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1. Infection related catheter complications in patients undergoing prone positioning for acute respiratory distress syndrome: an exposed/unexposed study

Author: Guillaume Louis, Thibaut Belveyre, Audrey Jacquot, Hélène Hochard, Nejla Aissa, Antoine Kimmoun, Christophe Goetz, Bruno Levy, and Emmanuel Novy
Subjects: Colonization, Catheter-related infection, ARDS, Prone positioning, Infectious and parasitic diseases, RC109-216
Abstract: Abstract Background Prone positioning (PP) is a standard of care for patients with moderate–severe acute respiratory distress syndrome (ARDS). While adverse events associated with PP are well-documented in the literature, research examining the effect of PP on the risk of infectious complications of intravascular catheters is lacking. Method All consecutive ARDS patients treated with PP were recruited retrospectively over a two-year period and formed the exposed group. Intensive care unit (ICU) patients during the same period without ARDS for whom PP was not conducted but who had an equivalent disease severity were matched 1:1 to the exposed group based on age, sex, centre, length of ICU stay and SAPS II (unexposed group). Infection-related catheter complications were defined by a composite criterion, including catheter tip colonization or intravascular catheter-related infection. Results A total of 101 exposed patients were included in the study. Most had direct ARDS (pneumonia). The median [Q1–Q3] PP session number was 2 [1–4]. These patients were matched with 101 unexposed patients. The mortality rates of the exposed and unexposed groups were 31 and 30%, respectively. The incidence of the composite criterion was 14.2/1000 in the exposed group compared with 8.2/1000 days in the control group (p = 0.09). Multivariate analysis identified PP as a factor related to catheter colonization or infection (p = 0.04). Conclusion Our data suggest that PP is associated with a higher risk of CVC infectious complications.
Published: 2021
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2. Evaluating antibiotic stewardship and healthcare-associated infections surveillance assisted by computer: protocol for an interrupted time series study

Author: Céline Pulcini, Nathalie Thilly, Nelly Agrinier, Béatrice Demoré, Nejla Aissa, Alain Lozniewski, Alexandre Charmillon, Alexandre Baudet, Julie Lizon, and Arnaud Florentin
Subjects: Medicine
Abstract: Introduction Antibiotic resistance is one of the most pressing health threats that mankind faces now and in the coming decades. Antibiotic resistance leads to longer hospital stays, higher medical costs and increased mortality. In order to tackle antibiotic resistance, we will implement in our tertiary care university hospital a computerised-decision support system (CDSS) facilitating antibiotic stewardship and an electronic surveillance software (ESS) facilitating infection prevention and control activities. We describe the protocol to evaluate the impact of the CDSS/ESS combination in adult inpatients.Methods and analysis We conduct a pragmatic, prospective, single-centre, before–after uncontrolled study with an interrupted time-series analysis 12 months before and 12 months after the introduction of the CDSS for antibiotic stewardship (APSS) and ESS for infection surveillance (ZINC). APSS and ZINC will assist, respectively, the antibiotic stewardship and the infection prevention and control teams of Nancy University Hospital (France). We will evaluate the impact of the CDSS/ESS on the antibiotic use in adult (≥18 years) inpatients (hospitalised ≥48 hours). The primary outcome is the prescription rate by all healthcare professionals from the hospital of all systemic antibiotics expressed in defined daily doses/1000 patients/month. Concurrently, we will assess the safety of the intervention, its impact on the appropriateness of antibiotic prescriptions and on additional precautions (isolation precautions) as recommended in guidelines, and on bacterial epidemiology (multidrug-resistant bacteria and Clostridioides difficile infections) in the hospital. Finally, we will evaluate the users’ satisfaction and the cost of this intervention from the hospital perspective.Ethics and dissemination The protocol has been approved by the Ethics Committee of Nancy University Hospital and registered on the ClinicalTrials platform. Results will be disseminated through conferences’ presentations and publications in peer-reviewed journals.Trial registration number NCT04976829.
Published: 2022
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3. Time to blood culture positivity: An independent predictor of infective endocarditis and mortality in patients with Staphylococcus aureus bacteraemia

Author: V. Le Moing, Sandrine Barbas, Elodie Curlier, Hélène Jean-Pierre, Willem Vanwamel, Damien Fournier, Isabelle Patry, Eric Bellissant, Jacques Reynes, Sandrine Gohier-Treuvelot, François Alla, Catherine Chirouze, Fabienne Le Gac, Catherine Neuwirth, Philippe Géraud, François Goehringer, Christine Selton-Suty, Bruno Hoen, Virginie Sussmuth, Christine Delonca, Nathalie Keil, Catherine Sportouch, Thanh Doco-Lecompte, S. Tubiana, F. Vandenesch, Laetitia Minary, S. Desage, Catherine Leport, Hepher Malela, Cécile Descottes-Genon, Lionel Piroth, Christian Michelet, Pascale Rausch, Matthieu Revest, Bernard Iung, Jerome Etienne, Albert Sotto, Vincent Le Moing, J.-P. Lavigne, Catherine Cornu, Fernando Rivadeneira, Elise Thebault, Nathalie Bedos, Pierre-Yves Donnio, Lucie Vettoretti, Michèle Bes, S. Siméon, Jean-Christophe Eicher, Catherine Lechiche, X. Duval, François Vandenesch, Marie Célard, Pascal Chavanet, Sarah Tubiana, Raymond Ruimy, M.-L. Erpelding, Thierry May, André Pechinot, Nejla Aissa, Emila Ilic Habensus, François Delahaye, C.-A. Gustave, Lorraine Letranchant, Taissia Lelekov-Boissard, C. Chirouze, Anne Tristan, Audrey Coma, Jean-Philippe Lavigne, Xavier Duval, Pierre Tattevin, Alex van Belkum, Pierre Braquet, Marie-Line Erpelding, Pascale Longuet, Malika Hadid, Marie-Christine Greusard, Florence Galtier, Anne Verchère, P. Tattevin, Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Maladies Infectieuses [CHU de Montpellier], Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier ), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CIC1425 Bichat [AP-HP Hôpital Bichat - Claude Bernard] (INSERM), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Bactériologie [CHRU Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Virulence bactérienne et maladies infectieuses (VBMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service de Microbiologie [CHU Caremeau, Nîmes], Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] (CHU Nîmes), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes)-Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Centre d'investigation clinique [Nancy] (CIC), Université de Lorraine (UL)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de référence des Staphylocoques [HCL, Lyon] (Institut des Agents Infectieux), Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Bactériologie [HCL, Lyon] (Institut des Agents Infectieux), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), ARN régulateurs bactériens et médecine (BRM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), VIRSTA/AEPEI Study Group. Chirouze C, Curlier E, Descottes-Genon C, Hoen B, Patry I, Vettoretti L, Chavanet P, Eicher JC, Gohier-Treuvelot S, Greusard MC, Neuwirth C, Péchinot A, Piroth L, Célard M, Cornu C, Delahaye F, Hadid M, Rausch P, Coma A, Galtier F, Géraud P, Jean-Pierre H, Le Moing V, Sportouch C, Reynes J, Aissa N, Doco-Lecompte T, Goehringer F, Keil N, Letranchant L, Malela H, May T, Selton-Suty C, Bedos N, Lavigne JP, Lechiche C, Sotto A, Duval X, Habensus EI, Iung B, Leport C, Longuet P, Ruimy R, Bellissant E, Donnio PY, Le Gac F, Michelet C, Revest M, Tattevin P, Thebault E, Alla F, Braquet P, Erpelding ML, Minary L, Tubiana S, Bès M, Etienne J, Lelekov-Boissard T, Tristan A, Vandenesch F, Van Belkum A, Rivadeneira F, Vanwamel W, Barbas S, Delonca C, Sussmuth V, Verchère A., Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon), CHU Caremeau, Nîmes, CIC-Nancy, Institut Lorrain du Coeur et des Vaisseaux Louis Mathieu [Nancy]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), CIC Hôpital Bichat, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-UFR de Médecine-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Modèles et méthodes de l'évaluation thérapeutique des maladies chroniques (U738 / UMR_S738), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Hôpital Jean Minjoz, Centre National de référence des Staphylocoques, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Hospices Civils de Lyon (HCL), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Point-à-Pitre, Guadeloupe], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Service de Cardiologie [CHU de Dijon], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Biologie Laboratoire de Bacteriologie, Laboratoire de Microbiologie Médicale et Moléculaire, Université de Bourgogne (UB), Département d'infectiologie (CHU de Dijon), Evaluation et modélisation des effets thérapeutiques, Département biostatistiques et modélisation pour la santé et l'environnement [LBBE], Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), REseau national d'Investigation clinique en VACcinologie (REIVAC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Groupe hospitalier Broca-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de Gestion des Essais de Produits de Santé (CeNGEPS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Service de Bactériologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Service de Cardiologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes (CHRU Nîmes), Laboratoire universitaire d'antibiologie, Université Montpellier 1 (UM1), CIC - CHU Bichat, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Bichat - Claude Bernard, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Microbiologie : Risques Infectieux, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Faculté de Chirurgie Dentaire de Rennes-Faculté d'Odontologie-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service des maladies infectieuses, Maladies chroniques, santé perçue, et processus d'adaptation (APEMAC), Université de Lorraine (UL), CHU Montpellier, Service d'Epidémiologie et Evaluations Cliniques [CHRU Nancy] (Pôle S2R), Centre National de Reference des Staphylocoques, Université de Lyon, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), and Jonchère, Laurent
Subjects: Male, Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus, 0301 basic medicine, Microbiology (medical), Staphylococcus aureus, bacteraemia, medicine.medical_specialty, Time Factors, Multivariate analysis, 030106 microbiology, Bacteremia, Independent predictor, medicine.disease_cause, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Interquartile range, hemic and lymphatic diseases, Internal medicine, medicine, Humans, Blood culture, Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, time to blood culture positivity, Prospective cohort study, [SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Aged, medicine.diagnostic_test, infective endocarditis, business.industry, Endocarditis, Bacterial, General Medicine, Middle Aged, Staphylococcal Infections, respiratory system, medicine.disease, mortality, 3. Good health, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Infectious Diseases, Quartile, Blood Culture, Infective endocarditis, Female, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Objectives - Time to blood culture positivity (TTP), a routinely available parameter in automated blood culture systems, may be a proxy for infectious burden in patients with bloodstream infections. We aimed to study the association between TTP and infective endocarditis (IE), or death, in patients with Staphylococcus aureus bacteraemia. Methods - VIRSTA is a multicenter prospective cohort study that included all adult patients with S. aureus bacteraemia in eight university hospitals in France (2009-2011). We analyzed data from four centers which collected data on TTP. Regression models were used to study the association between TTP and definite IE (Duke-Li criteria), and 30 day-mortality. Results - We included 587 patients with S. aureus bacteraemia: mean age was 65.3±16.3 years, 420/587 patients (71.6%) were male, 121/587 (20.6%) died, and 42/587 (7.2%) had definite IE. Median TTP of first positive blood culture was 13.7 h (interquartile range, 9.9-18). On multivariate analysis, 30-day mortality was associated with TTP≤13.7 h (74/295 (25.1%) vs 47/292 (16.1%), P=0.02), as well as old age, McCabe score, methicillin resistance, stroke, pneumonia, and C-Reactive Protein. TTP was also independently associated with IE, but with a U-shape curve: IE was more common in the first (TTP18 h, 8/146, 5.5%) quartiles of TTP, P=0.002. Conclusions - TTP provides reliable information in patients with S. aureus bacteraemia, on the risk of IE, and prognosis, with short TTP being an independent predictor of death. This data readily available at no cost may be used to identify patients who require specific attention.
Published: 2019
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4. Accuracy of procalcitonin for diagnosing peripheral blood culture contamination among patients with positive blood culture for potential contaminants

Author: Anne Elisabeth Manteaux, Alain Lozniewski, Jean-Louis Guéant, Nejla Aissa, Clémence Berthezène, and Abderrahim Oussalah
Subjects: Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, Univariate analysis, medicine.diagnostic_test, medicine.drug_class, business.industry, Antibiotics, Bacteremia, General Medicine, Contamination, Logistic regression, medicine.disease, Procalcitonin, Infectious Diseases, Cross-Sectional Studies, Blood Culture, Internal medicine, medicine, Biomarker (medicine), Humans, Blood culture, business, Retrospective Studies
Abstract: Blood culture contamination is still a frequently observed event and may lead to unnecessary antibiotic prescriptions and additional hazards and costs. However, in patients hospitalized in tertiary care, true bacteremias for pathogens that are classically considered as contaminants can be observed. We assessed the diagnostic accuracy of procalcitonin for differentiating blood culture contamination from bacteremia in patients with positive blood cultures for potential contaminants. We carried out a retrospective, cross-sectional, observational study on consecutive patients hospitalized between January 2016 and May 2019 at the University Hospital of Nancy and who had a positive peripheral blood culture for a pathogen classically considered as a potential contaminant. During the study period, 156 patients were screened, and 154 were retained in the analysis. Among the variables that were significantly associated with a diagnosis of blood culture contamination in univariate analyses, four were maintained in multivariate logistic regression analysis: a number of positive blood culture bottles ≤ 2 (OR 23.76; 95% CI 1.94–291.12; P = 0.01), procalcitonin
Published: 2021

5. Evaluating antibiotic stewardship and healthcare-associated infections surveillance assisted by computer: protocol for an interrupted time series study

Author: Alexandre Baudet, Nelly Agrinier, Alexandre Charmillon, Céline Pulcini, Alain Lozniewski, Nejla Aissa, Julie Lizon, Nathalie Thilly, Béatrice Demoré, Arnaud Florentin, Adaptation, mesure et évaluation en santé. Approches interdisciplinaires (APEMAC), Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre d'investigation clinique - Epidémiologie clinique [Nancy] (CIC-EC), Centre d'investigation clinique [Nancy] (CIC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Stress, Immunité, Pathogènes (SIMPA), Département Méthodologie Promotion Investigation [CHRU Nancy] (MPI), and Bocquier, Aurélie
Subjects: Adult, Antimicrobial Stewardship, Computers, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Humans, Interrupted Time Series Analysis, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Prospective Studies, General Medicine, Delivery of Health Care, Anti-Bacterial Agents
Abstract: IntroductionAntibiotic resistance is one of the most pressing health threats that mankind faces now and in the coming decades. Antibiotic resistance leads to longer hospital stays, higher medical costs and increased mortality. In order to tackle antibiotic resistance, we will implement in our tertiary care university hospital a computerised-decision support system (CDSS) facilitating antibiotic stewardship and an electronic surveillance software (ESS) facilitating infection prevention and control activities. We describe the protocol to evaluate the impact of the CDSS/ESS combination in adult inpatients.Methods and analysisWe conduct a pragmatic, prospective, single-centre, before–after uncontrolled study with an interrupted time-series analysis 12 months before and 12 months after the introduction of the CDSS for antibiotic stewardship (APSS) and ESS for infection surveillance (ZINC). APSS and ZINC will assist, respectively, the antibiotic stewardship and the infection prevention and control teams of Nancy University Hospital (France). We will evaluate the impact of the CDSS/ESS on the antibiotic use in adult (≥18 years) inpatients (hospitalised ≥48 hours). The primary outcome is the prescription rate by all healthcare professionals from the hospital of all systemic antibiotics expressed in defined daily doses/1000 patients/month. Concurrently, we will assess the safety of the intervention, its impact on the appropriateness of antibiotic prescriptions and on additional precautions (isolation precautions) as recommended in guidelines, and on bacterial epidemiology (multidrug-resistant bacteria and Clostridioides difficile infections) in the hospital. Finally, we will evaluate the users’ satisfaction and the cost of this intervention from the hospital perspective.Ethics and disseminationThe protocol has been approved by the Ethics Committee of Nancy University Hospital and registered on the ClinicalTrials platform. Results will be disseminated through conferences’ presentations and publications in peer-reviewed journals.Trial registration numberNCT04976829.
Published: 2022
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6. Infection related catheter complications in patients undergoing prone positioning for acute respiratory distress syndrome: an exposed/unexposed study

Author: Thibaut Belveyre, Christophe Goetz, Guillaume Louis, Audrey Jacquot, Nejla Aissa, Hélène Hochard, Bruno Levy, Emmanuel Novy, and Antoine Kimmoun
Subjects: Colonization, Male, ARDS, medicine.medical_specialty, Critical Care, Prone positioning, Infectious and parasitic diseases, RC109-216, Severity of Illness Index, Patient Positioning, law.invention, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, law, Internal medicine, Severity of illness, medicine, Prone Position, Humans, 030212 general & internal medicine, Aged, Retrospective Studies, Respiratory Distress Syndrome, business.industry, Research, Incidence (epidemiology), Incidence, 030208 emergency & critical care medicine, Retrospective cohort study, Middle Aged, medicine.disease, Intensive care unit, Catheter, Pneumonia, Intensive Care Units, Infectious Diseases, SAPS II, Catheter-Related Infections, Catheter-related infection, Female, business
Abstract: Background Prone positioning (PP) is a standard of care for patients with moderate–severe acute respiratory distress syndrome (ARDS). While adverse events associated with PP are well-documented in the literature, research examining the effect of PP on the risk of infectious complications of intravascular catheters is lacking. Method All consecutive ARDS patients treated with PP were recruited retrospectively over a two-year period and formed the exposed group. Intensive care unit (ICU) patients during the same period without ARDS for whom PP was not conducted but who had an equivalent disease severity were matched 1:1 to the exposed group based on age, sex, centre, length of ICU stay and SAPS II (unexposed group). Infection-related catheter complications were defined by a composite criterion, including catheter tip colonization or intravascular catheter-related infection. Results A total of 101 exposed patients were included in the study. Most had direct ARDS (pneumonia). The median [Q1–Q3] PP session number was 2 [1–4]. These patients were matched with 101 unexposed patients. The mortality rates of the exposed and unexposed groups were 31 and 30%, respectively. The incidence of the composite criterion was 14.2/1000 in the exposed group compared with 8.2/1000 days in the control group (p = 0.09). Multivariate analysis identified PP as a factor related to catheter colonization or infection (p = 0.04). Conclusion Our data suggest that PP is associated with a higher risk of CVC infectious complications.
Published: 2020

7. A new mechanism to render clinical isolates ofEscherichia colinon-susceptible to imipenem: substitutions in the PBP2 penicillin-binding domain

Author: Frédéric Bert, Alain Lozniewski, Nejla Aissa, Marie-Hélène Nicolas-Chanoine, Roger Labia, Noémie Mayer, Laboratoire de Bactériologie [CHU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de Microbiologie, Hôpital Beaujon-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Faculté de Médecine [Université Paris Diderot - Paris 7], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: DNA, Bacterial, 0301 basic medicine, Microbiology (medical), Imipenem, Carbapenem, Epidemiology, Resistance, 030106 microbiology, Mutation, Missense, Microbial Sensitivity Tests, Infections, medicine.disease_cause, Microbiology, 03 medical and health sciences, Enterobacteriaceae, Escherichia coli, polycyclic compounds, medicine, Humans, Penicillin-Binding Proteins, Pharmacology (medical), Escherichia coli Infections, Etest, Recombination, Genetic, Pharmacology, biology, Escherichia coli Proteins, Klebsiella-pneumoniae, Proteins, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, biology.organism_classification, Reverse Genetics, Anti-Bacterial Agents, 3. Good health, Spectrum beta-lactamases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Infectious Diseases, Amino Acid Substitution, Chromosomal region, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Penicillin binding, Bacterial outer membrane, Mutations, medicine.drug
Abstract: International audience; Objectives: So far, two types of mechanism are known to be involved in carbapenem non-susceptibility of Escherichia coli clinical isolates: reduced outer membrane permeability associated with production of ESBLs and/or overproduction of class C beta-lactamases; and production of carbapenemases. Non-susceptibility to only imipenem observed in two clinical isolates suggested a new mechanism, described in the present study.Methods: The ST was determined for the two isolates of E. coli (strains LSNy and VSBj), and their chromosomal region encoding the penicillin-binding domain of PBP2 was amplified, sequenced and then used for recombination experiments in E. coli K12 C600. Antibiotic MICs were determined using the Etest method.Results: Strains LSNy and VSBj, which displayed ST23 and ST345, respectively, showed amino acid substitutions in their PBP2 penicillin-binding domain. Substitution Ala388Ser located in motif 2 (SXD) was common to the two strains. Two additional substitutions (Ala488Thr and Leu573Val) located outside the two other motifs were identified in strain LSNy, whereas another one (Thr331Pro) located in motif 1 was identified in strain VSBj. Recombination experiments to reproduce non-susceptibility to imipenem in E. coli K12 C600 were not successful when only the common substitution was transferred, whereas recombination with DNA fragments including either the three substitutions (strain LSNy) or the two substitutions (strain VSBj) were successful.Conclusions: Substitution of amino acids in the penicillin-binding domain of PBP2 is a new mechanism by which E. coli clinical isolates specifically resist imipenem.
Published: 2015
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8. Predominance of healthcare-associated cases among episodes of community-onset bacteraemia due to extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae

Author: Jean-Ralph Zahar, Philippe Lesprit, Stephane Ruckly, Aurelia Eden, Hitoto Hikombo, Louis Bernard, Stephan Harbarth, Jean-François Timsit, Christian Brun-Buisson, Nejla Aissa, Alain Losniewski, Sandrine Henard, Christian Rabaud, Cécile Janssen, Léonardo Pagani, Stéphane Bland, Jacques Gaillat, Jean Pierre Bru, Pierre Bonnin, Gaelle Clavère, Virginie Vitrat, Laurence Maulin, Luc Quarsaet, Helene Roger, Jean-Baptiste Euzen, Eric Denes, Elodie Couve-Daecon, Catherine Lechiche, Jean-Philippe Lavigne, Véronique Mondain, Celine Pulcini, Veronique Garnier, Dorothée Lambert, Maxime Hentzien, Yohan Nguyen, Jean Paul Talarmin, Pascaline Rameau, Françoise Geffroy, Arnaud Salmon-Rousseau, Vincent Cattoir, Antoine Froissart, Said Aberrane, Laurence Legout, France Roblot, Guillaume Beraud, Patricia Pavese, Olivier Belmonte, Nicolas Traversier, Laurent Bellec, Marie Lagrange-Xelot, Marie-Pierre Moiton, Barbara Kuli, Pascal Longuet, Agnes Scanvic, Lea Colombain, Milagros Ferreyra, Maxime Jean, Etienne Laurens, Matthieu Saada, Hugues Aumaitre, Martine Malet, Frederique Roustant, Vincent LeMoing, Jean-Pierre Helene, Jonathan Theodore, Caroline Garandeau, Jocelyne Caillon, Benjamin Olivero, David Boutoille, Didier Lepelletier, Lucia Grandière-Perez, Aurélie Beaudron, Céline Ramanantsoa, Catherine Varache, Nicolas Varache, Nicolas Crochette, Hikombo Hitoto, Sophie Blanchi, Pascale Penn, Bernard Louis, Dominique Vanjak, Marie-Christine Escande, René-Gilles Patrigeon, Stéphanie Honoré, Audrey Barrelet, Marlène Amara, Jean-Marc Galempoix, Jean-Claude Réveil, Patricia Bucchiotty, Carine Couzigou, Alban LeMonnier, Emilie Boidin, Stephane Sire, Nelly Luizy, Caroline Bronstain, Carolina Fankhauser, Caroline Brossier, Elodie von Dach, Colette Sauve, Marie-Noelle Adam, Laurent Hocqueloux, Laurent Bret, Marie-Hélène André, Régine Barruet, Marion Challier, Andre Cabié, Benoit Roze, Patrick Plesiat, Katy Jeanot, Isabelle Patry, Joséphine Moreau, Catherine Chirouze, Aaron Laurent, Marie-Nadège Bachelier, Guillaume Kac, Nicolas Farthouat, Nicolas Feuillebois, Thomas Guimard, Sandra Bourdon, Sophie Nguyen, Serge Alfandari, Houcine Bentayeb, Mari-Thérèse Albertini, Bruno Marchou, Noémie Gaudré, Damien Dubois, Christelle Guillet-Caruba, Florence Doucet Populaire, Nicolas Fortineau, Leila Escaut, Vincent Fihman, Rémy Gauzit, Josette Raymond, Solene Kerneis, Veronique Leflon-Guibout, Agnes Lefort, Aurelien Dinh, Anne-Laure Roux, Sophie Abgrall, Françoise Jauréguy, Jean-Christophe Lucet, Nathalie Soismier, Amanda Lopes, Emmanuelle Cambau, Veronique Manceron, Guilène Barnaud, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Hôpital Foch [Suresnes], Outcomerea, Centre Hospitalier Saint Jean de Perpignan, Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Faculté de médecine [Genève], Prévention et contrôle des infections (PCI ), Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG), Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de réanimation médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Pediatrics, Bacteremia, Community-Acquired Infections/epidemiology/microbiology, Antibiotic appropriateness, Klebsiella spp, 0302 clinical medicine, Healthcare associated, Risk Factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Prevalence, Risk of mortality, Medicine, Pharmacology (medical), Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, beta-Lactamases/secretion, Community onset, ddc:616, Aged, 80 and over, Cross Infection, education.field_of_study, biology, Enterobacteriaceae Infections, General Medicine, Middle Aged, Enterobacteriaceae, 3. Good health, Community-Acquired Infections, Treatment Outcome, Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Cross Infection/microbiology, Female, Bacteremia/epidemiology/microbiology, Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, 030106 microbiology, Population, beta-Lactamases, 03 medical and health sciences, Extended-spectrum β-lactamase, Antibiotic therapy, Enterobacteriaceae/classification/enzymology/isolation & purification, Humans, Risk factor, education, Aged, Enterobacteriaceae Infections/epidemiology/microbiology, business.industry, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, biology.organism_classification, bacterial infections and mycoses, Survival Analysis, Risk factors, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Bacteraemia, business
Abstract: International audience; Extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae (ESBL-PE) are endemic pathogens worldwide. Infection with ESBL-PE may be associated with inadequate antibiotic therapy and a poor outcome. However, risk factors for ESBL-PE community-acquired infections are ill-defined. An observational multicentre study was performed in 50 hospitals to identify the prevalence of and risk factors for community-acquired ESBL-PE bacteraemia. All patients presenting with community-onset Enterobacteriaceae bacteraemia were recorded over a 2-month period (between June and November 2013). Risk factors and 14-day outcomes of patients were investigated. Among 682 Enterobacteriaceae bacteraemia episodes recorded, 58 (8.5%) were caused by ESBL-PE. The most frequent species isolated were Escherichia coli (537; 76.7%) and Klebsiella spp. (68; 9.7%), of which 49 (9.1%) and 8 (11.8%), respectively, were ESBL-producers. Most ESBL-PE episodes were healthcare-associated, and only 22 (38%) were apparently community-acquired. The main risk factor for community-acquired ESBL-PE bacteraemia was a prior hospital stay of ≥5 days within the past year. The overall 14-day survival was 90%; only 4 (6.9%) of 58 patients with ESBL-PE bacteraemia died. Inadequate initial antibiotic therapy was administered to 55% of patients with ESBL-PE bacteraemia but was not associated with increased 14-day mortality. Although many patients had community-onset ESBL-PE bacteraemia, almost two-thirds of the episodes were actually healthcare-associated, and true community-acquired ESBL-PE bacteraemia remains rare. In our essentially non-severely ill population, inappropriate initial therapy was not associated with a higher risk of mortality.
Published: 2017
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9. Erratum to 'Predominance of healthcare-associated cases among episodes of community-onset bacteraemia due to extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae' [International Journal of Antimicrobial Agents 49/1 67-73]

Author: Jean-Ralph Zahar, Philippe Lesprit, Stephane Ruckly, Aurelia Eden, Hitoto Hikombo, Louis Bernard, Stephan Harbarth, Jean-Francois Timsit, Christian Brun-Buisson, Jean Carlet, Pierre Dellamonica, Remy Gauzit, Christian Rabaud, Serge Alfandari, Robert Cohen, Bruno Coignard, Celine Pulcini, Jerome Robert, Nejla Aissa, Alain Losniewski, Sandrine Henard, Cecile Janssen, Leonardo Pagani, Stephane Bland, Jacques Gaillat, Jean Pierre Bru, Pierre Bonnin, Gaelle Clavere, Virginie Vitrat, Laurence Maulin, Luc Quarsaet, Helene Roger, Jean-Baptiste Euzen, Eric Denes, Elodie Couve-Daecon, Catherine Lechiche, Jean-Philippe Lavigne, Veronique Mondain, Veronique Garnier, Dorothee Lambert, Maxime Hentzien, Yohan Nguyen, Jean Paul Talarmin, Pascaline Rameau, Francoise Geffroy, Arnaud Salmon-Rousseau, Vincent Cattoir, Antoine Froissart, Said Aberrane, Laurence Legout, France Roblot, Guillaume Beraud, Patricia Pavese, Olivier Belmonte, Nicolas Traversier, Laurent Bellec, Marie Lagrange-Xelot, Marie-Pierre Moiton, Barbara Kuli, Pascal Longuet, Agnes Scanvic, Lea Colombain, Milagros Ferreyra, Maxime Jean, Etienne Laurens, Matthieu Saada, Hugues Aumaitre, Martine Malet, Frederique Roustant, Vincent LeMoing, Jean-Pierre Helene, Jonathan Theodore, Caroline Garandeau, Jocelyne Caillon, Benjamin Olivero, David Boutoille, Didier Lepelletier, Lucia Grandiere-Perez, Aurelie Beaudron, Celine Ramanantsoa, Catherine Varache, Nicolas Varache, Nicolas Crochette, Hikombo Hitoto, Sophie Blanchi, Pascale Penn, Bernard Louis, Dominique Vanjak, Marie-Christine Escande, Rene-Gilles Patrigeon, Stephanie Honore, Audrey Barrelet, Marlene Amara, Jean-Marc Galempoix, Jean-Claude Reveil, Patricia Bucchiotty, Carine Couzigou, Alban LeMonnier, Emilie Boidin, Stephane Sire, Nelly Luizy, Caroline Bronstain, Carolina Fankhauser, Caroline Brossier, Elodie von Dach, Colette Sauve, Marie-Noelle Adam, Laurent Hocqueloux, Laurent Bret, Marie-Helene Andre, Regine Barruet, Marion Challier, Andre Cabie, Benoit Roze, Patrick Plesiat, Katy Jeanot, Isabelle Patry, Josephine Moreau, Catherine Chirouze, Aaron Laurent, Marie-Nadege Bachelier, Guillaume Kac, Nicolas Farthouat, Nicolas Feuillebois, Thomas Guimard, Sandra Bourdon, Sophie Nguyen, Houcine Bentayeb, Mari-Therese Albertini, Bruno Marchou, Noemie Gaudre, Damien Dubois, Christelle Guillet-Caruba, Florence Doucet Populaire, Nicolas Fortineau, Leila Escaut, Vincent Fihman, Josette Raymond, Solene Kerneis, Veronique Leflon-Guibout, Agnes Lefort, Aurelien Dinh, Anne-Laure Roux, Sophie Abgrall, Francoise Jaureguy, Jean-Christophe Lucet, Nathalie Soismier, Amanda Lopes, Emmanuelle Cambau, Veronique Manceron, Guilene Barnaud, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Foch [Suresnes], Centre Hospitalier Saint Jean de Perpignan, Service d'Infectiologie et des maladies infectieuses et tropicales [CH Le Mans] | Infectious and tropical disease department [Le Mans hospital], Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Prévention et contrôle des infections (PCI ), Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG), Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, Hôpital Cochin [AP-HP], Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Réseau Antibiolor, Stress, Immunité, Pathogènes (SIMPA), Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Tourcoing, Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Bactériologie [CHU Nancy], Institute for Computational Modeling in Civil Engineering, Technische Universität Braunschweig = Technical University of Braunschweig [Braunschweig], Imperial College London, Service des Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier de la Région d'Annecy (Pringy), Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Limoges], CHU Limoges, Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CH Cornouaille, Plateforme imagerie et cytométrie (PFIC), Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse (AMMICa), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service NEUROSPIN (NEUROSPIN), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 (METRICS), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institute of New Imaging Technologies (INIT), Universitat Jaume I, Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion), Unité des maladies infectieuses, Hôpital Bichat - Claude Bernard, CHU Pontchaillou [Rennes], Laboratoire Cliniques Pathologique et Interculturelle (LCPI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), SAD Paysage (SAD Paysage), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Service des maladies infectieuses CHU Perpignan, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Département de Chimie Moléculaire (DCM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Thérapeutiques cliniques et expérimentales des infections (EA 3826) (EA 3826), Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Centre de Recherche en Ingénierie financière et finance Publique (CRIFP), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de bactériologie et hygiène hospitalière [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre de Recherches en Oncologie biologique et Oncopharmacologie (CRO2), Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier de Charleville-Mezières, Université de Bordeaux (UB), Institut de Recherche Dupuy de Lôme (IRDL), École Nationale d'Ingénieurs de Brest (ENIB)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Cell Biology, Sciences III, Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), Université Laval [Québec] (ULaval), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], CHU Fort de France-CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France], Agents pathogènes et inflammation - UFC (EA 4266) (API), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Institut de l'élevage (IDELE), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Laboratoire d'Informatique de l'Université du Mans (LIUM), Le Mans Université (UM), Physiopathologie de l'Endothelium, Vascular research center of Marseille (VRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], Université de Sherbrooke (UdeS), Centre hospitalier universitaire de Tourcoing, Homéostasie Cellulaire et Pathologies (HCP), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Laboratoire Montpelliérain d'Économie Théorique et Appliquée (LAMETA), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Faculty of Mathematics, Informatics, and Mechanics [Warsaw] (MIMUW), University of Warsaw (UW), Service de Microbiologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Services des maladies infectieuses, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble (IPAG), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Département de Médecine interne [Lariboisière], Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Emergence de la résistance bactérienne in vivo (EA3964), AP-HP Groupe Hospitalier Lariboisière, Laboratoire d'ethnologie et de sociologie comparative (LESC), Université Paris Nanterre (UPN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Equipe mobile d'infectiologie, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service Microbiologie-Hygiène Hospitalière, Institut franco-allemand de recherche de Saint-Louis, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Unité d’Otologie, implants auditifs et chirurgie de la base du crâne [CHU Pitié-Salpêtrière], Service d'Oto-Rhino-Laryngologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), CHU Toulouse [Toulouse], Institut de recherche en astrophysique et planétologie (IRAP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Epidémiologie pronostique des cancers et affections graves, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infection Control Programme and WHO Collaborating Centre on Patient Safety, CHU Cochin [AP-HP], Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA), Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Technische Universität Braunschweig [Braunschweig], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Génie Informatique et Ingénierie de Production (LGI2P), IMT - MINES ALES (IMT - MINES ALES), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Service d'Otologie, Implants auditifs et Chirurgie de la base du crâne [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Santé publique : épidémiologie et qualité des soins-EA 2694 (CERIM), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Geneva [Switzerland], Université Laval, Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens (UMR SYSTEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon), Institut de l'Elevage, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Université de Sherbrooke [Sherbrooke], Hôpital Purpan [Toulouse], Université Montpellier 1 (UM1)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Faculty of Mathematics, Informatics, and Mechanics [Warsaw], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP Hôpital Raymond Poincaré [Garches], Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Avicenne-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris 13 (UP13), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Lariboisière, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Aix Marseille Université (AMU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Université de Brest (UBO)-Université de Bretagne Sud (UBS), Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), CHU Fort de France-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-CHU de la Martinique [Fort de France], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes], Hôpital Beaujon [AP-HP], Cholley, Pascal, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Université de Bretagne Sud (UBS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Nice-University Hospital, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Laboratoire de Physiologie des Invertébrés ( LPI ), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) ( LEMAR ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ) -Université de Brest ( UBO ) -Institut Universitaire Européen de la Mer ( IUEM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Brest ( UBO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Brest ( UBO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale ( SESSTIM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie ( IMPMC ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de recherche en astrophysique et planétologie ( IRAP ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Observatoire Midi-Pyrénées ( OMP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Equipe Poitevine de Recherche et d'Encadrement Doctoral en sciences criminelles de Poitiers ( EPRED ), Université de Poitiers, Laboratoire de Génie Informatique et Ingénierie de Production ( LGI2P ), IMT - Mines Alès Ecole Mines - Télécom ( IMT - MINES ALES ), Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), Laboratoire de Physique Corpusculaire - Clermont-Ferrand ( LPC ), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS ( IN2P3 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Universitaire de Reims ( CHU de Reims ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Plateforme imagerie et cytométrie ( PFIC ), Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse ( AMMICa ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service NEUROSPIN ( NEUROSPIN ), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) ( DRF (CEA) ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, CHU de Poitiers, Santé publique : épidémiologie et qualité des soins-EA 2694 ( CERIM ), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Institute of New Imaging Technologies ( INIT ), Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion ( CHU La Réunion ), Laboratoire Cliniques Pathologique et Interculturelle ( LCPI ), Université Toulouse - Jean Jaurès ( UT2J ), SAD Paysage ( SAD Paysage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, VIH/SIDA et maladies associées, Université Montpellier 1 ( UM1 ), Département de Chimie Moléculaire ( DCM ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Thérapeutiques Cliniques et Expérimentales des Infections, Université de Nantes ( UN ), Centre de Recherche en Ingénierie financière et finance Publique ( CRIFP ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ), Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Université de Nantes ( UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Centre de Recherches en Oncologie biologique et Oncopharmacologie ( CRO2 ), Aix Marseille Université ( AMU ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Bordeaux ( UB ), Laboratoire Environnement Géomécanique et Ouvrages ( LAEGO ), Institut National Polytechnique de Lorraine ( INPL ), Institut de Recherche Dupuy de Lôme ( IRDL ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -ENSTA Bretagne-Université de Brest ( UBO ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens ( SYSTEM ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] ( WUR ), CHU de la Martinique-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], CHU Fort de France-CHU de la Martinique-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique, Agents pathogènes et inflammation - UFC (EA 4266) ( API ), Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Saint-Jacques, Laboratoire d'Informatique de l'Université du Mans ( LIUM ), Le Mans Université ( UM ), Vascular research center of Marseille ( VRCM ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Aix Marseille Université ( AMU ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Aix Marseille Université ( AMU ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou, Homéostasie Cellulaire et Pathologies ( HCP ), Université de Limoges ( UNILIM ) -CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST FR CNRS 3503 ), Hôpital Purpan - Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Toulouse, Laboratoire Montpelliérain d'Économie Théorique et Appliquée ( LAMETA ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), University of Warsaw ( UW ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP Hôpital Raymond Poincaré [Garches], Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble ( IPAG ), Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble ( OSUG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Avicenne-Université Paris 13 ( UP13 ), Infection, Antimicrobiens, Modélisation, Evolution ( IAME ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Lariboisière, Emergence de la résistance bactérienne in vivo ( EA3964 ), Laboratoire d'ethnologie et de sociologie comparative ( LESC ), Université Paris Nanterre ( UPN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ), Hopital Necker-Enfants Malades, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] ( CHU ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Université de Limoges (UNILIM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-CHU Limoges, and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris 13 (UP13)
Subjects: Microbiology (medical), 0303 health sciences, medicine.medical_specialty, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, biology, 030306 microbiology, business.industry, General Medicine, biology.organism_classification, Antimicrobial, Enterobacteriaceae, 3. Good health, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Infectious Diseases, Healthcare associated, [ SDV.MHEP ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, medicine, Pharmacology (medical), 030212 general & internal medicine, Intensive care medicine, business, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Community onset
Abstract: International audience
Published: 2017
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10. Prevalence of mupirocin resistance among invasive coagulase-negative staphylococci and methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in France: emergence of a mupirocin-resistant MRSA clone harbouring mupA

Author: Richard Bonnet, Hélène Jean-Pierre, Anne-Sophie Bourrel, J. Etienne, Y. Rio, Jacques Tankovic, M. Biendo, Elisabeth Chachaty, Jean-Winoc Decousser, Véronique Vernet-Garnier, Julien Potier, Nejla Aissa, Alain Lozniewski, Alain Fiacre, Marie-Hélène Nicolas-Chanoine, Frédéric Laurent, Patrice Nordmann, F. Girard-Pipau, Jean-Philippe Lavigne, C. Plouzeau-Jayle, Christian Cattoen, François Vandenesch, Vincent Cattoir, Florence Doucet-Populaire, C. Eloy, Jocelyne Caillon, François Caron, T. Roussel-Gaillard, François Jehl, J. Texier-Maugein, Max Maurin, Laurent Bret, Grégoire Aubert, M. Archambaud, Marie-Cécile Ploy, C. Loiez-Durocher, Isabelle Patry, Gerard Lina, H. Courtade, C. Buisson-Touati, H. Rostane, G. Blanchard-Marche, Nicolas Fortineau, Roland Leclercq, Nadège Bourgeois-Nicolaos, Philippe Morand, Marine Desroches, Frédéric Robin, Hôpital Antoine Béclère, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Immunité infection vaccination (I2V), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-IFR128-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Bactéries, Pathogènes et Santé (UBaPS), Faculté de Pharmacie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), CHU Henri Mondor, Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges], CHU Limoges, and Novartis, France
Subjects: DNA, Bacterial, Microbiology (medical), Staphylococcus, Mupirocin, Microbial Sensitivity Tests, Biology, Staphylococcal infections, medicine.disease_cause, Polymerase Chain Reaction, Microbiology, law.invention, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Bacterial Proteins, law, Drug Resistance, Bacterial, medicine, Pharmacology (medical), Prospective Studies, Polymerase chain reaction, 030304 developmental biology, Lyon clone, Pharmacology, Molecular Epidemiology, 0303 health sciences, 030306 microbiology, Broth microdilution, Nuclear Proteins, invasive staphylococci, Staphylococcal Infections, Microarray Analysis, medicine.disease, Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Anti-Bacterial Agents, Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field, 3. Good health, Molecular Typing, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Infectious Diseases, chemistry, Staphylococcus aureus, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, decolonization, lipids (amino acids, peptides, and proteins), France, Coagulase
Abstract: OBJECTIVES Mupirocin is the cornerstone of decolonization regimens, a successful strategy to prevent healthcare-associated staphylococcal infections. Several recent studies have reported alarming results: (i) an extending reservoir of mupA, the ancestral mobile resistance gene, among coagulase-negative staphylococci (CoNS); (ii) the emergence of a new resistance gene (mupB); and (iii) a growing number of mupirocin-resistant methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), including highly pathogenic clones. We performed a nationwide prospective study in France to detect such trends among invasive staphylococci. METHODS Between October 2011 and February 2012, 367 MRSA and 708 CoNS invasive isolates were collected from 37 hospitals and analysed centrally. Mupirocin MICs were determined using the broth microdilution method. mupA/B PCR was performed for resistant isolates (MIC >1 mg/L). Genetic relatedness between mupirocin-resistant MRSA isolates was determined by PFGE analysis and related isolates were tested by microarray. RESULTS Among MRSA isolates 2.2% (n = 8) were classified as mupirocin resistant; 1.4% (n = 5) showing low-level resistance (MIC ≤256 mg/L) and 0.8% (n = 3) high-level resistance (MIC >256 mg/L). Only the latter isolates carried mupA. A clonal relationship was identified between two mupA-negative MRSA from the same hospital and three mupA-positive MRSA from three distant towns; these three isolates belonged to the Lyon clone. Mupirocin resistance was identified in 10.3% of CoNS, mainly highly resistant mupA-positive isolates (5.6%). The mupB gene was not detected in mupirocin-resistant MRSA or CoNS. CONCLUSIONS This first large national study indicates the need for thorough epidemiological monitoring and a stewardship programme to prevent and detect mupirocin resistance in staphylococci.
Published: 2013
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11. Factors associated with 12 week case-fatality in Staphylococcus aureus bacteraemia: a prospective cohort study

Author: P. Braquet, F. Alla, C. Cornu, F. Goehringer, L. Piroth, C. Chirouze, M. Revest, C. Lechiche, X. Duval, V. Le Moing, Catherine Chirouze, Elodie Curlier, Cécile Descottes-Genon, Bruno Hoen, Isabelle Patry, Lucie Vettoretti, Pascal Chavanet, Jean-Christophe Eicher, Marie-Christine Greusard, Catherine Neuwirth, André Péchinot, Lionel Piroth, Marie Célard, Catherine Cornu, François Delahaye, Malika Hadid, Pascale Rausch, Audrey Coma, Florence Galtier, Philippe Géraud, Hélène Jean-Pierre, Vincent Le Moing, Catherine Sportouch, Jacques Reynes, Nejla Aissa, Thanh Doco-Lecompte, François Goehringer, Nathalie Keil, Lorraine Letranchant, Hepher Malela, Thierry May, Christine Selton-Suty, Nathalie Bedos, Jean-Philippe Lavigne, Catherine Lechiche, Albert Sotto, Xavier Duval, Emila Ilic Habensus, Bernard Iung, Catherine Leport, Pascale Longuet, Raymond Ruimy, Eric Bellissant, Pierre-Yves Donnio, Fabienne Le Gac, Christian Michelet, Matthieu Revest, Pierre Tattevin, Elise Thebault, François Alla, Pierre Braquet, Marie-Line Erpelding, Laetitia Minary, Michèle Bès, Jérôme Etienne, Anne Tristan, François Vandenesch, Alex Van Belkum, Willem Vanwamel, CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique [Nancy] (CIC-IT), Centre d'investigation clinique [Nancy] (CIC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Maladies chroniques, santé perçue, et processus d'adaptation (APEMAC), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université de Lorraine (UL), Evaluation et modélisation des effets thérapeutiques, Département biostatistiques et modélisation pour la santé et l'environnement [LBBE], Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CIC CHU Lyon (inserm), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Département d'infectiologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Fonction, structure et inactivation d'ARN bactériens, Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERA CIC, Hôpital Bichat - Claude Bernard, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses ( TransVIHMI ), Université de Montpellier ( UM ) -Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université Cheikh Anta Diop ( UCAD ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique ( CIC-IT ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Maladies chroniques, santé perçue, et processus d'adaptation ( APEMAC ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université de Lorraine ( UL ), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive ( LBBE ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Saint-Jacques, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes ( CHRU Nîmes ), Infection, Antimicrobiens, Modélisation, Evolution ( IAME ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique (CIC-IT), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes (CHRU Nîmes), and Jonchère, Laurent
Subjects: 0301 basic medicine, Microbiology (medical), Male, medicine.medical_specialty, Staphylococcus aureus, medicine.drug_class, 030106 microbiology, Antibiotics, Bacteremia, Penicillins, Prognostic factors, Tertiary Care Centers, 03 medical and health sciences, Interquartile range, [ SDV.MP ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Vancomycin, Internal medicine, Case fatality rate, medicine, Humans, Blood culture, Prospective Studies, Prospective cohort study, [SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Aged, Antistaphylococcal penicillins, Cross Infection, medicine.diagnostic_test, business.industry, Septic shock, General Medicine, Middle Aged, Staphylococcal Infections, medicine.disease, Prognosis, Survival Analysis, 3. Good health, Surgery, Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Bacteraemia, Antistaphylococcal penicillin, Female, France, business, medicine.drug
Abstract: International audience; Staphylococcus aureus bacteraemia (SAB) is a frequent and deadly disease. Given the lack of a randomized trial, optimal first-line antibiotic treatment is still debated. Our aim was to identify prognostic factors in SAB patients and to analyse the impact of first-line antibiotics. The VIRSTA prospective cohort study was conducted in eight tertiary care centres in France. Consecutive incident adults in whom a blood culture drawn in participating centres grew S. aureus between April 2009 and October 2011 were prospectively followed for 12 weeks. Factors associated with 12-week case-fatality were identified by multivariate logistic regression. We enrolled 2091 patients and analysed survival in 1972 (median age 67.8 years, interquartile range 55.5–78.9; females 692/1972, 35.1%). SAB was nosocomial or healthcare-related in 1372/1972 (69.6%) of cases and the primary focus was unknown in 414/1972 (21.0%) of cases. Week 12 case-fatality rate was 671/1972 (34.0%). The main independent prognostic factors on multivariate analysis were age (adjusted OR by 10-year increment 1.56; 95% CI 1.44–1.69), septic shock (OR 5.11; 95% CI 3.84–6.80), metastatic cancer (OR 4.28; 95% CI 2.88–6.38), and unknown primary focus (OR 2.62; 95% CI 2.02–3.41). In the 1538 patients with methicillin-sensitive S. aureus (MSSA) bacteraemia, first-line empiric antistaphylococcal penicillins (OR 0.40; 95% CI 0.17–0.95) and vancomycin (OR 0.37; 95% CI 0.17–0.83), alone or combined with an aminoglycoside, were associated with better outcome compared with other antibiotics. There are few modifiable prognostic factors for SAB. Initiating empiric antibiotics with antistaphylococcal penicillins or vancomycin may be associated with better outcome in MSSA bacteraemia. © 2016 European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
Published: 2016
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12. Clinical features and prognostic factors of listeriosis: the MONALISA national prospective cohort study

Author: Odile Fremin-Batteux, Juliette Clarissou-Philippe, Benoît Jauhlac, Severine Guyetand, Jacques Gasnault, Corinne Haioun, Liamine Aissaoui, Marie-Christine Pages, Marie-Pierre Fos, Christian Rose, Didier Hubert, Marie-Rose Rothe, N. Bouziges, Benoît Huc, François Devianne, Sabine Bidart, Anne Forest, Kevin Bertrand, Mohamed Eldeghedy, Annick Verhaeghe, Caroline Malderet, Anne Bertrou, Bernard Guerquin, Catherine Duche, Muriel Archambaud, Rabea Cotteret, Olivier Toullalan, Yves Devaux, Smail Bergheul, Valérie Sivadon-Tardy, Pierre-Gilles Merville, Geneviève Blanchard-Marche, Didier Raoult, Bernard Hory, Florence Richardin, Evelyne Belle, Mohamed Menouar, K Guitteaud, Mohamad Mohty, Ambroise Montcriol, Max Laurin, Aurélia Picard, Jean-Paul Mira, Marie-Charlotte Chopin, Richard Bonnet, Michel Wolff, Sébastien Maillez, Jeanne Maugein, Véronique Leblond, Nicola Walid, Bernard Gauche, Mathieu Evillard, Hassen Jeddi, Anne Bourlet, Isabelle Grawey, Thierry Jault, Sandrine Hiret, Valerie Gaborieau, Véronique Boin-Gay, An Kim, Thierry Constans, Jean-François Gaide, Martine Giraud, Eric Meaudre Desgouttes, Alain Fur, Abdallah Maakaroun, Olivier Matray, Bertrand Maubert, Frédérique Péchinot, Aurelie Garbi, Claire Delbrouck, Benoît Grandclerc, Vincent Cadiergue, Hervé Lécuyer, Bernadette Grignon, Thierry Bensaid, Nicole Constantin, Yannick Chevalier, Hassène Rahmani, Thierry Levent, Joelle Desliers, Florence Van de Velde, Xavier Adhoute, Clara Andriau, Christophe Charasse, Rémi Vatan, Benoît Martha, Alain Lecis, Didier Albert, Romain Jacobs, Hélène Lefranc, Christian Martin, Nasseur Rezgui, Bertrand Pigeon, Catherine Le Henaff, Dominique Cassignard, Françoise Cotes, Eric Pujade Lauraine, Jean-François Gattault, Nicole Ferreira-Maident, Noémie Jourde-Chiche, Hélène Garrec, Olivier Darchen, Carole Schwebel, Marie-Christine Bezian, Patrick Daoud, Tsouria Becaid, Simone Laluque, David Broche, Christine Boisselier, Pascale Martres, Sarah Hammami, Brigitte Olivier, Jean-Marie Nkunzimana, Eric Monlun, Isabelle Marterl-Lafay, Marion Carboni, Marie-Françoise Mattei, Sandrine Castelin, Isabelle Barillot, Marie-Noelle Cufi, Thomas Kaiser, Catherine Herry, Pascal Hutin, Jean-Pierre Bronowicki, Bernard Branger, Pierre Thomas, Elie Zagdoun, Anne Goquelin, Ziad Assaf, Ingrid Croquet, Bruno Pozzetto, Thomas Similowski, Anne-Isabelle Briere, Marie-Thérèse Albertini, Mariam Blaka, Christelle Tassot, Anne Gaschet, Jean-Philippe Lavigne, Antoine Pujol, Philippe Colombat, Edouard Devaud, Hana Talabani-Boizot, François Barière, Anne-Marie Cordier, Philippe Gueudet, Georges Simon, Anne-Sophie Lipovac, Françoise Bandaly, Anne Beauplet-Lepage, Sylvie Prince, Charlotte Jouzel, Jean-Luc Deboutin, Patrick Zavadil, Louis Puybasset, Marie-Cécile Petit, Loïc Guillevin, Kamel Touati, Christophe Ntalu Nkato, Sylvie Carette, Jacques Vaucel, Chantal Delasalle, Marine Gross Goupil, Laurent Gutmann, Christiane Payen, Annick Barboteau, Firouzé Bani-Sadr, Christophe Legendre, Philippe Roulier, Elie Azria, Ibrahim Farah, Isabelle Rouquette-Vincent, Anne-Sophie Erena-Penet, Philippe Labadie, Eric Josien, Aicha Derragui, Mathieu Legrand, Odile Beyne-Rauzy, Jean-Marc Nabholtz, Marie-Joelle Demarcq, Olivier Garosi, Michel Deiber, Fabrice Chaix, Bertrand Souweine, Anne Collignon, Gisèle Renard, Mickael Jego, Gilles Bernardin, Anne Allart, Jocelyn Barrier, Marc Vasse, Philippe Ménager, Marc Wurmser, Abderkader Ouazir, Olivier Gontieron, Yvon Berland, Sébastien Trouiller, David Leysenne, Christophe Ozanon, Fanny Autret, Tahar Saghi, Loïc Dopeux, Sophie Benoit-Coustou, T. Fraisse, Christine Maillard, Karine Nikodijevic, Georges Kaltenbach, Angéline Jamet, Philippe Aucher, Julie Bottero, Marie-Claude Piffaut, Marianne Besnard, Florence Courillon, Marie Bonfils, Christine Ghevaert, Marie Destors, Eliette Jeanmaire, Franck Zerbib, Manuel-Luis Gameiro, T Prazuck, Laurent Mandin, Olivier Guisset, Marguerite Fines, Toufik Feddal, Agnès Jouffret, Louis Mesnard, Thomas Bourrée, Hasinrina Razafimahefa, Sylvestre Tigaud, Vincent Estève, Philippe Malherbe, Jean-Michel Salord, Pascal Adam, Bertrand Rozec, Michel Fuillet, Olivier Lemenand, Denis Quinsat, Ana Danalaché, Véronique Vialette, François Brosset, Patrick Messner Pellenc, Nicolas Heisel, Edouard Girard, Régine Martin, Olivier Garesslin, Catherine Mille, Alexandre Gascon, Marc Nicolino, Laurence Mouly, Claire Fabre, Bénédicte Ponceau, Marie-Etiennette Emeriau, Pascal Cathebras, Bérangère Bernardaud, Michèle Pérouse de Montclos, O. Arsene, Karine Grenet, Yazdan Yazdanpanah, Sten De Witte, Anne Scemla, Laurence Bouillet, Christophe Burucoa, Vincent Loffeier, Séverine Visentin, Luc Desfrere, Miloud Arabi, Frédérique Costa, Sylvie Lechat, Ali Chekroun, Raymond Ruimy, Marie, Jérôme Bizet, Xavier Nassif, Baihas Dib, Patrick Bert-Marcaz, Laurent Martin Lefèvre, Nicholas Sedillot, Blandine Cattier, Emilie Boidin, Daniel Sondag, Aude Bourrouillou, Alain Noirot, Franck Desemerie, Fréderic Heluwaert, Catherine Tamalet, Marc G. Berger, Jean-Daniel Lelièvre, Dominique Perotin, Abdelkader Bemrah, Alain Lozniewski, Bernard Borstein, Hanna Eid, Diana Suatean, Virginie Mignaut, Jean-Claude N'guyen, Valérie Le Goff, Laurent Teillet, Christophe Rolland, Gwenaël Alfonsi, Florence Lachenal, Philippe Bossi, Yves Botreau, Florence Doucet Populaire, Henry Jardel, Nicolas Gallo, Elias Jabre-Sikias, Michel Dupon, Hélène Brihier, Isabelle Patry, Alexandre Leclercq, Bernadette Tourrand, Christophe Roussel, Jean-Emmanuel Kurtz, Bénédicte Paindaveine, Simon Elhadad, Richard Sanchez, Eric Sgro, Pierre Berger, Valérie Murbach, Anne Holstein, Florence Martin, Taoufik Merabet, Amélie Benbara, Milagros Ferreyra, Laure Esposito, Pierre Delobel, Antoine Andremont, Marc Bourlière, Carole-Anne Boudy, Jean-Baptiste Gaulthier, Laurent Tacchini, Olivier Marpeau, Sonia Tesseydre, Marie-Pierre Coulhon, Nathalie Hodee, Marie-Chrsitine Conroy, Pierre Weinbreck, Roland Leclercq, Laurent Souply, Christian Bidault, Annie Elbez, Marie-Annick Lebreton, Patrick Brisou, Agnès Ferroni, Jean-Louis Pourriat, Nadia Anguel, Christian Noel, Philippe Jouvencel, Eric Pichard, Xavier Martin, Mathieu Coste, Pierre Zuber, Catherine Neuwirth, Jean-Pierre Hacot, Paul Aye, Jérôme Guinard, Yves Pean, Jean-Christophe Dengo, Fabrice Petassou, Didier Viole, Thierry Messiaen, Jean Beytout, Philippe Petitjean, Ferdinand Savare, Patrice Cuvillier, Sophie Coignard, Hélène Anglaret, Nassim Kamar, Elisabeth Chachaty, Karine Guimard, Louis Braem, Hacene Fezoui, Pierre Martin, Jean-Paul Viard, Claire Larroche, Nicolai Claudiu-Plesa, Thierry Benoit-Cattin, Olivier Moquet, Thierry Pasdeloup, David Rosay, Rodolphe Jean, Jean-Bernard Mariette, Marc Debouverie, Hervé Peltier, Mustapha Terki, Jacques Daleas, Valérie Dattin-Dorrière, Michel Vergnaud, Emmanuel Grimprel, Sylvène Rosselli, Jean-Marc Didier, Pierre Faurie, Luc Frimat, Aziza Mandjee, Sabine Etchemendy, Pierre Tissières, Jean Nakhleh, Sylvie Mariette, Christian Perronne, Bruno Carbonne, Nathalie Houssiaux-Maisonneuve, Tristan Ferry, S Beague, Anthony Sebban, Marie-Thérèse Hili, Jean-Michel De Kermadec, Lucien Brasme, Gilles Blaison, Caroline Garandeau, Jean-Pierre Sollet, Laurent Tronchon, Thierry Samson, Julien Gesquière, Nicolas Ettahar, Alain Créange, Etienne Laurens, Véronique Equy, Fréderic Bart, Bernard Bouffandeau, Christine Vaillant, Valerie Pesque, Jean-Marc Lalot, Marc Levy, Michel Kaidomar, Mihaela Saplacan, Sterenn Yvenou, Marie-Isabelle Steibach, Emmanuelle Cambau, Agnès Riche, François Fourrier, François Raffi, Mélissa Lalu, Henri Bérard, Danielle Clave, Jean-Claude Mouries, Martine Porcheron, Jean Cabalion, Richard Lamarca, Nathalie Canu, Jean-Baptiste Roseau, Annabelle Stoclin, Luca Luminitan Elena Lupean, Rémi Gebeile, Celia Salanoubat, Carole Marmouset, Pierre Bigot, Anne-Laure Breton, Pierre Kalfon, Colette Vincent, Sophie Marty, Olivier Tandonnet, Alexis Redor, Xavier Valette, Ourida Aoudia, Jacques-Arnaud Seyrig, Bertrand Beaune, Hugues Aumaitre, Georges Pinon, Yann Leveneur, Sylvie Charachon, Raoul Herbrecht, Henriette de Valk, Gary David, Julien Pouyanne, Marc Dommergues, Majed Al Chaar, Véronique Blanc-Amrane, Pascale Guillarmé Grossmann, Bruno Abraham, Yves Morel, Philippe Suel, Denis Sautereau, Olivier Guilloy, Tu Anh Tran, Frédéric Laurent, Zahir Amoura, Jacques-Olivier Bay, Zoubida Elharie-Heraux, Joyce Sibony-Prat, Bernard Guillois, Dominique Rohmer-Heitz, Audrey Barrelet, Jérémie Courouble, Jean-Paul Herry, Daniel Vittecoq, Annie Vermesch-Langlin, Jean Auroux, Claude Aubert, Thierry Harvey, Ghislaine Lamoine-Gimet, J. Riahi, Florence Soraudeau, Bachar Al-Jalaby, Caroline Périsson, Khélifa Ayouz, Florence Cardot, François Maillet, Alain Goux, Théophile Magna, Bertille de Barbeyrac, Adrien May, Dominique Andreotti, Olivier Jonquet, Hélène Dumouchel, Didier Thibaud, Philippe Morlat, Pascal Chevalet, Pascal Ancelin, Guy Chambreuil, Cécile Le Boterff, Anne Ceriez, Olivier Detante, B Pangon, Claude C.A. Bernard, Vincent Cailleaux Pierre-Etienne Cailleux, Jordi Miatello, Pierre-Yves le Berruyer, Sylvain Kouaho, Michel Briaud, Hélène Delaby, Patrick Herbecq, Christine Segonds, Véronique Jault, Pascale Brunel, Christine Dussopt, Jean Thore, Jean-Marc Thouret, Jean-Marc Kerleau, François Le Baron, Slavius Matica, Sophie Leautez-Nainville, Matthieu Pecquet, Laurent Bret, Yacine Sedjelmaci, Pierre Metton, Habiboulaye Diallo, Jany Rey Zermati, Arnaud Delahaye, Hélène Chaussade, Laurent Mandelbrot, Emilie Bessede, Olivier Casanovas, Paul Pierrot, Annick Legras, Dominique Lauque, Hélène Gatti, Jean Catineau, Ebutu Likose, Gilles Capellier, Eric Kibbrecht, Freddy Thibaut, Patrick Valadier, Chantal Lemble, Joël Gaudelus, Joelle Mellier, Joëlle Brochen, Emmanuel Gascou, Stéphane Bonacorsi, Stéphanie Bannier, Bruno Fantin, Didier Raffenot, Valérie Revel, Hakim Amroun, Huguette Negrery, Anne-Laure Fauchais, Paul Mercury, Michel Chuzeville, Christian Zumbo, Nicolas Després, Pascal Roblot, Jérôme Pasche, Jean Claude Boufetteau, Jocelyne Caillon, Julien Boileau, V. Rabier, Benjamin Manéglier, Emilie Jourdes, Franck Ceppa, Christine Recule, Nicolas Degand, Benoît Henry, Thierry Baranger, Dominique Pateron, Agnès Pélaquier, Gérard Bouchet, Hélène Fiette, Ozel Guiden, Dana Ranta, Etienne Ruppé, Nabil Chiouk, Jacques Breuil, Dominique Leduc, Véronique Loustaud, Hervé Métenier, Michel Durand, Isabelle Mahé, Leila Karaoui, Marie-José Collus, Mehran Monchi, Olivier Belmonte, Romain Blondet, Jacques Thierry, Karine Humbert, Gilles Salama, Marie-Noelle Heurtaux, Cécile Goujard, Bruno Sivery, Martial Boisseau, Redouane Dahoumane, Pierre Delour, Christian Niels Meyer, Anne Faudon-Gibelin, Gérard Poulain, Roger-Charles Luciani, J.-C. Souquet, Olivier Grossi, François Vandenesch, Sylvain Mermont, Jacques Bronner, Sonia Dahan, Paul Marzouk, Pascal Pouedras, Noureddine Djafari, François-Xavier Caroli-Bosc, Jean-François Dessin, Brigitte Gruffat, Armelle Morin-Fatome, Sylvie Thoinet, Bano Konate, Jean-Winoc Decousser, Claire Poyart, Patrick Plessis, Olivier Millet, Vincent Cattoir, Françoise Geffroy, Manica Vasseur, Pierre Carli, Isabelle Citony, Christian Richard, Nicolas Sigur, Patrick Marthelet, Luwawu Mbimba, Pierre Feugier, Philippe Sauder, Hama Djerad, Evelyne Bourgerette, Hanen Chahtour, Adrien Lemaignen, Dominique Bechade, Patrick Ochocki, Antoine Vieillard Baron, Dominique Astruc, Marie-Pierre Moiton, Nicolas Dubois, Sylvie Ledru, Corinne Seknazi, Hélène Poupet, Jean-Philippe Brieux, Gérard Barthélémy, Aihem Yehia, Louis-Jean Couderc, Ahmed, Françoise Rigaux, Yohann N'guyen, Philippe Bethery, Damien Corberand, Etienne Auvray, Paul-Louis Woerther, Christian Combe, Sophie Delesalle, Jean-Marie Piala, Faraj Al Freijat, Philippe Juvin, Malcolm Lemyze, Hyacine Rey, Claire Larible, Noel Milpied, Lémia Zgarni, Julia Gaillard, Agnès Juven, Paola Otean, Adrien Melis, André Pechinot, Olivier Bouchaud, Olivier Chassin, Pierre Hausfater, Asma Trabelsi-Jnifen, Vincent Grobost, Didier Lemery, Pierre Soury, Françoise Brevet, Jacques Tankovic, Dominique Sansot, Jean Louis Salomon, Charlotte Cordonnier, Brigitte Lamy, Antoine Maisonneuve, Dominique Pressac, Claude Rémy, Rodolphe Sobesky, Stéphanie Cognet, Pierre Cougoul, Didier Jan, Dominique Perrotin, Cécile Hombrouk-Alet, Thierry André, Gilbert Pochmalicki, Serge Girard, Vincent Zerr, Guillaume Cadiot, Claudine Lasbasses, Michel Slama, Abderrazak El Yamani, Sophie Brovedani, Jean Armengaud, Romain Hernu, Géraldine Mascade, Aurélien Lorléa'ch, Ali Akkari, Mathieu Tourdjman, Christopher Payan, Eric Jullian, Nathalie Fonsale, Frédéric Riehl, Paul Strock, Geneviève Grise, Philippe Mottaz, Christian Floriot, Marie-Noëlle Ungeheuer, Denis Caillot, Arnaud Chalvon-Demersay, Catherine Branger, Stanislas Bruley des Varannes, Marc Paccalin, Marie-Pierre Danjean, Alexandre Mebazaa, Xavier Brunet, Roland De Varax, Laurence Delhoustal, Sophie Haro, Bruno Chabanon-Pouget, Isabelle Goidin, Dominique Chudersky, Corinne Costes, Delphine Chatellier, Maud Gelez, Damien Dassant, Pascal Joly, Jean-Michel Arnal, Zakaria Hamitou, Philippe Rondepierre, Carole Pignon, Valérie Crombe, Amanda Lopes, Chrystelle Kemenar, Olivia Raulin, Anne-Cécile Hochart, Sandrine Gérart Pons, Valérie Zeller, Guillermo Reyes Ortega, Mathilde Guérin, Audrey Migraine Bouvagnet, Florence Eboue, Isabelle Loury-Lariviere, Sophie Leotard, Suzanne Lima, Marie Kassis, Jean-Luc Donay, Jean-Pierre Audié, Guillaume Cartron, Arnaud Ribier, Fanny Buron, Mirela Tuca, Marius Semenescu, Arnaud Serre, Vincent Quentin, Denise Bouyssou-Destriau, Violaine Bresson, Christine Chandesris Joséphine Chapalain-Cagnon, Eric Cua, Henri Courtade, François Bénézit, Sébastien Lamache, Philippe Bonnefoy, Francis Schneider, Richard Monarchi, Adeline Schendel, Paramasiven Mootien, Ghislaine Gardes, Pierre-François Westeel, Jean-François Magny, François Caron, Jocelyn Michon, Didier Eyer, Isabelle Ronda, Pierre-Yves Robillard, Frédéric Renou, Anna Faucher, Jean-Robert Harlé, Anne Debernardi, Grégory Akerman, Benoît Fontenel, Pierre Hourdebaigt-Larrusse, Marie-Noëlle Adam, Aude Lessene, Abdelkader Hrichi, François Blot, Athéna Le Pierres, Romain Lemarie, Françoise Granier, Véronique Tardy, Marc Gatfosse, Pierre-Marie Roger, François Goupil, Saïd Aberrane, Franck Bernardi, Isabelle Plantier, Nathalie Funakoshi, Jean-Gilles Delecalle, Patricia Barbut, Jacques Reynes, Christophe Roy, Sophie Perreve, Michel Garre, David Ribes, Cyrille Ede, Jean-Claude Dausset, Francis Duchene, Jean Caussin, Michelle Becker-Schneider, Gilles Berthelot, Damien Dupont, Jean-Michel Gillot, Aurélie Messager, Jean-Marie Pannecouck, Jean-Christian Roussel, Alain Reynaud, Sylvie Cariou, Anne Dao, François Guillemot, Martin Martinot, Patrick Casali, Anne-Sophie Poirier, Aissa Kerchache, Necera Sakek, Eric Porthault, Christophe Decoene, Chantal Ache-Papillon, Brigitte Bicais, Jean-Claude Feugier, Thierry Masseron, Charles Marty-Ane, Daniele Goldgran Toledano, Jean-Christophe Dubus, Damien du Cheyron, Dominique Decré, Jean-Loup Pennaforte, Ahmed Tigaizin, Bernard Vache, Eric Oswald, Claire Moulinoux, Anne-Christine Jaouen, Caroline Charlier, Anne-Laure Virlouvet, Ali Kara, Jean-Luc Sicsic, Sylvie Goffart, Mathieu Zuber, Claudine Fèbre, Olivier Lortholary, Mathieu Dupont, Annie Vessieres, Thierry Helvadjian, Thomas Signouret, Cedric Daupin, Sandrine Essouri, Jean-Louis Jacob, Pascal Boileau, Caroline Blazejewski, Quentin Lepiller, Juan-Pablo Maureira, Eddy Lebas, Christophe Deschamps, Amévi Ananivi, Clovis Foguem, Daniel Adoue, Abdourahim Chamouine, Alain Michault, Bruno Guérin, Olivier Baud, Clara Vinci, Thierry Weitten, Jean-Marc Eychene, Marie Froidure, Julien Obiols, Patricia Roussellier, Marc Lecuit, André Cabié, Saskia Foucart, Karim Belhadj, Michel Cingotti, Bruno Dumoulard, Jean Puyhardy, Etienne Danquechin Dorval, Lucile Mendes-Martin, Enrique Casalino, Luc Jarrige, Fabien Lambiotte, Philippe Masson, Mohammed Mansouria, Pierre Thouvenot, Katy Jeannot, Martine Nyunga, Valérie Macci, Florent Masia, Claire Briere de la Hosseraye, Wassila Anteur, André Sommabère, Marie-Claude Germain, Isabelle Arnault, Bernard Carbonelle, Philippe Devos, Daniel Protar, Tiphaine Gaillart, Ludovic Lassel, Laurence Hamou-Plotkine, David Trystram, Thierry Bureau, Olivier Collard, Fanny Vuotto, Sophie Malhiere, Frederique Canis, Gillles Plainfosse, Catherine Lechiche, Bertrand Lassere, Martine Chouraqui, Jean Baptiste Michot, Fethi Radhouane-Khanjari, Carole Barbier, Pascal Bonitchi, Abdelaziz Benkhelil, Odile Salmon, Laurent Damaj Gandhi, Bertrand Minguet, Michel Wagner, Odile Falguières, Zahr-Eddine Ali Chaouche, Eric Zaoui, Isabelle Guichard, Bernard Huttin, Apollinaire Karirisi, Gaël Cinquetti, Christophe Plane, Lionel Rostaing, Yanne Henry-Andrieu, Daniel Re, Virginie Verrier, Pascal Bolot, Michel De Biasi, Laurence Vrigneaud, Mathilde Turpin, Marie-Claude Demachy, Etienne Roussel, Michèle Blancs, Olivier Join-Lambert, Yves Ville, Thierry Granger, Gilles Hilbert, Virginie Medeau, Daniel Villers, Benoit Pilmis, François Gouraud, Emmanuel Ardiet, Catherine Heyraud-Blanchet, Alain Devidas, Hélène Dieye, Julie Cremniter, Jean-François Bergmann, Rozenn Le Berre, Virginie Leguen, Daniel Royer, Gilles Le Maout, Christian Harou, Sylvie Gabriel-Soléan, Yves Regouby, Martine Pestel-Caron, Patrick Brunet, David Boutoille, Emmanuelle Bonnin, Patrice Coulon, Marc Sullice, Marianne Barbieux, Gilles Cambonie, Joëlle Tricoire, Marie-Nadège Bachelier, Delphine Briend, Céline Ramanantsoa, Nathalie Bednarek, Didier Lebreton, Julien Lagrandeur, Damien M'Bey, Philippe Audeguy, Elie Saliba, Lena Damaj, Hassan Fallouh, Pascal Couturier, Fabrice Prévost, Yves Domart, Marie-Odile Lafforgue, Anne Le Du, C. Beuscart, Pierre Guillet, Fabrice Larrazet, Marie-Hélène Hausermann, Henri Robert, Nicolas Fanjaud, François Goehringer, Thomas Bachelot Philippe Badia, Jean-Michel Coulaud, Cristel Fissore Magdelein, Renaud Defebvre, Anne-Sohie Moreau, Johan Courjon, Gilles Salles, Michel Mialon, Silvia Iacobelli, Emmanuelle Bille, Marie-Christine Barbier, Yves Aubard, Patrice Badila, Jean-Philippe Rasigade, Alban Deroux, Evelyne Lecaillon-Thibon, Michel Godin, Abdelmajid Djeffal, Viorica Badurescu, Meriem Canitrot, Pierre Blanchard, Antoine Legros, Laurence Got, Françoise Duluc, Mylène M. Maury, Gilles Dassieu, Nordine Khodeir, Jean-Marie Duez, Mathieu Morincomme, Jérôme Lacroix, Mathieu Revest, Koffi Blewoussi, Isabelle Barazer, Françoise Poitevin, Camille Seignovert, Stéphanie Honore Bouakline, Anne Heidt, Brigitte Malbruny, Julien Desblache, Christian Cattoen, Eric Jaunait, Bruno Chaminade, Claude Bazin, Jonathan Chelly, Anne Pottier, Alain Schmitt, Alain Tissot, Karim Dadoun, P. Rebattu, Claudine Contamin, Arnaud Guerard, Nathalie Ravet, Sandrine Khalifa-Thellier, Marlène Chatron, Gaëlle Dörr, Hélène Biessy, Emmanuel Forestier, Bruno Devaux, Jean-Jacques Grelaud, Xavier Tchenio, Marie-Cécile Ploy, Jérémie Violette, Michèle Burdin, Lionel Falchero, Dominique Jacomy, Jean-Christophe Rozé, Damien Labarriere, Stéphane Leroux, Corinne Meregnani, Assia Ferhat Carre, Paul Orode, Jean-Gabriel Paul, Catherine Godon, Agnès Vinay, Régine Barraduc, Dominique Dallay, Alexandre Ampère, Anne-Gaelle Kervegant, Guillaume Louart, Dominique Beal Ardisson, Francoise Leonetti, Jean-Yves Baril, Stéphanie Haiat, Bincy Darre, Jérôme Bay, Yvan Gauthier, Sylvie Radenne, Pierre-Yves Gueugniaud, Philippe Ravaud, Luc Landraud, Guillaume Ranchon, Loïc Chimot, Véronique Duval, Ilhem Agha-Mir, Sabine Camiade, Estelle Wafo, Jean-Patrick Laporte, Mariam Roncato-Saberane, Camille Bron, Patrice Laudat, Samir Kennouche, Nawel Afroukh, Dominique Neri, Hakim Kherouf, Yoar Hichri, Pierre-Edouard Bollaert, Gwenaelle Vary, Denis Castaing, Christine Lefort, Sébastien Rouget, René Robert, Christelle Guillet-Caruba, Catherine Simonin, Alain Vighetto, Severine Cabasson, Alain Brusset, Alexandra Doloy, Christel Cherlet, Ahmed Rouidi, Marina Salvucci, Réginald Pordes, René-Gilles Patrigeon, Emmanuelle Dupre-Narlet, Jacques Minet, Fethi Taleb, Anne-Marie Colingorski, Tahar Hadou, Sylvain Diamantis, Isabelle Glorieux, Thierry May, Jean-Claude Colombani, Anne Berth-Farges, Nicole Desplaces, Renaud de Tayrac, Elisabeth Walter, Fabienne Lorge, Pascal Reboul, Nathalie Dournon, Laurence Estépa, Marie-Lina Toubia, Mathilde Flahault, Thierry Delacour, Dominique Hurel, Hélinoro Andriamaneo, Cécile Bébéar, Denis Grasset, Miloud Serier, Oléna Orléva, Nadine Dubroca, Hervé Gentilhomme, Jean-Luc Baudel, Isabelle Lavenu, Salim Smati, Carlo Saroufim, Eric Placidi, Albert Sotto, Benoît Libeau, Hélène Leroy, François Golfier, Christophe Dollon, Laurence Desnoulez, Eric Barre, Daniel Cohen, Pascal Priollet, Thierry Marsepoil, Benoît Lionnet, Jacques Tebib, Pascale Penn, Antoine Bouissou, Christian Roth, Olivier Martinet, Anna Schmitt, Nathalie Fruleux, Fouzia Radaoui, Jean-Marc Lessinger, Virginie Morando, Jean-Jacques Maillet, Christophe Fruchart, François Boué, François Goffinet, Franck Lellouche, Martin Demarchi, Alain Geissler, Jean-Charles Picaud, David Assouline, Patricia Brazille, Philippe Guimier, Marie-Françoise Dabysing, Bruno Delpeuch, Vanessa Tran, Guy Gengembre, Delphine Deligne, Dominique Vodovar, Yvan Touze, Sabrina Parent, Anne Decoster, Camille Dewitte, Emmanuel Weiss, Thierry Lambert, Thomas Guimard, Vincent Caille, Claude Guérin, Françoise Evreux, Geneviève Barjon, Basile Ondze, Damien Fournier, Olivia Bandin, Sophie Mignart, Henri Demontclos, Didier Perez, Jacques Croize, Nicole Desbois-Nogard, Guenièvre Imbert, Clarisse Dupin, Khalid Ridah, Marie-Christine Varin, Guillaume Arlet, Edith De Clareuil, Marie-Line Eustache, Patricia Le Pimpec, Louise Fortin, Eugène Ngami, Fabrice Mihout, Cecilia Esnault, Vincent Bouden, Véronique Annaix, Yves Poinsignon, Aurélien Lorchleac'h, Jean-Marc Degreff, Marie Garofano, Renaud Mesnage, Anne-Marie Roque-Afonso, Alain Chevailler, Stéphane Hominal, Thierry Charbonnier, Adrianna Bildea, Fabien Fily, Benjamin Davido, Emmanuel Rassiat, Assi Assi, Stéphanie Brunet, Hervé Jacquier, Catherine Claise, Annie Durand, Yannick Monceau, Pierre Blanc, Jean-Marie Sire, Yves Sucin, Jean-Pierre Zarski, Nathalie Bronet, Ingrid Lafon, Philippe Rey, Jacques Markarian, Eric Sennevile, Olivier Wink, Guilène Barnaud, Anne-Sophie Peultier, Sabine Taylor, Rim Savatier, Patrick Valayer, Claude Negrier, Selim Jennane, Edouard Begon, Laura Hyerle, Delphine Bridoux, Claire Daurel, Benoît Dalle, Mathilde Lescat, Philippe Stolidi, Elodie Perrodeau, Xavier Heches, Pierre Castelnau, Philippe Bray, Jean-Claude Texier, Serge Rossignol, Maud Brung-Lefebvre, Jean-François Subra, Jean-Marie Delarbre, Morgane Schneerson, Guyro Jang, Mona Mehri, Nathalie Landgraf, Pierre-Marie Girard, Armand Goll, Zaineb Bekguesmia, Christophe Clement, Michel Collet, Vincent Maze, Amine Benjelloul, Solène Durliat-Ellie, Vincent Letouzey, François Schmitt, Valérie Martinez, Sarah Watson, Abderrezak Bouasria, François Barbier, Raphael Lauretta, Mirana Razafimahery, Cristina Sirbu, Patrick Malherbe, Anne Wuillai, Ludovic Lesecq, Philippe Gaudard, Serge Houssaye, Jacques Monsegu, Gilles Rival, Chantal Chaplain, Jean-Didier Grangé, Oana Zamfiri, Florence Nguyen-Khac, Marc Portneuf, Jean-Michel Pawlotsky, Delphine Bonnet, Laurent Traissac, Sophie Hamon-Charles, Didier Dreyfuss, Louis Bernard, Laurence Detourmignies, Olivier Martineau, François Pettinelli, Marc Zandecki, Michel Dreyfus, Alain Chapelle, Sébastien Sabbat, Anne-Sophie Labussiere, Jean-Louis Gaillard, Chloé Plouzeau-Jayle, Patrick Zoveda, Véronique Leflon, Marie Levy, Aurélie Labé, Bruno Soulie, Raoul Jacques Bensaude, Hecham Moussa, Sylviane Catteu, Nathalie Biron, Loïc Masson, Georges Mourad, Nejla Aissa, Dragos Ciocan, Hubert De Boysson, Jean-Luc Bouyer, Patrick Yeni, Thierry-Pascal Zame, Caroline Thomas, François Cavalié, Laurence Koulmann, Christophe Rioux, Olivier Barraud, François Bricaire, Marguerite Le Poulain, Marie-Noelle Noulard, René Thomas, Guy Semet, Laurent Mosser, Olivier Marret, Brigitte Rivière, Vincent Jarlier, Jean-Philippe Coindre, Marc Villemain, Martin Pierre, Yacine Benkaci, Philippe Chiron, Hoang Vu-Thien, Jérôme Gournay, Andrea Labaune-Kiss, Brigitte Lauzanne, Fanny Lemercier, Souad Silhadi, Imad Kansau, Christophe Poncelet, Olivier Baldesi, Francis Thuet, Olivier Leroy, Aurore Lamberet, Camille Petit Hoang, Sophie Micheli, Ayman Abokasem, Hakima Nesrine, Pierre Lureau, Christian Chidiac, Vincent Piriou, Fabien Zoulim, Dieudonné Nicobaharaye, Anne Tixier, Isabelle Matheron, Soumeth Abasse, Victoria Cacheux, Serge Herson, Christine Fuhrmann, Olivier Proost, Bernard Bedock, Olivier Rogeaux, Mostapha Hajjar, Anne Reverseau, René Courcol, Françoise Carmagnol, Yves Guénard, Céline Ménard, Bouchra Lamia, Bruno Lemmens, Damien Bouhour, L. Lequen, Gaëlle Baty, Cédric Bouet, Dominique Guerrot, Stéphane Blanc, Catherine Chirouze, Anne-Hélène Reboux, A. Vachée, Gregory Taurin, Myriam Mein-Bottini, Jean-Pierre Belot, Alain Lafeuillade, Patricia Gabez-Therou, Philippe Labrousse, Bernard Jarrousse, Philippe Noto, Vincent Brunot, Philippe Condominas, Marion Challier, Béatrice Berçot, Delphine Anuset, Mélanie Daval Cote, François Bernasconi, Y. Costa, Chandrah Goburdhun, Bernard Gressier, Alban Michaud-herbst, Franck Charlier, Moussa Hecham, Luc Boulain, Hélène Corneloup, Alix Greder Belan, Nicolas Boussekey, Claire-Antoinette Dupuy, Yannick Rouquet, Benoit Renard, Benifla Jl, Etienne Javouhey, Michèle Granier, Marie-Christine Jaffarbandjee, Emilie Piet, Benoît Bergues, Claire Malbrunot, Catherine Tiry, Philippe Mérigot, Mouna Ben Soltana, Chantal Roure Sobas, Florian Radenac, Yves Thomas, Agathe Blaise, Sylvie De Martino, Laurence Legout, Gabriel Choukroun, Jean-François Muir, Peggy Dupretz, Patrick Dupont, François Guichart, Julie Jean, Jean-Michel Descamps, Bernard Kittschke, Anne Gruson, Gerard Viquesnel, Marie Keller, Pascal Chavanet, Françis Vallet, Yvan Vaschalde, Jean-Luc Hanouz, Gerard Lina, Françoise Loison, Simon Vincent, Jean-Paul Thellier, Moncef Afi, Dominique Zagozda, Hélène Sokeng-Affoule, Marc Le Bideau, Jean-François Loriferne, Alain Gravet, Sophie Deprecq, Tarik Naceur, Severine Mielczarek, René-Jean Bensadoun, Bernard Karkous, Yves Bléher, Jocelyne Poulain, Véronique Goulet, Laurence Nicolet, Sophie Arista, Antônio Lúcio Teixeira, Jean-François Schved, Laurent Nicolet, Claire Lecomte, Faiza Benddif-Fin, Michel Aumersier, Laurence Burc-Struxiano, Maxime Thouvenin, Samia Harbi, Mathieu Detave, Catherine Rebeyrotte, Jean-Paul Kisterman, Bruno Berdin, Pascal Vincent, Laurent Argaud, Elisabeth Parisi-Duchene, Geneviève Julienne, Fernanda Farto-Bensasson, Georges-Fabrice Blum, Sad Gaizi, Tali-Anne Szwebel, Raphaël Lepeule, Marie-Thérèse Climas, Anne-Françoise Dillies, Amar Boudhane, Umberto Simeoni, Pierre-François Dequin, Gérard Oliviero, Alain Gourlaouen, Caroline Piau, Marie-France Lutz-Murphy, Benoît Claude, Jean-Paul Aubry, Nadine Dubosc-Marchenay, Kamilla Chraibi, Emmanuelle Heusse, Sylvain Le Chevallier, Nathalie Brieu, Farid Sifaoui, Lorraine Letranchant, Hélène Durox, Jean-Pierre Lagasse, Adel Ghedira, Xavier Roubert, Fatma Magdoud, Hélène Jean-Pierre, Etienne Carbonelle, Olivier Dereeper, Lionel Carbillon, Christophe Billy, Mélanie Roblin, Marie-José Kodzin, Philippe Niel, Solène Makdessi, Matteo Vassallo, Maryse Archambaud, Fabian Haccourt, Didier Blaise, Stéphane Bourgeois, Elena Marcu, Charles Kubiak, Brisse Castel, François Guinet, Marie Pouzoullic, Frédérique Nathan-Bonnet, Vincent Gendrin, Céline Becherrawy, Aline Secher, Pierre Abgueguen, Clarence Eloy, Jean-Marc Tourani, Frédéric Klapczynski, Bernard Montmasson, Philippe Real, Joanna Pofelski, Yves Welker, Karim Krechiem, Eric Caumes, Martine Elena-Daumas, Christophe Saigne, Gilles Hittinger, Chantal Delesalle, Jonathan Messika, Fabrice Lesage, Daniela Pop, Daniel Coetmeur, Renato Colamarino, Chetaou Mahaza, Patrick Plésiat, Isabelle Fredenucci, Mylène Baret, Guy Mager, Pascale Chavel, Isabelle Labourdette, Anne-Claude Menguy, Nicolas Fortineau, Ludovic Le Sec, Valérie Gauduchon, Francis Barraud, Nicolas Letellier, Didier Vincent, Janine Frey, Philippe Riegel, Michel Pavic, Jean-Luc Fabre, Jean-Pierre Fauchart, Alain Goudeau, Stéphanie Husson-Wetzel, Philippe Eymerit, Mohamed Camara, Nathalie Seta, Elisabeth Carole Ngo Bell, Philippe Repellin, Laurent Alric, Vincent Leroy, Françoise Delisle Mizon, Jean-Philippe Emond, Marie-Françoise Borie, Lise Crémet, Wladimir Chelle, Elisabeth Brottier-Mancini, Bernard Garrigues, Claire Letellier, Loïc Geffray, Frédéric Méchaï, Julien Bador, Benoit Guery, Alain-Charles Fouilhoux, Corinne Dagada, Pierre Duhaut, Julien Goustille, Arnaud Sément, Francis Carcenac, Isabelle Girard-Buttaz, Claire Chapuzet, Fabienne Jouatte, Bruno Riou, Fabrice Hayoun, Chloé Di Meglio, Youssef Ali, Michel Leneveu, Nathalie Montagne, Yves Garcera, Audrey Moustache, Pierre-Eric Danin, Geneviève Le Lay, Dominique Courouge-Dorcier, Isabelle Worcel, Emmanuel Morelon, Vincent Pestre, Jean-Pierre Vilque, Jean-Christophe Paquet, Lucien Bodson, Anne-Marie Forest, Fabrice Pierre, Christian Pommier, Fabien Dutasta, Pierre Fournel, Stéphanie Courtois, Elodie Dubois, Serge Vanden Einjden, Patrick Honderlick, Pascal Richette, Fabienne Tamion, Véronique Chassy, Richard Megbemado, Anne-Marie Le Reste, Bernard Simian, Henri Osman, Anthony Texier, Badih Ayach, François Simon, Jean-Michel Filloux, Béatrice Dubourdieu, Jean-Claude Semet, Sarah Kubab, Tawfiq Henni, Patrick Dudeffant, Delphine Hequet, Olivier Mimoz, Marc Auburtin, Amélie Chabrol, Mickael Bonnan, Caroline Léonnet, Claire Wintenberger, Serge Ilunga, Patrice Lanba, Sophie Rosello, Alexandre Damage, Flore Bouche, Michel Thibault, Frederic Faibis, Chantal Dhennain, Jean-Philippe Talarmin, Armelle Lamour, Remi Boussier, Fabien Garnier, Marie-Laure Brival, Nourredine Hedjem, Philippe Vande-perre, Raphaël Coint, Jean-Claude Reveil, Eva Weinbronn, Emmanuelle Lavalard, Alexandra Fille, Françoise Le Turdu, Lionel Leroux, Jean-Yves Lefrant, Jean Berthet, Radia Bouaziz, Alain Ravaud, Sylvaine Rousseau, Yacine Merrouche, Alain Le Coustumier, Bertrand Guider, Gisèle Dewulf, Jean-Marc Faucheux, Jacques Piquet, Franck Leibinger, Charles Cerf, Robin Stephan, Jean-Philippe Redonnet, Jean-Paul Stahl, Ella Dzeing, Simona Pavel, Guy Vernet, Ghada Hatem, Samer Kayal, Jacques Deschamps, Dominique Descamps, Marion Levast, Marc Bouiller, Sylvie Dargere, Claire Dingremont, Stéphane Gaudry, François Maillot, Sylvie Odent, Nathalie Cervantes, Hélène Zanaldi, Laurence Gachassin, Olivier Ruyer, David Patin, Benoît Cazenave, Pascal Jacquier, Michelle Boyer, Béatrice Berteaux, Virginie Zarrouk, Jacques Bor, Isabelle Legoff, Hélène Albinet, Florence Rousseau, Gilles Pialoux, Guenaelle Salaun-Beretta, Alexandra Moura, Véronique Vernet Garnier, Didier Lepelletier, Pierre-Alexandre Hauss, Joëlle Belaisch-Amart, Didier Lepeletier, Jacob Xavier, Aline Nare, Annie Motard-Picheloup, Alain Améri, Bertrand Lioger, Jean-Valère Malfuson, Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de Référence Listeria - National Reference Center Listeria (CNRL), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre collaborateur de l'OMS Listeria / WHO Collaborating Centre Listeria (CC-OMS / WHO-CC), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office (OMS / WHO), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 - UFR de Médecine Pierre et Marie Curie (UPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Département de Médecine interne [Lariboisière], Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Biologie des Infections - Biology of Infection, Service de Gynécologie et Obstétrique [Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Investigation Clinique et d’Accès aux Ressources Biologiques (Plate-forme) - Clinical Investigation and Access to BioResources (ICAReB), Institut Pasteur [Paris] (IP), Infectious Disease Department [Saint Maurice], Agence Nationale de la Santé Publique [Saint-Maurice] (ANSP), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), CHU Amiens-Picardie, Mécanismes physiopathologiques et conséquences des calcifications vasculaires - UR UPJV 7517 (MP3CV), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie, MONALISA study group, Programme Hospitalier Recherche Clinique, Institut Pasteur, Inserm, French Public Health Agency., ROZIER, marie-Claire, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre National de Référence Listeria - Biologie des Infections (CNRL), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre collaborateur de l'OMS Listeria - Biologie des Infections (CCOMS), CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Hôpital Lariboisière-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP], Institut Pasteur [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre National de Référence Listeria - Biologie des Infections ( CNRL ), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre collaborateur de l'OMS (CCOMS) des Listeria ( CCOMS ), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité ( CRESS (U1153 / UMR_A 1125) ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 - UFR de Médecine Pierre et Marie Curie ( UPMC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Lariboisière, Biologie des Infections, Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Investigation Clinique et d’Accès aux Ressources Biologiques (Plate-forme) - Clinical Investigation and Access to BioResources ( ICAReB ), Agence Nationale de la Santé Publique [Saint-Maurice] ( ANSP ), Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut Pasteur [Paris]-Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office (OMS / WHO), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Bacteremia/epidemiology/mortality, 0301 basic medicine, Male, Pediatrics, bacteraemia, Infectious Disease Transmission, [SDV]Life Sciences [q-bio], Bacteremia, France/epidemiology, Infant, Newborn, Diseases, Foodborne Diseases, Meningoencephalitis, Pregnancy, Risk Factors, Vertical, Medicine, Listeriosis, Prospective Studies, Pregnancy Complications, Infectious, Prospective cohort study, ddc:618, diabetes, alcoholism, Hazard ratio, Foodborne Diseases/microbiology, immuno suppressive therapies, Prognosis, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Hospitalization, Infectious Diseases, isolates, Population Surveillance, Female, France, Listeria monocytogenes/classification/isolation & purification, Cohort study, Adult, medicine.medical_specialty, 030106 microbiology, Notifiable disease, Listeriosis/diagnosis/epidemiology/microbiology, Context (language use), macromolecular substances, 03 medical and health sciences, Humans, study, Aged, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Public health, cirrhosis, Infant, Newborn, Infant, Diseases/epidemiology/microbiology, HIV, Mandatory Reporting, Newborn, medicine.disease, Listeria monocytogenes, infection, Infectious Disease Transmission, Vertical, Pregnancy Complications, Infectious/epidemiology/microbiology, Meningoencephalitis/epidemiology/microbiology/mortality, Observational study, business, prognostic, mellitus
Abstract: International audience; Evidence before this study We searched PubMed on June 30, 2016, for English-language cohort studies published since Jan 1, 1980, of patients with invasive listeriosis worldwide with the keywords " listeria " , " listeriosis " , " maternal " , and " neurolisteriosis ". Studies had to include epidemiological or clinical data on listeriosis. All clinical forms of infection were included (bacteraemia, neurolisteriosis, and maternal–neonatal infection). Host risk factors for listeriosis have been well identified, but the clinical features and prognostic factors of the disease are based on retrospective studies compiling heterogeneous data or random collected cases. Furthermore, no clinical trial has ever been done and medical management is not evidence based. Added value of the study Our study is the first prospective clinical study focusing on all forms of invasive listeriosis. The study is based on a national mandatory system that allowed the nearly complete capture of microbiologically proven cases. The study shows a higher burden of listeriosis than reported before: more than 80% of infected mothers experienced major fetal or neonatal complications (fetal loss, very high prematurity, early or late onset disease); only 39% of patients with neurolisteriosis survived and fully recovered. The study provides important new data to improve management and predict outcome in listeriosis, such as determination of the time window for fetal losses (
Published: 2016
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13. Inventory of Extended-Spectrum-β-Lactamase-Producing Enterobacteriaceae in France as Assessed by a Multicenter Study

Author: N. Brieu, David Leyssene, Richard Bonnet, Florence Doucet-Populaire, C. Recule, Laurent Bret, Stéphane Bonacorsi, Nejla Aissa, M Colomb-Cotinat, Nicolas Fortineau, Valérie Ponties, A. Chapuis, Vincent Cattoir, Antoine Grillon, Racha Beyrouthy, Isabelle Podglajen, Nicolas Degand, Marie-Cécile Ploy, Véronique Dubois, Philippe Lanotte, Alain Ros, Ivania Patry, Frédéric Robin, Hubert Chardon, Laboratoire de Bactériologie & CNR de la Résistance aux Antibiotiques, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Université d'Auvergne (Clermont Ferrand 1) (UdA), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), CNR Escherichia coli, Hôpital Universitaire Robert-Debré (AP-HP), Laboratoire de Bactériologie, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Service de Microbiologie, Hôpital Avicenne, Laboratoire de Diagnostic Biologique des Maladies Infectieuses et d'Hygiène, Centre Hospitalier du Pays d'Aix, Unité de Recherche Risques Microbiens (U2RM), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Normandie Université (NU), Service de Bacteriologie, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Laboratoire de Bactériologie, Hôpital Archet II, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU de Nice), Service de Bactériologie-Hygiène, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB), Service de Bactériologie-Virologie, Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Plateau technique de microbiologie, Laboratoire de bactériologie, Centre Hospitalier Universitaire de Strasbourg (CHU de Strasbourg ), Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Francois Rabelais [Tours], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Centre Hospitalier Universitaire de Grenoble, Laboratoire de Bactériologie-Virologie-Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne, Service des maladies infectieuses, Institut français de surveillance de la santé publique, Institut de Veille Sanitaire (INVS), Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges], CHU Limoges, Ministere de l’Education Nationale, de l’Enseignement Superieur et de la Recherche - INRA (USC-2018) Santé Publique France - Centre Hospitalier Regional Universitaire de Clermont-Ferrand, France, CHU Clermont-Ferrand, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Robin, F., Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte - Clermont Auvergne ( M2iSH ), Université Clermont Auvergne ( UCA ), Université d'Auvergne (Clermont Ferrand 1) ( UdA ), UMR 1137, IAME, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris Diderot (Paris 7), Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ), Hôpital Universitaire Robert-Debré ( AP-HP ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble, Unité de Recherche Risques Microbiens ( U2RM ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Normandie Université ( NU ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Centre Hospitalier Universitaire de Nice ( CHU de Nice ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), UMR 5234, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Bordeaux ( UB ), Hôpital Bretonneau-CHRU Tours, Centre Hospitalier Universitaire de Strasbourg ( CHU de Strasbourg ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire de Biologie médicale, Institut Pasteur de Bangui, Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Institut Pasteur de Bangui-Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Institut Pasteur de Bangui, Microbiologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Institut de Veille Sanitaire, CNR Escherichia coli [Hôpital Robert Debré - APHP] (CNR - laboratoire associé), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), and Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Klebsiella pneumoniae, plasmid-mediated quinolone resistance, medicine.medical_treatment, ESBL, AAC(3)-II, AAC(6’)-Ib, plasmid, Gene Expression, résistance aux antibiotiques, Plasmid, [ SDV.MP ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Drug Resistance, Multiple, Bacterial, polycyclic compounds, Prevalence, Pharmacology (medical), Child, Phylogeny, Aged, 80 and over, Microbiology and Parasitology, Enterobacteriaceae Infections, Plasmid-mediated resistance, Middle Aged, gène de résistance, Enterobacteriaceae, Microbiologie et Parasitologie, Hospitals, 3. Good health, Anti-Bacterial Agents, Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, resistance to antibiotics, Child, Preschool, Female, France, Plasmids, Adult, Adolescent, 030106 microbiology, Microbial Sensitivity Tests, Biology, beta-Lactams, beta-Lactamases, Microbiology, beta lactamase, 03 medical and health sciences, resistance gene, Mechanisms of Resistance, medicine, Humans, Typing, Aged, Pharmacology, Infant, Newborn, Infant, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, biology.organism_classification, bacterial infections and mycoses, Clone Cells, Beta-lactamase, Multilocus sequence typing, bacteria, Replicon, Enterobacter cloacae, enterobacteria, Multilocus Sequence Typing
Abstract: The objective of this study was to perform an inventory of the extended-spectrum-β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae isolates responsible for infections in French hospitals and to assess the mechanisms associated with ESBL diffusion. A total of 200 nonredundant ESBL-producing Enterobacteriaceae strains isolated from clinical samples were collected during a multicenter study performed in 18 representative French hospitals. Antibiotic resistance genes were identified by PCR and sequencing experiments. The clonal relatedness between isolates was investigated by the use of the DiversiLab system. ESBL-encoding plasmids were compared by PCR-based replicon typing and plasmid multilocus sequence typing. CTX-M-15, CTX-M-1, CTX-M-14, and SHV-12 were the most prevalent ESBLs (8% to 46.5%). The three CTX-M-type EBSLs were significantly observed in Escherichia coli (37.1%, 24.2%, and 21.8%, respectively), and CTX-M-15 was the predominant ESBL in Klebsiella pneumoniae (81.1%). SHV-12 was associated with ESBL-encoding Enterobacter cloacae strains (37.9%). qnrB , aac(6 ′ )-Ib-cr , and aac(3)-II genes were the main plasmid-mediated resistance genes, with prevalences ranging between 19.5% and 45% according to the ESBL results. Molecular typing did not identify wide clonal diffusion. Plasmid analysis suggested the diffusion of low numbers of ESBL-encoding plasmids, especially in K. pneumoniae and E. cloacae . However, the ESBL-encoding genes were observed in different plasmid replicons according to the bacterial species. The prevalences of ESBL subtypes differ according to the Enterobacteriaceae species. Plasmid spread is a key determinant of this epidemiology, and the link observed between the ESBL-encoding plasmids and the bacterial host explains the differences observed in the Enterobacteriaceae species.
Published: 2016
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14. Rapid bench identification of methicillin-sensitive and methicillin-resistant Staphylococcus aureus: A multicenter comparative evaluation of Alere PBP2a Culture Colony Test (Alere) Versus Slidex MRSA detection (bioMérieux)

Author: Pascale Bémer, Anne-Laure Michon, Brigitte Lamy, Michèle Bes, Jocelyne Caillon, Céline Dupieux, Sophie Trouillet-Assant, Laurent Mereghetti, Frédéric Laurent, Nejla Aissa, Alain Lozniewski, Philippe Lanotte, Jason Tasse, Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis (StaPath), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de bactériologie-virologie [Tours], Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infectiologie Santé Publique (ISP-311), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau
Subjects: 0301 basic medicine, Microbiology (medical), Susceptibility testing, Staphylococcus aureus, genetic structures, 030106 microbiology, Rapid tests, medicine.disease_cause, Methicillin resistance, Sensitivity and Specificity, Chromatography, Affinity, Comparative evaluation, Microbiology, PBP2a, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Agglutination Tests, medicine, Humans, Methicillin sensitive, Slidex, Bacteriological Techniques, business.industry, General Medicine, Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, France, business
Abstract: International audience; Using 30 clinical isolates of Staphylococcus aureus representative of the most prevalent clones circulating in France, the performance of the Alere™ PBP2a Culture Colony Test (CCT) and the Slidex(®) MRSA detection kit (SMD) were compared in 5 different labs. CCT demonstrated better performance and was easier to conduct in routine.
Published: 2016
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15. Comparison of Vitek MS and MALDI Biotyper for Identification of Actinomycetaceae of Clinical Importance

Author: Corentine Alauzet, Janina Ferrand, Alain Lozniewski, Nejla Aissa, Victoria Girard, Hélène Hochard, Baptiste Bogard, Laboratoire de Bactériologie [CHU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Laboratoire de biologie médicale [CHR Metz-Thionville], Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), and BIOMERIEUX
Subjects: 0301 basic medicine, Microbiology (medical), musculoskeletal diseases, Chromatography, biology, 030106 microbiology, education, Flight mass-spectrometry, Actinomycetaceae, Reproducibility of Results, Bacteriology, biology.organism_classification, musculoskeletal system, In vitro diagnostic, Bacterial Typing Techniques, 03 medical and health sciences, Desorption ionization-time, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization, Humans, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Identification (biology), Reagent Kits, Diagnostic, Actinomycetales Infections
Abstract: The Vitek MS in vitro diagnostic (IVD) and MALDI Biotyper IVD systems were evaluated for the identification of 158 strains of Actinomycetaceae . Correct species-level identification rates of 60.7% and 58.2% were obtained with the Vitek MS system after direct deposit and with the MALDI Biotyper system after on-plate formic acid treatment, respectively.
Published: 2016
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16. Diagnostic Accuracy of Procalcitonin for Predicting Blood Culture Results in Patients With Suspected Bloodstream Infection: An Observational Study of 35,343 Consecutive Patients (A STROBE-Compliant Article)

Author: Abderrahim, Oussalah, Janina, Ferrand, Pierre, Filhine-Tresarrieu, Nejla, Aissa, Isabelle, Aimone-Gastin, Fares, Namour, Matthieu, Garcia, Alain, Lozniewski, and Jean-Louis, Guéant
Subjects: Calcitonin, Male, Bacteria, Calcitonin Gene-Related Peptide, Reproducibility of Results, Observational Study, Bacteremia, Middle Aged, bacterial infections and mycoses, Diagnosis, Differential, Cross-Sectional Studies, parasitic diseases, Humans, Female, Prospective Studies, Protein Precursors, Biomarkers, Research Article
Abstract: Previous studies have suggested that procalcitonin is a reliable marker for predicting bacteremia. However, these studies have had relatively small sample sizes or focused on a single clinical entity. The primary endpoint of this study was to investigate the diagnostic accuracy of procalcitonin for predicting or excluding clinically relevant pathogen categories in patients with suspected bloodstream infections. The secondary endpoint was to look for organisms significantly associated with internationally validated procalcitonin intervals. We performed a cross-sectional study that included 35,343 consecutive patients who underwent concomitant procalcitonin assays and blood cultures for suspected bloodstream infections. Biochemical and microbiological data were systematically collected in an electronic database and extracted for purposes of this study. Depending on blood culture results, patients were classified into 1 of the 5 following groups: negative blood culture, Gram-positive bacteremia, Gram-negative bacteremia, fungi, and potential contaminants found in blood cultures (PCBCs). The highest procalcitonin concentration was observed in patients with blood cultures growing Gram-negative bacteria (median 2.2 ng/mL [IQR 0.6–12.2]), and the lowest procalcitonin concentration was observed in patients with negative blood cultures (median 0.3 ng/mL [IQR 0.1–1.1]). With optimal thresholds ranging from ≤0.4 to ≤0.75 ng/mL, procalcitonin had a high diagnostic accuracy for excluding all pathogen categories with the following negative predictive values: Gram-negative bacteria (98.9%) (including enterobacteria [99.2%], nonfermenting Gram-negative bacilli [99.7%], and anaerobic bacteria [99.9%]), Gram-positive bacteria (98.4%), and fungi (99.6%). A procalcitonin concentration ≥10 ng/mL was associated with a high risk of Gram-negative (odds ratio 5.98; 95% CI, 5.20–6.88) or Gram-positive (odds ratio 3.64; 95% CI, 3.11–4.26) bacteremia but dramatically reduced the risk of PCBCs or fungemia. In this large real-life setting experience with more than 35,000 patients, procalcitonin was highly effective at excluding bloodstream infections regardless of pathogen categories. The results from our study are limited by its cross-sectional design and deserve to be validated in prospective longitudinal studies.
Published: 2015

17. Rapid identification of MSSA and MRSA on the bench: multicentre comparative evaluation of PBP2a Culture Colony Test(TM) (Alere) versus Slidex(R) MRSA detection (bioMérieux)

Author: TASSE, Jason, Dupieux, Céline, Caillon, Jocelyne, Lanotte, Philippe, Lamy, Brigitte, Nejla, Aissa, Bémer, Pascale, Mereghetti, Laurent, Michon, Anne-Laure, Lozniewski, Alain, Bes, Michèle, Tristan, Anne, Vandenesch, François, Laurent, Frédéric, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT)
Subjects: [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience
Published: 2015

18. Evaluation of the duration of vanA vancomycin-resistant Enterococcus faecium carriage and clearance during a large-scale outbreak in a region of eastern France

Author: Sandrine Henard, Christian Rabaud, Alain Lozniewski, Nejla Aissa, and Nathalie Jouzeau
Subjects: Male, Veterinary medicine, Epidemiology, Enterococcus faecium, medicine.disease_cause, Disease Outbreaks, Microbiology, Recurrence, Humans, Medicine, Vancomycin-resistant Enterococcus, Colonization, Gram-Positive Bacterial Infections, Vancomycin resistant Enterococcus faecium, Vancomycin resistance, biology, business.industry, Health Policy, Public Health, Environmental and Occupational Health, Follow up studies, Outbreak, Vancomycin Resistance, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, biology.organism_classification, Infectious Diseases, Carriage, Carrier State, Female, France, business, Follow-Up Studies
Abstract: A monthly follow-up evaluation of vancomycin-resistant Enterococcus-colonized patients conducted during an outbreak in France revealed that carriage can persist for an extended period. Recurrence was observed despite as many as 3 negative cultures. As a result, we propose another definition for VRE clearance.
Published: 2011
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19. Characterization of a New blaOXA-48-Carrying Plasmid in Enterobacteriaceae

Author: Alain Lozniewski, Corentine Alauzet, Richard Bonnet, Christian Rabaud, Nejla Aissa, Sibel Berger, Sandrine Henard, Laboratoire de Bactériologie [CHU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Service de Bactériologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, and CHU Clermont-Ferrand
Subjects: Male, Imipenem, Turkey, Klebsiella pneumoniae, Spread, Resistance, Molecular Sequence Data, Drug resistance, Microbial Sensitivity Tests, Biology, beta-Lactamases, Strain, Microbiology, 03 medical and health sciences, Feces, Plasmid, Enterobacteriaceae, Mechanisms of Resistance, Drug Resistance, Bacterial, medicine, Humans, Pharmacology (medical), Base sequence, 030304 developmental biology, Pharmacology, 0303 health sciences, Strain (chemistry), Base Sequence, 030306 microbiology, Middle Aged, OXA-48-producing klebsiella-pneumoniae, biology.organism_classification, Virology, 3. Good health, Anti-Bacterial Agents, Klebsiella Infections, Transformation (genetics), Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Genes, Bacterial, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, France, Transformation, Bacterial, OXA-48-like carbapenemases, medicine.drug, Plasmids
Abstract: In this work, we characterized a new, 160-kb, bla OXA-48 -harboring IncL/M-type plasmid isolated from a Klebsiella pneumoniae strain from France. Moreover, we report the transfer of a 60-kb OXA-48-encoding plasmid from Klebsiella pneumoniae to other Enterobacteriaceae in two patients.
Published: 2013
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20. Urinary tract infections in hospitalized inflammatory bowel disease patients: a 10-year experience

Author: Jean-Louis Guéant, Claire Pillot, Marc-André Bigard, N Williet, Mamadou Balde, Abderrahim Oussalah, Laurent Bresler, Adeline Germain, Laurent Peyrin-Biroulet, Alain Lozniewski, Nejla Aissa, and Vincent Billioud
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, urologic and male genital diseases, Inflammatory bowel disease, Cohort Studies, Young Adult, Sex Factors, Risk Factors, Internal medicine, medicine, Prevalence, Immunology and Allergy, Humans, Young adult, business.industry, Genitourinary system, Gastroenterology, Age Factors, Odds ratio, medicine.disease, Inflammatory Bowel Diseases, Ulcerative colitis, digestive system diseases, female genital diseases and pregnancy complications, Surgery, Hospitalization, Cohort, Urinary Tract Infections, Female, business, Complication, Cohort study
Abstract: Background: Cystitis is the most common genitourinary complication in Crohn's disease (CD). We assessed the prevalence of and risk factors for urinary tract infections (UTI) in inflammatory bowel diseases (IBD). Methods: Among the 1173 IBD patients of the “Nancy IBD cohort” seen between January 1, 2000 and December 31, 2009, 56 hospitalized patients had 76 documented UTI. Prevalence of UTI in IBD was calculated using rates of UTI among non-IBD patients hospitalized during the same period. The cases were compared to 175 matched IBD patients without UTI hospitalized during the same period to identify risk factors for UTI. Results: Prevalence of UTI was 4% in IBD patients versus 3.3% in non-IBD patients (P = 0.1). Prevalence of UTI was 4.5% and 2.1% in ulcerative colitis (UC) and CD patients, respectively (P = 0.6). Risk factors for UTI in CD patients were perianal disease (odds ratio [OR] = 2.28, 95% confidence interval [CI], 1.06–4.89; P = 0.04) and colonic disease (OR = 2.42, 95% CI, 1.05–5.58; P = 0.04). Male gender (OR = 0.38, 95% CI, 0.17–0.85, P = 0.02) and noncomplicated behavior (OR = 0.26, 95% CI, 0.11–0.60, P = 0.002) were protective factors against UTI in CD. In UC patients, age over 40 years (OR = 9.59, 95% CI, 1.93–47.74; P = 0.006) and disease duration over 11 months (OR = 10.77, 95% CI, 1.68–68.89, P = 0.01) were risk factors for UTI. Male gender was negatively associated with UTI (OR = 0.04, 95% CI, 0.01–0.36, P = 0.00006). Conclusions: Hospitalized IBD patients are not at increased risk of UTI. Risk factors for UTI include perianal disease and colonic disease in CD and age and longer disease duration in UC. (Inflamm Bowel Dis 2011;)
Published: 2011

21. Hospital outbreak of Pseudomonas aeruginosa producing extended-spectrum oxacillinase OXA-19

Author: Pascal Cholley, Corentine Alauzet, Didier Hocquet, Aurélie Cravoisy-Popovic, Xavier Bertrand, Nejla Aissa, Daniel Talon, and Patrick Plésiat
Subjects: Microbiology (medical), Imipenem, medicine.drug_class, Cephalosporin, Molecular Sequence Data, medicine.disease_cause, Integron, Microbiology, beta-Lactam Resistance, beta-Lactamases, Disease Outbreaks, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, polycyclic compounds, medicine, Pulsed-field gel electrophoresis, Humans, Pseudomonas Infections, 030212 general & internal medicine, 0303 health sciences, Cross Infection, integumentary system, biology, 030306 microbiology, Pseudomonas aeruginosa, Outbreak, General Medicine, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, Hospitals, 3. Good health, Ticarcillin, biology.protein, bacteria, France, Piperacillin, medicine.drug
Abstract: This report describes the microbiological investigation of an outbreak of P. aeruginosa producing the extended-spectrum OXA-19 in a French university hospital. The 48 isolates producing OXA-19 recovered from 27 patients were clustered into 3 PFGE patterns. The blaOXA-19 gene responsible for OXA-19 was a part of class 1 integron.
Published: 2010

22. Hospital outbreak of P. aeruginosa producing extended-spectrum oxacillinase OXA-19

Author: Cholley , Pascal, Hocquet , Didier, Alauzet , Corentine, Cravoisy , Aurelie, Talon , Daniel, Nejla , Aissa, Plesiat , Patrick, Bertrand , Xavier, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Agents pathogènes et inflammation - UFC (EA 4266) (API), Université de Franche-Comté (UFC), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Agents pathogènes et inflammation - UFC (EA 4266) ( API ), and Université de Franche-Comté ( UFC )
Subjects: polycyclic compounds, bacteria, [ SDV.MP.BAC ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology
Abstract: International audience; This report describes the microbiological investigation of an outbreak of P. aeruginosa producing the extended-spectrum OXA-19 in a French university hospital. The 48 isolates producing OXA-19 recovered from 27 patients were clustered into 3 PFGE patterns. The blaOXA-19 gene responsible for OXA-19 was a part of class 1 integron.
Published: 2010
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23. Influence of preoperative antibiotherapy on valve culture results and outcome of endocarditis requiring surgery

Author: Firas Ali, Nejla Aissa, Armand Mekontso Dessap, Jean-Ralph Zahar, Christian Brun-Buisson, Matthias Kirsch, and Guillaume Voiriot
Subjects: Microbiology (medical), Adult, Male, medicine.medical_specialty, Heart disease, medicine.drug_class, medicine.medical_treatment, Antibiotics, law.invention, Pharmacotherapy, law, Medicine, Endocarditis, Humans, Chemotherapy, Univariate analysis, business.industry, Endocarditis, Bacterial, Antibiotic Prophylaxis, Middle Aged, medicine.disease, Intensive care unit, Combined Modality Therapy, Heart Valves, Surgery, Anti-Bacterial Agents, Infectious Diseases, Treatment Outcome, Infective endocarditis, Female, business
Abstract: Although medical-surgical therapy can reduce mortality in patients with infective endocarditis (IE), the optimal timing of surgery remains controversial. We evaluated the influence of preoperative antimicrobial therapy duration on positivity of valve culture and outcome.We retrospectively studied 94 consecutive patients admitted in our intensive care unit (ICU) and operated before completion of standard antimicrobial therapy.Of 90 valves cultured, 46 were positive. In univariate analysis, time between diagnosis and surgery as well as duration of adequate therapy before surgery was shorter in patients with positive valve cultures as compared to those with negative cultures. A preoperative duration of adequate therapyor =7 days was strongly associated with negative valve cultures (76% vs. 22%, P0.001). Logistic regression analysis identified duration of preoperative adequate antimicrobial therapy as an independent risk factor for positive valve culture. However, there was no significant difference between patients with positive or negative valve culture regarding the occurrence of complications, ICU and hospital length of stay, hospital and long-term mortality, endocarditis relapse and reinfection, as well as treatment failure.Although the duration of adequate preoperative antimicrobial therapy is associated with the positivity of valve culture, the latter factor does not influence short- or long-term outcome.
Published: 2008

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23 results on '"Nejla Aissa"'

1. Infection related catheter complications in patients undergoing prone positioning for acute respiratory distress syndrome: an exposed/unexposed study

2. Evaluating antibiotic stewardship and healthcare-associated infections surveillance assisted by computer: protocol for an interrupted time series study

3. Time to blood culture positivity: An independent predictor of infective endocarditis and mortality in patients with Staphylococcus aureus bacteraemia

4. Accuracy of procalcitonin for diagnosing peripheral blood culture contamination among patients with positive blood culture for potential contaminants

5. Evaluating antibiotic stewardship and healthcare-associated infections surveillance assisted by computer: protocol for an interrupted time series study

6. Infection related catheter complications in patients undergoing prone positioning for acute respiratory distress syndrome: an exposed/unexposed study

7. A new mechanism to render clinical isolates ofEscherichia colinon-susceptible to imipenem: substitutions in the PBP2 penicillin-binding domain

8. Predominance of healthcare-associated cases among episodes of community-onset bacteraemia due to extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae

9. Erratum to 'Predominance of healthcare-associated cases among episodes of community-onset bacteraemia due to extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae' [International Journal of Antimicrobial Agents 49/1 67-73]

10. Prevalence of mupirocin resistance among invasive coagulase-negative staphylococci and methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in France: emergence of a mupirocin-resistant MRSA clone harbouring mupA

11. Factors associated with 12 week case-fatality in Staphylococcus aureus bacteraemia: a prospective cohort study

12. Clinical features and prognostic factors of listeriosis: the MONALISA national prospective cohort study

13. Inventory of Extended-Spectrum-β-Lactamase-Producing Enterobacteriaceae in France as Assessed by a Multicenter Study

14. Rapid bench identification of methicillin-sensitive and methicillin-resistant Staphylococcus aureus: A multicenter comparative evaluation of Alere PBP2a Culture Colony Test (Alere) Versus Slidex MRSA detection (bioMérieux)

15. Comparison of Vitek MS and MALDI Biotyper for Identification of Actinomycetaceae of Clinical Importance

16. Diagnostic Accuracy of Procalcitonin for Predicting Blood Culture Results in Patients With Suspected Bloodstream Infection: An Observational Study of 35,343 Consecutive Patients (A STROBE-Compliant Article)

17. Rapid identification of MSSA and MRSA on the bench: multicentre comparative evaluation of PBP2a Culture Colony Test(TM) (Alere) versus Slidex(R) MRSA detection (bioMérieux)

18. Evaluation of the duration of vanA vancomycin-resistant Enterococcus faecium carriage and clearance during a large-scale outbreak in a region of eastern France

19. Characterization of a New blaOXA-48-Carrying Plasmid in Enterobacteriaceae

20. Urinary tract infections in hospitalized inflammatory bowel disease patients: a 10-year experience

21. Hospital outbreak of Pseudomonas aeruginosa producing extended-spectrum oxacillinase OXA-19

22. Hospital outbreak of P. aeruginosa producing extended-spectrum oxacillinase OXA-19

23. Influence of preoperative antibiotherapy on valve culture results and outcome of endocarditis requiring surgery

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