RESUMO Os benefícios para a saúde e as adaptações fisiológicas ao exercício regular são amplamente conhecidos e, com o advento das ciências ômicas e moleculares, revelou-se uma complexa rede de vias de sinalização e moléculas reguladoras que coordenam a resposta adaptativa do músculo esquelético ao exercício. As mudanças orgânicas transientes, porém, são cumulativas no pós-exercício. Elas incluem, de forma principal, a transcrição de genes relacionados aos fatores regulatórios da miogênese, ao metabolismo de carboidratos, à mobilização de gorduras, ao transporte e oxidação de substratos, ao metabolismo mitocondrial através da fosforilação oxidativa e, por fim, à regulação transcricional de genes envolvidos na biogênese mitocondrial. Tendo em vista o grande impacto científico, resumiram-se neste trabalho, além de algumas das principais respostas moleculares sofridas pelo músculo esquelético com o exercício físico, fatores que coordenam a plasticidade muscular para o ganho de desempenho. Foram citadas dezenas de biomarcadores ligados a alguns aspectos moleculares das adaptações do músculo esquelético ao exercício físico, algumas principais vias sinalizadoras e o papel mitocondrial, revelando alguns novos paradigmas para o entendimento desta área científica. ABSTRACT The health benefits and physiological adaptations to regular physical exercise are widely known, and with the advent of the omic and molecular sciences, a complex network of signaling pathways and regulatory molecules that coordinate the adaptive response of skeletal muscle to exercise has been revealed. Transient organic changes, however, are cumulative in the post-exercise period. They mainly include transcription of genes related to regulatory factors of myogenesis, carbohydrate metabolism, fat mobilization, transport and oxidation of substrates, mitochondrial metabolism through oxidative phosphorylation, and finally, the transcriptional regulation of genes involved in mitochondrial biogenesis. Given their great scientific impact, in addition to some of the main molecular responses experienced by the skeletal muscle to exercise, factors that coordinate muscle plasticity for performance gain were summarized in this work. This review mentioned dozens of biomarkers linked to some molecular aspects of skeletal muscle adaptations to physical exercise, some major signaling pathways and the role of mitochondria, revealing some new paradigms for the understanding of this field of science. RESUMEN Los beneficios para la salud y las adaptaciones fisiológicas al ejercicio regular son ampliamente conocidos y, con el advenimiento de las ciencias ómicas y moleculares, se ha revelado una compleja red de vías de señalización y moléculas reguladoras que coordinan la respuesta adaptativa del músculo esquelético al ejercicio físico. Los cambios orgánicos transitorios, sin embargo, son acumulativos después del ejercicio. Ellos incluyen principalmente la trascripción de genes relacionados a los factores de regulación de la miogénesis, metabolismo de carbohidratos, movilización de grasas, transporte y oxidación de substratos, metabolismo mitocondrial por la fosforilación oxidativa y, en última instancia, la regulación transcripcional de genes involucrados en la biogénesis mitocondrial. Teniendo en cuenta el gran impacto científico, se resumió en este trabajo, además de algunas de las principales respuestas moleculares experimentadas por el músculo esquelético con el ejercicio físico, factores que coordinan la plasticidad muscular en la ganancia del rendimiento. Se citaron decenas de biomarcadores relacionados con algunos aspectos moleculares de las adaptaciones del músculo esquelético al ejercicio físico, algunas de las principales vías de señalización y el papel mitocondrial, revelando algunos nuevos paradigmas para el entendimiento de esta área científica.