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O objetivo deste trabalho foi explorar a interação entre genótipos e ambientes em Glycine max com o uso do método de análise de componentes principais com múltiplas matrizes de dados. Utilizou-se o delineamento de blocos casualizados com duas repetições estratificadas em três conjuntos experimentais com testemunhas comuns. Os fatores considerados para a análise são: linhagens endogâmicas (G1, G2, ..., G44), ambientes, dados pela combinação entre locais, a saber, as Estações Experimentais de Anhembi (ANH) e Areão (AR), localizadas no município de Piracicaba, e a presença ou não de manejo. Implementou-se a análise por componentes principais generalizada feita por meio da decomposição das matrizes de componentes obtidas pelo software MATLAB. As linhagens experimentais 27 e 40 na Estação Experimental do Anhembi, na presença de manejo, foram tolerantes a sugadores e mastigadores e apresentaram alta produtividade além de apresentarem interações específicas podendo ser recomendadas para essa condição de cultivo. Os genótipos 6, 7, 12, 26, 30 são responsivos ao estímulo ambiental, apresentando previsibilidade específica na Fazenda Areão, na ausência de manejo. As linhagens experimentais: 2, 3, 6, 19, 23, 31 e 38 são bastante promissoras para produtividade considerando que se agrupa ao desempenho produtivo da linhagem testemunha (44) apresentando estabilidade específica para o local Anhembi na ausência de manejo. Os genótipos 3, 8, 13, 16, 22 e 23 podem ser indicados para Fazenda Areão na presença de manejo já que além da maior produtividade carregam em seus genomas genes que manifestam tolerância a insetos mastigadores e sugadores concomitantemente.