16 results on '"Office français pour la Biodiversité"'
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2. European flounder foraging movements in an estuarine nursery seascape inferred from otolith microchemistry and stable isotopes
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Nils Teichert, Anne Lizé, Hélène Tabouret, Jean-Marc Roussel, Gilles Bareille, Thomas Trancart, Anthony Acou, Laure-Sarah Virag, Christophe Pécheyran, Alexandre Carpentier, Eric Feunteun, Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Station marine Dinard, Centre De Recherche et d'Enseignement sur les Systèmes Côtiers (CRESCO), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), University of Liverpool, Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux (IPREM), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan (DECOD), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pôle OFB-INRAE-Institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement (MIAME), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Rennes (UR), This study was conducted with the financial support of the Agence de l’Eau Seine Normandie and the Office Français pour la Biodiversité., Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Patrimoine naturel (PatriNat), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Office français de la biodiversité (OFB), and This study was conducted with the financial support of the Agence de l’Eau Seine Normandie and the Office Français pour la Biodiversité
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Nursery ,Platichthys flesus ,Estuary ,Otolith chemistry ,General Medicine ,Dispersion ,Aquatic Science ,Oceanography ,Pollution ,Home range ,Isotopes ,[SDE]Environmental Sciences ,[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology ,Feeding strategy - Abstract
International audience; Despite the importance of estuarine nurseries in the regulation of many fish stocks, temporal and spatial movements and habitat use patterns of juvenile fish remain poorly understood. Overall, combining several movement metrics allowed us to characterize dispersal patterns of juvenile flounder, Platichthys flesus, along an estuarine seascape. Specifically, we investigated otolith microchemistry signatures (Sr:Ca and Ba:Ca ratios) and stable isotope ratios (δ13C and δ15N) in muscles of these juveniles, during three consecutive years to assess inter-annual fluctuations in their home range and isotopic niches. The morphological condition and lipid content of individuals were lower in years of high as compared to low dispersal along the estuarine gradient. We discuss these results in relation to the ecosystem productivity and intra- and inter-specific competition level, which in turn affects movements and foraging behaviors of juvenile flounders.
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3. Du Projet intégré LIFE 16 IPE/FR001 Marha – MarHa A3T2 Rapport final - Approfondissement de la connaissance des évènements sportifs sur le Domaine Public Maritime du Parc Naturel Marin des Estuaires Picards et de la Mer d'Opale
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Audouit, Christelle, Herbert, Vincent, Lo Prete, Mariantonia, Haultcoeur, Pauline, Territoires, Villes, Environnement & Société - ULR 4477 (TVES), Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille, Université de Lille, Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO), Cette étude a été financée par l'Office Français pour la Biodiversité, and TVES ULR 4477
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representation ,event for outdoor activites ,Natura 2000 ,survey ,[SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography ,[SHS]Humanities and Social Sciences - Abstract
In 2021, one of the Parc Naturel Marin des Estuaires Picards et de la Mer d'Opale's requests to TVES ULR 4477 was to find out about the real difficulties organisers have in completing the impact assessment in order to consider a method of use that could help them, and to better understand their constraints in organising sporting events in these specific environments. The EPMO NIP would like to spend more time upstream of the "impact assessment opinion" phase, by creating awareness-raising and information tools to avoid finding itself in this position. To this end, the main objectives for this study, as defined between TVES ULR 4477 and the NIP, are - to characterise the event and gain a better understanding of the organising structure's operations- to find out what motivates the organisers to propose events on the Public Maritime Domain;- to find out about their knowledge and perceptions of environmental issues;- Identify the environmental pressures generated and how they are taken into account in the organisation of events;- identify the difficulties encountered in the NATURA 2000 impact assessment process.; En 2021, l'une des demandes du PNM à TVES ULR 4477 a été de connaître les réelles difficultés des organisateurs à remplir l’évaluation d’incidence afin d’envisager un mode d’emploi qui pourrait les aider, et de mieux comprendre leurs contraintes quant à l'organisation des évènements sportifs dans ces milieux spécifiques. Le PNM EPMO souhaite consacrer plus de temps en amont de la phase "avis sur l'évaluation d'incidence", et ce par le biais de la création d’outils de sensibilisation et d'informations afin d'éviter de se retrouver dans cette position. Pour ce faire les objectifs principaux pour cette étude définis entre TVES ULR 4477 et le PNM sont : -caractériser l’événement et mieux connaître le fonctionnement de la structure organisatrice;-connaître les motivations des organisateurs à proposer des manifestations sur le Domaine Public Maritime;-connaître les connaissances et perceptions sur les enjeux environnementaux;-identifier les pressions environnementales engendrées et leurs prises en compte dans l’organisation des événements;-identifier des difficultés rencontrées dans les démarches d’évaluation des incidences NATURA 2000.
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- 2022
4. Growth variation in the endangered fish Zingel asper : Contribution of substrate quality, hydraulics, prey abundance, and water temperature
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Gauthier Monnet, Emmanuel Corse, Gaït Archambaud‐Suard, Rémi Grenier, Rémi Chappaz, Vincent Dubut, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of British Columbia (UBC), Centre Universitaire de Formation et de Recherche de Mayotte (CUFR), Risques, Ecosystèmes, Vulnérabilité, Environnement, Résilience (RECOVER), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), agence de l'Eau Rhône Méditerranée Corse (AERMC), Office Français pour la biodiversité(OFB), Conseil Régional Auvergne-Rhône-Alpes, Conseil Régional de Bourgogne-Franche-Comté, Conseil Régional Provence-Alpes-Côte-d'Azur, Direction Régionale pourl'Environnement, l'Aménagement et leLogement PACA (DREAL PACA), Electricité de France (EDF), Parc Naturel Régional du Verdon (PNRV), and Syndicat Mixte d'Aménagement de la Vallée de la Durance (SMAVD)
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scalimetry ,Ecology ,percids ,conservation ,Aquatic Science ,ZABR ,[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology ,life histories ,phenotypic plasticity ,Nature and Landscape Conservation ,trade-off - Abstract
International audience; Intraspecific variation in life histories and its environmental correlates can indicate the degree of vulnerability to extinction of endangered taxa and guide conservation actions. Zingel asper (Percidae) is an endangered fish endemic to the Rhône catchment (France and Switzerland), where five populations subsist in separate river systems (Loue, Beaume, Durance, Verdon, and Doubs). Two populations of Z. asper differ in growth and longevity, but the existence of broader intraspecific differentiation in life histories and the environmental origins of this variation (if any) remain unknown. The age structure and growth profile of four populations of Z. asper (Loue, Beaume, Durance, and Verdon) and nine additional sub-populations within the Durance system were determined by scale-reading analysis, before evaluating the contribution of measured variation in substrate quality, hydraulics, prey availability, and water temperature to growth differentiation among and within populations. A trade-off between early growth and longevity largely differentiated the populations of Z. asper along a slow (i.e. slower growth, smaller adult size, longevity of >5 years) to fast (i.e. faster growth, larger adult size, longevity of
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5. A multi-approach study to reveal eel life-history traits in an obstructed catchment before dam removal
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Nils Teichert, Anne Lizé, Hélène Tabouret, Claudia Gérard, Gilles Bareille, Anthony Acou, Alexandre Carpentier, Thomas Trancart, Laure-Sarah Virag, Emma Robin, Morgan Druet, Jordan Prod’Homme, Eric Feunteun, Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux (IPREM), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre De Recherche et d'Enseignement sur les Systèmes Côtiers (CRESCO), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Patrimoine naturel (PatriNat), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Office français de la biodiversité (OFB), Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agence de l’Eau Seine Normandie, and Office Français pour la Biodiversité
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[CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry ,River barrier ,[CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers ,[CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry ,Otolith microchemistry ,Life-history trait ,Metazoan parasites ,Phenotypic plasticity ,[CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry ,Aquatic Science ,LA-ICP-MS - Abstract
International audience; River fragmentation is expected to impact not only movement patterns and distribution of eels within catchment, but also their life-history traits. Here, we used otolith multi-elemental signatures to reconstruct life sequences of European silver eels within an obstructed catchment, just before the removal of hydropower dams. Beyond providing an initial state, we hypothesized that otolith signatures can provide crucial information on the way eels use the watershed. Indeed, their spatial distribution is expected to shape life-history traits, including condition coefficient, trophic level, growth rate, or infection by metazoan parasites. While Sr:Ca and Ba:Ca ratios were complementary in tracing fish movements between freshwater and estuary, the Ba:Ca variations allowed to discriminate three freshwater sectors. The eels assigned to the midstream sector were more mobile and exhibited lower growth rates, probably in response to higher competition at the vicinity of dams. While most eels are currently produced by downstream and midstream sectors, eels assigned to upper reaches of connected tributaries generally display higher richness in native parasite and higher body condition and lipid reserve, known to promote the success of migration and reproduction. In the near future, the dam removals will represent an outstanding experimental framework for evaluating impacts of catchment reconnection.
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6. Weed communities are more diverse, but not more abundant, in dense and complex bocage landscapes
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Sébastien Boinot, Cendrine Mony, Guillaume Fried, Aude Ernoult, Stéphanie Aviron, Claire Ricono, Eloïse Couthouis, Audrey Alignier, Biodiversité agroécologie et aménagement du paysage (UMR BAGAP), Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LTSER Zone Atelier Armorique (LTSER), Unité entomologie et plantes invasives (LSV Montpellier), Laboratoire de la santé des végétaux (LSV), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), and La Fondation de France (DIVERSIT'HAIES project) financially supports the postdoctoral research of SB. This project received financial support from the Office Français pour la Biodiversité (AGRIM project) and the Zone Atelier Armorique (DIVAG project).
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Ecology ,agroecological weed management ,organic farming ,[SDE]Environmental Sciences ,plant spillover ,environmental heterogeneity ,landscape ,functional diversity ,hedgerow ,agroforestry - Abstract
International audience; 1.Bocage landscapes are characterized by a network of hedgerows that delimits arable fields. Such landscapes provide many ecosystem services, including biodiversity conservation, but their effects on weed communities remain largely unknown. Bocage landscapes could affect weed communities through two main processes: plant spillover from hedgerows and increased environmental heterogeneity in arable fields. These bocage effects are also likely to vary between farming systems (conventional vs organic), due to differences in management practices.2.We sampled weed communities more than 20 m from field margins in 74 arable fields (37 per farming system). Fields were located along two independent landscape gradients of total length of hedgerows (with or without a shrub layer) and organic farming cover, in Brittany (France). We analysed the effect of ‘bocage’ (i.e., the density and complexity of hedgerow networks) and farming systems at field and landscape scales on species and functional diversity of weed communities. Further, we used fidelity to non-crop habitats and Ellenberg indicator values to assess the ‘plant spillover’ and ‘environmental heterogeneity’ hypotheses, respectively.3.Weed communities were more diverse and more abundant in organic farming systems. In addition, weed communities were more diverse, but not more abundant, in denser and more complex bocage landscapes. ‘Bocage’ increased species diversity of weeds, but also community-weighted variance of specific leaf area, plant height and seed mass. Positive effects of ‘bocage’ on weed diversity were driven by increased environmental heterogeneity rather than spillover of transient species from hedgerows. ‘Bocage’ effects were independent of farming systems at field and landscape scales.4.Synthesis and applications. Maintaining diverse weed communities is key to agroecological weed management and biodiversity conservation in agricultural landscapes. Farmers are often concerned that hedgerows harbour competitive plants spreading into field edges, thereby increasing weed pressure. However, our study shows that dense and complex bocage landscapes promote weed diversity in field cores, most likely by increasing environmental heterogeneity. Thus, bocage landscapes could actually enhance ecosystem services provided by weed communities and reduce weed-crop competition.; 1. Les paysages bocagers sont caractérisés par un réseau de haies qui délimite les champs cultivés. Ces paysages fournissent de nombreux services écosystémiques, y compris la conservation de la biodiversité, mais leurs effets sur les communautés adventices restent largement méconnus. Les paysages bocagers pourraient affecter les communautés adventices par le biais de deux mécanismes principaux : la dispersion des plantes depuis les haies et l'augmentation de l'hétérogénéité environnementale dans les champs cultivés. Ces effets du bocage sont également susceptibles de varier selon les modes de production (conventionnels ou biologiques), qui se caractérisent par des pratiques de gestion différentes.2. Nous avons échantillonné les communautés adventices à plus de 20 m des bordures de champs dans 74 champs cultivés (37 par mode de production). Les champs étaient situés le long de deux gradients paysagers indépendants de longueur totale en haies (avec ou sans strate arbustive) et de surface totale en agriculture biologique, en Bretagne (France). Nous avons analysé l'effet du bocage (c'est-à-dire la densité et la complexité des réseaux de haies) et des modes de production à l'échelle du champ et du paysage sur la diversité spécifique et fonctionnelle des communautés adventices. De plus, nous avons utilisé la fidélité aux habitats non cultivés et les valeurs indicatrices d'Ellenberg pour évaluer les hypothèses de dispersion depuis les haies et d'hétérogénéité environnementale, respectivement.3. Les communautés adventices étaient plus diversifiées et plus abondantes dans les systèmes en agriculture biologique. De plus, les communautés adventices étaient plus diversifiées, mais pas plus abondantes, dans les paysages bocagers denses et complexes. Le bocage augmentait la diversité spécifique des adventices, mais aussi la variance pondérée communautaire de la surface foliaire spécifique, de la hauteur des plantes et de la masse des graines. Les effets positifs du bocage sur la diversité adventice sont vraisemblablement dus à l'augmentation de l'hétérogénéité environnementale plus qu’à la dispersion d’espèces transitoires provenant des haies. Les effets du bocage étaient par ailleurs indépendants des modes de production à l'échelle du champ et du paysage.4. Synthèse et applications. Le maintien de la diversité adventice est essentiel à la gestion agroécologique des adventices et à la conservation de la biodiversité dans les paysages agricoles. Les agriculteurs sont souvent préoccupés par le fait que les haies abritent des plantes compétitives qui se propagent en bordure des champs, augmentant ainsi la pression en adventices. Cependant, notre étude montre que les paysages bocagers denses et complexes favorisent la diversité adventice au cœur des champs cultivés, très probablement en augmentant l'hétérogénéité environnementale. Ces résultats suggèrent que les paysages bocagers pourraient en fait améliorer les services écosystémiques fournis par les communautés adventices et réduire leur compétitivité.
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7. Questionner l’efficacité de la gouvernance d’une AMP : le cas de Natura 2000 en mer
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Christelle Noirot, Marie Lesueur, Frédérique Chlous, Lucille Ritschard, Anne Cadoret, Hélène Rey-Valette, Paul Sauboua, Julie Delannoy, Jean-Eudes Beuret, Ludovic Martel, Espaces et Sociétés (ESO), Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université d'Angers (UA)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Le Mans Université (UM), Pôle halieutique, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Corse (UDC), Université Pascal Paoli (UPP), Temps, espaces, langages Europe méridionale-Méditerranée (TELEMME), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Patrimoines locaux, Environnement et Globalisation (PALOC), Sorbonne Université (SU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre d'Economie de l'Environnement - Montpellier - UMR 5211 (CEE-M), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), EID Méditerranée (EID Méditerranée), Etablissement public administratif, Le Mans Université (UM)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Lieux, Identités, eSpaces, Activités (LISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pascal Paoli (UPP), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Vertigo lab, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Office français pour la Biodiversité, Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Pascal Paoli (UPP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Università di Corsica Pasquale Paoli [Université de Corse Pascal Paoli], Partenaires INRAE, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU), Institut Agro Rennes Angers, Centre d'Economie de l'Environnement - Montpellier (CEE-M), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, and Office français de la biodiversité (OFB)
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0106 biological sciences ,Social Sciences and Humanities ,marine environment ,environnement marin ,010501 environmental sciences ,01 natural sciences ,[SHS]Humanities and Social Sciences ,GE1-350 ,14. Life underwater ,0105 earth and related environmental sciences ,General Environmental Science ,gouvernance ,010604 marine biology & hydrobiology ,conservation ,Natura 2000 en mer ,[SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography ,15. Life on land ,[SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance ,aires marines protégées ,Environmental sciences ,governance ,Natura 2000 at sea ,General Earth and Planetary Sciences ,Sciences Humaines et Sociales ,marine protected areas - Abstract
Nous nous intéressons ici à la gouvernance d’une catégorie d’aires marines protégées, Natura 2000 en mer, et aux déterminants de l’efficacité de la gouvernance des sites. Après avoir constitué une base de données portant sur 158 sites localisés en France métropolitaine, un échantillon de 20 sites a été l’objet d’une analyse comparative par études de cas. Nous constatons d’abord qu’un même cadre standard est décliné, en réalité, de façons différentes selon les façades, régions et sites. La diversité des situations de gouvernance est déchiffrée à partir de l’identification de quatre facteurs discriminants : l’enchevêtrement (ou non) du site dans un autre dispositif de gestion territoriale, les temporalités de la gouvernance (en amont ou en aval du document d’objectifs), les proximités locales (préexistantes ou à créer), la situation géographique du site (côtier ou au large). L’analyse porte ensuite sur ce que produit la gouvernance, selon ses caractéristiques, avec différents types de plus-values (effets directs et effets-rebonds, ressources, actions et coordinations) qui ne se révèlent effectives que sous certaines conditions. Les facteurs qui fondent l’efficacité et la qualité de la gouvernance sont finalement caractérisés, au regard des objectifs du dispositif et différentes pistes d’amélioration en sont déduites., This article is focused on the governance of one type of Marine Protected Areas, namely Natura 2000 at sea. The aim is to identify what is determinant for the effectiveness of their governance. From a database of 158 sites located in Hexagonal France, 20 were used for comparative case-studies. The analysis of the database shows that despite an identical national framework, it is in fact implemented very differently according to the diversity of maritime frontage, regions and sites. To understand this diversity, we describe four discriminant factors: the overlapping of the Natura 2000 area within another territorial management zone, the governance temporalities (before or after the management plan), local proximities (pre-existing or to be created), the geographical location of the site (coastal or offshore). Then we analyze the effects and impacts of governance, according to their characteristics. Their added benefits are described (direct effect, rebound-effect, resources, actions and coordination), revealing that their effectiveness is nonetheless conditional. The effectiveness and quality of the governance are then characterized according to the objectives of Natura 2000 at sea and some improvements are suggested.
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- 2021
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8. Approfondissement de la connaissance de l’activité plaisance au sein du PNM de l’estuaire de la Gironde et de la mer des Pertuis - MarHa_A3T2 Rapport Final
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Cardinal, Jérôme, Audouit, C, Rufin-Soler, Caroline, Laboureur, M, Territoires, Villes, Environnement & Société - ULR 4477 (TVES), Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille, Contrat 'Développement et Recherche' financé par l'Office Français pour la Biodiversité, and TVES ULR 4477
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social representation ,conflict ,Ré island ,sailors ,Stackeholders ,[SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography ,eelgrass beds ,[SHS]Humanities and Social Sciences - Abstract
The issue of mooring on eelgrass beds is addressed by the Marine Natural Park of the Gironde Estuary and the Perth Sea (PNM EGMP), as it is included in the management plan approved on 26 June 2018.The TVES laboratory was mobilised to carry out a study on the uses and representations of stakeholders concerned by mooring on eelgrass beds in three sectors of the PNM EGMP, including the Ile de Ré. The objectives of the study are threefold :- to collect data on existing moorings and their dynamics over time. These dynamics provide information on the interplay between the players who govern these issues and give indications on the governance relationships which structure the existing facilities. - To understand the representations of the different stakeholders interviewed (association leaders, local elected representatives, mooring area managers, individual boaters, State services) in order to understand the power relationships. - To characterise the different representations which are grouped around these issues in order to understand the obstacles and levers to the concerted implementation of an organisational scheme for moorings on the Park scale.; La problématique des mouillages sur les herbiers de zostère est portée par le Parc naturel marin de l’estuaire de la Gironde et de la mer des Pertuis (PNM EGMP), car inscrite dans le plan de gestion approuvé le 26 juin 2018.Le laboratoire TVES a été mobilisé pour réaliser une étude sur les usages et représentations des acteurs concernés par les mouillages sur les herbiers de zostère sur trois secteurs du PNM EGMP, dont l'île de Ré. Les objectifs de l’étude sont de trois ordres :- récolter des données sur les mouillages existants et sur leur dynamique dans le temps. Ces dynamiques renseignent sur les jeux d’acteurs qui régissent ces problématiques et donnent des indications sur les rapports de gouvernance, qui structurent les aménagements existants. -appréhender les représentations des différentes parties prenantes interrogées (responsables associatifs, élus locaux, gestionnaires de zones de mouillage, plaisanciers individuels, services de l’État) pour comprendre les rapports de force et de pouvoir. -caractériser les différentes représentations qui s’agrègent autour de ces enjeux afin de saisir les freins et les leviers à la mise en place concertée d’un schéma d’organisation des mouillages à l’échelle du Parc.
- Published
- 2021
9. Quantitative estimates of freshwater fish stocking practices by recreational angling clubs in France
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Carsten Riepe, Robert Arlinghaus, Rémy Lassus, Frédéric Santoul, Mathieu Buoro, Julien Cucherousset, Paul Millet, Evolution et Diversité Biologique (EDB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Department of Biology & Ecology of Fishes, Leibniz Institute of Freshwater Ecology & Inland Fisheries, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Division of Integrative Fisheries Management, Humbolt University, Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ANR-13-EDIB-0002, Office Français pour la Biodiversité (OFB). Grant Number: SPECTRA, German Ministry of Education and Research. Grant Numbers: 01LC1320A, 033W046A, German Research Foundation (DFG). Grant Number: AR 712/4‐1, and Laboratoire d’Excellence (LABEX) TULIP. Grant Number: ANR‐10‐LABX‐41
- Subjects
0106 biological sciences ,angling club ,Fishing ,Aquatic Science ,01 natural sciences ,Stocking ,Recreational fishing ,14. Life underwater ,Recreation ,[SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment ,Ecology ,biology ,010604 marine biology & hydrobiology ,conservation ,stock enhancement ,04 agricultural and veterinary sciences ,biology.organism_classification ,Fishery ,Geography ,fisheries management ,recreational fisheries ,040102 fisheries ,Freshwater fish ,0401 agriculture, forestry, and fisheries ,Fisheries management ,[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology - Abstract
International audience; Although freshwater fish stocking is widely used by managers, quantitative assessments of stocking practices are lacking in many countries. The general objective of the present study was to determine the quantity and characteristics of fish stocking in metropolitan France. Using a survey‐based approach, stocking practices for 2013 by recreational angling clubs in France were quantified, which represented the bulk of fish stocking undertaken in that year. Stocking was found to be practiced by 88.6% of angling clubs in France, representing, on average, 65% of their annual budget. Overall, 22 species were stocked, including 13 native and nine non‐native species, with strong variations among species in terms of life stages and body sizes used for stocking. Using Bayesian modelling, a total biomass of 2.029 t, representing approximately 90 million fishes, was estimated to be stocked in France in 2013. In terms of biomass, the most widely stocked species were rainbow trout Oncorhynchus mykiss (Walbaum), brown trout Salmo trutta L., roach Rutilus rutilus (L.), common carp Cyprinus carpio L. and northern pike Esox lucius L. A stocking volume of approximately 60 fishes or 1.5 kg of fish biomass per angler per year seems commonplace in industrialised countries for which data are available
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- 2021
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10. Miniaturization of an extraction protocol for the monitoring of pesticides and polar transformation products in biotic matrices
- Author
-
Laure Wiest, Sylvain Slaby, Damien Banas, Vincent Dufour, Laurence Curtet, Lucile Auger, Xavier Dauchy, François Le Cor, Olivier Cardoso, Laure Pasquini, Emmanuelle Vulliet, Unité de Recherches Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux (URAFPA), Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), TRACES - Technologie et Recherche en Analyse Chimique pour l'Environnement et la Santé, Institut des Sciences Analytiques (ISA), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Office français de la biodiversité (OFB), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), and This project was funded by the 'Office Français pour la Biodiversité'.
- Subjects
Environmental Engineering ,Health, Toxicology and Mutagenesis ,0208 environmental biotechnology ,02 engineering and technology ,010501 environmental sciences ,01 natural sciences ,Polar transformation ,Matrix (mathematics) ,Dry weight ,Tandem Mass Spectrometry ,Macroinvertebrate ,[CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry ,Environmental Chemistry ,Animals ,Sample preparation ,Transformation product ,Pesticides ,LC-MS/MS ,0105 earth and related environmental sciences ,Miniaturization ,[SDE.IE]Environmental Sciences/Environmental Engineering ,Extraction (chemistry) ,Solid Phase Extraction ,Public Health, Environmental and Occupational Health ,Pesticide Residues ,General Medicine ,General Chemistry ,Pesticide ,Contamination ,Polar pesticide ,Pollution ,020801 environmental engineering ,Fish ,Environmental chemistry ,Environmental science ,%22">Fish ,Chromatography, Liquid - Abstract
The authors sincerely thank the fish farmers and owners for granting access to their ponds. They are also grateful to Alain Iurétig (sampling and pre-treatment, Univ. of Lorraine), Pamela Hartmeyer (pre-treatment, Univ. of Lorraine), Aisha Nunoo (extractions, Univ. of Lorraine/ISA), and Maud Dessein-Lepasteur (extractions and analysis, Univ. of Lorraine/ISA) for their work, as well as to Arnaud Chaumot and Laura Garnero from the Ecotoxicology Team of the UR RIVERLY (INRAE, Centre de Lyon-Villeurbanne) for providing chironomid larvae. They would also like to thank ABC Translation for proofreading the manuscript.; International audience; Monitoring pesticides in the environment requires the use of sensitive analytical methods. However, existing methods are generally not suitable for analyzing small organisms, as they require large matrix masses. This study explores the development of a miniaturized extraction protocol for the monitoring of small organisms, based on only 30 mg of matrix. The miniaturized sample preparation was developed using fish and macroinvertebrate matrices. It allowed the characterization of 41 pesticides and transformation products (log P from −1.9 to 4.8) in small samples with LC-MS/MS, based on European guidelines (European Commission DG-SANTE, 2019). Quantification limits ranged from 3 to 460 ng g−1 dry weight (dw) for fish and from 0.1 to 356 ng g−1 dw for invertebrates, with most below 60 ng g−1 dw. Extraction rates ranged from 70% to 120% for 35 molecules in fish. Recoveries ranged from 70% to 120% for 37 molecules in macroinvertebrates. Inter-day precision was below 30% for 32 molecules at quantification limits. The method was successfully applied to 17 fish and 19 macroinvertebrates collected from two ponds of the French region of Dombes in November and May 2018, respectively. Both sample matrices were nearly always contaminated with benzamide, imidacloprid-desnitro, and prosulfocarb at respective concentrations of 42–237, 3, and 30–165 ng g−1 dw in fish, and 62–438, 2–6, and 15–29 ng g−1 dw in macroinvertebrates. Results show that this method is an effective tool for characterizing polar pesticides in small biotic samples.
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- 2021
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11. Diet Metabarcoding Reveals Extensive Dietary Overlap between Two Benthic Stream Fishes (Zingel asper and Cottus gobio) and Provides Insights into Their Coexistence
- Author
-
Kurt Villsen, Emmanuel Corse, Gaït Archambaud-Suard, Kévin Héran, Emese Meglécz, Alexander V. Ereskovsky, Rémi Chappaz, Vincent Dubut, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Universitaire de Formation et de Recherche de Mayotte (CUFR), MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Risques, Ecosystèmes, Vulnérabilité, Environnement, Résilience (RECOVER), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), le Syndicat Mixte d’Aménagement de la Vallée de la Durance (SMAVD)l' Agence de l’Eau Rhône-Méditerranée-Corse (AERMC), le Conseil Régional de Provence-Alpes-Côte-d’Azur.Electricité de France (EDF)l'Office Français pour la Biodiversité (OFB)l'Ecole Doctorale des Sciences de l’Environnement (ED251, and Aix Marseille Université
- Subjects
Ecology ,Ecological Modeling ,coexistence ,conservation ,prey preferences ,Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous) ,dietary overlap ,trophic niche ,metabarcoding ,[SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology ,ZABR ,[SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition ,[SDV.EE.IEO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis ,Nature and Landscape Conservation - Abstract
International audience; Niche partitioning studies are essential to understand the mechanisms that allow ecologically similar species to coexist. The Rhone streber (Zingel asper) and the European bullhead (Cottus gobio) are both benthic riverine fishes that consume macroinvertebrates. Both species are protected under European legislature. We focused on trophic niche partitioning between these species, as sufficient access to trophic resources is an important requirement for long-term coexistence. We used a combination of faeces metabarcoding dietary data and prey community data to evaluate dietary overlap, trophic niche variation and dietary preferences. Sampling was performed in three sites along the Durance River (France). Both species consumed a wide range of macroinvertebrates but neither C. gobio nor Z. asper selected the most abundant taxa (chironomids and simuliids). Both species selected larger mayfly (Baetis and Ecdyonurus) and caddisfly (Hydropsyche) taxa. Dietary overlap was generally high but declined when large mayflies were rare. Contrasting secondary prey preferences and trophic niche variation may allow these species to exploit the same preferred mayflies in periods of abundance and to avoid competition during resource scarcity. We propose that dietary partitioning may support the coexistence of these two ecologically similar, benthic predators.
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- 2022
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12. Towards the development of ecosystem-based indicators of mangroves functioning state in the context of the EU water framework directive
- Author
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Guillaume Dirberg, Geneviève Barnaud, Olivier Brivois, Pierre Caessteker, Marie-Christine Cormier-Salem, Philippe Cuny, Maud Fiard, Francois Fromard, Gilbert Franck, Sandrine Grouard, Daniel Guiral, Cédric Hubas, Daniel Imbert, Dominique Lamy, Tarik Meziane, Emma Michaud, Claire Michelet, Cécile Militon, Alain Pibot, Christophe Proisy, Tony Robinet, Thomas Stieglitz, Lea Sylvi, Florent Taureau, Hélène Udo, Romain Walcker, Daniela Zeppilli, Olivier Monnier, Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Patrimoine naturel (PatriNat), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Office français de la biodiversité (OFB), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Office français de la biodiversité (OFB), Patrimoines locaux, Environnement et Globalisation (PALOC), Sorbonne Université (SU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements (AASPE), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université des Antilles (Pôle Guadeloupe), Université des Antilles (UA), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Français de Pondichéry (IFP), Ministère de l'Europe et des Affaires étrangères (MEAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN), IFREMER- Département Etude des Ecosystèmes Profonds (DEEP/LEP), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Office Français pour la Biodiversité, Office de l’Eau de Guyane, Office de l’Eau de Martinique, Office de l’Eau de Guadeloupe, ANR-10-LABX-0025,CEBA,CEnter of the study of Biodiversity in Amazonia(2010), Aix-Marseille Université - AMU (FRANCE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique - CIRAD (FRANCE), Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Collège de France (FRANCE), Institut français de Pondychéry - IFP (INDIA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la MER - IFREMER (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement - INRAE (FRANCE), Institut de Recherche pour le Développement - IRD (FRANCE), Sorbonne Université (FRANCE), Université de Bretagne Occidentale - UBO (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Université de Nantes (FRANCE), Office français de la biodiversité - OFB (FRANCE), Bureau de Recherches Géologiques et Minières - BRGM (FRANCE), Museum National d'Histoire Naturelle - MNHN (FRANCE), Université de Montpellier (FRANCE), Université des Antilles et de la Guyane (FRANCE), Institut Méditerranéen d'Océanologie - Mediterranean Institute of Oceanography - MIO (Marseille, France), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique - LETG (Nantes, France), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie des forêts de Guyane (UMR ECOFOG), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique UMR 6554 (LETG), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER Centre de Bretagne), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), Station de Biologie Marine de Concarneau, Direction générale déléguée à la Recherche, à l’Expertise, à la Valorisation et à l’Enseignement-Formation (DGD.REVE), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire Environnement Profond (LEP), Etudes des Ecosystèmes Profonds (EEP), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
- Subjects
[SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes ,Benthic Community ,mangroves ,Ecosystem-Based Management ,Wfd ,bioindication ,Bioindication ,European Water Framework Directive ,ecosystem-based management ,[SDE]Environmental Sciences ,[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology ,Milieux et Changements globaux ,Mangrove - Abstract
International audience; European Water Framework Directive is enforced in five tropical French Oversea Territories where mangroves are present. Developing bioindication tools to support the ecosystem-based management approach of the Directive is needed. A series of expert workshops was organized and led to the proposal of a strategy and of an applied research program to develop bioindication tools. The proceedings of the workshops are presented as a case study, as this is the first time such an integrative ecosystem-based approach is proposed in mangroves, combining structural and functional aspects, from forest structure to benthic community functioning.
13. Spatial genetic structure of European wild boar, with inferences on late-Pleistocene and Holocene demographic history.
- Author
-
de Jong JF, Iacolina L, Prins HHT, van Hooft P, Crooijmans RPMA, van Wieren SE, Baños JV, Baubet E, Cahill S, Ferreira E, Fonseca C, Glazov PM, Jelenko Turinek I, Lizana Martín VM, Náhlik A, Pokorny B, Podgórski T, Šprem N, Veeroja R, Ydenberg RC, and Megens HJ
- Subjects
- Animals, Swine, Europe, Demography, Sus scrofa genetics, Phylogeny, DNA, Mitochondrial genetics, Genetic Variation, Genome
- Abstract
European wildlife has been subjected to intensifying levels of anthropogenic impact throughout the Holocene, yet the main genetic partitioning of many species is thought to still reflect the late-Pleistocene glacial refugia. We analyzed 26,342 nuclear SNPs of 464 wild boar (Sus scrofa) across the European continent to infer demographic history and reassess the genetic consequences of natural and anthropogenic forces. We found that population fragmentation, inbreeding and recent hybridization with domestic pigs have caused the spatial genetic structure to be heterogeneous at the local scale. Underlying local anthropogenic signatures, we found a deep genetic structure in the form of an arch-shaped cline extending from the Dinaric Alps, via Southeastern Europe and the Baltic states, to Western Europe and, finally, to the genetically diverged Iberian peninsula. These findings indicate that, despite considerable anthropogenic influence, the deeper, natural continental structure is still intact. Regarding the glacial refugia, our findings show a weaker signal than generally assumed, but are nevertheless suggestive of two main recolonization routes, with important roles for Southern France and the Balkans. Our results highlight the importance of applying genomic resources and framing genetic results within a species' demographic history and geographic distribution for a better understanding of the complex mixture of underlying processes., (© 2023. The Author(s).)
- Published
- 2023
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14. Towards transferability in fish migration models: A generic operational tool for predicting silver eel migration in rivers.
- Author
-
Teichert N, Tétard S, Trancart T, de Oliveira E, Acou A, Carpentier A, Bourillon B, and Feunteun E
- Subjects
- Animal Migration, Animals, Hydrology, Anguilla, Rivers
- Abstract
In the global context of river fragmentation, predicting fish migration is urgent to implement management actions aimed at protecting and promoting the free movement of diadromous fish. However, large-scale applicability of conservation measures requires transferable models that enable prediction of migration even in data-poor regions. Here, we surveyed 12 contrasted European river sites to predict the activity peaks of silver eels (Anguilla anguilla) during river migration towards spawning areas through an ensemble modelling approach. Site-specific Boosted Regression Tree (BRT) models were adjusted using standardized hydrological variables to predict migration probability, which were aggregated in consensus predictions. Results of independent cross-validations demonstrated that silver eel migration runs were accurately predicted in response to changes in river discharge. Transferability and predictive performance were improved by considering catchment-size dissimilarity between river sites (85 to 109,930 km
2 ) when combining the site-specific predictions. Nevertheless, we provided two examples for which the effects of human actions on flow conditions were so high that they prevented reliable predictions of migration runs. Further contributions should thus take advantage of the flexibility of our approach for updating model collection with new sites to extend the predictive performance under a larger range of ecological conditions. Our transferable hydrological-based modelling framework offers an opportunity to implement large-scale management strategies for eel conservation, even in rivers where eel monitoring data lack. The BRT models and prediction functions were compiled in an R package named 'silvRpeak' to facilitate operational implementation by end-user managers, which can determine when mitigation measures should be implemented to improve river continuity (e.g. turbine shutdown and sluice gate opening) and balance their economic activity towards eel conservation. The only input required is discharge records that are widely available across European hydrological stations., Competing Interests: Declaration of competing interest The authors declare that they have no known competing financial interests or personal relationships that could have appeared to influence the work reported in this paper., (Copyright © 2020 Elsevier B.V. All rights reserved.)- Published
- 2020
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15. Helminths of urban rats in developed countries: a systematic review to identify research gaps.
- Author
-
Gliga DS, Pisanu B, Walzer C, and Desvars-Larrive A
- Subjects
- Animals, Developed Countries statistics & numerical data, Helminthiasis epidemiology, Helminthiasis parasitology, Humans, Prevalence, Public Health statistics & numerical data, Rats, Risk Factors, Rodent Diseases epidemiology, Research trends, Rodent Diseases parasitology
- Abstract
Although black (Rattus rattus) and brown (Rattus norvegicus) rats are among the most widespread synanthropic wild rodents, there is a surprising scarcity of knowledge about their ecology in the urban ecosystem. In particular, relatively few studies have investigated their helminth species diversity in such habitat. We followed the PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analysis) guideline to synthesize the existing published literature regarding the helminth fauna of urban rats in developed countries (North America, Europe, Australia, New Zealand and Japan). We aimed at describing the species diversity and richness of urban rat helminths, the species prevalence and associations, the methods of investigation, the pathological changes observed in the hosts, the risk factors of infection and the public health significance of rat-borne helminthiases. Twenty-three scientific papers published between 1946 and 2019 were reviewed, half of them were conducted in Europe. Twenty-five helminth species and eight genera were described from the liver, digestive tract, lungs and muscles of urban rats. The most commonly reported parasite was Calodium hepaticum. Prevalence and risk factors of helminth infection in urban rats varied greatly between studies. Observed pathological findings in the rat host were generally minor, except for C. hepaticum. Several rat helminths can parasitize humans and are therefore of public health significance. The lack of references to identification keys and the rare use of molecular tools for species confirmation represent the main limitation of these studies. Knowledge gap on this topic and the needs for future research are discussed.
- Published
- 2020
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16. Variation in the ontogenetic allometry of horn length in bovids along a body mass continuum.
- Author
-
Tidière M, Gaillard JM, Garel M, Lemaître JF, Toïgo C, and Pélabon C
- Abstract
Allometric relationships describe the proportional covariation between morphological, physiological, or life-history traits and the size of the organisms. Evolutionary allometries estimated among species are expected to result from species differences in ontogenetic allometry, but it remains uncertain whether ontogenetic allometric parameters and particularly the ontogenetic slope can evolve. In bovids, the nonlinear evolutionary allometry between horn length and body mass in males suggests systematic changes in ontogenetic allometry with increasing species body mass. To test this hypothesis, we estimated ontogenetic allometry between horn length and body mass in males and females of 19 bovid species ranging from ca. 5 to 700 kg. Ontogenetic allometry changed systematically with species body mass from steep ontogenetic allometries over a short period of horn growth in small species to shallow allometry with the growth period of horns matching the period of body mass increase in the largest species. Intermediate species displayed steep allometry over long period of horn growth. Females tended to display shallower ontogenetic allometry with longer horn growth compared to males, but these differences were weak and highly variable. These findings show that ontogenetic allometric slope evolved across species possibly as a response to size-related changes in the selection pressures acting on horn length and body mass., Competing Interests: None declared., (© 2020 The Authors. Ecology and Evolution published by John Wiley & Sons Ltd.)
- Published
- 2020
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