Thierry Fournier, Caroline Manet, Kenzo-Hugo Hillion, Thérèse Couderc, Emeline Perthame, Julian Buchrieser, Françoise Porrot, Séverine A. Degrelle, Marc Lecuit, Olivier Schwartz, Daniel A. Donahue, Quentin Nevers, Anne Dupressoir, Sylvie Souquere, Olivier Disson, Thierry Heidmann, Marlene V. Arroyo, Katinka Ruigrok, Xavier Montagutelli, Virus et Immunité - Virus and immunity, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine : Microbiote pré & post natal (3PHM - UMR-S 1139), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Inovarion [Paris], Biologie des Infections - Biology of Infection, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique fonctionnelle de la Souris, Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Howard Hughes Medical Institute [New York] (HHMI), Howard Hughes Medical Institute (HHMI)-New York University School of Medicine, NYU System (NYU)-NYU System (NYU)-Rockefeller University [New York]-Columbia University Irving Medical Center (CUIMC), Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse (AMMICa), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Virologie Structurale - Structural Virology, Rétrovirus endogènes et éléments rétroïdes des eucaryotes supérieurs (UMR 9196), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Vaccine Research Institute (VRI), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Work in the laboratory of O.S. is funded by Institut Pasteur, ANRS, Sidaction, the Vaccine Research Institute (ANR-10-LABX-77), Labex IBEID (ANR-10-LABX-62-IBEID), 'TIMTAMDEN' ANR-14-CE14-0029, 'CHIKV-Viro-Immuno' ANR-14-CE14-0015-01, CNRS and the Gilead HIV cure program. Work in the laboratory of M.L. is funded by Institut Pasteur, INSERM, ERC, Labex IBEID (ANR-10-LABX-62-IBEID), Institut Convergence, and Université Paris Descartes. C.M. was supported by a fellowship from grant no. ANR-10-LABX-62-IBEID. M.V.A. was supported by NSF GRFP grant no. 1644869., We thank members of the Virus and Immunity Unit for discussions and help, M. Maaran Rajah for critical reading of the manuscript. We thank patients who participated in the study. We also thank members of Embryology and Core Breeding teams (DTPS-C2RA-Central Animal Facility platform) for technical support with strain revivification, M. Cohen-Tannoudji for hosting mouse experiments. We thank the Cellular and Molecular Imaging facility of the Faculty of Pharmacy of Paris (UMS3612 CNRS/US25 INSERM), and the UtechS Photonic BioImaging (Imagopole)., ANR-10-LABX-0077,VRI,Initiative for the creation of a Vaccine Research Institute(2010), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-14-CE14-0029,TIMTAMDEN,Rôle des récepteurs TIM et TAM dans l'infection des cellules cibles par le virus de la dengue(2014), ANR-14-CE14-0015,CHIKV-Viro-Immuno,Multiplication et Relation avec l'hôte du virus Chikungunya(2014), Virus et Immunité - Virus and immunity (CNRS-UMR3569), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Vaccine Research Institute [Créteil, France] (VRI), Virus et Immunité, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris], Howard Hughes Medical Institute [New York], New York University School of Medicine, NYU System (NYU)-NYU System (NYU)-Columbia University Irving Medical Center (CUIMC)-Rockefeller University [New York], Virologie Structurale, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Institut des Maladies Génétiques Imagine [Paris], Institut des Maladies Génétiques Imagine [Paris], ANR-10-LABX-0077/10-LABX-0077,VRI,Initiative for the creation of a Vaccine Research Institute(2010), ANR-10-LABX-62-IBEID,IBEID,Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases'(2010), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)