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16 results on '"Nicollet, Philippe"'

2. Serological Evidence of Influenza D Virus Circulation Among Cattle and Small Ruminants in France

Author

Oliva, Justine, Eichenbaum, Amit, Belin, Jade, Gaudino, Maria, Guillotin, Jean, Alzieu, Jean-Pierre, Nicollet, Philippe, Brugidou, Roland, Gueneau, Eric, Michel, Evelyne, Meyer, Gilles, Ducatez, Mariette F., Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire Départemental Public du Nord, Laboratoire Vétérinaire  Départemental de l'Ariège, Partenaires INRAE, Laboratoire de l'Environnement et de l'Alimentation de la Vendée (LEAV), Aveyron Labo, Laboratoire départemental de la Côte d'Or, Conseil General, Laboratoire Public Conseil, This work was funded by the French National Agency for Research, project ANR-15-CE35-0005 'FLUD'. Justine Oliva is supported by a PhD scholarship of the French Ministry of Research and Higher Education., and ANR-15-CE35-0005,FLUD,Eco-épidémiologie de virus influenza D : évaluation du risque d'émergence(2015)

Subjects
0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, 030106 microbiology, lcsh:QR1-502, Cattle Diseases, Serological evidence, Biology, Antibodies, Viral, Article, lcsh:Microbiology, Virus, 03 medical and health sciences, Orthomyxoviridae Infections, Seroepidemiologic Studies, Virology, Epidemiology, medicine, Animals, Seroprevalence, small ruminants, Respiratory system, Respiratory Tract Infections, High prevalence, [SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, seroprevalence, Ruminants, Pathogenicity, Bovine Respiratory Disease Complex, 3. Good health, 030104 developmental biology, Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, cattle, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, epidemiology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, France, Influenza D virus, Thogotovirus
Abstract

International audience; Influenza D virus (IDV) has first been identified in 2011 in the USA and was shown to mainly circulate in cattle. While IDV is associated with mild respiratory signs, its prevalence is still unknown. In the present study we show that IDV has been circulating throughout France in cattle and small ruminants, with 47.2% and 1.5% seropositivity, respectively. The high prevalence and moderate pathogenicity of IDV in cattle suggest that it may play an initiating role in the bovine respiratory disease complex.

Published
2019
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3. Valeur informative de la qPCR dans le diagnostic des avortements répétés chez les bovins : retour sur le choix d’un seuil d’interprétation pour le diagnostic de la fièvre Q

Author

Guérineau, Simon, Nicollet, Philippe, Menudier, Nathalie, Guatteo, Raphaël, Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Laboratoire de l'Environnement et de l'Alimentation de la Vendée (LEAV), CEVA Santé Animale, Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
qPCR, Fièvre Q, [SDV]Life Sciences [q-bio], Avortement, Diagnostic
Abstract

Le diagnostic et surtout l'attributatibilité d'une série d'avortements à Coxiella burnetii a fait l'objet d'une proposition dans le cadre de la démarche d'harmonisation nationale. Afin de maximiser la spécificité, un seuil élevé de 104 bactérie/mL a été établi. Toutefois, en bovin, un tel seuil est rarement atteint y compris dans des situations où l'implication de Coxiella semble réelle. Cette étude a ainsi comparé les résultats en qPCR obtenus sur des placentas en comparaison au gold standard théorique, l'histologie. Comme attendu, le seuil de 10⁴ maximise la spécificité mais la sensibilité correspondante (moins de 25%) est médiocre. Compte-tenu de la très forte spécificité à ce seuil, la nécessité de disposer d'un deuxième résultat positif en qPCR pourrait se discuter. Compte-tenu de la très faible sensibilité, on doit renforcer le message sur le besoin de sérologies concomitantes et peut-être ouvrir la discussion à réviser ce seuil chez les bovins ou en tout cas ne pas le considérer comme un seuil indiscutable

Published
2018

4. Fièvre Q : Dispositif pilote

Author

Gache, Kristel, Calavas, Didier, Champion, Jean-Luc, De Cremoux, Renée, Dion, Francoise, Guatteo, Raphaël, Hosteing, Soline, Jourdain, Elsa, Lars, Frédéric, Natorp, Jean - Christophe, Nicollet, Philippe, Perrin, Jean-Baptiste, Rautureau, Séverine, Rousset, Elodie, Sala, Carole, Touratier, Anne, Zerrouki, Lidia, Groupement de Défense Sanitaire, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Groupement de Défense Sanitaire des Alpes de Haute Provence, Institut de l'élevage (IDELE), Races de France, Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Société Nationale des Groupements Techniques Vétérinaires (SNGTV), Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Association française des Directeurs et cadres de Laboratoires Vétérinaires publics d'Analyses (ADILVA), Direction Générale de l'Alimentation (DGAL), and Laboratoire National de Référence de la Tuberculose

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2015

5. Déclaration des avortements : surveillance évènementielle de la brucellose

Author

Hosteing, Soline, Bronner, Anne, Calavas, Didier, Champion, Jean-Luc, De Cremoux, Renée, Dion, Francoise, Garin-Bastuji, Bruno, Grünwald, Anne-Laure, Guatteo, Raphaël, Jaÿ, Maryne, Jourdain, Elsa, Lars, Frédéric, Natorp, Jean - Christophe, Nicollet, Philippe, Osdoit, Claire, Perrin, Jean-Baptiste, Rautureau, Séverine, Rousset, Elodie, Senkowski, Alexandra, Thomas-Loyau, Sophie, Touratier, Anne, Société Nationale des Groupements Techniques Vétérinaires (SNGTV), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Groupement de Défense Sanitaire des Alpes de Haute Provence, Institut de l'élevage (IDELE), Races de France, Direction Départementale de la Cohésion Sociale et de la Protection des Populations, Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Association française des Directeurs et cadres de Laboratoires Vétérinaires publics d'Analyses (ADILVA), Groupement de Défense Sanitaire, Direction Générale de l'Alimentation (DGAL), and Laboratoire National de Référence de la Tuberculose

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2015

6. Diagnostic différentiel des causes infectieuses d'avortements chez les bovins : intérêt d'une démarche harmonisée et intérêt d'une technique PCR multi-agents pour le diagnostic des avortements infectieux chez les bovins

Author

Guatteo, Raphaël, Nicollet, Philippe, Le Dréan, Eric, Ninio, Camille, Maingourd, Cyril, Joly, Alain, Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Oniris, UMR BioEpAR, PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Laboratoire de l'Environnement et de l'Alimentation de la Vendée (LEAV), Institut en Santé Agro-Environnement (ISAE), Laboratoire de Développement et d'Analyses du Morbihan, Partenaires INRAE, Laboratoire d'analyses, and Groupement de Défense Sanitaire Bretagne (GDS Bretagne)

Subjects
Bovin, Harmonisation, [SDV]Life Sciences [q-bio], Diagnostic différentiel, Avortements
Abstract

Cette présentation présente les bases d’une démarche harmonisée de diagnostic des avortements répétés mis au point dans le cadre de l’UMT Maîtrise de la Santé des Troupeaux Bovins ainsi que les résultats de la mise en œuvre de cette démarche sur le terrain. Cette étude confirme l’intérêt d’un dispositif de base dans une démarche nationale d’harmonisation du diagnostic des avortements qui devrait comprendre un écouvillon pour PCR FQ et 6 prises de sang sur congénères à problèmes pour sérologie Néosporose, BVD et Fièvre Q. Au final, en combinant les résultats PCR et sérologiques, un agent pathogène est fortement suspecté dans environ 6 cas sur 10. Les outils PCR permettant lma détection simultanée de nombreux pathogènes ouvre également des perspectives intéressantes pour augmenter la sensibilité des démarches diagnostiques.

Published
2014

7. Cartographie des dosages plasmatiques d'oligo-éléments chez les bovins : bilan à partir de 6620 analyses

Author

Trumeau, Damien, Lecourt, Jean, De Gelas, Ruud, Nicollet, Philippe, Lumet, Lionel, Liège, Philippe, Guatteo, Raphaël, Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Vetalis Technologies, Partenaires INRAE, Laboratoire de l'environnement et de l'alimentation de la Vendée, Anistème Biosciences, Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Oniris, UMR BioEpAR, and PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)

Subjects
Zinc, Iode, Cuivre, Dosages plasmatiques, [SDV]Life Sciences [q-bio], Sélenium, Cobalt, Oligoéléments
Abstract

Les oligo-éléments ou éléments traces sont essentiels, car ils agissent dans divers métabolismes vitaux. Ils sont ainsi des éléments indispensables à la synthèse et/ou au fonctionnement de plusieurs enzymes (glutathion peroxydase par exemple pour le Sélénium), hormones (thyroïdiennes pour l’Iode) ou vitamines (vitamine B12 pour le Cobalt).

Published
2014

8. Antibiorésistance d'Eschrichia coli isolée sur fèces des veaux allaitants

Author

Genthon-Troncy, Vivien, Nicollet, Philippe, Quillet, Jean-Michel, Madec, Jean-Yves, Assie, Sébastien, Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Oniris, UMR BioEpAR, PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Zootechnie, Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Laboratoire de l'Environnement et de l'Alimentation de la Vendée (LEAV), Groupement d’Intérêt Economique Souffleries Aéroacoustiques Automobiles (GIE S2A), Laboratoire de Lyon [ANSES], and Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)

Subjects
Veau allaitant, Gastro-entérite néonatale, [SDV]Life Sciences [q-bio], Escherichia coli, Antibiorésistance
Abstract

National audience; L’objectif de cette étude est de décrire les niveaux de résistance de souches d’’Escherichia coli isolées sur fèces de veaux allaitants de l’Ouest de la Vendée. Les fèces ont été récoltées dans 42 élevages entre février et avril 2013. Les souches d’’Escherichia coli ont été isolées sur mélange de fèces de veaux sains et de veaux atteints de gastro-entérite néonatale (GENN) d’un même élevage. Au total, la sensibilité de 58 souches vis-à-vis de 15 antibiotiques a été testée. Les plus forts niveaux de résistance ont été observés pour l’amoxicilline et la tétracycline (respectivement 67% et 66% de souches non-sensibles). Les plus faibles niveaux de résistance ont été mis en évidence pour la colistine, l’enrofloxacine, le ceftiofur, la céfopérazone et la cefquinome (moins de 6% de souches non-sensibles). Les veaux de moins de 10 jours hébergeaient plus fréquemment des souches d’E.coli nonsensibles à au moins un antibiotique classiquement utilisé dans le traitement des GENN. Les souches de sérotype CS31A étaient plus fréquemment non-sensibles à 3 antibiotiques ou plus que les souches de sérotype non-CS31A. Les résultats in vitro montrent que l’amoxicilline, la tétracycline et l’association amoxicilline-acide clavulanique ne sont que peu efficaces dans le cadre des GENN du veau allaitant dans l’Ouest de la Vendée. La gentamicine ou le triméthoprime-sulfaméthoxazole semblent en revanche être des molécules de choix. Dans l’optique de préserver l’arsenal thérapeutique actuellement disponible, la réalisation d’un antibiogramme et la mesure de la concentration minimale inhibitrice (CMI) lors du choix de l’antibiotique est un point essentiel dans la démarche thérapeutique.

Published
2014

10. Une technique PCR multi-agents pour le diagnostic des avortements infectieux chez les bovins

Author

Guatteo, Raphaël, Nicollet, Philippe, Le Dréan, Eric, Ninio, Camille, Maingourd, Cyril, Joly, Alain, Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Oniris, UMR BioEpAR, PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Laboratoire de l'Environnement et de l'Alimentation de la Vendée (LEAV), Institut en Santé Agro-Environnement (ISAE), Laboratoire de Développement et d'Analyses du Morbihan, Partenaires INRAE, Laboratoire d'analyses, and Groupement de Défense Sanitaire Bretagne (GDS Bretagne)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Une technique PCR a permis la détection simultanée de 8 agents pathogènes (Coxiella burnetii, Chlamydophila spp, Listeria monocytogenes, Salmonella spp, leptospires pathogènes, BHV4, Campylobacter fetus et fetus venerealis, Anaplasma phagocytophilum) dans le cadre du diagnostic des avortements infectieux chez les bovins. 925 avortements ont été étudiés dans 3 zones (Ille-et-Vilaine, Morbihan, Deux-Sèvres), avec une matrice à analyser pour chacun (placenta, mucus vaginal, avorton ou organes d’avorton). L’agent principalement identifié est C. burnetii (presque 18 % des cas) ; l’agent de l’ehrlichiose est souvent retrouvé également. Les résultats sérologiques associés confirment le rôle de Neospora caninum et du virus de la BVD comme participant, avec la fièvre Q, des 3 agents abortifs majeurs chez les bovins. En combinant les résultats PCR et sérologiques, un agent pathogène est suspecté dans environ 6 cas sur 10. Dans la démarche nationale d’harmonisation du diagnostic des avortements, cette étude confirme l’intérêt d’un dispositif devant comprendre un écouvillon pour PCR fièvre Q et 6 prises de sang sur congénères à problèmes pour sérologie néosporose, BVD et fièvre Q

Published
2014

11. Les avortements infectieux chez les bovins vers une démarche standardisée d'investigation

Author

Guatteo, Raphaël, Nicollet, Philippe, LeDréan, Eric, Vassiloglou, Barbara, Cheval, Jean-Luc, Treilles, Michaël, Thuillier, Benoit, Geollot, Sébastien, Holleville, Pascal, Leboeuf, Christophe, Joncour, Guy, Joly, Alain, ONIRIS-INRA - Umr 1300 Bioagression, Epidémiologie et Analyse de Risque, Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Laboratoire d'analyses, Institut en Santé Agro-Environnement (ISAE), Laboratoire de Développement et d'Analyses du Morbihan, Partenaires INRAE, Institut Départemental d'Analyse et de Conseil, Laboratoire de Développement et d'Analyses de la Manche, IDHESA Bretagne Océane, Fédération Régionale des Groupements de Défense Sanitaire de Bretagne, Groupement de Défense Sanitaire, and Fédération Régionale des Groupements Techniques Vétérinaires de Bretagne

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

L'impact néfaste des avortements répétés chez les bovins justifie le recours aux examens complémentaires. Afin d’augmenter la part des avortements élucidés, une étape préalable est de tenter d’harmoniser les protocoles d’investigation. Cela a fait l’objet d’un groupe de travail au sein de l’unité mixte technologique (UMT) maîtrise de la santé des troupeaux bovins basée à Oniris. Il en ressort des recommandations sur les investigations les plus pertinentes à réaliser en première intention ou non ainsi qu’une proposition de grille d’interprétation. un consensus clair se dégage sur la nécessité de rechercher systématiquement trois agents majeurs (le virus de la BVD, Neospora caninum et Coxiella burnetii). Des éléments particuliers peuvent motiver la recherche d'autres agents potentiellement abortifs.

Published
2011

15. C oxiella burnetii vaginal shedding and antibody responses in dairy goat herds in a context of clinical Q fever outbreaks.

Author

Cremoux, Renée, Rousset, Elodie, Touratier, Anne, Audusseau, Ghislain, Nicollet, Philippe, Ribaud, Danièle, David, Valérie, and Pape, Marilyne

Subjects
IMMUNOGLOBULINS, COXIELLA burnetii, VAGINAL diseases, Q fever, DISEASE outbreaks, GOAT diseases, SEROPREVALENCE
Abstract

This study, carried out in three goat herds, was aimed at describing individual responses to Q fever infection in an abortive context, focusing on both antibody and shedding levels. Seroprevalence of C oxiella burnetii ( C b) infection and vaginal shedding of 1083 goats were investigated using ELISA and real-time qPCR assays, respectively. At the end of the outbreaks, a seroprevalence of 45.0% was found, and vaginal shedding appeared massive with levels above 104 C b per swab in 42.3% of the whole population and above 106 C b per swab for 90.9% of aborted goats. Susceptible animals (i.e. seronegative nonshedders) were unfrequent (31.2%), most of them being kids (94.7%). Seronegative females were predominant among nonshedders and conversely seropositive ones, predominant among high shedders (above 106 C b per swab). Nevertheless, at least 43.3% of seronegative goats shed bacteria confirming the need of interpreting serology on a herd scale. The subsequent farrowing period was characterized by a significant reduction in the number of clinical cases. Females that had already aborted were more often involved than others. Shedding quantities remained high, particularly for primiparous does, mainly when facing infection for the first time. Thus, Q fever control must be based on both preventive measures directed to the preherd and environmental precautions. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2012
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16. Assessment of vaccination by a phase I C oxiella burnetii-inactivated vaccine in goat herds in clinical Q fever situation.

Author

Cremoux, Renée, Rousset, Elodie, Touratier, Anne, Audusseau, Ghislain, Nicollet, Philippe, Ribaud, Daniè, David, Valérie, and Pape, Marilyne

Subjects
Q fever, COXIELLA burnetii, ANIMAL vaccination, SEROLOGY, POLYMERASE chain reaction, DISEASE incidence, DISEASE susceptibility
Abstract

A study was carried out to assess the efficacy of vaccination, using a phase I C oxiella burnetii-inactivated vaccine ( Coxevac®; CEVA), within three goat herds experiencing Q fever abortions waves. The stratification of the population ( n = 905) was based on parity and on infection status related to both serological and q PCR vaginal shedding results. Control ( n = 443) and vaccinated ( n = 462) groups were established in each farm. Vaccination was administered to does before mating and to kids after active immunity acquisition (at least 3-4 months old). The vaccine effectiveness was analyzed at subsequent farrowing on both clinical incidence and vaginal shedding at the delivery day. Among the 231 animals considered as susceptible, that is, seronegative nonshedders, about 90% were infected whatever the group, showing that vaccination did not prevent infection under high infection exposure. Fortunately, vaccination induced an overall decrease in shedding levels. A significant average difference between groups was estimated to 1.16 log10 bacteria per swab for primiparous and even higher (1.81 log10) for initially susceptible ones. Thus, in a clinical context, vaccination should be implemented first in renewal animals. Indeed, young animals are those which best respond to vaccination by significantly reducing C. burnetii burden and, conversely, which excrete bacteria most massively if not vaccinated. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2012
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