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The objective of the current study was to compare the rumen inoculum of slaughtered cattle with the ruminal inoculum of cannulated cattle; additionally, determine its reliability in the in vitro analysis of ruminant feeds throughout a multivariate approach. Five male bovines (weight 320 ± 9.4 kg; mean ± standard deviation) provided with ruminal cannula and between five and seven bovines slaughtered in slaughterhouse were used. The evaluations were carried out following a completely randomized design. The data obtained were subjected to different multivariate analyzes to determine the reliability of the ruminal inoculum of animals slaughtered in commercial slaughterhouses compared to that obtained from cannulated animals. The relative contribution indicated that the in vitro dry matter digestibility (IVDMD, 50.75%) and in vitro neutral detergent fiber digestibility (IVNDFD, 29.83%) analysis influence 80.13% of the results to determine the reliability of the ruminal inoculum from slaughtered cattle. Furthermore, it was determined that the first two principal components (IVNDFD and acetic acid production) are the ones that influence the results by 89.87%. The grouping of diets using the Tocher optimization method and the dendrogram shows the formation of six groups and two groups, respectively. The grouping shows that the ruminal inoculum source was not the limiting parameter in the evaluation. Rumen inoculum from cattle slaughtered in a commercial slaughterhouse (with unknown diet) has potential as an alternative for the in vitro analysis of cattle feed, provided that the lignin concentration in the diet is less than 35.5 g/kg DM.

We provide new records of three globally threatened species of bird belonging to the family Cotingidae: Procnias nudicollis (Vieillot, 1817), Xipholena atropurpurea (Wied, 1820), and Cotinga maculata (Statius Müller, 1776). These findings in non-protected areas of the Brazilian Atlantic Forest and, for C. maculata, at higher altitudes than previously reported, improve our understanding of the distribution of these threatened species and can aid in conservation efforts to protect them.

The selection of animals with lower production costs can be achieved by using feed efficiency and growth curve information. Kleiber ratio (KR) is an alternative option for discriminating against the animals that have the greatest weight gain about their final weight. Alternative feed efficiency and growth curves for ostriches of the African Black (AB) and Red Neck (RN) breeds and their crossbreeds (CB) were investigated using KR and Gompertz equation. Univariate and multivariate analyses were used. The highest adult weight was identified in the RN and CB. AB was more precocious than the RN and CB individuals. Only AB animals reached 75% of their mature weight at one year of age. At 180 days, AB showed better KR. AB was different from the others, mainly for KR at 90 days and 180 days. Considering multivariate analysis, AB animals were different from the others, regardless of sex, mainly for KR at 90 days and KR at 180 days. Other subgroups separated the animals by sex. In a market preferring animals of minor structure (smaller cuts) and greater precocity, it would be suitable to opt for AB. When animals with greater body structure (larger cuts) are desired, males RN and CR is the best option, however, it will be slaughtered with greater age and lower value for KR (may generate a bigger production cost ). It is possible to obtain animals with precocity and high KR, being well represented by the AB breed.

Dairy cattle production is distributed throughout the Brazilian regions. However, Brazilian producing regions are different in air temperature and humidity, diet, birth season, and other factors that may alter the reproductive performances of cows. The age of the cow at first calving (AFC) is a good indicator of sexual precocity since it shows the beginning of the female reproductive life and has a great influence on cow replacement costs. Researches on genotype-environment interaction (GEI) show the importance of using specific bulls for the different production systems in Brazil since most semen used in the country is imported. The objective of this work was to evaluate GEI for AFC in Holstein cows in Brazil, using reaction norms. The statistical models used were the standard animal model, which disregards the GEI, and hierarchical reaction norm models with homoscedastic (HRNMHO) and heteroscedastic (HRNMHE) residual variance, and one (HRNMHO1S and HRNMHE1S) and two (HRNMHO2S and HRNMHE2S) steps. HRNMHO1S presented better fit to the data, with lower heritability for environments with lower AFC, and higher heritability for environments with higher AFC. The GEI found was complex, with a reclassification of bulls, denoting the importance of considering GEI for evaluation and selection of bulls for different production levels. The reduction of AFC is possible when using breeding bulls adapted to the tropical and subtropical conditions of Brazil.

Abstract: The objective of this work was to assess the effect of editing and modeling of milk production data for genetic evaluation of Murrah buffaloes. Six strategies for evaluating milk production were analyzed: observed milk production (OMP); adjustment of milk production data to 305 (MP305) and 270 (MP270) days of lactation; removal of the 5 (MP5%) and 10% (MP10%) shortest lactation periods; and milk production along the lactation period as linear covariate (MPCO). Genetic parameters were estimated using the Bayesian inference, with heritability estimates of 0.19 to 0.23 and repeatability estimates of 0.35 to 0.36. Sires classified by OMP were high correlated to those classified by the other models, however, correlations to MP270, MP305 and MPCO decreased when considering only the best 20% sires. OMP showed greater differences in absolute mean deviations when compared with MPCO, MP270 and MP305. The strategies of analysis had similar heritabilities and stabilities. However, changes in the ranking of sires with better classifications, due to overestimation of genetic values, as occurred in the models MP305, MP270 and MPCO, may lead to a decrease in the genetic progress of the herd.

Abstract: The objective of this work was to estimate the phenotypic diversity in Jafarabadi, Murrah, and Mediterranean buffalo cows (Bubalus bubalis). Thoracic perimeter, withers-and-rump height, body length, and biiliac, external biischiatic, external ilioischiatic, sacropubic, and mean biiliac diameters were measured. The following indexes were calculated: anamorphosis index, pelvic index, withers-to-rump ratio, body index, lateral-body index, relative body index, body capacity indexes 1 and 2, transversal pelvic index, longitudinal pelvic index, and thoracic-perimeter-to-withers ratio index. The effect of breed was evaluated using univariate (mean tests) and multivariate (size-free discriminant analysis and Fisher’s linear discriminant function) analyses. The diversity among the breeds and their correlation with the variables were also evaluated using biplot graphs developed from principal component analysis. The breeds evaluated show a rectilinear, midline body model with similar capacity of muscular tissue development in body parts from which the most valuable cuts are extracted, and intermediate suitability for meat and milk production. The Jafarabadi breed has a larger body size, with a rear portion wider than longer, while the Murrah and Mediterranean breeds show similar biotypes, mainly differentiated in the pelvic region.

This work aimed to determine which non-linear model (Brody, Gompertz, logistic, von Bertalanffy or Richards) best represents the average growth curve of goats, in addition to evaluating the effect of the environment. The weight data of 40 Repartida goats reared in the Brazil Caatinga were included in this study. Weight data was collected every 30 days from birth until 270 days of age. The parameters of the models (A, mature body weight; B, constant of integration; k, maturation rate; m, inflection point) were estimated using the NLIN procedure of SAS. The logistic model showed a slightly higher average fit in comparison to the other models. The absolute growth rate suggests that the maximum growth rate was reached early. The effect of the contemporary groups was significant (P < 0.05), but only for the estimated k parameter. The estimated correlation between the A and k parameters was significant and negative, indicating a lower probability of a high body weight in adulthood. Goats of the Repartida ecotype are characterized by their high birth weight and low weight at maturity, which combined with the nutritional deficit, suggests that these animals have adapted to the adverse conditions of the Brazilian Caatinga region.

Objetivou-se avaliar os índices zoométricos de populações caprinas brasileiras e cabo-verdianas e verificar sua aptidão zootécnica para produção de carne, leite ou mista. Foram amostradas 1.064 cabras adultas das populações: Alpina, Boer, Anglo-Nubiana, Mambrina, Azul, Gurguéia, Sem Raça Definida do Piauí (SRD-PI), Nambi, Marota, Repartida e as populações cabo-verdianas de cinco ilhas (Fogo, São Nicolau, Santiago, São Vicente e Santo Antão). Avaliaram-se altura da cernelha, altura das patas, altura de garupa, comprimento corporal e perímetro torácico. A partir destas medidas foram calculados cinco índices zoométricos baseados na combinação das variáveis anteriores. Estes índices foram submetidos às análises estatísticas descritivas, análise de variância e teste de Scott-Knott (P

Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar a sensibilidade ao ambiente em bovinos da raça Nelore por meio de diferentes modelos de normas de reação e estimar o progresso genético no gradiente ambiental. Determinaram-se os parâmetros ganho de peso da desmama ao sobreano (GP345) e o peso ajustado aos 205 dias de idade (P205). Um modelo animal padrão (MA), dois modelos hierárquicos de normas de reação com homocedasticidade de variância residual e dois com heterogeneidade foram utilizados. O modelo hierárquico de normas de reação homocedástico com um passo apresentou o melhor ajuste. Os coeficientes de herdabilidade diretos do ambiente baixo para o ambiente alto, no gradiente ambiental, foram de 0,03 a 0,63 e de 0,13 a 0,62, respectivamente, para GP345 e P205. As correlações entre o intercepto e a inclinação da norma de reação foram de: 0,93, para GP345 (direto); 0,95, para GP345 (materno); 0,92, para P205 (direto); e 0,82, para P205 (materno). As correlações indicam que animais com alto valor genético tendem a responder positivamente aos melhores ambientes. As tendências genéticas mostraram ganhos para os efeitos diretos, principalmente nos melhores ambientes. Há variação genética quanto à sensibilidade dos animais, nos diferentes ambientes, fato que permite a seleção de animais com genótipos mais adequados para a produção em determinado ambiente.

ABSTRACT The objective of this study was to evaluate productive traits in sheep fed roughage-free diets by multivariate analysis. Forty lambs were used in this study: 20 Santa Inês animals, consisting of 10 uncastrated males and 10 females; and 20 crossbreds (½ Santa Inês × Dorper), consisting of 10 uncastrated males and 10 females, at an average age of five months. Lambs were randomly allocated into the following treatments: Santa Inês males fed once daily (SM1); Santa Inês males fed twice daily (SM2); Santa Inês females fed once daily (SF1); Santa Inês females fed twice daily (SF2); crossbred males fed once daily (CM1); crossbred males fed twice daily (CM2); crossbred females fed once daily (CF1); and crossbred females fed twice daily (CF2). In the multivariate analysis, a difference was detected between the mean values for production classes and feeding-behavior variables (Wilks, Pillai, Hotelling-Lawley, and Roy tests). Tocher's optimization method had two groups formed: Group I, comprising treatments SM1, SM2, SF1, SF2, CF1, and CF2; and Group II, containing treatments CM1 and CM2 (crossbred males). When production and cud chews per day were evaluated, neutral detergent fiber digestibility and final weight were the performance-digestibility variables that most contributed to explaining the variation between treatments. When the feeding behavior was assessed, the time spent on other activities was the variable that most contributed. The crossbred genotype (½ Santa Inês × Dorper) and the male sex have superior performance for weight-related traits. However, when these animals are confined with females, it is recommended to supply the feed only once daily, irrespective of the genetic group.

The objective of this work was to verify the presence of genotype - environment interactions (GEI) on the weight adjusted to 365 days of age (W365) for Tabapua cattle in the Northeast of Brazil, using reaction norm (RN) models. The reaction norm model with homogeneous residual variance and 1 - step provided the best fit to the data by the criteria information of deviance, deviance based on the conditional predictive ordinate and deviance based on the Bayes factors. Direct and maternal heritability estimates for the animal model were 0.17±0.04 and 0.07±0.03, respectively. The direct heritability for model reaction norm in the low and high management environment were 0.21±0.06 and 0,70±0.04, respectively. The correlations between the slope and intercept of the reaction norm were 0.68±0.10 and 0.96±0.06 for the direct and maternal effect, indicating that the animals with high genetic values respond positively to environment improvements, especially for the maternal effect. The Spearman correlations between the sire classifications ranged from 0.14 to 0.94 in the different environments and models. Genetic values of most animals were robust to environmental variation, however, considering the sires with the highest number of progeny, there is the presence of GEI.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi verificar a presença da interação genótipos x ambientes (GxA) para peso aos 365 dias de idade, em bubalinos da raça Mediterrâneo, com o uso de modelos de normas de reação via regressão aleatória. O modelo animal padrão e os modelos de normas de reação foram testados, tendo-se avaliado o modelo hierárquico norma de reação (MNR) com um e com dois passos. O modelo hierárquico homocedástico de norma de reação com um passo (MHNRHO1P) apresentou o melhor ajuste, com base em três critérios de comparação. As estimativas de herdabilidade direta para esse modelo variaram de 0,19 a 0,78, conforme a melhoria do ambiente. Além disso, houve mudança dos valores genéticos diretos (efeito escala) de alguns reprodutores, o que indica a existência de interação GxA. As correlações de Spearman foram altas, tanto na comparação do modelo animal padrão com os MNR, como na comparação entre os níveis de baixa, média e alta qualidade no MHNRHO1p. Portanto, embora haja interação GxA, a classificação dos reprodutores não é significativamente afetada pelos modelos. A maioria dos bubalinos é formada por animais de genótipo robusto, que são menos sensíveis a mudanças ambientais.

The objective was to compare models by Bayes factor (BF) to estimate the (co)variance compo- nents, genetic parameters and genetic values for the adjusted weights at 205 (W205), 365 (W365) and 550 (W550) days of age in Tabapuã animals reared on pasture in the Brazilian Northeast. Information about 26,838 cattle born in the period from 1975 to 2007 originally from the weight - development - control system of the Bra- zilian Association of Zebu Farmers ( Associação Brasileira de Criadores de Zebu , ABCZ) was used. The (co) variance components and genetic parameters were estimated by the Bayesian approach, in single - and two - trait analysis, using the GIBBS3F90 software. The full model provided the best fit to estimate the breeding value for W205 and W365 characteristics parameters. For trait W550, the model that provided the best fit was the one that did not include the effect of permanent environment. Genetic trends of direct effect were significant for the W205, W365 and W550 features, corresponding to increments of 2.67 kg, 7.35 kg and 8.32 kg, respectively, during the 32 years evaluated. Phenotypic trends were significant only for W205 and W365 characteristics cor- responding to increments of 26.82 kg and 22.42 kg, respectively. The genetic correlations between weight at 205, 365 and 550 days of age were of high magnitude (P205P365 = 0.90, = 0.90 and P205P550 P365P550 = 0.98); you can obtain genetic gains via correlated response to the weights at 365 and 550 days old when select- ing for W205.

The objective of this study was to evaluate the population structure of 91,579 Nellore cattle reared in the Northeast semi-arid, born between 1965 and 2011. We analyzed the pedigree and the estimation of population parameters based on the probability of gene origin. In the early years, a higher number of female births occured, tending to gender balance over the years. The number of founder animals (fe) and ancestors (fa) indicated the reduced use of animals in the genetic formation of the herd. Among 2,4676 ancestors, 450 were responsible for 50% of the genetic variability of the population. Of the 10 most important founders, 8 were among the 10 ancestors. The individual with the highest expression presented a mean coefficient of relationship (CR) of 1.31%, explaining 1.81% of the variability.72% of animals have identified fathers and mothers, revealing loss of information between generations. 100% of the herds use external bulls and 61% of them sell bulls, with no core classification or isolate. Inbreeding ranged from 0.14% in the second generation to 0.73% in the eighth, while the CR ranged from 0.8% to 0.35% between the first and fourth generations, decreasing from the fifth on. The average generation interval observed was of 8.3 years. The herd has a small number of animals in the genetic make-up, and small completeness of pedigree, making it difficult to estimate some population parameters. Keywords: generation interval; genetic variability; inbreeding; Zebu.

Objetivou-se avaliar a estrutura populacional de 91.579 animais da raça Nelore criados no Semiárido Nordestino, nascidos entre 1965 e 2011. Analisaram-se o pedigree e a estimação dos parâmetros populacionais baseados na probabilidade de origem do gene. Nos primeiros anos, registraram-se nascimentos superiores de fêmeas, tendendo ao equilíbrio entre os sexos com o passar dos anos. Os números de efetivo de animais fundadores (fe) e ancestrais (fa) indicaram a utilização reduzida de animais na formação genética do rebanho. Dentre 24.676 ancestrais, 450 foram responsáveis por 50% da variabilidade genética da população. Dos 10 fundadores de maior importância, 8 se apresentam dentre os 10 ancestrais; o indivíduo com maior expressão apresentou coeficiente de relação médio (CR) de 1,31%, explicando 1,81% da variabilidade. 72% dos animais têm pais e mães identificados, observando-se perda de informação entre as gerações. 100% dos rebanhos utilizam touros externos e 61% deles vendem touros, não havendo classificação núcleo ou isolado. Endogamia variou de 0,14% na segunda geração a 0,73% na oitava, enquanto que o CR oscilou de 0,8% a 0,35% entre a primeira e a quarta geração, decrescendo a partir da quinta. Observou-se um intervalo médio de gerações de 8,3 anos. O rebanho possui número reduzido de animais na formação genética e pequena integralidade do pedigree, dificultando a estimativa de alguns parâmetros populacionais. Palavras-chave: endogamia; intervalo de gerações; variabilidade genética; zebuínos.

The objective of this study was to evaluate the genotype-environment interaction (GEI) in the body weight adjusted to 550 days of age (W550) of Polled Nellore cattle raised in Northeastern Brazil using reaction norms (RN) models. Hierarchical RN models included fixed effects for age of cow (linear and quadratic) and random effects for contemporary groups (CG) and additive genetic RN level and slope. Four RN hierarchical models (RNHM) were used. The RNHM2S uses the solutions of contemporary groups estimated by the standard animal model (AM) and considers them as environmental level for predicting the reaction norms and the RNHM1S, which jointly estimate these two sets of unknowns. Two versions were considered for both models, one with a homogeneous (Hm) and another with a heterogeneous (He) residual variance. The one-step homogeneous residual variance model (RNHM1SHm) offered better adjustment to the data when compared with other models. For the RNHM1SHm model, estimates of additive genetic variance and heritability increased with environment improvement (260.75±75.80 kg2 to 4298.39±356.56 kg2 and 0.22±0.05 to 0.82±0.01, for low- and high-performance environments, respectively). High correlation (0.97±0.01) between the intercept and the slope of RN shows that animals with higher genetic values respond better to environment improvement. In the evaluation of breeding sires with higher genetic values in the various environments using Spearman's correlation, values between 0 and 0.98 were observed, pointing to high reclassification, especially among genetic values obtained by the animal model in comparison with those obtained via RNHM1SHm. The existence of GEI is confirmed, and so is the need for specific evaluations for low, medium and high level production environments.

The aim was to investigate the population structure of eight beef breeds: three local Tuscan breeds under extinction, Calvana (CAL), Mucca Pisana (MUP), and Pontremolese (PON); three local unselected breeds reared in Sardinia, Sarda (SAR), Sardo Bruna (SAB), and Sardo Modicana (SAM); and two cosmopolitan breeds, Charolais (CHA) and Limousine (LIM), reared in the same regions. An effective population size ranges between 14.62 (PON) to 39.79 (SAM) in local breeds, 90.29 for CHA, and 135.65 for LIM. The average inbreeding coefficients were higher in Tuscan breeds (7.25%, 5.10%, and 3.64% for MUP, CAL, and PON, respectively) compared to the Sardinian breeds (1.23%, 1.66%, and 1.90% in SAB, SAM, and SAR, respectively), while for CHA and LIM they were

O objetivo deste trabalho foi avaliar o uso de teste de identidade de modelos não lineares, na comparação de curvas de crescimento de bovinos da raça Tabapuã, de cinco regiões de produção do Nordeste do Brasil. Foram analisados dados de peso de 3.695 machos e 4.236 fêmeas, originários das regiões Maranhão, Gado Algodão, Mata Agreste, Sertão e Itapetinga-Valadares. Após ajuste do modelo Brody, aplicou-se o teste da razão de verossimilhança, com aproximação de qui-quadrado, para avaliar a igualdade de parâmetros de curvas de crescimento entre as regiões. O modelo reduzido, com igualdade da taxa de maturidade, com 14 parâmetros, foi o mais adequado para descrever o crescimento dos animais. As curvas de crescimento dos machos apresentaram taxas de maturidade em comum nas regiões de produção Gado Algodão e Mata Agreste, Maranhão e Itapetinga-Valadares, e Sertão. Para as fêmeas, as regiões com taxas de maturidade em comum foram: Mata Agreste e Sertão, Maranhão e Itapetinga-Valadares, e Gado Algodão. A utilização de uma única curva não é adequada para descrever o crescimento de bovinos da raça Tabapuã nas regiões estudadas.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura populacional de ovinos da raça Santa Inês criados no Brasil. Foram utilizados dados de pedigree de 13.216 animais, pertencentes a 53 rebanhos de oito estados brasileiros, nascidos no período de 1976 a 2010. O programa Endog foi utilizado para análise do pedigree e estimação dos parâmetros populacionais. Do total de animais estudados, 80,86% apresentaram pedigree na primeira ascendência, 73,78% na segunda e 67,75% na terceira. O número máximo de gerações conhecidas foi de 19, e a média de gerações equivalentes foi de 4,67. A média do intervalo de gerações foi de 3,22±1,77 anos. O tamanho efetivo da população apresentou média de 172,5 animais. O número de animais fundadores foi 829, mas o número efetivo de fundadores foi apenas 50. Os 17 principais ancestrais explicaram 50% da variabilidade genética total. O coeficiente médio de relação foi de 3,87% e o de endogamia, de 6,92%. Apesar do satisfatório coeficiente médio de endogamia nas últimas gerações, este coeficiente requer monitoramento por sua proximidade do limite recomendável. O fluxo de genes entre os rebanhos é o principal fator para o aumento do tamanho efetivo e a manutenção da variabilidade genética da raça Santa Inês.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade fenotípica de uma população de galinhas Peloco e compará-la a três linhagens comerciais de frango de corte do tipo caipira. Avaliações foram feitas quanto a características de: peso de carcaça, peito, coxa e sobrecoxa; altura, largura e comprimento do peito; e comprimento da coxa e da sobrecoxa. Os dados foram submetidos às análises de variáveis canônicas e à análise discriminante independente do tamanho (ADIT). Os resíduos da ADIT foram utilizados na análise de agrupamento pelos métodos de Tocher e UPGMA. As duas primeiras variáveis canônicas foram suficientes para explicar 94,66% da variação total entre os fenótipos. O peso da carcaça teve a maior contribuição para a variação (59,91%) entre os grupos de aves, seguido de peso da coxa (12,63%) e largura do peito (11,75%). Ambos os métodos de agrupamento resultaram na formação de dois grupos: um de linhagens comerciais e outro da raça Peloco. O isolamento da Peloco é consequência da ausência de seleção para as características estudadas. Além disso, a presença de variabilidade dentro da raça Peloco mostra a existência de animais com maior potencial quanto ao peso de carcaça, o que possibilita o melhoramento da raça.

The objective of this study was to evaluate the population genetic structure of Nellore cattle in northeastern Brazil. Pedigree information was collected from 175,231 animals born from 1967 to 2007. Probability of gene origin, inbreeding, average relatedness coefficient (AR), completeness pedigree, effective population size and generation interval were calculated. Generation interval was high due to the long period of time animals were used as reproducers. The bottleneck effect was evidenced as a result of intensive use of limited breeders over the last years. Low values were observed ​​in the effective number of founder animals (434) and ancestors (427) comparing with the number on the base (175,231) and reference populations (130,038). Generally, the variability explained by the founders and ancestors is considered low. The average coefficient of inbreeding (0.11%) and AR (0.14%) estimated for this population is considered low and can be partly explained by the increased population effective number in recent periods; however, it may be underestimated by shallow pedigree.

In the present study, alternative and traditional nonlinear models to describe growth curves of Morada Nova sheep reared in the state of Bahia, Brazil, were applied. The nonlinear models were: Schnute, Mitscherlich, Gompertz, Logistic, Meloun I Meloun II, III Meloun, Gamito and Meloun IV. The model adjustment was evaluated by using: Adjusted Coefficient of Determination (R²aj), Akaike Information Criterion (AIC), Bayesian Information Criterion (BIC), Mean Squared Error of Prediction (MEP) and Coefficient of Determination of Prediction (R²p). The selection of the best model was based on cluster analysis, using the evaluators as variables. Six out of the nine tested models converged, while Meloun I and Meloun IV were equally effective in explaining animal growth, without significant influence of sex or type of parturition over the curve parameters. The models Meloun I and IV have the best adjustment and reveal a remarkable reduction of weight gain after 150 days of age, which indicates special attention should be given to feeding at this stage.

The major objective of this study was to estimate heritability and genetic correlations between milk yield (MY) and calving interval (CI) and lactation length (LL) in Murrah buffaloes using Bayesian inference. The database used belongs to the genetic improvement program of four buffalo herds from Brazil. To obtain the estimates of variance and covariance, bivariate analyses were performed with the Gibbs sampler, using the program MTGSAM. The heritability coefficient estimates were 0.28, 0.03 and 0.15 for MY, CI and LL, respectively. The genetic correlations between MY and LL was moderate (0.48). However, the genetic correlation between MY and CI showed large HPD regions (highest posterior density interval). Milk yield was the only trait with clear potential for genetic improvement by direct mass selection. The genetic correlation between MY and LL indicates that indirect selection using milk yield is a potentially beneficial strategy. The interpretation of the estimated genetic correlation between MY and CI is difficult and could be spurious.

O principal objetivo deste estudo foi aplicar componentes principais com múltiplas matrizes de dados para verificar a interação tripla genótipo x local x regime alimentar no valor genético do efeito direto do peso, aos 205 dias de idade. Foram utilizados touros com filhos em três regiões de produção do Nordeste Brasileiro (Maranhão, Mata e Agreste, e Recôncavo Baiano) e criados nos regimes alimentares a pasto ou com suplementação. Não se evidenciou interação genótipo x local para a característica estudada, entretanto, constatou-se interação do genótipo x regime alimentar. A utilização dos touros deve ser direcionada de acordo com o regime alimentar de seus filhos.The main objective of this study was to apply three-mode principal component analysis to assess the triple interaction (genotype x location x feeding) on direct genetic value for weight at 205 days of age. We used 60 sires with offspring in three regions of northeastern Brazil (Maranhão, Mata and Agreste, and Recôncavo Baiano) and raised on a pasture regime or with supplementation. There was no interaction between genotype and location, but there was a correlation between genotype and direct effect of feeding. The use of sires should be dictated according to the system of rearing of their offspring.

O objetivo deste trabalho foi estudar a estrutura genética populacional de bubalinos da raça Mediterrâneo, em quatros rebanhos, no Brasil. Foram utilizados dados de pedigree de 6.588 bubalinos da raça Mediterrâneo nascidos no período de 1980 a 2002. Do total de animais estudados, 60,5; 15,3 e 2,1% possuíam pedigree na primeira, segunda e terceira ascendência, respectivamente. O número efetivo de rebanhos que forneceram machos reprodutores foi de 1,60 para pais; 1,16 para avôs e 1,00 para bisavôs. O número de animais fundadores foi 923 e o número efetivo de fundadores foi apenas 71. O número efetivo de ancestrais que explicaram a variabilidade genética da população foi de 71 e somente 30 ancestrais explicaram 50% da variabilidade genética da população. Os coeficientes médios de relação (CR) entre os indivíduos da população e de endogamia (F) foram estimados em 0,37 e 0,34%, respectivamente. A estimativa média do intervalo de gerações foi de 8,71±2,85 anos. A variabilidade da população atual é fruto da contribuição de poucos ancestrais, que são, na sua maioria, também fundadores, evidenciando que a população se desenvolveu a partir de uma base genética estreita, o que caracteriza a ocorrência do efeito fundador.The objective of this research was to study the population genetic structure of four herds of Mediterranean buffaloes in Brazil. It was used pedigree data from 6,588 buffaloes of Mediterranean breed born from 1980 to 2002. Of the total number of animals studied, 60.5, 15.3 and 2.1% had a pedigree in the first, second and third ascendancy, respectively. The effective number of herds that provided breeding males was 1.60 for parents, 1.16 for grandparents and 1.00 for great-grandparents. There were 923 founder animals and only 71 effective founders. The effective number of ancestors explaining the genetic variability of the population was 71 and only 30 ancestors accounted for 50% of the genetic variability of the population. The average relatedness coefficient (AR) between individuals and inbreeding (F) of the population were estimated at 0.37 and 0.34% respectively. The average estimate of generation interval was 8.71±2.85 years. The variability of the current population is the result of a few ancestors, who are mostly also founders showing that the population was developed from a narrow genetic base which characterizes the occurrence of founder effect.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a interação genótipo × ambiente (IGA) quanto ao peso ajustado aos 365 dias de idade, em bovinos da raça Nelore Mocha do Nordeste do Brasil, por meio de modelos de norma de reação, via regressão aleatória com abordagem bayesiana. Os modelos analisados incluíram o efeito fixo de idade da vaca (linear e quadrático) e os efeitos aleatórios genético aditivo e de grupo de contemporâneos. O modelo de norma de reação com variância residual homogênea e um passo (MHNRHO1P) proporcionou melhor ajuste aos dados do que os modelos com variância residual heterogênea e o modelo animal padrão (MA). As estimativas de variância genética (64,41±13,24 kg² a 842,31±58,29 kg²) e herdabilidade (0,11±0,01 a 0,63±0,02) aumentaram com a melhoria do gradiente ambiental. As correlações de Spearman variaram de 0,69 a 0,99, entre as classificações dos reprodutores com maiores valores genéticos nos MA e MHNRHO1P, nos diferentes ambientes, o que indica alteração na classificação, especialmente dos valores genéticos obtidos pelo MA nos ambientes superiores. A identificação desse nível de IGA torna necessárias as avaliações específicas dos indivíduos e rebanhos para os ambientes de baixo, médio e alto nível de produção.

The objective of this study was to evaluate the history of the Tabapuã breed in Northeastern Brazil by determining its population structure and genetic progress. Pedigree information from animals born in the period between 1965 and 2006 and weight-adjusted data at 205 (W205), 365 (W365) and 550 (W550) days of age for bovines born between 1975 and 2006 were used. The (co)variance components and genetic value were estimated using the application MTDFREML. Also, the software ENDOG was used for pedigree analysis and parameter estimation based on the probabilities of gene origin, inbreeding and average generation interval. The heritability coefficients for direct genetic effects were 0.21±0.03, 0.26±0.04 and 0.36±0.05 for W205, W365 and W550, respectively. During the first 20 years studied, the observed effective size was small. The generation intervals by gametic pathway were: 7.7±3.4 (sire-son), 7.8±3.7 (sire-daughter), 6.9±3.3 (dam-son), 6.8 ± 3.1 (dam-daughter), and mean interval of 7.3±3.4 years. The studied population showed moderate heritability coefficients, whereas the genetic gains based on the studied traits may be higher than those estimated by genetic tendencies. Reduced generation interval, increased effective size and continuous mating control of relatives are important strategies for the genetic progress of the Tabapuã breed in the region.

The objective of this study was to characterize the population genetic structure of the Gir breed in the Northeast of Brazil. The data used in this study were taken from pedigree information of 8,897 Gir animals between 1957 and 2007, obtained from the Brazilian Zebu Breeders Association (ABCZ). The program ENDOG was used to estimate the parameters based on the probability gene origin. From the amount of the studied animals, 67.22%, 18.41% and 3.15% had complete pedigree only on the first, second and third parentage, respectively. The number of ancestors that contributed for the reference population was 2,755, of which only 171 explain the 50% genetic variability of the population. The actual number of founder herds was 168 and the effective number of founder herds was 22.3. The number of sire supplier herds was 22.16, 8.66 and 5.36 for fathers, grandfathers and great-grandfathers, respectively. The average coefficient of relatedness was estimated at 0.22%; the highest individual coefficient was 1.49%. The little variability of the current population is a result of the small number of effective founders and ancestors indicating the population evolved from a narrow genetic base.

Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.O objetivo deste estudo foi avaliar a eficiência de estratégias de transformação de dados para correção da heterogeneidade entre rebanhos na avaliação genética de touros, vacas e progênies. Quatro estruturas de dados relativos a peso à desmama de bovinos foram simuladas: rebanhos com e sem heterogeneidade para médias e variâncias, e rebanhos com e sem conexidade genética. Nas avaliações genéticas, utilizaram-se dados na escala original e transformados (Logarítmica, Raiz quadrada, Padronização e Razão pelo desvio-padrão fenotípico). As estratégias de transformação de dados avaliadas não foram eficientes para eliminar os efeitos negativos da heterogeneidade entre rebanhos sobre a avaliação genética de touros, vacas e progênies.

The objective of this study was to characterize body biometrics of Santa Ines sheep during growth. Data from 4,038 animals, males and females, with ages from four to 36 months, from different herds participating in the National Agricultural Fair in Bahia from 2003 to 2008 were used. The characteristics evaluated were: body weight, average daily gain, body length, thoracic circumference, anterior height and posterior height. The mean values found were compared by the Student-Newman-Keuls test. All characteristics studied showed gradual change with aging, and it is worth-noting that age had positive effect on body weight, body length, thoracic circumference, anterior height and posterior height and negative effect on average daily gain. Average daily gain was reduced by 68.5% from four to 36 months of age, while the mean improvements observed in both sexes in this age range, for body weight, body length, thoracic circumference, anterior height and posterior height were 137.8%, 23.5%, 43.2%, 19.3% and 19.6%, respectively. However, the increments for body weight, body length and thoracic circumference were higher until 12 months of age, when an increase of 72.7%, 14.6% and 24.8% in their respective characteristics was verified. For anterior height and posterior height, the greatest increase occurred up to eight months of age with improvement of 8.4% for both measures. Santa Ines sheep have different growth rates for body measurements; whereas growth in posterior height stabilizes earlier, the thoracic circumference, along with body weight, remains growing for longer time.

Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.

Os objetivos neste estudo foram analisar modelos não-lineares para descrever o crescimento em ovinos da raça Morada Nova criados no estado da Bahia e, após a definição do modelo de melhor ajuste, calcular a taxa de crescimento absoluto e avaliar a influência de fatores ambientais (sexo e tipo de parto) sobre os parâmetros da curva. Utilizaram-se dados de pesagem de 40 ovinos, do nascimento aos 385 dias de idade. Os modelos não-lineares utilizados foram: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Logístico e Gompertz. Os modelos Von Bertalanffy, Brody e Richards foram os que apresentaram os melhores ajustes e são equivalentes para explicar o crescimento dos animais. A taxa de crescimento absoluto teve acentuado decréscimo na fase pós-desmama, o que indica a necessidade de se adotar um regime alimentar adequado para acompanhar as exigências de nutrientes dos animais nessa fase. Os efeitos ambientais (sexo e tipo de parto) influenciaram significativamente a taxa a maturidade (k), mas apenas o sexo do animal afetou o peso à maturidade (A). Os animais que nasceram de parto simples tiveram peso maior que o daqueles de parto duplo, e estes apresentaram ganho compensatório. Os machos tiveram maior crescimento que as fêmeas, que, por sua vez, apresentaram maior precocidade. A correlação estimada entre os parâmetros A e k foi negativa (-0,65) para o modelo Von Bertalanffy e (-0,71) para os modelos Brody e Richards, e isso indica que os animais mais precoces possuem menor probabilidade de atingir pesos elevados à idade adulta.The objective of the present study was to evaluate non-linear models to describe Morada Nova sheep herds raised in the State of Bahia and, after defining the best suiting model, calculate the rate of absolute growth and evaluate the influence of environmental factors (sex and type of parturition) on the curve parameters. Weighting data from 40 sheep from birth up to 385 days of age were used. The non-linear models used were: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Logistic and Gompertz. Von Bertalanffy, Brody and Richards models presented the best adjustments and were equivalent to explain the growth of the analyzed animals. A remarkable drop in the absolute growth rate was observed after weaning, suggesting that a proper diet should be implemented to supply the nutritional demands of the animals at this stage. The environmental effects (sex and type of parturition) have significantly influenced the maturity rate (k), but only the sex of the lamb affected weight at maturity (A). Animals born from single parturition proved to be heavier than twins which, in turn, presented compensatory gain. The growth of males was higher than of females and the latter presented more precocity than males. Estimated correlation between parameters A and k was negative (-0.65) for the Von Bertalanffy model and for the Brody and Richards models (-0.71) indicating that the most precocious animals are less likely to reach elevated weights when adults.

Este estudo teve como objetivo utilizar a análise de agrupamento para classificar modelos de regressão não-lineares usados para descrever a curva de crescimento de ovinos cruzados, tendo em vista os resultados de diferentes avaliadores de qualidade de ajuste. Para tanto, utilizaram-se dados de peso-idade dos seguintes cruzamentos entre raças de ovinos de corte: Dorper x Morada Nova, Dorper x Rabo Largo e Dorper x Santa Inês. Após a indicação do melhor modelo, objetivou-se ainda aplicar a técnica de identidade de modelos a fim de identificar o cruzamento mais produtivo. Foram ajustados doze modelos não-lineares, cuja qualidade de ajuste foi medida pelo coeficiente de determinação ajustado, critérios de informação de Akaike e Bayesiano, erro quadrático médio de predição e coeficiente de determinação de predição. A análise de agrupamento indicou o modelo Richards como o mais adequado para descrever as curvas de crescimento dos três grupos genéticos considerados, e os testes de identidade de modelos indicaram o cruzamento Dorper x Santa Inês como sendo o mais indicado para a pecuária local.This study had the objectives to use the cluster analysis in order to classify nonlinear regression models used to describe the growth curve in relation to different quality fit evaluators. Were utilized weight-age data from the following crossbred beef lambs Dorper x Morada Nova, Dorper x Rabo Largo e Dorper x Santa Inês. After the choice of the best model, we aimed also to apply the model identity in order to identify the most efficient crossbred group. Eleven nonlinear models were used, whose fit quality was measured by determination coefficient, Akaike information criterion, Bayesian information criterion, mean quadratic error of prediction and predicted determination coefficient. The cluster analysis indicated the Richards as the best model for the three data sets, and the model identity tests revealed that the Dorper x Santa Inês crossbred group was recommend for meat production.

O objetivo deste estudo foi analisar modelos não-lineares para descrever o crescimento em animais da raça Indubrasil no Estado do Sergipe. Após a definição do modelo de melhor ajuste, calculou-se a taxa de crescimento absoluto e avaliou-se a influência de fatores ambientais (sexo, fazenda, mês e ano de nascimento) sobre os parâmetros da curva. Utilizaram-se dados de, no mínimo, 8 pesagens, obtidas a intervalos de aproximadamente 90 dias, do nascimento aos 2 anos de idade de 1.201 bovinos, provenientes da Associação Brasileira dos Criadores de Zebu (ABCZ). Os modelos não-lineares utilizados foram: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Logístico e Gompertz. O modelo Logístico apresentou melhor ajuste seguido dos modelos Gompertz e Von Bertalanffy. O peso assintótico (A) e a taxa de maturidade (K) estimada pelo modelo Logístico foram 427,87 kg e 0,0052, respectivamente. Constatou-se acentuado decréscimo da taxa de crescimento absoluto na fase pós-desmama, devendo ser adotado um regime alimentar adequado para acompanhar as exigências de nutrientes dos animais nessa fase. Os efeitos de ambiente influenciaram significativamente (P < 0,05) os parâmetros A e k . A correlação estimada entre os parâmetros A e k foi negativa (-0,62), indicando que os animais mais precoces possuem menor probabilidade de atingir pesos elevados à idade adulta.The objective of this study was to analyze nonlinear models to describe growth of Indubrazil cattle raised in Sergipe State. After defining the best adjusted model, it was evaluated the influence of environmental effects (sex, farm, month and year of birth) over mature weight (A) and maturation rate (K). Data from 1,201 animals weighed in nearly 90-day intervals from birth up to two years of age were used, based on records from the Brazilian Association of Zebu Breeders (ABCZ). The models utilized were Brody, Von Bertalanffy, Richards, Logistic and Gompertz. The Logistic model presented best adjustment followed by Gompertz and Von Bertalanffy models. The parameters A (weight at maturity) and k (maturation rate), obtained by the Logistic model were 427.87 and 0.0052, respectively. An accentuated decrease in the absolute growth rate was observed after weaning and nutritional strategies should be performed to avoid the low weight gain at this stage. Environmental factors affected significantly the parameters A and k. The correlation estimated between the parameter A and k was negative (-0.62), indicating that fast-growing young animals are less likely to reach higher weights when adults.

The objective of the present study was to evaluate the genetic structure of Gyr cattle selected for milk production. Files of pedigree and production were composed of 27,610 animals. The ENDOG program was used for the calculation of individual inbreeding coefficient (F) and coefficient of average relatedness (AR), effective number of animals(Ne), effective number of founders (f e) and ancestors (f a), and generation interval (GI). Individual inbreeding coefficients and average relatedness in the population were 2.82% and 2.10%, respectively. It was observed a reduction in the effective number of animals, especially after publication of the results of the first progeny test. The estimated effective number of founders was 146 and 75 for the ancestrals. Out of those, only 28 ancestors accounted for the origin of 50% of the population genes. The average generation interval was 8.41 years and it was longer for males than for females. For maintaining genetic variability in future generations, it should be invested mating strategies that reduce inbreeding and which do not use massively only some high breeding value sires.O objetivo neste trabalho foi avaliar a estrutura genética da raça Gir selecionada para produção de leite. Os arquivos de pedigree e de produção eram compostos de 27.610 animais. Utilizou-se o programa ENDOG para cálculo dos coeficientes individuais de endogamia (F) e coeficiente de relação médio (AR), número efetivo de animais (Ne), de fundadores (fe) e de ancestrais (fa) e do intervalo de gerações (GI). Os coeficientes individuais de endogamia e de relação médios da população foram 2,82 e 2,10%, respectivamente. Foi observada redução do número efetivo de animais, especialmente após a publicação dos resultados do primeiro teste de progênie. O número efetivo de fundadores estimado foi de 146 e o de ancestrais, 75. Desses, apenas 28 ancestrais foram responsáveis pela origem de 50% dos genes da população. O intervalo médio de gerações foi 8,41 anos e foi maior para machos que para fêmeas. Para manutenção da variabilidade genética em futuras gerações, deve-se investir em estratégias de acasalamento que reduzam a endogamia e que não façam uso maciço de apenas alguns reprodutores de alto valor genético.

The objective of this work was to evaluate the population structure and the genetic and phenotypic progress of Nelore cattle in Northern Brazil. Pedigree information concerning animals born between 1942 and 2006 were analyzed. Population structure was performed using the Endog program. Out of the 140,628 animals studied, 67.7, 14.52 and 3.18% had complete pedigree record of the first, second and third parental generation, respectively. Inbreeding and average relatedness coefficients were low: 0.2 and 0.13%, respectively. However, these parameters may have been underestimated, since information on pedigree was incomplete. The effective number of founders was 370 and the genetic contribution of 10, 50 and 448 most influent ancestors explained 13.2, 28 and 50% of the genetic variability in the population, respectively. The genetic variability for growth traits and population structure demonstrates high probability of increasing productivity through selective breeding. Moreover, management strategies to reduce the currently observed age at first calving and generation intervals are important for Nelore cattle genetic improvement.O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura populacional e o progresso genético e fenotípico da raça Nelore na Região Norte do Brasil. Informações sobre o pedigree foram analisadas em animais nascidos entre 1942 e 2006. A estrutura populacional foi estimada utilizando-se o programa Endog. Dos 140.628 animais avaliados, 67,7% dos pais, 14,52% dos avós e 3,18% dos bisavós eram conhecidos. O coeficiente de parentesco médio e a endogamia foram, em geral, baixos: 0,13 e 0,20%, respectivamente. Contudo, esses parâmetros podem ter sido subestimados, já que as informações de pedigree eram incompletas. O número efetivo de fundadores foi de 370 e a variabilidade genética na população explicada pelos 10, 50 e 448 mais influentes ancestrais foi de 13,2, 28 e 50%, respectivamente. A existência de variabilidade genética indica possibilidade de aumento na produtividade por meio da seleção. Adicionalmente, estratégias de manejo para diminuir a idade ao primeiro parto e o intervalo de gerações são importantes para o melhoramento da raça.

Objetivou-se com este estudo mapear locos de características quantitativas (QTL) nos cromossomos 9, 10 e 11 de suínos (Sus scrofa) e associar seus efeitos em características de carcaça, cortes de carcaça, órgãos e vísceras, desempenho e qualidade de carne. Utilizaram-se amostras de DNA de animais pertencentes a uma população F2, oriunda do cruzamento entre machos da raça Piau e fêmeas Landrace õ Large White õ Pietrain. Um total de 13 locos microssatélites foi utilizado na construção dos mapas de ligação da população atual. As análises de associação foram feitas utilizando-se mapeamento de intervalo por regressão para detecção de QTL. Identificaram-se associações significativas, em nível cromossômico, entre regiões do cromossomo 9 e as características peso total do carré e peso do lombo. No cromossomo 10, foram detectados três QTL significativos para espessura de toucinho na linha dorso-lombar entre a última e a penúltima vértebra lombar, peso de pulmão e índice de vermelho e um QTL significativo, no nível genômico, para peso de fígado. No cromossomo 11, foi detectada apenas uma associação significativa, em nível cromossômico, relacionada à espessura de toucinho imediatamente após a última costela, a 6,5 cm da linha dorso-lombar. As informações dos QTL significativos encontrados são importantes para estudos futuros, como o mapeamento fino e a identificação de genes, que ajudem no melhor entendimento da fisiologia e das características de produção de suínos.The objective of this study was to map quantitative trait loci (QTL) in chromosomes 9, 10 and 11 of swines (Sus scrofa) and to associate their effects on traits of carcass, carcass cuts, organs and guts, performance and meat quality. Samples of DNA of animals from a F2 population originated from crosses between Piau breed males and Landrace õ Large White õ Pietrain females were used. A total of 13 microsatellite loci were used to build link maps of the present population. Analyses of association were done using mapping of intervals by regression for QTL detection. Significant association were identified at the cromossomic level between cromossome 9 regions and total (bone-in) loin weight and boneless loin weight. On cromossom 10, three significant QTL were detected for midline backfat thickness immediately between the last and penultimate the last rib, lung weight and redness and a significant QTL at the genomic level for weight of liver. On chromosome 11, only one significant association was detected at cromosomic level related for backfat thickness immediately after the last rib at 6.5 cm from the midline. Information from significant QTL found here are important for future studies as fine mapping and gene identification, which help on a better understanding of physiology and characteristics of swine production.

The aim of this work was to investigate the short-term behavior of the genetic variability of quantitative traits simulated from models with additive and non-additive gene action in control and phenotypic selection populations. Both traits, one with low (h² = 0.10) and the other with high (h² = 0.60) heritability, were controlled by 600 biallelic loci. From a standard genome, it was obtained six genetic models which included the following: only the additive gene effects; complete and positive dominance for 25, 50, 75 and 100% of the loci; and positive overdominance for 50% of the loci. In the models with dominance deviation, the additive allelic effects were also included for 100% of the loci. Genetic variability was quantified from generation to generation using the genetic variance components. In the absence of selection, genotypic and additive genetic variances were higher. In the models with non-additive gene action, a small magnitude covariance component raised between the additive and dominance genetic effects whose correlation tended to be positive on the control population and negative under selection. Dominance variance increased as the number of loci with dominance deviation or the value of the deviation increased, implying on the increase in genotypic and additive genetic variances among the successive models.Objetivou-se estudar a variabilidade genética a curto prazo de características quantitativas simuladas a partir de modelos com ação gênica aditiva e não-aditiva em populações controle e de seleção fenotípica. As duas características, uma de baixa (h² = 0,10) e outra de alta (h² = 0,60) herdabilidade, foram controladas por 600 locos bialélicos. A partir de um genoma-padrão, foram obtidos seis modelos genéticos que incluíram: apenas efeitos aditivos dos genes; dominância completa e positiva para 25, 50, 75 e 100% dos locos; e sobredominância positiva para 50% dos locos. Nos modelos com desvio da dominância também foram incluídos os efeitos aditivos dos alelos para 100% dos locos. A variabilidade genética foi quantificada de geração a geração por meio de componentes de variância genética. Na ausência de seleção, as variâncias genotípica e genética aditiva mantiveram-se mais elevadas. Nos modelos com ação gênica não-aditiva, surgiu um componente de covariância entre os efeitos genéticos aditivos e de dominância de pequena magnitude e cuja correlação tendeu a ser positiva na população controle e negativa sob seleção. A variância de dominância aumentou com o acréscimo no número de locos com desvio da dominância ou no valor do desvio, o que implicou aumento das variâncias genotípica e genética aditiva entre os sucessivos modelos.

This paper provides an evaluation of the population structure, phenotype and genetic trends of registered Gyr herd cattle in northeast Brazil. The study provides important baseline information for the management, conservation and potential population expansion of this economically and culturally important cattle breed. Pedigree data were analyzed for individuals born between 1964 and 2006. Body weight values were adjusted to 205 and 365 days of age for animals born between 1978 and 2006. Phenotypic change of zebu Gyr in northeast Brazil is solely due to environmental improvement. However, there is potential for artificial selection for weight gain in young cattle. Effective population size decreased during the 1990s and the average inbreeding coefficient increased during the studied period. An increase of the effective population size of Gyr in northeast Brazil is strongly recommended, along with an increase in the management of the mating process to prevent inbreeding and to maintain the genetic variability of the breed.Com o intuito de fornecer subsídios para programas de conservação, seleção e expansão da raça Gir no Nordeste do Brasil, objetivou-se avaliar o histórico do rebanho Gir registrado no nordeste brasileiro, com base na sua estrutura populacional e no progresso genético e fenotípico de características de desenvolvimento ponderal. Foram utilizadas informações de pedigree de animais nascidos no período de 1964 a 2006 e dados dos pesos ajustados aos 205 e 365 dias de idade de bovinos nascidos de 1978 a 2006. O progresso genético para a raça no Nordeste foi ocasionado exclusivamente pelo melhoramento ambiental. O tamanho efetivo da população reduziu a partir da década de 90, e o coeficiente de endogamia médio aumentou durante o período estudado. É imprescindível que o tamanho efetivo da raça Gir do nordeste seja ampliado e que haja maior controle de acasalamentos entre indivíduos aparentados, para prevenção da endogamia e conservação da variabilidade genética e viabilidade da raça.

Objetivou-se com este estudo avaliar os impactos de se ignorarem os efeitos de dominância sobre a estimação de parâmetros genéticos e a predição de valores genéticos pelo método da máxima verossimilhança restrita sob modelo animal aditivo empregando-se o MTDFREML. Para a mesma arquitetura genômica, foram simulados dois modelos de ação gênica: um deles incluiu apenas efeitos aditivos dos genes e o outro, efeitos aditivos e dominância completa e positiva para 100% dos locos. Sob cada modelo genético, foram geradas três populações-base correspondentes às características com herdabilidades de 0,15 (baixa), 0,30 (média) e 0,60 (alta). A partir das populações-base, foram geradas as populações iniciais, que, submetidas a seleção e a acasalamentos ao acaso, durante seis gerações consecutivas e discretas, resultaram cada uma em 18.000 indivíduos com registro. As estimativas dos componentes de variância e herdabilidade obtidas no modelo com ação gênica aditiva foram semelhantes aos seus valores reais para todas as características, ao passo que, sob ação gênica de dominância, todos os componentes foram superestimados, principalmente a variância genética aditiva. A variância de dominância não-estimada pelo modelo animal adotado foi redistribuída entre os componentes genético aditivo e residual estimados. Houve perda na acurácia da avaliação genética sob o modelo genético com dominância e essa perda foi traduzida por correlações mais baixas entre os valores genéticos verdadeiros e preditos dos animais. Há necessidade de novos estudos, já que os genomas simulados podem não corresponder aos sistemas biológicos verdadeiros.The objective of this study was to evaluate impacts of ignoring the dominance effects on the estimation of genetic parameters and prediction of genetic values by the restricted maximum likelihood method, under the additive animal model, using MTDFREML. Two gene action models were simulated for the same genomic architecture: one model that included only additive effects of the genes and the other with additive effects and positive and complete dominance into 100% of the loci. Under each genetic model, three base populations were generated corresponding to the characteristics with heritabilities of 0.15 (low), 0.30 (average) and 0.60 (high). Starting from the base populations the initial populations were generated which by selection and mating at random, for six consecutive and discrete generations, each one produced 18,000 animals with record. The estimates of the components of variance and heritability obtained in the model with additive gene action were similar to the actual values for all traits, while under dominance gene action, every component was overestimated, especially the additive genetic variance. The non-estimated dominance variance by the animal model adopted was redistributed between the additive genetic and residual components estimated. Accuracy was lost in the genetic evaluation, under the genetic model with dominance, that resulted in smaller correlations between the actual and predicted breeding values of the animals. Additional studies are needed since the simulated genome might not correspond to the true biological systems.

Com o intuito de fornecer subsídios para programas de melhoramento, conservação e expansão da raça Indubrasil do Nordeste brasileiro, avaliaram-se o histórico evolutivo, as estimativas de parâmetros genéticos e a estrutura populacional da raça. Foram utilizadas informações do pedigree de animais nascidos no período de 1964 a 2006 e dados dos pesos ajustados aos 205, 365 e 550 dias de idade de bovinos nascidos a partir de 1976. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade foram menores que as encontradas na literatura para os pesos ajustados nas três idades (P205: direta 0,11 ± 0,03 e materna 0,01 ± 0,03; P365: direta 0,16 ± 0,04 e P550: direta 0,15 ± 0,05) e os ganhos genéticos para as características decresceram no período avaliado (P205: -0,028 kg/ano; P365: -0,030 kg/ano e P550: -0,025 kg/ano). A baixa variabilidade genética e o ganho genético negativo provavelmente devem-se à redução do tamanho efetivo e ao aumento da endogamia nesse período. Além disso, a redução significativa no número de nascimentos por ano e a pouca utilização de reprodutores externos nos rebanhos colocam a raça Indubrasil do Nordeste brasileiro como um grupo genético sob risco de extinção, fato que sugere a necessidade de programas visando sua conservação e expansão.In order to provide knowledge for breeding, conservation programs and expansion policies of the Indubrasil breed from northeastern Brazil, the evolutionary history, estimates of genetic parameters and the populational structure of the breed were studied. Pedigree information was used from animals born from 1964 to 2006 and the adjusted weights at 205, 365 and 550 days of age of bovines born from 1976 onwards. The heritability coefficient estimates were lower than those reported in the literature for the adjusted weights at the three ages (P205: direct 0.11 ± 0,03 and maternal 0.01 ± 0.03; P365: direct 0.16 ± 0.04 and P550: direct 0.15 ± 0.05) and the genetic gains for the evaluated traits decreased in the sampled period (P205: -0.028 kg/year; P365: -0.030 kg/year and P550: -0.025 kg/year). The low genetic variability and the reduced genetic gains were probably due to a reduction in the effective size and increasing inbreeding within the period. Furthermore, the drastic reduction in the number of births per year and the low use of unrelated sires within the herds make the Indubrasil breed a genetic group potentially threatened by extinction, so that conservationist and expansion programmes should be set up.

Foram avaliadas as razões entre componentes da variabilidade de características quantitativas simuladas a partir de genoma incorporando efeitos genéticos não-aditivos em populações de acasalamento ao acaso e de seleção fenotípica a curto prazo. Estudaram-se uma característica de baixa (h² = 0,10) e outra de alta herdabilidade (h² = 0,60) influenciadas por 600 locos bialélicos. Cinco modelos de ação gênica foram simulados, dos quais quatro incluíram dominância completa e positiva para 25, 50, 75 e 100% dos locos (D25, D50, D75 e D100, respectivamente); e um modelo incluiu sobredominância positiva para 50% dos locos. Todos os modelos incluíram efeitos aditivos dos alelos para 100% dos locos. As principais razões quantificadas foram d² (variância de dominância/variância fenotípica) e d²a (variância de dominância/variância aditiva). Para as duas características, d² e d²a aumentaram de acordo com o acréscimo na variância de dominância, decorrente da inclusão crescente de locos com desvio da dominância e sob sobredominância. No mesmo modelo, ambas as razões, sobretudo d², são mais elevadas sob alta herdabilidade, o que indica que os efeitos da dominância explicam a maior parte da variabilidade total dessa característica sob seleção.Ratios were assessed between variability components of quantitative traits simulated from the genome incorporating non-additive genetic effects in random mating populations and short-term phenotypic selection. A trait of low (h² = 0.10) heritability and another of high (h² = 0.60) heritability were studied, both influenced by 600 bi-allelic loci. Five gene action models were simulated, of which four included complete and positive dominance for 25, 50, 75 and 100% of the loci (D25, D50, D75 and D100, respectively); and one model included positive overdominance for 50% of the loci. Every model included additive effects of the alleles for 100% of the loci. The main quantified ratios were d² (dominance variance/phenotypic variance) and d²a (dominance variance/additive variance). For both traits, d² and d²a increased according to the increase in the variance of dominance with the growing inclusion of loci with dominance deviation and under overdominance. For the same model, both ratios, especially d², are greater under high heritability, that indicates that the dominance effects explain the greater part of the total variability of this trait under selection.

The aim of this study was to compare two selection criteria for growth speed in beef buffaloes. For this purpose, the traits “daily weight gain from birth to wean” (GWB) and “days to gain 160 kg from birth to wean” (D160) had been compared. To compare both criteria, we used Pearson and Spearman correlation of the predicted breeding values of each individual. The direct heritability estimative for both traits were similar and equal to 0.42. As for the maternal heritability, the values presented low magnitude, being equal to 0.05 and 0.03 for GWB and D160, respectively. A high degree of Pearson and Spearman correlation was observed between both selection criteria when all animals were analyzed. However, the scoring of the best 20 breeders was modified according to the selected criterion.KEY WORDS: Buffalo, daily weight gain, growth precocity. O objetivo deste trabalho foi comparar dois critérios de seleção para velocidade de crescimento em bubalinos de corte. Para essa finalidade foram comparadas as características, o ganho médio diário de peso do nascimento ao desmame (GND) e dias para ganhar 160 kg do nascimento ao desmame (D160). Para a comparação dos dois critérios estudados, utilizaram-se as correlações de Pearson e Spearman dos valores genéticos preditos dos animais. As estimativas dos coeficientes de herdabilidades (efeito direto) para as duas características foram semelhantes e iguais a 0,42. Já as herdabilidades maternas foram de baixa magnitude e iguais 0,05 e 0,03, para GND e D160, respectivamente. Constatou-se alto grau de correlação, de Pearson e Spearman, entre os dois critérios de seleção, quando analisados todos os animais. Entretanto, a classificação dos vinte melhores touros foi modificada pelo critério de seleção adotado. PALAVRAS-CHAVES: Búfalo, ganho de peso diário, precocidade de crescimento.

O objetivo deste trabalho foi avaliar o histórico do rebanho Nelore Puro de Origem no Sertão Nordestino por meio da determinação de sua estrutura populacional e da quantificação do progresso genético, fenotípico e ambiental ocorrido em características de desenvolvimento ponderal. Foram utilizadas informações de pedigree de animais nascidos no período de 1964 a 2006 e dados das massas corporais ajustadas aos 205 e 365 dias de idade de bovinos nascidos de 1978 a 2006. O pequeno número de ancestrais explicou a baixa variabilidade genética e os reduzidos valores dos coeficientes de herdabilidade observados para as características de crescimento. O coeficiente de endogamia média e a percentagem de animais endogâmicos na população aumentaram no decorrer das gerações. Contudo, o coeficiente de endogamia médio dos animais endogâmicos diminuiu, o que é indicativo de que os acasalamentos entre parentes próximos estão sendo evitados. O tamanho efetivo da população oscilou de 100 a 200 animais em quase todo o período estudado. Não se constatou ganho genético no período. Contudo, a raça obteve um considerável ganho fenotípico ocasionado por melhorias ambientais.The objective of this study was to evaluate the Pure Nelore cattle breed background in the Brazilian Northeastern Sertão region by determining its population structure and quantifying genetic, phenotypic and environmental progress based on ponderal development traits. Pedigree data of animals born between 1964 and 2006 and weight values, adjusted to 205 and 365 days of age, of bovines born between 1978 and 2006 were used. The small number of ancestors explained the population's low genetic variability and the reduced heritability coefficient values observed for growth traits. The mean inbreeding coefficient and the percentage of endogamic animals within the population increased over the generations. However, the mean inbreeding coefficient of endogamic animals decreased over the generations, indicating that mating between closely related individuals is being avoided. The effective size of the population ranged from 100 to 200 animals throughout nearly all of the studied period. No genetic gains were detected for this period. Nevertheless, a remarkable phenotypic gain was obtained due to environmental improvements.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura populacional e o progresso genético e fenotípico de características de desenvolvimento ponderal, em bovinos da raça Nelore, no Estado da Bahia. Foram utilizadas informações de pedigree de animais nascidos no período de 1955 a 2007, e dados dos pesos ajustados aos 205, 365 e 550 dias de idade, de bovinos nascidos de 1970 a 2006. As estimavas dos coeficientes de herdabilidade foram de moderadas a altas, quanto aos pesos ajustados nas três idades. Os rebanhos apresentaram ganho genético positivo nas três características, porém, de baixa magnitude. A mudança fenotípica no decorrer dos anos foi quase exclusivamente relacionada à melhoria ambiental. O tamanho efetivo da população de Nelore do Estado da Bahia tem sido alto em alguns períodos, o que tem levado a menor incremento de endogamia e maiores ganhos genéticos. O intervalo de geração é alto e sua redução é importante para que se possa alcançar maior ganho genético anual.The objective of this work was to evaluate the population structure as well as the genetic and phenotypic progress in growth development traits of Nellore cattle raised in Bahia state, Brazil. Pedigree data of bovines, born between 1955 and 2007, and weight values adjusted to 205, 365, and 550 days of age, from 1970 to 2006, were used. The heritability coefficients were moderate to high for the adjusted weights, in all three ages. The herds presented a positive but small genetic gain. The phenotypic changes over years were almost exclusively related to environmental improvements. The effective size of the Nellore population raised in Bahia state has increased over some periods, thereby decreasing the inbreeding rate and leading to higher genetic gains. The generation interval is high and its reduction is important, in order to increase the annual genetic gain.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura populacional e os progressos genéticos, fenotípicos e ambientais de características de desenvolvimento ponderal, em bubalinos da raça Mediterrâneo. Foram utilizadas informações dos pesos ajustados aos 205, 365 e 550 dias de idade, de 6.243 bubalinos nascidos no período de 1974 a 2003, provenientes de quatro fazendas. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade foram altas para os pesos ajustados nas três idades. Os rebanhos apresentaram ganho genético positivo quanto a essas três características, porém, aquém do possível, provavelmente em razão da seleção baseada somente no fenótipo, realizada pelos produtores. Para aumento nos ganhos genéticos, são necessários a redução do intervalo de geração, o aumento do tamanho efetivo, o uso de reprodutores avaliados com base nos valores genéticos preditos pelo BLUP e o controle dos acasalamentos de animais aparentados.The objective of this work was to evaluate the population structure as well as the improvement of genetic, phenotypic, and environmental effects on growth development of Mediterranean water buffaloes, raised in Brazil. Information on weight adjusted at 205, 365, and 550 days of age of 6,243 buffaloes from four farms, which were born between 1974 and 2003, were used. Heritability coefficients for weight were high at the three ages. The herds presented a positive genetic gain in the three analyzed traits, although lower than expected, what was likely to be caused by empirical phenotype-based selection used by the local breeders. In order to improve genetic gains, it is necessary to decrease the generation interval, to increase the effective size, to use reproducers whose genetic values have been previously evaluated by BLUP, and to avoid mating between related animals.

Para estudar os efeitos de heterogeneidade sobre a avaliação genética de bovinos, foram simuladas várias estruturas de dados com heterogeneidade para diferentes parâmetros, com e sem conexidade genética entre rebanhos. O “software” Genesys foi usado para gerar os dados e a metodologia MTDFREML para analisar estes dados. Os valores mais baixos de correlações de ordem (correlação de Spearman) entre valores genéticos verdadeiros e preditos foram obtidos para a estrutura de dados em que os rebanhos apresentavam heterogeneidade para todos os parâmetros. Para as estruturas de dados com médias genéticas similares e heterogeneidade para outros parâmetros, as correlações entre valores genéticos foram superiores a 70% e próximas às obtidas para dados sem heterogeneidade, indicando que a heterogeneidade para variâncias e média fenotípica tem pequeno efeito sobre a avaliação genética. A alta conexidade genética dos dados melhorou a predição dos valores genéticos de touros, mas este efeito não foi notado na avaliação genética das progênies e, principalmente, das vacas. As correlações de ordem calculadas com base nas predições das análises de característica única e de características múltiplas foram muito semelhantes, indicando que a análise de características múltiplas não foi eficiente para eliminar os problemas de heterogeneidade para média genética.In order to study the effects of heterogeneity on bovine geneticevaluation, several structures of data were simulated with heterogeneity for different parameters, with and without genetic connexity among herds. The Genesys software was used to generate the data and the MTDFREML metodology was employed to analyze thisdata. The lowest values of the rank correlations (Spearman correlation) were obtained for the data structure of herds with heterogeneity for all parameters. For the structures of data with similar genetic means and heterogeneity for others parameters, the correlations between breeding values were greater than 70% and near those obtained for data without heterogeneity, which indicates that the heterogeneity for variances and phenotypic mean has little effect on genetic evaluation. The high genetic connexity of data improved theprediction of breeding values of bulls, but this effect was not noted for progenies and, mainly, the genetic evaluation of cows. The rank correlations based on predictions from single and multiple traits analysis were very similar, indicating that the multiple trait analysis was not efficient in eliminating the problems of genetic means heterogeneity.

In the present work, morphometric and cytogenetic analyses were carried out in populations of the fish Astyanax fasciatus (Characidae) from Contas and Recôncavo Sul River basins (State of Bahia, Brazil), providing new data on the genetic structure of this species along the region. Based on morphologic measurements, we observed that populations from the same hydrographic basin were more similar to each other (Contas and Preto do Costa Rivers), and remarkably divergent from Recôncavo Sul (Mineiro Stream), as indicated by clustering analysis. Cytogenetic data revealed a same diploid number for all populations (2n = 48), but distinct karyotype formulae (8M+24SM+12ST+4A, FN = 92 in Contas River, 8M+24SM+10ST+6A, FN = 90 in Preto do Costa River, and 8M+18SM+16ST+6A, FN = 90 in Mineiro Stream). Ag-NORs were identified at telomeres on a subtelocentric chromosome pair, although multiple ribosomal sites have been detected in some specimens from Contas River. These results show that A. fasciatus populations from northeastern river basins are well differentiated and present peculiar cytogenetic features when compared to populations from other regions. Therefore, the apparent chromosomal plasticity of this species, likely to represent a complex of cryptic forms, is corroborated. Finally, we demonstrated that morphological features can be successfully used to support other sources of genetic information.

O objetivo deste trabalho foi comparar o desenvolvimento ponderal, por meio de curva de crescimento e pesos ajustados e avaliar a diversidade entre ovinos cruzados Dorper com as raças locais, com base em características de carcaça e morfológicas. Foram realizadas pesagens dos animais cruzados em intervalos de aproximadamente 15 dias e avaliados os efeitos de sexo, ano e grupo genético. Na estimativa dos parâmetros das curvas, foi utilizado o modelo não-linear Logístico e, a fim de avaliar o grau de similaridade entre os animais dos grupos genéticos, foram utilizadas variáveis canônicas. O sexo dos animais não influenciou o peso. Houve efeito de ano e grupo genético sobre o desenvolvimento dos animais. Conforme o modelo Logístico para a curva de crescimento, o grupo genético Dorper x Santa Inês apresentou maior velocidade de crescimento, estimado pelo peso à maturidade e taxa de maturação, seguido dos grupos genéticos Dorper x Morada Nova e Dorper x Rabo Largo. A análise de agrupamento ressaltou as diferenças entre os grupos genéticos e alocou os três cruzamentos em dois grupos, um formado pelos cruzamentos Dorper x Morada Nova e Dorper x Rabo Largo e o outro pelo cruzamento Dorper x Santa Inês.The goal of this work was to compare growth rate, by mean of growth and adjusted weight curves, and to analyze the diversity among crosses of Dorper ovines and local breeds, based on morphological and carcass features. Crossed animals were weighed in a 15-day-interval and the effects of sex, year and genetic group were analyzed. The non-linear Logistic model was used to estimate curve parameters and the degree of similarity among genetic groups was evaluated through canonic variables. Sex did not influence significantly on weight. There was a significant effect related to year and genetic group over animal's development. The estimates of growth curve based on parameters from the Logistic model indicated that the genetic group Dorper x Santa Inês presented a faster growth rate, as estimated by weight at maturity and maturity rate, followed by the genetic groups Dorper x Morada Nova and Dorper x Rabo Largo. Clustering analysis reinforced the differences among genetic groups, placing the three crosses in two groups, one comprising Dorper x Morada Nova and Dorper x Rabo Largo, and another including the cross Dorper x Santa Inês.

Objetivou-se estimar os parâmetros e avaliar as tendências genética e fenotípica para a produção de leite ajustada aos 305 dias em bubalinos da raça Murrah nascidos no período de 1982 a 2003. Os parâmetros e os valores genéticos foram estimados por meio do aplicativo MTDFREML. A tendência genética foi estimada pela regressão dos valores genéticos sobre o ano de nascimento, por duas metodologias: 1) regressão linear; 2) regressão por meio de polinômios articulados utilizando-se a função de alisamento spline. A herdabilidade e a repetibilidade estimadas foram de 0,20 e 0,36, respectivamente. As tendências (regressão linear) fenotípica e genética foram significativas e iguais a 32,86 e 0,85 kg/ano, respectivamente. O ganho genético foi positivo, constatando-se instabilidade na tendência genética no decorrer dos anos, com períodos de ganhos e outros de perdas genéticas. A maior parte do ganho observado em alguns períodos resultou de melhorias nas condições ambientais.This study aimed to estimate genetic and phenotypic parameters and trends for adjusted 305 days milk yield of Murrah buffaloes, which were born from 1982 to 2003. Variance components, genetic parameters and breeding values were obtained using the MTDFREML program. Genetic trends were estimated by regression of breeding values on birth year of the animals by two methodologies: 1) linear regression and 2) articulated polynomial regression using a spline smoothing function. Heritability and repeatability estimates were 0.20 and 0.36, respectively. Phenotypic and genetic trends (by linear regression) were significant and equal to 32.86 and 0.85 kg/year, respectively. The genetic trend was positive but very unstable during the period. Most of the gain observed was due to environmental improvements.