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Resumen La Cordillera de Los Andes tuvo un papel decisivo en la diversificación de los roedores sigmodontinos, los más diversos del Neotrópico, produciendo el aislamiento de poblaciones en zonas altas y bajas por cambios en el clima y el origen de ecosistemas como páramos y selvas subandinas entre el Mioceno y el Pleistoceno. Un ejemplo de esta alta diversificación en este grupo de roedores y la deficiencia en el conocimiento taxonómico es el género Oryzomys (tribu Oryzomyini), el cual a partir se reevaluaron los grupos morfológicos y geográficos, y se produjo la descripción de diez géneros nuevos en el año 2006. Entre los géneros nuevos descritos, se encuentra el género Nephelomys, el cual se distribuye en bosques de zonas altas de Los Andes de Suramérica desde Colombia hasta Bolivia, y en Centroamérica, en Panamá y Costa Rica. Actualmente, el género contiene 13 especies, varias de estas consideradas sinonimias de Nephelomys albigularis (Tomes, 1860) especie tipo del género restringida para Ecuador. Para Colombia se reportan cuatro especies: Nephelomys childi (Thomas, 1895), Nephelomys maculiventer (J. A. Allen, 1899), Nephelomys meridensis (Thomas, 1894) y Nephelomys pectoralis (J. A. Allen, 1912). El género Nephelomys aún requiere una revisión taxonómica, ya que se requiere clarificar la distribución y diagnosis de la mayoría de las especies. Las distribuciones de las especies y sus diagnosis han sido aproximaciones a través de la morfología, la cual es la herramienta históricamente usada para la diferenciación de las diferentes especies. Actualmente se emplean estudios moleculares para la delimitación de especies y filogenias, lo cual, brinda información para establecer relaciones filogenéticas y delimitación de las diferentes entidades taxonómicas. Por lo anterior, esta tesis tuvo como objetivo identificar las especies del género presentes en los Andes colombianos, establecer y analizar su distribución geográfica en Colombia. Para ello se examinaron especímenes depositados en seis colecciones biológicas, tomando datos de localidad, medidas morfométricas craneales revisión de caracteres morfológicos y toma de muestras de tejido para análisis moleculares. Se realizaron análisis estadísticos multivariados, con las medidas morfométricas y se compararon los caracteres morfológicos. A partir de la georreferenciaron de localidades se hicieron modelos de nicho ecológico. Adicionalmente se efectuaron análisis moleculares con dos genes mitocondriales: citocromo b y 12S, para diferentes localidades. Se encontraron diferencias entre las especies propuestas a nivel de morfometría lineal craneana, diferencias y similaridades en la morfología externa, distribuciones disyuntas, diferencias en los nichos ecológicos en cuatro especies que pudieron ser modeladas, y similitudes en los dos genes estudiados. Concluimos que en Colombia se encuentran seis taxones diferentes, que tienen distribuciones limitadas por los valles interandinos, zonas bajas y accidentes geográficos como cañones y cuencas de ríos, información que apoya el papel que Los Andes jugó en la diversificación en este género, confirmándose una de las áreas de endemismo propuestas para el país. Abstract. The Andes Mountains played a decisive role in the diversification of the sigmodontine rodents, which the most diverse of the Neotropics. The Andes mountains causing the isolation of populations in the highlands and lowlands due to changes in the climate and the origin of ecosystems as paramos and subandine forests between Miocene and Pleistocene. An example of this high diversification in this group of rodents and deficiency in taxonomic knowledge is the genus Oryzomys (Oryzomyini tribe), which re-evaluated the morphological and geographic groups and a description of ten new genera was given in 2006. Among the new genera are the genus Nephelomys, distributed in the forests of the highlands of the Andes of South America from Colombia to Bolivia, and in Central America, Panama, and Costa Rica. At present, the genus contains 13 species and several of them considered synonymous of Nephelomys albigularis (Tomes, 1860) type specie of the genus and restricted to Ecuador. Colombia has four species: Nephelomys childi (Thomas, 1895), Nephelomys maculiventer (J. Allen, 1899), Nephelomys meridensis (Thomas, 1894) and Nephelomys pectoralis (J. Allen, 1912). The genus Nephelomys still requires a taxonomic revision because of the distribution and diagnosis of most species is unclear. The distributions of the species and their diagnoses have been approximations through the morphology, which is the tool historically used for the differentiation of the different species. Molecular studies are currently used for the delimitation of species and phylogenies, thus, give information to establish phylogenetic relationships and the delimitation of different taxonomic entities. Therefore, this thesis aimed to identify the species of the genus in the colombian Andes to establish and analyze their geographical distribution in Colombia. For this reason, we examined the specimens deposited in six biological collections, obtaining locality data, cranial morphometric measurements, review of morphological characters and tissue sampling for molecular analysis. Multivariate statistical analyzes were performed with morphological measures and morphological characters were compared. Based on the georeferencing of the localities, models of ecological niches were made. In addition, molecular analyzes were performed with two mitochondrial genes: cytochrome 12S for different localities. We found differences among the proposed species on linear cranial morphometry, differences and similarities in external morphology, disjunctive distributions, differences in ecological niches in four species that could be modeled, as well as similitudes in the two genes studied. We conclude that in Colombia we find five different taxa, which have limited distributions by inter-Andean valleys, lowlands and geographic features such as canyons and basins, information that supports the role played by the Andes in the diversification in this genus, support one of endemism area for the country. Maestría