Search

Villenave, C, Dahyot, S, Leoz, M, Grand, M, Hassel, C, Pestel-Caron, M, Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de microbiologie [CHU Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU), and Mzembaba, Sandy

Destruel, L, Dahyot, S, Argemi, X, Grand, M, Prevost, G, Pestel-Caron, M, Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de microbiologie [CHU Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU), Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg (UNISTRA), CHU Strasbourg, and Mzembaba, Sandy

Marie Siatkowski, Sandrine Dahyot, Martine Pestel-Caron, Sophie Boyer, Département de microbiologie [CHU Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Mzembaba, Sandy

Brice Mastrovito, Chloé Naimi, Leslie Kouam, Xavier Naudot, Lucie Fournier, Guillaume Spaccaferri, Jean-Christophe Plantier, Anaïs Soares, Fabienne De Oliveira, Marie Gueudin, Véronique Jacomo, Céline Leroy, Alice Moisan, Mélanie Martel, Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Eurofins Biomnis, Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de virologie [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène, Agence Régionale de Santé de Normandie [Caen] (ARS Normandie), and Mzembaba, Sandy

Vautrin, Nicolas, Alexandre, Kévin, Ribet, David, Dahyot, Sandrine, Leoz, Marie, Bernard, Estelle, Caron, François, Pestel-Caron, Martine, Mzembaba, Sandy, Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Département de microbiologie [CHU Rouen]

Lecomte, M, Grand, M, Leoz, M, Cottalorda, A, Pestel-Caron, M, Dahyot, S, Mzembaba, Sandy, Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de microbiologie [CHU Rouen], CHU Rouen, and Normandie Université (NU)

Moisan, Alice, Mastrovito, Brice, de Oliveira, Fabienne, Martel, Mélanie, Hedin, Hugues, Leoz, Marie, Nesi, Nicolas, Schaeffer, Justine, Gouilh, Meriadeg, Plantier, Jean-Christophe, Mzembaba, Sandy, Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de virologie [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène, Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Service de Virologie [CHU Caen], CHU Caen, and Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)

Aude Nassif, Thi Lam, Maïa Delage, Jean-Philippe Jais, Marie-Noëlle Ungeheuer, Hélène Guet-Revillet, Alain Hovnanian, Émeline Riverain-Gillet, Sabine Duchatelet, Olivier Join-Lambert, Centre Hospitalier François Quesnay, Service d'informatique médicale et biostatistiques [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Investigation Clinique et d’Accès aux Ressources Biologiques (Plate-forme) - Clinical Investigation and Access to BioResources (ICAReB), Institut Pasteur [Paris] (IP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Génétique Médicale [CHU Necker], Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Service de Microbiologie [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), This study was funded by La Fondation pour la Recherche Médicale ('Roxane' project, LMV20100519581) and by a grant from the French Ministry of Health (PHRC, AOR11-071, 2011)., Mzembaba, Sandy, Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Centre Médical de l'Institut Pasteur, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]

Christophe Isnard, François Guérin, Elisabeth Chachaty, Vincent Cattoir, Michel Auzou, Jean-Christophe Giard, Agathe Capitaine, Paul-Louis Woerther, Université de Caen Normandie - UFR Santé (UNICAEN Santé), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service de Microbiologie [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service de bactériologie, virologie, hygiène [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Institut Gustave Roussy (IGR), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Unité de Recherche Risques Microbiens (U2RM), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques [CHU Rennes] (CNR), ARN régulateurs bactériens et médecine (BRM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Mzembaba, Sandy

Delage, Maïa, Guenin-Macé, Laure, Morel, Jean-David, Doisne, Jean-Marc, Schiavo, Angèle, Ungeheuer, Marie-Noëlle, Lam, Thi, Join-Lambert, Olivier, Santo, James, Nassif, Aude, Demangel, Caroline, Centre Médical de l'Institut Pasteur, Institut Pasteur [Paris], Immunobiologie de l'Infection - Immunobiology of Infection, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Immunité Innée - Innate Immunity, Investigation Clinique et d’Accès aux Ressources Biologiques (Plate-forme) - Clinical Investigation and Access to BioResources (ICAReB), Service de Microbiologie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Mzembaba, Sandy, and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris]

Guet-Revillet, H., Delage, Maïa, Riverain-Gillet, É, Jais, J-P, Ungeheueur, M-N, Consigny, P-H, Lemarchand, N., De Parades, V., Nassif, Aude, Join-Lambert, O., Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Institut Pasteur [Paris] (IP), Centre Hospitalier François Quesnay, Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Centre hospitalier Saint-Joseph [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Mzembaba, Sandy, and Centre Médical de l'Institut Pasteur

Ali Si-Mohammed, Jean-Dominique Poveda, Theresa Rabenja, B Visseaux, Karl Stefic, Fabienne De Oliveira, Anne Signori-Schmuck, Audrey Mirand, Magali Bouvier-Alias, Stéphanie Raymond, Vincent Calvez, Pantxika Bellecave, Coralie Pallier, Anne-Geneviève Marcelin, Véronique Schneider, Sidonie Lambert-Niclot, Chakib Alloui, Marie-Laure Chaix, Jean-Christophe Plantier, Diane Descamps, Elisabeth André-Garnier, Brice Malve, Marc Wirden, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Service de Virologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire de virologie [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène, Groupe de Recherche sur les Antimicrobiens et les Micro-Organismes (GRAM 1.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), CHU Henri Mondor, Laboratoire de Virologie [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire de Virologie [CHU Saint-Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Génomes, biologie cellulaire et thérapeutiques (GenCellDi (U944 / UMR7212)), Collège de France (CdF (institution))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Laboratoire Virologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Laboratoire de sérologie-virologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Service de bactériologie-Virologie-Hygiène [Avicenne], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Service de virologie [CHU Nantes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de virologie et unité de surveillance biologique [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Service de Virologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de Virologie Médicale et Moléculaire [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Service de Virologie [Villejuif], Hôpital Paul Brousse, Laboratoire CERBA [Saint Ouen l'Aumône], Grand Hôpital de l'Est Francilien (GHEF), Service de virologie [Hôpital Tenon], CHU Tenon [AP-HP], Département de virologie [Grenoble], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Service de bactériologie-virologie [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Virologie [CHU Bichat], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Mzembaba, Sandy, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Génomes, biologie cellulaire et thérapeutiques (GenCellDi (UMR_S_944)), Collège de France (CdF (institution))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPC), Laboratoire de Virologie [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre National de Référence des virus entériques [CHU de Dijon] (CNR virus entériques), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène-Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris 13 (UP13)-Hôpital Avicenne [AP-HP]

Constance Delaugerre, Virginie Ferré, Anne Maillard, Vincent Calvez, Audrey Mirand, Anne-Geneviève Marcelin, Corinne Amiel, Julia Dina, Coralie Pallier, Hélène Le Guillou-Guillemette, Stéphanie Raymond, D. B. Fofana, Thomas Mourez, Hélène Jeulin, Samira Fafi-Kremer, Brigitte Montes, Pantxika Bellecave, Sophie Vallet, Thuy Van Nguyen, Diane Descamps, Catherine Roussel, Maxime Grude, Mary-Anne Trabaud, Charlotte Charpentier, Laurence Bocket, Philippe Flandre, Laura Le Guen, Anne Signori-Schmuck, Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHU Toulouse [Toulouse], Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CIC CHU ( Lille)/inserm, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Laboratoire de Virologie [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Simulation et Traitement de l'information pour l'Exploitation des systèmes de Production (EDF R&D STEP), EDF R&D (EDF R&D), EDF (EDF)-EDF (EDF), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Laboratoire de virologie [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Interaction virus-hôte et maladies du foie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Amiens-Picardie, Service de Virologie [CHU Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075 ), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Virologie [Rennes] = Virology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), Service de virologie et unité de surveillance biologique [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Hôpital Paul Brousse, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Virologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Clermont-Ferrand, CHU Lille, CHU Saint-Antoine [AP-HP], Laboratoire de Virologie [CHU Saint-Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Service de Virologie [CHRU Nancy], CHU Strasbourg, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Hôpital de la Cavale Blanche - CHRU Brest (CHU - BREST ), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Service de Virologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC)-Université Sorbonne Paris Nord, Hôpital Paul Brousse-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Virologie [Toulouse], CHU Saint-Eloi, Mzembaba, Sandy, and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)

Dahyot, S, Lebeurre, J, Laumay, F, Argemi, X., Dubos, C., Lemée, L., Prevost, G., François, P., Pestel-Caron, M., Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), CHU Rouen, Geneva University Hospital (HUG), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], Les Hôptaux universitaires de Strasbourg (HUS), CHU Strasbourg, and Mzembaba, Sandy

Moisan, Alice, de Oliveira, Fabienne, Cappy, Pierre, Ngoupo, Paul-Alain, Vessière, Aurelia, Lemée, Veronique, Mourez, Thomas, Alessandri-Gradt, Elodie, Plantier, Jean-Christophe, Laboratoire de virologie [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène-Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Centre Pasteur du Cameroun, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), and Mzembaba, Sandy

Moisan, Alice, de Oliveira, Fabienne, Pronier, Charlotte, Chapplain, Jean-Marc, Tremeaux, Pauline, Cappy, Pierre, Lemée, Veronique, Maillard, Anne, Plantier, Jean-Christophe, Laboratoire de virologie [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène-Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, CHU Pontchaillou [Rennes], Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], Service de Virologie [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire de Virologie [Rennes] = Virology [Rennes], Mzembaba, Sandy, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène, Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes], Hôpital Pontchaillou-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), and Laboratoire de Virologie [CHU Rennes]

Yasmine Smail, Simon Le Hello, François Caméléna, Philippe Bidet, André Birgy, Stéphane Bonacorsi, Patricia Mariani-Kurkdjian, Céline Courroux, AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Centre National de Référence - National Reference Center Escherichia coli, Shigella et Salmonella (CNR-ESS), Institut Pasteur [Paris], Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris] (IP), and Mzembaba, Sandy

Fournier, Anna Lucie, Yazdanpanah, Yazdan, Verdon, Renaud, Lariven, Sylvie, Mackoumbou-Nkouka, Claude, Phung, Bao-Chau, Papot, Emmanuelle, Parienti, Jean-Jacques, Landman, Roland, Champenois, Karen, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Unité de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Institut de médecine et d'épidémiologie appliquée [AP-HP Hôpital Bichat-Claude Bernard] (IMEA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 (METRICS), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Mzembaba, Sandy

Aurélie Tatopoulos, Philippe Reix, Ralph Epaud, Jean-Christophe Dubus, Antoine Deschildre, Caroline Thumerelle, Christophe Delacourt, Lisa Giovannini-Chami, Katia Bessaci, Marie-Laure Dalphin, Nadia Nathan, Céline Delestrain, Pierre-Yves Boëlle, Stéphanie Wanin, Rola Abou Taam, Laurence Weiss, Annick Clement, Michael Fayon, Christophe Marguet, Cyril Schweitzer, Véronique Houdouin, Jacques Brouard, Françoise Troussier, Marie-Catherine Renoux, Anne Houzel, Isabelle Pin, Clara Lauby, CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Epidémiologie, Systèmes d'Information, Modélisation, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Centre Référence des Maladies Héréditaires du Métabolisme de l'Enfant et de l'Adulte [CHU Necker] (MaMEA Necker), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital universitaire Robert Debré [Reims], Service de Pédiatrie Médicale [Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Laboratoire de Sciences de la Terre (LST), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de pédiatrie spécialisée et médecine infantile (neurologie, pneumologie, maladies héréditaires du métabolisme) [Hôpital de la Timone - APHM], Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Service de pédiatrie médicale et médecine de l'adolescent [Rouen], CHU Rouen, CHU Grenoble, Inflammatory Responses and Transcriptomic Networks in diseases (Equipe Inserm U1163), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Hospices Civils de Lyon (HCL), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de Médecine Infantile III et Génétique Clinique [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service d'immunologie [HEGP, Paris], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Maladies génétiques d'expression pédiatrique (U933), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Biomécanique cellulaire et respiratoire (BCR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et la Recherche Médicale (INSERM), the European Union's Seventh Framework Program, Grant/Award Number: FP7‐ChILD‐EU 2007‐2013, Respirer c'est Grandir and Belleherbe Association, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Service de Pneumologie pédiatrique [CHU Trousseau], Centre de référence national pour les maladies respiratoires rares de l’enfant RespiRare [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Trousseau [APHP], Maladies génétiques d'expression pédiatrique [CHU Trousseau] (Inserm U933), Mzembaba, Sandy, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Physiologie, biologie des organismes, populations, interactions, and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Hubert de Boysson, Achille Aouba, Claire Delmas, A. Dumont, Nicolas Martin Silva, Jonathan Boutemy, G. Maigné, Jean-Jacques Parienti, Audrey Sultan, Gaétane Planchard, Service de médecine interne [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Unité de Biostatistique et de Recherche Clinique (UBRC), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Université de Caen Normandie - UFR Santé (UNICAEN Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U1172 Inserm - U837 (JPArc), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Lille Nord de France (COMUE)-Université de Lille, Laboratoire d'Anatomie Pathologique [CHU Caen], Mzembaba, Sandy, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U837 (JPArc), and Université Lille Nord de France (COMUE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille

Nicole, Ngo-Giang-Huong, Thu H K, Huynh, Anoumou Y, Dagnra, Thomas-d'Aquin, Toni, Almoustapha I, Maiga, Dramane, Kania, Sabrina, Eymard-Duvernay, Martine, Peeters, Cathia, Soulie, Gilles, Peytavin, Claire, Rekacewicz, Marie-Laure, Chaix, Avelin F, Aghokeng, Ton, Tran, Chiang Mai University (CMU), Institut Pasteur d'Ho Chi Minh Ville, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Université de Lomé [Togo], CENTRE INTÉGRÉ DE RECHERCHES BIOCLINIQUES D'ABIDJAN (CIRBA) (CIRBA), University of Bamako [Mali], Institut de Recherche en Sciences de la Santé (IRSS) / Centre Muraz, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Génétique et Ecologie des Virus, Génétique des Virus et Pathogénèse des Maladies Virales, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Virologie [CHU Saint-Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), ANRS 1233 study group, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), and Mzembaba, Sandy

Simon Le Hello, Alexandra Mailles, Lisa-A King, François-Xavier Weill, Delphine Sergentet-Thevenot, Réseau français hospitalier de surveillance du Shu pédiatrique, Nathalie Jourdan-Da Silva, Malika Gouali, Estelle Loukiadis, Stéphane Bonacorsi, Patricia Mariani-Kurkdjian, Dieter Van Cauteren, Chantal Loirat, Marie-Pierre Donguy, Mathias Bruyand, Henriette de Valk, Sophie Lefèvre, Département des maladies infectieuses, Institut de Veille Sanitaire (INVS), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de Référence - National Reference Center Escherichia coli, Shigella et Salmonella (CNR-ESS), Institut Pasteur [Paris], Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Direction Générale de l'Alimentation (DGAL), Ministère de l'agriculture, de l'agroalimentaire et de la forêt, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Service de neuropédiatrie et maladies métaboliques [CHU Robert-Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Members of the Réseau français hospitalier de surveillance du SHU pédiatrique Djamal-Dine Djeddi: Paediatric and Adolescent Medicine Departement, Centre Hospitalier Universitaire d’Amiens, Amiens, France. Lise Allard: Paediatric Departement, Centre Hospitalier Universitaire d’Angers, Angers, France. Sylvie Roullaud: Paediatric Departement, Centre Hospitalier d’Angoulême, Angoulême, France. François Nobili: Paediatric Nephrology Departement, Centre Hospitalier Universitaire de Besançon, Besançon, France. Brigitte Llanas: Paediatric Nephrology Departement, Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux, Bordeaux, France. Loïc de Parscau: Paediatric Departement, Centre Hospitalier Régional Universitaire Morvan, Brest, France. Anne-Laure Sellier-Leclerc: Paediatric Nephrology Departement, hôpital Femme-Mère-Enfant, Bron, France. Philippe Eckart: Paediatric Departement, Centre Hospitalier Universitaire de Caen, Caen, France. Lucie Bessenay: Paediatric Departement, Centre Hospitalier Universitaire Estaing, Clermont Ferrand, France. Frédéric Huet: Paediatric Departement, Hôpital d’Enfants, Dijon, France. Guylhene Bourdat-Michel: Paediatric Departement, Centre Hospitalier Universitaire de Grenoble, Grenoble, France. Corinne Guitton: Paediatric Departement, AP-HP Centre Hospitalier Universitaire Bicêtre, Le Kremlin-Bicêtre, France. Robert Novo: Paediatric Nephrology Departement, Hôpital Jeanne de Flandre, Centre Hospitalier Universitaire de Lille, Lille, France. Vincent Guigonis: Paediatric Departement, Centre Hospitalier Universitaire Limoges, Limoges, France. Marcel Guillot: Peadiatric Departement, Centre Hospitalier Robert Bisson, Lisieux, France. Michel Tsimaratos: Paediatric Nephrology Departement, Hôpital de la Timone, Marseille, France. Marc Fila: Paediatric Departement, Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier, Montpellier, France. Gwenaelle Roussey-Kessler: Paediatric Nephrology Departement, Centre Hospitalier Universitaire de Nantes, Nantes, France. Etienne Berard: Paediatric Nephrology Departement, Centre Hospitalier Universitaire de Nice, Archet 2, Nice, France. Tim Ulinski: Paediatric Nephrology Departement, Hôpital Armand Trousseau, APHP, Paris, France. Chantal Loirat: Paediatric Nephrology Departement, Hôpital Robert Debré, APHP, Paris, France. Pauline Krug: Nephrology Departement, Hôpital Necker Enfants Malades, APHP, Paris, France. Violaine Lefranc: Paediatric Emergencies Departement, Centre Hospitalier Universitaire La Miletrie, Poitiers, France. Catherine Didier-Wright: Paediatric Department, Centre Hospitalier de la Région Annecienne, Pringy, France. Christine Pietremont: Nephrology Department, American Mémorial Hospital, Reims, France. Amélie Ryckewaert: Paediatric Nephrology Departement, Centre Hospitalier Universitaire Rennes, Rennes, France. Françoise Broux: Paediatric Nephrology Departement, Centre Hospitalier Universitaire Charles Nicolle, Rouen, France. Marie-Pierre Lavocat: Paediatric Departement, Hôpital Nord, Centre Hospitalier Universitaire de Saint Etienne, Saint Etienne, France. Joelle Terzic: Paediatric Departement, Centre Hospitalier Universitaire de Strasbourg, Strasbourg, France. Stéphane Decramer: Pediatric Nephrology Department, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Toulouse, France. Hubert Nivet: Pediatric Nephrology Department, Centre Hospitalier Universitaire de Tours, Tours, France. Isabelle Vrillon: Paediatric Nephrology Departement, Hôpitaux de Brabois, Centre Hospitalier Universitaire de Nancy, Vandoeuvre Les Nancy, France., Institut Pasteur [Paris] (IP), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella - Bactéries pathogènes entériques (CNR-ESS), Santé publique France, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré, Infectious Disease Department [Saint Maurice], Agence Nationale de la Santé Publique [Saint-Maurice] (ANSP), and Mzembaba, Sandy

Jean-Jacques Parienti, Jean-François Timsit, Jerome Aboab, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Institut Mondor de recherche biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Unité de Biostatistique et de Recherche Clinique (UBRC), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), and Mzembaba, Sandy

Sei, Jean-François, Bertolotti, Antoine, Boyal-Barraco, Micheline, Jouan, Nicole, Bourgault, Isabelle, Sbidian, Emilie, Perrot, Pierre, Yordanov, Youri, Sidorkiewicz, Stéphanie, Join-Lambert, Olivier, Caumes, Eric, Bru-Daprés, Marie-France, Chazelas, Karine, Dermatologue Saint Germain en Laye, Dermatologue La Réunion, Dermatologue Paris, Dermatologue Brest, Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], Hôpital Henri Mondor, Sarcomes osseux et remodelage des tissus calcifiés - Phy-Os [Nantes - INSERM U1238] (Phy-Os), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bretagne Loire (UBL)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Service d'Urgences Adultes [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Médecin Généraliste Paris, Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Service de Microbiologie [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Association française pour la Recherche sur l'Hidrosadénite (AFRH), Mzembaba, Sandy, Service des Urgences [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière]

Join-Lambert, Olivier, Service de Microbiologie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), and Mzembaba, Sandy

Giry, Marion, Gueudin, Marie, Boyer, Déborah, Baron, Adeline, Beduneau, Gaetan, Skallil, Soumaya, Grange, Steven, Carpentier, Dorothée, Tamion, Fabienne, Girault, Christophe, Misset, Benoit, Mzembaba, Sandy, Service de soins intensifs [CHU Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Département de microbiologie [CHU Rouen], and Centre Hospitalier Universitaire de Liège (CHU-Liège)

Soares, A., Alexandre, K., Lemée, L., Caron, F., Pestel-Caron, M., Etienne, M., Mzembaba, Sandy, Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), CHU Rouen, Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)

Renaud Verdon, Frédéric Grenouillet, Pascal Hazera, Charlotte Barbier, Françoise Chapon, A. Baldolli, Julie Bonhomme, Hélène Yera, CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Mobilités : Vieillissement, Pathologie, Santé (COMETE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service de Radiologie [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre Hospitalier Mémorial France États-Unis de Saint-Lô (CH Saint-Lô), Unité de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Mzembaba, Sandy, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)

Soares, A, Alexandre, K., Lamoureux, F., Lemée, L., Caron, F., Pestel-Caron, M., Etienne, M., Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), CHU Rouen, Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), and Mzembaba, Sandy

Soudais, B, Schuers, M., Lefebvre, E, Etienne, Manuel, Pellerin, L, UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Mzembaba, Sandy

Jean-Christophe Plantier, Diane Descamps, Marie Leoz, Charlotte Charpentier, Elodie Alessandri-Gradt, Thomas Mourez, Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Laboratoire de virologie [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Virologie [CHU Bichat], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, and Mzembaba, Sandy

Moisan, Alice, Caron, Juliette, de Oliveira, Fabienne, Plantier, Jean-Christophe, Laboratoire de virologie [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène-Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, and Mzembaba, Sandy

Cottalorda, A, Dahyot, S, Soares, A, Alexandre, K, Etienne, M, Jumas-Bilak, E., Pestel-Caron, M., Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), CHU Rouen, Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mzembaba, Sandy, Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Soares, A, Alexandre, K., Lamoureux, F., Lemée, L., Caron, F., Pestel-Caron, M., Etienne, M., Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), CHU Rouen, Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), and Mzembaba, Sandy

Gicquel, Albane, Lemée, Veronique, Gueudin, Marie, Alessandri-Gradt, Elodie, Plantier, Jean-Christophe, Moisan, Alice, Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Laboratoire de virologie [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Département de microbiologie : Bactério, Virologie, Parasito, Hygiène-Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), and Mzembaba, Sandy

Gilles Peytavin, Mary-Anne Trabaud, Anne Signori-Schmuck, Charlotte Charpentier, Marc Wirden, Cécile Henquell, Laurence Bocket, Catherine Delamare, Samira Fafi-Kremer, Jacques Izopet, Chakib Allaoui, Georges Dos Santos, A. Beby-Defaux, Benoit Visseaux, Virginie Ferré, Coralie Pallier, Diane Descamps, Stéphanie Marque-Juillet, Lambert Assoumou, Magali Bouvier-Alias, Sophie Vallet, Alexis de Rougemont, Hélène Le Guillou-Guillemette, Vincent Calvez, Stéphanie Raymond, Corinne Amiel, Honorine Fenaux, Anne De Monte, Francis Barin, Anne Krivine, Véronique Avettand-Fenoel, Annick Allardet-Servent, Jean-Christophe Plantier, Rachid Ait-Namane, Laurence Morand-Joubert, Marie-Laure Chaix, Camille Tumiotto, Maxime Grude, Anne Maillard, Laurence Courdavault, Brigitte Montes, Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CIC CHU ( Lille)/inserm, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Service de Virologie [CHU Bichat], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Hôpital Avicenne [AP-HP], CHU Clermont-Ferrand, Service de Virologie [CHU Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU de la Martinique [Fort de France], Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075 ), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Virologie [Rennes] = Virology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Services des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Bordeaux [Bordeaux], Interaction virus-hôte et maladies du foie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier de Versailles André Mignot (CHV), Centre Hospitalier Victor Dupouy, Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Service de Virologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Laboratoire de virologie [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Laboratoire de Virologie [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Mzembaba, Sandy, Epidémiologie, Systèmes d'Information, Modélisation, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service de Virologie [Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hôpital Paul Brousse, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Service de Virologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service de Virologie Médicale et Moléculaire [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], Laboratoire de Virologie-Immunologie [Fort de France, Martinique] (EA 4537), Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], CHU Henri Mondor, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Laboratoire de Virologie [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Sorbonne Université (SU), Service de virologie et unité de surveillance biologique [Bordeaux], CHU Strasbourg, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre hospitalier Argenteuil (CH Argenteuil), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Groupe de Recherche sur les Antimicrobiens et les Micro-Organismes (GRAM 1.0), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Pathologie cellulaire : aspects moléculaires et viraux / Pathologie et Virologie Moléculaire, Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANRS – France REcherche Nord&Sud Sida-hiv Hépatites

Henriette de Valk, Mathias Bruyand, Brecht Ingelbeen, Cécile Sommen, Simon Le Hello, Stéphane Bonacorsi, Patricia Mariani-Kurkjian, Kostas Danis, Mzembaba, Sandy, European Programme for Intervention Epidemiology Training (EPIET), European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de Référence - National Reference Center Escherichia coli, Shigella et Salmonella (CNR-ESS), Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris], and European Centre for Disease Prevention and Control [Stockholm, Sweden] (ECDC)

Jacques Izopet, Chloé Dimeglio, Florence Nicot, Caroline Lefebvre, Romain Carcenac, Nicolas Jeanne, Stéphanie Raymond, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Virologie [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Laboratoire Virologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), and Mzembaba, Sandy

Réveillon-Istin, Mathilde, Alexandre, Kévin, Fabre, Roland, Delbos, Valérie, Etienne, Manuel, Pestel-Caron, Martine, Caron, François, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Laboratoire d'analyse de biologie médicale [Elbeuf], and Mzembaba, Sandy

Giry, Marion, Misset, Benoit, Boyer, Déborah, Baron, Adeline, Lemée, Ludovic, Plantier, Jean-Christophe, Gueudin, Marie, Mzembaba, Sandy, Service de soins intensifs [CHU Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Département de microbiologie [CHU Rouen], Laboratoire de virologie [Rouen], Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN)

Tomczyk, Tifaine, Pestel-Caron, Martine, Marret, Stéphane, Boyer, Sophie, Service de pédiatrie néonatale et réanimation - neuropédiatrie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Département de microbiologie [CHU Rouen], CHU Rouen, and Mzembaba, Sandy

Alexandre, K., Réveillon, M, Delbos, V., Etienne, M., Pestel-Caron, M., Dahyot, S, Caron, F., Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), and Mzembaba, Sandy

Dubos, C., Lebeurre, J, Dahyot, S, Pestel-Caron, M., CHU Rouen, Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Mzembaba, Sandy

Dahyot, S, Lebeurre, J, Prevost, G., Lemée, L., Argemi, X., Pestel-Caron, M., Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Virulence Bactérienne Précoce : fonctions cellulaires et contrôle de l'infection aigüe et subaigüe, Université de Strasbourg (UNISTRA), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), and Mzembaba, Sandy

Vandeville, Séverine, Ricarde, Nathalie, Faucon, Marjorie, Laforêts, Bénédicte, Debab, Yasmine, Vautrin, David, Dubois, Gérard, Caron, François, Delbos, Valérie, CeGIDD Rouen, Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), and Mzembaba, Sandy

S. Barbier, N. Ricarde, B. Laforets, F. Toutain, G. Dubois, N. Grana, V. Delbos, E. François, F. Caron, Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), and Mzembaba, Sandy

Réveillon-Istin, Mathilde, Alexandre, Kévin, Fabre, Roland, Delbos, Valérie, Etienne, Manuel, Pestel-Caron, Martine, Caron, Francois, Mzembaba, Sandy, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Hôpital Charles Nicolle [Rouen]

Ludovic Lemée, Christophe Marguet, Sophie Boyer, Capucine Picard, Steven Grangé, Guillaume Deverrière, Alain Fischer, Mzembaba, Sandy, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Service de soins intensifs [CHU Rouen], Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Référence Déficits Immunitaires Héréditaires (CEREDIH), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Collège de France - Chaire Médecine expérimentale (A. Fischer), Collège de France (CdF (institution)), Service de pédiatrie médicale et médecine de l'adolescent [Rouen], Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Chaire Médecine expérimentale (A. Fischer)

Moisan, Alice, de Oliveira, Fabienne, Cappy, Pierre, Ngoupo, Paul-Alain, Njouom, Richard, Plantier, Jean-Christophe, Mzembaba, Sandy, Laboratoire de virologie [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Pasteur du Cameroun, and Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)

Fiaux, Elise, Piednoir, Emmanuel, Thibon, Pascal, Bouglé, Céline, Monzat, Doreya, Verdon, Renaud, Caron, François, Mzembaba, Sandy, CRCA NormAntibio, and Observatoire du médicament, des dispositifs médicaux et de l'innovation thérapeutique Normandie (OMEDIT NORMANDIE)