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219 results on '"Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC)"'

1. Subcellular partitioning of metals in Aporrectodea caliginosa along a gradient of metal exposure in 31 field-contaminated soils

Author: Mickaël Hedde, Léa Beaumelle, Annie Guérin, Frédéric Gimbert, Isabelle Lamy, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), US 0010 Laboratoire d'analyses des sols (LAS), ADEME (Agence de l'environnement et de la maitrise de l'energie), INRA-EA (Institut National de la Recherche Agronomique - departement Environnement et Agronomie), Pi-vers Project (Pari scientifique, INRA-EA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), and Laboratoire d'Analyses des Sols (LAS)
Subjects: sol, Environmental Engineering, Bioavailability, métal, Subcellular fractionation, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, media_common.quotation_subject, Soil science, soil, Metal, Animals, Soil Pollutants, Environmental Chemistry, Oligochaeta, Waste Management and Disposal, media_common, Geochemical modeling, 2. Zero hunger, soil pollution, biology, Chemistry, Earthworm, 15. Life on land, biology.organism_classification, pollution du sol, Pollution, Soil contamination, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Speciation, Metals, visual_art, Bioaccumulation, Environmental chemistry, Soil water, visual_art.visual_art_medium, Field-contaminated soils
Abstract: Subcellular fractionation of metals in organisms was proposed as a better way to characterize metal bioaccumulation. Here we report the impact of a laboratory exposure to a wide range of field-metal contaminated soils on the subcellular partitioning of metals in the earthworm Aporrectodea caliginosa. Soils moderately contaminated were chosen to create a gradient of soil metal availability; covering ranges of both soil metal contents and of several soil parameters. Following exposure, Cd, Pb and Zn concentrations were determined both in total earthworm body and in three subcellular compartments: cytosolic, granular and debris fractions. Three distinct proxies of soil metal availability were investigated: CaCl2-extractable content dissolved content predicted by a semi-mechanistic model and free ion concentration predicted by a geochemical speciation model. Subcellular partitionings of Cd and Pb were modified along the gradient of metal exposure, while stable Zn partitioning reflected regulation processes. Cd subcellular distribution responded more strongly to increasing soil Cd concentration than the total internal content, when Pb subcellular distribution and total internal content were similarly affected. Free ion concentrations were better descriptors of Cd and Pb subcellular distribution than CaCl2 extractable and dissolved metal concentrations. However, free ion concentrations and soil total metal contents were equivalent descriptors of the subcellular partitioning of Cd and Pb because they were highly correlated. Considering lowly contaminated soils, our results raise the question of the added value of three proxies of metal availability compared to soil total metal content in the assessment of metal bioavailability to earthworm.
Published: 2015
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2. Soil bioindicators: how soil properties influence their responses and to select them in function of the site issues?

Author: Benjamin Pauget, Laurence Rougé, Antonio Bispo, Cécile Grand, Thierry Béguiristain, Jean-Jacques Bessoule, Josselin Bodilis, Rémi Chaussod, Nathalie Cheviron, Michael Coeurdassier, Jérôme Cortet, Steven Criquet, Samuel Dequiedt, Olivier Faure, Christophe Gangneux, Isabelle Gattin, Marina Le Guedard, Adnane Hitmi, Laurent, N., Marc Legras, Sylvie Nelieu, Ruiz, N., Salima Taïbi, Franck Vandenbulcke, Annette De Vaufleury, Cécile Villenave, Guenola Peres, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 (OSUR), Université de Rennes (UR), Ingénierie Durable, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Laboratoire de biogenèse membranaire (LBM), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), LEB Aquitaine Transfert-ADERA, Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord]), Laboratoire de Génie Civil et Géo-Environnement (LGCgE) - ULR 4515 (LGCgE), Université d'Artois (UA)-Université de Lille-Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-JUNIA (JUNIA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Laboratoire Génie Civil et géo-Environnement (LGCgE) - EA 4515 (LGCgE), IMT Lille Douai, Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Lille-Université d'Artois (UA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 ( OSUR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Ingénierie Durable, Rennes, France., ADEME, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie, Angers, France., Laboratoire de biogenèse membranaire ( LBM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Morphodynamique Continentale et Côtière ( M2C ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Esitpa, Mont Saint Aignan, France., LEB Aquitaine Transfert – ADERA, Villenave d'Ornon, France., Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier ( PIAF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), ESITPA, Ecole Nationale d'Ingénieurs des Techniques Agricoles, Mont Saint Aignan, France., Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Nord] ), Université Lille Nord de France - Laboratoire Génie Civil et géoEnvironnement LGCgE-Lille 1, Ecologie Numérique et Ecotoxicologie, Villeneuve d'Ascq, France., Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université d'Artois (UA)-Université de Lille-IMT Lille Douai, and Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2015

3. Which bioindicators are suitable for soil quality monitoring and risk assessment ? From relevance study to transfer tool development

Author: Guenola Peres, Benjamin Pauget, Annette De Vaufleury, Michael Coeurdassier, Marina Leguedard, Jean-Jacques Bessoule, Samuel Dequiedt, Rémi Chaussod, Lionel Ranjard, Daniel Cluzeau, Muriel Guernion, Laurence Rougé, Mickael Hedde, Nathalie Cheviron, C Thoisy-Dur, J., Sylvie Nelieu, Christian Mougin, Isabelle Gattin, Christophe Gangneux, Laurent, N., Marc Legras, Karine Laval, Patrice Lepelletier, Salima Taïbi, Cecile Villenave, Olivier Faure, Jennifer Hellal, Jérôme Cortet, Thierry Beguiristain, Corinne Leyval, Josselin Bodilis, Steven Criquet, Adnane Hitmi, Nuria Ruiz, Franck Vandenbulcke, Cécile Grand, Laurence Galsomies, Antonio Bispo, Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire de biogenèse membranaire ( LBM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), LEB Aquitaine Transfert – ADERA, Villenave d'Ornon, France., Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 ( OSUR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Ingénierie Durable, Rennes, France., UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Esitpa, Mont Saint Aignan, France., ESITPA, Ecole Nationale d'Ingénieurs des Techniques Agricoles, Mont Saint Aignan, France., Unite AgriTerr, Mont St Aignan, France., ESITPA, Ecole Superieure des Ingenieurs et Techniciens pour l'Agriculture, Mont Saint Aignan, France., Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), École des Mines de Saint-Étienne ( Mines Saint-Étienne MSE ), Institut Mines-Télécom [Paris], Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) ( BRGM ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Interactions Arbres-Microorganismes ( IAM ), Morphodynamique Continentale et Côtière ( M2C ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), IUT de Clermont Ferrand, Institut Universitaire de Technologie de Clermont Ferrand - Laboratoire de PBV, Aurillac, France., Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Nord] ), USTL, Université des Sciences et Technologies (Lille 1) - Département Génie Biologique, Villeneuve d’Ascq, France., ADEME, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie, Angers, France., ADEME, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie, Angers, France, Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Laboratoire de biogenèse membranaire (LBM), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LEB Aquitaine Transfert-ADERA, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 (OSUR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Interactions Arbres-Microorganismes (IAM), Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord]), Département Génie Biologique, Université de Lille, Sciences et Technologies, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme BIOCHEM-ENV, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; Introduction- Considering the few number of bioindicators available for soil risk assessment and soil characterization, a national research programme has been set up in France by the French Agency For Environment and Energy Management (ADEME) to develop indicators able to judge about soil degradation and/or remediation of its properties and functions. Objectives of this “BioIndicator programme” are to (i) develop and validate methods for measuring soil biodiversity and soil functions, (ii) test the sensibility and complementarity of the bioindicators for the characterization of different perturbations (contamination, modification of soil uses), iii) identify relevant bioindicators or endpoints for different purposes (ecological risk assessment, monitoring of soil quality..), iv) transfer the results to stakeholders (policy makers, farmers, research board) by providing suitable tools. Methods- 22 research teams are involved. 47 bioindicators are tested (microorganisms, fauna, flora) in a large panel of situations (47 situations including agricultural, industrial and forest sites) and sampled at the same moment by applying standardised sampling protocols. A common database allows the management of the high number of data (200.000). Results- Bioindicator programme initiates a first national benchmark i.e. baselines values for the different biological groups. It provides relevant tools (battery of bioindicators, biological index) adapted to different environmental targets such as i) evaluation of the impact of agricultural practices (crop rotations, reduced tillage, organic and pesticides management), ii) evaluation of the bioavailability of industrial contaminants, iii) evaluation of the biological state of contaminated soils in order to orientate their future use, iv) soil monitoring of biological state at large scale. Moreover, it provides communication tools, such as bioindicator technical sheets and web-interface addressed to stakeholders (http://ecobiosoil.univ-rennes1.fr/ADEME-Bioindicateur/). Conclusion- this10 years research programme, unique at the European Union scale, permits to improve the knowledge on soil biodiversity and its functioning, and provides tools to stakeholders for future soil management.
Published: 2014

4. Les indicateurs de l'état biologique des sols : Guide de sélection selon le type d’application et/ou la problématique

Author: Benjamin Pauget, Laurence Rougé, Guenola Peres, Antonio Bispo, Cécile Grand, Thierry Beguiristain, Jean-Jacques Bessoule, Josselin Bodilis, Rémi Chaussod, Nathalie Cheviron, Michael Coeurdassier, Jérôme Cortet, Stéven Criquet, Samuel Dequiedt, Olivier Faure, Christophe Gangneux, Isabelle Gattin, Marina Le Guédard, Adnane Hitmi, Laurent, N., Marc Legras, Sylvie Nelieu, Ruiz, N., Franck Vandenbulcke, Cécile Villenave, Annette De Vaufleury, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 (OSUR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Ingénierie Durable, Rennes, France., Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Laboratoire de biogenèse membranaire (LBM), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LEB Aquitaine Transfert-ADERA, Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord]), Laboratoire de Génie Civil et Géo-Environnement (LGCgE) - ULR 4515 (LGCgE), Université d'Artois (UA)-Université de Lille-Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-JUNIA (JUNIA), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Archive Ouverte, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Laboratoire Génie Civil et géo-Environnement (LGCgE) - EA 4515 (LGCgE), IMT Lille Douai, Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Lille-Université d'Artois (UA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université de Rennes (UR), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université d'Artois (UA)-Université de Lille-IMT Lille Douai, Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 ( OSUR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, ADEME, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie, Angers, France., Laboratoire de biogenèse membranaire ( LBM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), LEB Aquitaine Transfert – ADERA, Villenave d'Ornon, France, Morphodynamique Continentale et Côtière ( M2C ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), École des Mines de Saint-Étienne ( Mines Saint-Étienne MSE ), Institut Mines-Télécom [Paris], Esitpa, Mont Saint Aignan, France., LEB Aquitaine Transfert – ADERA, Villenave d'Ornon, France., Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier ( PIAF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), ESITPA, Ecole Nationale d'Ingénieurs des Techniques Agricoles, Mont Saint Aignan, France., Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Nord] ), Université Lille Nord de France - Laboratoire Génie Civil et géoEnvironnement LGCgE-Lille 1, Ecologie Numérique et Ecotoxicologie, Villeneuve d'Ascq, France., Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), and Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro )
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2014

5. La sensibilité des communautés microbiennes à une augmentation de la température augmente quand la biodégradabilité de la ressource organique baisse

Author: Lefevre, Romain, Barré, Pierre, Maron, Pierre-Alain, Dequiedt, Samuel, Terrat, Sébastien, Bardoux, Gérard, Christensen, Bent T., Girardin, Cyril, Houot, Sabine, Kätterer, Thomas, van Oort, Folkert, Chenu, Claire, Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Faculty of Agricultural Sciences, Deparment of Agroecology, Aarhus University [Aarhus], Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Departement of Soil and Environment, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Association Française pour l'Etude du Sol (AFES). FRA., Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Aarhus University, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Department of Soil and Environment, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), ProdInra, Archive Ouverte, Biogéochimie et écologie des milieux continentaux ( Bioemco ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AgroParisTech-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Géologie, Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris ( IEES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Swedish University of Agricultural Sciences ( SLU ), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG] Environmental Sciences/Global Changes, Pyroséquençage, Structures des communautés microbiennes, Diversité, ARISA, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Matières organiques du sol, Température
Abstract: La sensibilité des communautés microbiennes à une augmentation de la température augmente quand la biodégradabilité de la ressource organique baisse. 12. Journées d'Etude des Sols
Published: 2014

6. Quels bioindicateurs et biomarqueurs utiliser pour la surveillance de la qualité des sols et l’évaluation des risques environnementaux?

Author: Guenola Peres, Benjamin Pauget, Thierry Beguiristain, Jean-Jacques Bessoule, Josselin Bodilis, Rémi Chaussod, Daniel Cluzeau, Nathalie Cheviron, Michael Coeurdassier, Jérôme Cortet, Steven Criquet, Samuel Dequiedt, Annette De Vaufleury, Faure, A., Christophe Gangneux, Isabelle Gattin, Mickael Hedde, Adnane Hitmi, Marc Legras, Marina Leguedard, Patrice Lepelletier, Christian Mougin, Sylvie Nelieu, Stéphane Ponton, Lionel Ranjard, Laurence Rougé, Salima Taibi, Franck Vandenbulcke, Cecile Villenave, Laurence Galsomies, Cécile Grand, Antonio Bispo, Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de biogenèse membranaire (LBM), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LEB Aquitaine Transfert-ADERA, Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), ENS des Mines de St-Etienne, Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), Laboratoire de PBV, Institut Universitaire de Technologie de Clermont Ferrand, Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Ingénierie Durable, Equipe Ecologie Numérique et Ecotoxicologie, Université de Lille, Sciences et Technologies, Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Elisol Environnement, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Association Française pour l'Etude du Sol (AFES). FRA., Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Laboratoire Génie Civil et géoEnvironnement LGCgE-Lille 1, Ecologie Numérique et Ecotoxicologie, Université Lille Nord de France (COMUE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université de Rennes (UR), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Supérieure des Mines de St Etienne (ENSM ST-ETIENNE), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire de biogenèse membranaire ( LBM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), LEB Aquitaine Transfert – ADERA, Morphodynamique Continentale et Côtière ( M2C ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ), ESITPA, Ecole Nationale d'Ingénieurs des Techniques Agricoles ( ESITPA ), Ecole Superieure des Ingenieurs et Techniciens pour l'Agriculture ( ESITPA ), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] ( EEF ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ), Université Lille Nord de France, Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2014

7. Biodechlord : à la recherche de traces de dégradation microbienne du chlordécone dans les sols contaminés des Antilles

Author: Fabrice Martin, Chloé Merlin, Stéphane Vuilleumier, Imfeld, G., Timothy Vogel, Sébastien Cecillon, Achouak, W., Pierre Benoit, Laure Mamy, Christian Mougin, Dominique Patureau, Chovelon, J. M., Stéphane Pesce, Edgardo Ugarte, Denis Le Paslier, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 7156 GMGM, Ampère, Département Bioingénierie (BioIng), Ampère, École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), ProdInra, Archive Ouverte, Ampère (AMPERE), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-École Centrale de Lyon (ECL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, École Centrale de Lyon ( ECL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), UR 0050 Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement, Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] ( LBE ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Microbiologie et Chaîne Alimentaire ( MICA ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Milieux aquatiques, écologie et pollutions ( UR MALY ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] ( GENOSCOPE ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], chlordecone, contamination, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], French West Indies, microbial degradation
Abstract: Session 5 - Milieux impactés / Impacted mediaSession 5 - Milieux impactés / Impacted media; Objectives: Chlordecone was intensively used in the French West Indies (FWI) to control the banana weewil. Recent surveys showed that arable soils cropped with banana, representing up to 20,000 ha, are contaminated this insecticide with concentrations ranging between 0.2 and 37.4 mg kg−1. Chlordecone was classified as a persistent organic pollutant in May 2009. It is not only contaminating soil resources but also water resources where it is often detected. This insecticide is bioaccumulated in different plant and animals thereby contaminating the food chain causing an important human health. This contaminant is recalcitrant to biodegradation and very few information is available on microbial degradation of chlordecone in soils and almost nothing in the soil of the French West Indies. In this context, the program of research Biodechlord funded by the INRA (National Institute of Agronomical Research) in the framework the National Plan for Chlordecone (PNAC), was aiming at searching for traces of chlordecone microbial degradation in FWI soils. This project relied on a multidisciplinary approach developed by a broad scientific consortium involving researchers from CEA, Ecole Centrale Lyon, INRA, Irstea, Strasbourg and Lyon Universities. This program was made of several approaches consisting in (i) in silico analyses aiming at (ia) classifying chlordecone and its known metabolites using the QSAR Typol in order to define hypotheses on possible degradation pathways (ib) searching for microbial genes coding deshalogenases in genomic databank that could be used to dechlorinate chlordecone; (ii) chemical analyses aiming at (iia) optimizing approaches to quantify chlordecone and its main metabolites in soils, (iib) identify chemical processes (photodegradation and photocatalysis) that can be used to transform chlordecone; (iii) search for microbes tolerant to chlordecone able to grow on it under aerobic or anaerobic conditions; (iv) characterize the impact of chlordecone on soil microbial communities using soil metagenomics. A synthesis of the work carried out in the framework of Biodechlord will be presented. Innovative nature of the proposed topic: Very little information is available on the processes involved in the transformation of chlordecone in the contaminated soils of the French West Indies. Regarding to the environmental and the human health problems caused by the pollutant there is an urgent to document this question. The Biodechlord project proposed to search for chemical and microbial processes possibly involved in chlordecone transformation in the contaminated soils of the French West Indies. Among the results accumulated by the Biodechlord project, results about the isolation of microbial cultures tolerant to chlordecone will be highlighted.
Published: 2014

8. Les sols et la préservation de la biodiversité

Author: Chenu, Claire, Blanchart, Eric, Bispo, Antonio, Cluzeau, Daniel, Decaëns, Thibaud, Hedde, Mickael, Lavelle, Patrick, Nunan, Naoise, Peres, Guenola, Ranjard, Lionel, Vieublé, Laure, ProdInra, Archive Ouverte, Biogéochimie et écologie des milieux continentaux ( Bioemco ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AgroParisTech-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Unité INFOSOL ( ORLEANS INFOSOL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecosystèmes Biodiversité Evolution, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris ( IEES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), InfoSol (InfoSol), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité INFOSOL (ORLEANS INFOSOL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: Les sols et la préservation de la biodiversité. Journée Mondiale des Sols
Published: 2014

9. Dynamics of the toxic cyanobacterial microcystin-leucine-arginine peptide in agricultural soil

Author: Christian Mougin, Sylvain Corbel, Noureddine Bouaïcha, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie Systématique et Evolution (ESE), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie Systématique et Evolution ( ESE ), and Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: Irrigation, Mineralization, Plant transfer, Cyanotoxins, [SDV]Life Sciences [q-bio], Microcystin, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Persistence, 03 medical and health sciences, Soil, Environmental Chemistry, Microcystis aeruginosa, Leaching (agriculture), 030304 developmental biology, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, biology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Hepatotoxin, Mineralization (soil science), biology.organism_classification, 6. Clean water, chemistry, Environmental chemistry, Soil water, Water quality, Microcystin-LR
Abstract: Avec les remerciements pour Nathalie Cheviron, Virginie Grondin et Christelle Marrauld; Microcystin-leucine-arginine (MC-LR) is a cyclic heptapeptide hepatotoxin produced by cyanobacteria such as Microcystis aeruginosa. Being highly toxic, this compound is a threat to water quality, agriculture, and human and animal health. In particular, MC-LR has been frequently detected at high concentrations in surface waters. So far, the fate of MC-LR in soils is unknown. Here, we studied degradation and soil–plant transfer of 14C-radiolabelled MC-LR in an artificial system of agricultural soil and tomato seedlings. 14C-MC-LR was dissolved in water and applied by soil irrigation, one or two times with an interval of 28 days. Results show that the 14CO2 from the degradation of 14C-MC-LR amounted to 11 % of total 14C initial input; 74–80 % of 14C-MC-LR occurred in extractible fractions analysed by HPLC. Less than 14 % of 14C-MC-LR was adsorbed on soil particles. Overall, our findings evidence for the first time a high risk of toxin leaching from the soil toward groundwater.
Published: 2014
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10. Impact du travail du sol sur son fonctionnement biologique

Author: Bouthier, Alain, Pelosi, Céline, Villenave, Cecile, Peres, Guenola, Hedde, Mickael, Ranjard, Lionel, Vian, Jean Francois, Peigné, Josephine, Cortet, Jacques, Bispo, Antonio, Piron, Denis, ARVALIS - Institut du végétal [Paris], Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), SARA Lyon, Université de Lyon, Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Jerôme Labreuche, François Laurent, Jean Roger-Estrade, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), ProdInra, Archive Ouverte, ARVALIS - Institut du Végétal, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Université de Lyon (COMUE), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), ISARA-Lyon, Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), and Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], azote, prévention, agronomie, sol, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], pollution, système de culture, environnement, agriculture
Abstract: National audience; Les impacts des différentes modalités de travail du sol (labour, semis direct) sur l’environnement et les états du sol, sur la biodiversité ou sur le climat font l’objet de débats parfois passionnés mais souvent trop peu instruits sur les plans scientifique et technique. Que nous enseignent les expérimentations les plus récentes sur ce sujet ? Quelles sont les innovations qui se dessinent à l’heure actuelle ? Cet ouvrage propose une synthèse des connaissances les plus récentes dans ce domaine.
Published: 2014

11. Characterization of chlordecone-tolerant fungal populations isolated from long-term polluted tropical volcanic soil in the French West Indies

Author: Marion Devers, Cécile Héraud, Fabrice Martin-Laurent, Olivier Crouzet, Chloé Merlin, Christian Steinberg, Christian Mougin, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ADEME/Region Bourgogne, INRA AIP Demichlord part of PNAC 1, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: Fusarium, Insecticides, West Indies, Health, Toxicology and Mutagenesis, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Molecular Sequence Data, 010501 environmental sciences, Ecotoxicology, 01 natural sciences, Soil, 03 medical and health sciences, Drug Resistance, Fungal, Botany, Pochonia, Soil Pollutants, Environmental Chemistry, Biomass, Soil Microbiology, 0105 earth and related environmental sciences, 0303 health sciences, Base Sequence, biology, 030306 microbiology, Acremonium, Fungi, Fungal genetics, Bionectria, Musa, General Medicine, biology.organism_classification, Pollution, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Purpureocillium, Chlordecone, Biosorption, Biodegradation, Paecilomyces, Soil microbiology, Andosol
Abstract: The insecticide chlordecone is a contaminant found in most of the banana plantations in the French West Indies. This study aims to search for fungal populations able to grow on it. An Andosol heavily contaminated with chlordecone, perfused for 1 year in a soil-charcoal system, was used to conduct enrichment cultures. A total of 103 fungal strains able to grow on chlordecone-mineral salt medium were isolated, purified, and deposited in the MIAE collection (Microorganismes d'Intérêt Agro-Environnemental, UMR Agroécologie, Institut National de la Recherche Agronomique, Dijon, France). Internal transcribed spacer sequencing revealed that all isolated strains belonged to the Ascomycota phylum and gathered in 11 genera: Metacordyceps, Cordyceps, Pochonia, Acremonium, Fusarium, Paecilomyces, Ophiocordyceps, Purpureocillium, Bionectria, Penicillium, and Aspergillus. Among predominant species, only one isolate, Fusarium oxysporum MIAE01197, was able to grow in a liquid culture medium that contained chlordecone as sole carbon source. Chlordecone increased F. oxysporum MIAE01197 growth rate, attesting for its tolerance to this organochlorine. Moreover, F. oxysporum MIAE01197 exhibited a higher EC50 value than the reference strain F. oxysporum MIAE00047. This further suggests its adaptation to chlordecone tolerance up to 29.2 mg l(-1). Gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) analysis revealed that 40 % of chlordecone was dissipated in F. oxysporum MIAE01197 suspension culture. No chlordecone metabolite was detected by GC-MS. However, weak amount of (14)CO2 evolved from (14)C10-chlordecone and (14)C10-metabolites were observed. Sorption of (14)C10-chlordecone onto fungal biomass followed a linear relationship (r (2) = 0.99) suggesting that it may also account for chlordecone dissipation in F. oxysporum MIAE01197 culture.
Published: 2014
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12. Analysis of pharmaceuticals in aqueous and particulate phases of soil and of organic residues: critical points to ensure quality of the results

Author: Deschamps, Marjolaine, Leang, Sokha, Lariviere, Audrey, Bernet, Nathalie, Haudin, Claire-Sophie, Nelieu, Sylvie, Benoit, Pierre, Steyer, Dominique, Houot, Sabine, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Analysis of pharmaceuticals in aqueous and particulate phases of soil and of organic residues: critical points to ensure quality of the results. 15th International Conferences of RAMIRAN (Network on Recycling of Agricultural, Municipal and Industrial Residues in Agriculture)
Published: 2013

13. Effect of repeated organic waste applications on soil microorganisms involved in N cycle and their activities at the plot scale

Author: Obriot, Fiona, Vieublé, Laure, Philippot, Laurent, Crouzet, Olivier, Houot, Sabine, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2013

14. TyPol : un outil opérationnel permettant de cartographier et choisir des molécules « modèles » pour des études en écodynamique et en écotoxicologie des pesticides

Author: Benoit, Pierre, Latrille, Eric, Mamy, Laure, Steyer, Dominique, Rossard, Virginie, Bessac, Fabienne, Servien, Rémi, Barriuso, Enrique, Bedos, Carole, Laurent, Francois, Louchart, Xavier, Martin-Laurent, Fabrice, Miege, Christine, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire d'étude des Interactions Sol - Agrosystème - Hydrosystème (UMR LISAH), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Agroécologie [Dijon], Reproduction et développement des plantes (RDP), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), UR 0050 Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement, Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] ( LBE ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Microbiologie et Chaîne Alimentaire ( MICA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Ecole d'ingénieurs de Purpan, Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire d'étude des Interactions Sol - Agrosystème - Hydrosystème ( UMR LISAH ), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [ Madagascar] ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ), Reproduction et développement des plantes ( RDP ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2013

15. A network of long term experimental sites to include quantitative modelling of pesticides losses in the multi-criteria assessment of innovating cropping systems

Author: Benoit, Pierre, Alletto, Lionel, Gavaland, André, Giuliano, Simon, Farcy, Pascal, Leleu, Michel, Ubertosi, Marjorie, Pernel, Jérôme, Mamy, Laure, Pot-Genty, Valerie, Bedos, Carole, Colnenne-David, Caroline, Doré, Thierry, Justes, Eric, Munier-Jolain, Nathalie G., ProdInra, Archive Ouverte, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Domaine expérimental d'Auzeville (UE AUZEVILLE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Dynamique des Intrants dans les Agro-écosystèmes - UMR 1248 AGIR INRA / INPT, Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Domaine expérimental d'Époisses (DIJ EPOISSES), Domaine expérimental de Brunehaut (LILL MONS UE), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Agro-Transfert Ressources et Territoires, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Agronomie, Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers ( ARCHE ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Domaine expérimental d'Auzeville ( UE AUZEVILLE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ), Domaine expérimental d'Époisses ( DIJ EPOISSES ), Domaine expérimental de Brunehaut ( LILL MONS UE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Domaine expérimental d'Époisses - UE0115 U2E (DIJ EPOISSES), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2013

16. Démarche statistique pour la sélection des indicateurs par Random Forests pour la surveillance de la qualité des sols

Author: Olivier Faure, Hassani Taibi, C Thoisy-Dur, J., Patrice Lepelletier, Bodin, J., Nadia Laurent-Bennegadi, J Bessoule, J., Antionio Bispo, Bodilis, J., Rémi Chaussod, Nathalie Cheviron, Jérôme Cortet, Criquet, J., Jérôme Dantan, Samuel Dequiedt, Christophe Gangneux, Jennifer Harris-Hellal, Mickael Hedde, Hitmi, A., Le Guedard, M., Marc Legras, Guenola Peres, Repinçais, C., Rouge, L., Ruiz, N., Isabelle Trinsoutrot-Gattin, Cécile Villenave, Unité de recherche en agro-écologie des territoires (AGRI'TERR ), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Bordeaux Ségalen (Bordeaux 2), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Université de Bourgogne (UB), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Equipe Geosciences & Environnement, École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Laboratoire de biogenèse membranaire (LBM), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Elisol Environnement, LAboratoire de Recherche Historique Rhône-Alpes - UMR5190 (LARHRA), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Recherche Déchet et Sol, Agence de l'Environnement et de la Maitrise de l'Energie, Microbiologie du Sol et de l'Environnement (MSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), INRA, UR251 PESSAC, F-78026 Versailles Cedex, France, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d’écologie microbienne (BioSol), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Ecole Nationale Supérieure des Mines de Saint-Etienne, Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l’Arbre en environnement Fluctuant - Clermont Auvergne (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Agri’Terr, CS 40118, ESITPA, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement ( LMSM ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Université de Bourgogne ( UB ), UMR UL/INRA, 1120, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) ( BRGM ), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l’Arbre en environnement Fluctuant - Clermont Auvergne ( PIAF ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), UMR 5200, INRA Bordeaux Aquitaine, LEB Aquitaine Transfert – ADERA, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre France-Nord, UMR 211 BIOEMCO, Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Agri’Terr, CS 40118, 76134, Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LAboratoire de Recherche Historique Rhône-Alpes - UMR5190 ( LARHRA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Jean Moulin - Lyon III-Université Lumière - Lyon 2 ( UL2 ) -École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), ESITPA, Ecole Superieure des Ingenieurs et Techniciens pour l'Agriculture, Mont Saint Aignan, France., École Supérieure d'Ingénieurs et Techniciens Pour l'Agriculture ( ESITPA ), Microbiologie du Sol et de l'Environnement ( MSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Ecole Supérieure d'Ingénieurs et Techniciens pour l'Agriculture ( ESITPA ), Esitpa, Mont Saint Aignan, France., Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), ESITPA, Ecole Nationale d'Ingénieurs des Techniques Agricoles, Mont Saint Aignan, France., Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire BioSol, Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: Analyse discriminante, Random Forests, contaminantes orgánicos, indicateurs pédologiques, land use, organic pollutants, polluants organiques, [ SHS.ENVIR ] Humanities and Social Sciences/Environmental studies, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography, [SHS]Humanities and Social Sciences, bioindicateurs, [ SHS ] Humanities and Social Sciences, occupation des sols, sélection, méthodes statiques, bioindicadores, Random Forets, [ SHS.STAT ] Humanities and Social Sciences/Methods and statistics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SHS.STAT]Humanities and Social Sciences/Methods and statistics, pédologie, uso del suelo, Discriminant Analysis, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, sols, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, metal contamination, ETM, selección, [SHS.ENVIR]Humanities and Social Sciences/Environmental studies, bioindicators, análisis discriminante, [SDE.ES] Environmental Sciences/Environmental and Society, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society, qualité des sols
Abstract: The volume of data, and the large number of biological variables to be tested (one hundred), require analytical techniques, such asRandom Forests, which can overcome the problem of multi-colinearity for the selection of indicators, sensitive to various factors.Random Forests methodology is appropriate for the selection of the most discriminant variables. So, we searched for the best wayto select them, by bringing together all biological variables, representing the Microflora and Fauna. This approach focuses on impactindicators from the Bio2 program, indicators of flora and indicators of accumulation (snails) were not included.This work has been implemented on the three factors of discrimination : land use, metallic contamination levels and organic contaminationlevels.We grouped the most discriminating variables from each RF analysis. Linear discriminant analysis was then implemented for each factor,in order to develop a predictive model., El volumen de datos definidos en el programa bioindicadores 2 (Ademe) y el muy grande numero de variables biológicas para probar(una centena) necesitan técnicas de análisis como los Random Forests que pueden liberarse del problema de multicolinealidad para laselección de indicadores sensibles a los diferentes factores estudiados.La metodología de Random Forests consiste en la selección de variables las más discriminantes. Así buscamos la mejor selección agrupandoel conjunto de las variables biológicas que representan la Microflora y la Fauna. Estos trabajos se realizaron sobre los tres factoresde discriminación : el uso de los suelos, los niveles de contaminación en ETM y los niveles de contaminación en contaminantes orgánicos.Luego, agrupamos las variables las más discriminantes derivadas de cada análisis por RF. Un análisis discriminante linear se realizodespués para cada factor con vista a elaborar un modelo predictivo. Se observaron los indicadores del grupo Flora únicamente sobreun sub-conjunto de 47 parcelas de modalidades contrastadas, así no los incluimos en nuestro estudio. Las variables “estandarizadas"del grupo Flora podrán estar integradas en un segundo tiempo., Le volume des données définies dans le programme Bioindicateurs 2 (Ademe) et le très grand nombre de variables biologiques à tester(une centaine) nécessitent des techniques d’analyse telles que les Random Forests qui peuvent s’affranchir du problème de multi-colinéaritépour la sélection d’indicateurs sensibles aux différents facteurs étudiés.La méthodologie des Random Forests consiste en la sélection des variables les plus discriminantes. Ainsi nous avons recherché lameilleure sélection en étudiant l’ensemble des variables biologiques représentant la Microflore et la Faune. Cette démarche a portésur l’ensemble des indicateurs d’effet issus du programme Bio2, les indicateurs de la flore et d’accumulation (escargot) n’ayant pas ététraités. Ces travaux ont été mis en oeuvre sur les trois facteurs de discrimination : l’usage des sols, les niveaux de contamination en ETM,et les niveaux de contamination en polluants organiques.Nous avons ensuite regroupé les variables les plus discriminantes issues de chaque analyse par RF. Une analyse discriminante linéairea ensuite été mise en oeuvre pour chaque facteur en vue d’élaborer un modèle prédictif.
Published: 2013

17. Les enseignements du programme ADEME « Bioindicateurs de l’état biologique des sols »

Author: Antionio Bispo, Guenola Peres, Mickael Hedde, Isabelle Gattin, Daniel Cluzeau, Nathalie Cheviron, Jennifer Harris-Hellal, Marina Le Guédard, Jean-Jacques Bessoule, Nuria Ruiz, Benjamin Pauget, Annette de Vaufleury, Christian Mougin, Thierry Beguiristain, Lionel Ranjard, Samuel Dequiedt, Rémi Chaussod, Olivier Faure, Adnane Hitmi, Steven Criquet, Marc Legras, Nicolas Laurent, Franck Vandenbulcke, Karine Laval, Christophe Gangneux, Nicolas, E., Michael Coeurdassier, Stéphane Ponton, Jérôme Cortet, Cécile Villenave, Josselin Bodilis, Laurence Rougé, Salima Taïbi, C Thoisy-Dur, J., Jeanne Bodin, Aude Alaphilippe, Francis Douay, Sabine Houot, Muriel Guernion, Patrice Lepelletier, Cedric Repinçay, Jean-François Vian, Sébastien Conil, Noële Raoult, Pierre Plassart, Vincent Mercier, Hotte, H., Laurence Galsomiès, Cécile Grand, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecole d'Ingénieurs en Agriculture, ESITPA, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Equipe de Biogéochimie Environnementale, Bureau de Recherches Géologiques et Minières ( BRGM ), UMR 5200, INRA Bordeaux Aquitaine, LEB Aquitaine Transfert – ADERA, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Centre France-Nord, UMR 211 BIOEMCO, Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Department of Chrono-Environment, UMR UFC/CNRS 6249 USC INRA, Université de Franche-Comté ( UFC ), Department of Chrono-Environment, University of Franche-Comté, UMR UFC/CNRS 6249 USC INRA, Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols ( LIMOS ), Université Henri Poincaré - Nancy 1 ( UHP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), UMR CNRS 5600 EVS-EMSE-Géosciences et Environnement F 42, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Saint-Etienne, Université de Lyon (COMUE), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l’Arbre en environnement Fluctuant - Clermont Auvergne ( PIAF ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université ( AMU ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux ( UMR SELMET ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] ( EEF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement ( LMSM ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Unité de Recherches Intégrées - Gotheron ( GOTH RI UERI ), Equipe Sols et Environnement, Laboratoire Génie Civil et géoEnvironnement Lille Nord, Institut Supérieur d'Agriculture de Lille (Groupe ISA), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), UR 0251 PESSAC Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Département AGEP (AGroécosystèmes-Environnement-Productions), isaralyon, AGRAPOLE, AGEP, Observ Perenne Environm, DRD Observat Surveillance, Agence Nationale pour la Gestion des Déchets Radioactifs ( ANDRA ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), Université de Rennes (UR), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Laboratoire de biogenèse membranaire (LBM), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols (LIMOS), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Environnement, Ville, Société (EVS), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-École nationale supérieure d'architecture de Lyon (ENSAL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux (UMR SELMET), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Institut Supérieur d'Agriculture de Lille (ISA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AGroécosystèmes Environnement Productions (AGEP), ISARA-Lyon, Agence Nationale pour la Gestion des Déchets Radioactifs (ANDRA), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Université de Lyon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l’Arbre en environnement Fluctuant - Clermont Auvergne (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Unité de Recherches Intégrées - Gotheron (GOTH RI UERI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Les enseignements du programme ADEME « Bioindicateurs de l’état biologique des sols ». Séminaire national du « Programme Inventaire, Gestion et Conservation des Sols (IGCS) »
Published: 2013

18. Etude de la sécrétion d’enzymes fongiques dans les sols. Application au développement de biomarqueurs d’écotoxicité des sols et déchets

Author: Aloui, Achref, Cheviron, Nathalie, Chevret, Didier, Mougin, Christian, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Etude de la sécrétion d’enzymes fongiques dans les sols. Application au développement de biomarqueurs d’écotoxicité des sols et déchets. Colloque de restitution du DIM ASTREA 2008 - 2011
Published: 2012

19. Early colonization of a constructed Technosol by soil organisms after industrial site rehabilitation

Author: Jérôme Cortet, Thierry Béguiristain, Anne-Marie Charissou, Elodie-Denise Chenot, Sylvain Corbel, Daniel Cluzeau, Mickael Hedde, Corinne Leyval, Jean-François Masfaraud, Fabrice Martin, Johanne Nahmani, Denis Piron, Christophe Schwartz, Geoffroy Séré, Cecile Villenave, Françoise Watteau, Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Eurofins IPL Est, Maxéville, France, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), CNRS, Centre National de la Recherche Scientifique, Rennes, France, Transfert Sol-Plante et Cycle des Eléments Minéraux dans les Ecosystèmes Cultivés (TCEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire des Interactions Ecotoxicologie, Biodiversité, Ecosystèmes (LIEBE), Université Paul Verlaine - Metz (UPVM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Elisol Environnement, Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), CNRS, Centre National de la Recherche Scientifique, Vandoeuvre les Nancy, France, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Transfert Sol-Plante et Cycle des Eléments Minéraux dans les Ecosystèmes Cultivés ( TCEM ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux ( ENITAB ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire des Interactions Ecotoxicologie, Biodiversité, Ecosystèmes ( LIEBE ), Université Paul Verlaine - Metz ( UPVM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ProdInra, Archive Ouverte, Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2012

20. Soil fauna used as bioindicators for soil monitoring, risk assessment and soil characterization. Results from the French national 'Bioindicators Programme'

Author: Mickael Hedde, Antonio Bispo, Daniel Cluzeau, Michael Coeurdassier, Jérôme Cortet, Annette De Vaufleury, Muriel Guernion, Benjamin Pauget, Nuria Ruiz, Franck Vandenbulcke, Cécile Villenave, Aude Alaphilippe, Thierry Beguiristain, Francis Douay, Olivier Faure, Adnane Hitmi, Sabine Houot, Marc Legras, Jean Francois Vian, Sebastien Conil, Laurence Rougé, Guenola Peres, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 (OSUR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Grp ISA - Equipe Sols & Environm, Lab Genie Civil & GeoEnvironm LGCgE Lille Nord Fr, EA 4515, Lille, France, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), IRD, Institut de Recherche pour le Développement, Montpellier, France, Unité de Recherches Intégrées - Gotheron (GOTH RI UERI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols (LIMOS), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnement Ville Société (EVS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-École nationale supérieure d'architecture de Lyon (ENSAL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), AGEP - Département AGEP (AGroécosystèmes-Environnement-Productions), isaralyon, AGRAPOLE , Lyon, France, Ctr Meuse Haute Marne - Observ Perenne Environm, DRD Observat Surveillance, Bure, France, Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Université de Rennes (UR), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LGCgE-ISA (LGCgE-ISA), Institut Supérieur d'Agriculture de Lille (ISA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Environnement, Ville, Société (EVS), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-École nationale supérieure d'architecture de Lyon (ENSAL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, AGroécosystèmes Environnement Productions (AGEP), ISARA-Lyon, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-École nationale supérieure d'architecture de Lyon (ENSAL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 ( OSUR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux ( Bioemco ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AgroParisTech-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Unité de Recherches Intégrées - Gotheron ( GOTH RI UERI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols ( LIMOS ), Université Henri Poincaré - Nancy 1 ( UHP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnement Ville Société ( EVS ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Université Lumière - Lyon 2 ( UL2 ) -Université Jean Moulin - Lyon III-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -École Nationale des Travaux Publics de l'État ( ENTPE ) -Ecole Nationale Supérieure des Mines de Saint-Etienne-École nationale supérieure d'architecture de Lyon ( ENSAL ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l'Arbre Fruitier et Forestier ( PIAF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Esitpa - Ecole d’Ingénieurs en Agriculture, Agri’Terr Unit, Mont Saint Aignan, France, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut Supérieur d'Agriculture [Université catholique, Lille] (ISA), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-École nationale supérieure d'architecture de Lyon (ENSAL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2012

21. Does the sensitivity of the soil organic matter mineralization to a change of temperature depend on its quality?

Author: Lefevre, Romain, Barré, Pierre, Bardoux, Gérard, Christensen, Bent Tolstrup, Girardin, Cyril, Houot, Sabine, Kätterer, Thomas, van Oort, Folkert, Chenu, Claire, Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de géologie de l'ENS (LGENS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département des Géosciences - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Faculty of Agricultural Sciences, Department of Agroecology and Environment, Aarhus University [Aarhus], Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Departement of Soil and Environment, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Laboratoire de géologie de l'ENS (LGE), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Department of Soil and Environment, ProdInra, Archive Ouverte, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), European Confederation of Soil Science Societies. INT., Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), and Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC)
Subjects: [SDE.MCG] Environmental Sciences/Global Changes, soil temperature, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, soil organic matter, température du sol, mineralization, [SDE.ES] Environmental Sciences/Environmental and Society, minéralisation, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, matière organique du sol
Abstract: Does the sensitivity of the soil organic matter mineralization to a change of temperature depends on its quality ?. 4. International congress EUROSOIL 2012
Published: 2012

22. Typologie des contaminants organiques : vers un outil opérationnel permettant d’aboutir à la définition et au choix de micropolluants représentatifs « modèles » pour des études en écotoxicologie

Author: Pierre Benoit, Laure Mamy, Virginie Rossard, Eric Latrille, Fabienne Bessac, Dominique Patureau, Enrique Barriuso Benito, Carole Bedos, Xavier Louchart, Fabrice Martin, Cécile Miege, Francois Laurent, Patrice Carpentier, Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire d'étude des Interactions Sol - Agrosystème - Hydrosystème (UMR LISAH), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Toxicologie Alimentaire (UTA), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université de Toulouse (UT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Microbiologie du Sol et de l'Environnement (MSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), UR MAEP, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Unité Ecotoxicologie Environnement, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Microbiologie du Sol et de l'Environnement (1229)., AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), UR 0050 Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement, Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] ( LBE ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Microbiologie et Chaîne Alimentaire ( MICA ), Ecole d'ingénieurs de Purpan, Toulouse, France, Laboratoire d'étude des Interactions Sol - Agrosystème - Hydrosystème ( UMR LISAH ), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [ Madagascar] ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Milieux aquatiques, écologie et pollutions ( UR MALY ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Anses - Unité Ecotoxicologie Environnement, Maisons-Alfort, France, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ), Microbiologie du Sol et de l'Environnement ( MSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement ( EcoLab (ENSAT-Bat A) ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-PRES Université de Toulouse-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail ( ANSES Maisons-Alfort )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], classification, contaminant organique, QSAR, impact environnemental, [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Communication orale, résuméCommunication orale, résumé; Le nombre et la diversité des contaminants organiques (pesticides, HAP, PCB, médicaments,…) potentiellement présents dans l’environnement est une réalité à laquelle sont confrontées les recherches portant sur le devenir et les impacts de ces substances. Selon les estimations, entre 30 000 et 100 000 substances sont concernées, il est donc impossible de les étudier au cas par cas. Cette difficulté se rencontre notamment dans le contexte de la Directive Européenne REACH (Registration, Evaluation, Authorisation and Restriction of Chemical substances) qui vise à mettre en place un système d’enregistrement de 30 000 substances chimiques pour lesquelles des informations précises sur la dispersion de ces substances dans l’environnement et leurs impacts écotoxicologiques sont exigées. Parallèlement à ces besoins en lien direct avec le travail d’évaluation des risques, notre communauté scientifique ressent fortement la nécessité de classer les contaminants organiques en fonction de leurs propriétés essentielles dans les mécanismes responsables de leur comportement dans l’environnement, de leur passage dans les organismes vivants et de leurs effets toxicologiques. Nous avons récemment développé une méthodologie permettant de classer des contaminants organiques selon des propriétés directement liées aux processus d’intérêt environnementaux, par exemple leur rétention irréversible, leur dégradation biotique ou abiotique, leur transfert vers l’air ou les eaux, leur passage dans les organismes vivants ou encore leurs effets toxicologiques. Cet outil, appelé TYPOL, est basé à la fois sur une approche «in silico» calculant des descripteurs moléculaires et sur des méthodes de classification combinant descripteurs moléculaires et paramètres comportementaux. Les classes sont construites à partir d’une analyse statistique (type PLS) des propriétés déduites de la prise en compte des caractéristiques structurales des molécules considérées et des paramètres environnementaux. Le choix des relations entre paramètres et descripteurs est en grande partie basée sur des relations de type QSAR (structure-activité). De par son mode de construction, l’outil est adaptable à différentes questions de recherche et concerne l’ensemble des contaminants organiques existants ou potentiels. Il vise à extrapoler des connaissances au sein d’une classe de composés à partir des résultats obtenus sur quelques molécules. Il est composé d'une base de données en MySQL accessible sur un serveur commun. L'ajout de nouvelles données se fait soit par transfert d'un fichier tableur (type Excel), soit par modification de la base à l'aide d'un outil web (phpMyAdmin). Les interfaces d'interrogation de la base de données et des traitements statistiques sont programmées dans le langage R qui intègre de nombreuses bibliothèques de méthodes de traitements statistiques des données. Les sorties graphiques sont aussi réalisées par le logiciel R. Des perspectives d’améliorations sont envisagées : - Ajouts de paramètres environnementaux. Un travail important sera à réaliser autour des données manquantes pour combler une partie des manques. Au sein de l’ANSES, des contacts dans les services BIOCIDE et REACH sont envisagés. Pour les pesticides, il sera possible d’insérer des données extraites de la base AGRITOX pour notamment pour des paramètres écotoxicologiques. Des possibilités non explorées existent auprès de l’INERIS. Des travaux en cours au Cemagref de Lyon pourraient potentiellement se raccrocher à ce travail. - Ajouts de descripteurs moléculaires. Pour d’autres pesticides ou des contaminants émergents, la phase d’obtention des descripteurs pourra être améliorée en réalisant l’analyse conformationnelle pour localiser le minimum global grâce à l’utilisation de méthodes comme la dynamique moléculaire ou des méthodes de type Monte Carlo. - Travailler sur les liens entre molécules parent et métabolites Il serait intéressant de les prévoir pour par exemple faire apparaître les filiations lors des changements de classes suite à des processus de biodégradation. Ce travail a démarré en 2011 dans le cadre du projet BIODECHLORD « Etudes exploratoires de la dégradation microbienne de la chlordécone » (financement AIP DEMICHLORD et coordination Fabrice Martin (INRA Dijon) où TYPOL sera utilisé pour tester des scénarios de biodégradation de la chlordécone et de cyclodiènes apparentés (approche in silico).
Published: 2011

23. French Bioindicator Program first results on soil fauna–based tools for soil monitoring, characterization and risk assessment

Author: Mickael Hedde, Antonio Bispo, Daniel Cluzeau, Jérôme Cortet, Francis Douay, Laurence Galsomiès, Cécile Grand, Sabine Houot, Corinne Leyval, Benjamin Pauget, Ruiz-Camacho, N., Erwinn Ulrich, Franck Vandenbulcke, Annette De Vaufleury, Cécile Villenave, Guenola Peres, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 ( OSUR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), ISA, Institut Supérieur d'Agriculture de Lille - Laboratoire Génie Civil et géoEnvironnement (LGCgE) Lille Nord de France, EA 4515, Equipe Sols et Environnement, 48 boulevard Vauban, Lille, France, Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols ( LIMOS ), Université Henri Poincaré - Nancy 1 ( UHP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux ( Bioemco ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AgroParisTech-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), ONF, Office National des Forêts - Département Recherche, Fontainebleau, France, LGCgE, Université Lille 1 - Laboratoire Génie Civil et géoEnvironnement (LGCgE) Lille Nord de France, EA 4515, Equipe Ecologie Numérique et Ecotoxicologie, Villeneuve d’Ascq, France, RD, Institut de Recherche pour le Développement, Montpellier, France, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 (OSUR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), LGCgE-ISA (LGCgE-ISA), Institut Supérieur d'Agriculture [Université catholique, Lille] (ISA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols (LIMOS), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Laboratoire de Génie Civil et Géo-Environnement (LGCgE) - ULR 4515 (LGCgE), Université d'Artois (UA)-Université de Lille-Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-JUNIA (JUNIA), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Rennes (UR), Institut Supérieur d'Agriculture de Lille (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Laboratoire Génie Civil et géo-Environnement (LGCgE) - EA 4515 (LGCgE), Université d'Artois (UA)-Université de Lille-IMT Lille Douai, Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), and Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2011

24. 4ème séminaire d'Ecotoxicologie

Author: Benoit, Pierre, Caquet, Thierry, Denaix, Laurence, Lagadic, Laurent, Martin, Fabrice, Mougin, Christian, Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques ( DEPT EFPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Transfert Sol-Plante et Cycle des Eléments Minéraux dans les Ecosystèmes Cultivés ( TCEM ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux ( ENITAB ), Écologie et santé des écosystèmes ( ESE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (DEPT EFPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Transfert Sol-Plante et Cycle des Eléments Minéraux dans les Ecosystèmes Cultivés (TCEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2011

25. The BioTechnoSol project: Biological dynamics and functioning of a constructed Technosol at the field scale

Author: Jérôme Cortet, Thierry Béguiristain, Anne-Marie Charissou, Daniel Cluzeau, Mickael Hedde, Corinne Leyval, Jean-François Masfaraud, Fabrice Martin, Jean-Louis Morel, Johanne Nahmani, Benjamin Pey, Laurence Rougé, Christophe Schwartz, Geoffroy Séré, Cécile Villenave, Françoise Watteau, Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols (LIMOS), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Eurofins IPL Est, Maxéville, France, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 (OSUR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire des Interactions Ecotoxicologie, Biodiversité, Ecosystèmes (LIEBE), Université Paul Verlaine - Metz (UPVM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IRD, Institut de Recherche pour le Développement, Montpellier, France, Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols ( LIMOS ), Université Henri Poincaré - Nancy 1 ( UHP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 ( OSUR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire des Interactions Ecotoxicologie, Biodiversité, Ecosystèmes ( LIEBE ), Université Paul Verlaine - Metz ( UPVM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), ProdInra, Archive Ouverte, Université de Rennes (UR), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2010

26. Typologie des contaminants organiques. Comment relier les propriétés moléculaires des contaminants à leur devenir dans l’environnement et à leurs effets écotoxicologiques?

Author: Laure Mamy, Pierre Benoit, Enrique Barriuso Benito, Carole Bedos, Fabienne Bessac, Eric Latrille, Dominique Steyer, Virginie Rossard, Xavier Louchart, Christian Bockstaller, Fabrice Martin, Cécile Miège, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'étude des Interactions Sol - Agrosystème - Hydrosystème (UMR LISAH), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Laboratoire Agronomie et Environnement - Antenne Colmar (LAE-Colmar ), Laboratoire Agronomie et Environnement (LAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecole d'ingénieurs de Purpan, Toulouse, France, UR 0050 Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement, Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] ( LBE ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Microbiologie et Chaîne Alimentaire ( MICA ), Laboratoire d'étude des Interactions Sol - Agrosystème - Hydrosystème ( UMR LISAH ), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [ Madagascar] ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ), Laboratoire Agronomie et Environnement - Antenne Colmar ( LAE-Colmar ), Laboratoire Agronomie et Environnement ( LAE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Milieux aquatiques, écologie et pollutions ( UR MALY ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2010

27. Programme ADEME - Bioindicateur II : Recherche d’outils de surveillance, de caractérisation et d’évaluation des risques des sols basés sur la faune du sol

Author: Mickael Hedde, Antonio Bispo, Daniel Cluzeau, Jérôme Cortet, Francis Douay, Laurence Galsomiès, Cécile Grand, Sabine Houot, Corinne Leyval, Benjamin Pauget, Ruiz-Camacho, N., Erwin Ulrich, Franck Vandenbulcke, Annette De Vaufleury, Cécile Villenave, Guenola Peres, Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 (OSUR), Université de Rennes (UR), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Laboratoire de Génie Civil et Géo-Environnement (LGCgE) - ULR 4515 (LGCgE), Université d'Artois (UA)-Université de Lille-Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-JUNIA (JUNIA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols (LIMOS), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ONF, Office National des Forêts - Département Recherche, Fontainebleau, France, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Equipe Ecologie Numérique et Ecotoxicologie, Université de Lille, Sciences et Technologies, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Laboratoire Génie Civil et géo-Environnement (LGCgE) - EA 4515 (LGCgE), Université d'Artois (UA)-Université de Lille-IMT Lille Douai, Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Lille Douai (IMT Lille Douai), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Laboratoire Génie Civil et géoEnvironnement (LGCgE) Lille Nord de France, EA 4515, Equipe Ecologie Numérique et Ecotoxicologie, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LGCgE, Groupe ISA - Equipe Sols et Environnement, Lille, France, IRD, Institut de Recherche pour le Développement, Montpellier, France, LGCgE-ISA (LGCgE-ISA), Institut Supérieur d'Agriculture de Lille (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Station Biologique de Paimpont CNRS UMR 6653 ( OSUR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Laboratoire Sols et Environnement ( LSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), LGCgE, Groupe ISA - Equipe Sols et Environnement, Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols ( LIMOS ), Université Henri Poincaré - Nancy 1 ( UHP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux ( Bioemco ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AgroParisTech-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), IRD, Institut de Recherche pour le Développement, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Supérieur d'Agriculture [Université catholique, Lille] (ISA), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lille 1 - Laboratoire Génie Civil et géoEnvironnement (LGCgE) Lille Nord de France, EA 4515, Equipe Ecologie Numérique et Ecotoxicologie, Villeuneuve d'Ascq, France, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2010

28. Évaluation de bioindicateurs d'impact du recyclage de produits résiduaires organiques en sols cultivés: lien avec les modifications des caractéristiques physico-chimiques du sol

Author: Houot, Sabine, Cambier, Philippe, Capowiez, Yvan, Steinberg, Christian, Beguiristain, Thierry, Lebeau, Thierry, Lhoutellier, Claire, Barriuso, Enrique, Benoit, Pierre, Bernet, Nathalie, Bodineau, Guillaume, Deschamps, Marjolaine, Devaux, Anne, Edel-Hermann, Veronique, Etievant, Veronique, Gautheron, Nadine, Jaulin, Anne, Norini, Marie-Paule, Leyval, Corinne, Petraud, Jean Pierre, Rampon, Jean-Noel, Ventroux, Magali, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Abeilles et Environnement (AE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Microbiologie du Sol et de l'Environnement (MSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols (LIMOS), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plate-forme technologique « Agrosystèmes », Institut Universitaire de Technologie, Veolia Environnement, Laboratoire des Sciences de l’Environnement, École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE), Plate-forme technologique «Agrosystèmes», Université de Lorraine (UL), Ecole Nationale des Travaux Publics de l’Etat, ProdInra, Archive Ouverte, Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Abeilles et Environnement ( AE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Microbiologie du Sol et de l'Environnement ( MSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Laboratoire des Interactions Microorganismes-Minéraux-Matière Organique dans les sols ( LIMOS ), Université Henri Poincaré - Nancy 1 ( UHP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Université de Lorraine ( UL )
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], bioindicateur, stomatognathic diseases, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], recyclage, produit résiduaire organique, sol cultivé
Abstract: Communication orale, résumé étendu; absent
Published: 2009

29. Recherche de bioindicateurs d'impact du recyclage de produits résiduaires organiques en sols cultivés : lien avec la disponibilité de micropolluants organiques et métalliques

Author: Houot, Sabine, Barriuso Benito, Enrique, Benoit, Pierre, Deschamps, Marjolaine, Bodineau, Guillaume, Rampon, Jean-Noel, Etievant, Veronique, Cambier, Philippe, Petraud, Jean Pierre, Jaulin, Anne, Capowiez, Yvan, Steinberg, Christian, Edel-Hermann, Veronique, Bispo, Antonio, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale d'Amélioration des Arbres Forestiers (UEARF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), ProdInra, Archive Ouverte, FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Expérimentale d'Amélioration des Arbres Forestiers ( UEARF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles ( PSH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME )
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2009

30. Kinetic extractions to assess mobilization of Zn, Pb, Cu, and Cd in a metal-contaminated soil: EDTA vs. citrate

Author: Folkert van Oort, Alain Bermond, Isabelle Lamy, Fabrice Monna, Jérôme Labanowski, Philippe Cambier, Christelle Fernandez, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Biogéosciences [UMR 6282] [Dijon] (BGS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), Biogéosciences [Dijon] ( BGS ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
Subjects: Health, Toxicology and Mutagenesis, 010501 environmental sciences, Toxicology, 01 natural sciences, CITRATE, Soil Pollutants, Environmental Restoration and Remediation, Chelating Agents, Cadmium, EDTA, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, Pollution, Soil contamination, 6. Clean water, Zinc, visual_art, visual_art.visual_art_medium, Mineralogy, chemistry.chemical_element, Industrial Waste, Citric Acid, Metal, METAL MOBILITY, Metals, Heavy, HEAVY METALS, Chelation, métal lourd, Edetic Acid, 0105 earth and related environmental sciences, modélisation, Extraction (chemistry), Environmental and Society, Copper, pollution du sol, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, SOILS, chemistry, Lead, Soil water, 040103 agronomy & agriculture, extraction, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environnement et Société, KINETIC EXTRACTION MODELING, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society, Nuclear chemistry
Abstract: Kinetic EDTA and citrate extractions were used to mimic metal mobilization in a soil contaminated by metallurgical fallout. Modeling of metal removal rates vs. time distinguished two metal pools: readily labile (QM1) and less labile (QM2). In citrate extractions, total extractability (QM1 + QM2) of Zn and Cd was proportionally higher than for Pb and Cu. Proportions of Pb and Cu extracted with EDTA were three times higher than when using citrate. We observed similar QM1/QM2 ratios for Zn and Cu regardless of the extractant, suggesting comparable binding energies to soil constituents. However, for Pb and Cd, more heterogeneous binding energies were hypothesized to explain different kinetic extraction behaviors. Proportions of citrate-labile metals were found consistent with their short-term, in-situ mobility assessed in the studied soil, i.e., metal amount released in the soil solution or extracted by cultivated plants. Kinetic EDTA extractions were hypothesized to be more predictive for long-term metal migration with depth.
Published: 2008
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31. Ecodynamics and bioavailability of metal contaminants in a constructed wetland within an agricultural drained catchment

Author: Cédric Chaumont, Julien Tournebize, Lise C. Fechner, Sophie Ayrault, Louise Bordier, Emmanuelle Uher, Aymeric Drouet, Jérémie D. Lebrun, Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Hydrosystèmes continentaux anthropisés : ressources, risques, restauration (UR HYCAR), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géochimie Des Impacts (GEDI), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire d'Economie Forestière (LEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Environmental Engineering, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Drainage basin, Wetland, 010501 environmental sciences, Management, Monitoring, Policy and Law, 01 natural sciences, Panoply, Nutrient, Ecosystem, 0105 earth and related environmental sciences, Nature and Landscape Conservation, 2. Zero hunger, geography, geography.geographical_feature_category, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, Contamination, 6. Clean water, Bioavailability, 13. Climate action, Bioaccumulation, Environmental chemistry, [SDE]Environmental Sciences, 040103 agronomy & agriculture, Constructed wetland, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology
Abstract: International audience; Constructed wetlands are designed to mitigate nutrient and pesticide fluxes from agricultural catchments. Nevertheless, information on their efficiency in removing non-degradable contaminants such as metals is still scarce. This study aimed to explore the metallic signature and fate of metals within the Rampillon wetland (France) receiving water from a drained 355-ha catchment under intensive agriculture. Original monitoring coupling classic, time-integrated and bioaccumulation-based tools was achieved to characterise spatiotemporal dynamics of various metals (As, Cd, Cr, Co, Cu, Mn, Ni, Pb, Sb, Se and Zn). To assess metal inflows and mitigation, samples of dissolved and particulate metals were collected bimonthly at the inlet and outlet of the wetland over 3 months. Simultaneously, time-integrated (sediment traps and passive samplers) and bioaccumulation-based (caged gammarids and biofilms) tools were deployed to monitor temporal changes in metal speciation and bioavailability. To gain insight into the spatial distribution of metals between abiotic and biotic matrices, sediments and indigenous invertebrates with contrasted ecologies were sampled in different cells of the wetland. The results showed time-integrated tools were more suitable than bimonthly samples to quantify metal mitigations because of temporal fluctuations and low contamination levels. Significant mitigations were thus observed in trapped sediments for all metals (ranged 11–23%, except Mn) as well as in the DGT-labile fraction for Cd, Cr, Co, Mn and Ni (ranged 13–51%). Bioaccumulation levels in biofilms also revealed a decrease in metal bioavailability at the outlet. Furthermore, the spatial survey supported the central role of sediments in metal trapping and the beneficial effect of this wetland for local biodiversity in terms of exposure. To conclude, this study provides valuable information on the ecodynamics and bioavailability of metals required for sustainable management of such artificial ecosystems and furthermore, of agricultural areas.
Published: 2019
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32. Does the use of reference organisms in radiological impact assessments provide adequate protection of all the species within an environment?

Author: N. Gunawardena, Elisabeth Leclerc, Justin Smith, Ari T.K. Ikonen, J. C. Mora, Benjamin Zorko, Amanda Anderson, Valeria Amado, Diego M. Telleria, Yuri Bonchuk, Benoit Charrasse, Ville Kangasniemi, Lodovit Liptak, Léa Beaumelle, Emilie Cohenny, Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS), U.S. Department of Energy [Washington] (DOE), Departamento de Fundamentos del Análisis Económico, Universidad de Alicante, CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Jozef Stefan Institute [Ljubljana] (IJS), Ukrainian Radiation Protection Institute, Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Utah, Nuclear Regulatory Authority (Argentina), Agence Nationale pour la Gestion des Déchets Radioactifs (ANDRA), International Atomic Energy Agency [Vienna] (IAEA), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), U.S. Department of Energy (DOE), and CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN)
Subjects: Environmental Engineering, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Fauna, Endangered species, 010501 environmental sciences, Terrestrial animal, [PHYS.NEXP]Physics [physics]/Nuclear Experiment [nucl-ex], Radiation Dosage, 01 natural sciences, Risk Assessment, Species Specificity, Radiation Monitoring, Environmental Chemistry, Air Pollution, Radioactive, Waste Management and Disposal, Organism, Ecosystem, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, biology, Ecology, Impact assessment, Biota, Radiation Exposure, biology.organism_classification, Pollution, 13. Climate action, Models, Animal, Environmental science, Risk assessment, Global biodiversity
Abstract: Non-human biota in radiological risk assessment is typically evaluated using Reference Organisms (ROs) or Reference Animals and Plants (RAPs), for all exposure situations. However, it still remains open whether the use of an increased number of species would improve the ability to demonstrate protectiveness of the environment. In this paper, the representativeness of a broader list of fauna is tested in terms of the geometrical characteristics and habits for radiological risk assessments in the case of routine discharges from a nuclear installation: the Cadarache centre. A list of terrestrial animal species, compiled from ecological inventories carried out around it was evaluated. A first survey around the centre inventoried >400 terrestrial fauna species, which were then filtered to reduce the number to 28 species for which dose assessments were carried out. Despite the differences between geometries for those site-specific species and the ROs (including RAPs), the absorbed dose rates calculated for both were very close (within a factor of two). Regardless of the studied organism, the absorbed dose rates calculated for the discharge scenario were mainly related to internal exposure, particularly for tritium (3H) and carbon 14 (14C), showing that there would be an acceptable dose rates difference between species from the same organism group. Additionally, sensitivity analyses were conducted to determine if the use of generic, predefined ROs was enough to assure an adequate protection of endangered species. It was observed that for every radionuclide the difference between assessments for site-specific species and ROs are unlikely to exceed a factor of 3. Hence, the result of this evaluation indicates that the use of generic ROs for non-human biota radiological risk assessment covers sufficiently other species, including endangered ones.
Published: 2019
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33. Responses of earthworm communities to crop residue management after inoculation of the earthworm Lumbricus terrestris (Linnaeus, 1758)

Author: Jack H. Faber, Ron G.M. de Goede, Mickaël Hedde, Tamás Salánki, Mirjam M. Pulleman, Joana Frazão, Lijbert Brussaard, Soil Biology Group, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Wageningen Environmental Research, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, International Center for Tropical Agriculture, Wageningen University and Research Center (WUR), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: 0106 biological sciences, Crop residue, [SDV]Life Sciences [q-bio], Arable field, Soil Science, Rao's quadratic entropy, 01 natural sciences, Tillage, Trait-based approach, Bodembiologie, 2. Zero hunger, Conventional tillage, Ecology, biology, Earthworm, Species diversity, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, Soil Biology, CBLB Bodembiologie, 15. Life on land, biology.organism_classification, PE&RC, Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous), Community weighted mean, Agronomy, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Dierecologie, Animal Ecology, Epigeal, Arable land, Crop residue availability, Lumbricus terrestris, 010606 plant biology & botany
Abstract: Earthworms are important for soil functioning in arable cropping systems and earthworm species differ in their response to soil tillage and crop residue management. Lumbricus terrestris (Linnaeus, 1758) are rare in intensively tilled arable fields. In two parallel field trials with either non-inversion (NIT) or conventional tillage (CT), we investigated the feasibility of inoculating L. terrestris under different crop residue management (amounts and placement). Simultaneously, we monitored the response of the existing earthworm communities to L. terrestris inoculation and to crop residue treatments in terms of earthworm density, species diversity and composition, ecological groups and functional diversity. L. terrestris densities were not affected by residue management. We were not able to infer effects of the inoculation on the existing earthworm communities since L. terrestris also colonized non-inoculated plots. In NIT and two years after trial establishment, the overall native earthworm density was 1.4 and 1.6 times higher, and the epigeic density 2.5 times higher, in treatments with highest residue application (S 100 ) compared to 25% (S 25 ) or no (S 0 ) crop residues, respectively. Residue management did not affect earthworm species composition, nor the functional trait diversity and composition, except for an increase of the community weighted means of bifide typhlosolis in S 0 compared to S 100 . In CT, however, crop residues did have a strong effect on species composition, ecological groups and functional traits. Without crop residues (S 0 ), epigeic density was respectively 20 and 30% lower than with crop residues placed on the soil surface (S 100 ) or incorporated (I 100 ). Community composition was clearly affected by crop residues. Trait diversity was 2.6 to 3 times larger when crop residues were provided, irrespective of placement. Crop residues in CT also resulted in heavier earthworms and in a shift in the community towards species with a thicker epidermis and cuticle, a feather typhlosolis shape, and a higher average cocoon production rate. We conclude that earthworm communities under conventional tillage respond more strongly to the amount of crop residue than to its placement. Under non-inversion tillage, crop residue amounts affected earthworm communities, but to a smaller degree than under conventional tillage.
Published: 2019
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34. Effect or organic amendments on soil enzymatic activities. Results of the 'Bioindicators' French program

Author: Riah, Wassila, Cheviron, Nathalie, Trap, Jean, Criquet , Steven, Peltre, Clement, Houot, Sabine, Legras, Marc, Vian, Jean-François, Bispo, Antonio, Grand, Cécile, Galsomies, Laurence, Pérès, Guenola, Laval, Karine, Trinsoutrot-Gattin, Isabelle, Mougin, Christian, Unité de recherche en agro-écologie des territoires (AGRI'TERR ), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (I.S.A.R.A.), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnement et Grandes Cultures (EGC), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (ISARA), ProdInra, Archive Ouverte, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Supérieur d'Agriculture Rhône-Alpes, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2018

35. Biochem-Env : une plateforme de biochimie pour la recherche en sciences environnementales et agronomiques

Author: Mougin, Christian, Cheviron, Nathalie, GRONDIN, Virginie, Jaulin, Anne, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris-Saclay, ProdInra, Archive Ouverte, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Programme Investment d’Avenir' infrastructure AnaEE-France, soutenu par l'ANR (ANR-11-INBS-0001).
Subjects: macrofaune, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], enzymes, automatisation, biochimie, sols, biomarqueurs, sédiments
Abstract: il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : SOFTWARE; Biochem-Env est une plateforme scientifique et technique qui permet : 1) le développement d’outils de caractérisation biochimique de sols et de sédiments (biomarqueurs enzymatiques, activité métabolique…) ainsi que de la macrofaune terrestre et benthique (biomarqueurs enzymatiques, réserves énergétiques…), 2) l’analyse de ces indicateurs biochimiques dans ces différentes matrices, et 3) l’expertise, la formation et la veille scientifique et technologique sur ces indicateurs. Biochem-Env développe également un Système d’Information Environnementale centré sur une base de données qui permet : 1) de gérer la traçabilité des échantillons, 2) de stocker et d’analyser les données de caractérisation biologique des matrices analysées.
Published: 2017

36. Increasing soil carbon storage: mechanisms, effects of agricultural practices and proxies. A review

Author: Pierre Barré, Lauric Cécillon, Catherine Roumet, Sébastien Barot, Delphine Derrien, Claire Chenu, Marie-France Dignac, Mickaël Hedde, Isabelle Basile-Doelsch, Naoise Nunan, Tiphaine Chevallier, Bertrand Guenet, Gwenaëlle Lashermes, Grégoire T. Freschet, Pierre-Alain Maron, Katja Klumpp, Patricia Garnier, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris ( IEES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers ( BEF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux ( Bioemco ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AgroParisTech-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecosystèmes montagnards ( UR EMGR ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] ( LSCE ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Unité de Recherche sur l'Ecosystème Prairial, Microbiologie du Sol et de l'Environnement ( MSE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Centre européen de recherche et d'enseignement de géosciences de l'environnement ( CEREGE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Collège de France ( CdF ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de géologie de l'ENS (LGENS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département des Géosciences - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des EcoSystèmes et des Sociétés en Montagne (UR LESSEM), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Modélisation des Surfaces et Interfaces Continentales (MOSAIC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Fractionnement des AgroRessources et Environnement (FARE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Dignac, Marie-France, Laboratoire de géologie de l'ENS (LGE), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES (UMR_7618 / UMR_D_242 / UMR_A_1392 / UM_113) ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fractionnement des AgroRessources et Environnement - UMR-A 614 (FARE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR Condorcet, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Laboratoire de géologie de l'ENS ( LGE ), Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Département des Géosciences - ENS Paris, École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Fractionnement des AgroRessources et Environnement - UMR-A 614 ( FARE ), Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -SFR Condorcet, Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ) -Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ) -Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles ( PSH ), Centre Européen de Recherche et d'Enseignement des Géosciences de l'Environnement, CEREGE, Institut d'Administration des Entreprises de Poitiers ( IAE Poitiers ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] )
Subjects: Environmental Engineering, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], Microorganisms, Organomineral associations, 01 natural sciences, Ecosystem engineer, C dynamics, Environmental protection, Models, Litter, Stabilisation mechanisms, Indicators, Organic matter, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, Abiotic component, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Land use, business.industry, Ecology, Soil organic matter, Mineralisation, Root inputs, 04 agricultural and veterinary sciences, Soil carbon, 15. Life on land, Soil organic C, Stabilisation mechanisms Mineralisation, Agricultural practices, Macrofauna, Porosity, Tillage, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, chemistry, 13. Climate action, Agriculture, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, business, Agronomy and Crop Science
Abstract: [Departement_IRSTEA]Territoires [TR1_IRSTEA]SEDYVIN; The international 4 per 1000 initiative aims at supporting states and non-governmental stakeholders in their efforts towards a better management of soil carbon (C) stocks. These stocks depend on soil C inputs and outputs. They are the result of fine spatial scale interconnected mechanisms, which stabilise/destabilise organic matter-borne C. Since 2016, the CarboSMS consortium federates French researchers working on these mechanisms and their effects on C stocks in a local and global change setting (land use, agricultural practices, climatic and soil conditions, etc.). This article is a synthesis of this consortium’s first seminar. In the first part, we present recent advances in the understanding of soil C stabilisation mechanisms comprising biotic and abiotic processes, which occur concomitantly and interact. Soil organic C stocks are altered by biotic activities of plants (the main source of C through litter and root systems), microorganisms (fungi and bacteria) and ‘ecosystem engineers’ (earthworms, termites, ants). In the meantime, abiotic processes related to the soil-physical structure, porosity and mineral fraction also modify these stocks. In the second part, we show how agricultural practices affect soil C stocks. By acting on both biotic and abiotic mechanisms, land use and management practices (choice of plant species and density, plant residue exports, amendments, fertilisation, tillage, etc.) drive soil spatiotemporal organic inputs and organic matter sensitivity to mineralisation. Interaction between the different mechanisms and their effects on C stocks are revealed by meta-analyses and long-term field studies. The third part addresses upscaling issues. This is a cause for major concern since soil organic C stabilisation mechanisms are most often studied at fine spatial scales (mm–μm) under controlled conditions, while agricultural practices are implemented at the plot scale. We discuss some proxies and models describing specific mechanisms and their action in different soil and climatic contexts and show how they should be taken into account in large scale models, to improve change predictions in soil C stocks. Finally, this literature review highlights some future research prospects geared towards preserving or even increasing C stocks, our focus being put on the mechanisms, the effects of agricultural practices on them and C stock prediction models.
Published: 2017
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37. Survival and DNA Damage in Plant Seeds Exposed for 558 and 682 Days outside the International Space Station

Author: David Tepfer, Sydney Leach, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Etude du Rayonnement et de la Matière en Astrophysique (LERMA), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU), Université Paris sciences et lettres (PSL), Observatoire de Paris, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), University of Aarhus, Centre National d'Etudes Spatiales (CNES), European Space Agency (ESA), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Sorbonne Universités, PSL Research University (PSL), Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), and École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)
Subjects: 0106 biological sciences, Time Factors, DNA damage, Nicotiana tabacum, [SDV]Life Sciences [q-bio], Mutant, Arabidopsis, Germination, Space, 01 natural sciences, International Space Station, 0103 physical sciences, Botany, Tobacco, Arabidopsis thaliana, 010303 astronomy & astrophysics, Research Articles, 2. Zero hunger, Flavonoids, biology, DNA degradation, fungi, DNA, Chloroplast, food and beverages, Space Flight, UV light, biology.organism_classification, Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous), Chloroplast, Chloroplast DNA, Space and Planetary Science, Sinapate, Seeds, Spectrophotometry, Ultraviolet, DNA Damage, 010606 plant biology & botany
Abstract: For life to survive outside the biosphere, it must be protected from UV light and other radiation by exterior shielding or through sufficient inherent resistance to survive without protection. We tested the plausibility of inherent resistance in plant seeds, reporting in a previous paper that Arabidopsis thaliana and tobacco (Nicotiana tabacum) seeds exposed for 558 days outside the International Space Station (ISS) germinated and developed into fertile plants after return to Earth. We have now measured structural genetic damage in tobacco seeds from this EXPOSE-E experiment by quantitatively amplifying a segment of an antibiotic resistance gene, nptII, inserted into the chloroplast genome. We also assessed the survival of the antibiotic resistance encoded by nptII, using marker rescue in a soil bacterium. Chloroplast DNA damage occurred, but morphological mutants were not detected among the survivors. In a second, longer mission (EXPOSE-R), a nearly lethal exposure was received by Arabidopsis seeds. Comparison between a ground simulation, lacking UV
Published: 2017
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38. Speciation of Cr, Cu, Ni and Zn in soils irrigated with contaminated waters: A case study of agricultural soils from the plain of Saiss (Fez, Morocco)

Author: Meriem Bellarbi, Mustapha Ijjaali, Joëlle Duplay, Naoual Rais, Françoise Elsass, Laboratoire de Chimie de la Matière Condensée, Université Sidi Mohamed Ben Abdellah (USMBA), Laboratoire de Géosciences et Environnement, Faculté des sciences (Fès), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and 1. Laboratoire de Chimie de la Matière Condensée
Subjects: Speciation, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, media_common.quotation_subject, Soil Science, chemistry.chemical_compound, Agricultural soils, Oued Fez, Environmental Chemistry, Ecosystem, Sequential extractions of Tessier, Quartz, Earth-Surface Processes, Water Science and Technology, media_common, Global and Planetary Change, business.industry, Environmental engineering, Geology, Oued Sebou, Contamination, Pollution, Heavy metals, chemistry, Agriculture, Soil water, Carbonate, Clay minerals, business
Abstract: The excessive input of heavy metals into agricultural soils has become one of the most important concerns in the third world cities all over the world. The contamination of agricultural soils can affect the health of people living in agricultural areas and the surrounding ecosystems. The current study was conducted to assess the quality of urban and suburban soils of the City of Fez (Morocco), which are irrigated by waters enriched by heavy metals. The main objective was to define the distribution and the mobility of heavy metals in different soil compartments using the method of sequential extractions. The samples were also investigated for mineralogy using X-ray diffraction. The identified minerals were mainly composed of quartz, carbonate and clay minerals. Smectite and mixed-layer (chlorite-vermiculite and mica-smectite) are by far the most abundant clay minerals in all soils. The study of the availability and distribution of heavy metals (Cr, Cu, Ni, Pb and Zn) in urban soils, allowed us to observe a total content of Cr in the Oued Fez soils which is lower than the contents in the Oued Sebou soils. The Cu and Zn contents are low in Oued Sebou. Despite the Oued Fez input; the contents of these elements in the confluence do not increase. Sequential extractions completed the study of the potential mobility of heavy metals in different fractions of the soil. Indeed, this has allowed us to show that Cr, Cu, Ni and Pb are mostly related to the residual fraction; they are therefore theoretically little mobile; while Zn is practically related to the metals oxides fraction and exchangeable phase, respectively, in soils (FEZ1, FEZ2, SEBup) and (SEBdown, SEBconf), therefore the Zn is potentially mobile.
Published: 2014
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39. Responses of soil macroinvertebrate communities to Miscanthus cropping in different trace metal contaminated soils

Author: Mickaël Hedde, Fabien Abonnel, Folkert van Oort, Isabelle Lamy, Estelle Boudon, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Biomass plantation, Environmental remediation, Soil biodiversity, 010501 environmental sciences, complex mixtures, 01 natural sciences, Carabid beetles, Earthworms, Trace metal, Waste Management and Disposal, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, Biomass (ecology), biology, Renewable Energy, Sustainability and the Environment, Ecology, Detritivore, Forestry, 04 agricultural and veterinary sciences, Miscanthus, 15. Life on land, Contaminated soils, biology.organism_classification, 6. Clean water, Phytoremediation, Agronomy, Soil water, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Agronomy and Crop Science, Functional traits
Abstract: Avec les remerciements à Christelle Marrauld; Nowadays, the influence of biomass plantations in polluted soils as a remediation strategy has mainly been considered in the view of phytoextraction, but little of soil biodiversity. Our objective was to assess the impact of Miscanthus × giganteus plantations on soil macroinvertebrates in trace metal contaminated soils. We hypothesized (1) that miscanthus plantations host more numerous and diverse communities than comparable annual crop soils and (2) that functional traits permit to decrypt the biological strategies underlying invertebrate community response. We selected fields on sandy and loamy-clay soils contaminated either by urban wastewater or atmospheric deposition, respectively. Our results showed that in comparison to annual cropping systems, miscanthus plantation enhanced higher densities and diversity of soil invertebrates but not of ground-dwelling invertebrates. Miscanthus cropping led to an increase in the proportion of resident, detritivores and rhizophages species, and a trend was revealed for larger invertebrates. Thus, the use of a trait-based approach provided fine opportunities to elucidate invertebrate responses to land use changes in contaminated areas.
Published: 2013
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40. Modeling Copper and Cadmium Mobility in an Albeluvisol Amended with Urban Waste Composts

Author: Yves Coquet, Vilim Filipović, Pierre Benoit, Anne Jaulin, Sabine Houot, Vincent Mercier, Guillaume Bodineau, Valérie Pot, Lana Filipović, Philippe Cambier, Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - UMR7327 (ISTO), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Department of Soil Amelioration, Faculty of Agriculture, University of Zagreb, Milieux Poreux - UMR7327, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Unité Expérimentale d'Amélioration des Arbres Forestiers (UEARF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Unité de Recherches Intégrées - Gotheron (GOTH RI UERI), INRA AgreenSkills support scheme, and the PHC COGITO 2015 bilateral research agreement (Contract 33049VJ) between France andCroatia., European Project: 226536,EC:FP7:ENV,FP7-ENV-2008-1,GENESIS(2009), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Soil Amelioration [Zagreb], Faculty of Agriculture [Zagreb] (UNIZG), University of Zagreb-University of Zagreb, Biogéosystèmes Continentaux - UMR7327, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), and Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI)
Subjects: Amendment, Soil Science, Soil science, 010501 environmental sciences, engineering.material, 01 natural sciences, Pedotransfer function, 11. Sustainability, Organic matter, Leaching (agriculture), Urban waste compost, Cd, Cu, sorption, HYDRUS 2D, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, 0105 earth and related environmental sciences, chemistry.chemical_classification, Chemistry, Compost, Soil organic matter, Sorption, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, 6. Clean water, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Lysimeter, 040103 agronomy & agriculture, engineering, 0401 agriculture, forestry, and fisheries
Abstract: International audience; Two experimental plots amended with a co-compost of sewage sludge and green wastes (SGW) or with a municipal solid waste compost (MSW) were compared with a control plot without organic amendment (CONT) in terms of trace metals mobility. These plots were equipped with wick lysimeters, time-domain reflectometry probes and tensiometers for 6 yr (2004–2010). Different soil structures due to tillage and compost incorporation were identified in the tilled layers and reproduced in HYDRUS-2D for simulating water, Cu, and Cd transport. Two sorption estimation approaches were used, either assuming equilibrium between CaCl2 and ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) extractable metals (Kd-1) or using equations based on pedotransfer functions assuming nonlinear sorption for Cu (Kf) and linear sorption for Cd (Kd-2). Lysimeter data on Cu leaching were successfully reproduced with the Kd-1 approach for the SGW and CONT plots (model efficiency coefficient ESGW = 0.97, ECONT = 0.95), while the MSW plot showed better fitting with the Kf approach (EMSW = 0.77), which could be explained by the less stable organic matter of the MSW compost because it takes into account organic matter components (dissolved organic C and soil organic matter). The Cd leaching was reproduced with the Kd-2 approach for the two amended plots (ESGW = 0.12, EMSW = 0.80), while CONT simulation overestimated leaching. The percentage of measured Cu and Cd leached in reference to input mass was 0.6 and 2.7%, respectively, in the SGW plot compared with 5% for both metals in the MSW plot. Trace metal mobility appeared to be limited in the tilled layer by sorption to organic matter.
Published: 2016
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41. Influence of organic matters on AsIII oxidation by the microflora of polluted soils

Author: Hugues Thouin, T. Ben Ali Saanda, Pascale Bauda, C. Charles, Tiffanie Lescure, N. Pillas, Fabienne Battaglia-Brunet, J. Moreau, I. Lamy, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - UMR7327 (ISTO), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux (LIEC), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), French Environment and Energy Management Agency (ADEME), BRGM (convention TEZ 11-16), ANR-10-LABX-100-01/10-LABX-0100,VOLTAIRE,Geofluids and Volatil elements – Earth, Atmosphere, Interfaces – Resources and Environment(2010), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-10-LABX-0100,VOLTAIRE,Geofluids and Volatil elements – Earth, Atmosphere, Interfaces – Resources and Environment(2010)
Subjects: 0301 basic medicine, Polluted soils, Environmental Engineering, Microorganisms, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Arsenic, Soil, 03 medical and health sciences, Geochemistry and Petrology, Soil Pollutants, Environmental Chemistry, Organic matter, Organic Chemicals, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, Soil Microbiology, 0105 earth and related environmental sciences, General Environmental Science, Water Science and Technology, Total organic carbon, chemistry.chemical_classification, Chemistry, Microbiota, Soil organic matter, Substrate (chemistry), Soil classification, General Medicine, 15. Life on land, Soil contamination, Culture Media, 030104 developmental biology, 13. Climate action, AsIII oxidation, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Environmental chemistry, Soil water, France, Oxidation-Reduction, Soil microbiology
Abstract: International audience; The global AsIII-oxidizing activity of microorganisms in eight surface soils from polluted sites was quantified with and without addition of organic substrates. The organic substances provided differed by their nature: either yeast extract, commonly used in microbiological culture media, or a synthetic mixture of defined organic matters (SMOM) presenting some common features with natural soil organic matter. Correlations were sought between soil characteristics and both the AsIII-oxidizing rate constants and their evolution in accordance with inputs of organic substrates. In the absence of added substrate, the global AsIII oxidation rate constant correlated positively with the concentration of intrinsic organic matter in the soil, suggesting that AsIII-oxidizing activity was limited by organic substrate availability in nutrient-poor soils. This limitation was, however, removed by 0.08 g/L of added organic carbon. In most conditions, the AsIII oxidation rate constant decreased as organic carbon input increased from 0.08 to 0.4 g/L. Incubations of polluted soils in aerobic conditions, amended or not with SMOM, resulted in short-term As mobilization in the presence of SMOM and active microorganisms. In contrast, microbial AsIII oxidation seemed to stabilize As when no organic substrate was added. Results suggest that microbial speciation of arsenic driven by nature and concentration of organic matter exerts a major influence on the fate of this toxic element in surface soils.
Published: 2016
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42. Fate of airborne metal pollution in soils as related to agricultural management: 2. Assessing the role of biological activity in micro-scale Zn and Pb distributions in A, B and C horizons

Author: Isabelle Lamy, Alain Bermond, C. Fernandez, Philippe Cambier, F. van Oort, Jérôme Labanowski, Toine Jongmans, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR), and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: sol, métal, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, ZINC, activité biologique, Land Dynamics, heavy-metals, activité microbienne, media_common, VERS DE TERRE, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, AGRICULTURAL LAND MANAGEMENT, ATMOSPHERIC DEPOSITION, LEAD, BIOLOGICAL ACTIVITY, SIZE FRACTIONS, METAL DISTRIBUTION, biology, casts, 04 agricultural and veterinary sciences, PE&RC, Tillage, Deposition (aerosol physics), tillage, Soil horizon, earthworm activity, Pollution, media_common.quotation_subject, pollution atmosphérique, Soil Science, chemistry.chemical_element, Soil science, Zinc, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, Leerstoelgroep Landdynamiek, plomb, Organic matter, fractionation, organic-matter, 0105 earth and related environmental sciences, polluant, Earthworm, turnover, clay, 15. Life on land, biology.organism_classification, pollution du sol, chemistry, 13. Climate action, Soil water, extraction, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, bioavailability, qualité du sol
Abstract: This work assesses relationships between characteristic aggregate microstructures related to biological activity in soils under different long-term land use and the distribution and extractability of metal pollutants. We selected two neighbouring soils contaminated with comparable metal loads by past atmospheric deposition. Currently, these soils contain similar stocks, but different distributions of zinc (Zn) and lead (Pb) concentrations with depth. One century of continuous land use as permanent pasture (PP) and conventional arable (CA) land, has led to the development of two soils with different macro- and micro-morphological characteristics. We studied distributions of organic matter, characteristic micro-structures and earthworm-worked soil by optical microscopy in thin sections from A, B and C horizons. Concentrations and amounts of total and EDTA-extractable Zn and Pb were determined on bulk samples from soil horizons and on size-fractions obtained by physical fractionation in water. Large amounts of Zn and Pb were found in 2–20-µm fractions, ascribed to stable organo-mineral micro-aggregates influenced by root and microbial activity, present in both soils. Unimodal distribution patterns of Zn, Pb and organic C in size-fractions were found in horizons of the CA soil. In contrast, bimodal patterns were observed in the PP soil, because large amounts of Zn and Pb were also demonstrated in stable larger micro-aggregates (50–100-µm fractions). Such differing distribution patterns characterized all those horizons markedly influenced by earthworm activity. Larger earthworm activity coincided with larger metal EDTA-extractability, particularly of Pb. Hence, land use-related biological activity leads to specific soil microstructures affecting metal distribution and extractability, both in surface and subsurface horizons.
Published: 2010
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43. The significance of bolting and floral transitions as indicators of reproductive phase change in Arabidopsis

Author: Sylvie Pouteau, Catherine Albertini, Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC)
Subjects: 0106 biological sciences, FLOWERING TIME, Physiology, Photoperiod, Mutant, Arabidopsis, Flor, Flowers, Plant Science, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, Gene Expression Regulation, Plant, Botany, Arabidopsis thaliana, 030304 developmental biology, photoperiodism, 0303 health sciences, Bolting, biology, Reproduction, digestive, oral, and skin physiology, fungi, Wild type, food and beverages, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, DAYLENGTH, biology.organism_classification, CRITICAL PHOTOPERIOD, PHASE CHANGE, BOLTING, Photomorphogenesis, CEILING PHOTOPERIOD, EARLY FLOWERING MUTANTS, 010606 plant biology & botany
Abstract: Reproductive phase change in Arabidopsis thaliana is characterized by the floral transition (initiation of the first flower) and the bolting transition (elongation of the first internode). Here, the relationship between these transitions is examined by comparing variation in cauline and total leaf numbers in wild-type plants and 49 early-flowering mutants under a wide range of photoperiods. The timing of these transitions was also evaluated by subjecting wild-type plants to photoperiodic perturbations at different developmental stages. Coupling between the bolting and floral transitions was altered in the wild type under non-optimal flowering conditions but could be restored by optimal conditions that activate the progression to flowering, including continuous light treatments and early flowering mutations. Under non-optimal photoperiodic conditions, the floral node was specified a few days before the bolting node. Altered definitions of long days for the cauline and total leaf responses were frequently coupled in early flowering mutants and were associated with similar photomorphogenetic defects. By contrast, altered definitions of short days were often opposite for the two leaf responses and were associated with different photomorphogenetic and circadian phenotypes. It is concluded that the bolting and floral transitions are regulated by different signalling pathways under non-optimal conditions and that phase change is a multidimensional process. This paper also proposes that, in contrast to the floral transition which is contingent on different factors, the bolting transition may be a robust indicator of reproductive phase change, especially when the progression to flowering is not optimal.
Published: 2009
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44. The impact of management strategies in apple orchards on the structural and functional diversity of epigeal spiders

Author: Gaël Caro, Jodie Thenard, Christophe Mazzia, Jean-François Cornic, Alain Pasquet, Yvan Capowiez, Mickaël Hedde, Abeilles et Environnement (AE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Unité de Recherches Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux (URAFPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372 (CEBC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-La Rochelle Université (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC)
Subjects: 0106 biological sciences, Integrated pest management, Health, Toxicology and Mutagenesis, Management, Monitoring, Policy and Law, Biology, Toxicology, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Pesticides, Organic, Bioindicator species, Ecological traits, Dispersion, Abundance (ecology), Animals, Overwintering, 2. Zero hunger, Spider, Organic Agriculture, Ecology, Agriculture, Spiders, General Medicine, Biodiversity, biology.organism_classification, 010602 entomology, Linyphiidae, Malus, Species evenness, Biological dispersal, France, Seasons, Epigeal, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; Apple orchards are agro-ecosystems managed with high levels of inputs and especially pesticides. Epigeal spider communities were sampled in three seasons using pitfall traps in 19 apple orchards with four different management strategies (abandoned, under organic, Integrated Pest Management or conventional protection) and thus significantly different pesticide usage. The abundance and diversity of the spider communities was the highest in abandoned orchards. Higher diversity and evenness values were the only difference in spider communities from the organic orchards compared to the other commercial orchards. The analysis of five ecological traits (proportion of aeronauts, type of diet, overwintering stages, body size and maternal care), however, clearly showed differences in the spiders from the organic orchards. The spider species in the other commercial orchards were smaller and have higher dispersal abilities. Seven bioindicator species were identified in abandoned orchards, two species in organic ones (only Lycosidae) and one species in conventional orchards (Linyphiidae).
Published: 2015
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45. Improving relationship between soil characteristics and metal bioavailability by using reactive fractions of soil parameters in calcareous soils

Author: de Santiago Martin, Ana, Van Oort, Folkert, González, Concepción, Quintana, José R., Lafuente, Antonio L., Lamy, Isabelle, Department of Pedology, Faculty of Pharmacy, Universidad Complutense de Madrid [Madrid] (UCM), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Complutense University of Madrid, Madrid Autonomous Region [GR58/08], Research Team 950605, Characterization, Modeling, and Risk Assessment of Contaminated Soils (CARESOIL) Network [P2009/AMB-1648], and Universidad Complutense de Madrid = Complutense University of Madrid [Madrid] (UCM)
Subjects: Mediterranean calcareous soils, Bioavailability, Soil contamination, Metals, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Soil reactive phases
Abstract: The contribution of the nature instead of the total content of soil parameters relevant for metal bioavailability in lettuce was tested using a series of low-polluted Mediterranean agricultural calcareous soils offering natural gradients in the content and composition of carbonate, organic and oxide fractions. We compared two datasets by canonical ordination based on redundancy analysis: total concentrations (TC-dataset) of main soil parameters (constituents, phases or elements) involved in metal retention and bioavailability; and chemically-defined reactive fractions of these parameters (RF-dataset). The metal bioavailability patterns were only satisfactorily explained when using the RF-dataset and results showed that the proportion of crystalline Fe oxides, dissolved organic C, diethylene-triamine-pentaacetic-acid (DTPA)-extractable Cu and Zn, and a labile organic pool accounted for 76% of the variance. Additionally, two multipollution scenarios by metal spiking were tested showing better relationships with the RF-dataset than with the TC one (up to 17% more) and new reactive fractions involved. For Mediterranean calcareous soils, we concluded that the use of reactive pools of soil parameters rather than their total contents, improved the relationships between soil constituents and metal bioavailability. Such pool determinations should be systematically included in studies dealing with bioavailability or risk assessment.
Published: 2015
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46. Earthworms in a 15 years agricultural trial

Author: Jodie Thenard, Christian Mougin, Céline Pelosi, Michel Bertrand, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
Subjects: no-till, Soil biodiversity, Population, Soil Science, population, living mulch, No-till farming, Living mulch, organic farming, Cropping system, education, pesticide, 2. Zero hunger, education.field_of_study, long-term, Ecology, biology, Earthworm, conventional system, 15. Life on land, biology.organism_classification, Lumbricus-terrestris, Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous), organic cropping system, soil quality indicator, transformation product, conservation agriculture, Agronomy, Organic farming, impact, France, pesticide use, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Lumbricus terrestris, management
Abstract: Avec les remerciements pour Nathalie Cheviron et Virginie Grondin; Alternative cropping systems have been proposed to enhance sustainability of agriculture, but their mid and long-term effects on soil biodiversity should be studied more carefully. Earthworms, having important agro-ecological functions, are regarded as indicators of soil biological health. Species composition, abundance, and biomasses of earthworms were measured in autumn 2005–2007 (period 1) and 2011–2013 (period 2) in a trial initiated in 1997 near Paris, France. A conventional, an organic and a direct seeded living mulch-based cropping systems were compared. Earthworms were sampled in a wheat crop by combining the application of a chemical expellant and hand-sorting.In period 1, earthworm abundance did not usually differ in the three cropping systems, but sometimes it was higher in the conventional system. Mean total abundance was 122, 121 and 149 individuals m−2 in period 1 and 408, 386 and 216 in period 2 in the organic, living mulch and conventional systems respectively. While earthworm abundance and biomass increased slightly in the conventional system between the two periods, they at least tripled in the other two systems. This was mainly due to the species Aporrectodea caliginosa and Aporrectodealonga in the living mulch cropping system, and to A. caliginosa,Lumbricus castaneus, Lumbricus terrestris and A. longa in the organic system.After at least 14 years, organic and living mulch cropping systems contained between 1.5 and 2.3 times more earthworms than the conventional system. Considering the inter-annual variations in earthworm communities due to climatic conditions and cultural practices, earthworm communities should be assessed over several years before conclusions can be drawn. Moreover, since changes in cultural practices may take a long time to affect earthworm communities, mid and long-term trials are needed to assess the effects of cropping systems on soil biodiversity.
Published: 2015
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47. Fourteen years of evidence for positive effects of conservation agriculture and organic farming on soil life

Author: Céline Pelosi, Mickaël Hedde, Claire Chenu, Michel Bertrand, Cécile Villenave, Ludovic Henneron, Eric Blanchart, Cyril Girardin, Laetitia Bernard, Blanchart, Eric, Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Elisol Environnement, Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agronomie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Environnement et Grandes Cultures (EGC), ANR Systerra-PEPITES, ANR-08-STRA-0010,PEPITES,Processus Ecologiques et Processus d'Innovation TEchnique et Sociale en Agriculture de Conservation(2008), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Environmental Engineering, biodiversité du sol, Soil biodiversity, Soil biology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Ecological farming, Biology, Soil quality, nématofaune, microorganisme du sol, Soil management, No-till farming, agriculture biologique, Soil food web, Land management, Agricultural sustainability, Soil ecology, Functional groups, Soil functionning, Agroecosystems, Agroecology, 2. Zero hunger, Soil functioning, communauté microbienne, Agroforestry, Soil organic matter, agriculture conventionnelle, 15. Life on land, Agroécologie, Agronomy, 13. Climate action, agriculture de conservation, Agronomy and Crop Science
Abstract: Avec les remerciements pour Jodie Thénard; Conventional agriculture strongly alters soil quality due to industrial practices that often have negative effects on soil life. Alternative systems such as conservation agriculture and organic farming could restore better conditions for soil organisms. Improving soil life should in turn improve soil quality and farming sustainability. Here, we have compared for the first time the long-term effects of conservation agriculture, organic farming, and conventional agriculture on major soil organisms such as microbes, nematofauna, and macrofauna. We have also analyzed functional groups. Soils were sampled at the 14-year-old experimental site of La Cage, near Versailles, France. The microbial community was analyzed using molecular biology techniques. Nematofauna and macrofauna were analyzed and classified into functional groups. Our results show that both conservation and organic systems increased the abundance and biomass of all soil organisms, except predaceous nematodes. For example, macrofauna increased from 100 to 2,500 %, nematodes from 100 to 700 %, and microorganisms from 30 to 70 %. Conservation agriculture showed a higher overall improvement than organic farming. Conservation agriculture increased the number of many organisms such as bacteria, fungi, anecic earthworms, and phytophagous and rhizophagous arthropods. Organic farming improved mainly the bacterial pathway of the soil food web and endogeic and anecic earthworms. Overall, our study shows that long-term, no-tillage, and cover crops are better for soil biota than periodic legume green manures, pesticides, and mineral fertilizers.
Published: 2015
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48. Interactions between head blight pathogens: consequences for disease development and toxin production in wheat spikes

Author: Sonia Elbelt, Marjolaine Bourdat-Deschamps, Frédéric Suffert, Cédric Repinçay, Sandrine Gélisse, Valérie Laval, Christian Lannou, Dorothée Siou, BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Bayer CropScience, ANR DON Co project, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Fusarium, Microdochium, [SDV]Life Sciences [q-bio], Real-Time Polymerase Chain Reaction, medicine.disease_cause, Applied Microbiology and Biotechnology, Microbiology, COLONIZATION, BIOMASS, chemistry.chemical_compound, Plant Microbiology, FUSARIUM-GRAMINEARUM, Tandem Mass Spectrometry, Botany, INFECTION, medicine, Colonization, MONILIFORME, Xylariales, DNA, Fungal, Mycotoxin, Ecosystem, Triticum, Plant Diseases, CEREALS, 2. Zero hunger, Ecology, biology, Inoculation, Toxin, Fungal genetics, food and beverages, IN-VITRO, Mycotoxins, biology.organism_classification, AGGRESSIVENESS, MYCOTOXIN PRODUCTION, chemistry, Microbial Interactions, FUNGAL COMPETITION, Chromatography, Liquid, Food Science, Biotechnology
Abstract: Head blight (HB) is one of the most damaging diseases on wheat, inducing significant yield losses and toxin accumulation in grains. Fungal pathogens responsible for HB include the genus Microdochium , with two species, and the toxin producer genus Fusarium , with several species. Field studies and surveys show that two or more species can coexist within a same field and coinfect the same plant or the same spike. In the current study, we investigated how the concomitant presence of F. graminearum and another of the HB complex species influences the spike colonization and the toxin production by the fungi. To study these interactions, 17 well-characterized isolates representing five species were inoculated alone or in pairs on wheat spikes in greenhouse and field experiments. The fungal DNA in the grains was estimated by quantitative PCR and toxin contents (deoxynivalenol and nivalenol) by ultraperformance liquid chromatography-UV detection-tandem mass spectrometry. The responses of the different isolates to the presence of a competitor were variable and isolate specific more than species specific. The development of the most aggressive isolates was either unchanged or a slightly increased, while the development of the less aggressive isolates was reduced. The main outcome of the study was that no trend of increased toxin production was observed in coinoculations compared to single inoculations. On the contrary, the amount of toxin produced was often lower than expected in coinoculations. We thus conclude against the hypothesis that the co-occurrence of several HB-causing species in the same field might aggravate the risk linked to fusarium toxins in wheat production.
Published: 2015
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49. Du transfert des pesticides à l’écotoxicologie : quelles approches dans les compartiments aquatiques et terrestres?

Author: Mougin, Christian, Garric, Jeanne, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Du transfert des pesticides à l’écotoxicologie : quelles approches dans les compartiments aquatiques et terrestres?. Séminaire INRA-Allenvi Pesticides, écotoxicologie et exposition environnementale
Published: 2014

50. Des pratiques agricoles aux transferts de pesticides dans l’environnement : observations, modèles, utilisation dans l’évaluation des risques

Author: Mamy, Laure, Voltz, Marc, Bedos, Carole, Benoit, Pierre, Barriuso, Enrique, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Laboratoire d'étude des Interactions Sol - Agrosystème - Hydrosystème (UMR LISAH), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2014

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