This study aims to evaluate, via a mixed methods study, the implementation of the screening process for pulmonary tuberculosis (PTB) within indigenous population of the Department of Cauca, Colombia, during the 2016-2018 period. Indicators assessing the PTB screening process were elaborated and estimated. Subsequently, an evaluation of the indicators were performed based on a sampling process from health care providers of the municipalities with the highest and lowest PTB incidence and from key agents’ perspective. Screening indicators were estimated and thematic analysis was performed based on the interviews conducted with key agents. Finally, a triangulation of quantitative and qualitative findings was performed. From the total population expected to have respiratory symptomatics (n = 16,711), the health care providers were able to identify 42.3% of them. Out of the individuals identified as respiratory symptomatics (n = 7,064), they were able to examine 93.2% (n = 6,585) with at least one acid-fast bacilli smear test. The reported positivity index from acid-fast bacilli smear test was 1.87%. The explanations from key agents revolved around the possibility of an overestimated targeted amount of respiratory symptomatics; insufficient personnel for the search of symptomatic individuals; high costs for the search in areas of difficult access; the need to request permissions from indigenous authorities; culturally ingrained stigma; use of traditional medicine and self-medication; and patient’s personal beliefs. This study revealed barriers in the implementation of the screening process for PTB within the indigenous population from the Department of Cauca, mainly in the identifying process of the respiratory symptomatics. El objetivo fue evaluar la implementación del proceso y los indicadores en las pruebas para detectar tuberculosis pulmonar (TBP) en población indígena del Departamento de Cauca, Colombia, durante el periodo de 2016-2018, a través de un estudio de métodos mixtos. Fueron elaborados y estimados indicadores para el tamizaje de TBP. Posteriormente, a través de un proceso de muestreo de los proveedores de cuidados de salud de las municipalidades con las incidencias más altas y más bajas de TBP, y desde la perspectiva de actores clave, se intentó encontrar una explicación para los resultados de la primera fase. Se estimaron los indicadores de las pruebas y se realizó un análisis temático de las entrevistas dirigidas a los actores clave. Finalmente, se realizó la triangulación de los hallazgos cuantitativos y cualitativos. Del total de sintomáticos respiratorios esperados (n = 16.711), los proveedores de servicios de salud fueron capaces de identificar a un 42,3% de ellos, y de estos sintomáticos respiratorios identificados (n = 7.064) fueron capaces de examinar un 93,2% (n = 6.585) con al menos una prueba de frotis de bacilos ácidorresistentes. El índice de positividad informado en la prueba de la flema analizada en el microscopio, mediante la prueba de frotis de bacilos ácidorresistentes, fue 1.87%. Las explicaciones de los actores clave giraron alrededor de la percepción de un objetivo posiblemente sobreestimado de sintomáticos respiratorios; insuficiente personal para la consulta; altos costes para las consultas en áreas geográficas de difícil acceso; solicitud de permisos a las autoridades indígenas; estigma; medicina tradicional, automedicación y creencias. Este estudio reveló barreras en la implementación de las pruebas para la TBP en la población indígena del Departamento de Cauca, principalmente en el proceso de identificación de sintomáticos respiratorios. O estudo teve como objetivo avaliar a implementação do processo e os indicadores de triagem para tuberculose pulmonar (TBP) numa população indígena do Departamento de Cauca, Colômbia, no período 2016-2018. Foi realizado um estudo com métodos mistos. Foram elaborados e estimados os indicadores para triagem da TBP. Em seguida, procurou-se explicar os achados da primeira fase, com base em um processo de amostragem de provedores de saúde dos municípios com os coeficientes mais altos e mais baixos de incidência de TBP, e da perspectiva dos atores-chave. Os indicadores de triagem foram estimados e a análise foi realizada das entrevistas com os atores-chave. Finalmente, foi feita a triangulação dos achados quantitativos e qualitativos. Do total de sintomáticos respiratórios esperados (n = 16.711), o provedor de saúde conseguiu identificar 42,3%, e destes sintomáticos respiratórios identificados (n = 7.064) conseguiram examinar 93,2% (n = 6.585) com pelo menos um exame de escarro (teste de BAAR). O índice de positividade do teste de BAAR foi de 1,87%. As explicações dos atores chave giraram em torno da percepção de uma proporção possivelmente superestimada de sintomáticos respiratórios, pessoal insuficiente para a busca, custos elevados da busca em áreas de difícil acesso geográfico, solicitação de autorização pelas autoridades indígenas, estigma, medicina tradicional, automedicação e crenças. O estudo revelou barreiras para a implementação da triagem para TBP na população indígena do Departamento de Cauca, principalmente no processo de identificação de sintomáticos respiratórios.