Although conservation and management of tropical ecosystems requires that we understand the threats to these areas, there are no standardized methods to quantify threats to ecosystems. We used a geographic information system-based protocol with several physical and socioeconomic attributes to assess the threats to a protected area, a wildlife sanctuary in southern India. Physical attributes included threats from major and minor roads and the accessibility of an area (given as inverse of the slope of the area), and socioeconomic attributes included the number of human settlements and human, cattle, and sheep populations. We divided the sanctuary into 30-ha grids, and for each grid we computed three threat categories: (1) settlement-associated threat from humans, cattle, and sheep; (2) development-associated threat resulting from major and minor roads; and (3) accessibility-related threat caused by the steepness of the terrain. Combining all three threats, we derived a composite threat index for each grid and mapped five levels of threats in the sanctuary. We collected data on human activities, tree species richness, and diversity in the transects laid in areas corresponding to these five threat levels. Although the threat levels of the transects were strongly correlated with the human-related disturbance activities, the composite threat indices of the transects were negatively correlated with tree species richness, indicating that the threat values we derived served as a good surrogate of the actual threat experienced by the sanctuary. With appropriate modifications, the protocol developed here can be applied to other ecosystems as well. Resumen: La conservacion y manejo de ecosistemas tropicales requiere que entendamos las amenazas a esas areas. Sin embargo, no hay metodos estandarizados para cuantificar las amenazas a los ecosistemas. Utilizamos un protocolo basado en SIG con varios atributos fisicos y socioeconomicos para evaluar las amenazas a un area protegida, un santuario de vida silvestre en el sur de India. Los atributos fisicos incluyeron amenazas de caminos mayores y menores y accesibilidad de un area (como el inverso de la pendiente del area), y los atributos socioeconomicos incluyeron el numero de asentamientos humanos y las poblaciones humanas, de ganado y ovejas. Dividimos al santuario en parcelas de 30 ha, y en cada parcela computamos tres categorias de amenaza: (1) amenaza de humanos, ganado y ovejas asociada con asentamientos, (2) amenaza asociada con desarrollo debido a caminos mayores y menores y (3) amenaza relacionada con accesibilidad debido a la pendiente del terreno. Combinando las tres amenazas, derivamos un indice compuesto de amenaza para cada parcela y mapeamos cinco niveles de amenaza en el santuario. Recolectamos datos sobre actividades humanas, riqueza y diversidad de especies de aves en los transectos ubicados en areas correspondientes a estos cinco niveles de amenaza. Aunque los niveles de amenaza en los transectos estuvieron fuertemente correlacionados con actividades de perturbacion humana, los indices compuestos de amenaza estuvieron correlacionados negativamente con la riqueza de especies de arboles lo que indica que los valores de amenaza que derivamos fueron buen sustituto de la amenazas que hay en el santuario. Con las modificaciones apropiadas, el protocolo desarrollado puede ser aplicado en otros ecosistemas.