158 results on '"Muñoz Flórez, Jaime Eduardo"'
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2. Non-conventional Management of Plant-Parasitic Nematodes in Musaceas Crops
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Riascos-Ortiz, Donald, Mosquera-Espinosa, Ana T., Varón de Agudelo, Francia, Oliveira, Claudio Marcelo Gonçalves, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Ciancio, Aurelio, Series Editor, Chaudhary, Kamal Kishore, editor, and Meghvansi, Mukesh Kumar, editor
- Published
- 2022
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3. Exploring Genomics and Microbial Ecology: Analysis of Bidens pilosa L. Genetic Structure and Soil Microbiome Diversity by RAD-Seq and Metabarcoding
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Reyes-Ardila, Wendy Lorena, primary, Rugeles-Silva, Paula Andrea, additional, Duque-Zapata, Juan Diego, additional, Vélez-Martínez, Glever Alexander, additional, Tarazona Pulido, Lina, additional, Cardona Tobar, Karen Melissa, additional, Díaz Gallo, Sergio Alberto, additional, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, additional, Díaz-Ariza, Lucia Ana, additional, and López-Alvarez, Diana, additional
- Published
- 2024
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4. Molecular and morphological characterization oi Musa spp. (Zingiberales: musaceae) cultivars/Caracterizacion molecular y morfologica de cultivares de Musa spp. (Zingiberales: musaceae)
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Buitrago-Bitar, María Angélica, Enríquez-Valencia, Ayda Lilia, Londoño-Caicedo, Jorge Mario, Muñoz-Flórez, Jaime Eduardo, Villegas-Estrada, Bernardo, and Santana-Fonseca, Gloria Esperanza
- Published
- 2020
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5. Comparative Analysis of Bacteria, Fungi, and Arbuscular Mycorrhizal Fungi in Medicinal Plants Lippia alba and Petiveria alliacea in Colombia
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Vélez-Martínez, Glever Alexander, primary, Duque-Zapata, Juan Diego, additional, Reyes-Ardila, Wendy Lorena, additional, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, additional, Díaz Gallo, Sergio Alberto, additional, Díaz Ariza, Lucia Ana, additional, and López-Álvarez, Diana, additional
- Published
- 2023
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6. Morpho-molecular characterization of Colombian and Brazilian populations of Rotylenchulus associated with Musa spp
- Author
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Riascos-Ortiz Donald, Mosquera-Espinosa Ana Teresa, De Agudelo Francia Varón, de Oliveira Claudio Marcelo Gonçalves, and Muñoz-Flórez Jaime Eduardo
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banana ,diagnosis ,phytonematodes ,plantain ,rotylenchulus reniformis ,taxonomy ,Biology (General) ,QH301-705.5 - Abstract
Three populations, two from Colombia and one from Brazil, of Rotylenchulus reniformis associated with banana and plantain, were characterized using morphological, morphometric, and molecular methods. Morphometric data from these populations were similar to type and reference populations of R. reniformis. Partial sequences of both D2-D3 rDNA and mitochondrial cytochrome oxidase subunit I (COI) regions had a strong affinity (99% similarity) to previously published sequences of R. reniformis. Phylogenetic analyses (maximum likelihood and Bayesian inference) suggested that the Colombian populations of R. reniformis corresponded to the previously described Type A of the species. This is the definitive first report in Colombia of R. reniformis associated with banana and plantain crops.
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- 2019
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7. Soil bacteria and fungi communities are shaped by elevation influences in Colombian forest and páramo natural ecosystems
- Author
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Vélez-Martínez, Glever Alexander, primary, Reyes-Ardila, Wendy Lorena, additional, Duque-Zapata, Juan Diego, additional, Rugeles-Silva, Paula Andrea, additional, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, additional, and López-Álvarez, Diana, additional
- Published
- 2023
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8. Molecular Identification and Phylogenetic Diversity of Native Entomopathogenic Nematodes, and Their Bacterial Endosymbionts, Isolated from Banana and Plantain Crops in Western Colombia
- Author
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Londoño-Caicedo, Jorge Mario, primary, Uribe-Londoño, Miguel, additional, Buitrago-Bitar, María Angélica, additional, Cortés, Andrés J., additional, and Muñoz-Flórez, Jaime Eduardo, additional
- Published
- 2023
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9. Soil Bacterial Communities from Three Agricultural Production Systems in Rural Landscapes of Palmira, Colombia
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Rugeles-Silva, Paula Andrea, primary, Londoño, Jairo Andrés, additional, Sánchez de Prager, Marina, additional, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, additional, and López-Álvarez, Diana, additional
- Published
- 2023
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10. Caracterización de agrosistemas productores de plátano (Musa AAB) en los cantones Santo Domingo y El Carmen, Ecuador
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López Mejía, Francel Xavier, primary, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, additional, Vivas Cedeño, Jorge Sifrido, additional, Cedeño Zambrano, José Randy, additional, Tacuri Troya, Elizabeth, additional, and Cruzatty Loor, Nexsy Marlene, additional
- Published
- 2022
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11. Caracterización morfológica de 29 introducciones de Physalis peruviana L. de la colección de trabajo de la Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira
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Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Barrera Marín Nancy, Madriñán Palomino Carlos Eduardo, and Vásquez Amariles Herney Darío
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Banco de germoplasma, descriptores, Solanaceae, uchuva ,Cape gooseberry, descriptors, germoplasm bank ,Agriculture - Abstract
Physalis peruviana L. (uchuva), de la familia Solanaceae, es una de las frutas más importantes en términos de exportaciones para Colombia debido a sus propiedades nutricionales y medicinales. En nuestro país la caracterización morfológica y evaluación de los bancos de germoplasma ha comenzado a implementarse. El objetivo de la presente investigación es la caracterización morfológica mediante descriptores discriminantes de 29 Introducciones de uchuva representativas de la colección de trabajo de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira. El trabajo se realizó en la Reserva Natural "La Albecia", vereda Regaderos, corregimiento de Auji, Municipio de El Cerrito - Valle del Cauca, a una altura de 1945 msnm, temperatura de 18-20°C, humedad relativa 70-80% y precipitación anual de 900-1200 mm. El ensayo se desarrolló en tres fases. En la primera se escogieron 29 introducciones representativas de la colección de trabajo de uchuva (CTU). En la segunda se estableció el ensayo bajo un diseño experimental de bloques completos al azar (BCA) y en la ültima fase se recopiló la información mediante descriptores cuantitativos y cualitativos previamente seleccionados. Se obtuvo un dendrograma a partir del análisis de conglomerado de varianza mínima de Ward, que determinó cinco grupos para las variables cualitativas. El tercer grupo explica el mayor grado de similitud entre las 29 introducciones evaluadas, con un porcentaje del 27.58. La mayor variabilidad estuvo relacionada con los caracteres del fruto: peso con y sin cáliz, grados Brix y diámetros polares y ecuatoriales.
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- 2011
12. Detección de una mutación puntual en el gen receptor Ryanodina (Ryr 1) en cerdos criollos colombianos Detection of a single mutation point in Ryanodine receptor gene (Ryr 1) in colombian creole pigs
- Author
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Darwin Y Hernández, Andrés Mauricio Posso Terranova, and Muñoz Flórez Jaime Eduardo
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Estrés porcino ,cerdos criollos ,PCR-RFLP ,PCR-SSCP ,Creole pigs ,porcine stress ,Agriculture - Abstract
El síndrome de estrés porcino (PSS) es una enfermedad hereditaria monogénica recesiva relacionada con el gen receptor ryanodina (Ryr1). Utilizando PCR-SSCP y PCR-RFLP se tipificaron genéticamente 14 individuos de cerdos comerciales con el rasgo sindactilia (Casco de Mula-CM), 21 San Pedreños -SP y 100 Zungos- ZN. Las razas CM y SP tuvieron las mismas frecuencias alélicas (F(H) = 0.79 y F(h) = 0.21), mientras que en los cerdos ZN no se encontró el alelo recesivo (h). La heterocigosidad (He) fue de 0.28% para los cerdos CM y 0.23% para los SP. La He para la muestra poblacional fue de 0.066.The Porcine Stress Syndrome is a hereditary monogenic recessive disease related with Ryanodine Receptor gen (Ryr1). Using PCR-SSCP and PCR-RFLP 14 animals of commercial breed with Mule foot characteristic (CM), 21 San Pedreño breed (SP) and 100 Zungo breed (ZN) were genotipificated. Allelic frequency for CM and SP was the same (F(H) = 0.79 y F(h) = 0.21), while in ZN there was no evidence of recessive allele (h). Heterocigosity (He) was 0.28% for CM and 0.23% for SP. He value for population sample was 0.066.
- Published
- 2008
13. Microsatélites amplificados al azar (RAM) en estudios de diversidad genética vegetal
- Author
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Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Morillo Coronado Yacenia, and Morillo Coronado Ana Cruz
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Physalis peruviana ,Psidium guajava ,Rubus spp ,Heliconia spp ,marcadores moleculares ,análisis genéticos ,molecular markers ,genetic analysis ,Agriculture - Abstract
Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM) en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesiones de fruto rojo que se diferenciaron genéticamente de las amarillas y una región geográfica con alta variabilidad. En guayaba los cebadores fueron altamente polimórficos y se encontró alta variabilidad en el Valle del Cauca. En heliconias y especies relacionadas se diferenciaron las familias del orden Zingiberales, algunos subgéneros y variaciones en la especie. La técnica es de bajo costo, utiliza un cebador, no requiere información previa, es altamente polimórfica y diferencia especies en los taxones evaluados.
- Published
- 2008
14. Detección de una mutación puntual en el gen receptor Ryanodina (Ryr 1) en cerdos criollos colombianos
- Author
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Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Hernández Darwin, and Posso Terranova Ándres Mauricio
- Subjects
Estrés porcino ,cerdos criollos ,PCR-RFLP PCR-SSCP ,Creole pigs ,porcine stress ,Agriculture - Abstract
El síndrome de estrés porcino (PSS) es una enfermedad hereditaria monogénica recesiva relacionada con el gen receptor ryanodina (Ryr1). Utilizando PCR-SSCP y PCR-RFLP se tipificaron genéticamente 14 individuos de cerdos comerciales con el rasgo sindactilia (Casco de Mula-CM), 21 San Pedreños -SP y 100 Zungos- ZN. Las razas CM y SP tuvieron las mismas frecuencias alélicas (F(H) = 0.79 y F(h) = 0.21), mientras que en los cerdos ZN no se encontró el alelo recesivo (h). La heterocigosidad (He) fue de 0.28% para los cerdos CM y 0.23% para los SP. La He para la muestra poblacional fue de 0.066.
- Published
- 2008
15. Caracterización molecular de 15 aislamientos de Beauveria bassiana asociados con Cosmopolites y Metamasius en plátano y banano en tres regiones de Colombia
- Author
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Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Posso Terranova Andrés Mauricio, Hurtado Tenorio Ifigenia, Marmolejo Diego Fernando, and Mejía Rosa
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Entomopatógenos ,Deuteromicetes ,marcadores moleculares ,RAM ,diversidad genética ,picudos ,Coleoptera Rhinchophorinae ,Musa spp ,Entomopathogen ,molecular markers ,RAMs ,genetic diversity ,weevils ,Agriculture - Abstract
Se colectaron picudos de Cosmopolites y Metamasius en municipios del Valle del Cauca, Caldas y Quindío. Se obtuvieron cultivos monospóricos con diluciones de 10-10 y 10-11. Los aislamientos fueron almacenados a -80°C con glicerol al 10% y el ADN a –20°C. Los marcadores moleculares RAM generaron 82 fragmentos de los cuales 67% fueron polimórficos con una heterocigocidad de 0.24, que indica diversidad media a alta. A un índice de similitud 0.84 se formaron 5 grupos: uno con 11 aislamientos y 4 con un solo aislamiento. En el gran grupo se detectó un duplicado y se encontró diversidad del hongo en los sitios muestreados. No se encontró relación entre aislamientos sobre Cosmopolites y Metamasius o zona geográfica en la formación de grupos genéticos.
- Published
- 2008
16. Expresión transitoria del gen GUS en caña de azúcar usando Agrobacterium tumefaciens
- Author
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Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Ángel Sánchez Fernando, and Bonilla Betancourth Martha Liliana
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Agrobacterium tumefaciens ,Saccharum spp ,caña de azúcar ,transformación genética ,sugarcane ,genetic transformation ,Agriculture - Abstract
En el estudio se desarrolló una metodología de transformación genética mediante Agrobacterium tumefaciens en cultivares colombianos de caña de azúcar. La transformación se evaluó mediante la expresión del gen GUS. Callos embriogénicos y explantes meristemáticos de los genotipos CC85-92, CC84-75 y CC87-505 se transformaron usando tres cepas (AGL-1, LBA4404 y EHA105) con el plásmido pCambia 1305.2 y dos (EHA105 y LBA4404) con pCambia 2301. Se usó el medio de infiltración (IM) con acetosiringona y se evaluó el tiempo de cocultivo y la densidad óptica de la bacteria al momento de la inducción. Los genotipos mostraron respuesta diferencial con las combinaciones cepa-plásmido: obtuvieron mayor expresión del gen GUS cuando el genotipo CC85-92 se transformó con la cepa AGL-1-pCambia 1305.2. CC84-75 y CC87-505 mostraron mayor expresión cuando se transformaron con la cepa EHA105-pCambia 1305.2. Mayor eficiencia en la expresión se obtuvo cuando la bacteria se indujo en IM después de siete días de cocultivo y cuando la densidad óptica de la bacteria fue de 0.2600nm al momento de la inducción. Se demostró superioridad de los explantes en la eficiencia de transformación.
- Published
- 2008
17. Morphologic characterization of 24 accessions of Cape gooseberry from the National University campus Palmira's germplasm bank Caracterización morfológica de 24 accesiones de uchuva del banco de germoplasma de la Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira
- Author
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Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Vásquez Amariles Herney Darío, Posso Terranova Andrés Mauricio, Espinosa Piedrahíta Katherine, and Bonilla Betancourt Martha Liliana
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Descriptores cualitativos y cuantitativos ,Análisis de Correspondencia Múltiple (ACM) ,Análisis de Componentes Principales (ACP) ,Qualitative and quantitative descriptors ,Multiple Correspondence Analysis (ACM) ,Principal Components Analysis (ACP). ,Agriculture - Abstract
24 accessions of Cape gooseberry Physalis peruviana L. from The National University of Colombia campus Palmira's work collection were characterized using 27 morphologic descriptors (10 qualitative and 17 quantitative). Two different analyses were made, the multiple correspondence analyses (ACM) and the ascendant hierarchy classification for qualitative variables and the principal component analysis (ACP) for quantitative variables. The results showed that 65.64% of variability was explained with three axes in the ACM. The first axe with 38.53% contained the variables colour of petals, anthers, berry ripped and seeds. The hierarchy classification generated three groups. The two first axes in ACP analysis explained 32.04% and 17.02% of the variation. Besides, the highest variability was supported by different characteristics such as fruit weight, transversal and longitudinal size of fruit, dry and wet seed weight, seeds number and soluble solids content and also the hierarchy classification showed five groups. Furthermore, it was possible to establish five materials with potential to be processed, traded and improved because of the high weight fruit, low number of seeds and high Brix grades.Key words: Qualitative and quantitative descriptors; Multiple Correspondence Analysis (ACM); Principal Components Analysis (ACP).Se caracterizaron 24 accesiones de uchuva Physalis peruviana L. de la colección de trabajo de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, mediante 27 descriptores morfológicos (10 cualitativos y 17 cuantitativos). Se analizó la correspondencia múltiple (ACM) y clasificación jerárquica ascendente para variables cualitativas y de componentes principales (ACP) para variables cuantitativas. En el ACM tres ejes explicaron el 65.64% de la variabilidad; el primero con 38.53% reunió las variables color de máculas, color de anteras, color de la baya madura y color de semilla y la clasificación jerárquica generó tres grupos. Los dos primeros ejes del ACP explicaron 32.04% y 17.02% de la variación. El mayor aporte a la variabilidad fue dado por peso del fruto, tamaño transversal y longitudinal del fruto, peso de semilla húmeda y seca, número de semillas y contenido de sólidos solubles. La clasificación jerárquica determinó la conformación de cinco grupos. Se identificaron 5 materiales con potencialidades para el procesamiento, mercado y programas de mejoramiento por poseer alto peso del fruto, bajo número de semillas y valor alto de grados Brix.Palabras claves: Descriptores cualitativos y cuantitativos; Análisis de Correspondencia Múltiple (ACM); Análisis de Componentes Principales (ACP).
- Published
- 2008
18. Sexual reproduction of the cape gooseberry Biología reproductiva de la uchuva
- Author
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Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Vallejo Cabrera Franco Alirio, Criollo Escobar Hernando, and Lagos B Tulio César
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Physalis peruviana ,antesis ,apertura floral ,autopolinización ,polinización cruzada ,anthesis ,self-pollination ,cross-pollination. ,Agriculture - Abstract
The objectives of the study were to determine the time of pollen and stigma ripening and to establish the kind of pollination in Physalis. This research was conducted in the Botana Farm at the University of Nariño, Colombia (2820 m a s l, 13 ° C, pluvial precipitation of 800 mm / year and relative humidity of 82%). P. peruviana took 37 days to anthesis, which took place between 7:00 and 10:00 am. In 85% of the flowers the first anther dehiscent was the day after the opening of the flower. The pollen grains showed 97% of viability to 35 days. Pollen matured before anthesis and stigma was receptive before the opening of the flower. Both, pollen and the pistil matured to 35 days of development, two days before anthesis; receptivity of the pistil was filed two days prior to anthesis, a phenomenon that restricts the self. The absence of vectors influenced pollination of P. peruviana. In emasculate flowers and subjected to self-pollination is introduced low fruit and seed formation, there was a differential response in pollination among samples inside the greenhouse. P. peruviana showed mixed pollination with 54% of cross-pollination.Key words: Physalis peruviana; anthesis; self-pollination; cross-pollination.Los objetivos del trabajo fueron determinar la época de maduración del polen y del estigma y establecer el tipo de polinización de la uchuva en condiciones de invernadero con cinco genotipos de uchuva. La investigación se realizó en la Granja Botana de la Universidad de Nariño (2.820 msnm, 13°C, precipitación de 800 mm/año y humedad relativa de 82%). P. peruviana tomó 37 días para la apertura floral, la cual se efectuó entre las 7:00 a.m. y las 10:00 a.m. En el 85% de las flores la primera antera fue dehiscente al día siguiente de la apertura floral. Los granos de polen tuvieron 97% de viabilidad a los 35 días. El polen maduró antes de la antesis y el estigma fue receptivo antes de la apertura de la flor. Tanto el polen como el pistilo maduraron a los 35 días de desarrollo, dos días antes de la apertura floral; la receptividad del pistilo se presentó dos días antes de la antesis, fenómeno que restringe la autopolinización. En invernadero, la ausencia de vectores influyó en la polinización de P. peruviana. En flores emasculadas y sometidas a libre polinización se presentó baja formación de frutos y semillas, existió respuesta diferencial a la polinización dentro del invernadero entre las muestras evaluadas. P. peruviana presentó polinización mixta con 54% de polinización cruzada.Palabras claves: Physalis peruviana; antesis; apertura floral; autopolinización; polinización cruzada.
- Published
- 2008
19. Molecular characterization of 43 accesions of Cape gooseberry from six departments of Colombia Caracterización molecular de 43 accesiones de uchuva de seis departamentos de Colombia
- Author
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Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Posso Terranova Andrés Mauricio, Vásquez Amariles Herney Darío, Espinosa Piedrahíta Katherine, and Bonilla Betancourt Martha Liliana
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Solanaceae ,loci polimórficos ,cebadores ,RAM ,Polymorphic loci ,primers ,Agriculture - Abstract
The RAM's technique (Random Amplified Microsatellites) was used to assess the genetic diversity of 43 accesions of Cape gooseberry collected in six regions of Colombia (Nariño, Valle del Cauca, Cauca, Caldas, Quindío and Cundinamarca), property of the National University of Colombia at Palmira's campus collection. This analysis was based on the data from 42 polymorphic loci generated with seven primers. The results showed high genetic distance among accessions from Valle del Cauca and low genetic distance among accessions from Nariño, Cauca, Quindío, Caldas and Cundinamarca departments.Key words: Solanaceae; Polymorphic loci; primers; RAM.La técnica RAM (Random Amplified Microsatellites) se usó para el análisis de diversidad genética de 43 accesiones de uchuva recolectadas en seis regiones de Colombia (Nariño, Valle del Cauca, Cauca, Caldas, Quindío y Cundinamarca), pertenecientes a la colección establecida en la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira. El análisis se realizó sobre 42 loci polimórficos obtenidos con siete cebadores, encontrándose baja diversidad para las introducciones de Nariño, Cauca, Quindío, Caldas y Cundinamarca. La población del Valle del Cauca reunió la mayor diversidad de los materiales recolectados.Palabras claves: Solanaceae; loci polimórficos; cebadores; RAM.
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- 2008
20. Establishing of a Cape gooseberry working collection collected in the colombian southwest zone Establecimiento de una colección de trabajo de uchuva del suroccidente colombiano
- Author
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Espinosa Piedrahíta Katherine, Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Vásquez Amariles Herney Darío, Posso Terranova Andrés Mauricio, and Bonilla Betancourt Martha Liliana
- Subjects
Physalis peruviana ,Solanaceae ,diversidad genética ,Banco de germoplasma ,genetic diversity ,germplasm bank. ,Agriculture - Abstract
Physalis peruviana L. is a promissory fruit specie for the Andean Colombian zone, however, it has not been a priority genetic resource for conservation. In this study a working collection of 222 accessions collected in the states of Nariño, Valle del Cauca, Cauca, Caldas, Quindío and Cundinamarca of Colombia was established and registered in a computational data base. It represent the variability present of native and spontaneous varieties. Seeds of the collected materials are available in cold room in the Experimental Centre of The National University of Colombia campus Palmira. This collection contributes to the conservation and genetic diversity studies in this specie, besides for implementing selection and breeding programs..Key words: Physalis peruviana ; Solanaceae; genetic diversity; germplasm bank.Physalis peruviana L. es una especie frutícola promisoria para la zona andina colombiana; sin embargo, no ha sido un recurso genético prioritario de conservación. En el estudio se estableció una colección de trabajo registrada en una base de datos computarizada de 222 accesiones recolectadas en los departamentos de Nariño, Valle del Cauca, Cauca, Caldas, Quindío y Cundinamarca que representan la variabilidad existente de cultivariedades nativas y espontáneas. Las semillas del material recolectado se encuentran en el cuarto frío del Centro Experimental de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira. Esta colección contribuye a la conservación y al estudio de la diversidad de esta especie y a la disponibilidad de una base genética para futuros programas de selección y mejoramiento genético.Palabras claves: Physalis peruviana; Solanaceae; diversidad genética; Banco de germoplasma.
- Published
- 2008
21. Genetic structure and diversity of Calycolpus moritzianus (Myrtaceae) in the north-eastern Andes of Colombia
- Author
-
Hernández-Contreras, Diego Alexander, primary, Torres-Torres, Franklin De Jesús, additional, Figueroa-Lozano, Mauricio, additional, Sánchez-Montaño, Luis Roberto, additional, Posso-Terranova, Andrés Mauricio, additional, and Muñoz-Flórez, Jaime Eduardo, additional
- Published
- 2021
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22. RESCUE OF COCOA NATIONAL VARIETY: GENETIC POTENTIAL OF SELECTION.
- Author
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Carranza Patiño, Mercedes, Morante Carriel, Jaime, Cruz Rosero, Nicolás Javier, Jiménez-Romero, Edwin, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
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PRINCIPAL components analysis ,COCOA ,INDEPENDENT variables ,MULTIPLE regression analysis ,FACTOR analysis - Abstract
The research focused on fine aroma cocoa is a priority for Ecuador. The objective of this work was to identify stable, high-yielding accessions. The genetic base was based on 2222 cocoa accessions from the germplasm bank of the Tenguel Aroma Cocoa Center - Ecuador. An index was applied for selecting 150 accessions based on yield and health status. A descriptive analysis, principal component analysis by the factor extraction method between the meteorological parameters and the variables evaluated, was used. A multiple regression and stability analysis was also performed using the method of Eberhart & Russell (1966) modified by considering the years as the different environments and multivariate principal component analysis. Variables related to high CV % yield ranged from 93 to 112 %. The highest yields were observed in 2003, 2004 and 2005. The flowering intensity was influenced by rainfall, temperature and relative humidity and thus by the yield of the accessions. The predictor variables for yield were healthy pods, diseased pods and flowering intensity with a correlation of 0.95, 0.33 and 0.07, respectively, and an R2 = 0.899. The following were selected for their stability and average yield per tree 2.1 kg tree-1: L17H38, L33H45, L53H4, L49H4, L41H70, L49H4, L21H56, L13H11, L30H1, L30H46, L42H80, L30H45 and L32H72. The characteristics of the selected accessions constitute a contribution to cocoa breeding programs in Ecuador and other cocoa-producing regions. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
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- 2022
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23. Deteccion de una mutacion puntual en el gen receptor Ryanodina (Ryr 1) en cerdos criollos colombianos
- Author
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Hernández, Darwin Y., Posso Terranova, Andrés Mauricio, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2008
24. Caracterizacion molecular de 15 aislamientos de Beauveria bassiana asociados con Cosmopolites y Metamasius en platano y banano en tres regiones de Colombia
- Author
-
Marmolejo, Diego Fernando, Mejía, Rosa, Hurtado Tenorio, Ifigenia, Posso Terranova, Andrés Mauricio, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2008
25. Expresion transitoria del gen GUS en caña de azúcar usando Agrobacterium tumefaciens
- Author
-
Bonilla Betancourt, Martha Liliana, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, and Sánchez, Fernando Angel
- Published
- 2008
26. Caracterizacion molecular de 43 accesiones de uchuva de seis departamentos de Colombia
- Author
-
Bonilla Betancourt, Martha Liliana, Espinosa Piedrahíta, Katherine, Posso Terranova, Andrés Mauricio, Vásquez Amariles, Herney Darío, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2008
27. Caracterizacion morfologica de 24 accesiones de uchuva del banco de germoplasma de la Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira
- Author
-
Bonilla Betancourt, Martha Liliana, Espinosa Piedrahíta, Katherine, Posso Terranova, Andrés Mauricio, Vásquez Amariles, Herney Darío, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2008
28. Establecimiento de una coleccion de trabajo de uchuva del suroccidente colombiano
- Author
-
Bonilla Betancourt, Martha Liliana, Espinosa Piedrahíta, Katherine, Posso Terranova, Andrés Mauricio, Vásquez Amariles, Herney Darío, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2008
29. Biologia reproductiva de la uchuva
- Author
-
Lagos B., Tulio César, Vallejo Cabrera, Franco Alirio, Criollo Escobar, Hernando, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2008
30. Molecular and morphological characterization of Musa spp. (Zingiberales : Musaceae) cultivars
- Author
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Buitrago Bitar, María Angélica, Enríquez Valencia, Ayda Lilia, Londoño Caicedo, Jorge Mario, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Villegas Estrada, Bernardo, and Santana Fonseca, Gloria Esperanza
- Subjects
fluorescent microsatellites ,phenotyping ,genotyping ,fenotipificación ,genotipificación ,diversidad genética ,genetic diversity ,microsatélites fluorescentes - Abstract
Objetivos: Analizar la diversidad genética de cultivares de Musa acuminata Colla y Musa balbisiana Colla (Musaceae), cultivados en el departamento de Caldas Alcance: Caracterización de la variabilidad genética, a nivel molecular y morfológico de cultivares de M. acuminata y M. balbisiana, encontrados en fincas de agricultores de Caldas, utilizando descriptores morfológicos y microsatélites fluorescentes. Metodología: Las evaluaciones fenotípicas comprendieron la evaluación de 57 caracteres morfológicos según los descriptores propuestos por el IPGRI para el género Musa, mientras la genotipificación comprendió el uso de nueve marcadores microsatélites fluorescentes (SSR) para la identificación correcta de los alelos amplificados. El análisis de clúster fue llevado a cabo independientemente para ambas caracterizaciones, morfológica y molecular, bajo Análisis de Componentes Principales (PCA) y métodos de probabilidad posterior (Bootstrapping) respectivamente. Resultados principales: Con los descriptores morfológicos se identificaron correlaciones directas e inversamente significativas, y se destacaron descriptores como tamaño de bellota masculina, diámetro del pedúnculo, número de frutos, altura de pseudotallo y longitud del fruto, para lo cual contribuyeron considerablemente a la variabilidad entre cultivares de plátano y banano permitiendo la discriminación de tres grupos principales en el análisis de clúster; desde la perspectiva molecular un total de 72 alelos polimórficos fueron obtenidos con una diversidad genética promedio de 0.79, Contenido de Información Polimórfica (PIC) de 0.77 y heterocigocidad de 0.48, mostrando un grado moderado de diferenciación genética (FST = 0.061) entre especies generando tres sub-grupos principales basados en su disimilaridad genética. Conclusiones: La identificación de ciertos rasgos morfológicos demostraron ser adecuados para la discriminación de los cultivares del género Musa evaluados en el presente estudio. Por otra parte, la caracterización molecular permitió establecer las relaciones genéticas dentro de los grupos, adicionalmente los SSRs evaluados presentaron alta precisión e información, siendo apropiados para su uso en caracterizaciones de variedades y cultivares del género Musa. Objectives: The overall goal was to analyze genetic diversity in cultivars of Musa acuminata (Colla) and M. balbisiana (Colla), commonly grown in farms from Caldas department. Scope: Characterization of the genetic variability, at the molecular and morphological level of cultivars of M. acuminata and M. balbisiana, found in farms from Caldas farmers using morphological descriptors and fluorescent microsatellites. Methodology: Phenotyping evaluations comprised 57 morphological characters following the descriptors proposed by IPGRI for the Musa genus, and for genotyping evaluations, nine fluorescent microsatellites (Simple Sequence Repeats-SSR) were used to allow the precise identification of alleles. Additionally, cluster analyses were carried out independently for both morphological and genotypic characterizations under Principal Component Analysis (PCA) and Bootstrapping methods respectively. Main results: Positive and negative highly significant correlations were found for the morphological descriptors, where traits such as presence/ absence of male bud was the rule, as well as the diameter and perimeter of this trait, plus the diameter and perimeter of the peduncle, number of fruits, pseudostem height and fruit length contributed considerably to the variability among the cultivars allowing the discrimination of three main groups in the cluster analyzes. From the molecular perspective a total of 72 polymorphic alleles were obtained, with an average genetic diversity of 0,79, polymorphic information content (PIC) of 0,77 and heterozygosity of 0,48, showed a moderate degree of genetic differentiation (FST = 0,061) among Musa cultivars, generating three main sub-clusters based on their genetic dissimilarity. Conclusions: The identification of certain morphological traits showed to be suitable for the discrimination of Musa cultivars evaluated here. On the other hand, molecular characterization allowed to establish the genetic relationships among groups, also fluorescent SSR were highly informative and accurate, in such a way that can be considered suitable for characterizations in Musa varieties.
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- 2020
31. Evaluación de plagas y su impacto sobre la producción de plátano y banano
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Angulo Angulo, Wargner Javier, Osorio, Juan Gabriel, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, and Riascos Ortíz, Donald
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Producción alimentaria ,Plátano ,Agricultura ,Enfermedades y plagas ,632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetales [630 - Agricultura y tecnologías relacionadas] ,Banano ,Picudos - Abstract
Cartilla ilustrada El complejo de picudos de plátano y banano, conformado por los insectos plaga Cosmopolites sordidus, Metamasius hemipterus, Metamasius hebetatus, Metamasius submaculatus, Polytus mellerborgii, es de gran importancia económica para estos cultivos por los daños que ocasionan los estados larvales y adultos de estas especies en las plantas (Pava et al., 2020). Entre los daños que ocasionan estos insectos se incluyen las galerías en los cormos y pseudotallos, lo que limita la formación de nuevos colinos para futuras siembras, además de que predisponen a la planta al ataque de patógenos, como moko o madurabiche, Ralstonia solanacearum E. F. (Smith) raza 2, pudrición acuosa del pseudotallo o bacteriosis Dickeya chrysanthemi, mal de panamá Fusarium oxysporum f. sp. cubense y Sigatoka negra Mycosphaerella fijiensis Morelet var. difformis, principalmente (Alarcón y Jiménez, 2012). El complejo de picudos de plátano y banano causa un reducido número de hojas funcionales durante la floración, retraso en la maduración, peso reducido del racimo, acortamiento de la vida útil del cultivo, volcamiento y, en algunos casos, la muerte prematura de la planta. En consecuencia, se generan pérdidas en producción del 42-60 % (Gold et al., 2004; Sepúlveda y Rubio, 2009). La presente cartilla es una herramienta para uso por parte de productores, asistentes técnicos y profesionales de las ciencias agrarias y afines, cuyo fin es la evaluación del daño y la estimación de las pérdidas en producción ocasionadas por larvas del complejo de picudos, los cuales generan impactos económicamente negativos a los cultivadores de plátano y banano del país. La aproximación metodológica propuesta en este documento permitirá, a partir de la evaluación del daño en los cormos, tomar decisiones de manejo del complejo de picudos en los cultivos de plátano y banano, y con ello reducir las pérdidas en la producción de racimos en los cultivos. Finalmente, la cartilla suministra información sobre estrategias de manejo del complejo de picudos en los cultivos de plátano y banano, haciendo énfasis en prácticas culturales y biológicas. INTRODUCCIÓN COMPLEJO DE PICUDOS DEL PLÁTANO Y BANANO DAÑO OCASIONADO POR EL PICUDO NEGRO EVALUACIÓN DEL DAÑO EN EL CORMO Y PSEUDOTALLO POR EL COMPLEJO DE PICUDOS RECOMENDACIONES PARA EL MANEJO DEL COMPLEJO DE PICUDOS DEL PLÁTANO Y BANANO CONCLUSIONES AGRADECIMIENTOS BIBLIOGRAFÍA 1° ed.
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- 2020
32. Los nematodos: microorganismos con múltiples funciones en los cultivos
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Uribe Londoño, Miguel, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, and Riascos Ortiz, Donald
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Agricultura ,Enfermedades y plagas ,Cultivos ,632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetales [630 - Agricultura y tecnologías relacionadas] ,Nematodos entomófilos - Abstract
Cartilla ilustrada Los nematodos son los animales más abundantes del planeta, representan cerca del 80 % de los animales en la tierra, de manera que son el grupo más numeroso en cuanto a individuos (Yeates et al., 2009). La palabra nematodo proviene del griego nema, que significa ‘en forma de hilo’. Tienen forma de gusanos, son redondos, largos y no segmentados (al contrario de las lombrices que son segmentadas). Los nematodos se pueden encontrar en la mayoría de los ambientes alrededor del mundo, desde tundras, desiertos, ambientes marinos o de agua dulce, aguas termales y aguas congeladas, una gran parte de ellos se encuentran en el suelo. Cada metro cuadrado de hojarasca del suelo o sedimentos acuáticos pueden contener millones de nematodos, que pertenecen a más de 400 especies (Wilson y Kakouli-Duarte, 2009). Los nematodos presentan diferentes hábitos alimenticios y se diferencian ampliamente en la morfología del estoma o «boca» (Eisenback, 2003). Los nematodos que se alimentan de plantas (fitoparásitos) poseen un estilete para romper la pared celular vegetal y así alimentarse del contenido celular; los nematodos depredadores presentan formas de sierra o «dientes» en el estoma para destrozar e ingerir otros organismos; los nematodos que se alimentan de bacterias y los que parasitan insectos presentan una estructura de sifón. Introducción, Nematodos que atacan plantas, Nematodos depredadores, Nematodos entomopatógenos, Conclusiones, Agradecimientos, Bibliografía. 1° ed.
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33. Picudos del plátano y banano: Cosmopolites sordidus, Metamasius hemipterus, Metamasius hebetatus, Metamasius submaculatus y Polytus mellerborgii
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Solarte Quintero, Andrés Fernando, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, and Riascos Ortíz, Donald
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Curculionidae ,Plátano ,Enfermedades y plagas ,632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetales [630 - Agricultura y tecnologías relacionadas] ,Manejo de picudos ,Banano ,Picudos - Abstract
Cartilla ilustrada Uno de los compromisos del proyecto “Desarrollo de tecnologías innovadoras para el manejo integrado de plagas y enfermedades limitantes de plátano y banano en el Valle del Cauca” fue el reconocimiento de las diferentes especies de picudo que afectan a los cultivos de plátano y banano en el departamento, como medida inicial para el diagnóstico y control de estas plagas. En ese sentido, esta cartilla hace parte del plan de socialización de los resultados del proyecto antes mencionado y busca proporcionar, a los productores y técnicos de esta cadena productiva, información que les permita conocer algunos detalles de especies del complejo de picudos del plátano y banano, con énfasis en Cosmopolites sordidus y Metamasius hemipterus, que en la actualidad son el principal problema ocasionado por insectos plaga debido a la magnitud del daño que causan y por su presencia en todas las zonas productoras. En esta cartilla también se comparte información útil para futuros trabajos de investigación enfocados en el conocimiento de este grupo de insectos plaga, en los cuales se requiera multiplicar, bajo condiciones controladas, diferentes especies de picudos. Introducción, Picudo negro, Picudo rayado, Picudo amarillo, Metamasius submaculatus, El picudo enano del banano (Polytus mellerborgii), Biología y ecología de los picudos, Reconocimiento de picudos en campo, Estrategias de manejo de picudos, Metodología de cría de C. sordidus y M. hebetatus, Cría de picudos en laboratorio, Metodología de cría de M. hemipterus, Conclusiones, Agradecimientos, Bibliografía. 1° ed.
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34. Monitoreo y captura de picudos del plátano y banano
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Angulo Angulo, Wagner Javier, Osorio, Juan Gabriel, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, and Riascos Ortíz, Donald
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Curculionidae ,Plátano ,Agricultura ,Enfermedades y plagas ,632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetales [630 - Agricultura y tecnologías relacionadas] ,Banano ,Picudos - Abstract
Cartilla ilustrada Los cultivos de plátano y banano son atacados por los insectos plaga Cosmopolites sordidus, Metamasius hemipterus, M. hebetatus, M. submaculatus y Polytus mellerborgii, los cuales conforman el llamado complejo de picudos. Estos insectos impiden el buen desarrollo de las plantas y la formación de racimos, lo que ocasiona pérdidas en producción del 40 al 60 % en plantaciones de plátano y banano con mal manejo agronómico (Gold et al., 2004). Dichas pérdidas son consecuencia del daño que estos insectos causan a los cormos y pseudotallos, debido a que sus larvas ocasionan galerías durante su proceso de alimentación, dejando expuesta a la planta al ataque de enfermedades también limitantes, como moko o madurabiche inducida por la bacteria Ralstonia solanacearum E. F. (Smith) raza 2, pudrición acuosa del pseudotallo por la bacteria Dickeya chrysanthemi, mal de panamá por el hongo Fusarium oxisporium f. sp. Cubense, y Sigatoka negra por el hongo Mycosphaerella fijiensis Morelet var. difformis (Alarcón y Jiménez, 2012). El número de individuos del complejo de picudos en las plantaciones de plátano y banano es un factor determinante de la producción de racimos y del desarrollo de nuevos colinos para nuevas siembras. Por tal razón, el monitoreo y captura de estos insectos plaga es una medida de gran importancia en las zonas productoras de plátano y banano para lograr mantener a las poblaciones de estos insectos plaga en un nivel en el cual no causen daño económico a los productores (Alpízar et al., 1997). La presente cartilla provee información sobre algunos métodos de monitoreo y captura de insectos plaga del complejo de picudos, como una medida para disminuir el nivel poblacional, determinar los sitios con mayor infestación y establecer la necesidad o no de aplicación de estrategias de manejo de estos insectos plaga en los cultivos de plátano y banano. Introducción, Complejo de picudos del plátano y banano, Monitoreo y tipos de trampa para la captura de picudos, Trampa tradicional tipo sándwich, Trampa tradicional tipo sándwich con feromona, Trampa tipo rampa, Consideraciones generales, Conclusiones, Agradecimientos, Bibliografía. 1° ed.
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- 2020
35. Genetic diversity of ecuadorian cocoa from the germplasm bank of Tenguel-Guayas Ecuador based in snp’s.
- Author
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Carranza Patiño, Mercedes Susana, Zapata, Patricia del Carmen, Gallego, Gerardo, Morante Carriel, Jaime, Cruz Rosero, Nicolás, Medina Jara, Sila, Nieto, José Ignacio, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Carranza Patiño, Mercedes Susana, Zapata, Patricia del Carmen, Gallego, Gerardo, Morante Carriel, Jaime, Cruz Rosero, Nicolás, Medina Jara, Sila, Nieto, José Ignacio, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
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Se estudió la diversidad genética y estructura de 80 introducciones de Theobroma cacao L. ‘Nacional’ existente en la finca “La Buseta”, Tenguel-Guayas, Ecuador. La caracterización incluyó 19 controles y 96 marcadores de polimorfismo de nucleótidos simples (SNP), en la plataforma del sistema Fluidigm EP1. Los SNP’s mostraron información polimórfica de 0,289 y 0,395; con heterocigosidad observada de 0,479 y esperada de 0,378. Se obtuvieron los perfiles genéticos de las introducciones, a partir de los cuales se identificaron 16 grupos de introducciones idénticas. El análisis de probabilidad de identidad, incluyendo hermanos (PIsib), concluyó que los SNP’s fueron suficientes para diferenciar las introducciones. El promedio de heterocigosidad de las muestras fue de 0,432 siendo mayor en el grupo F (0,646) y menor en el grupo P (0,253). Los controles de genotipeo Criollo y Contamana, mostraron mayor distancia genética que los controles Trinitario, Forastero y Criollo ecuatoriano. La distancia genética máxima entre las introducciones fue de 0,167. Los resultados son consistentes con la historia del cultivo del cacao Nacional, el cual a lo largo del tiempo recibió contribuciones genéticas de otras variedades. El presente estudio constituye un avance significativo en el conocimiento de la diversidad genética del cacao Nacional de Ecuador. Palabras clave adicionales: Diversidad genética, germoplasma, marcadores moleculares, SNPs, The genetic diversity and structure of 80 cocoa introductions of Theobroma cacao L. Nacional variety existing in the farm “La Buseta”, Tenguel-Guayas, Ecuador, was studied. The characterization included 19 controls and the use of 96 markers of simple nucleotide polymorphisms (SNPs), in the Fluidigm EP1 system platform. The SNPs showed to be informative, with a mean content of polymorphic information of 0.289, and an average observed heterozygosity of 0.479 and expected heterozygosity of 0.378. The genetic profiles of the introductions were obtained from which 16 groups of identical introductions were identified. The identity probability analysis, including siblings (PIsib), concluded that the SNPs were enough to differentiate the introductions. The average of heterozygosity of the samples was 0.432 being higher in the group F (0.646) and lower in the group P (0.253). The Criollo and Contamana genotyping controls showed greater genetic distance than the Trinitario, Forastero and Ecuadorian Criollo controls. The maximum genetic distance between the introductions was 0.167. The results are consistent with the history of cultivation of the Nacional cacao, which over time received genetic contributions from other varieties. The present study constitutes a significant advance in the knowledge of the genetic diversity of Ecuador's Nacional cacao. Additional keywords: Genetic diversity, germplasm, molecular markers, SNPs
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- 2020
36. Diversidad genética de ovinos criollos colombianos
- Author
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Vivas, Nini, Landi, Vincenzo, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Bustamante, Moris de J., Álvarez-Franco, Luz Ángela, Vivas, Nini, Landi, Vincenzo, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Bustamante, Moris de J., and Álvarez-Franco, Luz Ángela
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Ojective. genetical characterization the creole Colombian sheep and their relationships with breeds of European origins. Materials and methods. Blood samples of 261 sheeps from the following populations were collected: Criollos de Lana (CL), Mora Colombiana (MC), Criollo de Pelo (CP), criollos mestizos (Mes), Hampshire (Hamp), Corriedale (Corr), Katahdin (Kath), Pelibuey (Pel), in 40 farms of 8 departments (Córdoba, Magdalena, Cesar, Atlántico, Valle del Cauca, Nariño, Boyacá, Tolima) and 30 samples of Merino Spanish, Merino Precoz (MP), Merinofleischschaf (MF), Segureño (Seg) and Uda (UD) de Nigeria. A total of 15 microsatellites markers were included inthis study. Results. In creole sheep, the average number of alleles was found 6.20±1.48 (CL), 7.27±1.39 (CP) y 3.60±1.55 (MC); high genetic diversity found (high heterozygosities 75%), negative values in the FIS revealed high degree of introgression; furthermore the FST revealed genetic structure in both: Creole sheep (FST=0.02**) and departments (FST=0.039**).According to genetic distance, the creole Colombian sheep differs with outsider sheep. Conclusions. The results recommend protecting the Creole sheep production because it has been threatened by constant cross with foreign breeds, which would lead to the loss of genetic identity and adapting traits of creole sheep.themselves., Objetivo. Caracterizar genéticamente los ovinos criollos colombianos y sus relaciones con razas de origen europeo. Materiales y métodos. 261 muestras de sangre de las siguientes poblaciones, fueron colectadas: Criollos de Lana (CL), Mora Colombiana (MC), Criollo de Pelo (CP), mestizos (Mes), Hampshire (Hamp), Corriedale (Corr), Katahdin (Kath), Pelibuey (Pel), En 40 fincas de ocho departamentos (Córdoba, Magdalena, Cesar, Atlántico, Valle del Cauca, Nariño, Boyacá y Tolima) y 30 muestras de Merino Español (ME), Merino Precoz (MP), Merinofleischschaf (MF), Segureño (Seg) y Uda (UD) de Nigeria. Un total de 15 marcadores microsatélites fueron incluidos en este estudio. Resultados. En ovinos criollos, el número promedio de alelos encontrado fue 6.20±1.48 (CL), 7.27±1.39 (CP) y 3.60±1.55 (MC); hallándose también alta diversidad genética en ellos (heterocigosidades superiores al 75%), valores negativos en el FIS revelaron alto grado de introgresión; además el FST reveló estructura genética tanto en los grupos criollos (FST=0.02**), como en los departamentos muestreados (FST=0.039**). Según la distancia genética, los ovinos criollos colombianos presentan diferencias con los ovinos foráneos. Conclusiones. Los resultados obtenidos recomiendan proteger la ovinocultura criolla puesto que se encuentra amenazada por los constantes cruzamientos con razas foráneas, lo que conllevaría a pérdida de la identidad genética y de los rasgos de adaptación propios de los animales criollos.
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- 2020
37. Detección del virus de la leucosis bovina en ganado criollo colombiano mediante PCR-anidado
- Author
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Giovambattista Guillermo, Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Posso Terranova Andres Mauricio, Hernández Herrera Darwin Yovanny, and Antonio Benavides Javier
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Diagnóstico molecular, ganado criollo, leucosis bovina enzoótica, Creole cattle, enzootic bovine leukosis, molecular diagnostic ,Agriculture - Abstract
Se evaluó la presencia del virus de la leucosis bovina (VLB) en 360 muestras de ADN de oc%o razas bovinas criollas: Blanco (re)inegro (B(N), -asanare/o (-AS), -oste/o con -uernos (---), -%ino Santandereano (-%S), -a4uete/o (-8T), Hartón del Valle (HV), Romosinuano (RS) y San Martinero (SM), dos Razas SintBticas -olombianas: Lucerna (LD-) y VelEs4uez (VGL) y dos razas HorEneas: Bra%- mEn (B) y Holstein (H)J Para la detección del proKvirus se amplificó una región del gen env viral, me- diante P-R anidadaJ La presencia del VLB Hue mayor en la raza HV seguido por -%S (M3J3O y 60O respectivamente), VGL y LD- tuvieron el mismo porcenta)e (Q0O), en -AS, --- y -8T la presencia del virus fue de 26.7%, 23.3% y 16.7% respectivamente; no se encontró el virus en BON, SM y RS. En las razas foráneas la presencia fue de 83.3% para H y 6.7% para B. Se encontró dependencia altamente significativa entre la presencia del VLB y la raza, el sexo y región de origen de la muestraJ Gl prome- dio de presencia en las razas criollas Hue menor 4ue en las HorEneas, menor en los mac%os 4ue en las síembras y en la región norte 4ue en el suroccidente y el centro del pais
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- 2011
38. Diversidad genética de accesiones de nacedero Trichanthera gigantea (Humb. & Bonpl.) Nees, mediante RAM’s (Random Amplified Microsatellites)
- Author
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Posso Terranova Andrés Mauricio, Leterme Pascal, Muñoz Flórez Jaime Eduardo, Murgueitio Enrique, and Cárdenas Henao Heiber
- Subjects
ADN, bancos de germoplasma, extracción de ADN, marcadores genéticos, nacedero, DNA, DNA isolation, genetic markers, germplasm banks, nacedero ,Agriculture - Abstract
Con el objeto de estudiar la diversidad genética del árbol forrajero nacederoTrichanthera gigantea (Humb.Bonpl.) Nees, existente en la colección nacional de la Fundación Centro para la Investigación en SistemasSostenibles de Producción Agropecuaria (CIPAV) se utilizaron cinco cebadores RAMs en 38 accesionesprocedentes de once departamentos de Colombia y dos estados de Venezuela. Se obtuvieron 71 bandasusadas para estimar los parámetros de diversidad genética. Se adaptó un protocolo de extracción deADN para la especie y se estableció un banco de ADN de las accesiones en la Universidad Nacionalde Colombia sede Palmira, para la realización de trabajos futuros. Los resultados indicaron que lacolección nacional de nacedero presenta heterogeneidad en sus accesiones, alta diversidad genética yno se encontró relación entre los grupos genéticos formados mediante el análisis molecular y las zonasgeográficas de origen.
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- 2011
39. ZnO-based nanofungicides : Synthesis, characterization and their effect on the coffee fungi Mycena citricolor and Colletotrichum sp
- Author
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Arciniegas Grijalba, P.A., Patiño Portela, M.C., Mosquera Sánchez, L.P., Guerra Sierra, Beatriz Elena, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Erazo Castillo, L.A., and Rodríguez Páez, J.E.
- Subjects
Pathogenic coffee fungi ,Characterization ,Chemical and green synthesis ,ZnO-based nanomaterials ,Nanofungicides - Abstract
18 p. Electrónico, mical route and a ZnO-based nanobiohybrid obtained by green synthesis in an extract of garlic (Allium sativum). To find out the characteristics of the materials synthesized, X-ray diffraction (XRD), IR spectroscopy and absorption in UV–Vis were used, as well as both scanning (SEM) and transmission (TEM) electron microscopy. The results showed that the samples obtained were of nanometric size (< 100 nm), with a predominance of the wurtzite crystal phase of ZnO and little crystallization of the nanobiohybrids. Their antifungal capacity on two pathogenic fungi of coffee, Mycena citricolor (Berk and Curt) and Colletotrichum sp. was also evaluated. Both nanomaterials showed an efficient antifungal capacity, particularly the nanobiohybrids, with ~97% inhibition in growth of M. citricolor, and ~93% for Colletotrichum sp. The microstructural study with high resolution optical (HROM) and ultra-structural microscopy (using TEM) carried out on the fungi treated with the synthesized nanomaterials showed a strong nanofungicidal effect on the vegetative and reproductive structures and fungal cell wall, respectively. The inhibition of the growth of the fungi and micro and ultra-structural affectations were explained considering that the size of the nanomaterials allows them to pass easily through the cell membranes. This indicates that they can be absorbed easily by the fungi tested here, causing cellular dysfunction. Nanofungicide effects are also attributable to the unique properties of nanomaterials, such as the high surface-tobulk ratio of atoms and their surface physicochemical characteristics that could directly or indirectly produce reactive oxygen species (ROS), which affect the proteins of the cell wall.
- Published
- 2019
40. Formación de un banco de ADN en la especie Cucurbita moschata (Duchesne ex lam.) Dúchense ex Poir y evaluación de ocho marcadores moleculares como código de barras para su autenticación
- Author
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Cañar Serna, Dubert Yamil, Vallejo Cabrera, Franco Alirio, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2012
41. Morpho-molecular characterization of Colombian and Brazilian populations of Rotylenchulus associated with Musa spp
- Author
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Riascos-Ortiz, Donald, Riascos-Ortiz, Donald, Mosquera-Espinosa, Ana Teresa, De Agudelo, Francia Varón, de Oliveira, Claudio Marcelo Gonçalves, Muñoz-Flórez, Jaime Eduardo, Riascos-Ortiz, Donald, Riascos-Ortiz, Donald, Mosquera-Espinosa, Ana Teresa, De Agudelo, Francia Varón, de Oliveira, Claudio Marcelo Gonçalves, and Muñoz-Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2019
42. Genetic diversity and geographical genetic diversity in Colombian accessions of Lippia alba (Mill.) N.E. Brown
- Author
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Cardona Montoya, José Omar, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Cardona Montoya, José Omar, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Abstract
Bushy matgrass (Lippia alba, Verbenaceae) is a promising plant genetic resource, by their active compounds. The present document studied the molecular genetic diversity and spatial genetic structure on two contrasting populations of L. alba in Colombia. Eight RAM, evaluated total DNA of 59 accessions of non-cultivated plants collected in two Colombia regions, Chicamocha and Sumapaz. The expected average heterozygosity (or average heterozygosity genetic diversity of Nei) for the sample had low value (0.0≤He=0.2467≤0.5). The values of molecular diversity indicated values in the range of 0.1219 to 0.3425 for seven RAM. The frequency of variants is based on effective number of alleles [Ae] and expected heterozygosity [He], genetic diversity by locus (hj=1-p2-q2) had maximum values (near 0.5) in the primers ACA-AG-CGA-CEC. RAM suitably analyzed Lippia alba as endemic genetic resource. A DNA bank composed of 59 Colombian accessions from Lippia alba was set up. The analysis of the spatial global structure shows that the subpopulation Sumapaz is structured, whilst the subpopulation Chicamocha, is in structuring process. The results suggest in all cases the need for implementing: a) exchange of gene-seed, (b) gene banks of minimum, with a maximum genetic variability, c) induce genetic diversity., El Prontoalivio (Lippia alba, Verbenaceae) es un recurso fitogenético promisorio por sus compuestos activos. Este documento determinó la diversidad genética molecular y la estructura genética espacial de dos poblaciones colombianas de Lippia alba. Ocho RAM, evaluaron el ADN total de 59 accesiones de plantas no cultivadas colectadas en dos regiones colombianas (Chicamocha y Sumapaz). La Heterocigocidad promedio esperada-Hegg (Heterocigocidad media o Diversidad genética de Nei) para la muestra de trabajo tuvo un valor bajo (0.0≤ He=0.2467≤ 0.5). Los valores de Diversidad Molecular-DM- estuvieron en el rango de 0.1219 a 0.3425 para siete marcadores RAM. Con base en la frecuencia de variantes (Numero efectivo de alelos [Ae] y Heterocigocidad esperada [He], la diversidad genética por locus (hj=1-p2-q2) tuvo valores máximos (cercanos a 0.5) en los cebadores ACA-AG-CGA-CCA. Lippia alba como recurso genético promisorio propio, fue susceptible de ser analizada mediante RAM. El laboratorio de biología molecular de la UN-Palmira, conformó un banco de ADN con 59 accesiones de L alba. El análisis de la estructura global espacial mostró que la subpoblación Sumapaz está estructurada, mientras que la población Chicamocha está en proceso de estructuración. Los resultados sugieren en todos los casos implementar: a) intercambio de semilla genética, b) bancos de germoplasma de mínimos individuos con máxima variabilidad genética, c) inducir diversidad genética.
- Published
- 2019
43. Diversidad genética en patrones de cítricos mediante microsatélites amplificados al azar (rams)
- Author
-
Gallego colonia, Jeisson Steevens, Lilia Enríquez, Ayda Lilia, Caicedo Arana, Alvaro, Posso Terranova, Andres Mauricio, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Gallego colonia, Jeisson Steevens, Lilia Enríquez, Ayda Lilia, Caicedo Arana, Alvaro, Posso Terranova, Andres Mauricio, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Abstract
Los patrones de cítricos son esenciales en la citricultura debido a que afectan más de veinte características agronómicas de las copas y frutos. La caracterización y documentación de las introducciones de un banco de germoplasma permiten evitar duplicados e identificar introducciones promisorias para procesos de selección, mejoramiento genético o procesos agroindustriales. Se evaluó la diversidad genética de 39 introducciones del banco de germoplasma de Cítricos de CORPOICA Centro de Investigación Palmira. Se utilizaron seis cebadores RAMs los cuales generaron 134 loci polimórficos que se usaron para estimar los parámetros de diversidad genética. La He y porcentaje de loci polimórficos para la colección fue de 0,38 y 92,54%, respectivamente. El análisis de similitud permite apreciar que los materiales se encuentran dispersos en el dendrograma, sin embargo a un nivel de similitud de 0,63 se agrupan las introducciones del género Poncirus y sus híbridos. La especie Clausena lansium fue la más distante del resto de las especies y se diferenció a un nivel de similitud de 0,54. Los resultados indican alta diversidad genética en el banco de germoplasma de patrones de cítricos, que puede ser utilizada en futuros trabajos de investigación.
- Published
- 2017
44. Variabilidad fitoquímica entre accesiones colombianas de Lippia alba (Mill.) N.E. Brown
- Author
-
Cardona Montoya, José Omar, primary and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, additional
- Published
- 2016
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45. Diversidade genética do gene BoLA-DRB3 em gado crioulo colombiano Hartón del Valle
- Author
-
Hernández Herrera, Darwin Yovanny, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, and álvarez Franco, Luz ángela
- Subjects
marcador genético ,PCR-SBT ,Genetic marker ,major histocompatibility complex ,Complejo mayor de histocompatibilidad ,Complexo maior de histocompatibilidade - Abstract
El objetivo de esta investigación fue evaluar la diversidad genética del gen BoLA-DRB3 en el ganado criollo Colombiano Hartón del Valle. En 93 animales Hartón del Valle (HV), 30 Lucerna (LUC) y 30 Holstein (HOL) se evaluó el polimorfismo del gen DRB3 usando la metodología PCR-SBT. Se encontraron 27 alelos en la raza HV, 17 en LUC y 14 en HOL. El alelo más frecuente en HV fue el DRB3*1101 (14,5%), en la raza LUC los alelos DRB3*0701, *1107, *1501 y *2301 al igual que el alelo DRB3*0701 en la raza HOL tuvieron la frecuencia más alta (11,7%). Los valores de heterocigocidad esperada fueron más altos que la observada, lo que se tradujo en un valor bajo del índice de fijación, valores de F IS positivos solo significativo en el HV y desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg no significativos en LUC. El análisis de varianza molecular reflejó poca variación entre razas (3%) y una diferenciación genética moderada (F ST= 0,056 p
- Published
- 2015
46. Aplicación de la espectroscopia NIR para la predicción de sólidos solubles en pulpa de guayaba
- Author
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Gutiérrez Devia, ányelo Andrey, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Belalcázar Martínez, John Eiver, Ibarra Espinosa, Dora Mónica, Caicedo Arana, álvaro, and Caetano, Creuci María
- Subjects
Espectroscopia en el infrarrojo cercano ,guava ,calibración ,°brix ,guayaba ,calibration ,Near infrared spectroscopy - Abstract
Utilizando la técnica NIRS (espectroscopia de reflectancia en el infrarrojo cercano) se realizó la predicción de sólidos solubles en pulpa de guayaba (Psidium guajava L.) y (Psidium friedrichsthalianum) sobre 92 muestras en dos estados de madurez de la fruta. Cada fruto fue procesado hasta obtener la fracción comestible en la cual se determinó el contenido de sólidos solubles (%). De esta fracción se tomaron dos submuestras que fueron escaneadas en el espectrofotómetro NIR en un rango entre 400 y 2500 nm. Para la calibración se generaron modelos de regresión mediante MPLS (mínimos cuadrados parciales modificados) en un rango entre 1108 y 2498.2 nm. Para la elección del modelo final de calibración del NIR se consideraron como criterios el coeficiente de determinación (R²) y la desviación residual predictiva (RPD). Para establecer la existencia de diferencias entre los resultados obtenidos por el método primario o de referencia y los de NIR se realizó un análisis de varianza y prueba de medias mediante el programa estadístico SAS v 9.0. Los resultados mostraron una alta capacidad de predicción del modelo (R² = 0.990) entre las mediciones primarias y las de NIR. El valor de RPD fue 6.20, que indica una excelente precisión de la predicción. Entre las estimaciones por NIR y primarias no se presentaron diferencias significativas, pero sí se observaron entre muestras. Prediction of soluble solids in pulp of 92 samples of guava (Psidium guajava L.) and (Psidium friedrichsthalianum) in two maturity stages was made by using NIRS technique (near infrared reflectance spectroscopy). Each fruit was processed to obtain the edible fraction in which it was determined the soluble solids content (%). Two subsamples were taken and scanned in NIR spectrophotometer at the range of 400 to 2500 nm. Calibration regression models were generated by using MPLS (modified partial least squares) at the range of 1108 - 2498.2 nm. For the choice of the final model of the NIR calibration the criteria considered were the coefficient of determination (R²) and the residual predictive deviation (RPD). Analysis of variance and mean test employing the statistical program SAS v 9.0 were realized in order to establish differences in the results obtained by the primary or reference method and NIR. The results showed a high predictive power of the model (R² = 0.990) when compared the primary and NIR measurements. The RPD value was 6.20, indicating excellent prediction accuracy. Primary estimates and NIR not showed significant differences. Ho wever there were significant differences at level of samples.
- Published
- 2015
47. Variabilidad fitoquímica entre accesiones colombianas de Lippia alba (Mill.) N.E. Brown
- Author
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Cardona Montoya, José Omar, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Cardona Montoya, José Omar, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Abstract
La fluctuación fisiológica de constituyentes orgánicos alrededor de su respuesta ambiental, tiene dos componentes, variación intra e interindividual. Este estudio evaluó los componentes de variación biológica con base en una matriz de presencia-ausencia, generando valores de precisión inter-intra poblacional/individual a partir de una muestra de 58 accesiones de L. alba. La variabilidad química intra-individual fue alta (WI=2.06 [98%]) y la inter-poblacional, fue baja (AP=0.033), con FST=0.023 p(rand>data=0.07) y proporción 2%. No se observaron valores altos de Estimativos de Varianza [Est.Var.] que conduzcan a establecer Diversidad Genética-DG- entre poblaciones e individuos. Los resultados generados por la prueba apuntan a la presencia de dos sub-poblaciones, delimitadas cada una por condiciones ambientales locales.
- Published
- 2016
48. Entomopatógenos asociados a cítricos y su patogenicidad sobre Compsus viridivittatus Guérin-Méneville (Coleoptera: Curculionidae)
- Author
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Zuluaga Cárdenas, Paola Andrea, primary, Caicedo Vallejo, Ana Milena, additional, Cardozo Santamaría, Nancy, additional, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, additional, and Carabalí Muñoz, Arturo, additional
- Published
- 2016
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49. Caracterización molecular del complejo picudo de plátano (coleóptera: curculionidae), géneros Cosmopolites y Metamasius, en tres localidades de Colombia
- Author
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Duque Gamboa, Diana Nataly, Caicedo Vallejo, Ana Milena, Montoya-Lerma, James, Vallejo Espinosa, Luis Fernando, and Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
- Published
- 2012
50. Asociación del gen BoLA-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina (VLB) en ganado criollo hartón del Valle
- Author
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Posso Terranova, Andrés Mauricio, Muñoz Flórez, Jaime Eduardo, Giovambattista, Guillermo, Álvarez Franco, Luz Ángela, and Hernández Herrera, Darwin Yovanny
- Published
- 2012
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