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4 results on '"Phamela Bernardes Perônico"'

1. ZooTraits: An R shiny app for exploring animal trait data for ecological and evolutionary research

Author

Thiago Gonçalves‐Souza, Beatriz Milz, Nathan J. Sanders, Peter B. Reich, Brian Maitner, Leonardo S. Chaves, Gabriel X. Boldorini, Natália Ferreira, Reginaldo A. F. Gusmão, Phamela Bernardes Perônico, Fabrício B. Teresa, and María Natalia Umaña

Subjects
animal trait database, Open Science, Raunkiæran shortfall, trait‐based ecology, Ecology, QH540-549.5
Abstract

Abstract Animal trait data are scattered across several datasets, making it challenging to compile and compare trait information across different groups. For plants, the TRY database has been an unwavering success for those ecologists interested in addressing how plant traits influence a wide variety of processes and patterns, but the same is not true for most animal taxonomic groups. Here, we introduce ZooTraits, a Shiny app designed to help users explore and obtain animal trait data for research in ecology and evolution. ZooTraits was developed to tackle the challenge of finding in a single site information of multiple trait datasets and facilitating access to traits by providing an easy‐to‐use, open‐source platform. This app combines datasets centralized in the Open Trait Network, raw data from the AnimalTraits database, and trait information for animals compiled by Gonçalves‐Souza et al. (2023, Ecology and Evolution 13, e10016). Importantly, the ZooTraits app can be accessed freely and provides a user‐friendly interface through three functionalities that will allow users to easily visualize, compare, download, and upload trait data across the animal tree of life—ExploreTrait, FeedTrait, and GetTrait. By using ExploreTrait and GetTrait, users can explore, compare, and extract 3954 trait records from 23,394 species centralized in the Open Traits Network, and trait data for ~2000 species from the AnimalTraits database. The app summarizes trait information for numerous taxonomic groups within the Animal Kingdom, encompassing data from diverse aquatic and terrestrial ecosystems and various geographic regions worldwide. Moreover, ZooTraits enables researchers to upload trait information, serving as a hub for a continually expanding global trait database. By promoting the centralization of trait datasets and offering a platform for data sharing, ZooTraits is facilitating advancements in trait‐based ecological and evolutionary studies. We hope that other trait databases will evolve to mirror the approach we have outlined here.

Published
2024
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3. Neotropical freshwater fisheries : A dataset of occurrence and abundance of freshwater fishes in the Neotropics

Author

Lívia Helena Tonella, Renata Ruaro, Vanessa Salete Daga, Diego Azevedo Zoccal Garcia, Oscar Barroso Vitorino, Tatiana Lobato‐de Magalhães, Roberto Esser dos Reis, Fabio Di Dario, Ana Cristina Petry, Michael Maia Mincarone, Luciano Fogaça de Assis Montag, Paulo Santos Pompeu, Adonias Aphoena Martins Teixeira, Alberto Luciano Carmassi, Alberto J. Sánchez, Alejandro Giraldo Pérez, Alessandra Bono, Aléssio Datovo, Alexander S. Flecker, Alexandra Sanches, Alexandre Lima Godinho, Alexandre Matthiensen, Alexandre Peressin, Alexandre Wagner Silva Hilsdorf, Alexéia Barufatti, Alice Hirschmann, Aline Jung, Allan K. Cruz‐Ramírez, Alline Braga Silva, Almir Manoel Cunico, Amanda Saldanha Barbosa, Amauri de Castro Barradas, Ana Carolina Lacerda Rêgo, Ana Clara Sampaio Franco, Ana Paula Lula Costa, Ana Paula Vidotto‐Magnoni, Anderson Ferreira, Anderson Kassner Filho, André Batista Nobile, André Lincoln Barroso Magalhães, André Teixeira da Silva, Andréa Bialetzki, Andréa Cristina dos Santos Maroclo Gomes, Andrezza Bellotto Nobre, Armando Cesar Rodrigues Casimiro, Arturo Angulo Sibaja, Arthur Alexandre Capelli dos Santos, Átila Rodrigues de Araújo, Augusto Frota, Bárbara Angélio Quirino, Beatriz Moreira Ferreira, Bianca Weiss Albuquerque, Bruna Arbo Meneses, Brunno Tolentino Oliveira, Bruno Augusto Torres Parahyba Campos, Bruno Bastos Gonçalves, Bruno Busnello Kubiak, Bruno da Silveira Prudente, Bruno Gorini de Araujo Passos Pacheco, Bruno Kazuo Nakagawa, Bruno Tayar Marinho do Nascimento, Calebe Maia, Camila Cantagallo Devids, Carla Ferreira Rezende, Carla Muñoz‐Mendoza, Carlos A. Peres, Carlos Alberto de Sousa Rodrigues Filho, Carlos Alberto Santos de Lucena, Carlos Alexandre Fernandes, Carlos Benhur Kasper, Carlos Donascimiento, Carmino Emidio, Carolina Carrillo‐Moreno, Carolina Machado, Carolina Pera, Caroline Hartmann, Catherine M. Pringle, Cecília Gontijo Leal, Céline Jézéquel, Chris Harrod, Clarissa Alves da Rosa, Claudio Quezada‐Romegialli, Crisla Maciel Pott, Crislei Larentis, Cristiane A. S. Nascimento, Cristina da Silva Gonçalves, Cristina Jaques da Cunha, Cristina Moreira Pisicchio, Daniel Cardoso de Carvalho, Daniel Galiano, Daniel Gomez‐Uchida, Daniel Oliveira Santana, Daniel Salas Johnson, Danielle Katharine Petsch, Danielly Torres Hashiguti de Freitas, Dayani Bailly, Débora Ferreira Machado, Débora Reis de Carvalho, Dhyego Hamilton Topan, Diego Cañas‐Rojas, Diego da Silva, Diogo Freitas‐Souza, Dilermando Pereira Lima‐Júnior, Diovani Piscor, Djalma Pereira Moraes, Douglas Viana, Dyego Leonardo Ferraz Caetano, Éder André Gubiani, Edson K. Okada, Eduardo Cazuni do Amaral, Eduardo Meneguzzi Brambilla, Eduardo Ribeiro Cunha, Elaine Antoniassi Luiz Kashiwaqui, Elise Amador Rocha, Elisete Ana Barp, Elmary da Costa Fraga, Elvira D'Bastiani, Eugenia Zandonà, Eurizângela Pereira Dary, Evanilde Benedito, Everardo Barba‐Macías, Evelyn Vanessa Calvache Uvidia, Fabiana Luques Fonseca, Fabiane Silva Ferreira, Fábio Lima, Fábio Maffei, Fábio Porto‐Foresti, Fabrício Barreto Teresa, Fabrício de Andrade Frehse, Fagner Júnior M. Oliveira, Felipe Pessoa da Silva, Felipe Pontieri de Lima, Fernanda Dotti do Prado, Fernando Camargo Jerep, Fernando Emmanuel Gonçalves Vieira, Fernando Gertum Becker, Fernando Rogério de Carvalho, Flávio Kulaif Ubaid, Francisco Keilo Teixeira, Francisco Provenzano Rizzi, Francisco Severo‐Neto, Francisco Villamarín, Franco Teixeira de Mello, Friedrich Wolfgang Keppeler, Gabriel de Avila Batista, Gabriel de Menezes Yazbeck, Giancarlo Tesitore, Gilberto Nepomuceno Salvador, Gita Juan Soteroruda Brito, Giulianna Rondineli Carmassi, Gregório Kurchevski, Guillermo Goyenola, Hasley Rodrigo Pereira, Helen Jamille Fernandes Silva Alvez, Helena Alves do Prado, Henrique Ledo Lopes Pinho, Híngara Leão Sousa, Hugo Bornatowski, Hugo de Oliveira Barbosa, Ibon Tobes, Igor de Paiva Affonso, Igor Raposo Queiroz, Irma Vila, Iván Vinicio Jácome Negrete, Ivo Gavião Prado, Jean Ricardo Simões Vitule, Jessé Figueiredo‐Filho, Jessica Antúnez Gonzalez, Jéssica Caroline de Faria Falcão, Jéssica Vieira Teixeira, Jimmy Pincheira‐Ulbrich, Jislaine Cristina da Silva, João Antonio de Araujo Filho, João Fernando Marques da Silva, João Gabriel Genova, João Gabriel Ribeiro Giovanelli, João Vitor Perin Andriola, Jonatas Alves, Jonathan Valdiviezo‐Rivera, Jorge Brito, Jorge Iván Sánchez Botero, Jorge Liotta, Jorge Luis Ramirez, Jorge Reppold Marinho, José Luís Olivan Birindelli, Jose Luis Costa Novaes, Joseph E. Hawes, Josiane Ribolli, Juan Francisco Rivadeneira, Juan Jacobo Schmitter‐Soto, Juliana Camara Assis, Juliana Paulo da Silva, Juliana Silveira dos Santos, Juliana Wingert, Juliana Wojciechowski, Juliano André Bogoni, Juliano Ferrer, Julio César Jut Solórzano, Júlio César Sá‐Oliveira, Jussara Oliveira Vaini, Kamila Contreras Palma, Karine Orlandi Bonato, Karla Dayane de Lima Pereira, Kassiano dos Santos Sousa, Kevin Giancarlo Borja‐Acosta, Laís Carneiro, Larissa Faria, Leonardo Brito de Oliveira, Leonardo Cardoso Resende, Leonardo Ferreira da Silva Ingenito, Leonardo Oliveira Silva, Leydiane Nunes Rodrigues, Lida Guarderas‐Flores, Lidiane Martins, Lorena Tonini, Lorrana Thaís Máximo Durville Braga, Louise Cristina Gomes, Lucas de Fries, Lucas Gonçalves da Silva, Lucas Ribeiro Jarduli, Luciano Benedito Lima, Luciano Gomes Fischer, Luciano Lazzarini Wolff, Luciano Neves dos Santos, Luis Artur Valões Bezerra, Luisa Maria Sarmento Soares, Luisa Resende Manna, Luiz Fernando Duboc, Luiz Guilherme dos Santos Ribas, Luiz Roberto Malabarba, Marcelo Fulgêncio Guedes Brito, Marcelo Rennó Braga, Marcelo Silva de Almeida, Maria Cecília Sily, Maria Claudene Barros, Maria Histelle Sousa do Nascimento, Maria Laura de Souza Delapieve, Maria Teresa Fernandez Piedade, Marina Tagliaferro, Mário Cesar Cardoso de Pinna, Mario H. Yánez‐Muñoz, Mário Luís Orsi, Marlon Ferraz da Rosa, Marlos Bastiani, Marta Severino Stefani, Martha Buenaño‐Carriel, Martha Elena Valdez Moreno, Mateus Moreira de Carvalho, Mateus Tavares Kütter, Matheus Oliveira Freitas, Mauricio Cañas‐Merino, Mauricio Cetra, Mauricio Herrera‐Madrid, Mauricio Mello Petrucio, Mauro Galetti, Miguel Ángel Salcedo, Miguel Pascual, Milton Cezar Ribeiro, Milza Celi Fedatto Abelha, Mônica Andrade da Silva, Mônica Pacheco de Araujo, Murilo Sversut Dias, Naiara Guimaraes Sales, Naraiana Loureiro Benone, Natane Sartor, Nelson Ferreira Fontoura, Nicholas Silvestre de Souza Trigueiro, Nicolás Álvarez‐Pliego, Oscar Akio Shibatta, Pablo A. Tedesco, Pablo Cesar Lehmann Albornoz, Pablo Henrique Fernandes Santos, Pâmela Virgolino Freitas, Patricia Calegari Fagundes, Patrícia Domingues de Freitas, Patricio Mena‐Valenzuela, Paul Tufiño, Paula Araujo Catelani, Paula Peixoto, Paulo Ilha, Pedro De Podestà Uchôa de Aquino, Pedro Gerhard, Pedro Hollanda Carvalho, Pedro Jiménez‐Prado, Pedro Manoel Galetti, Pedro Paulino Borges, Pedro Peixoto Nitschke, Pedro Sartori Manoel, Phamela Bernardes Perônico, Philip Teles Soares, Pitágoras Augusto Piana, Priscila de Oliveira Cunha, Priscila Plesley, Rafael Couto Rosa de Souza, Rafael Rogério Rosa, Rana W. El‐Sabaawi, Raoni Rosa Rodrigues, Raphael Covain, Raquel Coelho Loures, Raul Rennó Braga, Reginaldo Ré, Rémy Bigorne, Renata Cassemiro Biagioni, Renato Azevedo Matias Silvano, Renato Bolson Dala‐Corte, Renato Tavares Martins, Ricardo Rosa, Ricardo Sartorello, Rodrigo de Almeida Nobre, Ronald D. Bassar, Ronaldo César Gurgel‐Lourenço, Ronaldo Fernando Martins Pinheiro, Ronaldo Leal Carneiro, Rosa Florido, Rosana Mazzoni, Rosane Silva‐Santos, Rosiane de Paula Santos, Rosilene Luciana Delariva, Sandra Maria Hartz, Sebastien Brosse, Sérgio Luiz Althoff, Shaka Nóbrega Marinho Furtado, Sidnei Eduardo Lima‐Junior, Silvia Yasmin Lustosa Costa, Solange Arrolho, Sonya K. Auer, Sybelle Bellay, Taís de Fátima Ramos Guimarães, Talitha Mayumi Francisco, Tatiane Mantovano, Tatyana Gomes, Telton Pedro Anselmo Ramos, Thaís de Assis Volpi, Thais Moura Emiliano, Thiago Augusto Pedroso Barbosa, Thiago José Balbi, Thiago Nascimento da Silva Campos, Thiago Teixeira Silva, Thiago Vinícius Trento Occhi, Thiely Oliveira Garcia, Tiago Magalhães da Silva Freitas, Tiago Octavio Begot, Tony Leandro Rezende da Silveira, Ueslei Lopes, Uwe Horst Schulz, Valéria Fagundes, Valéria Flávia Batista da Silva, Valter M. Azevedo‐Santos, Vanessa Ribeiro, Vanessa Graciele Tibúrcio, Vera Lúcia Lescano de Almeida, Victoria J. Isaac‐Nahum, Vinicius Abilhoa, Vinicius Farias Campos, Vinicius Tavares Kütter, Vivian de Mello Cionek, Viviane Prodocimo, Wagner Vicentin, Waldney Pereira Martins, Walna Micaelle de Moraes Pires, Weferson Júnio da Graça, Welber Senteio Smith, Wesley Dáttilo, Windsor Efren Aguirre Maldonado, Yuri Gomes Ponce de Carvalho Rocha, Yzel Rondon Súarez, and Zilda Margarete Seixas de Lucena

Subjects
biodiversity hotspot, ichthyology, Landschapsarchitectuur en Ruimtelijke Planning, Landscape Architecture and Spatial Planning, conservation, species distribution, Neotropical region, occurrence, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, data paper
Abstract

The Neotropical region hosts 4225 freshwater fish species, ranking first among the world's most diverse regions for freshwater fishes. Our NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set is the first to produce a large-scale Neotropical freshwater fish inventory, covering the entire Neotropical region from Mexico and the Caribbean in the north to the southern limits in Argentina, Paraguay, Chile, and Uruguay. We compiled 185,787 distribution records, with unique georeferenced coordinates, for the 4225 species, represented by occurrence and abundance data. The number of species for the most numerous orders are as follows: Characiformes (1289), Siluriformes (1384), Cichliformes (354), Cyprinodontiformes (245), and Gymnotiformes (135). The most recorded species was the characid Astyanax fasciatus (4696 records). We registered 116,802 distribution records for native species, compared to 1802 distribution records for nonnative species. The main aim of the NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set was to make these occurrence and abundance data accessible for international researchers to develop ecological and macroecological studies, from local to regional scales, with focal fish species, families, or orders. We anticipate that the NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set will be valuable for studies on a wide range of ecological processes, such as trophic cascades, fishery pressure, the effects of habitat loss and fragmentation, and the impacts of species invasion and climate change. There are no copyright restrictions on the data, and please cite this data paper when using the data in publications.

Published
2023
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4. Large-scale Degradation of the Tocantins-Araguaia River Basin

Author

Carlos Roberto dos Anjos Candeiro, Marcelo F. G. Brito, Alberto Akama, Dilermando Pereira Lima Junior, Francisco Leonardo Tejerina-Garro, Murilo S. Dias, Idelina Gomes da Silva, Fabrício Barreto Teresa, Luis Mauricio Bini, Mário Luís Orsi, Renato Torres Pinheiro, Mariana Pires de Campos Telles, Lucas Barbosa e Souza, André Lincoln Barroso Magalhães, Pedro Ribeiro Martins, Valter M. Azevedo-Santos, Paulo De Marco, Rosana Mazzoni, João Carlos Nabout, Ludgero Cardoso Galli Vieira, Edson Eyji Sano, Diego Azevedo Zoccal Garcia, Miguel Petrere, Rodrigo Assis de Carvalho, Marcus Vinicius Moreira Barbosa, Hasley Rodrigo Pereira, Vanessa S. Daga, Paloma Helena Fernandes Shimabukuro, Davi Borges das Chagas, Jean Ricardo Simões Vitule, Wagner de Melo Ferreira, Phamela Bernardes Perônico, Rodrigo Ferreira Krüger, Érica Pellegrini Caramaschi, Rafael Loyola, Vagner Leonardo Macedo dos Santos, Jansen Zuanon, Fernando Mayer Pelicice, Solange de Fátima Lolis, José Dilermando Andrade Filho, Angelo Antonio Agostinho, Thiago Nilton Alves Pereira, Adriana Malvasio, Tiago Kütter Krolow, Sidinei Magela Thomaz, Edgardo Manuel Latrubesse, André Andrian Padial, Paulo Santos Pompeu, Guarino R. Colli, Lívia Helena Tonella, Philip M. Fearnside, Priscilla Carvalho, José Alexandre Felizola Diniz Filho, Carine C. Chamon, Fabyano Alvares Cardoso Lopes, Thiago Costa Gonçalves Portelinha, Leandro Castello, Etiene Fabbrin Pires, Universidade Federal do Tocantins (UFT), Universidade Estadual de Maringá (UEM), Museu Paraense Emílio Goeldi, Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Universidade Estadual Paulista (UNESP), Universidade Estadual do Tocantins (Unitins), Universidade Federal de Goiás (UFG), Universidade Federal de Sergipe (UFS), Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Universidade Estadual de Goiás, Virginia Polytechnic Institute and State University, Universidade de Brasília (UnB), Researcher, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Universidade Estadual de Londrina (UEL), Universidade Federal de Pernambuco (UFPE), Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT), Laboratório de Microbiologia Universidade Federal do Tocantins (UFT), Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ), Universidade Federal do Paraná (UFPR), Secretaria de Estado da Educação de Goiás-(Seduc-GO), PPGECOMAR, Universidade Federal de Lavras (UFLA), Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA), Universidade Federal do Pará (UFPA), Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Universidade Evangélica de Goiás, Pontifícia Universidade Católica (PUC), and Laboratório de Genética & Biodiversidade - ICB/UFG

Subjects
Conservation of Natural Resources, Forest management, Drainage basin, Conservation, Structural basin, Ecosystem services, Rivers, Animals, Environmental planning, Ecosystem, Hydropower, Agribusiness, Global and Planetary Change, geography, geography.geographical_feature_category, Ecology, business.industry, Biodiversity, South America, Pollution, Environmental Policy, Policy, Sustainability, Agriculture, business
Abstract

Made available in DSpace on 2022-04-28T19:42:34Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2021-10-01 The Tocantins-Araguaia Basin is one of the largest river systems in South America, located entirely within Brazilian territory. In the last decades, capital-concentrating activities such as agribusiness, mining, and hydropower promoted extensive changes in land cover, hydrology, and environmental conditions. These changes are jeopardizing the basin’s biodiversity and ecosystem services. Threats are escalating as poor environmental policies continue to be formulated, such as environmentally unsustainable hydropower plants, large-scale agriculture for commodity production, and aquaculture with non-native fish. If the current model persists, it will deepen the environmental crisis in the basin, compromising broad conservation goals and social development in the long term. Better policies will require thought and planning to minimize growing threats and ensure the basin’s sustainability for future generations. Núcleo de Estudos Ambientais Universidade Federal do Tocantins (UFT) Programa de Pós Graduação em Ecologia de Ambientes Aquaticos Continentais (PEA) Universidade Estadual de Maringá (UEM) Museu Paraense Emílio Goeldi Grupo de Estudos em Leishmanioses Instituto René Rachou Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” Museu de Zoologia e Taxidermia José Hidasi Universidade Estadual do Tocantins (Unitins) Departamento de Ecologia Universidade Federal de Goiás (UFG) Laboratório de Ictiologia Departamento de Biologia Universidade Federal de Sergipe (UFS) Laboratório de Paleontologia e Evolução Curso de Geologia Universidade Federal de Goiás (UFG) Departamento de Ecologia Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) Universidade Federal de Goiás (UFG) Laboratório de Biogeografia e Ecologia Aquática Universidade Estadual de Goiás Department of Fish and Wildlife Conservation Virginia Polytechnic Institute and State University Herbário do Tocantins Núcleo de Estudos Ambientais Universidade Federal do Tocantins (UFT) Laboratório de Ictiologia Sistemática Núcleo de Estudos Ambientais Universidade Federal do Tocantins (UFT) Departamento de Zoologia Universidade de Brasília Researcher Departamento de Ecologia Universidade de Brasília (UnB) Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) Laboratório de Ecologia de Peixes e Invasões Biológicas Universidade Estadual de Londrina (UEL) Laboratório de Entomologia Universidade Federal do Tocantins (UFT) Universidade Federal de Pelotas (UFPel) Environmental Sciences Program-CIAMB Universidade Federal de Goiás (UFG) Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT) Campus Universitário do Araguaia Laboratório de Microbiologia Universidade Federal do Tocantins (UFT) Fundação Brasileira para o Desenvolvimento Sustentável (FBDS) & Universidade Federal de Goiás (UFG) Laboratório de Ecologia e Zoologia (LABECZ) Universidade Federal do Tocantins (UFT) Laboratório de Ecologia de Peixes Departamento de Ecologia Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ) Laboratório de Análise e Síntese em Biodiversidade Departamento de Botânica Universidade Federal do Paraná (UFPR) Secretaria de Estado da Educação de Goiás-(Seduc-GO) UNISANTA PPGECOMAR Universidade Federal do Tocantins (UFT) Laboratório de Paleobiologia Universidade Federal do Tocantins (UFT) Departamento de Ecologia e Conservação Universidade Federal de Lavras (UFLA) Laboratório de Caracterização de Impactos Ambientais (LCIA) Universidade Federal do Tocantins (UFT) Embrapa Cerrado Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade Universidade Federal do Rio de Janeiro Programa de Pós-Graduação em Ecologia Universidade Federal do Pará (UFPA) Laboratório de Análises Geoambientais (LGA) Universidade Federal do Tocantins (UFT) Centro de Biologia Aquática Pontifícia Universidade Católica de Goiás Laboratório de Biodiversidade Universidade Evangélica de Goiás Escola de Ciências Agrárias e Biológicas Pontifícia Universidade Católica (PUC) Laboratório de Genética & Biodiversidade - ICB/UFG Núcleo de Pesquisas em Limnologia Ictiologia e Aquicultura (Nupelia) Universidade Estadual de Maringá (UEM) Departamento de Direito Universidade Federal do Tocantins (UFT) Núcleo de Estudos e Pesquisas Ambientais e Limnológicas (Nepal) Universidade de Brasília (UnB) Laboratório de Ecologia e Conservação (LEC) Universidade Federal do Paraná (UFPR) Coordenação de Biodiversidade Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho”

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2021
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