, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Optimisation des procédés en Agriculture, Agroalimentaire et Environnement (UR OPAALE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Légumineuses, Ecophysiologie Végétale, Agroécologie (LEVA), Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire de géologie de l'ENS (LGENS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département des Géosciences - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Elisol Environnement, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chambre Régionale d'Agriculture des Pays de la Loire, Gaz Réseau Distribution France (GRDF), and ACE METHANISATION
- Subjects
high throughput DNA sequencing ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,microcosm experiment ,soil microbes ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,organic fertilization - Abstract
International audience; Anaerobic digestion of organic waste is considered a key process to produce renewable energy to meet the growing sustainable energy demand. Digestates can be used in agriculture as soil amendments and improve crop yields. However, their use at large scale in agricultural fields still requires to prove their innocuity on soil biota, especially on microorganisms that play important roles in soil ecosystem. Here, we designed a microcosm experiment to compare the short-term (42-days) effects of four different digestates (derived from cattle manure, energy crop, food residues or slurry with bio-waste) on the soil microbial communities. Each digestate was applied on three contrasting soils representing a range of physicochemical characteristics (BOU, silty clay loam texture; PDL, loam texture and PACA, sandy loam texture). These soils are termed BOU, PDL and PACA hereafter, respectively. None of them had a historical record of digestate application; BOU and PDL were under annual cropping systems, while PACA was a vineyard soil. In addition, selected soils had never received digestates inputs before. Amended microcosms were compared to a control (undigested cattle manure). The effect of digestate inputs on the soil microbial communities was assessed using molecular DNA-based tools (quantification of extracted soil DNA and high-throughput sequencing) to measure microbial biomass and diversity, respectively. The impact of the digestates depended on the soil type. No digestate significantly affected the microbial biomass or diversity of the soil presenting the highest organic matter content (P > 0.05), as compared to the cattle manure. In the other soils, digestate addition led to lower microbial biomass compared to undigested manure. The intensity of this effect was dependent on the digestate type, and so were the microbial diversity indicators. Our results show that 42 days after biogas residue application, the effect of digestates on the soil microbial community structure depends on both the soil type and the digestate characteristics. To summarized, our results suggest that the soil microbial communities of coarse-textured soils with an acidic pH and a low C/N ratio are more sensitive to nitrogen-rich digestate inputs.
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- 2022
46. JMS 2022 : Quelle santé des sols pour quelle nutrition ? C dans l’sol émission et magazine digital autour du sol. Video en ligne
- Author
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Billet, Philippe, Lionel, Combet, Ranjard, Lionel, Denhez, Frédéric, Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon, Agence de l'Environnement et de la Maitrise de l'Énergie (Bourgogne-Franche-Comté) (ADEME BFC), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Journaliste, and EL Mjiyad, Noureddine
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] - Abstract
C dans l’sol est une émission et un magazine digital autour du sol, animés par Frédéric Denhez, et produit par les coopératives du Groupe Eïwa; National audience; Aujourd’hui que l’on parle des sols, on peut se demander si parfois c’est bien à propos. Ainsi, la santé. La commission européenne prépare pour mi-2023 une future directive portant sur les sols, dans le cadre d’une stratégie globale sur la santé – des sols, laquelle s’inscrit dans une autre stratégie, mondiale, lancée au début des années 2000 par l’OMS, One health : santé des animaux, santé de l’environnement, santé des humains, tout est lié. La preuve, le Covid qui se serait répandu à cause du mauvais état des écosystèmes chinois, abîmés par nous, humains. C’est évidemment un tantinet plus compliqué que cela. Cependant, dans notre esprit, s’installe un lien de causalité entre la bonne santé des sols, de la terre, de la Terre, et la nôtre. Est-ce bien fondé ? Comment on mesure la santé des sols ? C’est à ces questions qu’ont répondu les intervenants du troisième C dans l’sol organisé avec l’Afes durant la Journée mondiale des sols, le 2 décembre 2022.Commençons par le début. Pour qu’un médecin établisse un diagnostic, encore faut-il qu’il ait un patient reconnu comme tel. Ça tombe mal, car le sol est toujours invisible au regard du droit. Qu’il soit, lui, cet écosystème, malade ou bien portant, peu importe, car il n’existe que si on en fait quelque chose. Pas de sols dans le code de l’environnement, donc, pas de santé des sols. « Sauf dans le cadre de la responsabilité environnementale, s’il y a un risque d’atteinte grave à la santé en cas de mauvais état du sol, » nous apprend Philippe Billet, professeur et directeur de l’Institut de droit de l’environnement de Lyon III. Dans notre corpus légal les sols n’apparaissent que dès lors qu’ils nous menacent, notamment s’ils sont bien pollués. « La loi climat et biodiversité n’a rien changé à cela. Le sol se trouve dans le code de la santé publique dans le cas d’une pollution qui nuirait à la qualité d’un captage d’eau, ou dans le code rural si son mauvais état peut avoir une incidence sur un bail rural. » On peut malmener un sol, tant que cela ne nuit pas à autrui. Le lien entre notre santé et celle des sols n’apparaît donc qu’à l’occasion d’un risque, il est oublié dès lors que celui-ci n’existe plus. En définitive, le sol n’est qu’en tant que vecteur et média, constate Philippe Billet. Il est comme un de ces gros sacs bien remplis qu’on pousse derrière la porte pour qu’elle reste ouverte. Directeur de recherches à l’INRAE, Lionel Ranjard l’a glissé dans celle de la Métropole de Dijon. « Même si la science ne l’a pas parfaitement démontré, le lien semble évident entre la santé d’un sol et la santé des plantes », et, d’une manière métaphorique, avec la santé d’un territoire. Grâce à lui, Dijon et ses alentours ont élaboré un programme de « transition alimentaire », ProDij qui vise à garantir l’accès de tous les citoyens à une alimentation « saine », produite par des agriculteurs économes en intrants qui valorisent la biodiversité, font attention aux sols, une alimentation transformée par des acteurs locaux. Adopté en décembre 2019, le PLU intercommunal « HD » (il englobe habitat et transport) protège résolument les terres agricoles, les espaces naturels, les trames vertes etc. Il devrait permettre de diminuer de 30 % la consommation de celles-ci d’ici 2030, par rapport à la décennie 2010. « Le sol est enfin pris en considération, on va pouvoir regarder les empreintes sol de la production alimentaire, en espérant que le sol entrera dans la constitution d’un label bas carbone… » espère Lionel Ranjard.Mesurer l’améliorationD’ici-là, on aura au moins beaucoup parlé des sols, ce qui est fondamental pour que le droit, un jour, le considère, explique Philippe Billet. Le droit ne fait que mettre des mots sur l’air du temps, alors il faut souffler, en réunions, en colloques, en séminaires, il faut en parler aux gens, à tout le monde, aux élus. Voici un exemple de bonne vulgarisation qui renforce le lien intuitif, sans doute fondé, entre notre santé et l’état des sols.Acteur associatif bien connu du monde du sol, Pour une agriculture du vivant (PADV) a créé un indicateur de bonnes pratiques. Anne Trombini est sa directrice : « L’indice de régénération, c’est un outil qui permet d’envisager le sol de manière systématique en étant pragmatique et opérationnel. C’est un outil créé par et pour les agriculteurs et validé par la recherche, » dont Jean)-Pierre Sarthou (Enta) et Marc-André Sélosse (MNHN), présents lors de cette JMS 2023. Selon Anne Trombini, puisque tout part des sols, il faut que les agriculteurs aient les bonnes lunettes pour bien les regarder : « pour calculer cet indice, on prend par exemple les phytos, la biodiversité, la couverture et le travail du sol, le cycle du carbone, la fertilisation azotée… L’indice de régénération est un compromis entre réalité technique et solidité scientifique, il a vocation à être un outil de dialogue, un outil pour construire un plan de progrès ou pour mesurer l’impact d’un choix de pratiques. » L’IR, comme dit la directrice de pADV, est une note sur cent, une boussole. « Nous, on mesure les résultats des pratiques, on évalue la progression. » L’indice est open source et gratuit afin qu’un maximum puisse l’utiliser. « On s’est constitués en association, de façon que l’outil soit accessible à tous, qu’il soit gratuit pour les paysans. » Par contre, car il faut bien vivre, les adhérents de Pour une agriculture du vivant cotisent selon la taille de leurs structures. D’après Anne Trombini, si le modèle était payant, il serait contre-productif car il amplifierait les biais de constitution de l’IR : « quand c’est payant, c’est celui qui a inventé qui décide de la manière dont [un tableau de bord d’indicateurs] a été constitué. Un indice comme le nôtre est un agrégat, la pondération entre les indicateurs qui le constituent est un biais, car cette pondération serait forcément décidée par les intérêts du moment, par celui qui vendrait l’indice s’il était payant. » L’association existe depuis trois ans, elle a réalisé en dix-huit mois 2 000 indices de régénération et a formé 200 techniciens à son interprétation. L’IR s’applique aux productions végétales et aux bovins, il devrait bientôt concerner les ovins et les mono-gastriques (les cochons).Penser au futurDijon a un autre bon exemple à donner en matière de vulgarisation. Référent prospective, chargé de mission Bioéconomie & Construction durable à l’Ademe, Lionel Combet travaille à l’élaboration de scénarios prospectifs d’échelle régionale, dans le cadre des scénarios nationaux Transitions 2050 déjà publiés par l’Ademe. L’exercice s’appelle « Autonomie alimentaire et énergétique en Bourgogne-Franche-Comté » : « on fait débattre une centaine de personnes sur les ressources qui constituent notre bien commun, et on montrera in fine aux gens comment les futurs possibles et souhaitables pourront se traduire concrètement dans des territoires précis. » Le programme se focalise sur les ressources naturelles, les « bioressources » qui, « dans un contexte de dépression climatique, présentent un risque d’appauvrissement des milieux et de conflit entre secteurs économiques, entre usagers aussi. L’exercice prospectif est sur la neutralité carbone, mais on l’a élargi aux grands enjeux contemporains que sont la biodiversité, la disponibilité de l’eau et les sols, qui sont la base de la réflexion. » Pour se faire, dans la même philosophie que Pour une agriculture du vivant, Lionel Combet travaille avec les acteurs des territoires identifiés, les instituts techniques, les représentants de l’État, les filières du bois et de l’agriculture, les parcs naturels régionaux, les chercheurs et les associations, etc. « Quelles trajectoires, quels équilibres dans l’usage des sols et des ressources en biomasse faut-il trouver ? », c’est ce qu’il essaie de savoir. Résultats lors d’assises régionales qui se tiendront fin mai à Beaune. « Tous ces travaux sont nécessaires », défend Philippe Billet, « je ne sais pas s’ils permettront qu’un jour le sol devienne un objet de droit, mais ils créent un besoin, qui sera traduit par le droit – c’est sa fonction, » analyse Philippe Billet. Créer des résonances, en n’oubliant jamais l’élément-clé, l’agriculteur.Ensuite, que la lecture soit facileEn effet. Un bon indicateur doit avant tout servir à quelque chose. Des indicateurs, des indices, des projets et des prospectives qui ne sont que des tartes à la crème de colloques ne changeront pas le monde. Ils doivent être opérationnels. « C’est le but de nos scénarios, », assure Lionel Combet, « on ne sait pas dire si finalement l’échelle à laquelle nous traitons le sujet est pertinente, mais la finalité est bien d’élaborer un projet de territoire, avec une dimension opérationnelle. » À Dijon, on aimerait « organiser la ville autour des sols et pas l’inverse, », rêve Lionel Ranjard, qui se contenterait déjà d’une place plus importante des sols dans les Scot. Encore faut-il bien les connaître, ce qui coûte du temps et de l’argent. Un argument qui s’ajoute souvent au fameux « oui, mais on n’a pas les bons indicateurs, il faut réfléchir à en créer des fiables, à dessiner les cartographies les plus précises, » très classique dans la bouche de celles et ceux qui ne veulent surtout pas voir. Ne pas savoir, c’est ne pas se sentir responsable. « On est en pleine guerre des thermomètres, », confirme joliment Lionel Ranjard, « ça fait vingt ans que ça dure, et ça continue, alors qu’il y a en ce moment une offre de services, avec des choses rationnelles et d’autres moins. » Nul besoin de colloques sur comment mesurer la « santé » d’un sol, car on sait faire, mais la recherche est timide, alors elle s’est fait doubler par des sociétés comme Genesys qui, sentant l’air du temps, proposent depuis quelques années des indicateurs faciles à déployer, censés délivrer une carte de santé des sols fiable. Nonobstant leurs qualités intrinsèques, Philippe Billet admet que « les indicateurs mis à disposition des élus ou des agriculteurs doivent être simples à lire et à comprendre, » ce que n’ont pas toujours su faire les laboratoires de la recherche publique. « Il n’y aura jamais d’indicateurs simples, car leurs techniques seront toujours complexes, c’est leur traduction qui doit l’être » poursuit Lionel Ranjard. Malgré tout, élus et agriculteurs disent que le meilleur indicateur, le plus facile à comprendre, sera toujours trop cher. Cela énerve superbement Lionel Ranjard : « ça coûte cher ? Mais non, c’est le consentement à payer qui est difficile ! » Les sols ont encore trop peu de valeur pour qu’on ait l’idée que dépenser pour mieux les connaître n’est pas une dépense inutile. En France, on trouve toujours des sous pour faire un rond-point, difficilement pour mettre une signalétique autour d’une zone humide. Faire un carottage pour jauger de la capacité d’une terre à supporter une ZAC, oui, mesurer sa vie et son fonctionnement afin de voir si la ZAC ne serait pas mieux ailleurs, certainement pas. « Mais attention, on parle de vraies mesures, c’est-à-dire quelque chose qui est mesuré, pas estimé, pas modélisé… » glisse le chercheur, un œil sur Genesys, un autre sur PADV.Vers des certif’Disposer du bilan de santé de son sol n’est pas inutile quand on est agriculteur. Cela peut même rapporter de l’argent, ou éviter d’en perdre, parce que cela aide à mieux piloter son exploitation, affirme Lionel Ranjard : « quand un système est de bonne qualité, il est en général assez stable dans sa production, il est résistant et résilient. » L’anthropomorphisme aide à comprendre : un bon métabolisme est gage de longue vie, il se mesure à des paramètres physiologiques sur lesquels on peut agir séparément si on les jauge de manière régulière. La durabilité d’un patrimoine qui marche, serait-ce cela la santé des sols ? Les diagnostics existent et ne demandent qu’à être utilisés. Pour une agriculture du vivant a développé un réseau de fermes pionnières afin de tester son indice de régénération et d’en démontrer l’intérêt pratique. « On aimerait d’ailleurs constituer une base de données sur les pratiques et leurs impacts, tels qu’on les mesure avec l’IR, » demande Anne Trombini aux labos de recherche. Une fois que les indicateurs seront devenus naturels, on pourra passer à la phase de certification ou de labellisation, qui dira au grand public ce qui est « bon » pour lui ou non, parce qu’il y a du bon, ou pas, pour les sols. Mais quel label ? Ou bien faut-il modifier les labels actuels afin qu’ils intègrent les sols ? « Ce serait intéressant, car cela permettrait au public de s’approprier les sols [sans le savoir]. Il faudrait que le sol, avec l’eau, soit dans les indications géographiques protégées. Ce n’est pas le cas, sauf pour les lentilles du Puy ! », déplore et espère Philippe Billet. L’INAO devrait modifier ses cahiers des charges de la façon suivante : désormais, vous n’obtiendrez ce label qu’à la condition que votre production soit bonne pour les sols. Ainsi les intervenants à ce C dans l’sol seront-ils parvenus à leur but, positionner la qualité du sol au même titre que l’empreinte carbone, la composition d’un aliment et la santé des humains.
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- 2022
47. AGRO-ECO SOL, un outil de diagnostic des fonctions du sol et de conseil basé sur des bioindicateurs - schéma général d’interprétation
- Author
-
Le Souder, Christine, Valé, Matthieu, Chlebowski, Florent, Ranjard, Lionel, Maron, Pierre‐alain, Dequiedt, Samuel, Hedde, Mickael, Cheviron, Nathalie, Cortet, Jérôme, Saby, Nicolas P. A., Villenave, Cécile, Dizien, Caroline, Soenen, Baptiste, and Mougin, Christian
- Subjects
[SDE] Environmental Sciences ,[SDV] Life Sciences [q-bio] - Published
- 2022
48. Méta-analyse sur l’impact des modes de production agricole sur la qualité écologique du sol
- Author
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Amélie, Christel, Maron, Pierre‐alain, Ranjard, Lionel, and EL Mjiyad, Noureddine
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,agroécologie ,mode de production ,pratique culturale ,biodiversité - Abstract
Le modèle d’agriculture productiviste, développé après la seconde guerre mondiale, a permisd’augmenter les rendements de façon à répondre à la demande alimentaire croissante mais il aaussi profondément affecté les propriétés physico-chimiques des sols et leur biodiversité. Pourréduire l’empreinte environnementale de l’agriculture conventionnelle et intensive, les acteurs dumonde agricole ont développé des modes de production alternatifs comme l’agriculture biologique(AB), la biodynamie (ABD) ou l’agriculture de conservation (ACS) qui visent tous à améliorer laqualité physico-chimique et biologique des sols. Si de nombreuses publications et synthèsesbibliographiques ont évalué l’impact des pratiques culturales sur la qualité biologique du sol, peuont considéré l’évaluation systémique de l’impact des modes de production agricole. Ici, nousavons mené la première synthèse bibliographique internationale qui évalue l’impact de quatremodes de production sur la qualité écologique du sol grâce à des indicateurs ciblant les grandsgroupes d’organismes vivants. Cette étude montre tout d’abord que les modes de productionconventionnel, AB et ABD sont les plus étudiés et comparés entre eux alors que l’ACS est peuétudié. Les tendances observées indiquent une amélioration d’environ 70 % des bioindicateursbiologiques en ABD et AB par rapport à l’agriculture conventionnelle. L’ABD montre une amélioration pour 43 % des bioindicateurs en comparaison avec l’AB. De son côté, l’ACS apparait plusvertueux que l’agriculture conventionnelle pour 57 % des indicateurs mesurés. L’ABD représente donc le mode de production le plus vertueux, suivi de l’AB et l’ACS et enfin de l’agriculture conventionnelle, pour la qualité écologique dusol. L’analyse fine des pratiques culturales montre que la fertilisation organique et l’allongement de la rotation sont les pratiques les plusfavorables alors que l’application des produits phyto-pharmaceutiques et le travail du sol sont les plus délétères. Cette synthèse permetaussi de pointer le manque d’études sur l’ACS ainsi que sur certains bioindicateurs de la faune du sol. Elle permet donc d’identifier lespistes de recherche pour l’identification des modes de production les plus vertueux et innovants et ainsi orienter les décisions politiqueset le conseil agricole dans le sens de la transition agroécologique.
- Published
- 2022
49. FOCUS PROJET EcoVitiSol
- Author
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Ranjard, Lionel
- Published
- 2022
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50. France 3 - Emission 'Le monde de Jamy' : Santé, budget, environnement : des solutions dans nos assiettes ! 19 janvier 2022
- Author
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Gourmand, Jamy, Eglantine, Emeye, Ranjard, Lionel, and EL Mjiyad, Noureddine
- Subjects
émission télévision nationale ,[SHS] Humanities and Social Sciences ,France 3 ,grand public - Abstract
La production de l'alimentation représente un quart des émissions de gaz à effet de serre. Mange-t-on trop riche ? Comment savoir si les fruits et légumes contiennent des pesticides ? Faut-il consommer moins de viande ? Jamy apporte des solutions : des menus savoureux, bons pour la santé, pour la planète, et pour le portefeuille. Afin de mieux comprendre l'impact de certains aliments sur l'organisme, Jamy fait un voyage à l'intérieur des carottes, des cookies et des yaourts. Il rencontre les nutriments qu'ils contiennent et dont certains rendent accros. Dans les plus beaux terroirs de France, Jamy fait aussi découvrir ces nouveaux agriculteurs qui produisent en préservant l'environnement. Ce qui pollue enfin, c'est le gaspillage : un tiers de la nourriture part à la poubelle.
- Published
- 2022
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